3QFBC

Crystal structure of the human thioredoxin reductase-thioredoxin complex
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPSKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKSMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the human thioredoxin reductase-thioredoxin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 27
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3qfbC00
4K7IA 5HR0A 4K7OA 5GAND 1XFLA 3GNJA 4YQUA 13GSA 5IMVA 3CTGA 1BAYA 1GSYA 4I2TA 1DBYA 3RBTA 3CTFA 2GQLA 3CXGA 2VO4A 1TU7A 2YWMA 4ULXA 2YCDA 3RPPA 6GSWA 3RPNA 1TRWA 2V2GA 2LNSA 2AJQB 1X5DA 1FHEA 4EXJA 3UARA 3LSZA 1AQVA 1YF1A 3ERFA 3KH9A 2VLUA 4HJ2A 4KCAA 4YAPA 1M2AA 4N30A 2C0DA 3VI7A 1SK0A 3HD5A 1PQNA 3LFLA 17GSA 3LJRA 3IA1A 1O8XA 4GSTA 4NV5A 4FIWA 3ZL5A 3ZVJA 1XWGA 3W6GA 3TKRA 2K9FA 10GSA 1X9SB 4MK3A 1ERUA 1M2BA 3P2AA 4BWQA 6GSXA 2AAWA 1Z7PA 5ID2A 2E0QA 2DJKA 2ALBA 4DSRA 3LGCA 2CAQA 5D93A 1X9WB 5D9TA 2MMAA 5C00A 2DIYA 2IPAA 3BOAA 4K0NA 1UA5A 1JHBA 4KB3A 1G0TA 4GQCA 3TKSE 2C0EA 4ILFA 1SJIA 3I43A 2DJ2A 2MMNA 1TU8A 2C3TA 1PD21 5B8BA 2VL9A 1OE7A 2C0FA 3Q18A 2HXKA 1PL2A 3DXBA 5G5EA 2PERA 4TXVA 4L0UA 4N11A 4HEA2 4GRFA 5HFGA 4LL1B 1SKWB 1SJZA 3F6FA 2VM1A 4O32A 5A4VA 3ME8A 1WOUA 5G2ZA 3TRXA 1YEPA 4ML1A 1ZYQB 2P31A 5AISA 1GLPA 3RHCA 4EF0A 1FO5A 1TK5B 5D9XA 4I97A 3C71A 2B6MA 3VPQA 2VCWA 3IV4A 1E2YA 12GSA 4KGIA 1ON4A 3D22A 1TW9A 2K8SA 4RUVA 3GUSA 4NV2A 4LLRA 3UAPA 2JU5A 4TRXA 5J4UA 3HZ4A 1FAAA 1YZXA 3HJPA 5B6NA 2R2JA 1SL2B 4MPGA 1GSFA 2F8AA 3QAWA 3IAM2 2AUVA 2O85A 3GSSA 2VCZA 2LRTA 4IQAA 2M46A 4ZL8A 2H76A 2X8GA 4HI7A 1IYIA 3ZREA 2CV4A 2A2SA 3TRPA 1VF2A 4YH2A 3LXZA 4KCEA 1CQHA 1E6BA 2PN8A 3LQ7A 3UMAA 1EOGA 3M8NA 2HRNA 3C1SA 2Z9SA 3GFKA 2FGXA 2KP1A 3F8UA 3O6TA 4V1Ap 5A4WA 3UL3A 2H1BA 3HVSA 2VIMA 1G6WA 3F3RA 1KBNA 3IXRA 4IJ3A 4ZBAA 3US3A 3FRCA 3ZITA 1NM3A 3TKSC 2E7PA 2D2ZA 3F9UA 5G30A 4IQ1A 1ST9A 2G0FA 3KEBA 4I6XA 4RI7A 2GZYA 2LQOA 2GT5A 3GN3A 1KNGA 1UC7A 1QK8A 1K0CA 5KN3A 5J5NA 3FR3A 4XCSA 3DEXA 2PPTA 2HI7A 4BA7A 4OCFA 2GGTA 5IOXA 1JZRA 2IJYA 4E8EA 2HT9A 4DVCA 3J7Yb 2YWNA 1S3AA 1SENA 4Q5RA 4Q5FA 2YWOA 1THOA 4ISDA 1Q4JA 2FWHA 2LUSA 1AQXA 3NZNA 1SK1A 3RAZA 3FR6A 1J9BA 4HS1A 2H30A 2RLIA 4WR5A 1OC9A 2CX4A 3WGEA 3KMOA 1PKWA 1FVKA 1LJRA 3WT2A 2O7KA 4KSMA 5ID2B 2CVBA 1K0MA 3NOFA 2N5AA 4TR4A 3L4NA 2YN1A 2GSRA 1M0UA 3H1NA 3H8QA 3RDWA 5EL8A 1Z7RA 2PBJA 3L9VA 2JZSA 4IN0A 2NBSA 1O73A 2BJXA 1YF0A 3DVWA 2YP6A 2LJRA 4OD7A 5J9BA 5F06A 2H75A 4I8BA 5IMDA 4TXOA 1JLWA 1XCCA 3QD9A 4OMVA 4OCEA 3A2XA 1AQWA 4K7NA 18GSA 1GSQA 3D21A 4KAEA 2JZRA 1GSUA 4MZWA 3M0FA 2I1UA 2H8LA 2WGRA 4G9HA 4D73A 2K6VA 2JZTA 4BVXA 9GSSA 2G2QA 1NSWA 4GSNA 2WRTA 3Q19A 2WS2A 3EYTA 3CSJA 4ZB9A 1XOAA 1VGLA 5KEJA 4LA1A 2MBSA 5ABRA 1USBA 4FYUA 3V1WA 3WT1A 4EKZA 2HSYA 1MTCA 4HZ4A 2L4CA 1EEJA 1KTEA 14GSA 1A2JA 1SL0B 3GKMA 5DAKA 1ABAA 1K0OA 1K0AA 3A2VA 3D4TA 2GZZA 1MD3A 2V32A 4JZQA 1RQMA 1TRUA 2YJHA 3GX8A 2XPDA 2IFQB 1DSBA 1O6JA 1TDIA 3EU3A 16GSA 3H4KA 4WBRD 1F6MC 2IMEA 3GIXA 5ECNB 1U3AA 5GSSA 3UIWA 1ZOFA 1GP1A 2EC4A 2H19A 2FWFA 4YQVA 2OE1A 4K8MA 4KSOA 1EP7A 1BQ7A 3BD2A 4K0GA 5D96A 4TN8A 5GZZB 2C8UA 3F63A 4IGJA 5EVOA 1ML6A 1EWXA 5LNKe 1EV9A 3UVTA 2K8VA 2LEGA 3ZMKA 4MJBA 3L0HA 5ELGA 1UVZA 4BPYA 3O3TA 2VOCA 2IMDA 4ZB6A 1KEBA 4H86A 3HVXA 1U6TA 4DSSA 3ERWA 2VCVA 3N5OA 3UJ1A 3Q6OA 4KUNA 4WR4A 2AB6A 2V6OA 3UBLA 4MA9A 1HD2A 1OE8A 2E2MA 4X0XA 2TIRA 4ZILA 5DJMA 5IMZA 3L78A 3A5WA 2IL3A 1K3LA 3CRUA 3TJGA 1M9AA 3EINA 5LCZA 4QQ7A 3F4SA 4KE3A 3FZ4A 2HNLA 2I81A 1GLQA 4GCIA 1DE2A 2FUG2 1ZCPA 1OC9B 1TTZA 1A23A 2V41A 3ISOA 2I9HA 5CRDA 2PVOC 1LU4A 1V9WA 3IK7A 4KX4A 1YEXA 1XXUA 3GV1A 1X0RA 4NPBA 4N10A 7GSSA 2X8HA 3E9JB 6GSYA 2HYXA 1H75A 3Q74A 4RQXA 3KGKA 3W8SA 1T8EB 3J7Yk 3HHVA 4J2FA 2FWEA 3IR4A 2GQKA 2H0HA 2VLVA 1FB0A 3DWVA 1S3DA 2DIZA 5CAXA 4OWYA 4PGTA 2IIYA 2ZUPA 4AGSA 5CREA 1MDIA 4POMA 2C4JA 4K6XA 2RUEA 2OJLA 5IPGA 1Z6NA 3F4RA 1AC1A 4XS4B 2IN3A 1XZOA 5CRWA 3HY2A 4FYBA 20GSA 2RUFA 1FG4A 3TJKA 4K2DA 3L9SA 3HVVA 4IJIA 2YV9A 1XW6A 4RI6A 3DKSA 1TRSA 3M1GA 5DQYA 4F03A 3QFBC 1OAZA 2VUPA 1PRXA 2PGTA 3VPTA 3QCPA 4CW9A 5CP1A 4EDYA 4HQSA 3TOUA 1GWCA 2OE3A 1R4WA 1EOHA 1QXHA 1NHYA 1VF1A 3ME7A 4KDYA 1PKZA 2H0GA 3DD3A 1QQ2A 4PXOA 1MDKA 5IMAA 5DAKB 2PVQA 2IMKA 4F0BA 5EPFA 4MCUA 5KN0A 1PN9A 2RIIA 1THXA 3PINA 3OR5A 1GTUA 1WJKA 5B8AA 5DVBA 2LJAA 1T7PB 2F9SA 1XWCA 4XHMA 3ZYWA 1FVJA 4ZXGA 5DALA 1SYRA 2LJKA 2H1GA 5HFKA 4WEYA 4I2UA 3GURA 4O92A 3F6DA 5IOWA 4IKHA 1BG5A 4TR1B 4EVMA 1AIUA 4OFNA 4GXZA 4ZL7A 2FD3A 1ILOA 2B7JA 4WBJA 3H79A 2WFCA 2CAIA 2N5BA 1B9XC 4KH7A 2O87A 4AF2A 2P5QA 4MDCA 4LMVA 1TXXA 1GUKA 3ZIVA 1X9MB 5JCUA 8GSSA 2NDOA 1W4VA 3IDVA 2LKUA 2R4VA 4V2MA 4AJ7A 5FT3A 2EIOA 1UN2A 3LG6A 1IYHA 5DBQA 3GA4A 1QFNA 1Z6MA 3LEFA 3E3EA 1B4PA 1CQGA 1SKSB 2PUKC 3ZRDA 2RM5A 1LBKA 4XS6A 1N8JA 3WGDA 2GDRA 3ZVJD 2VM2A 2VD0A 1K3OA 4MMMA 3TJFA 1FW1A 3TKPA 5F07A 2H0IA 4EC0A 1GUMA 1RW1A 5IQYA 3IK9A 3EMXA 2VD1A 2KLXA 1K3YA 3TUEA 4V2NA 1QMVA 1U87A 2A4VA 2TRCP 3TGZA 3SWLA 4AJ6A 2AHEA 3APOA 4ACSA 3FYGA 3PH9A 1EGOA 3QOUA 2H73A 2R5GA 3G7IA 1B9YC 5COHA 3ZFBA 4HQZA 4G19A 3DRNA 2IMFA 3GH6A 3VLNA 4L5OA 4NWYA 1Z9HA 4NHZA 3LXTA 1F37A 3F3QA 3IC4A 2DJ1A 3M9JA 4DSQA 1TP9A 1WRYA 3LYPA 4JR4A 1XWKA 2LRCA 6GSTA 4AJ8A 3U5RE 3SBCA 1OKDA 2DLXA 2DBCA 2VL2C 2YJ7A 5DCHA 1MD4A 1OC3A 4L8EA 2WZ9A 1GTBA 4GQFA 3H93A 4ML6A 4MPFA 4MP4A 1TI1A 1A8YA 1HNAA 4WF4A 1XIYA 5F05A 1F2EA 5G5FA 4EUYA 5IMFA 1FOVA 4ZL9A 5CYYA 5G1KA 2QC7A 4PX1A 1ZL9A 6GSUA 4TKYA 3UVHA 3GHAA 5ECKB 2H74A 4XRDA 2MYGA 4ECBA 2XBIA 2NVLA 1TK8B 4HU7A 3MDKA 2VLTA 3I6AA 4PUFC 1SKRB 2I4AA 2C80A 3D0ZA 3KJYA 5J3RA 3L9UA 3MWHA 2WULA 4ZBDA 3GMFA 4J56E 3DIEA 2GSTA 2CZ3A 1TOFA 5ENUA 4GLTA 3JCML 4MJCA 4X1UA 2H6YA 4ZBBA 5DALB 1WWJA 1WIKA 3QMXA 4L0WA 2I3YA 1ACVA 2AYTA 1U3IA 2FLSA 3ED3A 4OFTA 5D9WA 4HZ2A 2XPEA 3KIJA 1EV4A 2QSIA 22GSA 4HDEA 4XRAA 5J41A 4ECJA 4IP1A 1XOBA 4V1Ag 3EURA 1EZKA 2DMMA 4TW5A 4WKWA 1G7EA 2KUCA 2E2GA 5CNWA 1ERTA 1GTAA 2WDUA 1GULA 4IS0A 2IMIA 1AW9A 1C72A 3QR6A 4MLYA 2H70A 5AIXA 5E59A 2F51A 5IO0A 4ZB8A 2QGVA 2L57A 3HZ8A 3NIVA 2FA4A 1S3CA 2GLRA 4L5LA 3D4MA 4MF6A 2JSZA 1VRSD 4QL7A 3I69A 1ZGNA 3LWAA 1XVWA 1TI3A 4XS1A 1GUHA 1Y25A 2R6KA 2X8CA 5HQPA 2XHFA 4EDZA 3VI5A 1V98A 4JE1A 2MMZA 3S9FA 3CSHA 2VCTA 4IELA 5A4UA 2LV3A 4KDXA 2H6ZA 2H72A 1XWAA 3TKSA 4BL7A 3EMPA 3FHKA 1YQ1A 1HNCA 4WETA 1JFUA 2CA8A 5F0GA 3EU4A 4V2LA 4OFMA 4NHWA 4IBPA 1EGRA 2L4QA 4MF7A 3HCZA 1T1VA 4PQHA 3KZQA 5ELAA 2DJ0A 4PURA 1V40A 4MF5A 1GSDA 2OBIA 4MZBA 1O85A 11GSA 3P7XA 4HJMA 4ECIA 3E0UA 3BCIA 2ZNMA 1MDJA 1PGTA 1PA3A 4GSSA 2O8VB 4NMUA 4KNDA 1M99A 1XBSA 1T4YA 3QPMA 4PUAA 5FWGA 1FB6A 1R7HA 1A24A 1YJ6A 5AN1A 4ECCA 2WCIA 4JRRA 1QGVA 3D6IA 2LQQA 4E8HA 6GSVA 3O76A 2LSTA 2V6KA 3WYWA 4IVFA 5ECHB 3ZIJA 2LNTA 2H1AA 3P8WA 2YWIA 1M2DA 1VF3A 2P5RA 3GRXA 2KHPA 2RM6A 4TR3A 3KTBA 2YANA 4IW9A 5JWQB 2C3QA 1I9DA 2O89A 1NHOA 4QL9A 2FNOA 3IE3A 4TXOB 3HA9A 5GAPD 1M9BA 3BBYA 3HJOA 1GSSA 2REMA 3ZZXA 4POLA 2GZPA 2DMLA 2PU9C 2EIQA 3R2QA 3KMNA 3TOTA 1SU9A 5AGYA 5JWOB 4D73B 3EVIA 3QAGA 2OA7A 2YNXA 3KD0A 3K8NA 3A2WA 3IHQA 3FZ5A 2HZEA 1R5AA 3EE2A 2DC5A 4JR6A 2MBTA 5D73A 2AV4A 1HNBA 3MSZA 1I5GA 3KP8A 2B5XA 4IHUA 4DEJA 2KOKA 4N0ZA 1WMJA 3AY8A 1JLVA 4WF5A 4PNFA 1PMTA 4LMWA 5J9CA 2HZFA 4RQRA 3MAKA 1Y6EA 2OBKA 2FWGA 1AUCA 1DE1A 1PSQA 2DJ3A 5CO3A 2K18A 3CSIA 3IPZA 1MEKA 1SD8A 1JZDA 5HFIA 1G7OA 2DSAA 2C0GA 2LTKA 4G2EA 4F82A 5CRHA 4JBBA 2CX3A 5ECSA 1EP8A 3APQA 3N9JA 4FO5A 5LD0A 2JACA 3FZAA 5ECIB 1YKAA 2B3SA 5DDLA 4CHSA 2J9HA 3HXSA 3I9V2 4LL4B 1K0BA 5DJLA 3C7MA 6GSSA 5H5SA 4TR0A 1ZYEA 1Q98A 5B6MA 2FA8A 19GSA 3F0IA 3KP9A 3G7JA 5DCGA 2DJJA 5IMCA 4KW6A 2HE3A 2YZHA 3TJJA 2L6DA 2CVDA 4F0CA 2ZCTA 4FH8A 1YKCA 3FY7A 1ERWA 1JZWA 5L71A 2P0GA 2X64A 3IRAA 5C04A 3WGXA 1F3BA 2H01A 1T00A 4DSSB 2BTOT 1V2AA 1X5CA 3QFAC 1WP0A 3FR9A 2HFDA 3A3TA 3VWUA 3ZMLA 2GS3A 1J0FA 5HR1A 2GSQA 2GQMA 4MZCA 2JADA 2QKEA 5ECQB 1K0DA 1GSEA 4G10A 3FK8A 3PGTA 1GTIA 2IFQA 2OKAA 3TDGA 2VCXA 4TOPA 3TRQA 1PX7A 3ZTLA 4O7HA 1T3BA 1BX9A 3UOMA 2TRXA 2ON7A 1GRXA 3DGQA 2HSHA 4F9ZA 3ZLPA 5INYA 1H4OA 3ZFLA 2VCQA 4POBA 1PX6A 1OYJA 5ECMB 2CT6A 4JEDA 5G1LA 2PWJA 1F3AA 2L6CA 1OC8A 2ES7A 3GTUA 2IWTA 1X5EA 2GSSA 4FYCA 3LORA 1O81A 2MZCA 1B48A 5IIZA 1VF4A 2ON5A 4F2IA 3CMIA 2H66A 1SL1B 1OVNA 4YQMA 2B1KA 1TK0B 1BYEA 5JCGA 1B4QA 3GL5A 3MNGA 3KH7A 4KA0A 1GL8A 4KDUA 2EIRA 3APSA 1N2AA 1A2MA 2WJUA 3BJ5A 2YOIA 4XTSA 2L5LA 2OE0A 2FCHA 1DUGA 3FKFA 5ECLB 3F4TA 4PNGA 1A0RP 4YAVA 2HZEB 2VL3A 2A2RA 3C73A 4GTUA 5A5KA 2HRFA 3CBUA 2M80A 1WE0A 3KCMA 5IO2A 4MH2A 4GF0A 3C8EA 2M72A 3FEUA 1BJXA 5JCWA 2NPBA 3GSTA 3CYNA 3UBKA 3TB2A 1R26A 4HUAA 1ERVA 1ZMAA 3ERGA 1URMA 5FHIA 5JWRB 4X43A 3VWXA 2F3MA 4BWSA 2LS5A 4MJEA 5IPHA 4HOJA 1JZOA 3GX0A 3VWWA 2B5YA 2R3XA 2MMOA 1Z3EA 1XPVA 3KTLA 2XBQA 4EL1A 2NTOA 1HYUA 1G6YA 1XW9A 2GT6A 1F9MA 1SK2A 3EC3A 3VFIA 1M7TA 3QDNA 3TJBA 4WXTA 1TRVA 2L5OA 2KP2A 4JU5A 2H6XA 5ECPB 1QUWA 1K0NA 4XS4A 4NAXA 4EE0A 2GTUA 3HJMA 4MJAA 1A2LA 5HR3A 3TKQA 1PL1A 4XIHA 4OO5A 5CRGA 5AIVA 5GSTA 5ECRB 3GL3A 2YV7A 1NW2A 5D8IA 1W89A 4TVEA 3GYKA 5E4WA 5KN1A 1XW5A 5KN2A 3VURA 1YY7A 1J08A 4NXIA 4CDOA 5DQSA 4PQ1A 3M9KA 1WPIA 4P3YB 2B7KA 4MH3A 2J23A 2HLSA 2C3NA 2LRNA 4O5RA 3DYRA 2CVKA 3EWLA 1V58A 3C1RA 3HKRA 5B7CA 1B8XA 1U88A 3GKXA 1O7UA 2VAFA 3RHBA 5IM9A 1HQOA 2FHEA 3G9BA 1A0FA 1XWBA 3VK9A 4K9ZA 3W8JA 3WD6A 3KM6A 2X99A 4J57E 1O8WA 1ZZYA 3M3MA 1RK4A 3HYPA 3PR8A 1Z5YE 1TKDB 1SYXA 3FW2A 4MABA 2JSYA 2B5EA 4EO3A 3CRTA 3GTUB 1GNWA 1GH2A 1SD9A 1OKTA 4K1FA 2L59A 2BMXA 3GKNA 1YDKA 3IOSA 3LYKA 4ID0A 3D5JA 4TR1A 2FY6A 5H5RA 1EEMA 2C1YA 3KXOA 3QAVA 4Z7XA 5F8BA 3GH9A 4I5QA 4Q5QA 2OADA 3DVXA 4N0VA 5H5QA 3UEMA 3HDCA 1TJDA 2H1DA 5EY6A 2B1LA 3FZ9A 2OACA 3VWVA 1GNEA 5HR2A 1T4ZA 4HU9A 4OO4A 2WB9A 1SJ6A 2GVPA 4IP6A 2F8FA 2YZUA 4BVYA 5G31A 4GWRA 3BCKA 2YPMA 1BEDA 2R37A 2VL2A 5D9VA 2XC2A 5ECOB 2JL4A 2H71A 4ZIJA 1R5PA 1XVQA 3TCOA 3P90A 2CZ2A 3IBHA 1A8LA 2PMTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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