3OR5A

Crystal structure of thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein from chlorobium tepidum tls
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
145
structure length
145
Chain Sequence
ADARPTPAPSFSGVTVDGKPFSSASLKGKAYIVNFFATWCPPCRSEIPDMVQVQKTWASRGFTFVGIAVNEQLPNVKNYMKTQGIIYPVMMATPELIRAFNGYIDGGITGIPTSFVIDASGNVSGVIVGPRSKADFDRIVKMALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Chlorobaculum tepidum
publication title Crystal structure of thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein from Chlorobium tepidum TLS
rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family prot
total genus 33
structure length 145
sequence length 145
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3or5A00
4GRFA 4MK3A 1ACVA 3FY7A 5IMVA 3Q74A 3LWAA 1M9AA 1I5GA 4WR4A 5G5FA 1NM3A 6GSWA 5CRGA 5HR3A 2C4JA 2O7KA 1GSYA 3ME7A 5B6NA 5GSTA 2V6OA 2C3TA 3GH9A 3DYRA 2C0FA 2E7PA 3QAVA 3D4TA 5CNWA 3APQA 1JLVA 3FZ5A 4V1Ap 5EL8A 4OD7A 5J4UA 3UBLA 5IOWA 5C04A 1E2YA 4KW6A 4ZL8A 3GKXA 1BEDA 3PGTA 2OBKA 2FLSA 2FY6A 2E0QA 3WGEA 2L4CA 3ZFBA 4DEJA 3V1WA 5A4UA 1TU7A 2VL9A 3DRNA 1M2AA 1SU9A 5AIVA 1Z7RA 4MDCA 4X43A 4K0GA 1JZDA 3VPTA 2JL4A 1NHOA 3TRPA 3HZ4A 4J2FA 4PXOA 1ZYQB 2B1KA 1AUCA 4GLTA 2XHFA 2DJJA 1Z7PA 4MZBA 1Q4JA 4KX4A 7GSSA 3ZLPA 5ECNB 4KH7A 2I9HA 4ZL7A 5GSSA 2VD0A 2FD3A 1GSQA 3QR6A 2KP1A 3DVXA 3GL5A 4GWRA 5ECQB 4YAVA 1JHBA 1Z5YE 3QFBC 1TDIA 3EVIA 1T1VA 1W4VA 1BX9A 5HR1A 2C1YA 5ECHB 2ES7A 2HT9A 1AQXA 1FG4A 1YEXA 1M2BA 2YWMA 2QKEA 4EXJA 4MLYA 5E59A 3D5JA 3TB2A 1F6MC 3DIEA 2GQMA 2CV4A 3GL3A 1G6WA 3FR6A 4IJIA 2GVPA 2HNLA 2ALBA 2X8GA 3WT2A 2J9HA 3BJ5A 3EINA 3LG6A 1B9YC 2JADA 4MPGA 3P7XA 2GDRA 1OC8A 2XPEA 3UOMA 1HQOA 2G2QA 6GSSA 3TJKA 4N11A 3W6GA 1FVJA 4K2DA 3CSJA 5FWGA 5AGYA 4XS6A 4ML6A 2YN1A 1EZKA 2M80A 4XS1A 2V6KA 1O8XA 3NIVA 3HJOA 1FB6A 3FHKA 5KN1A 1WMJA 1J9BA 3VFIA 5HQPA 2IMKA 1BYEA 2OADA 1TJDA 2MBTA 1UVZA 4POMA 2CZ2A 1KTEA 2F9SA 5B8BA 3KM6A 3KIJA 3M3MA 2WJUA 1NSWA 2C0EA 4L5OA 1U87A 2H1BA 1GNEA 5DJLA 1DSBA 3GH6A 2NVLA 4AF2A 4GQCA 2I4AA 2B6MA 1QQ2A 4I97A 1RQMA 2M72A 2H6XA 3J7Yb 2K8VA 5JCUA 2JU5A 1F9MA 1HNBA 4MMMA 4E8HA 4WR5A 2A4VA 3F3RA 2LQQA 4JE1A 2GS3A 1TI1A 3C1SA 3FEUA 3GSSA 4YQMA 1GTIA 1M99A 4KE3A 2KHPA 5DQYA 1V57A 1YQ1A 2A2RA 4PURA 5IIZA 2FA8A 1PL2A 4POLA 3ZMKA 4GF0A 2O85A 2BTOT 1A0RP 5ECPB 3FZ4A 4OFMA 3A2VA 1SKWB 6GSTA 2FUG2 1EV4A 3H8QA 6GSUA 3UEMA 1GSEA 2CZ3A 3ZL5A 1WOUA 3WD6A 3ZREA 2WS2A 5ECOB 1XZOA 2OE0A 4IW9A 4G2EA 2VLUA 2H6ZA 2REMA 2JSYA 3FRCA 3GIXA 1K0BA 1XW5A 2L5OA 1SKRB 1ZL9A 1YKAA 5AIXA 1E6BA 1LBKA 1SL0B 2EC4A 3M0FA 4IN0A 2HFDA 4GSTA 4JEDA 4K7OA 3L0HA 5J3RA 2CVKA 3F4SA 1ST9A 6GSYA 2VCZA 3APSA 1XW6A 3F8UA 1KEBA 5HFGA 2E2MA 3F4TA 4P3YB 4MH2A 1S3CA 4MF5A 4WBRD 3EURA 3IAS2 4L8EA 1XPVA 4WEYA 2GSTA 3R2QA 4HQSA 4XIHA 4PQ1A 5ECKB 3QD9A 1V9WA 2AB6A 2P5QA 2VL2A 4AJ6A 1XVQA 2GSRA 1BJXA 1TKDB 1X9WB 4XS4A 1SYXA 1ZCPA 1M9BA 4KSMA 3TKQA 2YJHA 4OFNA 2HZFA 3C1RA 1R7HA 4NWYA 1K3YA 1A23A 3MWHA 1XOAA 3WT1A 1MEKA 4ZILA 1R26A 2YOIA 4K7IA 1DUGA 3HJPA 2L59A 2OE3A 1GSFA 4BWQA 3S9FA 2GGTA 2NTOA 4L0UA 3WYWA 2HE3A 3U6VA 2IMEA 2LJAA 4CHSA 1SD8A 1TTZA 3DGQA 2K6VA 1GULA 3H4KA 2B5XA 2LRTA 2O8VB 2OA7A 4CW9A 1XVWA 1GSDA 1ZOFA 1WWJA 4IQAA 3CSHA 4WKWA 2LRNA 4X0XA 1H75A 1SKSB 5DQSA 2PGTA 5D73A 3O3TA 2L6CA 5DBQA 4YQUA 3GKMA 4V2MA 1V40A 4IQ1A 2C3NA 3LYPA 2TRXA 3WGXA 5IOXA 4G19A 2WB9A 1A2LA 2B7JA 5AISA 1XWBA 2PVQA 3MAKA 3HD5A 1ZYEA 2OE1A 4ECIA 3LEFA 4E8EA 4HOJA 4TN8A 2NPBA 1ERVA 4K6XA 5G30A 4AJ7A 3IK7A 2ZNMA 3I6AA 5HFKA 1QMVA 4PGTA 2V32A 3BBYA 3TUEA 4L0WA 3FZ9A 1C72A 3KH9A 2WRTA 4EE0A 4TR3A 3N5OA 4LMVA 2H76A 1QK8A 5H5QA 5FHIA 3M9KA 2NDOA 2F51A 14GSA 1TP9A 2DC5A 5B7CA 1F3BA 3US3A 2XPDA 4ZB9A 1TK5B 4XRAA 2H70A 4ZB6A 2JZSA 3IBHA 2GZPA 3VK9A 2R37A 4WF5A 2FWHA 1YEPA 1EWXA 1PX6A 5DJMA 2G0FA 1PMTA 2C80A 3HVXA 3APOA 4KAEA 2PN8A 2TIRA 4MH3A 2YV7A 1GTBA 1PL1A 1WE0A 5JWQB 1HNCA 2DSAA 4KCEA 4HDEA 1ERUA 2EIQA 3FZAA 4Q5FA 3C8EA 3EYTA 4N30A 5A5KA 1K0AA 1X5EA 3GUSA 4HU9A 4ACSA 2GSQA 4MJBA 3L78A 5JCGA 3ZIVA 3VWWA 4RI6A 4ECJA 3G7IA 2HLSA 5JWOB 3RDWA 1YF0A 3IHQA 1OAZA 1FB0A 4LL4B 2VM2A 2IWTA 1ABAA 5CRHA 3TJBA 3G7JA 4H86A 3GMFA 2M46A 1YKCA 3QMXA 3KCMA 2FHEA 1EEMA 1EP7A 4TR4A 1MTCA 1F3AA 1XWKA 1N2AA 4QL7A 4O32A 2D2ZA 3O76A 2AV4A 2DJ2A 5CAXA 3E3EA 4XHMA 3RPPA 4IELA 2IMFA 2H71A 4I2TA 4MJAA 4Q5RA 5F8BA 1BQ7A 5IO0A 3ED3A 4KA0A 1FVKA 1URMA 2VCVA 1TRVA 9GSSA 5LNKe 2FNOA 4MA9A 2P0GA 3QAWA 4EVMA 2YNXA 11GSA 1ZGNA 1XW9A 5COHA 1ML6A 3KTLA 4HJ2A 5HFIA 2XC2A 2WULA 1SK0A 4PX1A 1G7OA 4I5QA 2MBSA 2FA4A 4JBBA 2LTKA 5ECIB 5ECRB 3KD0A 1DE2A 3UJ1A 5F05A 1U3IA 2RIIA 2PPTA 3IAM2 3MSZA 1OC3A 1T3BA 1Z6NA 1K0CA 5CP1A 4D73B 1M2DA 2VOCA 4IJ3A 1GWCA 3QAGA 3KP8A 5G2ZA 1A2JA 4K8MA 2K18A 3GX0A 2RLIA 4NHZA 1CQHA 19GSA 2ZUPA 1V58A 2LRCA 2FWEA 4LA1A 2X8CA 3UIWA 1LU4A 1T4YA 6GSXA 5LCZA 2HRNA 1QUWA 5F06A 1K0DA 2VL2C 3IDVA 4MPFA 3U5RE 4PNFA 4WBJA 1R5AA 2HSHA 2RM5A 16GSA 1QFNA 2H0GA 3UVHA 4WETA 1A8LA 1B4PA 3H1NA 4TKYA 2L57A 1WJKA 5J9BA 3LXTA 3KJYA 3LXZA 1XOBA 1LJRA 4EUYA 4F2IA 4PQHA 4FYBA 5J5NA 1AXDA 1PSQA 2V1MA 2KP2A 3ZYWA 4AGSA 4BPYA 1Z3EA 3IA1A 2H30A 1X5CA 1GLQA 1X9SB 1J0FA 2C0GA 2CQ9A 2HYXA 3J7Yk 5IMAA 5JCWA 4V2NA 2ON7A 3GN3A 2HZEB 1A24A 2F3MA 5DALB 2H1DA 2YZHA 3ZZXA 4V2LA 2LNTA 4I8BA 2AHEA 4IP6A 5F0GA 4FIWA 3A3TA 5KN3A 3F0IA 2NBSA 4YAPA 4WF4A 2CT6A 4K0NA 3L9SA 4FO5A 2BMXA 1RW1A 2XBIA 2YCDA 3TDGA 5CRDA 1OYJA 3FK8A 1J08A 3MNGA 2LJKA 1IYIA 2H72A 5D9TA 4ZIJA 2X8HA 2HI7A 2QSIA 2JZRA 1TOFA 2FWFA 4ISDA 5C00A 3RHBA 4KDUA 4OO5A 2GSSA 4ZB8A 2VM1A 2C3QA 3F6DA 3HHVA 3KMOA 3BOAA 3VI5A 5ECMB 2YZUA 4ML1A 1PKZA 1XXUA 2LKUA 4MZCA 4HEA2 10GSA 4QL9A 4KNDA 2VCWA 1N8JA 1G6YA 3IK9A 1X0RA 2R6KA 2X64A 1R5PA 1JFUA 2JSZA 1TRSA 2PMTA 2PBJA 3UMAA 4ZBDA 1Z6MA 4V1Ag 5EY6A 5H5SA 4EDZA 2GT6A 1AQVA 1OE8A 5ECLB 4HJMA 2MZCA 1NW2A 4POBA 2HRFA 4I6XA 3TKSC 2V41A 5D93A 4PNGA 5H5RA 4ECBA 2GZZA 3HVSA 1AQWA 4EC0A 2RM6A 2IMIA 3GHAA 1O6JA 3K8NA 1A8YA 3F4RA 2DMMA 1HNAA 2CAQA 3MDKA 3IRAA 1S3AA 3RBTA 3CXGA 1OC9A 1A2MA 4O5RA 4IVFA 1O7UA 3L9VA 4F9ZA 1XFLA 1VRSD 1EEJA 3QOUA 3VPQA 1TRUA 5KEJA 2IFQB 4BVXA 3TKRA 2GQKA 1YDKA 3F63A 5AN1A 8GSSA 1JLWA 3ZFLA 4XRDA 5DAKB 1THOA 1EOGA 1WPIA 1THXA 3ZRDA 3D21A 2O87A 4KSOA 1GUMA 4HQZA 2YPMA 2O89A 5GZZB 4KB3A 1T7PB 4HZ4A 2H0HA 2KLXA 2VAFA 4FYUA 2H19A 1OC9B 5ID2B 2QGVA 1OKTA 5FT3A 3GRXA 1MDKA 3LORA 5IMCA 3ISOA 2LS5A 2OBIA 4J56E 3TOUA 5B8AA 3CTGA 2RUFA 4NPBA 4FYCA 1ILOA 3QDNA 3W8JA 5INYA 2HXKA 1SK1A 2EIOA 18GSA 1SJZA 1B4QA 3TJGA 4RQRA 1WIKA 2L5LA 2V2GA 4KGIA 2B5YA 5HR0A 5E4WA 2Z9SA 3UVTA 3VI7A 1OKDA 1I9DA 3EMPA 3QFAC 4OWYA 1DBYA 2DJ1A 4F03A 2WFCA 4JR6A 17GSA 1XWAA 3HA9A 4NHWA 5ECSA 4MJEA 2VD1A 1TU8A 2OKAA 4MF7A 1RK4A 1PA3A 1K0MA 3IR4A 1QGVA 2CX4A 1MDIA 3CRUA 1AAZA 2K9FA 3VURA 5DCGA 4LLRA 4NMUA 2N5BA 3IE3A 2LEGA 2DJ0A 2AAWA 2E2GA 3EWLA 5D9WA 3TRQA 3Q19A 4MABA 2VCTA 4MF6A 4GQFA 2LSTA 2C0DA 5EVOA 1R4WA 2DBCA 2R2JA 3AY8A 1MD4A 2A2SA 1AIUA 5D9VA 3TKSA 2CAIA 2N5AA 1YJ6A 2VIMA 3I69A 4QQ7A 4OCFA 3QCPA 5JWRB 3FYGA 1K0NA 3SBCA 3VWUA 5IO2A 3ZMLA 2H6YA 4Q5NA 2PUKC 6GSVA 3D22A 2DIYA 5HR2A 4BWSA 1QXHA 2XBQA 1U3AA 2B1LA 1T00A 4DSRA 4PQIA 4CDOA 2H75A 2VLVA 3EU4A 1F2EA 22GSA 2H73A 2B3SA 5ABRA 1BAYA 4N10A 3RPNA 4F82A 5A4VA 4LMWA 3ERWA 3GSTA 4EL1A 4K9ZA 2IJYA 1AC1A 5GAND 3LGCA 3TCOA 3LYKA 3M8NA 1M7TA 2H66A 3GTUA 1FO5A 2DJ3A 3GFKA 2ON5A 1Q98A 3HCZA 1EGOA 3F3QA 4MP4A 3TOTA 3NZNA 2VLTA 4TVEA 5KN2A 1MD3A 5D96A 4YQVA 2B5EA 3EE2A 3UAPA 3GX8A 2R4VA 5IQYA 3A2XA 3EMXA 1IYHA 4PUAA 4J57E 4D73A 3A5WA 1VGLA 3VWVA 3RHCA 3KMNA 3HZ8A 4TXVA 2GZYA 4NV5A 4ZBAA 5IM9A 2FWGA 1PQNA 1JZRA 2LJRA 3GA4A 4NV2A 3IOSA 1UA5A 4WXTA 2AUVA 2KUCA 3VLNA 2IMDA 1GNWA 3GTUB 1G7EA 4RUVA 5G5EA 3L9UA 3DKSA 2GTUA 3CSIA 4GSSA 1HYUA 3UL3A 1OE7A 3BCKA 4OFTA 3P8WA 5ELAA 5IMFA 1VF4A 2HSYA 2CVBA 1PX7A 3TRXA 2RUEA 2H1AA 4ZBBA 1XIYA 1O85A 2CVDA 3H93A 1GH2A 3GKNA 3FR3A 1TK8B 4HUAA 4N0ZA 3WGDA 5G31A 1UC7A 3GNJA 3M9JA 4HU7A 5DCHA 2IL3A 1SENA 2H0IA 2VL3A 4JRRA 2MMNA 4O7HA 1FHEA 4IP1A 2ZCTA 5G1KA 5IPGA 1SD9A 4IBPA 4JR4A 1K0OA 1T4ZA 2J23A 2FCHA 3LQ7A 3TGZA 2VCXA 2JACA 4K7NA 1EP8A 2HZEA 3H79A 1Y25A 2LV3A 5DALA 1U6TA 1Z9HA 4IKHA 1WRYA 2N5FA 2QC7A 4TW5A 1PD21 4TOPA 2F8FA 5EPFA 3EU3A 4NAXA 3BD2A 4BL7A 5IMDA 4HS1A 5GAPD 4DSQA 13GSA 2AJQB 5J41A 3E0UA 2AYTA 2H8LA 4F0CA 2CX3A 3D4MA 3ZITA 1EV9A 5KN0A 1KNGA 1GUHA 2DIZA 1VF1A 2IN3A 3CRTA 3TKSE 1KBNA 4EKZA 3D0ZA 3C7MA 5ELGA 1PKWA 3G7YA 2DMLA 3KH7A 4YH2A 1A0FA 1CQGA 1XWCA 5CO3A 4TR1A 2PERA 2YANA 4EO3A 2OACA 3I9V2 1W89A 2LQOA 2VO4A 4ZXGA 3IPZA 3HVVA 1GTAA 4OMVA 1DE1A 1EOHA 4AJ8A 3D6IA 5IPHA 2YWNA 3N9JA 4PUFC 1B8XA 1XCCA 4K1FA 2YWIA 1F37A 5D8IA 2PU9C 3VWXA 4IS0A 1FAAA 1S3DA 2I1UA 1MDJA 2WGRA 3HDCA 3ME8A 5J9CA 5DVBA 1GTUA 3ZTLA 3RAZA 4ULXA 3LFLA 4TR1B 4BVYA 1GSSA 1ERWA 2F8AA 1X5DA 2H1GA 3QPMA 12GSA 3IXRA 4IGJA 4G9HA 5A4WA 3BCIA 2TRCP 4I2UA 1YY7A 5IMZA 4OO4A 1GSUA 1U88A 3ZVJD 1V98A 1Y6EA 1TXXA 3TJJA 1ON4A 1TRWA 3DWVA 3DEXA 2EIRA 4MCUA 5D9XA 4O92A 1SJ6A 3ZIJA 3KGKA 1T8EB 3G9BA 3HKRA 3P2AA 2MMZA 2IFQA 1FOVA 3L4NA 4HI7A 4XCSA 4DSSA 2MMAA 4Z7XA 1VF3A 4POKA 2YJ7A 4KCAA 2GT5A 4IHUA 3Q18A 3FKFA 1XWGA 3A2WA 5DAKA 1GP1A 5CYYA 2KOKA 2R3XA 2GLRA 3HY2A 2I81A 5CREA 1ZZYA 3KEBA 2BJXA 4GCIA 3GYKA 5F07A 3DXBA 3CYNA 5ENUA 1WP0A 4EDYA 1O81A 5ID2A 3Q6OA 1VF2A 1SK2A 4DVCA 3KTBA 3OR5A 4GXZA 1V2AA 3DMLA 1TW9A 2LUSA 3CMIA 1USBA 3KP9A 4ILFA 4JZQA 3M1GA 4ECCA 4Q5QA 4DSSB 2WZ9A 1O8WA 3IC4A 3ZVJA 1FW1A 2VUPA 1NHYA 2YWOA 1B9XC 5CRWA 2I3YA 3DVWA 2GQLA 3I43A 2CA8A 3CTFA 4BA7A 2DJKA 1B48A 2IPAA 1XBSA 3F6FA 4RI7A 2L6DA 4FH8A 2JZTA 2YV9A 1EGRA 3FR9A 2IIYA 3DD3A 1K3LA 4KUNA 4MZWA 3SWLA 2C8UA 1JZOA 2P5RA 1TK0B 3ERFA 4X1UA 1GLPA 2R5GA 3LJRA 2MYGA 3GURA 4MJCA 4XS4B 3PR8A 3P90A 2PVOC 2FGXA 3CBUA 5G1LA 4ID0A 4F0BA 1ZMAA 1BG5A 3EC3A 5LD0A 4EF0A 3HXSA 1SL1B 1GRXA 3GKKA 1GUKA 1SL2B 1H4OA 3UBKA 1OVNA 4XTSA 1AW9A 1UN2A 5DDLA 2P31A 3HYPA 4RQXA 3HJMA 20GSA 3KXOA 3ERGA 1YF1A 4JU5A 1G0TA 3E9JB 3O6TA 2DLXA 1PGTA 3C71A 4TXOA 3LSZA 3PH9A 1ERTA 1X9MB 4GTUA 2WDUA 2H74A 3FW2A 4NXIA 2K8SA 4N0VA 1HD2A 2MMOA 4GSNA 2B7KA 5B6MA 1PRXA 2X99A 3PINA 2OJLA 3TJFA 4L5LA 2L4QA 3GV1A 1SYRA 4TR0A 2VCQA 3TKPA 4LL1B 2WCIA 5L71A 4KDYA 3KZQA 1M0UA 1JZWA 4OCEA 2YP6A 1YZXA 4ZL9A 2H01A 1GL8A 4G10A 2LNSA 3NOFA 4KDXA 1O73A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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