3RPPA

Crystal structure of human kappa class glutathione transferase in apo form
Total Genus 69

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
220
structure length
216
Chain Sequence
GPLPRTVELFYDVLSPYSWLGFEILCRYQNIWNINLQLRPSLITGIMKKPPGLLPRKGLYMANDLKLLRHHLQIPIHFPKDFLSVMLEKGSLSAMRFLTAVNLEHPEMLEKASRELWMRVWSRNEDITEPQSILAAAEKAGMSAEQAQGLLEKIATPKVKNQLKETTEAACRYGAFGLPITVAHVDGQTHMLFGSDRMELLAHLLGEKWMGPIPPA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS2 (35-41)AH9 (202-210)AH8 (162-178)S1 (6-12)3H2 (111-113)AH3 (88-94)AH1 (17-29)AH5 (114-128)TI2 (29-32)TIV1 (30-33)AH4 (97-109)3H1 (44-46)AH7 (149-157)TIV2 (131-134)AH6 (135-145)S4 (193-198)TIV3 (189-192)S3 (185-190)TIV4 (199-202)TI1 (13-16)TVIII1 (57-60)AH2 (61-77)TI3 (158-161)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures and kinetic studies of human Kappa class glutathione transferase provide insights into the catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase kappa 1
total genus 69
structure length 216
sequence length 220
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3rppA01
3TJKA 3GH9A 3ZMLA 4J2FA 3ZFLA 3F0IA 2OE1A 3BJ5A 3GIXA 1FB0A 1JZWA 2PN8A 4TR4A 4ZXGA 4XRAA 4PX1A 3FY7A 4IN0A 1G6YA 1O73A 2L5OA 1OKDA 4DSRA 2FNOA 3LSZA 2H1BA 3KZQA 2YWNA 3KH7A 5ECMB 3ZTLA 4GQFA 3GL5A 2WZ9A 4TXOB 4F9ZA 4CDOA 3LQ7A 5B6NA 2IMIA 1F9MA 1PMTA 4L5LA 2VLTA 4P3YB 2H30A 3TJFA 4EC0A 1GWCA 2YCDA 1MD4A 3EC3A 1GUKA 1VRSD 3EE2A 4K6XA 4IELA 3TCOA 1EV4A 3MNGA 1GSYA 3UBKA 3GX0A 2P0GA 3N5OA 5IQYA 2YN1A 20GSA 1SJIA 3UOMA 5HR2A 3KMNA 4PQ1A 3G9BA 2BMXA 1XWBA 2H75A 1T8EB 3HYPA 1K0MA 2VAFA 2LKUA 5IOXA 2IFQA 3M1GA 5DDLA 5CAXA 2H74A 2GZPA 5CP1A 5DJMA 4GTUA 1GSSA 3BOAA 5DAKA 3TUEA 2PPTA 4V1Ag 1M9AA 2O87A 5H5RA 1M2BA 2NDOA 3DIEA 1O8XA 2FWEA 2H66A 4O5RA 1WIKA 4G9HA 5A5KA 1ZL9A 4ZL8A 2B1LA 4WF4A 5FWGA 4RI7A 5J9BA 1GH2A 3UBLA 1WP0A 3BCKA 4N0VA 3GSSA 3KJYA 1G6WA 2FUG2 3M9JA 2YANA 2V2GA 4HEA2 3LG6A 3TRPA 3O76A 5ECIB 2DSAA 4MP4A 4F82A 3HHVA 3DEXA 3MDKA 1ERUA 3CXGA 4KW6A 2IMEA 3CTGA 2LS5A 2CZ2A 5D9WA 2RM6A 4EUYA 1FHEA 5G31A 1YEXA 3BBYA 2MZCA 5J5NA 3F6FA 4MABA 3FR9A 4EDZA 1K0DA 3KD0A 1BEDA 1OE7A 2BJXA 1Z7RA 5IPGA 3FZAA 4GQCA 5KN2A 1H75A 2LJKA 2PGTA 1C72A 3TDGA 1PKZA 1GUHA 2OACA 4N30A 5J3RA 2WS2A 1JZRA 1QXHA 3W8SA 1HYUA 3LWAA 2HSHA 1PGTA 1GTUA 4XIHA 1TRUA 3QCPA 2H0IA 3HA9A 1IYHA 3GL3A 4NV2A 5B8BA 1TRSA 1XVWA 2I4AA 3LEFA 3G7JA 3GYKA 2LJRA 2B5EA 2AHEA 1XWAA 1O8WA 1ZCPA 1GSUA 1EOGA 5LNKe 1YQ1A 1AAZA 2OJLA 3FR3A 1MEKA 4BPYA 5IPHA 5GZZB 3C73A 2B1KA 2YJHA 4ZBBA 4D73B 1LBKA 2HLSA 4JE1A 2M46A 3HZ4A 4F2IA 2R3XA 1X5DA 2K9FA 3TKQA 4MDCA 3CMIA 1MD3A 2E2MA 4PURA 4TXOA 5HR0A 4I8BA 2LQQA 1Z3EA 2L5LA 3QAWA 1J9BA 3M9KA 4AJ6A 2DJ0A 1PL2A 1T1VA 2VD1A 2H1GA 5E4WA 1XCCA 4KDUA 3KCMA 4K0NA 3U6VA 3FZ9A 2VD0A 3EINA 1R5PA 2L4CA 2MMOA 1N2AA 2LEGA 2DIYA 4LLRA 2CA8A 2WDUA 5A4VA 1XWCA 3DXBA 3GMFA 5HR3A 1OKTA 2L59A 1M7TA 4HI7A 2C0GA 1CQHA 1ML6A 1W89A 3HJPA 1EEJA 1GNWA 2WJUA 1RW1A 3OR5A 1K0AA 1SK2A 5DCGA 2FD3A 5IMFA 3KTLA 4PUAA 1GTAA 2GVPA 4HZ2A 4XTSA 3FRCA 3GFKA 1GSEA 2QC7A 1TKDB 3GUSA 4V1Ap 4RQRA 1DE1A 1O81A 3EURA 1HNAA 4KGIA 1F2EA 4WEYA 19GSA 3QOUA 4DEJA 3TB2A 2I1UA 5B6MA 3QR6A 2J23A 1EGOA 5DJLA 2P5RA 4K8MA 5JCWA 3EU3A 2O7KA 1V57A 2JSZA 2KLXA 4OMVA 4MK3A 4MCUA 4XS6A 1Y25A 5ECPB 2JACA 4FYCA 2L4QA 3O6TA 2GSRA 5AGYA 1ERVA 10GSA 3HDCA 2YWMA 2EIRA 5CO3A 1ABAA 2M80A 4IVFA 2L6CA 4K9ZA 4GLTA 4IS0A 3H1NA 2FWFA 5IMVA 4KUNA 3TOTA 4OO4A 2MMZA 4X0XA 2AV4A 2IMDA 2JZSA 3QD9A 3IDVA 1PX7A 1AQWA 2WULA 1PRXA 3ZVJA 4JU5A 3APOA 5GSSA 2GS3A 3HKRA 2LQOA 5D8IA 5ECSA 3L0HA 2LRTA 5HFGA 3Q19A 3QAGA 1ZZYA 5B8AA 1S3CA 3HD5A 1S3DA 1JZOA 1O85A 4K1FA 5JWQB 1XVQA 1YDKA 2GSSA 3KIJA 1FB6A 4K0GA 2HRNA 3KP9A 3CSJA 4BWSA 4D73A 1K3YA 3GV1A 3A5WA 4JEDA 5KN1A 4TOPA 3Q74A 1X9WB 3RPPA 2Z9SA 2XBQA 4ML6A 3HVVA 4X1UA 4FYBA 1ST9A 5D9VA 3FKFA 1HNBA 1LJRA 4ID0A 5J9CA 1PSQA 1YY7A 5ECNB 1T7PB 3QAVA 3ZRDA 1FG4A 3ERWA 2CZ3A 4NXIA 3TJGA 1WE0A 1B4QA 3WGDA 4ECBA 3D5JA 3L4NA 2TRXA 4MJBA 2KUCA 2YWOA 6GSYA 3V1WA 2XPEA 3ZVJD 3DVXA 1XIYA 4BL7A 4IP1A 3EMPA 4RUVA 2PERA 4G19A 3EWLA 4FH8A 4TVEA 4NWYA 2KP2A 1A24A 5ECHB 1M2DA 2YWIA 2VCWA 1EP7A 2XHFA 2LRCA 4OFTA 4FO5A 2B7JA 1V9WA 2R4VA 3CYNA 1MDKA 2F51A 2X8GA 5GAPD 2DJ1A 4TR1A 4OWYA 4LL4B 3KEBA 1EEMA 2YJ7A 2L57A 1ACVA 2K6VA 3ZYWA 1ZMAA 3VI5A 3F8UA 2CAQA 3ZIVA 4RQXA 2DIZA 2GTUA 3DD3A 2ZNMA 4ILFA 2FGXA 4MZWA 6GSVA 4CHSA 1NSWA 1A2LA 4MJAA 5B7CA 1GNEA 1OC3A 3U5RE 2ES7A 2GDRA 4KX4A 5G5EA 1V58A 4XS1A 1OE8A 4OCEA 5CNWA 2OE0A 2VL9A 1TTZA 12GSA 2E7PA 3F63A 3IC4A 1I9DA 2I9HA 5D93A 3VLNA 4KCEA 4LMWA 1YZXA 1JLVA 2VLVA 1VF1A 3D0ZA 3P8WA 3VFIA 1F37A 3ZITA 1SENA 2HRFA 2H8LA 4KH7A 1N8JA 4TN8A 2IN3A 1TP9A 4PNFA 2JZTA 3UARA 6GSWA 3D4TA 1BQ7A 2VCVA 4QQ7A 4HJMA 1EOHA 1A2JA 2PUKC 1OYJA 2V6OA 2EC4A 3ED3A 2IL3A 1QFNA 2VOCA 1Z5YE 2WGRA 2FY6A 4K7NA 2C3TA 2K8SA 3UVTA 2C4JA 2YPMA 3FR6A 5G1LA 1T00A 1XWKA 2LJAA 1AC1A 2HT9A 3FW2A 4KSOA 4TW5A 1M99A 3W8JA 3FK8A 3LXTA 1T4YA 3TKRA 1U88A 5KN0A 3N9JA 1TK5B 1BJXA 4MJCA 3L9SA 1SYRA 1G7EA 1R4WA 4JRRA 3MSZA 3HVSA 4XHMA 4NHWA 5AIVA 4GXZA 3GKXA 1SL2B 2YV7A 4LA1A 4WETA 4V2MA 2NVLA 1B8XA 2A2RA 2AYTA 2X8HA 3CRUA 4OFMA 4E8HA 7GSSA 5D96A 2A4VA 2VLUA 2CVKA 5IMZA 3IK7A 2R5GA 1DE2A 5HQPA 2DJ3A 1EP8A 5GAND 4AGSA 3QDNA 4EF0A 1XOAA 4MF5A 9GSSA 4G10A 1QUWA 3EU4A 4I5QA 1B4PA 4MPFA 3BCIA 2TIRA 3RAZA 3HJMA 1VF4A 1XW6A 5HFKA 3UAPA 4PNGA 4H86A 1SL1B 1NHYA 4EE0A 4POBA 2CQ9A 5EY6A 3KH9A 4K7IA 2WB9A 1O7UA 2FWGA 5G5FA 2RLIA 2VCTA 2V41A 1AQXA 4Q5QA 5D73A 1GLQA 3IK9A 3US3A 2N5AA 3L9UA 2RUFA 3ZFBA 2K8VA 4POLA 1NW2A 1AQVA 4TKYA 2V32A 1SU9A 5H5QA 2G0FA 3TKSC 3HVXA 1TXXA 4JR4A 1M0UA 1SJZA 3MWHA 1S3AA 1F3BA 1BYEA 1A23A 5DCHA 2GSTA 3SWLA 4LMVA 5J4UA 3WT2A 3QPMA 3VWVA 1EGRA 4TRXA 3TOUA 2MMAA 3S9FA 2HZEB 4TR3A 4OD7A 2RIIA 3GURA 4ECJA 2H01A 3FYGA 3IHQA 3J7Yk 1WOUA 2J9HA 2LTKA 3QMXA 4ECIA 5IMDA 3KM6A 2K18A 1SKWB 2EIOA 1R26A 4YQVA 2H0GA 1HQOA 1MDJA 2QKEA 4POKA 1DUGA 1HD2A 2GZYA 1WWJA 8GSSA 4OFNA 1TK0B 2C8UA 3IE3A 4QL9A 2H71A 3UJ1A 2FA4A 4ZB6A 1PL1A 1DSBA 2H1AA 1X5CA 6GSUA 1JLWA 4IKHA 4GSNA 2JL4A 5E59A 3UIWA 2CT6A 2VUPA 3A2WA 4TR1B 2F8AA 1EZKA 4X43A 1URMA 4KCAA 2P31A 5CRDA 1K0CA 3ME8A 1AUCA 1VF3A 16GSA 5DQYA 4BVXA 2HZFA 2HXKA 5G30A 1SKRB 3DKSA 4WKWA 3A2XA 3WGEA 1THOA 3RDWA 4AJ7A 2L6DA 4KE3A 2OE3A 4K7OA 2ZUPA 2PVOC 1EWXA 2DLXA 3E0UA 3GTUB 4BVYA 4O7HA 3WYWA 1WMJA 4MH2A 1U6TA 2V6KA 2IJYA 1FOVA 3GA4A 2ALBA 3PH9A 3HXSA 4YQMA 2C0FA 1U3IA 3RHBA 2JADA 2WCIA 4IGJA 17GSA 2C0EA 1G0TA 4GSTA 2IWTA 1MTCA 3ME7A 1KEBA 1ERWA 4L0WA 2NBSA 3H8QA 4N10A 4NMUA 3I69A 5D9XA 3FHKA 1GTBA 2NPBA 2X99A 1JHBA 3TJBA 2OA7A 4NHZA 1XFLA 3GX8A 3QFBC 5EVOA 5IM9A 3LXZA 2LV3A 2PVQA 1TRVA 3I6AA 2AB6A 1WJKA 1E6BA 1KNGA 3KGKA 1PQNA 2OADA 4HDEA 3DRNA 5JWOB 3ERFA 4PQHA 4PXOA 2HI7A 1YEPA 18GSA 1B9XC 1TRWA 4N11A 3LFLA 5AIXA 2E0QA 1VF2A 2C3NA 3C71A 1K0OA 2WFCA 2FCHA 3VURA 3C1RA 4IBPA 5AISA 4YQUA 5GSTA 3E9JB 3Q18A 4I2TA 3C8EA 4IW9A 5LD0A 2E2GA 6GSXA 5F8BA 3TRXA 4JR6A 1WRYA 1USBA 4MF6A 4ZL9A 1J0FA 5IOWA 3APQA 3L78A 2HZEA 4I2UA 3DVWA 1UC7A 3WD6A 1GSQA 5ABRA 3TKSA 4Q5NA 1M2AA 2YP6A 2AAWA 4WBJA 1VGLA 4ULXA 3ZL5A 2ZCTA 4HU7A 3J7Yb 1EV9A 5A4UA 3H4KA 4DVCA 1TDIA 4HJ2A 4O32A 3UVHA 2IPAA 2ON7A 1IYIA 3VWWA 1K3OA 4KNDA 5DQSA 2LRNA 1NM3A 4IHUA 2IMFA 2F9SA 5IMAA 3M0FA 2AUVA 3LJRA 3TKPA 2GT6A 1G7OA 1GTIA 3CSHA 3NIVA 4PUFC 5JCUA 5DALA 3GH6A 3IOSA 1U3AA 1PX6A 2NTOA 1YF1A 2BTOT 1K3LA 4DSSB 1ZOFA 1QQ2A 3DMLA 2LNSA 3PGTA 5IO0A 1SK0A 1RK4A 1ON4A 5CRWA 4ACSA 4NAXA 2LUSA 2H0HA 1B9YC 1I5GA 4KDYA 3P2AA 1WPIA 2D2ZA 4YAVA 1R7HA 1ZGNA 3F4RA 1BX9A 4EO3A 5CRGA 2GQKA 3GTUA 1GULA 4V2NA 2VCZA 4F0BA 2F3MA 3WGXA 3W6GA 2QGVA 3NZNA 1JZDA 3KTBA 1TK8B 4ZB8A 3HZ8A 4J57E 4XCSA 2CAIA 3ZLPA 5ECRB 3VPQA 1KTEA 3CSIA 2WRTA 1XXUA 4YAPA 1JFUA 3TJJA 2X8CA 1A8LA 2GQMA 1V98A 2VCQA 1V40A 5G1KA 2FHEA 2H70A 4ZBDA 1SJ6A 2DJJA 3ZMKA 2TRCP 1ZYEA 5D9TA 5ECKB 4MF7A 14GSA 5EPFA 4LL1B 3DGQA 5ID2B 3UMAA 5ECQB 1FW1A 3IBHA 2CVDA 1HNCA 3NOFA 4QL7A 3MAKA 1A2MA 2GT5A 2LSTA 5J41A 4XS4A 2GQLA 3FZ4A 2IIYA 2H6ZA 3F3RA 1YKCA 3HCZA 2QSIA 1UN2A 2VO4A 1SL0B 2M72A 4I97A 4EKZA 4POMA 1RQMA 2EIQA 5ELGA 2C0DA 2YZUA 1E2YA 4MH3A 5FHIA 4EXJA 4ISDA 3ZIJA 2B5YA 5INYA 3IAS2 1K0NA 2H1DA 5CYYA 3M8NA 3RHCA 2ON5A 3ISOA 4BA7A 2B3SA 1Z6NA 3CRTA 1TI1A 2C1YA 2XC2A 3DWVA 1TI3A 4N0ZA 1OC8A 2CX3A 3C7MA 2CVBA 4NPBA 4FIWA 1T4ZA 3KMOA 5ELAA 1A0FA 3G7YA 2HE3A 1NHOA 3F3QA 2VL3A 3Q6OA 5H5SA 2REMA 5ENUA 4MMMA 3IRAA 3PINA 4L0UA 3GSTA 4XRDA 1AIUA 2GGTA 3H79A 3A2VA 1M9BA 1MDIA 1XWGA 3GHAA 4EL1A 2G2QA 2VL2A 3HJOA 4F0CA 1UA5A 1X9SB 3E3EA 2JSYA 2B6MA 1UVZA 4MA9A 4ZL7A 3IR4A 3KXOA 2IMKA 4L5OA 1PA3A 3A3TA 1TW9A 2PWJA 2OKAA 5JCGA 5CREA 3GKNA 3H93A 1KBNA 4HU9A 4JBBA 1THXA 1XZOA 3F9UA 1Q98A 1V2AA 2JZRA 4JZQA 1GSDA 4DSSA 3IPZA 5CRHA 2O8VB 3IA1A 1YKAA 2MMNA 4ML1A 3FZ5A 2O85A 1K0BA 2R2JA 2H19A 2DJ2A 22GSA 2VIMA 4ZBAA 1FVJA 2DMMA 1SK1A 4ZIJA 1OVNA 4HOJA 5F06A 5HFIA 2CV4A 2FLSA 2HNLA 4PQIA 4BWQA 4AJ8A 3JCML 3D22A 3GNJA 2H72A 4G2EA 5KN3A 1PKWA 1CQGA 4GCIA 3GRXA 3P90A 3I43A 4KAEA 2X64A 5LCZA 5FT3A 1PN9A 5KEJA 1T3BA 1Z9HA 5ECLB 1X9MB 1QMVA 2R6KA 5C04A 4HZ4A 2H73A 1FVKA 2OBKA 2A2SA 5ID2A 4Q5RA 2RUEA 3O3TA 5ECOB 1Q4JA 4OO5A 2KOKA 5F07A 3K8NA 4F03A 1R5AA 4WR5A 1H4OA 1PD21 5HR1A 3FEUA 2GLRA 1B48A 3ERGA 2MBTA 5DALB 5G2ZA 3LYPA 1OC9B 1O6JA 1GLPA 2MBSA 3EMXA 5DVBA 2F8FA 4WBRD 2PMTA 2HYXA 1GSFA 1J08A 3EVIA 4HS1A 4E8EA 3M3MA 4GWRA 5F0GA 1AXDA 2N5BA 3RBTA 1TJDA 4Z7XA 1A8YA 2GZZA 5F05A 2B5XA 3VI7A 2H76A 4IP6A 4GRFA 2XBIA 1YF0A 3BD2A 4I6XA 1ZYQB 2N5FA 3GKKA 2VM1A 5IMCA 3VWUA 4ZB9A 1ERTA 1AW9A 3D6IA 3GN3A 3PR8A 6GSSA 3G7IA 3WT1A 3UL3A 5IO2A 11GSA 1GL8A 5IIZA 2O89A 2LNTA 1A0RP 2GSQA 1GRXA 5A4WA 3IAM2 3CTFA 1Z6MA 4K2DA 3VPTA 3IXRA 1OAZA 4IJIA 3TKSE 4KDXA 4Q5FA 1ILOA 1XPVA 3L9VA 3QFAC 4EDYA 2H6XA 4CW9A 2C3QA 1F6MC 2PBJA 5COHA 1TU7A 2DMLA 4L8EA 3GKMA 1X5EA 4GSSA 4V2LA 2H6YA 1BG5A 3F4SA 4XS4B 4GF0A 3RPNA 2XPDA 4OCFA 1LU4A 3F6DA 3F4TA 2YOIA 1XBSA 2YZHA 3IV4A 3SBCA 5C00A 2VCXA 3R2QA 5JWRB 3EYTA 2AJQB 1Z7PA 2IFQB 4HQZA 3LORA 2KHPA 4KB3A 2P5QA 4MJEA 1FAAA 1XW9A 2JU5A 1U87A 3VWXA 2HFDA 5DAKB 4MZBA 4FYUA 6GSTA 4WXTA 2VL2C 1DBYA 4O92A 2DC5A 1SD8A 4J56E 3HY2A 4NV5A 4DSQA 2DJKA 2B7KA 2FWHA 3I9V2 2R37A 4KA0A 3APSA 3ZREA 2RM5A 3VK9A 4RI6A 1BAYA 2DBCA 5L71A 3KP8A 2VM2A 3TRQA 4MLYA 4TXVA 2MYGA 4YH2A 3UEMA 1Y6EA 1W4VA 4MZCA 4IQAA 2I81A 3D21A 4ZILA 4EVMA 2I3YA 1QK8A 3ZZXA 1TU8A 4KSMA 1QGVA 1XOBA 3CBUA 1SKSB 1GP1A 1XW5A 3TGZA 5AN1A 4ECCA 5EL8A 4HQSA 4WR4A 2PU9C 1SD9A 3C1SA 4TR0A 2FA8A 4IJ3A 1X0RA 13GSA 1SYXA 1FO5A 1TOFA 2YNXA 2C80A 2YV9A 4HUAA 2OBIA 3P7XA 4IQ1A 1GUMA 4AF2A 3AY8A 5DBQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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