3TJGA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c51a mutant in oxidized form
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 57
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjgA00
4OMVA 5LD0A 4POMA 2PBJA 3BJ5A 1YEXA 3C71A 2VL2A 4MH2A 4XS1A 3WGXA 3G7IA 1K0OA 3CSIA 3HDCA 4P3YB 1PN9A 1TTZA 5HFKA 2JL4A 2ES7A 3LXTA 5IMFA 1EGOA 4MF5A 4MZBA 3MWHA 2G2QA 4MK3A 3LQ7A 1Q98A 4IGJA 1EGRA 3LYPA 3HJMA 3ISOA 1G0TA 3GUSA 1X5DA 1TK0B 1Z5YE 1U6TA 3W6GA 3L78A 4F0BA 3Q19A 2VCVA 3FR9A 2VL3A 2AHEA 1T7PB 4ML1A 1A2MA 1TK5B 3EMXA 2J23A 3BD2A 4K8MA 2B7JA 4OFMA 1F6MC 3HVSA 3PINA 2I1UA 5ID2A 3HA9A 4G9HA 4X43A 1A8LA 3UMAA 2FGXA 4XHMA 5ECQB 2DIYA 3QD9A 3TJBA 4GCIA 5E4WA 6GSSA 1XOBA 4N0VA 6GSWA 1A2LA 2IWTA 4DSQA 4V1Ap 2YN1A 3EINA 3Q18A 4K0GA 1YKCA 2H0HA 3BBYA 2VM2A 3L9SA 2GZYA 3GSSA 2HLSA 1HD2A 3D0ZA 3TKQA 4HJ2A 1E2YA 1K3YA 5G31A 3VK9A 1TU7A 2B6MA 1B8XA 4I6XA 4YH2A 1EWXA 2MZCA 2GSQA 2KP2A 2YCDA 2GZZA 2CX4A 2K18A 4ECJA 1R7HA 3FR3A 1MTCA 4IN0A 3TOTA 2F51A 1ERTA 1JZRA 3GA4A 4YQMA 4KE3A 1T4ZA 5DBQA 2A2RA 1YJ6A 1EOGA 5D8IA 2HSYA 4EDYA 5AGYA 3PH9A 3LFLA 5EL8A 4HI7A 5ECLB 2M46A 5ECNB 2DJ3A 3SWLA 3I6AA 1AC1A 3FZ4A 2LQQA 5L71A 4HZ2A 3TKRA 4N30A 5ECHB 11GSA 1F3AA 1OC8A 1B48A 5DALA 5KN1A 3FZ5A 2R4VA 4GTUA 1X9WB 3TOUA 2WCIA 4DSRA 4DSSB 2HSHA 3IR4A 4LLRA 5KN3A 3IAS2 1O8XA 2NVLA 4N10A 2F9SA 3WGDA 3HY2A 1J0FA 3QMXA 2H70A 2LJAA 3IRAA 1FG4A 1PD21 1PRXA 4K6XA 1NW2A 2B1LA 3VPTA 3ZIVA 4HU9A 5ENUA 3CSJA 1O81A 2PVQA 4PUFC 5G2ZA 5J9CA 1QFNA 3KIJA 3GL5A 4XS4B 3F0IA 2P31A 3F4RA 2GQLA 5ECPB 2NTOA 3NZNA 1O85A 4E8HA 3BOAA 2K8VA 4IHUA 4KDXA 3KMOA 3QDNA 4LL4B 3A2VA 2RIIA 1WJKA 4NXIA 4KSMA 20GSA 3EU4A 1ST9A 3D4TA 4HJMA 2DJ2A 4ILFA 3FEUA 4EO3A 13GSA 1G7OA 3LJRA 4JR4A 5A4VA 1DBYA 1V2AA 1PQNA 3U5RE 5FWGA 4IBPA 3MDKA 2IFQB 1MDJA 4QL7A 2GT5A 2AYTA 4CW9A 2MMOA 4KDUA 2FWFA 3UBLA 3C8EA 3QAGA 5A4UA 3WGEA 1E6BA 3HVXA 4K7NA 2H0IA 2L4CA 4MPGA 5IOXA 2H6ZA 3TB2A 2VL2C 1Y6EA 3V1WA 3C73A 2HZEA 3P8WA 4ZL8A 1SD8A 5AIVA 1K3OA 1V98A 5IMDA 2HZFA 1GP1A 2L6DA 16GSA 3HJPA 1XWBA 1SYRA 2H1GA 3HJOA 1XWCA 5EPFA 3ED3A 3VI5A 1K3LA 4EVMA 2VLUA 2MMZA 3IE3A 2PPTA 2CQ9A 2GDRA 4ZB6A 5CO3A 1GSSA 6GSTA 2L5OA 5ELGA 2AB6A 2LEGA 3TKPA 4KUNA 3IA1A 4AJ6A 4EE0A 2AUVA 1GRXA 4O7HA 4I2UA 2K6VA 1N2AA 4XCSA 3D21A 1T1VA 3D5JA 3FW2A 5FT3A 4TR4A 2R6KA 5LNKe 3JCML 4QL9A 2FA4A 2GZPA 1A24A 4RQXA 3TRXA 1O7UA 2VLVA 1VF4A 2B5EA 1R5PA 2C1YA 1EV4A 4EF0A 2WRTA 4OWYA 4KSOA 1HYUA 3KMNA 3GKKA 4EC0A 3GX8A 4YAPA 3ZRDA 5IMAA 3E0UA 5IO2A 1R26A 2IMKA 3HHVA 2EIRA 14GSA 4IVFA 3IHQA 4G19A 5IIZA 4TVEA 4PGTA 3IV4A 3ZREA 4EDZA 2FY6A 2WJUA 1NHYA 3CSHA 2CX3A 4BPYA 1SD9A 2YZHA 2IPAA 3UOMA 2FCHA 2GSSA 1XFLA 2LV3A 3WT2A 4TOPA 1B4PA 2I81A 4IP6A 1TRUA 4TR3A 5A4WA 1DSBA 4EKZA 3ZYWA 2IIYA 3PR8A 5CP1A 1A2JA 1XPVA 4D73A 5DVBA 4V2MA 2FWHA 2GSRA 2GS3A 5HR3A 4PX1A 2LJRA 2IMIA 3GSTA 2FD3A 2O87A 3QFBC 1XVQA 3GX0A 4LMVA 5ECSA 2YNXA 2JZRA 4IJ3A 4K7OA 2AV4A 5IPHA 2C0EA 1B9XC 5IMCA 2GLRA 3GYKA 5ECOB 3Q74A 3UAPA 3D4MA 4NV2A 1F37A 2C0DA 1WOUA 3UL3A 3F63A 2QKEA 3Q6OA 4LMWA 5FHIA 1GH2A 1AAZA 3EU3A 1YDKA 2E0QA 5CYYA 2I3YA 22GSA 1ILOA 1SJIA 2H76A 1GLQA 1M2DA 1AQWA 1YF0A 2PMTA 1R4WA 2E7PA 5CAXA 1DE1A 1V58A 2CA8A 4IS0A 3DGQA 1YF1A 2OKAA 5ECMB 1SK0A 1PSQA 2DLXA 2PWJA 3HVVA 5F05A 4ECBA 4NMUA 1XXUA 1KBNA 1SKSB 1FB6A 1VF1A 1X5CA 4EL1A 3HZ4A 4WR5A 2PN8A 2R3XA 2E2MA 7GSSA 5G1KA 2VM1A 1G7EA 2GT6A 5B6NA 1K0MA 5C00A 6GSYA 1O6JA 2IMFA 1EEMA 1BJXA 4GSSA 1ON4A 2V2GA 3ZL5A 2A4VA 1FOVA 3L9UA 3TJGA 4I8BA 4KX4A 5CRHA 3I9V2 4JEDA 1IYHA 2PGTA 1K0BA 4TRXA 4TXOB 2OACA 2YZUA 4IJIA 2IMEA 4Q5FA 19GSA 3J7Yk 4GWRA 1VGLA 4Z7XA 1XW6A 3MNGA 12GSA 2JZTA 2L6CA 4NPBA 2VAFA 5G5FA 4AJ7A 3O6TA 3D22A 2YV7A 1DE2A 1X0RA 2TRCP 2C80A 2KLXA 3RAZA 1GSQA 4MJEA 3UJ1A 1M0UA 4K9ZA 3KP8A 4FYUA 4PUAA 3KM6A 2I4AA 4XRAA 1JZWA 2VIMA 3DIEA 1Z7RA 5KEJA 4ZBBA 1X9SB 2VCXA 3BCIA 2FHEA 2KP1A 3HYPA 4WKWA 3H4KA 2PVOC 3P2AA 3VURA 1FW1A 1TP9A 3ZVJA 1GTUA 3VWXA 1T8EB 2EIOA 4MF6A 3NIVA 4ULXA 2VD0A 1T4YA 5IMVA 2DJ0A 3SBCA 2YP6A 5JCGA 4HQSA 3VWWA 2FA8A 5F06A 1ZL9A 4TR1B 2HT9A 3GN3A 1BYEA 17GSA 2RLIA 3KH7A 1QXHA 1A8YA 4Q5QA 1PKWA 3ZZXA 4N0ZA 2N5FA 2X8HA 1G6WA 2LRNA 2H01A 3ERGA 2ON5A 3M3MA 3KJYA 4F9ZA 5ECIB 4KDYA 1JZOA 3J7Yb 1K0AA 3UVHA 4KB3A 3GIXA 2HXKA 1TRVA 5DALB 1BEDA 3A3TA 1THOA 4MF7A 3RPNA 2KUCA 2NPBA 5CREA 2DJKA 1WMJA 2XBIA 4HZ4A 5F0GA 1S3DA 1F3BA 2DBCA 3HXSA 5GSTA 2B3SA 1JZDA 1EP8A 4V2LA 2GGTA 3RBTA 4WF5A 1J9BA 4V1Ag 2MYGA 1WE0A 3ERFA 2P5RA 3GMFA 1YKAA 1R5AA 2C0GA 3EYTA 3F3QA 1ACVA 1O73A 1VF3A 4IELA 2B5XA 3DYRA 3EMPA 3TJKA 1GSUA 3FYGA 3GKMA 1NHOA 1A0RP 2YANA 1OE7A 4HQZA 1KNGA 2JSYA 3LEFA 1LBKA 4PXOA 3DWVA 3EVIA 4ECIA 4MJBA 5B6MA 1HNAA 1I9DA 2IMDA 4DSSA 5IPGA 1NM3A 3QOUA 3TJFA 1XW9A 1F2EA 4IQ1A 1BAYA 3M1GA 2RM5A 4TR0A 4OFNA 3TKSE 4WBJA 3VLNA 3TDGA 1PX6A 4PNGA 3KXOA 3KCMA 1UA5A 1JLWA 2XBQA 1AQVA 2LNTA 2TRXA 1JLVA 3UVTA 1N8JA 3ME8A 2YWOA 5D93A 2G0FA 5DJLA 4QQ7A 2IN3A 1M9BA 5HQPA 2FLSA 2ON7A 4MZWA 2YWIA 2OBKA 1PL2A 3CRTA 2RUFA 3CTFA 1CQHA 2V6KA 2ZNMA 2OBIA 3C1SA 3QAVA 3GKXA 4JZQA 1GSFA 3GTUB 1FAAA 1OC3A 2WFCA 1C72A 1O8WA 1YY7A 2C4JA 4BA7A 2HZEB 4POLA 1S3CA 2LQOA 4ACSA 1ML6A 2WB9A 3WYWA 4F0CA 3VWUA 3TKSA 1VRSD 2JACA 3C1RA 5EY6A 1ERUA 3APSA 4JBBA 1SU9A 4ZIJA 5B8BA 4K7IA 1PGTA 2YWMA 2KHPA 3KZQA 2WGRA 1KTEA 2H6XA 2WZ9A 2LJKA 5DDLA 2VL9A 3UEMA 3I69A 4LA1A 3HZ8A 3EC3A 3MAKA 4WXTA 2O7KA 3IBHA 2O8VB 2JU5A 5DAKA 6GSXA 2J9HA 1BX9A 4MP4A 1G6YA 5CRWA 5B8AA 2DIZA 2MMNA 5AISA 2PU9C 4ZBDA 4ZL9A 4MPFA 3ZMKA 2EIQA 4I2TA 1NSWA 1ABAA 1SJZA 3GH6A 4BVYA 1FO5A 2LRCA 4HDEA 5G30A 1H4OA 4H86A 1WRYA 4XIHA 4OO5A 4KA0A 2H74A 5D9XA 2AJQB 1V9WA 2V41A 2M80A 1TKDB 4WF4A 3HKRA 2HFDA 2MMAA 4ZB9A 3LYKA 1K0CA 4PQIA 1BQ7A 2P5QA 4POBA 3US3A 1TW9A 4X1UA 2REMA 3C7MA 1YQ1A 3M8NA 3DRNA 1IYIA 3QR6A 4GRFA 5GZZB 3WD6A 4ZBAA 2K9FA 1XBSA 1GNWA 3FZ9A 2NDOA 1ERWA 2H71A 3FY7A 1USBA 3W8JA 1XZOA 2DC5A 4YAVA 4I5QA 4MCUA 3ZIJA 1OYJA 4YQVA 2VCWA 2XHFA 3UARA 1PL1A 2E2GA 4JE1A 4X0XA 1OKDA 4NAXA 9GSSA 3G7JA 3FK8A 3IK9A 5EVOA 4F03A 2H72A 3G9BA 4WEYA 2F3MA 2LRTA 2LKUA 1ERVA 2DSAA 1PX7A 4N11A 3DEXA 2XC2A 3F6FA 2H30A 2MBSA 3EWLA 4RUVA 4NHWA 1CQGA 1TI1A 3KH9A 4XRDA 5KN2A 3RDWA 3APQA 1XW5A 4J56E 2R2JA 4BVXA 4EUYA 1I5GA 1OC9B 4OD7A 3FHKA 1A23A 2EC4A 5JCWA 4L5OA 3ERWA 1Z3EA 4ID0A 5D96A 1F9MA 1MD4A 4IQAA 3F6DA 3F3RA 5GSSA 4ZL7A 2KOKA 3N9JA 3AY8A 10GSA 3DVWA 3GH9A 4K2DA 2H0GA 4RI7A 4HEA2 2OADA 1Q4JA 4G2EA 1SK2A 1EP7A 5INYA 5CRGA 4MJCA 3H1NA 2CV4A 4KNDA 4MZCA 2JADA 2WULA 4FYBA 4I97A 1YZXA 3CXGA 1TI3A 4JU5A 1AUCA 4WBRD 1TRSA 1ZMAA 1W89A 4GSNA 2X99A 5J5NA 3QAWA 2CAQA 5DCGA 5IMZA 3M9JA 1MD3A 6GSVA 2VUPA 2H6YA 5CNWA 4MJAA 3VPQA 4LL1B 3TGZA 1DUGA 3DXBA 4KW6A 1XWKA 1PMTA 4NHZA 4NV5A 3CRUA 2Z9SA 5IQYA 5HR0A 4AJ8A 3KEBA 1QK8A 3IK7A 1GSEA 2FNOA 3S9FA 2VCZA 4RQRA 4JR6A 1QMVA 2CT6A 2DMMA 4MABA 2CAIA 2GQMA 3GURA 3P90A 3H93A 3IXRA 1SL2B 2TIRA 1URMA 2OE3A 3CTGA 3ZVJD 2H1AA 5ID2B 5H5QA 2HNLA 2M72A 4KCEA 4GSTA 2H66A 4J2FA 5E59A 3EURA 2P0GA 3HCZA 3RPPA 3FKFA 2H73A 3TKSC 2R5GA 4WR4A 4MA9A 2ZCTA 1SKRB 3QFAC 2PERA 1TOFA 1GNEA 2YJ7A 2DJ1A 4TXOA 3RHBA 2R37A 3KD0A 2V1MA 5DQSA 2LS5A 1RQMA 2RM6A 4PNFA 4XTSA 1WPIA 3N5OA 4MDCA 5JWRB 1MDIA 1FVJA 4KH7A 2B7KA 3LXZA 2DJJA 2NBSA 4GF0A 2VLTA 2LSTA 2OA7A 5G1LA 2HRNA 3TUEA 6GSUA 1GULA 1AW9A 3PGTA 4JRRA 5CRDA 2H75A 2QC7A 4FO5A 1ZCPA 1K0DA 1UC7A 4Q5NA 1U88A 2N5BA 2K8SA 3A2XA 1QUWA 4OFTA 4CHSA 2HRFA 1WWJA 5HFGA 2H19A 3A5WA 1TU8A 2VD1A 2V6OA 1GSYA 1UN2A 3IC4A 2AAWA 1LU4A 2O85A 1FVKA 3GKNA 5J4UA 1JFUA 2QGVA 3ZMLA 1LJRA 5DQYA 5JCUA 2L57A 2VOCA 4HU7A 2WDUA 4TR1A 1GWCA 4IP1A 1M99A 2CZ3A 1XVWA 2PUKC 5A5KA 3IDVA 2O89A 1X5EA 3TJJA 2I9HA 4DEJA 2A2SA 3LGCA 2WS2A 2YWNA 1A0FA 1U87A 3UIWA 3ZFBA 2N5AA 2YOIA 3QPMA 1GUMA 4RI6A 2LNSA 3HD5A 1OAZA 4BL7A 1HNCA 2OJLA 2X64A 4GLTA 1X9MB 2GTUA 2HE3A 3DVXA 1BG5A 4O92A 4E8EA 2FWGA 5AIXA 2IJYA 2MBTA 3KP9A 3IAM2 1QQ2A 5IO0A 4V2NA 3R2QA 5JWQB 5JWOB 1JHBA 3A2WA 2X8GA 2H1BA 1OVNA 3DKSA 3VI7A 1GLPA 3LORA 8GSSA 1FHEA 1ZGNA 1FB0A 3L4NA 4PURA 3W8SA 4PQ1A 2VCQA 5F8BA 4YQUA 2GQKA 2LTKA 1TXXA 4OCFA 4HUAA 2V32A 1EV9A 3ZITA 1GTAA 5DJMA 1XWAA 1J08A 2OE1A 4TXVA 5COHA 1RK4A 2YJHA 3KTBA 2D2ZA 2HYXA 2L5LA 3G7YA 3TRQA 4BWSA 4CDOA 3M0FA 2XPEA 3ME7A 1SL1B 4XS4A 1B9YC 1XIYA 4FIWA 4POKA 3OR5A 1QGVA 1UVZA 3GNJA 5H5SA 1U3AA 1T00A 1U3IA 3TCOA 1Y25A 1Z9HA 3P7XA 18GSA 2C8UA 3F9UA 1EEJA 1V57A 2C0FA 4OO4A 4PQHA 2YV9A 2F8AA 2CVKA 3IOSA 4G10A 4EXJA 1ZYQB 3F8UA 1V40A 2JZSA 3O76A 2CVDA 4HS1A 2C3QA 3ZLPA 2VCTA 5D73A 5C04A 5GAND 5D9TA 3E9JB 1SENA 1S3AA 1PKZA 1SK1A 2B5YA 2IFQA 3GTUA 5DAKB 1TRWA 2LUSA 2BJXA 4L8EA 3LWAA 1PA3A 3KGKA 3NOFA 5G5EA 4XS6A 3I43A 5F07A 3LG6A 1ZOFA 2H1DA 3U6VA 1GTBA 3GHAA 5B7CA 4O5RA 4MLYA 3H8QA 4L0WA 2XPDA 5H5RA 1THXA 1K0NA 2C3NA 3QCPA 3ZFLA 2F8FA 1SJ6A 3M9KA 3H79A 3GRXA 2CVBA 3DD3A 1XWGA 3GV1A 1VF2A 4MMMA 5AN1A 2CZ2A 1T3BA 1XOAA 2RUEA 3KTLA 2OE0A 2X8CA 3TRPA 1EZKA 4F2IA 5HFIA 5ECKB 2BMXA 3GL3A 2L59A 1HQOA 1Z7PA 2ZUPA 3E3EA 1MEKA 5ECRB 3RHCA 1RW1A 5IOWA 4O32A 4L5LA 4ZB8A 5DCHA 5IM9A 3DMLA 3L0HA 1KEBA 1GSDA 4MH3A 3VFIA 4AF2A 2JSZA 4D73B 2DMLA 5LCZA 2L4QA 5GAPD 1XCCA 1M9AA 4IKHA 3VWVA 5D9VA 3BCKA 5ELAA 1TDIA 1ZYEA 1Z6MA 3EE2A 1GUHA 4FYCA 4BWQA 3APOA 4ISDA 2IL3A 3UBKA 3CMIA 4AGSA 4K0NA 5ABRA 1HNBA 4L0UA 1M2AA 5J41A 3F4TA 5HR2A 2FUG2 4F82A 1OE8A 4IW9A 2BTOT 3K8NA 4KGIA 2C3TA 4GXZA 4K1FA 1TJDA 4TW5A 3LSZA 2H8LA 1GUKA 4Q5RA 3MSZA 2ALBA 5KN0A 2VO4A 1B4QA 1GTIA 3CBUA 3IPZA 4HOJA 4DVCA 1Z6NA 2HI7A 4FH8A 3L9VA 2FWEA 4KAEA 3GFKA 1AXDA 1ZZYA 1M2BA 3D6IA 2GSTA 2B1KA 3F4SA 1MDKA 2YPMA 3CYNA 1TK8B 4ECCA 4ML6A 3FR6A 1OC9A 3WT1A 4NWYA 1H75A 1WP0A 1YEPA 2GVPA 1SKWB 1AIUA 4OCEA 4TN8A 1OKTA 2QSIA 1M7TA 4GQFA 4ZXGA 3FRCA 5HR1A 3ZTLA 1EOHA 4TKYA 4ZILA 5J3RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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