3Q6OA

Oxidoreductase fragment of human qsox1
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
233
structure length
228
Chain Sequence
ALYSPSDPLTLLQADTVRGAVLGSRSAWAVEFFASWCGHCIAFAPTWALAEDVKAWRPALYLAALDCAEETNSAVCRDFNIPGFPTVRFFAFTNGSGAVFPVAGADVQTLRERLIDALESHHDTWPPACPPLEPALEEIDGFFARNNEEYLALIFEGGSYLAREVALDLSQHKGVAVRRVLNTEANVVRKFGVTDFPSCYLLFRNGSVSRVPVLMESRSFYTAYLQRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The dynamic disulphide relay of quiescin sulphydryl oxidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Sulfhydryl oxidase 1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 65
structure length 228
sequence length 233
ec nomenclature ec 1.8.3.2: Thiol oxidase.
pdb deposition date 2011-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF18108 QSOX_Trx1 QSOX Trx-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3q6oA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3q6oA02
1SD8A 2H6YA 4Q5RA 1OVNA 5ELGA 2VIMA 3KH9A 4MA9A 1B9XC 4K2DA 4XIHA 3DEXA 2XHFA 2NPBA 2YP6A 1HQOA 3KJYA 6GSVA 4J2FA 3IC4A 5JCWA 2B5XA 5CRWA 2PMTA 17GSA 4ZB9A 1JHBA 5ID2B 1NW2A 3I6AA 4OCEA 1BJXA 1FG4A 3C7MA 1SJIA 5F06A 3W8JA 1Q4JA 4WBRD 4KDUA 3UEMA 13GSA 4FYUA 4RQXA 4X43A 1QGVA 4IELA 3HY2A 2HRNA 4N0VA 4TXOA 1TJDA 1F3BA 11GSA 4HZ4A 5JWQB 1X5DA 2Z9SA 4X1UA 4N0ZA 4LL1B 1OYJA 4NPBA 3N9JA 2C80A 1TW9A 1R5AA 4MPFA 1G6YA 3FYGA 3L0HA 2GQLA 3N5OA 2LEGA 4MJCA 2KHPA 3GYKA 3HKRA 1SKWB 2VCZA 1K0OA 3G7JA 2MMZA 1QFNA 3U6VA 4MZCA 3HZ8A 4MP4A 4OFNA 1XW6A 1TK8B 5IMCA 3OR5A 3RBTA 3G7IA 1XW9A 3A2VA 3EYTA 3ZZXA 1CQGA 1WIKA 1ZYQB 3HVVA 1U6TA 5FT3A 2H75A 3M9KA 2HRFA 1JFUA 3TRQA 1GLPA 1K0MA 1NHYA 2LRTA 4MF6A 2O89A 3ERFA 1Y25A 4RI7A 2AYTA 5CP1A 2EIOA 1TXXA 2FA4A 3KP9A 4PNGA 1H75A 3E3EA 4EC0A 4GF0A 2IJYA 3A5WA 1OKTA 2ALBA 3ZIJA 2VM1A 1J08A 1MDKA 3CRUA 1AIUA 2LJKA 5DQSA 1LU4A 3DIEA 18GSA 1NHOA 2OBKA 2YNXA 1A2JA 1OC9A 4IBPA 3D4MA 4WF4A 2TRCP 1ZYEA 5G5EA 5HQPA 3SBCA 4MLYA 5D9TA 3VPQA 2LQOA 4ECJA 2CVKA 1PSQA 4PGTA 3QMXA 4ZB6A 4DSSB 1ON4A 4GWRA 3D5JA 2H72A 1FAAA 1SL0B 2BJXA 1HYUA 1V58A 1Z5YE 3QDNA 3C1RA 3D22A 5CAXA 2PUKC 3ERGA 1NM3A 5D9VA 1K3LA 3HYPA 5AISA 4EXJA 2HXKA 1MD4A 4PNFA 4TOPA 3EU4A 2H1AA 1UN2A 4JR6A 4K0GA 4H86A 4BWSA 2DJKA 1S3CA 1IYHA 2F3MA 2AHEA 1MEKA 4IJIA 1EOHA 5AN1A 3DWVA 3RAZA 3LXZA 1YJ6A 3GH6A 5IMDA 2KP1A 5D73A 2OA7A 4CW9A 3UBLA 2B6MA 3IHQA 1EEMA 4HS1A 2V6OA 3LJRA 4IS0A 1BAYA 5B6NA 1VGLA 2BTOT 3IPZA 3BJ5A 4K0NA 4OCFA 1PGTA 3EE2A 4WF5A 4ZIJA 1ZMAA 4K7NA 2FGXA 2GVPA 2R5GA 5IIZA 1ZL9A 4HZ2A 5G31A 1Q98A 4XRAA 4MH3A 1A24A 4V2NA 3QR6A 4PX1A 4E8HA 3FZ4A 3IRAA 2NBSA 1XZOA 4G2EA 1EGRA 2R4VA 4RUVA 1WE0A 3CTGA 2E2GA 4MABA 5DVBA 5JWOB 4WETA 4HJ2A 3WGEA 2REMA 4F2IA 5DCHA 3KTLA 2PWJA 4MJEA 4XCSA 5ECQB 1QMVA 2CAIA 4ZL9A 3M8NA 2OBIA 5INYA 4OFMA 4L0WA 3F4RA 3UMAA 4DVCA 4EUYA 2H0IA 3C73A 1K0AA 4IN0A 1O81A 3FW2A 1U87A 1B48A 1KTEA 2N5AA 1VF3A 3CMIA 5DBQA 2HSYA 3GH9A 4HEA2 2RLIA 5HFIA 1XVWA 1TU8A 1Z7PA 3FR6A 3GN3A 2LKUA 3IE3A 3LG6A 4CHSA 2JSZA 2H0GA 3RHCA 2GZZA 1TK5B 1BEDA 5ECMB 5JCUA 1EGOA 5G30A 5ECOB 1USBA 2FD3A 2H01A 3D21A 5C04A 5D9XA 4ISDA 1ERUA 3MWHA 4KCEA 1MD3A 4MJAA 5CRHA 3BCKA 3ZVJA 4DEJA 4ILFA 3WT2A 1UA5A 2WULA 2K6VA 3JCML 3M0FA 1OC8A 4JBBA 2FNOA 3HJPA 2V6KA 1PRXA 2CVDA 2NDOA 1ABAA 2CV4A 2YZUA 3VLNA 1GTIA 1GNEA 5CREA 4PQIA 1THXA 4NWYA 2YWIA 1GLQA 1M2AA 4V1Ap 5AGYA 3VI7A 3TRXA 5GAPD 1SKSB 2B7KA 1THOA 4YQUA 2DMMA 2A2RA 5GAND 5ECKB 2LS5A 2IPAA 3FRCA 1A8LA 2C3QA 1CQHA 4IHUA 4OMVA 3BBYA 5G5FA 4TR1B 4HI7A 9GSSA 2HLSA 2H74A 4WR4A 1X5EA 4N30A 4D73A 2QC7A 5A4UA 3ZFLA 4E8EA 1W4VA 4ECBA 3ZL5A 1TP9A 2P5RA 4HOJA 4BVYA 2DJ1A 2VL9A 1KEBA 1DE2A 4V2MA 3I9V2 3C71A 3WT1A 4QQ7A 1YEXA 4EE0A 3IXRA 3WYWA 3O3TA 4I2TA 3HVXA 2DMLA 2VCWA 4KCAA 1G0TA 6GSUA 1EP7A 4DSQA 2CA8A 2IL3A 4IQ1A 4OFTA 3LSZA 3CSJA 5IPHA 3KZQA 3MNGA 2GLRA 4G19A 5EY6A 3APOA 2WFCA 1M7TA 1T8EB 2KUCA 4NV5A 3DMLA 4MF7A 3H1NA 1XOAA 5CRDA 4YQMA 1ILOA 2DJ2A 3KD0A 2A4VA 1ML6A 3M9JA 2MMNA 3D4TA 4KAEA 4OD7A 1LJRA 1LBKA 5F0GA 1VF4A 5IQYA 1T1VA 5DJMA 2WJUA 2YOIA 5IMAA 1H4OA 1XOBA 4IJ3A 2AAWA 2H1DA 2VL2A 2C0DA 3TKSA 3GKKA 1YZXA 4KDYA 3GUSA 4EF0A 4TVEA 1T00A 1YF0A 4JRRA 3UL3A 2DJ3A 2M46A 2IMFA 4ZL7A 3CSHA 4HJMA 1X9SB 4NV2A 4BA7A 1GULA 5IO2A 2B5YA 4KA0A 4MDCA 4NAXA 4EVMA 3GRXA 3QAGA 1AXDA 5E4WA 4AJ6A 4KUNA 1VF2A 4I2UA 4ZBBA 4BVXA 4GSNA 3FHKA 2VO4A 5C00A 2F8AA 1URMA 2LNSA 3LXTA 2H73A 3F63A 2PBJA 1PKZA 3FKFA 1QXHA 19GSA 2FWFA 3GL3A 3LYKA 3D6IA 1UC7A 1GTBA 2C1YA 2FWEA 3GURA 1XFLA 3VK9A 4MH2A 3KGKA 5HR0A 3RPNA 5EVOA 1Z6MA 5F07A 3M1GA 4V2LA 1YDKA 1EP8A 1BG5A 4ECIA 1K3YA 1PQNA 3UAPA 5CRGA 5A4VA 4EDYA 2I4AA 4PUAA 2C4JA 5EL8A 2RUFA 2N5FA 2CVBA 1JLVA 3P8WA 1XIYA 3EINA 2E0QA 3G7YA 4WKWA 5ELAA 1SENA 2R37A 3QPMA 1GH2A 4EO3A 2RUEA 4ZBDA 6GSSA 20GSA 3L9VA 3QAWA 4IGJA 4O7HA 1ERTA 3VWUA 4PURA 2HE3A 4QL9A 4F9ZA 4I5QA 1TRSA 3KEBA 3QCPA 5IOWA 3WD6A 1FB0A 4IW9A 2TIRA 3L78A 1SU9A 3TKRA 4TR1A 4GLTA 1O85A 4KSMA 1M99A 3A3TA 1K0CA 4Q5FA 2DSAA 5IM9A 2VD1A 3FR3A 1GSUA 4ECCA 5JCGA 3ZITA 1MDJA 2CAQA 4XS4A 1EV4A 2GSRA 2RM6A 3HZ4A 4DSRA 5ECLB 3FK8A 1U3IA 3IAS2 1B4QA 2NTOA 4RI6A 1UVZA 2IMKA 2P5QA 2YV9A 4TN8A 1JZRA 1R5PA 2B1LA 3TOUA 5IMFA 1HNCA 1WP0A 2OADA 2O8VB 1GSFA 4GSTA 3GFKA 2OACA 5F8BA 1QUWA 3HVSA 3ZYWA 4Q5NA 2IMDA 5FWGA 2PN8A 3GL5A 2YZHA 4G10A 5F05A 1OE7A 1V57A 1I9DA 2F51A 1AQWA 1SKRB 2EIQA 4P3YB 1M9AA 5FHIA 4LL4B 1TRUA 3KMOA 2B5EA 2OJLA 1R4WA 5ECPB 6GSTA 1M2DA 3ZVJD 2VCVA 2LRNA 2WB9A 1GSDA 3NOFA 2L57A 3F8UA 2DJ0A 4KGIA 4ZBAA 1PD21 1YEPA 4IKHA 3VWVA 4D73B 3C8EA 1N2AA 4PQHA 4TRXA 1QK8A 2VM2A 2LQQA 4KW6A 4ZXGA 4WBJA 1F2EA 3TOTA 5J4UA 2YWMA 4I8BA 5ECNB 1SL2B 1GP1A 4XHMA 2L59A 7GSSA 2OE3A 5GSSA 3L9SA 1FW1A 2CZ2A 3KP8A 4Z7XA 5GZZB 3FZ5A 3A2WA 4XRDA 1Z7RA 3KM6A 2X8HA 4F0CA 4ID0A 2VOCA 4YAVA 2H1BA 4K1FA 3HJOA 3IV4A 4HDEA 4PXOA 3DRNA 2WRTA 3L9UA 4KX4A 3UJ1A 2DC5A 3E0UA 2HZEB 3Q19A 5ENUA 4PQ1A 2KOKA 4TKYA 1TTZA 2PU9C 1PX6A 3KH7A 3ZREA 2I1UA 3BOAA 1OAZA 5DCGA 4ZL8A 2FY6A 3IK7A 5H5QA 3DKSA 1XWCA 4FYCA 1N8JA 3TGZA 1WRYA 1XWBA 3UIWA 3GTUB 2AV4A 1XWAA 12GSA 8GSSA 3NZNA 1EV9A 2QSIA 2YJ7A 1SJZA 1TI1A 3ISOA 2FA8A 4YQVA 1DSBA 3A2XA 1T4ZA 2JZTA 3DXBA 1ERVA 1PA3A 3QOUA 4CDOA 1HNBA 3P90A 1SD9A 2KP2A 5ECSA 3ZIVA 1XWKA 3EMXA 1ZOFA 5LD0A 3UVHA 3KIJA 5KN0A 1SL1B 1SK0A 1GL8A 4ULXA 2VLTA 4YAPA 3VURA 2FWHA 3G9BA 4OO5A 5KN3A 4JE1A 3S9FA 1A0RP 1PN9A 1JZOA 3GX0A 4ML6A 3KTBA 3LGCA 3HJMA 4KB3A 1E2YA 5B8AA 4G9HA 5D9WA 3F3RA 2CQ9A 3UVTA 1VF1A 2PERA 4L5OA 3LWAA 5HR3A 3Q74A 2GT5A 3GKXA 2FCHA 1XPVA 2H1GA 3FEUA 2VCTA 2O7KA 3HDCA 5B7CA 5LCZA 2PVOC 3GV1A 1A2MA 1YKAA 2O85A 4F0BA 3F4SA 3H79A 5DALB 5G1KA 1FO5A 2XC2A 1F3AA 1F9MA 3DGQA 1ACVA 2LV3A 2LRCA 2X8GA 4MK3A 3HCZA 2VCQA 1A23A 3QFBC 5A4WA 5J5NA 3ZTLA 2X8CA 2GDRA 1O73A 2X99A 2H19A 3W6GA 3CYNA 3H4KA 3GA4A 1XCCA 2B7JA 2BMXA 3GKMA 3HA9A 1TOFA 4POMA 2RM5A 1EOGA 5LNKe 3R2QA 4K9ZA 3TJKA 2VD0A 4XS6A 1W89A 5G1LA 3ERWA 4PUFC 3AY8A 3F9UA 4KNDA 5IOXA 4LA1A 2GSTA 2YWOA 3MSZA 4XS4B 2CZ3A 3IOSA 3VFIA 4EL1A 1FVKA 3UOMA 4LLRA 2FUG2 4KSOA 2VUPA 3CSIA 1K0BA 1WPIA 3UARA 1AUCA 1M2BA 4NMUA 2WS2A 3EC3A 3GX8A 1XW5A 1JLWA 3HD5A 3GSTA 3CXGA 4AF2A 1K3OA 1TRWA 3VWXA 3J7Yk 2PPTA 5JWRB 3LEFA 3I69A 2N5BA 5KN1A 2J23A 1MDIA 2HZEA 4F03A 2HI7A 2GGTA 2CX3A 1S3AA 2HNLA 4HUAA 3FR9A 2OE1A 1TDIA 1YY7A 1X9MB 2P31A 5HFKA 5KN2A 5J9BA 2VLUA 2G0FA 1GTUA 3FZ9A 3V1WA 4FH8A 2H8LA 3APSA 2I3YA 4NHZA 3F0IA 3GTUA 3ME7A 2H30A 2DIYA 2GS3A 3W8SA 3TCOA 3WGXA 4BWQA 4GSSA 1T3BA 2AUVA 2G2QA 3IDVA 2V1MA 3MDKA 2K8SA 2PGTA 1GSEA 3BCIA 2MMOA 1WMJA 4NXIA 4AJ8A 2ZUPA 2GSSA 3MAKA 3GSSA 4LMVA 5J3RA 3EU3A 2J9HA 1XBSA 5H5RA 3F6FA 3QFAC 5L71A 2K8VA 3TKSE 5E59A 1RW1A 2OE0A 2ON5A 5IMZA 1BX9A 4MJBA 2RIIA 4ZB8A 2IMEA 2B1KA 2VL2C 3LFLA 3TKSC 3M3MA 2EIRA 1M0UA 1GSQA 1KBNA 1DUGA 1G7EA 1NSWA 2E2MA 2L6CA 3TJGA 2MBSA 3LYPA 2YV7A 3EURA 1SK1A 2P0GA 2VAFA 5HR2A 4L8EA 2VLVA 2V32A 3ZMKA 4N10A 1Y6EA 2MBTA 4F82A 3EVIA 1M9BA 2H70A 2WGRA 2ES7A 4YH2A 2B3SA 3IK9A 1DE1A 1AW9A 5J41A 2WCIA 4RQRA 5DALA 4WXTA 3IAM2 4HQSA 4FIWA 5GSTA 3RHBA 3CBUA 5EPFA 4FYBA 3D0ZA 2L4CA 1TI3A 2HZFA 3TJJA 4POBA 4MF5A 1X5CA 2GZYA 5B6MA 4AJ7A 1SYXA 3F4TA 2C0FA 3FY7A 1RK4A 2L4QA 5H5SA 1FHEA 1SYRA 4TR3A 2GQKA 4ML1A 5ECRB 3DVXA 2C3TA 1OKDA 1U3AA 3GHAA 2YANA 3DD3A 3NIVA 2LUSA 4ACSA 3HHVA 1F6MC 5D93A 3C1SA 3QD9A 3DVWA 4O92A 4WR5A 3ZRDA 3I43A 1KNGA 4POKA 5DAKB 3ZFBA 5AIVA 3SWLA 4IP6A 4Q5QA 2NVLA 3GMFA 4EDZA 2EC4A 3Q6OA 5J9CA 4LMWA 2DIZA 3WGDA 2I9HA 1WJKA 1O7UA 1EWXA 3PR8A 2AJQB 1EZKA 4GQFA 3GKNA 2F9SA 4ZILA 2GT6A 4GXZA 5HFGA 3TKPA 1ST9A 5ABRA 1ERWA 1YF1A 2R2JA 5ECHB 2MYGA 6GSWA 1XVQA 2ZCTA 3ED3A 4JEDA 3F3QA 2JL4A 3K8NA 6GSYA 4TR0A 1TK0B 2FWGA 3HXSA 2MMAA 2JADA 5IMVA 4L0UA 2GSQA 1G6WA 1GWCA 2D2ZA 2L6DA 4IP1A 2K9FA 2GZPA 3RDWA 2TRXA 4IVFA 2LTKA 4BPYA 4K7OA 2LJAA 5B8BA 5IO0A 2M80A 1K0DA 1U88A 2VL3A 5IPGA 1A0FA 1O8WA 2HYXA 4K7IA 2LSTA 2K18A 2JACA 2JU5A 3TJBA 1AAZA 10GSA 4HQZA 5DDLA 4WEYA 1DBYA 4GRFA 5DQYA 3E9JB 1E6BA 1V40A 1ZZYA 1PMTA 1I5GA 2L5OA 3KMNA 4POLA 3ME8A 2YPMA 5CYYA 3PGTA 4MZWA 5ID2A 2JZSA 2DJJA 1OE8A 2XPEA 3O76A 1FOVA 3KXOA 16GSA 1GSSA 3PINA 4MMMA 1YKCA 4J56E 4MCUA 2E7PA 2H71A 2C0EA 1BYEA 1SK2A 5G2ZA 3TDGA 5CO3A 4MPGA 3DYRA 5ECIB 2IMIA 4KE3A 3ZMLA 2YCDA 1V2AA 2GTUA 1FB6A 2WDUA 2IFQB 4QL7A 1X9WB 1ZGNA 2FLSA 3TB2A 1AQVA 3U5RE 1GRXA 2JSYA 4GQCA 2HFDA 3H8QA 1G7OA 2DBCA 3GIXA 4EKZA 2IWTA 1MTCA 1J9BA 1GTAA 1BQ7A 2XBIA 2A2SA 2XPDA 5KEJA 3J7Yb 1TKDB 2C8UA 1O8XA 2H0HA 4OWYA 4KDXA 2AB6A 5CNWA 2HSHA 3EWLA 4HU9A 4V1Ag 2CX4A 3APQA 4XTSA 3IBHA 2QKEA 4O32A 1VRSD 22GSA 3CRTA 4JR4A 3TJFA 2JZRA 2LJRA 1T7PB 3LORA 5D96A 3TRPA 5DAKA 3ZLPA 2H6ZA 3F6DA 4TXOB 1WWJA 4HU7A 3VPTA 4OO4A 4JZQA 2QGVA 1S3DA 2KLXA 2OKAA 2H6XA 3PH9A 3Q18A 1PKWA 2YWNA 1OC3A 2WZ9A 4L5LA 3H93A 2YN1A 2FHEA 4K6XA 4I97A 1Z9HA 1HD2A 14GSA 3VWWA 5HR1A 2R6KA 4NHWA 2MZCA 2V2GA 3RPPA 3UBKA 4DSSA 4KH7A 1EEJA 4O5RA 4FO5A 2V41A 1V98A 4GTUA 5A5KA 1AQXA 2I81A 2F8FA 2H76A 5D8IA 1TRVA 1TU7A 1JZWA 3P7XA 4XS1A 1YQ1A 1O6JA 4AGSA 3BD2A 3EMPA 3QAVA 2DLXA 1Z3EA 1T4YA 6GSXA 1B8XA 1PL1A 1XWGA 4IQAA 4JU5A 4I6XA 3TUEA 1GUMA 1PX7A 3TKQA 1SJ6A 3GNJA 1XXUA 2PVQA 2IIYA 1GUHA 2ZNMA 3P2AA 5DJLA 4K8MA 1B9YC 1K0NA 2C3NA 1A2LA 3KCMA 2XBQA 5AIXA 1WOUA 4X0XA 3O6TA 3LQ7A 1OC9B 2GQMA 1AC1A 3FZAA 2LNTA 1RQMA 3IA1A 1A8YA 2R3XA 1X0RA 2IN3A 1GSYA 4GCIA 4J57E 2C0GA 1J0FA 2ON7A 2YJHA 1B4PA 1HNAA 1QQ2A 2CT6A 2L5LA 3US3A 1ZCPA 3CTFA 1R26A 3L4NA 1PL2A 3IR4A 4MZBA 4TXVA 3VI5A 5COHA 2O87A 1GUKA 2HT9A 1V9WA 1R7HA 2H66A 4TR4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite