3PH9A

Crystal structure of the human anterior gradient protein 3
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
133
structure length
133
Chain Sequence
PQTLSRGWGDDITWVQTYEEGLFYAQKSKKPLMVIHHLEDCQYSQALKKVFAQNEEIQEMAQNKFIMLNLMHETTDKNLSPDGQYVPRIMFVDPSLTVRADIAGRYSNRLYTYEPRDLPLLIENMKKALRLIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the human anterior gradient protein 3
rcsb
molecule keywords Anterior gradient protein 3 homolog
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 133
sequence length 133
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2010-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ph9A00
3NZNA 1TRSA 3TKSE 3ISOA 2IMFA 2IJYA 2FUG2 2OADA 1PQNA 5KEJA 3FW2A 1OC9B 2WB9A 3HHVA 1R5AA 1S3CA 4WEYA 2H74A 2HSHA 4IKHA 1K0AA 3TKSA 5A5KA 2K8SA 5A4VA 1OE7A 1KBNA 4PQIA 4FH8A 4XRAA 2CT6A 1XW5A 2WZ9A 3LG6A 2V6KA 4FYUA 3A2WA 3GL5A 4NXIA 1ERUA 4F0CA 2BJXA 2YJHA 4WKWA 1BX9A 4POBA 4L5OA 4BL7A 1ERWA 1ZCPA 1ILOA 4PUFC 4E8HA 5J5NA 2YWNA 4MJBA 1MDIA 1WE0A 2GT6A 2P0GA 4JE1A 5CRHA 4MH2A 3C7MA 12GSA 4XHMA 2CA8A 2L5OA 2V6OA 1JZDA 3L9VA 4XS4B 1ON4A 1WRYA 2HZEA 2YNXA 1EEJA 4ACSA 3ZL5A 2GDRA 3QD9A 2DJ2A 2DBCA 1BG5A 5DJMA 3GSSA 5IO2A 3P90A 2KP2A 1WMJA 4X43A 1XFLA 5COHA 3ME8A 2A2SA 1EGOA 4KDXA 1M9AA 5AIXA 6GSUA 4TXVA 2H71A 4EL1A 2GSRA 2AUVA 1JZWA 4GQFA 4K9ZA 3U6VA 4KDYA 2VD1A 4L8EA 2X8CA 3ERWA 4OFNA 2H1DA 3VPTA 4V2NA 3UVHA 4L0WA 1G0TA 2I9HA 3O6TA 4EC0A 1TRUA 5IPGA 2H0GA 1GLQA 3GYKA 3HVSA 1Z7PA 3CTGA 1B9XC 4IN0A 3GSTA 3CXGA 1KTEA 1VGLA 3UARA 1DBYA 2OE1A 2WRTA 3EWLA 4LL4B 3Q74A 3WD6A 3CSHA 1LJRA 1TOFA 2R4VA 3IK9A 2RM6A 1OC8A 4N0VA 3F3QA 2O7KA 1M99A 1THOA 3ZIVA 4V2MA 2N5AA 4JRRA 1GNEA 2R6KA 1K3LA 2DJ0A 5H5RA 5ECQB 3IA1A 2VAFA 3FR3A 4KA0A 5EL8A 3GKXA 3DEXA 2PWJA 5D9WA 1V40A 4EDZA 2JZTA 2VIMA 3D6IA 5JWOB 3DMLA 3TOUA 1ERVA 1TDIA 2V1MA 3GKKA 4OWYA 4DEJA 1AIUA 2VLTA 3QAVA 2O89A 3LWAA 1SL0B 2H70A 2GTUA 3F4SA 1O8WA 2LSTA 1PL2A 2CZ3A 2L6DA 4YQMA 1B9YC 4BA7A 4KDUA 4ML6A 4IGJA 3ZMKA 5IIZA 4XCSA 1F3BA 2OKAA 1O73A 3Q19A 2FGXA 3US3A 4IVFA 2Z9SA 3CBUA 3EU4A 1WPIA 1NM3A 3ZRDA 2VUPA 1EZKA 1KNGA 2FWGA 2QKEA 3FRCA 18GSA 3FYGA 2K18A 2HE3A 2DMMA 2H0HA 2CX4A 4I6XA 3UIWA 2YZUA 4OD7A 4AJ8A 2J23A 3KMNA 1R7HA 3HVVA 4IJIA 1SYRA 1HYUA 4GXZA 4N11A 4H86A 1N2AA 2DIYA 3HCZA 1QUWA 3G7YA 1GLPA 4EXJA 4WXTA 1QMVA 3RPPA 1ST9A 2CAQA 2YCDA 5D8IA 1O8XA 1F3AA 1V98A 1PN9A 2RUFA 3IAS2 2B3SA 4RI7A 2DJ3A 5IQYA 4D73A 3IRAA 3MDKA 5G5FA 2HZFA 3QMXA 5DVBA 4K0NA 2WDUA 3M1GA 3EINA 1Z6MA 2PMTA 3F9UA 4JR6A 1BEDA 3UBLA 3MNGA 2TRCP 5LNKe 2C8UA 4RI6A 4WR4A 4TN8A 5GAND 2H0IA 2K6VA 1J08A 1ACVA 3R2QA 3A5WA 5IMCA 5GSSA 3LSZA 4ECBA 1JZOA 1T00A 2QGVA 1VF4A 5KN2A 4ZL9A 3TKQA 2HZEB 4KB3A 1FB6A 5HR0A 2YN1A 4MCUA 2LRNA 4POLA 2O87A 3TJKA 4DSQA 5F0GA 4MPGA 2OA7A 2LUSA 1X5DA 3GNJA 3HYPA 1YY7A 3TJFA 3KTLA 9GSSA 3LQ7A 1WP0A 4MA9A 2LJKA 4QL7A 5ECNB 1TJDA 2CVBA 3L9SA 4V1Ap 3EVIA 1TKDB 3P7XA 2VCTA 2H19A 4NV5A 3C1SA 4L0UA 4DSRA 2VCVA 2MBSA 3P2AA 2ALBA 3QCPA 1TRWA 1EV9A 1S3AA 1XOBA 2KUCA 4AF2A 1ZYQB 2BMXA 2YPMA 4O5RA 4XS6A 4K7IA 2ZNMA 3I69A 2VCZA 4NPBA 3P8WA 3FZAA 2AAWA 3LGCA 1Y25A 3FEUA 2RM5A 3O76A 3HZ8A 3APSA 4OCEA 1BYEA 1N8JA 2F3MA 4MPFA 1QFNA 3MAKA 3Q6OA 2B1LA 2X8GA 3TRXA 2LEGA 2DJJA 2YJ7A 3LXZA 4IQ1A 3MSZA 1GUHA 1SD9A 2A4VA 2C0DA 2B5EA 2HLSA 5ECSA 4TXOA 6GSWA 4NV2A 1HQOA 1Q98A 3HD5A 1A2LA 1SK1A 3KH7A 1A24A 3D4TA 2WCIA 3VURA 4ECIA 1JZRA 1QGVA 3I6AA 4QL9A 5DAKA 4F9ZA 2LJRA 1DE2A 3GKMA 2GQLA 2DIZA 3IV4A 4X0XA 3C8EA 5C04A 5HFGA 4J56E 1M7TA 1XWCA 3FHKA 3GN3A 4BWQA 3GURA 3UEMA 6GSVA 4N10A 2MMOA 7GSSA 1A8LA 3BOAA 4JBBA 2M46A 4GQCA 1PSQA 3DGQA 5H5SA 5D93A 1AUCA 4WBJA 5KN3A 1B4QA 4QQ7A 2V41A 2I4AA 4BVXA 4I2UA 1BJXA 1TP9A 3ZTLA 1GSYA 2XPEA 1TK0B 1SJZA 5F06A 5ECHB 3ERGA 2GZPA 2YWMA 5DQSA 4V1Ag 3DVWA 5JCGA 2O8VB 2GSQA 2H1GA 3GX0A 1AW9A 1SJ6A 1GUMA 1YKCA 5DDLA 5JCWA 14GSA 2JSYA 5KN1A 1GSSA 2NBSA 3W8JA 4J57E 1PX6A 4MF7A 1T1VA 3M9JA 2C3TA 2C0GA 3LXTA 4CDOA 4POMA 1MD4A 4F2IA 3ZMLA 5CREA 3LFLA 4CHSA 2EIQA 4HJMA 1A2JA 4IHUA 1SKSB 4FO5A 5DCGA 4MMMA 3E3EA 3IAM2 1YF1A 1LU4A 4PQHA 2JU5A 1M2BA 2ON5A 2P5QA 4WR5A 3LORA 1SKRB 1XCCA 1Z9HA 1F6MC 3VLNA 3CSIA 4IBPA 3ZYWA 2H8LA 2WGRA 2PGTA 1PD21 4HOJA 1SENA 4IS0A 2FHEA 4KH7A 4KCAA 3K8NA 3RHBA 1XWBA 1UA5A 4ZILA 4XTSA 1DSBA 4KSOA 1DE1A 1XVQA 4OFTA 2C80A 2HSYA 2H1AA 3RHCA 4MDCA 1GSDA 4F82A 3I9V2 1CQGA 2PPTA 4OO5A 3I43A 1PA3A 1HD2A 8GSSA 2H75A 1ZL9A 3D22A 5F05A 1Z3EA 4O92A 1AC1A 2MMZA 3ZIJA 1HNBA 3GTUB 2I3YA 3QPMA 3OR5A 4O7HA 4TR1A 2IMKA 3RDWA 1GULA 2NTOA 5J41A 2HFDA 2VM1A 2RIIA 3CYNA 1EWXA 2LS5A 1ZGNA 2F8AA 4NWYA 2BTOT 1XW9A 5CRWA 4WETA 3EURA 1YKAA 2YP6A 2GVPA 1K0NA 4PXOA 4HU9A 2XPDA 4O32A 2WJUA 3HJMA 3NOFA 4KNDA 3W8SA 5IOXA 1K0BA 1E6BA 4I97A 3QFAC 4DSSB 4JR4A 2PUKC 3A3TA 6GSSA 5D96A 2G0FA 5IMAA 1URMA 1S3DA 4K0GA 4MZCA 4OO4A 3QAWA 1SU9A 1OC3A 2E2MA 1PKZA 2FCHA 2H73A 1SK2A 3TKPA 3LYKA 3DXBA 3C71A 1FVKA 2PERA 1YEXA 3BD2A 4WF4A 2LNTA 2MMAA 3WT1A 4AJ7A 5B8BA 5IMZA 1XW6A 1XVWA 3UVTA 3ZFBA 1GSQA 1X9WB 4N0ZA 1O6JA 3H1NA 1H4OA 5ECLB 1GRXA 2LJAA 2L4CA 1TU8A 4HI7A 5ECOB 5ABRA 3DYRA 1B4PA 1AAZA 2WS2A 5CO3A 1YZXA 2OJLA 3KM6A 3G7JA 5D9TA 4XS1A 2REMA 2B5YA 2CAIA 5DALA 5HR2A 5A4WA 1TTZA 1MDJA 4LL1B 4YAVA 1WOUA 2IFQA 2NDOA 4JU5A 3S9FA 1U3AA 1TRVA 3W6GA 1GUKA 3ME7A 5HFKA 1IYHA 2JZSA 5ID2B 2X99A 3DWVA 2GGTA 5IO0A 3EC3A 2YV9A 2KLXA 1X0RA 5G5EA 1MTCA 4L5LA 1H75A 2P5RA 3F0IA 3WT2A 3GIXA 2OE3A 1OC9A 3UOMA 3FZ5A 3VFIA 3TJGA 3IPZA 4KX4A 1M2AA 4ILFA 3UAPA 2N5FA 2TIRA 4MJAA 3NIVA 1J0FA 2AJQB 2C3QA 2RLIA 4K1FA 1T7PB 2H66A 5FHIA 2VLUA 1YEPA 2KOKA 2B6MA 2LQOA 1W89A 5CRDA 1MD3A 4DVCA 3V1WA 3ZREA 2V2GA 2FD3A 5AGYA 2XHFA 3AY8A 1BQ7A 3J7Yb 1SYXA 3HJOA 2PVQA 4EVMA 1V57A 4EF0A 1X9SB 2VCQA 1XWAA 5E4WA 1C72A 1KEBA 4TW5A 4HEA2 4E8EA 4OMVA 3LEFA 4XS4A 1A0RP 2RUEA 3M0FA 4ZIJA 1ABAA 4ZB9A 3D0ZA 5HR3A 4FYCA 3BJ5A 1OAZA 1V58A 1EEMA 4PGTA 5IM9A 3M3MA 4BWSA 16GSA 2H30A 2V32A 5IMFA 1DUGA 3RAZA 3TRQA 4ULXA 1QXHA 5AIVA 2CV4A 2C4JA 3GV1A 4Q5QA 4RQRA 3KCMA 5KN0A 1USBA 2O85A 2PBJA 3F6FA 2YZHA 5CYYA 4FIWA 3QAGA 1SL2B 1EOGA 1EGRA 1NW2A 1EP8A 5E59A 1RK4A 1A23A 1FHEA 2JACA 5ECKB 2CQ9A 2VL9A 2FWHA 3IBHA 4J2FA 2YWIA 4BPYA 2VCWA 1K0OA 3WGXA 3E9JB 4PNFA 4PX1A 1SL1B 4GWRA 4ZL7A 2PU9C 2XC2A 1GTIA 3DKSA 3GRXA 1JLWA 4RQXA 2OE0A 4HU7A 2AYTA 3TJBA 3D21A 2OBIA 2LNSA 3HVXA 1XZOA 4G9HA 1GP1A 3HDCA 2H01A 2AV4A 1VF1A 2C0FA 4MH3A 3ZITA 1K3OA 1CQHA 1JFUA 4OFMA 1G7EA 4KCEA 1IYIA 4X1UA 19GSA 5ELGA 2NPBA 1MDKA 5HQPA 4MZBA 4NMUA 2F51A 1TXXA 1NHYA 3F3RA 1FVJA 1JHBA 1GSEA 3JCML 2K8VA 2GT5A 1J9BA 2GSSA 3HZ4A 5EPFA 3IK7A 4MK3A 2IL3A 1YDKA 1GTUA 1WWJA 1MEKA 3GA4A 5LCZA 2HNLA 2DJKA 1ZYEA 2GQKA 1SJIA 3GHAA 3GH9A 1ZZYA 1U88A 4MP4A 5F07A 1X5EA 1SK0A 5AN1A 2OACA 2WFCA 3IR4A 3MWHA 3GMFA 3O3TA 2FY6A 4YH2A 2OBKA 2VOCA 4G10A 2R3XA 5HFIA 1XWGA 2QSIA 5J3RA 5IOWA 1X5CA 5D73A 2DJ1A 1EV4A 1RQMA 11GSA 2HRFA 4TR4A 5LD0A 4I8BA 4ZB8A 1Z7RA 3QFBC 3QOUA 1TW9A 3ZVJA 1GSFA 2LV3A 1QQ2A 1GSUA 3KH9A 1F2EA 2FA8A 5ECPB 1UN2A 3VI7A 4GTUA 2MYGA 4TRXA 4F03A 2FWFA 2FWEA 4HZ4A 2H6YA 2IWTA 2MBTA 2XBQA 3TB2A 4PUAA 3TCOA 3FZ4A 1ZMAA 20GSA 4HDEA 4HQZA 2HT9A 3M9KA 2N5BA 4KAEA 4PNGA 3ZZXA 5FT3A 2H6XA 3VPQA 3QR6A 3ERFA 3H8QA 1PKWA 1XXUA 1A0FA 5J4UA 3PR8A 1R4WA 4TVEA 5DCHA 4PURA 3VK9A 3HA9A 4D73B 4YQVA 4AGSA 2I81A 5DJLA 4HUAA 3CTFA 2KP1A 3UBKA 1PRXA 5B6MA 3D4MA 1V9WA 2E2GA 3KIJA 2D2ZA 5CRGA 4EUYA 3G7IA 4IW9A 2DLXA 1THXA 2E0QA 2YWOA 4KW6A 3IXRA 5EY6A 1E2YA 4MF6A 4YQUA 2HI7A 2C0EA 2GSTA 2LTKA 3H79A 1XBSA 2F9SA 3U5RE 2A2RA 1I9DA 2H72A 1AQXA 1SD8A 4NHZA 1T4ZA 1U87A 1V2AA 3TOTA 1G6WA 1GWCA 3HJPA 2VD0A 6GSTA 2JZRA 4YAPA 4HJ2A 3J7Yk 3D5JA 3N9JA 3N5OA 3QDNA 3FR9A 4ZB6A 2IMIA 1X9MB 4G2EA 1PMTA 1VF3A 1B8XA 5J9CA 4FYBA 3KZQA 1M0UA 5G1KA 2ES7A 3F4RA 2L59A 4JZQA 1K3YA 5B8AA 4ISDA 1VRSD 2QC7A 3IE3A 4LLRA 6GSYA 5CP1A 4Q5FA 3TJJA 3APQA 1M2DA 2VLVA 5G2ZA 1G7OA 5L71A 2HXKA 4Z7XA 1Z5YE 4K6XA 3KP8A 1A2MA 4TOPA 2YV7A 4XRDA 1M9BA 1K0DA 1VF2A 4N30A 3TDGA 1JLVA 1AXDA 5D9XA 5HR1A 2FLSA 2R37A 3KP9A 2EIRA 5EVOA 1UVZA 1O7UA 1AQWA 4ZL8A 3IHQA 2LKUA 4EDYA 2FA4A 3HKRA 1NSWA 3GFKA 2MZCA 4Q5RA 2B7JA 4ZBDA 3UL3A 3ED3A 2VL2A 4TKYA 1PL1A 2E7PA 2JADA 5IMVA 2JSZA 5DQYA 13GSA 4JEDA 5ECRB 5ENUA 1LBKA 1PX7A 1WIKA 1Y6EA 3KGKA 1XOAA 1OKTA 3CMIA 4TXOB 4LMWA 2CVDA 2JL4A 3FY7A 5G31A 1GNWA 4K7NA 3LJRA 3IDVA 3RPNA 1TK8B 5DAKB 2EIOA 4RUVA 3DIEA 3WGDA 2AHEA 3EU3A 3KEBA 4V2LA 2IMDA 1F37A 3KJYA 1T8EB 2IIYA 2FNOA 4AJ6A 1FB0A 2GQMA 3TKSC 5INYA 2B1KA 2K9FA 3APOA 5B6NA 2R2JA 2YANA 3HY2A 4EE0A 1T3BA 1K0CA 2LRCA 3DRNA 2DSAA 4I5QA 4ZBAA 4CW9A 2X64A 2PN8A 4F0BA 3GH6A 3A2VA 3CRUA 5G1LA 1EP7A 2EC4A 2F8FA 5B7CA 3RBTA 3TRPA 1XPVA 1O85A 1W4VA 3TGZA 1GH2A 4TR0A 4GSSA 1I5GA 1OKDA 3BCKA 1HNCA 22GSA 5F8BA 3H4KA 1EOHA 4IJ3A 1AQVA 2MMNA 1SKWB 2YOIA 4K7OA 5CNWA 3EMXA 5C00A 1FG4A 4GSNA 3F63A 4KGIA 1FOVA 2GZYA 4K2DA 2M80A 1ERTA 3EYTA 3IC4A 1R5PA 10GSA 1XWKA 3G9BA 4HZ2A 3FR6A 2TRXA 3A2XA 2H76A 1PGTA 1U6TA 1TU7A 1WJKA 3CSJA 4LMVA 3VWWA 4EKZA 2L57A 2R5GA 3KD0A 2P31A 2CX3A 4MJCA 4KSMA 1ZOFA 3LYPA 1GTAA 3TKRA 2WULA 3ZLPA 1FO5A 3TUEA 2H1BA 2B7KA 1YJ6A 1QK8A 5D9VA 4OCFA 5GSTA 2AB6A 3F4TA 2GS3A 1YF0A 2CZ2A 4MABA 4HQSA 3F8UA 3E0UA 3PGTA 3C1RA 3H93A 4IQAA 2L4QA 4EO3A 2VO4A 5JWRB 3GTUA 1FW1A 1U3IA 2M72A 1TI3A 1RW1A 1T4YA 2ZCTA 1YQ1A 3SWLA 1GL8A 2VL3A 3ZVJD 1R26A 3KTBA 4IELA 3PH9A 4MJEA 5ELAA 1FAAA 4TR1B 2VM2A 2LRTA 2XBIA 3VWVA 4GF0A 1BAYA 5FWGA 1NHOA 3KMOA 4MF5A 4GRFA 2ON7A 2VCXA 3GKNA 3BCIA 4GSTA 3BBYA 4MLYA 2HYXA 3CRTA 4ECJA 1OVNA 1TK5B 3VWUA 1ML6A 1K0MA 2I1UA 4Q5NA 5H5QA 2GZZA 3VWXA 2VL2C 4ZBBA 4GCIA 3DD3A 4KUNA 4P3YB 2DC5A 4DSSA 4WF5A 5GAPD 1F9MA 17GSA 5GZZB 2H6ZA 4ML1A 2PVOC 4ZXGA 4G19A 1OE8A 3L78A 2C3NA 4PQ1A 2G2QA 5IMDA 2KHPA 5J9BA 2CVKA 1B48A 5JCUA 3FKFA 4MZWA 3IOSA 2LQQA 3C73A 1A8YA 1TI1A 5A4UA 5IPHA 3UJ1A 1O81A 3F6DA 4ECCA 4HS1A 4IP6A 5ECMB 3VI5A 5ECIB 3GL3A 6GSXA 3GUSA 2ZUPA 4K8MA 2NVLA 2C1YA 2DMLA 3HXSA 2J9HA 1Z6NA 4GLTA 4I2TA 4ID0A 4POKA 5JWQB 5G30A 2HRNA 1G6YA 3L4NA 3KXOA 5CAXA 2IN3A 4KE3A 4WBRD 2L6CA 3L0HA 3Q18A 4XIHA 1Q4JA 1GTBA 1HNAA 5DBQA 3SBCA 3L9UA 4IP1A 2GLRA 3PINA 1OYJA 2X8HA 4NAXA 5DALB 3FK8A 2IMEA 2L5LA 2IFQB 2IPAA 4LA1A 3WGEA 5ID2A 3UMAA 3M8NA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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