The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
93
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sequence length |
359
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structure length |
313
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Chain Sequence |
EILEEEAEVDELKSPESVVQLLHIDPIEFEFGYGLIPLADANQGGDLLDRIVMIRRQLALELGLVIPVVRIRDNIALQPNEYRLKIKGNEVAKGELLLDHYLATVVDPASVVSTHITEKIKQHAHELIGRQETKQLIDHLKESYPVLVEEVTPNPLSVGDIQKVLAKLLKEKVSIRNLVTIFETLADYGKLTTDSDLLTEYTRQALAKQITAQFAKENEVLKVVTCSGRVEKAIADGVQYLSLEPDISESIVRSVAKEAEQLSLRQETAILLCSPPVRMYVKQLLERYFPDLPVLSYNELEANVEVQSIGVVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
FlhA provides the adaptor for coordinated delivery of late flagella building blocks to the type III secretion system.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Flagellar biosynthesis protein flhA
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| molecule tags |
Protein transport
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| source organism |
Bacillus subtilis
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| total genus |
93
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| structure length |
313
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| sequence length |
359
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-04-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Glutaredoxin | Glutaredoxin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2X4A A; 3LW9 A; 3MIX A; 3MYD A; 3A5I A; 2X49 A; 4A5P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OFN A; 1U87 A; 3N9J A; 1GSY A; 5E4W A; 1A24 A; 1TKD B; 4GSN A; 4JU5 A; 2MBT A; 3F63 A; 4RUV A; 1B4Q A; 2JL4 A; 5HFK A; 5DVB A; 2H01 A; 1XG8 A; 4V1A g; 4PNG A; 1GL8 A; 2H8L A; 1I5G A; 4HUA A; 2F9S A; 4L0U A; 4LA1 A; 1XPV A; 3EC3 A; 4MNN A; 3TCO A; 2B7K A; 4IEL A; 1BX9 A; 2HSM A; 1HNB A; 2DMM A; 5LCZ A; 1M3J A; 3FHK A; 2GSQ A; 1ZYE A; 3HJO A; 4K2X A; 4ZXG A; 3TKR A; 1MEK A; 1MD4 A; 4QL9 A; 3HCZ A; 3LW9 A; 2TRX A; 4IJ3 A; 3CRU A; 1R4W A; 2DC5 A; 4KW6 A; 3ZIJ A; 3IE3 A; 4ZB6 A; 2LNT A; 4KSO A; 4BA7 A; 1AXD A; 2GGT A; 4K9Z A; 1T7P B; 4BVX A; 1E6B A; 3DKS A; 3IOS A; 1OAZ A; 3KMO A; 4X43 A; 5EY6 A; 3GHA A; 4TVE A; 4MA9 A; 3RDW A; 3QFA C; 1B9X C; 2X99 A; 1XZO A; 3TJG A; 2B1K A; 4KE3 A; 5B8A A; 1BQ7 A; 2FUG 2; 4X1U A; 2BJX A; 2H0H A; 3MSZ A; 2MYG A; 2FHE A; 2R2J A; 2K18 A; 4HU9 A; 4PXO A; 5E59 A; 2M46 A; 2QSI A; 2DKI A; 2GDR A; 3FZ4 A; 1O85 A; 4ZBB A; 1DE1 A; 2MBS A; 3ZFL A; 1KTE A; 2GZZ A; 1DUG A; 4FO5 A; 2HLS A; 1R5A A; 5KOW A; 1GTA A; 2K8V A; 4EC0 A; 3ZRD A; 3C73 A; 1R5P A; 4KDY A; 5G30 A; 1TK0 B; 4IVF A; 3ZML A; 3IRA A; 1XWK A; 5CRH A; 2I3Y A; 3CMI A; 4Z2R A; 4KCE A; 4IQA A; 3IBH A; 5AIS A; 2VL2 A; 2PGT A; 4KSM A; 4K1F A; 1EV4 A; 1PKZ A; 5HR1 A; 2C3Q A; 2X8C A; 5CRE A; 3ED3 A; 3EMP A; 1F6M C; 3GKK A; 5KN1 A; 1M2D A; 1SKW B; 1OVN A; 4FYB A; 2WUL A; 3EMX A; 1TRS A; 1THX A; 3UJ1 A; 1FOV A; 1Q4J A; 3D4T A; 2DIY A; 2GT6 A; 2FWG A; 1Q98 A; 4RI6 A; 2PVO C; 1RW1 A; 4G0I A; 3TKQ A; 1M0U A; 1Z6M A; 2M72 A; 4ECI A; 1X5E A; 1ZOF A; 2DIZ A; 3IXR A; 1GRX A; 1PL1 A; 3LJR A; 4OCE A; 3JCM L; 2AYT A; 3CXG A; 2OA7 A; 4N11 A; 3BCI A; 1K3Y A; 2H1G A; 1J0F A; 12GS A; 3ZYW A; 1NM3 A; 1EEM A; 2V1M A; 1YJ6 A; 1TK5 B; 3MAK A; 5DAL B; 3HJP A; 4BL7 B; 2ES7 A; 4JZQ A; 1NSW A; 1ON4 A; 1YKA A; 4ZIJ A; 2CVK A; 1LU4 A; 1ZYQ B; 1RK4 A; 1JZW A; 3FR6 A; 2IWT A; 3PH9 A; 3ISO A; 4TN8 A; 5GST A; 1PFO A; 5D9X A; 1SYX A; 2HRF A; 3D21 A; 3EVI A; 2VLV A; 2VOC A; 4PGT A; 4MPF A; 3TGZ A; 2WRT A; 3ME8 A; 1X9W B; 2LQO A; 4RQR A; 5C04 A; 2WB9 A; 4CHS A; 2L4Q A; 1PQN A; 1JHB A; 4GXZ A; 1MDI A; 4BWQ A; 3BOA A; 2EIR A; 3G7J A; 3KP8 A; 2WDU A; 4TW5 A; 3J7Y b; 2P0G A; 1OE8 A; 2B6M A; 3HYP A; 1FW1 A; 4G0K A; 3ZFB A; 3GFK A; 1HQO A; 2B3S A; 2C3T A; 4EDZ A; 3TOT A; 4IJI A; 4HZ4 A; 4AF2 A; 4ACS A; 3KCM A; 4RQX A; 4OO4 A; 4KDX A; 4E8H A; 1U3I A; 1GUK A; 1IYI A; 3FR3 A; 5DCH A; 1GWC A; 4EF0 A; 5A4W A; 4PQH A; 1DE2 A; 1GUM A; 4TRX A; 2DJ0 A; 4MAB A; 1K3L A; 2VL2 C; 5G31 A; 2IFQ B; 4XS4 B; 4H86 A; 4BWS A; 1A8L A; 2O87 A; 3KP9 A; 1WIK A; 1M2B A; 3P2A A; 5CP1 A; 2F8F A; 2A2S A; 2H19 A; 2DKH A; 1O6J A; 1XIY A; 2X64 A; 3IAM 2; 4XRD A; 2VCV A; 3HVX A; 3EE2 A; 3M8N A; 3GTU B; 3P90 A; 2N5A A; 4G10 A; 2HSH A; 1K0D A; 4K5R A; 1OYJ A; 5JCU A; 3H1N A; 4IN0 A; 2VLT A; 1QXH A; 1GSF A; 1M9B A; 1X9M B; 1O8X A; 2J9H A; 16GS A; 1PN9 A; 1GLQ A; 2HRA A; 1DBY A; 1WMJ A; 4DSS B; 3ERF A; 5L71 A; 2EIO A; 4KDU A; 4J57 E; 4MF7 A; 1SYR A; 3C1S A; 1VGL A; 3CSI A; 4Q5R A; 2AB6 A; 2ZCT A; 1G6W A; 4GLT A; 1O81 A; 1V57 A; 5DCG A; 1OE7 A; 3PPU A; 3TOU A; 2KHP A; 3I43 A; 4GQF A; 5DAL A; 2O7K A; 2R3X A; 1GTI A; 1T00 A; 2FWE A; 2KOK A; 3WGX A; 3LOR A; 2VCX A; 3LSZ A; 3GH6 A; 5G5E A; 1G7E A; 1GLP A; 5ELG A; 5IPH A; 2YZH A; 2MMA A; 1PX6 A; 1Z5Y E; 5F07 A; 4JR6 A; 14GS A; 4MZW A; 4V2L A; 3VI7 A; 1OC3 A; 2HSY A; 3H4K A; 4WR4 A; 3WGD A; 3L4N A; 3M9J A; 1TTZ A; 3Q6O A; 5JWR B; 2VAF A; 4XTS A; 2GQL A; 3CBU A; 1A2L A; 1J08 A; 5B8B A; 3EU3 A; 5G1L A; 4K6X A; 1ERV A; 1AQV A; 3PIN A; 1YEX A; 1A2M A; 1C72 A; 4KH7 A; 4KA0 A; 1AW9 A; 4L5L A; 5ID2 B; 1XCC A; 1XBS A; 1HD2 A; 1K3O A; 2DJ1 A; 4KX4 A; 1TK8 B; 3GN3 A; 2L57 A; 11GS A; 3Q19 A; 3DGQ A; 4MK3 A; 2FD3 A; 1MDK A; 5J3R A; 2YN1 A; 4BPY A; 3F4T A; 3GKN A; 2YPM A; 4IGJ A; 1A23 A; 1ZMA A; 5ECQ B; 2VUP A; 2CAQ A; 4GTU A; 1S3A A; 4NV5 A; 4OFT A; 3GST A; 2IMF A; 4EO3 A; 3GA4 A; 3APS A; 4MJA A; 3DXB A; 1JZD A; 5J5N A; 3G7Y A; 1CQG A; 2O8V B; 3IPZ A; 3UVH A; 1WPI A; 3I69 A; 4MLY A; 3NOF A; 2VO4 A; 2IFQ A; 1FB0 A; 4K5S A; 4XS4 A; 4Z2U A; 2PBJ A; 4ZBA A; 3IHG A; 5ECI B; 1K0C A; 2RII A; 5BMU A; 4XHM A; 3Q74 A; 3DVX A; 3TKS A; 3CSH A; 4TXO A; 3CSJ A; 5B6N A; 2LJR A; 2VCQ A; 2XBI A; 4F82 A; 3GTU A; 5G2Z A; 3DIE A; 4XIH A; 2YJ7 A; 4YKF A; 4I2T A; 6GSV A; 2VCT A; 3DML A; 2YWN A; 1TP9 A; 1ZYN A; 1EGO A; 1FO5 A; 1PN0 A; 1V98 A; 3FEU A; 1XW9 A; 1XW6 A; 2P31 A; 1ERW A; 2PPT A; 1TDI A; 3LFL A; 2LST A; 3EUR A; 4DSS A; 3GSS A; 3DVW A; 2C0D A; 1OKT A; 2YWO A; 2AAW A; 4WXT A; 3L0H A; 1AUC A; 2LRN A; 3U5R E; 2E2G A; 5EL8 A; 4IQ1 A; 6GSW A; 1YQ1 A; 4TR1 A; 3EU4 A; 4GSS A; 3KMN A; 3FKF A; 4BVY B; 4EDY A; 9GSS A; 4KUN A; 4NXI A; 1FOH A; 4F9Z A; 2PER A; 3ZLP A; 2Z9S A; 1Y6E A; 3GYK A; 3AY8 A; 4Z7X A; 1QK8 A; 2VIM A; 2DSA A; 2OAD A; 3VPT A; 5G1K A; 2P5Q A; 1EZK A; 5DAK B; 4LL4 B; 1VRS D; 1TRV A; 4DEJ A; 4KND A; 4X4J A; 3FZ9 A; 4G0L A; 4HI7 A; 8GSS A; 3FK8 A; 3F6D A; 3NIV A; 4MDC A; 2LRT A; 1F9M A; 1GUL A; 2DBC A; 4KF9 A; 3VPQ A; 3TKS E; 1M7T A; 4YQV A; 1QQ2 A; 4O7H A; 3H8Q A; 2FA8 A; 1W89 A; 4FQU A; 4NV2 A; 1A8Y A; 2KUC A; 5ID2 A; 1VF2 A; 1PSQ A; 2E0Q A; 2H6Y A; 1ZZY A; 2DJK A; 3MDK A; 2HZE B; 3WYW A; 4LLR A; 1AAZ A; 1HYU A; 1S3C A; 3I9V 2; 3UL3 A; 1SK0 A; 3MNG A; 4DSR A; 5ECH B; 5ELA A; 3O6T A; 2IIY A; 3FW2 A; 2RUE A; 2PMT A; 2WGR A; 10GS A; 4WEY A; 4JR4 A; 1W4V A; 1XW5 A; 3M9K A; 3KIJ A; 4YQM A; 5IOX A; 3L9S A; 2VL9 A; 3GUS A; 4LMW A; 1KNG A; 2IJY A; 4PUF C; 3ZIT A; 3C8E A; 3ZVJ D; 3QOU A; 2C0G A; 4WET A; 1HNA A; 4K7I A; 2GTU A; 3M0F A; 2VD1 A; 3N5O A; 2LEG A; 4N0V A; 2IL3 A; 3TKS C; 2R0C A; 5J9C A; 2GLR A; 3ERG A; 4F0B A; 3S9F A; 2B5Y A; 1OC9 B; 2DML A; 4YQU A; 4EKZ A; 2NDO A; 4AGS A; 2C80 A; 13GS A; 3GNJ A; 4ZB8 A; 2XBQ A; 3G7I A; 3F3R A; 3IC4 A; 5JWO B; 2A2R A; 2CX4 A; 4ZBD A; 4HQS A; 2V6K A; 1EOG A; 4Z2T A; 2IME A; 1TRU A; 2FA4 A; 1NHO A; 4Q5Q A; 3UIW A; 1TI1 A; 1K0N A; 4MMM A; 1U6T A; 4F03 A; 3D0Z A; 4ZL9 A; 2J23 A; 3HXS A; 4KCA A; 5GZZ B; 2FWF A; 1B4P A; 1SL0 B; 2A2P A; 2C0E A; 1GSS A; 4N30 A; 2L59 A; 2YWI A; 4ILF A; 2GSS A; 1ABA A; 1M2A A; 4Q5F A; 4NWY A; 3IAS 2; 3LG6 A; 2PN8 A; 1TU8 A; 2WS2 A; 2A4H A; 4O5R A; 4BVY A; 4HJ2 A; 3A3T A; 1SEN A; 2D2Z A; 3VUR A; 1BED A; 5F06 A; 2PUK C; 5F05 A; 3HJM A; 4JBB A; 1URM A; 4O32 A; 2C0F A; 1TJD A; 1Z9H A; 4L8E A; 4ULX A; 3KTL A; 5A5K A; 2GSR A; 1QMV A; 2B1L A; 19GS A; 2GT5 A; 1TW9 A; 22GS A; 3HA9 A; 3VWX A; 2MMO A; 4OWY A; 3A2W A; 1PL2 A; 5CYY A; 3BD2 A; 2XHF A; 1ERU A; 2R0G A; 3BJ5 A; 1ZCP A; 1K0M A; 1K0O A; 5C00 A; 3F0I A; 4MJB A; 4ZIL A; 3DWV A; 3GKM A; 1FAA A; 3KD0 A; 1F37 A; 5AIV A; 2OE0 A; 1UA5 A; 3DD3 A; 2C8U A; 5EPF A; 2IMI A; 2JSZ A; 2HFD A; 1GH2 A; 1MD3 A; 1A2J A; 3LXT A; 3VWU A; 2A4V A; 1T1V A; 1LJR A; 2CVB A; 3RPP A; 5IMC A; 3W6G A; 18GS A; 7GSS A; 4QQ7 A; 2OKA A; 3FR9 A; 5IO0 A; 3O76 A; 2GZY A; 3FYG A; 1B8X A; 1B9Y C; 2I4A A; 5CNW A; 4POB A; 1XFL A; 4USS A; 2KP2 A; 2YV9 A; 4ECB A; 5F0G A; 3HVV A; 4GCI A; 5IIZ A; 2G0F A; 2OBI A; 3ERW A; 4TKY A; 5CO3 A; 1T3B A; 4IKH A; 4IHU A; 1QGV A; 3SBC A; 3IR4 A; 3QAV A; 4AJ7 A; 5D9W A; 5ABR A; 2G2Q A; 4LL1 B; 5D9V A; 1KBN A; 1XWB A; 1IYH A; 4CY6 A; 3DEX A; 1U3A A; 1XXU A; 4MZB A; 2ON7 A; 4HEA 2; 2CV4 A; 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