3NZNA

The crystal structure of the glutaredoxin from methanosarcina mazei go1
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
SNAVNLFGQKDRGNHVSGVDRGKVIMYGLSTCVWCKKTKKLLTDLGVDFDYVYVDRLEGKEEEEAVEEVRRFNPSVSFPTTIINDEKAIVGFKEKEIRESLGF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of the Glutaredoxin from Methanosarcina mazei Go1
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Methanosarcina mazei
total genus 27
structure length 103
sequence length 103
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3nznA00
2WULA 2CA8A 12GSA 4ZL7A 1ZZYA 1SD9A 2VL9A 2F8AA 3HZ8A 3KTLA 4KDUA 4ZILA 3EWLA 4CHSA 5GAPD 4BVXA 4IBPA 2JADA 3ZTLA 2KHPA 1GUKA 1H75A 2H19A 2O89A 3M3MA 1MEKA 4I6XA 5INYA 1MD3A 2REMA 1XWAA 2IFQB 1VF4A 4FYBA 4PXOA 2D2ZA 3BD2A 2P5QA 1GUMA 4DVCA 3IXRA 3KZQA 1EP8A 2NDOA 4F9ZA 3V1WA 1GLQA 3L9SA 1BX9A 5ECMB 1U87A 4PUFC 2YJ7A 4FIWA 5H5QA 2IL3A 5ECHB 1OC9B 3I43A 2XPDA 4TR3A 3KXOA 4G10A 1EV9A 5GAND 2H1GA 1FB6A 4KX4A 1BAYA 1V98A 3TJKA 3FW2A 3FR3A 1UVZA 2ALBA 4V2LA 4LMWA 1A0FA 4I2UA 1GSSA 2C3TA 3GURA 2DIZA 3IR4A 3L78A 2B5XA 3QR6A 3Q19A 2IMDA 4N30A 1YF0A 2DSAA 1BEDA 2JU5A 1SU9A 4ML6A 5ECPB 4DSSA 3FKFA 4XTSA 4KAEA 1THOA 4MP4A 1PD21 5G5FA 1CQHA 3KTBA 3KMNA 3TKPA 5IO0A 2LSTA 1GNWA 3A3TA 4XS6A 1TI1A 5IPHA 2VCXA 2MMOA 2GZYA 1M2AA 5A4VA 13GSA 1WWJA 3MAKA 2N5FA 1TRWA 4ZBDA 2GQLA 4PNFA 2GQKA 2V6KA 3HXSA 2KP1A 2HSYA 5DAKB 2VCWA 4IJ3A 5F05A 4IELA 2WB9A 2GSRA 2HSHA 1HQOA 3L0HA 4O5RA 4G2EA 3ZVJD 2H70A 3HVSA 2WRTA 1QFNA 1FVJA 4RQXA 4K1FA 4IHUA 3IDVA 3O3TA 1J08A 4E8HA 4KDYA 1TJDA 3GH6A 1V57A 3M9KA 3F3RA 3QCPA 4FYCA 4RI6A 3GX8A 3C7MA 3GKNA 5DJLA 1JZDA 3PR8A 5CRGA 1Y25A 2V32A 3DWVA 1N2AA 2N5BA 3KEBA 1ERWA 4ZBBA 1M9AA 2FHEA 3ZITA 1EZKA 3CRTA 3J7Yk 2PWJA 2PPTA 1XVQA 2HI7A 4AGSA 2FWHA 1ILOA 1FOVA 3LXTA 4MMMA 4AJ8A 1T7PB 1FG4A 3F63A 2DMMA 2GT6A 2GSTA 4BL7A 1OKDA 2DMLA 3GTUA 5D93A 4K9ZA 3IE3A 1A23A 3F4SA 3EE2A 4BPYA 1PMTA 2O7KA 1T8EB 1K3LA 1NM3A 2MZCA 1PL1A 3RPNA 3ZREA 2KOKA 2K6VA 2M72A 3GN3A 4EDZA 5HR3A 3RPPA 3VURA 3UBKA 4O32A 4EE0A 5C00A 3HVXA 3FZ9A 2DJ2A 9GSSA 2VCTA 2LKUA 4I5QA 1CQGA 3IPZA 2LS5A 2YWNA 4LA1A 1YY7A 4HU7A 1TK0B 4OMVA 2GS3A 5CYYA 3N9JA 1F3AA 3BJ5A 2R4VA 2NVLA 4HJMA 3IBHA 4IQAA 2EIQA 3F9UA 4MZBA 2O85A 3ZLPA 2LEGA 1XWBA 1WJKA 4KSMA 2OADA 2OBKA 1W89A 2WFCA 2DJ3A 1Z6NA 5D9WA 2MYGA 1VF3A 3HJPA 4NHZA 1USBA 4JZQA 2I81A 3JCML 3F6DA 3LORA 1M0UA 3TKQA 1EGOA 2LRNA 3AY8A 4JR4A 1SD8A 4TR1B 5ELGA 1GSYA 1K0BA 2GT5A 5D96A 2YZHA 4XS4A 2YCDA 2CQ9A 2M46A 2OE1A 4Q5RA 1T3BA 2H72A 3P7XA 1G7EA 4MF7A 5F8BA 1GL8A 3US3A 1TW9A 4MPFA 4GRFA 2VL2A 2R37A 3ZFLA 3A5WA 1Q4JA 1SYRA 5DCGA 5ID2A 2OE0A 1GSFA 4YQMA 5E4WA 2JL4A 2H6XA 5B8BA 1YJ6A 1YEXA 4EC0A 4ZB9A 2OBIA 2X8HA 3IK7A 5IO2A 6GSTA 5IOXA 3GH9A 1N8JA 4V2MA 5D73A 3D5JA 2OE3A 4F82A 4MZCA 1F37A 2YWOA 3CSJA 1G0TA 1SYXA 1XW6A 5G5EA 5ECNB 2FWEA 3F0IA 2RUFA 4Z7XA 1X9SB 3UBLA 3APOA 4MPGA 1HNCA 2VL2C 2LNSA 4NV5A 1TXXA 3EMXA 5IIZA 4HZ4A 2I1UA 5ENUA 3A2WA 2MMAA 2VOCA 5CRHA 3GKKA 3KM6A 4ISDA 2ES7A 2LRTA 4DSSB 3E3EA 4YQUA 4IW9A 3ZMKA 3VI7A 5DALB 2H6ZA 5CREA 2O8VB 3HCZA 3WD6A 4Q5NA 1Z7RA 3TUEA 14GSA 3VWVA 1RW1A 3G7YA 4BWSA 2OA7A 3U6VA 2OJLA 1A2LA 4LL4B 2MBTA 2LRCA 3QOUA 4ECBA 1DE1A 2YV9A 4KSOA 1FB0A 4NWYA 4Q5QA 3DYRA 3M9JA 4HDEA 3QFBC 3GIXA 2IN3A 4TR4A 3ME7A 2AB6A 4NAXA 5EY6A 4K6XA 5F06A 1DUGA 1ST9A 3IOSA 1EGRA 1UC7A 6GSWA 3D0ZA 3FZAA 4POLA 3GKMA 5HFIA 1R5AA 4V1Ap 1I5GA 4GLTA 1FHEA 4JR6A 5IMFA 2B5EA 2H76A 2X8CA 2C8UA 4KA0A 3P8WA 2RM5A 1ERTA 3ZIJA 2L59A 3GNJA 1MDKA 2DIYA 4GWRA 4J56E 5A4UA 2YPMA 1GSEA 1YF1A 1GRXA 3C1SA 3C73A 5G31A 5DBQA 3L9VA 4MCUA 4L5LA 3D6IA 2H71A 3TJGA 3MDKA 2HE3A 1PQNA 1C72A 2L57A 3RBTA 1PL2A 2B5YA 4IP6A 1GTUA 1ZMAA 1ERUA 1U3IA 4ZIJA 1TK8B 1U6TA 2LJAA 1PKWA 3M0FA 1TU7A 4Q5FA 1K0AA 5GSTA 3GYKA 4HUAA 4BWQA 3HDCA 5G1KA 4RI7A 2HRNA 3I9V2 4WBJA 2O87A 6GSVA 5FHIA 4PURA 5CP1A 5HFGA 1AQXA 2VAFA 2GSSA 4L5OA 3RHCA 3TB2A 3TCOA 1IYIA 2FCHA 1FW1A 3BBYA 5A4WA 3I6AA 2PVOC 5DJMA 1JZWA 4PGTA 3UJ1A 1R26A 3GMFA 1GTBA 2JSYA 2RM6A 2H0HA 2VUPA 3IC4A 3ZYWA 1O8WA 2CVBA 4TW5A 6GSXA 1MD4A 1SK0A 1GWCA 2YWIA 1ZOFA 3BCIA 2HNLA 5J5NA 1X9WB 1NW2A 3RDWA 2YN1A 3ISOA 5D9TA 2WCIA 3GV1A 4GCIA 1EEMA 4E8EA 1VRSD 4WF4A 4POKA 5HR1A 3UARA 5B8AA 2HT9A 1PA3A 3IK9A 2PMTA 2HYXA 1GSUA 5FT3A 4JE1A 3F8UA 1SKRB 5ECSA 3CTFA 2VD1A 2NBSA 2H8LA 1XW5A 4K7NA 1QQ2A 2M80A 1BG5A 4K8MA 2HZEA 6GSYA 3ERGA 4J2FA 2TRCP 3HJOA 3GL5A 4GSSA 5DQSA 2C0GA 2CAQA 1GTIA 5DCHA 2RLIA 3FR6A 4HEA2 3EU4A 6GSSA 3UEMA 1AIUA 19GSA 2K9FA 3DGQA 3FK8A 1O81A 3ERWA 2OACA 3QDNA 4EL1A 10GSA 4LL1B 2B7JA 6GSUA 1GSDA 4X0XA 4DSQA 3L4NA 5H5SA 3CRUA 2QKEA 2L6DA 4TVEA 4MA9A 1EWXA 3D22A 5J3RA 5ECKB 1Z3EA 2L4CA 4TXOB 1SL1B 1F2EA 2LQQA 3GFKA 2P0GA 1RK4A 1SJZA 2VCVA 5CNWA 4NHWA 3EINA 5JWQB 4IQ1A 3Q6OA 1T4YA 3UMAA 2G2QA 3EC3A 3H4KA 2BMXA 1XOBA 1R7HA 1EOHA 2H30A 3LGCA 4ILFA 1WRYA 5E59A 5CO3A 3OR5A 2JACA 2LJKA 4POMA 2KP2A 1LBKA 3QAWA 1O8XA 1XOAA 5JCUA 1O7UA 2VLTA 4I2TA 4KW6A 3CMIA 4KGIA 4TN8A 20GSA 4NMUA 5AN1A 1A2JA 4EVMA 3TJBA 2MMNA 3D4TA 2RUEA 4WETA 3IHQA 2K18A 3TDGA 4MK3A 1GNEA 2IWTA 2GGTA 1B8XA 5FWGA 1DE2A 3HD5A 4LLRA 1TTZA 3VLNA 3FZ4A 2VCZA 5IMDA 2IMFA 3KJYA 1MTCA 2B7KA 4EF0A 4EDYA 4HQSA 3ED3A 4FO5A 2FWGA 2IFQA 1QUWA 2F51A 1ZGNA 1O73A 2GDRA 3KP8A 3HYPA 2VM1A 3WYWA 4QQ7A 2CVDA 2LQOA 4D73B 1VGLA 1TP9A 2K8SA 3G9BA 3ZZXA 4IJIA 2X8GA 1EEJA 5JCGA 3IV4A 1ZYEA 3IRAA 3LSZA 4KCEA 2YP6A 4MJAA 4OFTA 4MH2A 1OC9A 5KN3A 3GL3A 1HNAA 3FR9A 4O7HA 3F3QA 4YAVA 3TRXA 2KLXA 1K0CA 2H6YA 2EIRA 2BTOT 3G7IA 1HYUA 3LXZA 1LU4A 3C71A 1XIYA 2TIRA 2PU9C 4N10A 2XBQA 5HQPA 3GUSA 1SKSB 4ZB8A 2FUG2 4XIHA 3GRXA 3LEFA 5AIVA 3E9JB 3F6FA 2IMIA 1PSQA 5DQYA 4YQVA 3MNGA 3VPQA 3FEUA 4PNGA 2VLUA 2L6CA 1FVKA 2ZNMA 3G7JA 4JU5A 1RQMA 4OFNA 3NOFA 1OE7A 1S3DA 3ZFBA 1MDJA 4K2DA 2FY6A 3ME8A 3HHVA 1J9BA 2YNXA 3RAZA 1UN2A 4TKYA 3TOTA 4KH7A 1JZRA 3DD3A 4WR5A 5EL8A 5DDLA 5B6NA 2FA8A 2FA4A 1YQ1A 5DAKA 17GSA 2DJ1A 5H5RA 3L9UA 3VPTA 3WGXA 3TGZA 3LQ7A 4I8BA 4OCFA 5CRDA 1E6BA 2IIYA 2B1LA 5IPGA 5EVOA 1WP0A 4KCAA 1OVNA 5KN0A 3PGTA 4K7OA 3WGEA 1V58A 5AGYA 1I9DA 3PH9A 4HU9A 2C0DA 2B1KA 3CSHA 1SENA 3CYNA 2IMEA 4XHMA 3VWUA 2E7PA 2AHEA 1O6JA 5COHA 1S3CA 1SL2B 4ECCA 2L5OA 2CV4A 2XC2A 2C3NA 2B6MA 2V2GA 2VCQA 2LUSA 2AAWA 4CW9A 1XCCA 4EXJA 2I3YA 4LMVA 4N11A 1LJRA 2H66A 4POBA 1NHYA 4WF5A 4OCEA 4HI7A 1KEBA 4PUAA 5G2ZA 2DJ0A 4KDXA 2R2JA 3CXGA 5B7CA 3WT1A 1XPVA 2JZSA 1VF1A 4FYUA 4OO5A 2WZ9A 2EC4A 4RQRA 1GULA 3LJRA 4PQHA 3GKXA 3O6TA 3FRCA 5IMCA 2X99A 1JLVA 4ML1A 4RUVA 2H74A 1R4WA 2GQMA 3ERFA 5J4UA 2PBJA 3HY2A 4EKZA 5ECIB 1K3OA 1ABAA 3IA1A 1XWKA 4MF6A 2XBIA 1Z6MA 4OFMA 3ZL5A 1TKDB 2H01A 3WT2A 4PQIA 4WR4A 3QD9A 22GSA 4AF2A 4L0WA 5JWOB 1SK1A 4V1Ag 1AQVA 3DRNA 1AW9A 2F3MA 2H1BA 2V1MA 1QXHA 1R5PA 4XCSA 1SJIA 1TRVA 2FLSA 2C1YA 5HR0A 1WE0A 4BA7A 3VFIA 3UIWA 4GQFA 2QSIA 4PX1A 3M8NA 4OWYA 3WGDA 3TKSA 1GLPA 2YANA 1T00A 2VIMA 2CT6A 4MABA 1UA5A 1B9YC 1PRXA 1V9WA 1ON4A 2VO4A 5D9XA 3P90A 3DXBA 4XRDA 1WIKA 4IN0A 4MJBA 1ZCPA 2HFDA 1O85A 3GTUB 4TR1A 3QFAC 3W8SA 3CSIA 4F03A 2A2RA 3QAVA 1B48A 1TI3A 3NIVA 2IPAA 4HS1A 3H1NA 1OE8A 1XWCA 1VF2A 3DEXA 2V6OA 2YV7A 3A2VA 3GHAA 2J9HA 1A2MA 5KEJA 2I9HA 1XWGA 3TKSC 3LWAA 3TJFA 5LD0A 5IMVA 5J9CA 4ACSA 4XS1A 2K8VA 3EVIA 4WXTA 2PN8A 1HD2A 4JEDA 4QL9A 1ZL9A 3IAS2 1G6WA 3DIEA 2ON7A 2LV3A 3LYPA 1X5DA 3GX0A 4DSRA 1H4OA 3KH9A 5ECQB 3MWHA 4KNDA 1WPIA 3QMXA 4GSTA 5KN1A 2H0GA 1YEPA 2WGRA 4K0GA 2FWFA 1T4ZA 1MDIA 4ID0A 3KP9A 3H79A 5HR2A 2C80A 2LNTA 2FD3A 3DKSA 1F6MC 1U3AA 2V41A 3SBCA 3ZVJA 1YDKA 1ERVA 4L0UA 1E2YA 4I97A 3PINA 3KGKA 5ECLB 1NSWA 3TKSE 3EYTA 4ZL8A 1KBNA 5HFKA 3UVTA 1W4VA 5D9VA 5DALA 1HNBA 1TRUA 2WJUA 1OC3A 2CAIA 3UVHA 4XS4B 1QMVA 3UAPA 1SKWB 3VWWA 2P31A 5KN2A 1GUHA 2AV4A 2GZZA 2PUKC 4IKHA 1ZYQB 4X43A 2PVQA 2GTUA 2GVPA 4GSNA 5GZZB 4GF0A 4F0BA 5ID2B 4GQCA 2HZFA 3VWXA 1M7TA 3LYKA 1X0RA 3IAM2 11GSA 2TRXA 5AISA 2F8FA 4ECJA 2PERA 4IP1A 1ML6A 1THXA 4NPBA 1BJXA 2I4AA 1OKTA 2H0IA 4BVYA 7GSSA 2XHFA 3ZIVA 1F3BA 2YWMA 1V2AA 4ZBAA 3TRQA 1A24A 1PGTA 1SL0B 8GSSA 5J9BA 4TOPA 2C0EA 2WS2A 3ZMLA 3J7Yb 4IVFA 3APQA 3Q74A 1EV4A 4NV2A 4ZXGA 3S9FA 1K0DA 2ON5A 4PQ1A 1TRSA 2HXKA 4HOJA 1S3AA 3QPMA 1XVWA 3M1GA 4N0VA 1KTEA 4K0NA 2YJHA 5LNKe 4KB3A 1TOFA 5IQYA 1GTAA 3BCKA 4YH2A 5B6MA 2DC5A 2KUCA 2F9SA 4XRAA 1A8YA 5ELAA 2R6KA 1EP7A 2JZRA 5ABRA 1X5EA 4P3YB 4MJEA 1EOGA 3NZNA 5F07A 1URMA 1YKCA 1KNGA 4GTUA 4DEJA 4F0CA 3HZ4A 1NHOA 4G9HA 3SWLA 2AJQB 4MDCA 1YZXA 4TRXA 4K7IA 1B4QA 1X9MB 3W8JA 3CBUA 3VK9A 3HA9A 4WKWA 2A4VA 4AJ6A 5A5KA 2IMKA 3HJMA 3DMLA 3LG6A 2E2GA 4JRRA 2R5GA 3CTGA 3KD0A 4WBRD 5IMZA 1OC8A 2VD0A 2AUVA 1XBSA 3HVVA 2FGXA 1K0MA 3D21A 4X1UA 2CZ3A 4G19A 1AQWA 2R3XA 1XW9A 3FHKA 2L4QA 3W6GA 1BYEA 1SK2A 3N5OA 1A0RP 2CZ2A 3C1RA 4OD7A 4KUNA 1DSBA 2GLRA 3E0UA 4ULXA 2BJXA 4OO4A 1TDIA 4WEYA 1YKAA 1AC1A 2GSQA 5JCWA 1GH2A 1M2DA 1K0OA 2HLSA 4TXVA 5F0GA 2VL3A 2CVKA 4F2IA 3R2QA 1V40A 1XXUA 2C4JA 2LJRA 1AUCA 1XFLA 1J0FA 3H93A 2HRFA 4N0ZA 2A2SA 3FZ5A 3RHBA 3EMPA 2B3SA 5C04A 4O92A 4TR0A 3GA4A 2GZPA 4MJCA 4IS0A 2DLXA 1Z9HA 3TKRA 5D8IA 1JZOA 5IMAA 2C0FA 2Z9SA 3TJJA 5LCZA 3FYGA 1F9MA 2CX3A 2E0QA 2JSZA 2EIOA 4L8EA 3UL3A 3A2XA 4QL7A 1OAZA 3DVXA 4FH8A 1Y6EA 1TK5B 4MLYA 4TXOA 1FO5A 4HQZA 2LTKA 5J41A 3C8EA 3H8QA 2QGVA 1JHBA 4V2NA 1K0NA 1ACVA 2CX4A 2ZUPA 4JBBA 5JWRB 4CDOA 5CRWA 2MMZA 2MBSA 2VLVA 2JZTA 3ZRDA 1Q98A 1M99A 3LFLA 2YOIA 1PKZA 1U88A 1OYJA 3K8NA 4HZ2A 1XZOA 5DVBA 5IM9A 2ZCTA 5L71A 2E2MA 1SJ6A 3F4RA 3U5RE 2HZEB 5IOWA 3GSSA 1JLWA 4GXZA 5ECOB 3D4MA 3KMOA 3P2AA 4MZWA 1PX6A 3BOAA 3KIJA 4ZL9A 2PGTA 2XPEA 2RIIA 2YZUA 3Q18A 1AAZA 4EO3A 1IYHA 2X64A 3GSTA 1DBYA 4IGJA 2N5AA 2P5RA 3UOMA 1PN9A 3I69A 5G1LA 1FAAA 2IJYA 2J23A 1PX7A 5ECRB 3FY7A 4NXIA 3DVWA 4HJ2A 5G30A 16GSA 1G6YA 1K3YA 3F4TA 2WDUA 1T1VA 1WMJA 2C3QA 3HKRA 4D73A 4MH3A 1B9XC 1GP1A 3QAGA 4H86A 3TRPA 4ZB6A 1Z5YE 1Z7PA 2AYTA 4YAPA 2DBCA 3TOUA 2H75A 2QC7A 4ECIA 3MSZA 1BQ7A 3APSA 2DJJA 4EUYA 5EPFA 2H73A 2NPBA 2DJKA 1A8LA 5GSSA 3KH7A 2H1AA 5CAXA 1GSQA 2OKAA 3EU3A 3O76A 2L5LA 4J57E 2NTOA 2VM2A 1TU8A 1M9BA 3VI5A 1JFUA 1WOUA 1QGVA 1AXDA 3EURA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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