3P7XA

Crystal structure of an atypical two-cysteine peroxiredoxin (saouhsc_01822) from staphylococcus aureus nctc8325
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
GSMTEITFKGGPIHLKGQQINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSDASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an atypical two-cysteine peroxiredoxin (SAOUHSC_01822) from Staphylococcus aureus NCTC8325
rcsb
molecule keywords Probable thiol peroxidase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Staphylococcus aureus
total genus 46
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2010-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3p7xA00
3F4TA 2JACA 5A5KA 5IMDA 2PGTA 3LXTA 2FNOA 5INYA 3MAKA 1O8WA 4ML1A 4ULXA 3O3TA 3CYNA 3BCIA 3P8WA 2OE1A 4KCEA 5D9TA 1O6JA 1KEBA 3G7YA 1AW9A 4OCFA 3VK9A 5ECNB 5AIVA 1XVWA 3RAZA 5J5NA 1GNWA 2H0HA 1S3DA 2MMAA 2PBJA 1QMVA 3Q74A 5ECMB 1S3AA 2PN8A 3A2WA 2N5FA 2FCHA 4WR5A 2HZEA 3GTUB 2PUKC 4IP1A 1K0CA 3NZNA 13GSA 4PQIA 3G7IA 1KNGA 1XOAA 6GSXA 1FW1A 1O73A 4ZB8A 3E0UA 4F82A 1E6BA 2LJRA 3TJBA 2CVBA 4LLRA 3TKQA 1FOVA 2JZSA 4ZBAA 4TR4A 3LYPA 3IAM2 4MJAA 3IOSA 1JZWA 3BCKA 2CZ2A 5HR3A 1DUGA 3FZ5A 2X8HA 1SJIA 2CX4A 2IL3A 3KP9A 3FEUA 4MF5A 2DSAA 2YWOA 1GSDA 4WEYA 2FWGA 3D21A 2GVPA 4RQXA 1TW9A 2VLUA 2FGXA 1WOUA 1MTCA 3EVIA 5F07A 4MH2A 2EIQA 1TP9A 5KN2A 2L5LA 3LSZA 1WPIA 3F6DA 1H4OA 3QR6A 5ECLB 2PVQA 1MDKA 5CO3A 5D8IA 2GDRA 1T3BA 1GH2A 3LORA 1HNAA 3QOUA 3DRNA 2FY6A 5DALB 3GN3A 1TRUA 2VCVA 1ZZYA 1G0TA 3H8QA 4TR0A 2Z9SA 3PH9A 1Y6EA 5HR2A 2WULA 1TI1A 1UN2A 1PMTA 2WB9A 3GX8A 2OKAA 5ECRB 5ID2B 3GKNA 1TOFA 2B5YA 1QK8A 3GFKA 2K8SA 2QGVA 4MABA 2WZ9A 3K8NA 1M2BA 3HJOA 3OR5A 3R2QA 1SK2A 4FYCA 5B8BA 3RHCA 1GP1A 2DMLA 2IWTA 3UBKA 4TXVA 3LFLA 5H5SA 5D9XA 2H0GA 1YDKA 2B7KA 2YWNA 3SBCA 3WGDA 5GZZB 4AGSA 2C80A 3GL5A 3M3MA 3MDKA 5CP1A 4ZL7A 4NPBA 1U6TA 5LNKe 2V32A 4N30A 5GAND 2B3SA 4QL9A 4Z7XA 1ZL9A 2VL9A 3LJRA 4HUAA 5A4WA 2F8FA 1WWJA 1B9XC 3VFIA 5HR1A 4MPFA 3SWLA 2VL3A 4TW5A 1AQXA 4GCIA 3GV1A 1USBA 2H72A 4PXOA 1Z6NA 4WF4A 1V58A 1U3IA 1PKWA 1PQNA 3KEBA 5DVBA 4N0ZA 2D2ZA 3WT1A 1XWGA 4ID0A 1OC9B 5KN3A 4F0BA 2H74A 3ME8A 3FHKA 2C3TA 2DJKA 2DLXA 2YV7A 2VCQA 4RUVA 3IA1A 1AAZA 4KSMA 3L0HA 2AYTA 2I81A 2FLSA 1PSQA 4BA7A 3G7JA 5EVOA 5AGYA 1A2LA 2XHFA 2QC7A 3JCML 4NWYA 5H5RA 5ECQB 1B4PA 2E2GA 2WDUA 1O7UA 4MPGA 1PKZA 2F8AA 4XS1A 2FUG2 4AJ7A 2XC2A 2LV3A 2C3NA 2GT5A 3MSZA 4K7OA 4MLYA 3UARA 2WJUA 1A2JA 3D5JA 1ZYQB 1TU7A 1WP0A 3F9UA 1BJXA 1EP7A 1V2AA 2XPEA 4RQRA 4ZL8A 4LL1B 4MK3A 3IHQA 5G1LA 4JRRA 3J7Yk 2ZCTA 4XCSA 1FB6A 4G19A 1NW2A 1XOBA 4N11A 1PN9A 4NV2A 3HZ8A 4OWYA 1A0FA 1ZOFA 2FWHA 4MF7A 4DSSA 4KNDA 3KIJA 1W4VA 5KN1A 2DIZA 1YEPA 4MDCA 2VM1A 1Z9HA 2QKEA 2H19A 5CRHA 1B8XA 1AUCA 4HU9A 4ISDA 1R5PA 1V98A 3F3QA 3KH7A 1JHBA 1T7PB 1J9BA 1TK5B 2LEGA 2NBSA 1JFUA 5ELGA 4N0VA 3FYGA 3GRXA 5D9WA 3CSJA 1JZRA 4JZQA 4LL4B 4MP4A 4KSOA 4ECBA 2PU9C 3BJ5A 19GSA 4DVCA 1PX6A 1XWAA 2GQMA 3KD0A 2LRCA 2VCXA 2B5XA 3ZRDA 2K18A 1XW5A 2YJ7A 4OCEA 1QQ2A 1FG4A 5J3RA 3HJMA 3TJJA 5EPFA 1EGRA 2QSIA 3KGKA 3UEMA 3FY7A 2GSRA 4F9ZA 4XTSA 4PQHA 3F4SA 1YEXA 2OBIA 2FD3A 3C1SA 3RPPA 2L59A 3J7Yb 3L78A 3EC3A 1RQMA 3P7XA 4KA0A 3APSA 4OFNA 1XZOA 4EVMA 8GSSA 1T8EB 1T1VA 2MBTA 2R5GA 4YAVA 2H75A 3V1WA 1CQHA 3VWWA 5DCHA 3QFAC 4GXZA 1SYRA 2AUVA 4PGTA 2E7PA 3QAWA 1SL0B 2LTKA 4WF5A 2VCWA 3GKMA 4K7IA 4DEJA 2OA7A 4GSNA 4KE3A 5IMVA 1GTBA 3EE2A 4TR3A 4HQSA 4AF2A 5DDLA 2WCIA 4OFTA 1WE0A 3EWLA 4Q5FA 3IV4A 2M72A 4CHSA 2H6XA 2WGRA 4IELA 3DWVA 1GUHA 5D93A 1DE1A 2H70A 4D73B 2H1GA 4HZ2A 3HJPA 1SYXA 5LCZA 1GTIA 2CX3A 2VD1A 1A8YA 2C4JA 2J23A 4V2LA 1XCCA 3CTFA 2E2MA 3L4NA 2C0EA 1IYHA 3NOFA 4POMA 4JEDA 3EMXA 3BBYA 3MNGA 2LQQA 2XPDA 5CRDA 5IPGA 5F8BA 3TRPA 4K8MA 4PUAA 2NDOA 1V40A 2VOCA 1SK0A 1A2MA 5D9VA 1SKRB 2CQ9A 2YZHA 5DALA 5ENUA 1SL2B 1EGOA 3LGCA 4I8BA 4TR1B 4O92A 3HCZA 1VGLA 3HHVA 3W8JA 4HS1A 2GTUA 4MZCA 4NMUA 1V57A 3DEXA 3L9SA 1K0AA 2PVOC 1A0RP 3GMFA 3APQA 3ERGA 1F37A 17GSA 3PINA 4E8EA 4OO4A 3QDNA 5FHIA 3TGZA 2CV4A 2B5EA 3LYKA 20GSA 4WBJA 5B6NA 3ZLPA 3ERWA 1UC7A 4ZILA 3IK7A 4QL7A 1X9SB 4IW9A 3Q6OA 3WGEA 2DBCA 2F51A 3QFBC 5ECKB 1GNEA 4HU7A 1N8JA 2GGTA 2REMA 1THOA 2JSZA 6GSUA 1ZYEA 5AIXA 1URMA 3KTLA 2YNXA 3A5WA 3D4TA 1ZCPA 1U87A 4ECIA 4KDYA 1AIUA 4I97A 1K0BA 4TVEA 4OO5A 1G7OA 1GSYA 3GSTA 4HOJA 3LG6A 5CREA 1LBKA 4KX4A 2YN1A 2HLSA 1XXUA 3IDVA 3GHAA 1GSQA 3CBUA 3CRUA 2DJ3A 4MMMA 3IAS2 2H1BA 4IKHA 2TRCP 3DXBA 1JZDA 1Z7RA 2NVLA 4GRFA 2N5BA 1BEDA 1GLPA 4IVFA 3GYKA 1T4ZA 4F0CA 4ZIJA 4EXJA 4KUNA 5ECHB 2LRTA 1FVJA 2L6DA 3M8NA 2V41A 2P5QA 2HI7A 4FO5A 3VPTA 4EC0A 5L71A 2WS2A 1M9AA 3IE3A 5E4WA 1M9BA 3UVHA 4FYUA 3UIWA 4KW6A 2H6YA 4JR6A 3O76A 5IMFA 1R26A 4ECJA 3HVSA 2MZCA 1Z7PA 3TKRA 1GRXA 1ACVA 2BMXA 2I1UA 3H79A 1OC8A 4K7NA 1PA3A 5EY6A 2IMKA 3D22A 4FH8A 4HZ4A 2FA4A 4NHZA 5DQSA 3DVXA 2K6VA 3E3EA 4N10A 4KAEA 3KMOA 5IOWA 1EEJA 1MD4A 3TKPA 4BPYA 2AHEA 2AB6A 3DMLA 5GAPD 1OE7A 2G2QA 1TTZA 2LJAA 2GSSA 4TRXA 3DVWA 2BJXA 2HZEB 1ON4A 3CMIA 2VUPA 1TRVA 5IMZA 1XW9A 2N5AA 1MDJA 1X5EA 1PGTA 5GSTA 2H0IA 4HJ2A 2CT6A 1XIYA 5G30A 3TKSA 1FAAA 1TRWA 1VF2A 3FZ9A 1T4YA 3GX0A 3C71A 1KTEA 4MCUA 3N5OA 2A2RA 2WRTA 2VLVA 3VI5A 3WT2A 3KXOA 1MDIA 4XRDA 5JWRB 1NM3A 2NTOA 2G0FA 1Q98A 3ZFBA 7GSSA 3IRAA 4LA1A 4EE0A 2X99A 6GSTA 2HSYA 3HDCA 4YH2A 5E59A 2YWMA 3N9JA 1NHYA 1AQVA 3KP8A 1ML6A 4GF0A 2KOKA 1M99A 1GSUA 5J4UA 2IIYA 4WXTA 1M7TA 2H8LA 4V2NA 5KEJA 3CXGA 1SL1B 1HD2A 2OE0A 1KBNA 4NV5A 5F0GA 3DYRA 1M2DA 1JLVA 3O6TA 3M9KA 2ON7A 3BD2A 1NSWA 1AQWA 4X0XA 4WBRD 3FR9A 4O5RA 3ISOA 1K3LA 4G9HA 4BL7A 1UVZA 1ERVA 1OC3A 4YQMA 5G2ZA 2KHPA 2F9SA 4I5QA 5DAKB 10GSA 1G6WA 3TDGA 3VI7A 6GSWA 2I4AA 1QXHA 4KDXA 4MZBA 5JWOB 3FRCA 2O7KA 4F2IA 1SD9A 3NIVA 4EUYA 5ECPB 5HFIA 1XBSA 2H66A 3F6FA 3I43A 4TXOB 1SJZA 3ZIVA 4IJ3A 5JCWA 1Y25A 2P0GA 2YWIA 5A4VA 4WKWA 4GTUA 1J08A 4POKA 4NAXA 4WETA 2LUSA 5IM9A 3ZVJA 1R5AA 3GNJA 1GSFA 5G5FA 1MEKA 2L6CA 4GQCA 2MMZA 5J9BA 3KH9A 3F0IA 2CAIA 2RUEA 1BQ7A 1SKSB 1M0UA 3ZMKA 4YQVA 5IO2A 1EOGA 4IN0A 3F63A 3PR8A 2B7JA 3ZITA 3KTBA 2EC4A 5JWQB 2L5OA 1U88A 2GLRA 1SD8A 2IFQA 1F3BA 1C72A 4MZWA 4WR4A 2HNLA 1X0RA 4IP6A 2X8CA 3EU4A 2VO4A 1YQ1A 2BTOT 4X1UA 3GUSA 3F3RA 1TU8A 4XS4A 3UAPA 4L5LA 2C3QA 4TR1A 5IOXA 1W89A 4MF6A 3L9UA 3ZMLA 3HYPA 1DBYA 4PNGA 14GSA 1EOHA 1X5DA 2H76A 2M80A 1TJDA 3U5RE 1GULA 5IMAA 3TOUA 2GSQA 4PX1A 1UA5A 1XWKA 2PMTA 3VPQA 2O85A 2K9FA 1TK8B 3KCMA 4HI7A 5D73A 5HFGA 2RM6A 2CAQA 2HXKA 5B7CA 3GTUA 4XS6A 1K3OA 4K2DA 1EWXA 3IC4A 3C7MA 1IYIA 4L0UA 1S3CA 2MMNA 2YV9A 2LSTA 2YANA 2IMEA 3IK9A 5IQYA 4IQ1A 2L4QA 1ERWA 1QGVA 4ZB9A 11GSA 1CQGA 1N2AA 2V6OA 4DSQA 3D6IA 2VCZA 3EMPA 3WD6A 6GSVA 1XWCA 2DMMA 4HDEA 1I9DA 3C73A 1O81A 5C00A 2WFCA 2IJYA 2R37A 4J56E 4ZXGA 3APOA 1TXXA 3S9FA 1K0NA 2DJ1A 2F3MA 1T00A 4FIWA 4YAPA 1A23A 4KH7A 5ELAA 2JZRA 5DJLA 4EL1A 3FK8A 4POLA 4J57E 1JLWA 2HT9A 4LMWA 2VCTA 5J9CA 5AISA 2IN3A 3LEFA 1K0MA 1YF0A 1SKWB 2L57A 1GTAA 2PPTA 1EV9A 4Q5QA 3VURA 2VD0A 2JZTA 1THXA 2KUCA 2MYGA 2LRNA 1QUWA 3TKSE 1GSEA 1JZOA 2YOIA 2RLIA 3HA9A 1OE8A 4QQ7A 3GA4A 1F2EA 4OFMA 2K8VA 4PNFA 5FWGA 1V9WA 2CA8A 5CRGA 2GS3A 12GSA 1VRSD 1EEMA 1YZXA 4K9ZA 5ECIB 2R4VA 5ID2A 2HE3A 5COHA 3WGXA 2DIYA 2PERA 2RM5A 5IIZA 2NPBA 5JCGA 5LD0A 1X9WB 5GSSA 5CNWA 1I5GA 1K0DA 1YKCA 4EO3A 4ILFA 2AAWA 3TJGA 5F06A 3IR4A 1Z5YE 3CTGA 1HNBA 3GH9A 4IBPA 1ZMAA 3GL3A 1B48A 1TKDB 2C0DA 2HRFA 3DD3A 1OAZA 4O7HA 1O85A 4MH3A 2X8GA 3D0ZA 3GURA 4XIHA 4CW9A 3A2XA 3ZVJD 4GLTA 2KP2A 1BAYA 1RK4A 2GT6A 2MMOA 4K6XA 9GSSA 3RBTA 5IPHA 1SENA 4YQUA 4IS0A 5FT3A 2IMIA 1EP8A 1XFLA 4NHWA 4Q5NA 3US3A 1J0FA 2H30A 4L8EA 2HZFA 4KCAA 5CRWA 2FA8A 2L4CA 4I2TA 4G10A 3P2AA 5KN0A 1SK1A 2IMFA 3MWHA 3UMAA 2OACA 4GWRA 3D4MA 4AJ8A 1FO5A 1OC9A 1XPVA 3W8SA 1OKTA 4RI6A 5G1KA 1RW1A 1SJ6A 3DKSA 2FHEA 1FB0A 1TK0B 3ERFA 5C04A 1ZGNA 4BWSA 2V1MA 3G9BA 4BWQA 1A8LA 1WMJA 2AV4A 4POBA 2H73A 3QCPA 3HVXA 6GSYA 5H5QA 4JU5A 2MBSA 2CVKA 3ZREA 2B1KA 4ML6A 4TOPA 3M1GA 5DAKA 2R2JA 1Q4JA 3TOTA 1G6YA 4H86A 3KM6A 2HSHA 3CSHA 1GL8A 3QMXA 2GZZA 4ZB6A 4ZBDA 1ABAA 2ZNMA 4TXOA 4CDOA 1GUMA 2E0QA 4PUFC 3UVTA 4ZL9A 4GSTA 2X64A 4OD7A 3QAGA 4K1FA 1SU9A 2KLXA 1PX7A 5F05A 2DJJA 3FW2A 1BX9A 3VWUA 4PURA 4NXIA 2H71A 2AJQB 1VF1A 2A2SA 3EINA 4KGIA 3UOMA 1DSBA 2OBKA 4MJBA 1MD3A 1LJRA 2EIRA 2LJKA 5J41A 1NHOA 4RI7A 3GH6A 4FYBA 2B1LA 4X43A 1WIKA 2VL2C 2B6MA 2DJ0A 1G7EA 3U6VA 4LMVA 2ALBA 4MA9A 3VWXA 2H01A 3TUEA 4L5OA 4HEA2 3I6AA 3KZQA 2HYXA 3HXSA 5B6MA 1ST9A 1AXDA 5CYYA 5ECOB 4EDYA 1F3AA 1FVKA 2GQLA 4MJCA 3LWAA 2ES7A 2LQOA 2VM2A 3VWVA 2R3XA 3GIXA 3HVVA 1B9YC 1PL2A 4EF0A 1K0OA 4V2MA 3PGTA 3LQ7A 4IJIA 5JCUA 3IPZA 3RPNA 3I69A 3TJKA 4BVXA 3DIEA 2I3YA 2LKUA 1R4WA 3M9JA 3H93A 2DJ2A 5A4UA 1YKAA 2IPAA 3GSSA 4PQ1A 3ED3A 2C8UA 4I2UA 2HRNA 1AC1A 4KB3A 1PRXA 1YF1A 4DSRA 2H6ZA 2YZUA 4IGJA 3VLNA 2ZUPA 3TRXA 1O8XA 5DCGA 2M46A 3WYWA 3QD9A 3TRQA 1HQOA 4EKZA 4L0WA 1WJKA 3TCOA 4F03A 1FHEA 1PL1A 1XVQA 1OVNA 4K0GA 3EYTA 2H1AA 2JL4A 2RIIA 1TDIA 1GUKA 22GSA 4OMVA 3GKKA 2YCDA 3FZ4A 4XHMA 4BVYA 4E8HA 4D73A 2O8VB 2C1YA 3TB2A 1F9MA 3TJFA 1QFNA 3UBLA 1OYJA 4HQZA 2DC5A 3CRTA 5DBQA 1U3AA 4JE1A 4EDZA 3QAVA 3LXZA 3ZL5A 3AY8A 3FR6A 3HZ4A 5D96A 1Z3EA 2A4VA 3C1RA 3UJ1A 1OKDA 5DJMA 3H4KA 3EURA 5ABRA 5G31A 2YP6A 1X9MB 6GSSA 2TIRA 1YY7A 4G2EA 2I9HA 4IHUA 4K0NA 3L9VA 1XW6A 3F4RA 3F8UA 3I9V2 18GSA 1TI3A 4I6XA 2PWJA 2O89A 2JADA 4V1Ag 2OADA 4IQAA 3KJYA 4GQFA 2P5RA 3Q19A 3W6GA 2ON5A 1B4QA 3FKFA 4XRAA 2TRXA 3UL3A 1EZKA 5G5EA 5HR0A 1EV4A 2O87A 3HKRA 2V6KA 1XWBA 2XBQA 3FR3A 1GWCA 3E9JB 3P90A 3ZTLA 5HFKA 2YPMA 2H1DA 2V2GA 1F6MC 1LU4A 3QPMA 16GSA 2FWFA 3ZFLA 2GZPA 3ME7A 4AJ6A 3KMNA 4JR4A 1X5CA 2XBIA 2C0GA 3C8EA 3FZAA 1GTUA 2FWEA 1VF3A 2GZYA 2VAFA 1BG5A 1GLQA 3EU3A 1H75A 3RDWA 4ECCA 4MJEA 1DE2A 1M2AA 3IXRA 2VL2A 4TKYA 1BYEA 4Q5RA 2CVDA 5IMCA 3ZIJA 2KP1A 1ERUA 1Z6MA 3RHBA 4ZBBA 3ZZXA 1HYUA 2JU5A 2VLTA 1A24A 2P31A 3H1NA 1PD21 5CAXA 1K3YA 4KDUA 2GSTA 2LS5A 2EIOA 3CSIA 1YJ6A 5IO0A 5DQYA 4DSSB 2LNTA 4V1Ap 4JBBA 2CZ3A 3A2VA 2VIMA 3Q18A 3GKXA 3IBHA 1E2YA 2R6KA 5EL8A 1GSSA 3M0FA 1ERTA 3HD5A 4TN8A 1WRYA 3A3TA 2C0FA 3ZYWA 2YJHA 1ILOA 2GQKA 2IMDA 4J2FA 4HJMA 2OJLA 1HNCA 5AN1A 3DGQA 2J9HA 5ECSA 1TRSA 5B8AA 3BOAA 4O32A 2HFDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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