3RPPA

Crystal structure of human kappa class glutathione transferase in apo form
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
220
structure length
216
Chain Sequence
GPLPRTVELFYDVLSPYSWLGFEILCRYQNIWNINLQLRPSLITGIMKKPPGLLPRKGLYMANDLKLLRHHLQIPIHFPKDFLSVMLEKGSLSAMRFLTAVNLEHPEMLEKASRELWMRVWSRNEDITEPQSILAAAEKAGMSAEQAQGLLEKIATPKVKNQLKETTEAACRYGAFGLPITVAHVDGQTHMLFGSDRMELLAHLLGEKWMGPIPPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and kinetic studies of human Kappa class glutathione transferase provide insights into the catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase kappa 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 69
structure length 216
sequence length 220
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3rppA01
4EXJA 3H1NA 4NV2A 3L9SA 3KTLA 2K8VA 5D9XA 3QAWA 2CVDA 1F6MC 5ECQB 2FNOA 2H8LA 3NOFA 2IMKA 1A24A 3U5RE 4IP1A 3LXZA 3EE2A 4POLA 4ZB6A 1VRSD 2NDOA 2MMNA 3E9JB 2GQKA 2TRCP 3UL3A 3IC4A 3F3RA 3VLNA 3BBYA 3ZIVA 2HZEA 2V1MA 5F0GA 4WKWA 4GXZA 1TOFA 4V2MA 3KIJA 3APQA 4K0NA 1TK0B 2X8GA 19GSA 5LD0A 1QGVA 4IP6A 5AIVA 4NWYA 2AJQB 2CVKA 1SJZA 4K7IA 5G30A 1XWGA 4TKYA 5IQYA 3DIEA 1PQNA 2H1BA 2V6KA 1PKWA 4POKA 4Q5FA 3VWWA 2HZFA 3J7Yb 3E3EA 5E4WA 1Q98A 3IAM2 4ISDA 4IJIA 3D21A 1GNEA 1XBSA 1XWCA 4OFTA 3VWVA 1S3AA 4FYUA 5J5NA 3I6AA 2HRNA 8GSSA 1TRVA 3W8SA 2YWOA 5ECMB 1NW2A 5DCHA 4N11A 1KEBA 4RQRA 4QL9A 3LFLA 2GT6A 3LGCA 2LTKA 1X5EA 5J41A 4IHUA 3CRTA 3TJKA 1XIYA 3GSTA 2LNSA 4EC0A 1GWCA 2J9HA 3I9V2 1VGLA 5IOXA 1SKSB 4N30A 3CSHA 3UVTA 2C3TA 1A0RP 2GVPA 2WULA 3WYWA 2A4VA 4RI7A 3BJ5A 5LNKe 3RDWA 1EGRA 1PX6A 4L0WA 3DWVA 1FO5A 1OE8A 3EVIA 5JWQB 3APOA 2H0HA 1GSDA 1KNGA 2GTUA 2HYXA 2DJ3A 4I6XA 2MZCA 3MDKA 3F6DA 3KM6A 2HNLA 1SYRA 1V57A 1DE2A 3LYPA 5FT3A 1XXUA 3TB2A 5J9CA 2X64A 3UVHA 3HVXA 1HYUA 2N5FA 4EO3A 4ZBBA 4YQUA 2XBIA 2IMIA 5D8IA 4F0CA 1DSBA 1CQHA 5H5RA 1EZKA 4ZB9A 2LSTA 4PX1A 3TKPA 1SJIA 1GH2A 4MJEA 2LNTA 1OKDA 2JU5A 2WRTA 4NPBA 2LEGA 5B6MA 2VCTA 3C1SA 2GDRA 4I2UA 3RBTA 4MLYA 5F8BA 3F8UA 2DC5A 3U6VA 1ZYQB 4MZBA 2OA7A 1PL2A 3MAKA 4NV5A 2B7JA 3F4SA 2O87A 2ZCTA 3GKMA 3ZIJA 2GLRA 1WPIA 3Q6OA 5IO2A 1AQWA 4LMWA 3BCKA 1O8XA 3FZAA 2GSSA 1GLPA 4MZWA 3UEMA 2HLSA 3CSJA 4KAEA 4ECBA 3AY8A 2CZ3A 4BWQA 3KEBA 4KW6A 3M8NA 3O6TA 4GWRA 4JZQA 2BTOT 1WJKA 1FOVA 2H1GA 2JL4A 2GGTA 1BX9A 4FO5A 1E2YA 4G2EA 3CRUA 4IN0A 1O6JA 2C8UA 1H75A 3FZ5A 2TRXA 2HT9A 2E0QA 2H70A 4K1FA 3FHKA 1JZRA 3GX0A 2NPBA 5ECNB 1T1VA 4O7HA 3ZVJA 5F05A 2F8FA 1U3AA 2P0GA 2OACA 4EF0A 2GT5A 5INYA 2O85A 1Q4JA 1HNBA 2NVLA 2OBIA 1FHEA 1SL0B 1IYHA 4GTUA 2WFCA 2LJKA 1SK0A 4ZL7A 2XPEA 2N5AA 4WF4A 3US3A 1BG5A 1YY7A 1HNAA 3FK8A 4KGIA 5D9TA 3EURA 1EEJA 2CVBA 4KSMA 1R7HA 3A2VA 1ERWA 2HI7A 1GNWA 4ML6A 4WR5A 2L5LA 3MWHA 2PWJA 1G0TA 3CTGA 4JE1A 2AYTA 3Q19A 2H30A 2F8AA 3D6IA 3L9VA 1G7EA 3OR5A 3H93A 2ON5A 2C1YA 1O81A 2ZUPA 2EIOA 4IW9A 2VM1A 4X43A 4ECCA 2PVQA 4L0UA 4KCAA 3IRAA 2VLUA 5IMZA 1TRUA 1F3BA 5JWOB 3LXTA 4YQMA 1K0DA 3L4NA 1TK5B 2DJ1A 2FWFA 2R3XA 4L8EA 3M9KA 4IGJA 3TGZA 2XC2A 4O92A 4K0GA 2YWIA 1XOBA 17GSA 2IMEA 2OKAA 2GZPA 5DQYA 5G5EA 5HFIA 1GULA 1GUMA 4J57E 2V6OA 2B6MA 1A8YA 4MH3A 4AJ7A 4F0BA 2I4AA 4DSQA 3UAPA 2B5EA 5HQPA 5IIZA 4BA7A 2CAIA 4ZB8A 2F51A 1BAYA 1J08A 4HQZA 2KP1A 1A2JA 3K8NA 1PX7A 3IOSA 2X99A 1ZL9A 3WT2A 1Y25A 4MCUA 3HD5A 3IA1A 3SBCA 2B7KA 3ZLPA 1A2MA 1T3BA 1JZOA 1AQXA 5EPFA 1U87A 1YKAA 1JZDA 1Z6NA 2RM6A 3EMXA 1F9MA 3L78A 5EVOA 2YWNA 2K6VA 4IQ1A 4XTSA 4EL1A 3VURA 3HDCA 2C0GA 1XCCA 3M9JA 2N5BA 2H66A 4JBBA 4HJMA 1ST9A 1VF3A 1V2AA 2LUSA 4MJCA 6GSWA 1X0RA 5ECOB 5KN1A 4PQ1A 4EKZA 4G10A 4MMMA 3FEUA 4I5QA 1T7PB 3ZL5A 7GSSA 3D0ZA 4HU9A 3EC3A 2PMTA 4MJBA 5ABRA 4Q5RA 4OWYA 1JZWA 1NM3A 2MMOA 2NTOA 2IPAA 1LJRA 4XS1A 3HXSA 3RPNA 2FY6A 1PN9A 1SD8A 1PRXA 5CAXA 4I97A 1JHBA 2R6KA 1ABAA 3I43A 1TW9A 2VCQA 2TIRA 3G9BA 2GS3A 2XHFA 4AF2A 2C0FA 3QD9A 2ZNMA 2VM2A 3TJFA 5DVBA 3C71A 2PUKC 1M7TA 3HVVA 1W4VA 5GSTA 2DJ0A 1KBNA 1XVWA 3IBHA 4ZBDA 4TR0A 1XW9A 1K0CA 4F9ZA 1TU7A 3QDNA 1TI1A 3P90A 2HSHA 2JZSA 3HJPA 5IMCA 4HZ4A 2C3QA 1TRWA 3QFBC 4L5OA 3ZZXA 3O3TA 4ID0A 2VL2C 1SU9A 4GSTA 3D22A 4XS6A 2MMZA 1OC9B 2PBJA 2WJUA 1V9WA 1FVKA 2O8VB 5ECSA 3LG6A 3ERFA 5G31A 4YQVA 4GLTA 1QFNA 1RW1A 1EWXA 5IMVA 4WBJA 2GSTA 3PINA 2P5QA 3ZFBA 1TJDA 1EV9A 2CX3A 4OCFA 2KP2A 3ZRDA 1F3AA 4O32A 4AJ6A 2WDUA 1Z7PA 5DJMA 1K0BA 5CO3A 3IXRA 1AXDA 4HEA2 1B9XC 4MABA 3VPTA 1JLVA 3JCML 2R4VA 1GTAA 1EP7A 4OCEA 6GSTA 1TI3A 4EDYA 2K9FA 2GZYA 2OBKA 4P3YB 3TJJA 3TUEA 1R26A 3F9UA 2RUFA 5HR2A 1LBKA 2X8HA 4ZL9A 4PURA 1R5AA 3P8WA 3PGTA 4NXIA 4E8EA 3FRCA 3W8JA 1GSFA 2H6YA 3BCIA 5AN1A 4LMVA 18GSA 2LKUA 4MF6A 1OKTA 2OE1A 4KX4A 1PMTA 3VK9A 2E7PA 1K3OA 2H1AA 2L5OA 3SWLA 4O5RA 3FR3A 5ECRB 4MDCA 4K2DA 5JCUA 1TTZA 3UIWA 2OADA 3UOMA 1T4YA 1PKZA 2QSIA 1KTEA 2JADA 2RM5A 2L4CA 2H0IA 2H71A 3ZREA 1SK1A 5DJLA 1THXA 4LA1A 4EE0A 5GZZB 3ZVJD 3TJGA 3KTBA 1VF2A 3A2XA 1Z6MA 2KHPA 2LV3A 3EWLA 2AB6A 1V98A 1YQ1A 5A4VA 3ERGA 1EP8A 2PPTA 1K0NA 1GUHA 2I1UA 4HJ2A 5LCZA 3C1RA 3FR9A 3QOUA 2I3YA 4TW5A 1XZOA 5COHA 2VIMA 4GSSA 3TCOA 5ECLB 1ZYEA 1EOHA 4RI6A 2FCHA 2OE3A 1MDIA 5KN0A 2A2SA 4JEDA 3DVXA 1K3YA 3CBUA 1ZGNA 5DALB 2CA8A 1MD3A 2A2RA 2FA4A 2JZTA 4Q5NA 3GL3A 2F9SA 1Z7RA 2YJHA 3HA9A 2LJRA 2MBSA 4JU5A 3CMIA 1AAZA 4WXTA 5ID2A 1U88A 3FZ4A 2I9HA 5IOWA 2H76A 1UVZA 1GSEA 1A2LA 5CREA 5J4UA 4FYBA 4OO5A 14GSA 4NAXA 1X5CA 3IK7A 3F63A 3QAGA 2M80A 1F2EA 2P5RA 3DMLA 4V2NA 1B4QA 3FR6A 1QQ2A 4PUFC 5HFKA 4PNGA 5J3RA 2FWGA 2IFQA 4KDYA 1GRXA 4KB3A 4KDUA 1S3CA 1YF1A 5E59A 1B9YC 2YPMA 1OC9A 2YJ7A 1UC7A 1S3DA 4PQIA 1YKCA 2EIQA 4ZIJA 5EL8A 2C0DA 16GSA 2JSYA 1K0MA 4TXVA 2CT6A 4KDXA 2VLVA 3D5JA 1ZMAA 3MNGA 2VL9A 3QAVA 3IV4A 2VUPA 6GSVA 1Z5YE 1AC1A 5FHIA 4TR3A 2PGTA 2VLTA 1SD9A 5F06A 1GTIA 1OYJA 1O8WA 2GSQA 2VCVA 1M2DA 2VCWA 2CAQA 4GSNA 5C00A 1JLWA 1X9SB 1K3LA 3M0FA 1M99A 2VL2A 3LEFA 4N0VA 1THOA 4Q5QA 5AGYA 4IBPA 1RK4A 2KUCA 5IMFA 2RUEA 1DBYA 2FLSA 4N10A 3DXBA 3IE3A 5G2ZA 4K6XA 3LYKA 3CYNA 5KN2A 5G1LA 4GF0A 2B1LA 1FW1A 1QXHA 3ZYWA 3TKSC 3GN3A 1ZCPA 4I8BA 4MJAA 4L5LA 3GKKA 4TRXA 4RUVA 3R2QA 2PERA 5GAPD 1TXXA 3KXOA 4AGSA 3H4KA 3HY2A 3LORA 3TOUA 1TDIA 4HUAA 6GSXA 4YAPA 4TVEA 4PGTA 1K0OA 1YEXA 3MSZA 5ELGA 3LJRA 2YANA 5F07A 5IO0A 4FIWA 4IJ3A 3EU3A 1WE0A 1XWAA 3M3MA 4V1Ag 4CDOA 1X5DA 1XW6A 3TRQA 2EIRA 2VCXA 2IN3A 1H4OA 1XWKA 2B5YA 3GX8A 2R37A 3HJMA 4LLRA 2MMAA 3GTUB 3DGQA 4JR6A 4RQXA 3S9FA 1ACVA 1EEMA 4OFNA 1X9WB 4JRRA 1I9DA 1URMA 2V32A 4ACSA 2QKEA 4MP4A 1WMJA 1SKRB 3HJOA 3EU4A 4IS0A 5C04A 3FW2A 1M9BA 4XRAA 5D9VA 1GTBA 2YP6A 5CP1A 2BJXA 2AHEA 3FZ9A 4X0XA 1GSUA 3GV1A 5DALA 3GA4A 1OC8A 13GSA 1G6YA 5H5SA 2DJJA 2JZRA 2LQQA 3HZ8A 3DEXA 5ELAA 4ECIA 3EMPA 3WGEA 2IIYA 5CRDA 3CXGA 4ZBAA 5B8AA 1O7UA 2CX4A 5AIXA 2G0FA 4J2FA 3Q18A 2CQ9A 4WETA 2YNXA 3P7XA 2AAWA 4FYCA 1O85A 3M1GA 4XCSA 4DEJA 1YZXA 2HXKA 4KSOA 3KP9A 1MTCA 3G7JA 1ERUA 3IAS2 3ZITA 4D73B 3HHVA 2H74A 2DMLA 1K0AA 3F0IA 3ME8A 4ULXA 5HR3A 4PNFA 1OVNA 4YAVA 4PXOA 1NHOA 4PQHA 1FG4A 4ILFA 1XOAA 3GKNA 4QQ7A 2GQLA 2M46A 1TRSA 3WD6A 2B3SA 4GQCA 2HSYA 2YWMA 3ME7A 3KH7A 3IR4A 3RHCA 5KEJA 3EINA 1M2BA 2DJKA 4J56E 4TXOB 1GTUA 4KA0A 3F4TA 2QC7A 4MF7A 4NMUA 1AQVA 5CRWA 3VPQA 1USBA 2FWHA 1YF0A 1SYXA 5ID2B 1SK2A 2WGRA 1QUWA 2C3NA 4I2TA 1ERVA 4V1Ap 3DVWA 4K8MA 2K8SA 4E8HA 2MYGA 3QFAC 2IWTA 3KZQA 2DLXA 4OMVA 10GSA 4LL4B 1NSWA 5DAKB 1T00A 4GCIA 3PR8A 1M0UA 2H01A 3BD2A 3HVSA 3GRXA 3A5WA 1JFUA 2IFQB 2DBCA 5EY6A 2L57A 4KNDA 4BVXA 20GSA 1EGOA 2EC4A 1AUCA 1PL1A 3N5OA 1ML6A 3WGDA 1EOGA 1MDKA 1GSYA 3EYTA 4MPGA 3F4RA 2RIIA 2YOIA 4EDZA 1DUGA 3GIXA 3GUSA 2HRFA 1SL1B 1B4PA 2CV4A 5JCWA 1OE7A 4MPFA 1A0FA 1CQGA 2NBSA 4ECJA 3FKFA 5A4UA 2WS2A 1PA3A 2H0GA 2FHEA 3RPPA 2B1KA 3TOTA 1QMVA 1TKDB 2BMXA 4JR4A 3ISOA 3D4MA 4H86A 3TRXA 9GSSA 4FH8A 3QPMA 3IHQA 2HFDA 3TKSA 1YJ6A 4HOJA 3NIVA 3GHAA 2LRCA 1V58A 3KCMA 2R5GA 3GTUA 5DCGA 2YZUA 3GH9A 3GURA 2GZZA 1AIUA 2LQOA 2JSZA 3P2AA 4DVCA 2WCIA 3UJ1A 1ZOFA 4TR1A 5ECIB 4BPYA 2FD3A 3G7YA 3IK9A 3J7Yk 3LWAA 5H5QA 2JACA 5KN3A 3H79A 4WF5A 2H73A 4DSSB 6GSSA 4HI7A 2VAFA 2YCDA 5IPHA 4YH2A 5D73A 3GYKA 1MEKA 3LQ7A 2QGVA 3VI5A 3TKSE 3HCZA 1VF1A 3CTFA 2V2GA 4XS4B 1Z9HA 2PN8A 4WEYA 3RHBA 2ES7A 5IPGA 2LS5A 1PGTA 1GSQA 2F3MA 3V1WA 2J23A 5CRHA 1SJ6A 5ECHB 4HS1A 4HU7A 4ZILA 4D73A 1Z3EA 4MA9A 3FY7A 3KMOA 1VF4A 2H6XA 5D93A 4KH7A 2L6DA 2FA8A 2O89A 3KP8A 12GSA 2MBTA 3BOAA 4Z7XA 1UA5A 2DMMA 1R5PA 2LRNA 3PH9A 5ECKB 5JWRB 3ZFLA 2KLXA 3CSIA 3F3QA 3RAZA 2O7KA 1BQ7A 4XHMA 4TXOA 3NZNA 11GSA 1TK8B 2YN1A 5D9WA 4PUAA 4ZXGA 3WT1A 2XBQA 1YDKA 1EV4A 1B8XA 5B8BA 4G9HA 5DDLA 3VWXA 1FVJA 4CHSA 1GL8A 3GMFA 4X1UA 1WOUA 5HFGA 22GSA 2DJ2A 5DAKA 1AW9A 4POBA 4EUYA 3VI7A 4IQAA 2PU9C 5DQSA 2PVOC 3TRPA 2H19A 3ERWA 3QMXA 3W6GA 2VD0A 4CW9A 2GQMA 3ZMKA 3G7IA 2H6ZA 1MDJA 1FB0A 3UBKA 4WR4A 2VD1A 1F37A 2C4JA 3TJBA 1N8JA 1GP1A 2R2JA 4HQSA 1U6TA 1PD21 4EVMA 4MK3A 1SKWB 1GSSA 2C80A 5AISA 5L71A 5FWGA 4OO4A 2REMA 5CYYA 2X8CA 4IELA 5G1KA 2L59A 1I5GA 3DD3A 3GSSA 3QCPA 2L4QA 1B48A 2AUVA 3WGXA 2L6CA 2IL3A 1M9AA 4KUNA 3UBLA 2H72A 2DIZA 4F03A 2VOCA 4DSRA 3F6FA 1XPVA 3FYGA 2GSRA 4K9ZA 2D2ZA 1O73A 4IKHA 1WRYA 3KJYA 4POMA 4TN8A 2FGXA 1UN2A 2I81A 3HKRA 2H1DA 3H8QA 5IM9A 1E6BA 1XFLA 4F2IA 3TDGA 1HD2A 4KCEA 1TU8A 3QR6A 5A5KA 1X9MB 3KH9A 2YV9A 2HZEB 2RLIA 4QL7A 3HZ4A 5JCGA 1J0FA 1WP0A 4DSSA 5ENUA 2C0EA 2AV4A 2DIYA 4KE3A 1G6WA 1PSQA 5G5FA 4TOPA 4OD7A 5B6NA 2DSAA 4GRFA 4XS4A 2K18A 4BL7A 1ON4A 4WBRD 6GSUA 1T8EB 2WZ9A 3VWUA 4K7OA 1U3IA 2FWEA 1Y6EA 2CZ2A 1M2AA 2V41A 1ILOA 4XRDA 3KGKA 2IJYA 1A23A 4TR1B 2XPDA 4F82A 1XWBA 1SL2B 3GL5A 1V40A 1G7OA 3VFIA 3GH6A 1N2AA 4G19A 4OFMA 2G2QA 2LRTA 2B5XA 3IDVA 2Z9SA 3A2WA 2LJAA 3C7MA 1MD4A 1OAZA 3C8EA 2M72A 4MF5A 5A4WA 5CRGA 2KOKA 5DBQA 3O76A 3L9UA 2ON7A 1BJXA 3KMNA 5IMDA 1FAAA 1WWJA 3TKQA 3DRNA 3L0HA 5HR0A 2OJLA 3GKXA 3D4TA 3DKSA 1T4ZA 3LSZA 1R4WA 4MH2A 3C73A 1LU4A 5J9BA 3N9JA 3TKRA 1FB6A 2OE0A 3KD0A 3HYPA 4N0ZA 5HR1A 4BWSA 1DE1A 3E0UA 1OC3A 1SENA 1TP9A 2E2GA 2ALBA 4AJ8A 1NHYA 4IVFA 4HDEA 5ECPB 1W89A 1XVQA 1ERTA 1HNCA 5CNWA 1RQMA 5B7CA 5IMAA 1J9BA 3Q74A 2FUG2 3ZMLA 1BEDA 2YV7A 3IPZA 4ML1A 4XIHA 2IMDA 2VL3A 3UMAA 5GSSA 5GAND 1IYIA 3GNJA 1XW5A 2E2MA 3I69A 1YEPA 1BYEA 2P31A 4V2LA 5D96A 4TR4A 4LL1B 3A3TA 3GFKA 1GUKA 6GSYA 4NHWA 1GLQA 1QK8A 4MZCA 1C72A 4GQFA 4BVYA 3APSA 1ZZYA 4K7NA 2H75A 2WB9A 2HE3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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