3LORA

The crystal structure of a thiol-disulfide isomerase from corynebacterium glutamicum to 2.2a
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
154
structure length
154
Chain Sequence
LDNAPLLELDVQEWVNHEGLSNEDLRGKVVVVEVFQMLCPGCVNHGVPQAQKIHRMIDESQVQVIGLHSVFEHHDVMTPEALKVFIDEFGIKFPVAVDMPREGQRIPSTMKKYRLEGTPSIILADRKGRIRQVQFGQVDDFVLGLLLGSLLSET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of a Thiol-disulfide Isomerase from Corynebacterium glutamicum to 2.2A
rcsb
molecule keywords Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
molecule tags Isomerase
source organism Corynebacterium glutamicum
total genus 42
structure length 154
sequence length 154
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lorA00
3L0HA 1U87A 2BTOT 3ZFLA 1BQ7A 2VLUA 2B1KA 6GSUA 4HQZA 1O7UA 3GIXA 3CSIA 1BJXA 3TRPA 3PINA 1DUGA 2FA8A 3FR3A 1DE2A 4PX1A 2ZCTA 3DMLA 1YKAA 4D73B 4EO3A 5J4UA 3EE2A 4JRRA 3FYGA 4PQIA 1SK2A 5J3RA 5IM9A 5AISA 4IHUA 1KNGA 1JZDA 1FW1A 3ZVJD 1YKCA 4BVYA 3F0IA 1PKZA 3O76A 4I2TA 2OA7A 1NHYA 1HD2A 3CTFA 5DAKA 3C73A 3ERFA 2VCVA 2H70A 18GSA 5CRHA 2C1YA 2GZPA 1C72A 4G2EA 2IMIA 2CV4A 5IMFA 1Z6NA 2P0GA 1GRXA 1O8WA 4XHMA 3N9JA 1GNWA 2P5RA 1M99A 2YN1A 2H1DA 2ES7A 1EWXA 2C4JA 1FVJA 2DLXA 4Q5NA 3EYTA 1GSFA 1ZZYA 3F4TA 3TKQA 4FYCA 1V57A 1SENA 2E2GA 4EUYA 1E2YA 2DC5A 2IFQA 2IMFA 3M0FA 4KA0A 1B8XA 4IBPA 4MF6A 2IMEA 4HUAA 1Z3EA 4TKYA 2I9HA 2F8FA 1AQXA 1HNAA 4V1Ap 4KB3A 3L9SA 2WZ9A 2DMMA 2KUCA 3QFBC 4NMUA 2KHPA 2O89A 4LMWA 4L8EA 4KCEA 3UBKA 1ERVA 2OE3A 4G9HA 5ECLB 1G6WA 1YEXA 4EVMA 3TKSA 4PUAA 4MF7A 2V41A 1XFLA 2E0QA 4OCEA 3UARA 2MMZA 5D9TA 3A5WA 3GKMA 3HJOA 2FWFA 2DJKA 5H5QA 4K8MA 1YDKA 3P90A 1KTEA 4PNFA 3PR8A 4MCUA 5IMDA 3ZYWA 3GKKA 3N5OA 1PX7A 3D0ZA 2M72A 1A2JA 1SL1B 2GSQA 2RIIA 2JADA 4POBA 1JLVA 1ZGNA 4EE0A 1RK4A 1O6JA 4Q5FA 4NHWA 5HFIA 4AF2A 1H75A 5F05A 3EVIA 2JZRA 3FZ5A 4Q5RA 3TJFA 3D4MA 3AY8A 3FZ4A 1TTZA 1T4ZA 3WGXA 3H93A 4EF0A 1ML6A 2GQMA 1A24A 1WWJA 2B6MA 2XC2A 1QK8A 4HU7A 1A2MA 2LRTA 3QDNA 1MDIA 3GRXA 3UMAA 5G2ZA 4K9ZA 2B7JA 4ZB8A 3KTBA 4KAEA 2LS5A 3BCIA 1PD21 1HNBA 4ECCA 17GSA 1FG4A 3F3QA 3GX0A 3L4NA 3C1RA 4ZILA 2DIZA 1S3DA 4X1UA 4EC0A 5EY6A 4NV2A 4TXOB 3H4KA 2AHEA 3KEBA 4KW6A 4BVXA 1B9XC 1EGOA 3F8UA 6GSWA 4ZL9A 2CT6A 2XPEA 5D9VA 2H72A 3GH9A 5ID2B 2F3MA 5DDLA 2CVKA 5CRGA 3HD5A 3G7IA 2L5LA 2PVOC 1QXHA 3TDGA 3FEUA 3UL3A 4JEDA 2PWJA 1IYIA 2KOKA 2AUVA 3US3A 5DQSA 5HR3A 3J7Yk 2QGVA 3BBYA 3F4SA 4CW9A 2K6VA 1T7PB 3CSHA 3CRTA 4ECBA 3DVXA 4ACSA 1XWKA 4K7IA 2VL9A 3ZZXA 2MMAA 2PU9C 3DKSA 1H4OA 4P3YB 4MLYA 4IELA 3F63A 1SD9A 5G31A 2DBCA 2FWGA 2VD1A 6GSYA 2FCHA 1M9BA 1TRUA 2R6KA 3TOUA 1SYRA 5HFKA 2GSRA 5IQYA 3C7MA 1K3YA 1JLWA 1GTBA 1R26A 3M9KA 1F9MA 2H1AA 1Y25A 4MJBA 3MSZA 1Z5YE 2GGTA 1GUMA 2AB6A 4ZB6A 5B8BA 3LFLA 3IOSA 19GSA 3H79A 3TRXA 5GSTA 2VLVA 1CQHA 4XRDA 14GSA 2QKEA 3WYWA 1GSYA 1AQWA 4I97A 3O6TA 5IOXA 3IDVA 4WBRD 4YQMA 1JFUA 3TKSE 3FHKA 3RHCA 2BJXA 4ML1A 5C00A 4NXIA 3D21A 3ZRDA 5ECOB 3VPQA 2VM2A 2HRNA 3QOUA 3CXGA 1PN9A 4MZBA 2VOCA 3LXZA 4PGTA 2DIYA 3QCPA 2ON7A 2YNXA 5IO0A 3L78A 4XS4B 3I9V2 4MF5A 5DALA 3RBTA 3M9JA 3GTUA 1ZMAA 2GT5A 3KCMA 1OE8A 3H1NA 3FKFA 1AQVA 1M0UA 4WKWA 4L5LA 1GH2A 4IKHA 1GP1A 5ABRA 3QAGA 2C3QA 2JL4A 4MMMA 2VCWA 2P5QA 3H8QA 3FR6A 3DYRA 1UVZA 1BG5A 1YF0A 1QQ2A 1HQOA 2HT9A 3HVXA 1MD4A 2FUG2 3BJ5A 2YJ7A 1PL2A 3P7XA 2C0GA 1S3AA 2YWOA 3VFIA 3QFAC 3MDKA 5L71A 2B5EA 4K7NA 1SJ6A 5CRDA 1O85A 5KN2A 2M80A 3IK7A 1M2DA 5ECQB 3GKNA 3CMIA 1TI1A 3HJPA 4OMVA 5D73A 4RUVA 1EEMA 2OACA 2REMA 1ZYQB 2VL2C 2YZUA 4QL7A 4I5QA 9GSSA 4O5RA 1DBYA 2HZEA 1V2AA 4WR4A 4KDYA 3Q74A 5CP1A 3TUEA 3FRCA 5IOWA 1XZOA 3F6FA 2HYXA 3KJYA 5ECIB 6GSXA 3EINA 2HZEB 4MP4A 3IE3A 5IPHA 5IO2A 4DEJA 5AGYA 4KCAA 2DJ3A 3O3TA 1XOAA 2R4VA 1UC7A 5DVBA 3ZVJA 4ZIJA 1V9WA 4MA9A 2B5YA 1DE1A 3BD2A 2YZHA 5D9WA 4D73A 5C04A 1EOGA 1XOBA 3Q18A 1A8YA 4L0WA 2HNLA 2X8GA 4MK3A 1XW9A 2NVLA 3DIEA 1F2EA 1TW9A 1VF2A 3M3MA 2P31A 5A5KA 4PURA 3ERWA 4YH2A 4HI7A 3WT1A 5F06A 5J5NA 1TOFA 5FWGA 1XWAA 2YWIA 2EIQA 1JHBA 3UBLA 3ZIJA 2OBIA 1K0DA 3P2AA 4GLTA 1T4YA 2VM1A 2LRCA 2DJJA 5D8IA 1XIYA 4V2NA 5E4WA 3PH9A 2XBQA 2LKUA 4AJ8A 4V2MA 2LV3A 1QGVA 2ZNMA 4NAXA 4WETA 3KMOA 3TB2A 5J9BA 3EU3A 2EIOA 1XW5A 4ID0A 4IP1A 2C3NA 4BWSA 3UAPA 4K7OA 2H71A 3TJKA 2XPDA 4EDYA 3P8WA 2NTOA 4K6XA 2X8CA 2PN8A 5JWRB 2TRXA 4ZL8A 4KX4A 1HNCA 3W6GA 1X9WB 1FB6A 1THXA 3ZLPA 5J41A 16GSA 3GURA 1XCCA 2CX3A 1UA5A 1U3AA 2VD0A 5IMCA 2J23A 4WEYA 3U6VA 3DRNA 3D22A 3KP8A 1M2BA 1SD8A 5B6MA 2BMXA 4LMVA 2QC7A 3D4TA 4WBJA 5KN0A 2GDRA 1Z9HA 1ACVA 3NOFA 3KXOA 3A3TA 3I6AA 2GLRA 2H30A 6GSSA 1AAZA 1G0TA 2K8SA 2GZZA 5G1LA 1SKSB 4N30A 2YOIA 2IL3A 1V98A 4YAVA 3MWHA 2L57A 3CTGA 5G1KA 1QFNA 2L4CA 2YJHA 4I6XA 3M1GA 2L59A 2XBIA 5ECSA 1URMA 2VUPA 4OD7A 2E2MA 4BPYA 1TU8A 2OE1A 3C71A 5KN3A 5F07A 5EPFA 3G9BA 3CSJA 12GSA 2CA8A 4PXOA 5LCZA 3IA1A 3BCKA 2X64A 2VAFA 2C0DA 5G5EA 1O81A 2HXKA 5ECHB 3E0UA 1PSQA 4ZL7A 5B7CA 1GUHA 3GSSA 4KSOA 2IIYA 2V2GA 4OO5A 3U5RE 4MJEA 3IHQA 1GTAA 4GF0A 4RI7A 3FZAA 3RDWA 3IAS2 3IBHA 4H86A 3APQA 3LWAA 1SKRB 2VCTA 1FB0A 3HXSA 3VLNA 4BA7A 1VF1A 3G7JA 2NDOA 10GSA 2YV7A 2OADA 3OR5A 2FA4A 1R4WA 2YV9A 1JZWA 3TRQA 4KSMA 4GCIA 4FYUA 1JZRA 5DBQA 1PMTA 2M46A 5COHA 3IR4A 4YQVA 5AN1A 5GSSA 4JE1A 4TXOA 1USBA 1X9MB 4MPFA 3S9FA 1I5GA 3NIVA 1ERUA 5IMZA 2B3SA 4ZBDA 1YJ6A 1R5PA 3R2QA 4GXZA 5HR2A 1NM3A 1ZOFA 1NSWA 2X8HA 3KTLA 2H6XA 3C1SA 2JU5A 2GS3A 2WDUA 3IRAA 4RQXA 3LG6A 2AYTA 5D9XA 4WF5A 5ID2A 2GSTA 1AXDA 2KP1A 3E9JB 5LD0A 4X0XA 2V32A 4GSTA 2A2SA 4FO5A 2GT6A 2YP6A 4AGSA 4FYBA 2H0HA 2WFCA 1J08A 2YANA 2HSHA 1SJIA 4O7HA 1YF1A 4F0BA 4LL4B 2OBKA 1IYHA 2H1BA 3QAVA 1XWGA 2ON5A 4FH8A 4EKZA 4IN0A 1PRXA 2VL3A 5G30A 1WRYA 4E8HA 4XS6A 1EP8A 5IMVA 4TR1B 13GSA 2RUEA 4HJMA 4MJCA 1K0BA 1MDJA 1MEKA 1TJDA 3QR6A 4EXJA 2IMDA 1Z7PA 5B6NA 3DXBA 1GSEA 3LORA 4J57E 1ILOA 4NPBA 5AIVA 4F03A 5JWOB 1PQNA 2K8VA 2YWMA 3KGKA 2RLIA 3KMNA 4Q5QA 3Q6OA 2KLXA 1J9BA 2RM6A 4ML6A 2EIRA 1AW9A 4YQUA 3ISOA 3ERGA 1SK1A 1NW2A 1B4PA 1I9DA 1U88A 1PX6A 5CAXA 3CBUA 4QL9A 4MABA 4DSQA 2H75A 3LQ7A 5E59A 1JZOA 1ERTA 3D6IA 4G10A 2HRFA 4TOPA 1GSQA 4MZCA 3VWVA 2V1MA 3BOAA 2LJAA 4JBBA 5A4VA 2DSAA 8GSSA 3GL3A 3GN3A 4F0CA 4HQSA 2DJ0A 1CQGA 1MD3A 1K0OA 2NBSA 4WXTA 2L5OA 3VK9A 4AJ6A 4XS4A 4IVFA 4TVEA 3HY2A 4I2UA 2LQOA 3MNGA 1VF3A 3EURA 2WGRA 3L9VA 3GHAA 3UIWA 4GQFA 5ECRB 3ZITA 2VCQA 3GNJA 3IC4A 2I4AA 1X5CA 4IGJA 3WGDA 3ZFBA 5HQPA 3LXTA 4BWQA 2HE3A 1BX9A 4OFTA 3VI5A 3NZNA 3KIJA 3IAM2 1EGRA 5DQYA 4K1FA 4JZQA 4XRAA 4O32A 3ZREA 4L0UA 5EL8A 1Z6MA 1PA3A 1Z7RA 7GSSA 2WS2A 4K0NA 3LEFA 3CRUA 4PUFC 4HDEA 1OAZA 2ZUPA 4IS0A 1XPVA 4HEA2 4WF4A 3I43A 1XWCA 4XS1A 2MZCA 3VPTA 1GNEA 2WCIA 4GRFA 4OFNA 4ZXGA 3HVVA 2WRTA 4POMA 1OC9B 3FR9A 3CYNA 2O85A 4TW5A 5ECNB 3FZ9A 2H0IA 2LJKA 2VLTA 1O8XA 1WPIA 5ENUA 2RM5A 1FVKA 4KDXA 4MZWA 5DJLA 5LNKe 3F3RA 1WJKA 4EL1A 2H8LA 3FY7A 1GWCA 5FHIA 2H1GA 4F82A 5HFGA 2H66A 3PGTA 5GZZB 2AJQB 4DSSB 5INYA 5JCUA 4IJIA 1SL2B 1WIKA 5ECMB 2WJUA 2PUKC 3IPZA 1SJZA 1R5AA 1A8LA 1LJRA 3LGCA 4BL7A 2OJLA 4KGIA 5H5SA 1OKDA 3J7Yb 2VO4A 3TKPA 2OKAA 2I3YA 3F4RA 5KEJA 4HZ2A 3TKSC 2LNTA 1J0FA 1T00A 1SYXA 1QMVA 1GSDA 1B48A 5ECKB 3KZQA 3HDCA 5B8AA 1WE0A 2LJRA 3F6DA 1LBKA 1XVQA 2N5FA 3GH6A 1V58A 4X43A 2MMNA 4O92A 4N0ZA 1GUKA 4JR4A 2GSSA 3TGZA 1VRSD 2GQLA 2FGXA 3GUSA 1PGTA 1B4QA 4G19A 1TKDB 2DJ1A 3HZ4A 3EMPA 4K0GA 2CZ3A 1K0CA 3VWXA 4F9ZA 3KH7A 3ZMLA 1TXXA 2X99A 2R2JA 2JZTA 3M8NA 2IJYA 2L4QA 1VF4A 2DMLA 1X5DA 2HLSA 2V6KA 3ME8A 4AJ7A 3E3EA 4OO4A 3UEMA 1EV9A 4JU5A 1ZL9A 1A0FA 1N2AA 1R7HA 3UJ1A 4I8BA 6GSTA 2HI7A 1G6YA 2A2RA 5DAKB 4IW9A 3QD9A 3A2VA 1UN2A 3GKXA 4TR0A 1W89A 4LLRA 4TN8A 5IMAA 3LYPA 2HZFA 2JSYA 1XXUA 2C0EA 5DCHA 2PVQA 2H6ZA 4KDUA 3VI7A 3DEXA 4XTSA 2HSYA 2R3XA 2JZSA 5J9CA 4GQCA 4TR3A 4OFMA 5JWQB 4V2LA 3HYPA 1MDKA 2VL2A 4IQ1A 2H01A 3WD6A 3APOA 2RUFA 3QAWA 1F6MC 2CAQA 5ELGA 4QQ7A 4KUNA 2E7PA 1FHEA 5IIZA 2VIMA 2QSIA 1A2LA 2IFQB 2H0GA 3EMXA 4IQAA 2Z9SA 3UVHA 1GULA 4ECJA 4NWYA 3ED3A 3LJRA 3KD0A 4GSSA 4OCFA 3FW2A 4KE3A 1U6TA 4GSNA 1LU4A 5IPGA 1TK8B 3DWVA 3ZL5A 4POKA 22GSA 3HJMA 2IPAA 2F8AA 1ON4A 5EVOA 3IXRA 4PNGA 1DSBA 2MBSA 2H74A 1ST9A 2C8UA 3LSZA 4TRXA 1EEJA 3JCML 1OVNA 3TJGA 5D93A 3F9UA 3UVTA 2CVDA 3TKRA 5CNWA 3SBCA 4L5OA 5A4UA 4HS1A 2CX4A 3GX8A 2LSTA 1BAYA 5D96A 1GLPA 1ERWA 4MH2A 1G7EA 4OWYA 4N10A 1A0RP 2TRCP 2FWEA 3DGQA 2LRNA 1T8EB 1K3LA 3RHBA 4ISDA 1EV4A 1T3BA 3KM6A 2K18A 3TOTA 1GTUA 4Z7XA 1Q4JA 2B1LA 3HZ8A 3KH9A 3ZTLA 4PQ1A 2MBTA 5F8BA 3LYKA 2AAWA 2PERA 1YY7A 3L9UA 3GV1A 3HHVA 1THOA 1TRSA 4ZBAA 4NV5A 2NPBA 5F0GA 1W4VA 1K3OA 3GA4A 4IJ3A 1OC8A 2FD3A 1EOHA 5CYYA 1G7OA 4WR5A 2FHEA 1M7TA 4KH7A 3IK9A 3ME7A 2H73A 2XHFA 2TIRA 2F9SA 3D5JA 2J9HA 2V6OA 1FOVA 3VWWA 1B9YC 3VURA 2MMOA 1TK5B 3RPPA 2GVPA 1U3IA 5JCGA 1NHOA 4TXVA 2D2ZA 1AC1A 3HKRA 2CAIA 2CZ2A 2CVBA 3ZMKA 3I69A 4ULXA 1K0MA 1KEBA 1KBNA 2R5GA 4MPGA 1TI3A 1F3BA 3GMFA 2C3TA 3UOMA 2G0FA 2FLSA 4TR1A 2FWHA 4GTUA 1T1VA 2H76A 5HR0A 5ELAA 2R37A 1GSUA 1EZKA 4POLA 1FO5A 1AIUA 1S3CA 3ZIVA 2PMTA 2PGTA 1WOUA 5GAND 3GL5A 4E8EA 1O73A 2VCXA 2MYGA 2OE0A 3K8NA 5DJMA 3FK8A 2DJ2A 20GSA 2JSZA 4XCSA 2JACA 3SWLA 2B5XA 1WMJA 3QMXA 3IV4A 1TU7A 3A2XA 2ALBA 1OC3A 1PL1A 3WT2A 2F51A 2KP2A 4J56E 1OE7A 2O8VB 2YPMA 1K0AA 4IP6A 3HVSA 5DCGA 2VCZA 3WGEA 2FNOA 4KNDA 5H5RA 1EP7A 1GL8A 1QUWA 2IMKA 3APSA 4GWRA 2WULA 11GSA 5KN1A 5JCWA 1SK0A 1YEPA 2A4VA 5CREA 3C8EA 1K0NA 3KP9A 1X0RA 4RQRA 1GTIA 5CO3A 1SL0B 1XVWA 1OKTA 5G5FA 2B7KA 4TR4A 3W8SA 3TCOA 4LL1B 4FIWA 2K9FA 4ECIA 3EU4A 1YZXA 4PQHA 5AIXA 1RW1A 4CDOA 4NHZA 4HU9A 1X5EA 1F3AA 2N5BA 1WP0A 4CHSA 2N5AA 2O7KA 4N11A 1GLQA 1A23A 2HFDA 2IN3A 3W8JA 5CRWA 3TJJA 4HOJA 4HJ2A 1TK0B 1V40A 2L6DA 3QPMA 1X9SB 2PPTA 4HZ4A 1VGLA 1XWBA 1BEDA 1M2AA 2PBJA 2C0FA 2GQKA 1RQMA 4F2IA 2I81A 2CQ9A 2LTKA 1GSSA 4V1Ag 2YWNA 4DSRA 4ILFA 3VWUA 1ABAA 2C80A 4N0VA 4J2FA 2LNSA 3GFKA 1MTCA 2LUSA 5FT3A 1FAAA 1BYEA 2EC4A 1OC9A 5DALB 3MAKA 3GTUB 4MH3A 1M9AA 1TP9A 2L6CA 3HCZA 3RAZA 4K2DA 4MDCA 2O87A 3V1WA 1SU9A 3A2WA 3RPNA 5ECPB 3Q19A 1Q98A 1E6BA 1SKWB 4ZBBA 4LA1A 2FY6A 4MJAA 2I1UA 3GSTA 5A4WA 2H19A 1TDIA 4DSSA 3DD3A 3G7YA 1HYUA 3TJBA 4JR6A 1YQ1A 1AUCA 4ZB9A 3GYKA 4YAPA 3DVWA 1F37A 1Y6EA 4EDZA 1PKWA 2LEGA 5GAPD 1N8JA 2GTUA 1ZCPA 4XIHA 2YCDA 5HR1A 1OYJA 1TRWA 1XW6A 2WB9A 2H6YA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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