3QPM | Genus

Total Genus 64

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	64
sequence length	195
structure length	195
Chain Sequence	LHLSKAKISKPAPQWEGTAVINGEFKELKLSDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRVHEFRAINTEVVACSVDSQFTHLAWIITPRKQGGLGPMKIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDQGHTLRGLFIIDEKGVLRQITMNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSDTIIPDPSGKLKYFD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The N-terminal beta-sheet of peroxiredoxin Prx4 in the large yellow croaker Pseudosciaena crocea is critical for its peroxidase and anti-bacterial activities rcsb
molecule keywords	Peroxiredoxin
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Larimichthys crocea
total genus	64
structure length	195
sequence length	195
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2011-02-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3qpmA00

4EO3A 2RUEA 3WGEA 5ECKB 1A0RP 4KDXA 1THXA 4YAVA 5G5FA 4DVCA 3FK8A 1GLQA 2C0GA 1OC9B 4D73B 4KAEA 1K0MA 3HYPA 2PMTA 1WE0A 1GNWA 2DJJA 2FUG2 2JACA 2C80A 1KTEA 3D6IA 1EWXA 3ME8A 5JCWA 3J7Yk 2XBQA 3M9KA 2RIIA 3A3TA 2HYXA 1T00A 1SU9A 2VOCA 3DWVA 1AC1A 3CMIA 4GTUA 3QD9A 4TW5A 1T4ZA 5ID2B 1GSEA 3LFLA 4HUAA 2H75A 2OKAA 3FYGA 2GQLA 3NOFA 5CNWA 3KD0A 2RM6A 1WWJA 1FO5A 1TRVA 3PH9A 2RM5A 3KH7A 1KNGA 4F0CA 2IMKA 1E2YA 2AAWA 4KUNA 2O87A 1K3OA 2FA4A 1EOGA 2H19A 5G2ZA 3UVHA 2XC2A 2C3NA 1LBKA 3M8NA 4NXIA 3FY7A 1F3BA 1GULA 2NVLA 2LTKA 1GP1A 3GNJA 3GTUA 3TKSA 1PD21 2L59A 2ZUPA 2C0EA 2GSSA 1O85A 3ZFBA 2YN1A 1WJKA 1AQWA 3VFIA 1F2EA 1WMJA 1J0FA 2V41A 3HXSA 5IOXA 1SJIA 3IE3A 1WRYA 2H8LA 4DSSB 1HNCA 2FA8A 4I97A 5FT3A 1IYHA 1E6BA 3KEBA 2NPBA 3FZ5A 4ILFA 1GTUA 3F4RA 4GLTA 3KP8A 1PKWA 2YWMA 3IC4A 4L0WA 3I69A 1VGLA 2OE0A 10GSA 3KM6A 4N0VA 3F6FA 4OD7A 2VL3A 1F37A 1XW6A 3QFAC 2LEGA 1GSSA 2VCXA 2EIOA 3TKRA 3OR5A 1OE7A 3TGZA 5D8IA 2WRTA 3E3EA 1WPIA 4MDCA 1U87A 5L71A 3LWAA 1DSBA 4PURA 4F2IA 1KEBA 4POBA 2N5FA 4V2LA 1GRXA 1SK0A 4X1UA 1T8EB 5ECSA 2I81A 3UEMA 3GURA 1JZOA 3M3MA 4MK3A 4HI7A 3QCPA 1BAYA 2HLSA 2V6KA 2ZCTA 4IW9A 3LJRA 4LL4B 1H4OA 5IPGA 1Q4JA 1B48A 5AN1A 1OAZA 4NWYA 1XWBA 3H79A 2OJLA 3KIJA 5G31A 6GSVA 2YZUA 3P8WA 3GX8A 5LD0A 3TRQA 2HE3A 3TRPA 3F3RA 2FY6A 2V2GA 2B1KA 5B7CA 5HR1A 2GTUA 1G7EA 3EURA 2H1AA 1VF3A 4KDUA 5F8BA 1XW9A 2M46A 3FR6A 2QSIA 5CRWA 2VAFA 4E8EA 4XS4B 1YF0A 1RQMA 1BX9A 2JZRA 1HD2A 4MF7A 5CO3A 1XZOA 1XWCA 2ON5A 2FD3A 1KBNA 3HCZA 1YJ6A 3TJGA 5ECPB 2LRNA 5C00A 2L5LA 5DQYA 2KOKA 3BCKA 3DVWA 4PXOA 3ZMKA 5ELAA 3L4NA 3EWLA 1J08A 16GSA 1G0TA 5E4WA 2HZEA 2H71A 1OKTA 2H1DA 1Z6NA 3GSSA 2MMAA 4IELA 3D0ZA 3JCML 3GA4A 2F51A 4G9HA 1PKZA 2VLVA 4GXZA 2LJAA 1UC7A 3IK7A 1Y6EA 1X9WB 2WJUA 3VWXA 2CZ3A 5D96A 1XWKA 2OBKA 1O6JA 5G5EA 2K18A 1U88A 4TXOA 2GZYA 4QL9A 1ML6A 4DEJA 4FIWA 4PUAA 4ZIJA 1A8YA 2LV3A 2DIYA 3QOUA 1AQXA 5HR3A 1R5AA 2B1LA 3ME7A 1AUCA 1CQGA 1FVJA 1NSWA 3F4SA 4GRFA 4BWSA 4XS1A 2H6XA 1XIYA 2OADA 4ZXGA 1TRUA 3CSJA 3IR4A 4ECBA 3MWHA 5HR2A 4KH7A 2QC7A 5ECQB 9GSSA 3GSTA 1T3BA 4YAPA 1Y25A 5D9WA 2P0GA 4TR4A 5H5RA 2PERA 3TJKA 1K0NA 5F05A 2R6KA 3IDVA 1V2AA 2EIQA 1BQ7A 1M9AA 1SKSB 4IP6A 1R4WA 1ZZYA 1ZOFA 4F0BA 1F3AA 2KUCA 1J9BA 2XHFA 2LNSA 1PMTA 1TDIA 3VI5A 2CX3A 1T7PB 1MDKA 3VURA 2G0FA 2C4JA 4Q5NA 1M2DA 2V32A 1S3DA 1MD3A 3RPPA 1GH2A 1QFNA 1SK2A 3P2AA 4NPBA 1K0CA 4FYCA 4PQIA 3Q19A 4KCAA 1W4VA 3TB2A 1SJ6A 4ML6A 2MMNA 5KN1A 1M99A 2HNLA 1ZCPA 5A5KA 14GSA 1PRXA 1TK5B 3UL3A 1ACVA 2A2RA 5J9CA 4XTSA 2LSTA 4IHUA 5CRDA 1YQ1A 2VLUA 1H75A 3A5WA 1S3CA 4J56E 3CTGA 1A2MA 1ABAA 3ZREA 4OWYA 1A23A 5CP1A 2C0FA 3EMPA 3ZMLA 2PGTA 2IN3A 2AB6A 1EV9A 4HQSA 4IJIA 2VCVA 3KXOA 3UAPA 1DBYA 3NZNA 3C1RA 2OBIA 2JU5A 4BL7A 2JL4A 2WZ9A 1UN2A 5ECOB 2VL9A 3N5OA 5ECHB 5EY6A 2JZSA 3ISOA 1C72A 2F9SA 2IMDA 1A0FA 3UOMA 5J5NA 4LMVA 2X64A 2C0DA 1YDKA 2ON7A 5JWRB 5KN0A 4TR0A 4EXJA 2CVBA 3IRAA 4ZB9A 3CXGA 3D4TA 3HZ8A 1O81A 2L57A 4TR1A 5CREA 3IV4A 4NHZA 3A2VA 4PGTA 1YF1A 3IAM2 1TI3A 1TRWA 3TKSE 3BCIA 1ZMAA 1K0AA 1XVQA 4E8HA 5GSSA 2VCQA 5HFGA 3L9VA 1V58A 3QFBC 2MMZA 3VPTA 5DJMA 3ZLPA 4PNGA 3KCMA 2H0HA 1VF4A 5IMFA 4H86A 1TRSA 2B6MA 3E0UA 4WEYA 3KTLA 3CSHA 3G9BA 4IVFA 2H1GA 5LCZA 3N9JA 2YV7A 3LYPA 4TOPA 3LQ7A 5INYA 1A24A 3VWUA 4RUVA 2M80A 1GTBA 3VI7A 1B8XA 1OVNA 3DEXA 2V1MA 3TRXA 5B6MA 1T1VA 2PUKC 1SKWB 3KP9A 4G10A 3TOUA 1S3AA 3TJFA 1JLVA 5IO0A 4ACSA 2G2QA 3RPNA 2J23A 3LSZA 1URMA 1X9MB 2CAQA 3HJMA 1M7TA 3V1WA 3ERFA 2RUFA 1XVWA 4NHWA 2PU9C 1SENA 5GAPD 5D93A 1JZDA 1ST9A 2LQOA 5IO2A 1GNEA 4AJ7A 2IL3A 2IMIA 4ISDA 2EIRA 3GRXA 3UBKA 5E59A 3RAZA 2E2MA 1I5GA 3BOAA 3GL5A 1B4PA 2H01A 3FZAA 3DYRA 2B7KA 4O32A 2E7PA 1X5DA 1HNAA 4HEA2 4FYBA 1QUWA 5DBQA 2PN8A 3ZZXA 5G30A 2H66A 5DJLA 8GSSA 2H0IA 2E2GA 5ELGA 5B8BA 4LL1B 1OC3A 1YKCA 1HQOA 2O89A 4GQCA 1EZKA 2D2ZA 5AISA 2YWIA 1ERTA 2CT6A 1PSQA 4ZL8A 3CTFA 4RI7A 5DALA 5GAND 5ECIB 5DAKB 1ZYEA 1TXXA 2PWJA 2DIZA 1M2BA 3GTUB 4CW9A 4EF0A 1FVKA 1TTZA 4KSOA 4OFMA 3U5RE 1TU8A 4V2NA 4BVXA 3M0FA 4N0ZA 2KHPA 1SL1B 2YCDA 1EOHA 2PVQA 2LUSA 1N2AA 2FNOA 2P5QA 1XFLA 4KDYA 3HKRA 4ID0A 1M0UA 2VL2A 3GKKA 1SK1A 1ERWA 1GSQA 2IWTA 2DJ0A 2X8GA 3LORA 3SWLA 1R5PA 2H74A 5F06A 3UBLA 1K0OA 4V2MA 2R37A 1GUMA 3APQA 3C1SA 2FCHA 2VCWA 4MF6A 2HSYA 5JWQB 4F03A 1OE8A 4TRXA 2GT5A 5FHIA 5HFIA 6GSWA 3GN3A 3O6TA 4KE3A 2WGRA 4WBRD 2BTOT 3F63A 5ECNB 2DMMA 18GSA 3U6VA 2WDUA 3WGXA 2H72A 1LU4A 20GSA 2FGXA 1DE2A 3GYKA 3VWVA 1HYUA 3BJ5A 5ECLB 3SBCA 1IYIA 2V6OA 1VF1A 4K6XA 2GQKA 3F6DA 3PGTA 3C8EA 3MNGA 2AUVA 4XS4A 1R7HA 4MMMA 2LS5A 4KCEA 1R26A 4GF0A 1FAAA 4HQZA 4I2TA 2H76A 2JSYA 1EEMA 5HQPA 1V57A 1NM3A 2LNTA 1G6WA 2AV4A 3H1NA 3DKSA 4I2UA 4MLYA 3ZYWA 5C04A 2JADA 2YPMA 3ZITA 3CRTA 4J57E 3KTBA 1EV4A 4LA1A 2NBSA 5J3RA 2M72A 5IMCA 1G6YA 5CYYA 4K1FA 3GUSA 2WS2A 3G7IA 4I5QA 2GSTA 3HJOA 1YZXA 3GFKA 3ZIVA 2B5XA 1XWAA 3DVXA 2VM1A 4MPGA 1NHYA 2A4VA 1PL2A 2HRFA 3G7YA 2HZEB 2GGTA 1Z7PA 3FW2A 2IJYA 1GSFA 4XS6A 5DCHA 3FKFA 4KW6A 5D73A 1TJDA 6GSUA 1QK8A 4FO5A 4IKHA 2B5EA 4JZQA 4N30A 2K9FA 4EDZA 2IIYA 3FZ9A 3TJBA 1GL8A 2WCIA 3US3A 1TP9A 4MJAA 2IFQA 3LEFA 2CZ2A 1JLWA 4EUYA 4I8BA 4MZBA 4X0XA 5JCGA 2K8VA 4K7IA 3D4MA 3KMOA 4BVYA 5CRGA 2XBIA 6GSTA 3A2WA 2IPAA 1O8WA 3EMXA 1FB0A 4GQFA 1XBSA 2VUPA 3GKMA 4K8MA 2HRNA 4HOJA 4XHMA 4TR3A 4MA9A 4GSTA 1QXHA 2DJ2A 1DE1A 4Q5FA 1U3IA 4TN8A 3QAWA 4GSSA 5GSTA 2JSZA 4MZWA 5LNKe 3O76A 3GHAA 2E0QA 2FWHA 1B9YC 3TOTA 5IIZA 5F07A 1TK8B 1Z9HA 1UA5A 4L8EA 1ZGNA 2P5RA 5IOWA 1NHOA 1YKAA 2CVDA 5JCUA 12GSA 2AHEA 1MDIA 2ALBA 1QGVA 5J41A 3ZVJA 5GZZB 1TOFA 3UARA 1ZYQB 13GSA 3IOSA 6GSXA 2A2SA 5IPHA 3EU3A 5DDLA 1XOAA 3TUEA 1M9BA 2I4AA 3HHVA 1PGTA 4DSQA 1QMVA 1AXDA 4OCEA 3FZ4A 5IMDA 5IMVA 2BJXA 4N10A 3ZFLA 5B6NA 2H0GA 4PNFA 4BPYA 1AQVA 3L78A 1A8LA 1XCCA 3TKSC 3LXZA 2FWGA 1MDJA 1LJRA 1USBA 2H6ZA 3HVXA 3ZRDA 3H8QA 4IN0A 4YQMA 4IJ3A 3QDNA 3FR3A 4OO5A 2FWFA 2CAIA 5D9XA 2DJ1A 3ZVJD 4MF5A 5HR0A 1Z7RA 1PX6A 2F3MA 2BMXA 4MABA 2PBJA 4AF2A 2P31A 3GH9A 4POMA 1EP7A 4MCUA 2TIRA 3FR9A 4YH2A 2FLSA 1F9MA 4OMVA 2PPTA 2JZTA 1XW5A 3I43A 4P3YB 5EL8A 4IQAA 2REMA 3RHBA 2GVPA 3HVSA 2VL2C 3RDWA 5A4VA 2GZPA 4TR1B 2ES7A 4JEDA 3IA1A 2CVKA 4ZILA 4L0UA 2XPEA 2I1UA 3LXTA 4Z7XA 3HDCA 3HY2A 4MJBA 3GIXA 4EE0A 4JR6A 1I9DA 2VO4A 4ZBAA 3H93A 4F82A 4X43A 2GS3A 3EC3A 1OC9A 4D73A 2VD1A 1ERVA 2OA7A 3KJYA 3IAS2 1XPVA 5KN3A 4HS1A 3QR6A 5H5QA 4F9ZA 3MSZA 3F9UA 3CRUA 17GSA 5AGYA 1WP0A 2K6VA 5HFKA 2VCTA 5ABRA 5ID2A 2H6YA 4Q5RA 4MZCA 3HVVA 4HZ4A 5D9VA 1B9XC 2H73A 5J9BA 11GSA 3DGQA 3RBTA 4JR4A 2YWNA 3GKXA 3IXRA 1K3LA 3EINA 2DJ3A 4HDEA 2GDRA 4MPFA 3KZQA 3CSIA 4EC0A 2X8HA 4K7OA 2I9HA 2MBTA 2GLRA 2DC5A 4NAXA 4WBJA 4AGSA 4NMUA 1GTAA 3TKPA 4EKZA 3M9JA 4OO4A 4PQHA 2WFCA 2NDOA 4MH3A 2O8VB 2YOIA 5IM9A 2C1YA 1FB6A 1EGRA 3ED3A 1V40A 2RLIA 2N5AA 4K0GA 5CRHA 1B4QA 2K8SA 3MAKA 3FHKA 4O92A 1TK0B 2VCZA 4TKYA 1MEKA 1OKDA 4HU7A 3UJ1A 4JRRA 3PR8A 4HJ2A 5JWOB 4ZB6A 4GSNA 3EVIA 4YQVA 3HJPA 1JFUA 3H4KA 2VLTA 3RHCA 2YZHA 4XIHA 3C7MA 2MYGA 1SD9A 5DAKA 2CA8A 4DSSA 2CX4A 1FW1A 2MMOA 3FEUA 2KLXA 1RK4A 5G1KA 2FHEA 1ILOA 1F6MC 3TKQA 1XOBA 5F0GA 3C71A 1BJXA 2QKEA 3GKNA 4XCSA 2LQQA 2OE1A 1BYEA 4CHSA 3G7JA 2L5OA 2VM2A 2XPDA 1OC8A 4LLRA 4I6XA 4POLA 3L9SA 5DALB 1GSYA 3E9JB 1RW1A 1YEXA 1SD8A 1MTCA 3UIWA 3TJJA 4LMWA 1AW9A 3APOA 1GTIA 2DLXA 4CDOA 2WB9A 4O5RA 1EEJA 4K2DA 4BA7A 5A4WA 4L5LA 3ZL5A 4XRAA 1NW2A 3IBHA 2R4VA 5DVBA 4KX4A 1VF2A 3F3QA 4IBPA 5IQYA 4FH8A 4N11A 4K7NA 1Z6MA 1K0BA 1TW9A 3KMNA 3GV1A 5H5SA 4JU5A 4AJ6A 2IMFA 4OCFA 2H1BA 2TRCP 3HD5A 5B8AA 2DBCA 3ERGA 2B5YA 2YV9A 1YY7A 2Z9SA 4ZBBA 1XWGA 4FYUA 4IS0A 2C8UA 1GWCA 3IPZA 2QGVA 4V1Ap 5IMAA 2LKUA 4RI6A 3VLNA 2LJKA 1VRSD 3IK9A 2EC4A 2L4QA 4NV5A 3LYKA 2DSAA 5ECMB 1SYRA 2HT9A 3LGCA 5J4UA 3QAGA 2KP2A 2H70A 2ZNMA 4RQRA 4WR5A 2YANA 1PN9A 3QMXA 2YJHA 3I9V2 2X8CA 4JE1A 3J7Yb 1K3YA 4MJEA 2GT6A 4ZL7A 2DJKA 2AYTA 4ZBDA 2GZZA 2LRCA 1SL0B 4QQ7A 4ZB8A 1N8JA 3GX0A 7GSSA 4EL1A 4K0NA 1V9WA 4RQXA 2OACA 4ULXA 1DUGA 2GSRA 3WD6A 2WULA 1M2AA 3P90A 1GUHA 3VK9A 4AJ8A 3Q6OA 2C3TA 4ML1A 3APSA 1GSDA 6GSSA 1Z5YE 3F0IA 1SL2B 1PX7A 4MJCA 3D5JA 2CV4A 4L5OA 4V1Ag 3K8NA 1BG5A 1TI1A 3CBUA 3L0HA 2H30A 1MD4A 1A2LA 2CQ9A 4K9ZA 4WR4A 2F8AA 3L9UA 1GSUA 4HJMA 1FHEA 3DRNA 1X9SB 1K0DA 2AJQB 3C73A 19GSA 3AY8A 4QL7A 3GH6A 4MH2A 4O7HA 1X0RA 4NV2A 2HFDA 2YNXA 3IHQA 1TU7A 4TXOB 1T4YA 2YP6A 1JZRA 3DD3A 1EGOA 4KSMA 5AIVA 4G19A 2NTOA 4KB3A 5G1LA 3VWWA 3WT2A 3EU4A 1UVZA 4GCIA 2R2JA 1U3AA 3QAVA 4G2EA 4WXTA 5FWGA 5IMZA 4ECIA 2TRXA 2IFQB 3GMFA 4OFTA 3BD2A 1V98A 2OE3A 1SJZA 1SYXA 2VIMA 2I3YA 4POKA 4WETA 3ZTLA 3KGKA 1AAZA 2KP1A 3TCOA 3VPQA 4EDYA 3MDKA 22GSA 3WT1A 2MZCA 1ON4A 3UVTA 1U6TA 4IP1A 4J2FA 4PX1A 4WF5A 1BEDA 4XRDA 3NIVA 3FRCA 1GUKA 4EVMA 3ERWA 1O8XA 2N5BA 3O3TA 4WF4A 5KN2A 1WOUA 3KH9A 3PINA 2L6DA 2GSQA 3I6AA 4KNDA 2R5GA 3DMLA 1XXUA 4JBBA 3F8UA 5EPFA 3WYWA 3TDGA 3S9FA 4HU9A 1JHBA 4KA0A 3P7XA 3Q18A 3UMAA 1A2JA 2DMLA 4KGIA 3A2XA 1TKDB 3QPMA 2L6CA 3DIEA 1O7UA 5DQSA 1PA3A 4Q5QA 3R2QA 1YEPA 5EVOA 2IMEA 3F4TA 5ENUA 1PL1A 3ZIJA 4HZ2A 3HA9A 1OYJA 6GSYA 3W8SA 3EE2A 4YQUA 4OFNA 1O73A 5AIXA 1HNBA 4ECCA 1ZL9A 1SKRB 2R3XA 5D9TA 3M1GA 1JZWA 2MBSA 1Q98A 2HXKA 4PUFC 4IGJA 2L4CA 1FG4A 4MP4A 2LJRA 1X5CA 5COHA 1AIUA 5KEJA 3CYNA 3W8JA 1THOA 2FWEA 1ERUA 4TVEA 3DXBA 5A4UA 1EP8A 3Q74A 2YJ7A 2LRTA 1QQ2A 1Z3EA 3WGDA 1W89A 4BWQA 1FOVA 4DSRA 3LG6A 3BBYA 1GLPA 3EYTA 4ZL9A 4IQ1A 4PQ1A 4TXVA 5ECRB 2HI7A 2C3QA 3D22A 1CQHA 1G7OA 2O7KA 1X5EA 2HSHA 2B3SA 2VD0A 1PQNA 2X99A 2J9HA 3W6GA 3GL3A 5CAXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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