3TKSC

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 in three different redox states
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
197
structure length
196
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 64
structure length 196
sequence length 197
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
C PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tksC00
4I8BA 2H1DA 2YWNA 3KTLA 1GP1A 3E9JB 1ZMAA 1BAYA 1GUKA 1YDKA 2IMDA 3RBTA 1Q4JA 1M9BA 5EVOA 4WETA 2CVKA 1GRXA 1ZGNA 2LUSA 2B5XA 3ZFBA 2M72A 5FHIA 2AYTA 1G0TA 3KGKA 2DLXA 6GSSA 4HS1A 1U3AA 1B9YC 3TKSA 3RDWA 5DALA 4XCSA 5IOXA 4IGJA 1SYXA 2DJJA 3HZ4A 3M8NA 3ERWA 4V2LA 4ECJA 3I43A 2R3XA 4L5OA 1M2BA 2H71A 3TKSE 3VFIA 4DSQA 3PINA 1JZOA 4EC0A 5J41A 4MMMA 5JCUA 2CVBA 3HVXA 4EDYA 3QAVA 4K2DA 3QMXA 3HJOA 3ZL5A 3KMOA 3P2AA 4K0GA 4ZL7A 1ILOA 1AUCA 3DVWA 2FWEA 5J3RA 4G9HA 3UEMA 3C1SA 2JSZA 1GULA 4G19A 2LNTA 3EE2A 3HZ8A 5ECPB 4N30A 3EC3A 1TI3A 2OACA 2VM1A 3VWXA 2DJKA 5IMZA 2MMAA 1PSQA 4PQ1A 3D21A 1KBNA 1V9WA 2IFQB 5ECOB 1F9MA 2I9HA 4LMVA 4GCIA 3DYRA 1VF4A 1YZXA 2LJAA 4K7NA 2CT6A 1JHBA 1RQMA 4XS6A 5G2ZA 2L4CA 1W89A 2YCDA 2C0EA 3QCPA 4D73B 2H72A 5HFIA 1IYIA 2H1AA 3ZMLA 2N5BA 4POKA 1SKRB 3GTUB 2PWJA 2LEGA 5ENUA 5IO2A 4GLTA 2DIYA 4V1Ap 4CHSA 5B8BA 4KDXA 4IVFA 4BL7A 2GLRA 3GA4A 1G7OA 4LL1B 3PR8A 3RPPA 3GKXA 5DJLA 5CAXA 3UMAA 1MD3A 5DVBA 5ECIB 4POMA 4GWRA 3IK7A 3UAPA 1XZOA 2B5YA 1O7UA 5F05A 5DJMA 2RUEA 1OKDA 1XWAA 3F6FA 4Q5NA 1FB0A 3TKPA 4RQXA 2LJKA 5EY6A 5JWRB 4TR1A 1JZDA 2FA4A 1F37A 3LFLA 3C7MA 1EV9A 4LMWA 5HQPA 1TRWA 2H19A 3H8QA 1EGOA 2VCWA 5B6MA 1A8YA 3GHAA 2JSYA 5AGYA 1Z6NA 5AIVA 3GN3A 3GFKA 2I1UA 1SKWB 1SD8A 3LORA 3TB2A 3FKFA 2CAIA 4KB3A 4NXIA 3DIEA 3HDCA 1T1VA 3N5OA 4RI7A 1BG5A 4IBPA 1O81A 1KEBA 2GZZA 4WR4A 7GSSA 3HHVA 2GSSA 3HCZA 4N10A 1PX7A 2G0FA 4G10A 2O89A 3HVSA 3I9V2 1Z6MA 3CMIA 4PUAA 4KNDA 2N5AA 3FZ5A 1NW2A 4KDYA 2B5EA 4HZ4A 2RM5A 2FLSA 4GTUA 3UBKA 4OO5A 5HR3A 2NPBA 2ZCTA 2H66A 1EP7A 1TOFA 4L8EA 5ABRA 1OVNA 2KP1A 3KH7A 2RM6A 3CTGA 4IELA 1WWJA 1O85A 4HJ2A 3CRUA 1DE2A 4MPGA 1MDKA 1FAAA 3DD3A 5D93A 2WFCA 2NDOA 4HU9A 3VURA 3M3MA 5FT3A 4MLYA 2KUCA 4IN0A 1K3LA 3UJ1A 3ISOA 1ERWA 3O6TA 2H6YA 2WZ9A 3I69A 2B7KA 1XOBA 3TKSC 4DSSA 2N5FA 1FVJA 4EUYA 3LJRA 2VM2A 1TW9A 4F9ZA 4QL9A 3KP8A 4MP4A 3LYKA 1EGRA 4MDCA 1YQ1A 1GLQA 2YV7A 4PNFA 1WJKA 1ZYQB 2Z9SA 4ILFA 4ZB8A 2DJ0A 3W6GA 3TRQA 4FIWA 4Q5RA 2CX3A 5CRWA 4E8HA 3TJBA 3GURA 2H6XA 3L4NA 2IMEA 4Z7XA 4ISDA 2C4JA 1TKDB 5JWOB 3GV1A 1TJDA 5A4WA 2XBQA 2QKEA 1T7PB 3JCML 4ZL9A 3F4TA 5D8IA 2JL4A 2H75A 2IL3A 1MD4A 4J56E 4K0NA 1OE7A 3A3TA 3F4SA 2H1BA 14GSA 1YEPA 3V1WA 2K8VA 3FR9A 3ERFA 3ZZXA 5ID2A 1U87A 5G1KA 5HFGA 5KN1A 2K6VA 2GZYA 3DKSA 2AJQB 1V57A 3TUEA 18GSA 2B6MA 4EO3A 4IW9A 2OA7A 1T00A 2J23A 3GH9A 3KMNA 3GL5A 1QGVA 1F6MC 4NHWA 4N11A 2H73A 3IAS2 4L0UA 2CVDA 1MTCA 4EL1A 1ERUA 3IV4A 1VF1A 6GSYA 2A2RA 2OBKA 4JEDA 4Q5QA 2IWTA 3FZ4A 3NZNA 1GSUA 2C8UA 3KIJA 5DAKA 4JU5A 3DRNA 2YJHA 1K0OA 1AXDA 3GSSA 4MH2A 2KHPA 2F9SA 1SK0A 2IN3A 2E7PA 4OCEA 5J4UA 11GSA 4YAPA 4KW6A 2YWMA 2R6KA 2NVLA 3VWUA 3ERGA 2C0GA 2MBSA 4ID0A 3O3TA 1XWGA 2ALBA 3IA1A 2NTOA 2GVPA 2BTOT 3A2XA 2GSTA 3IOSA 1ST9A 3LSZA 2HT9A 1V2AA 2DBCA 3MDKA 3G7JA 4O92A 4POBA 2P0GA 2L6DA 3KJYA 1EOGA 3FR3A 4V1Ag 4IQ1A 3HJMA 2LS5A 4P3YB 2REMA 1XW5A 2VLVA 4TR3A 2PBJA 4GSSA 1IYHA 2I81A 4CDOA 1GH2A 2A2SA 3U6VA 4KE3A 5IPGA 1BX9A 1PL2A 3FHKA 4TR4A 5B7CA 3F3RA 1GNEA 3UL3A 1Y25A 4WEYA 1A0FA 2L5LA 2EIQA 1TI1A 4K9ZA 5F8BA 3IAM2 2LQQA 3QDNA 4HDEA 3TOTA 3RAZA 1NSWA 4XS1A 1EV4A 2CAQA 5IOWA 4PXOA 1U88A 1ZL9A 2WJUA 2J9HA 1AAZA 5ECLB 4PUFC 2TIRA 4AJ6A 2P5QA 1YKAA 1PMTA 3QPMA 1GUHA 6GSVA 2GT6A 3ZRDA 2YZUA 5G5EA 1PL1A 5LCZA 2DMLA 4TKYA 1TXXA 2F8AA 2FWFA 4NWYA 2VUPA 2OE1A 5ECMB 4TRXA 1SK1A 4J2FA 4KGIA 4XS4A 3KXOA 3UIWA 1TK5B 2O7KA 5ECSA 1TRSA 5EPFA 3ED3A 4BWQA 1PD21 3EVIA 2V1MA 3J7Yb 3MWHA 4MPFA 1KNGA 2WS2A 2VLTA 1THOA 1F3AA 3M1GA 3AY8A 1GSDA 1ERTA 2WB9A 2G2QA 4GQFA 4EKZA 3BCIA 2YP6A 2GS3A 4AJ8A 4XIHA 2IMIA 4K8MA 1R4WA 4ZB9A 2E0QA 2FY6A 3P90A 5ID2B 1SENA 2PN8A 4ZBAA 4WBJA 5IO0A 2YJ7A 2O8VB 4TW5A 1GNWA 2P31A 3TOUA 1TRUA 1B48A 3GKNA 3GKMA 1TK0B 4LA1A 3IE3A 2V41A 2R5GA 2VL2A 5IMCA 3L78A 4FH8A 2KOKA 5IMVA 3BJ5A 4OD7A 5C00A 4POLA 3W8JA 3IBHA 5G30A 2BJXA 1AQWA 3LXTA 1GTAA 2XPDA 1Z7PA 4DEJA 4OO4A 1FG4A 1XIYA 4XHMA 3CYNA 1ML6A 4PNGA 3P8WA 2X8GA 3ZMKA 1TTZA 1YF1A 2WULA 3F4RA 1YY7A 2VCQA 2HRNA 4F2IA 1WP0A 4F82A 5DCHA 2H6ZA 1A2JA 1K0BA 5F06A 1OAZA 2ZNMA 1Z7RA 4NHZA 4ACSA 3UBLA 4ECIA 4JZQA 3KEBA 2LKUA 4FYUA 2H76A 2VD0A 4HI7A 1DE1A 3UVTA 5J9BA 4DSRA 2AV4A 5CP1A 1JFUA 3L9UA 3WT2A 2XC2A 3W8SA 3VPTA 2L57A 2GGTA 2QGVA 2GQKA 4J57E 5AIXA 1YKCA 1SJ6A 3OR5A 4WKWA 5FWGA 1EP8A 5JCGA 1XW9A 4EE0A 2CZ3A 5D73A 3BOAA 2NBSA 4F0BA 2ON5A 1A2MA 4PQHA 4IP1A 2HI7A 4DVCA 1XXUA 4H86A 5IMFA 2DJ3A 2I4AA 4YH2A 5A4UA 1MDJA 2FNOA 2H70A 3FY7A 3G9BA 4YQVA 3FW2A 2OE3A 1XVWA 3EYTA 2B1KA 2LRTA 3Q18A 2VO4A 1Y6EA 4HZ2A 2OBIA 4I5QA 1PX6A 2HE3A 1FB6A 1HD2A 3DMLA 3SWLA 1X9WB 2AAWA 3H4KA 4HEA2 2XPEA 2HSHA 4EF0A 4KH7A 2RUFA 4MF6A 1OYJA 2I3YA 4KA0A 4F03A 1UC7A 3DGQA 4TXOA 1SL2B 3DEXA 2VD1A 3MSZA 1NM3A 2LJRA 3QOUA 4NAXA 3TRPA 4XS4B 2GDRA 4HQSA 4ZILA 1YEXA 4FO5A 4WR5A 1XWCA 2VCZA 3DWVA 3MNGA 12GSA 2PVOC 3HXSA 1UA5A 5AN1A 4GXZA 4FYCA 4ZL8A 1V58A 1I9DA 17GSA 2IIYA 4GQCA 4MF7A 2K18A 13GSA 5DALB 1VF3A 3ZFLA 1GTBA 2GQLA 3TJJA 3GKKA 4I2UA 4WXTA 2IMFA 4PX1A 1BEDA 3ZREA 2M80A 4HOJA 1OC3A 5ELGA 2CV4A 5IPHA 1JLWA 3U5RE 2JU5A 3CRTA 1UN2A 1K0NA 2MMOA 2P5RA 1K0CA 5ECNB 4OWYA 3HY2A 2V6KA 2B7JA 4ZBBA 4IS0A 2C80A 2CA8A 2HNLA 2M46A 1G6YA 5L71A 1WOUA 2F3MA 2QC7A 6GSUA 1URMA 1M0UA 3IXRA 3HD5A 2FWGA 1R7HA 1GTIA 1O8WA 2CQ9A 3KTBA 5EL8A 1XOAA 3TCOA 5B6NA 1EZKA 2MMNA 2X99A 4KUNA 3VPQA 4E8EA 3HA9A 3IR4A 2LTKA 2VL2C 1HNBA 4ML6A 20GSA 3TGZA 4QQ7A 4NV2A 1GL8A 4JR6A 4K7IA 2KLXA 5DDLA 1B9XC 4JRRA 3GUSA 1R5PA 4K7OA 1AW9A 1S3DA 3KCMA 4NMUA 2X8HA 3LQ7A 2WRTA 2WDUA 1A23A 2GTUA 1PRXA 3DXBA 3L0HA 1V40A 4X1UA 2LQOA 2FUG2 5INYA 5ECRB 5IQYA 4FYBA 2C3QA 1GSSA 3UARA 4ML1A 4OMVA 4EXJA 4WF4A 4IJIA 4GRFA 3KM6A 3GH6A 4TR1B 1H75A 2JZRA 3RHBA 2RLIA 1R26A 1TU8A 3GRXA 1RW1A 3RPNA 2GSRA 4ZIJA 4MZCA 3L9VA 1GSFA 2HXKA 2YWIA 4TXVA 1M2DA 1LBKA 1OC8A 4KDUA 5H5SA 2GZPA 4MZBA 3PGTA 5CYYA 4RUVA 4TXOB 1JLVA 3GSTA 3EU3A 2B1LA 3QFAC 5LNKe 1T3BA 4YAVA 1Z9HA 3ZIVA 3HVVA 5H5QA 2FGXA 2KP2A 3MAKA 2IFQA 3CTFA 3KZQA 4ZBDA 5C04A 5GSTA 5CREA 3D0ZA 1QK8A 5J9CA 5IMAA 3WGXA 3LGCA 1ZCPA 1PN9A 3Q19A 2V6OA 2DMMA 4MH3A 3GTUA 1SK2A 4RQRA 2JZSA 4I6XA 4NV5A 2VCXA 3QAWA 5D9XA 4LLRA 1BQ7A 6GSXA 1AIUA 2YWOA 3E0UA 4BPYA 3IRAA 1XCCA 3F6DA 6GSTA 2PU9C 3DVXA 2ZUPA 2VCTA 1U3IA 2HRFA 1Z3EA 2OE0A 3D4MA 1M9AA 3WGEA 3G7IA 9GSSA 1BJXA 2LRCA 3GX0A 3GX8A 4KAEA 2GT5A 4AJ7A 5J5NA 1R5AA 2IPAA 1QXHA 1QQ2A 2YV9A 1XWBA 2AHEA 4DSSB 1F2EA 3TJFA 1F3BA 1X5EA 1GSEA 4IKHA 2XBIA 2TRCP 5GZZB 3QR6A 4WF5A 1GSQA 3EU4A 5E4WA 3A2VA 2CZ2A 4PGTA 1DBYA 3CSHA 3O76A 2R37A 1O6JA 5CRGA 1T4YA 1G6WA 1SU9A 5GAND 4OFMA 3NOFA 3TDGA 2B3SA 1AQXA 3KH9A 4IQAA 1XPVA 5COHA 3ZYWA 2PGTA 5JWQB 2LSTA 1EWXA 1YJ6A 2H01A 4MABA 1JZRA 2HYXA 5ECQB 4XRAA 4XRDA 4OFNA 4PQIA 3EURA 2EIRA 3D5JA 1X9SB 2H0HA 1WIKA 3F0IA 3US3A 3M0FA 1PGTA 2PVQA 4QL7A 2CX4A 2DC5A 3GYKA 1DSBA 3ZTLA 1PKZA 1S3CA 3ME7A 19GSA 3WD6A 1ACVA 5LD0A 1TP9A 4JBBA 1ZZYA 1K0MA 3VWVA 2C0DA 1G7EA 2IMKA 2C3TA 2O85A 1E6BA 5DBQA 3TRXA 1M99A 2FD3A 2HZEA 3LEFA 4ULXA 3HJPA 1ZYEA 3WYWA 3VWWA 1T8EB 4TVEA 1K3OA 1SJZA 5CO3A 5DAKB 1X0RA 4OCFA 1USBA 4RI6A 1M7TA 5G31A 1TRVA 1GSYA 3ME8A 1T4ZA 1CQHA 1K0AA 1OC9A 1AC1A 2O87A 1OE8A 5F07A 3ZIJA 4O5RA 1GLPA 2H30A 3CSJA 2F51A 2OJLA 2R4VA 3N9JA 3H79A 4YQUA 3K8NA 4LL4B 2L5OA 3VI5A 5CRHA 5DCGA 1EOHA 4X43A 4N0VA 1QUWA 2F8FA 4MZWA 2MZCA 2H0GA 5B8AA 2FA8A 1A24A 2DSAA 5F0GA 3GMFA 3I6AA 5DQSA 3L9SA 3IDVA 3F8UA 8GSSA 22GSA 2VIMA 3J7Yk 2AB6A 1SKSB 2H0IA 1OKTA 1SL0B 4GF0A 5ECKB 3C8EA 4MJEA 1KTEA 4ZB6A 1GUMA 2L59A 1ZOFA 1XW6A 5DQYA 5IM9A 3TJKA 1E2YA 4MJAA 4KCAA 3WGDA 2YNXA 3F9UA 5D9TA 5CNWA 1I5GA 3ZITA 3EMPA 3IC4A 1SD9A 2HFDA 1BYEA 2BMXA 4BVYA 4IHUA 2DIZA 1A8LA 3FZAA 2DJ1A 3Q74A 4IJ3A 4TR0A 3FK8A 4L5LA 5KN3A 2PUKC 3A5WA 2JACA 4GSTA 2L4QA 1LU4A 2D2ZA 3FEUA 1X5DA 4JR4A 3HYPA 1FO5A 1GWCA 2FCHA 2E2MA 1XFLA 2LNSA 4HJMA 2R2JA 1HYUA 4Q5FA 2WGRA 1WMJA 2YANA 5A4VA 5CRDA 2DJ2A 2OADA 1NHYA 3HKRA 3R2QA 4AF2A 3Q6OA 2WCIA 2JZTA 3LWAA 1J08A 4HU7A 4I2TA 4G2EA 4OFTA 4JE1A 3TKQA 4AGSA 5D96A 2EC4A 2FWHA 1PA3A 1Z5YE 1FW1A 2YZHA 1VF2A 4EDZA 2LV3A 5HFKA 5HR1A 4K1FA 1SYRA 1A2LA 1J9BA 4IP6A 2VCVA 2ES7A 1TDIA 5ECHB 2YPMA 1S3AA 1X9MB 2RIIA 3F63A 10GSA 5JCWA 1LJRA 3LYPA 1MEKA 1WPIA 3PH9A 2VOCA 1FOVA 1WRYA 2X8CA 3S9FA 2VL9A 2H1GA 2HZEB 1Q98A 1EEJA 4O32A 2IJYA 4PURA 3VK9A 3LXZA 2XHFA 2AUVA 4CW9A 3TJGA 3CXGA 4XTSA 3IPZA 4I97A 1O8XA 3UVHA 3LG6A 1UVZA 2K8SA 2VLUA 3ZVJA 2V32A 1OC9B 3CSIA 3KP9A 4MF5A 4MA9A 1JZWA 3APOA 1K3YA 4YQMA 1ABAA 1HQOA 3FYGA 5H5RA 3BCKA 1THXA 4KX4A 2K9FA 4O7HA 4V2MA 1RK4A 3C73A 3BD2A 5A5KA 5G1LA 2HLSA 2TRXA 1EEMA 2VAFA 3M9KA 1H4OA 5HR2A 3EMXA 1YF0A 4V2NA 3C1RA 3H1NA 1FVKA 2ON7A 3QFBC 4MCUA 1SL1B 2YOIA 3VI7A 3D6IA 3FR6A 4K6XA 2PPTA 4KSMA 3D4TA 3QAGA 4TN8A 1K0DA 3GL3A 2JADA 5IMDA 4GSNA 1PKWA 3P7XA 2VL3A 1AQVA 1VGLA 3E3EA 1XWKA 1XVQA 1ON4A 2E2GA 3IK9A 4ECCA 4BWSA 3BBYA 4NPBA 3WT1A 3APSA 3H93A 3EINA 4EVMA 4HQZA 1TK8B 6GSWA 3APQA 4N0ZA 5GSSA 4WBRD 4ZXGA 1WE0A 4X0XA 4F0CA 2GQMA 2C0FA 5AISA 1B4PA 3TKRA 1M2AA 3CBUA 1B8XA 2HZFA 3GIXA 5D9WA 1MDIA 5ELAA 4L0WA 1HNCA 3ZVJD 4D73A 2LRNA 1CQGA 1U6TA 2C1YA 2A4VA 5HR0A 1O73A 1DUGA 1HNAA 2PMTA 3SBCA 2L6CA 2QSIA 2OKAA 3FRCA 4BA7A 3KD0A 2FHEA 1GTUA 2X64A 3M9JA 1QFNA 4TOPA 3G7YA 2H74A 1PQNA 3D22A 3EWLA 1ERVA 1FHEA 5E59A 2YN1A 2EIOA 2HSYA 5IIZA 2MBTA 4MJBA 2C3NA 2V2GA 4KCEA 3IHQA 3QD9A 4ECBA 1V98A 3A2WA 3RHCA 1W4VA 3GNJA 1B4QA 4KSOA 16GSA 1A0RP 2PERA 2GSQA 5D9VA 1TU7A 1C72A 4MJCA 3FZ9A 1XBSA 2MMZA 1J0FA 5GAPD 1N2AA 4MK3A 1SJIA 3NIVA 1X5CA 5KN2A 1NHOA 2H8LA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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