3TKSC

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 in three different redox states
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
197
structure length
196
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 64
structure length 196
sequence length 197
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
C PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tksC00
4TR4A 2JACA 5CYYA 3K8NA 1M99A 3WGEA 2M46A 2HT9A 3ZFLA 1X0RA 1CQHA 5D73A 2V6KA 2FY6A 1UVZA 5HR2A 2K9FA 1GTAA 4V1Ap 3VWXA 1XZOA 4KDUA 2JSYA 1G7OA 1XWCA 3WGXA 5HQPA 1KEBA 4GSSA 2A4VA 3ZTLA 3VI5A 3G7YA 4PUFC 5GSTA 1SL2B 3M8NA 1GLPA 5ECOB 3HA9A 3V1WA 1QQ2A 4FYBA 4GQCA 2NDOA 3CTGA 2ES7A 3HVSA 3QR6A 1XBSA 1ZOFA 3LEFA 2OE1A 4G19A 4ACSA 3GRXA 4ML1A 5DAKA 3RBTA 4KH7A 2VLTA 3IDVA 5HR0A 3FZ4A 4ID0A 4V2LA 2YP6A 4EUYA 4OWYA 3KTBA 4WR5A 2DMLA 4KCAA 2LNSA 4HOJA 2N5BA 4MZBA 1PN9A 2J23A 3GL5A 3UAPA 3GV1A 3OR5A 5KN0A 2MZCA 3EU4A 1SU9A 4O92A 2DJJA 4PQIA 1MDKA 3TKSE 2HNLA 3LWAA 2CVKA 19GSA 3W8JA 4KSMA 1PA3A 5KEJA 2XPDA 4N0VA 2IJYA 4I5QA 4JEDA 4KA0A 3O3TA 5EL8A 2RIIA 2CVBA 3LYPA 5B7CA 3KGKA 3JCML 2DLXA 4E8HA 2E2GA 3ZMKA 2GZPA 1EOHA 5C00A 2B7KA 5G5FA 2X8GA 1FHEA 4G2EA 2CA8A 1R4WA 3CXGA 3VFIA 2V6OA 2HRFA 3UVTA 1E2YA 3EMXA 1SKWB 1A23A 5IO0A 4XS1A 1SKSB 4LMWA 2AUVA 1IYHA 1VF2A 2I1UA 2AYTA 2PBJA 3W8SA 4JBBA 3ZRDA 3RPPA 2IFQB 5ECMB 8GSSA 4PQHA 3UBKA 2CAIA 4LL4B 4I2TA 2IMIA 3HVVA 2GQLA 2H30A 3DD3A 3IHQA 4GSTA 2EIOA 3QOUA 5FHIA 2LRTA 2VLVA 2GTUA 3KMOA 3Q74A 2GSSA 2CX3A 1ERTA 2P5QA 2DSAA 3FHKA 2PN8A 1URMA 3IK7A 4OCEA 3C1RA 2EC4A 2V41A 1ABAA 2DIYA 3ZMLA 1TKDB 3DXBA 4ML6A 1EEJA 2LJKA 2VLUA 2IMEA 1Q4JA 5HFGA 1YJ6A 3VLNA 5CREA 3P2AA 1A2JA 3HZ4A 3GUSA 2FWEA 3KD0A 4CHSA 3F4SA 3H4KA 2VM2A 3TKSC 16GSA 2ZCTA 2R3XA 4OFTA 4WF5A 1K0OA 3IRAA 3ED3A 5ECRB 2REMA 2FWGA 3UL3A 2LUSA 1WMJA 3UOMA 2X8CA 3UBLA 3E0UA 3S9FA 1GSQA 1K0AA 4MLYA 4HJMA 5F05A 2H6YA 2B6MA 2CVDA 4YQMA 1YZXA 3F6DA 1WWJA 5B8BA 1VRSD 1GP1A 3MSZA 4L0WA 3D4TA 2DJ2A 1M7TA 4Q5NA 2QSIA 3GFKA 3QCPA 1YY7A 4LA1A 2O85A 5COHA 2VL2C 1YEXA 1X9MB 1HNCA 5G30A 1K0CA 3C7MA 3MWHA 1ERWA 1B9YC 1ON4A 1PGTA 2B5YA 2QKEA 1WRYA 1O81A 4ZB6A 2YZHA 3DRNA 1EGOA 1NHYA 3MAKA 2L6CA 3RHBA 1BQ7A 1M9BA 2B5EA 3A2VA 4O5RA 1ZZYA 1V2AA 2M72A 3UARA 1JZOA 3QPMA 3IE3A 1WPIA 5DCHA 1S3DA 3IAM2 3VWVA 2WFCA 2IFQA 4LLRA 1Y25A 2HRNA 2AHEA 2C3TA 3GKXA 5GZZB 5ECSA 3HJOA 5D9TA 2D2ZA 3W6GA 5IMAA 3HHVA 3TJJA 3UEMA 3EURA 2TIRA 4ECBA 4XIHA 4ZL9A 1Z9HA 3KM6A 4MP4A 2L59A 4HQZA 1WJKA 2RUEA 1FAAA 2LJAA 3CSJA 12GSA 2H1DA 4IGJA 2FA8A 2HLSA 2PWJA 1FVJA 2VM1A 1FO5A 1HQOA 4O32A 3DVXA 1PL1A 4IELA 1X9WB 2OADA 3LQ7A 3GX8A 1USBA 1ZL9A 5FT3A 5J3RA 4IW9A 2R37A 3RPNA 4L5LA 3VK9A 2BMXA 5ECIB 5J5NA 2C0EA 2N5FA 1SJ6A 2GSTA 3QAGA 1UA5A 2R4VA 2O7KA 4HJ2A 3RHCA 2LEGA 2KP2A 1XVQA 1DE1A 4NWYA 4PUAA 1QFNA 4KE3A 2H1BA 2O87A 5DBQA 3F0IA 3M9KA 1ZGNA 3ZVJA 4HQSA 3DEXA 2Z9SA 3A5WA 3TGZA 3VPTA 3GKNA 4EXJA 3KIJA 1J9BA 1JFUA 5DQYA 2MMOA 3U6VA 1Z7RA 2KOKA 5G1LA 4IHUA 5GAND 4N10A 5IMVA 1NM3A 1GTBA 3HJMA 5IOWA 2DIZA 1I9DA 1B8XA 1EGRA 1F3BA 1N2AA 5ECNB 5DAKB 3EE2A 3LSZA 2XC2A 3GYKA 3HD5A 5A5KA 1SL1B 3H79A 5CRDA 3EWLA 3FR6A 4KDXA 1LJRA 3FR9A 4IVFA 2H0HA 4P3YB 3GSSA 3IV4A 2LNTA 2H71A 1XOBA 1XW5A 2XPEA 3LJRA 4K8MA 2VAFA 4PXOA 1MDIA 1M2BA 3L9UA 2HI7A 1FOVA 1SYXA 1V57A 5G2ZA 1I5GA 1TXXA 3F63A 3UIWA 4FYCA 1T7PB 1AQVA 3MNGA 2VIMA 1O7UA 5J9CA 1OE8A 1TTZA 3RDWA 1EWXA 4WBRD 2VL9A 2JZSA 2H6ZA 4NV2A 2VCQA 2VD0A 4TN8A 2FA4A 3GL3A 4RUVA 5IMDA 1K0NA 2GQMA 2O8VB 1X9SB 2PGTA 1OVNA 1WP0A 1BYEA 2R6KA 3KH7A 1E6BA 2K6VA 2F9SA 2H66A 1TK0B 2VO4A 1SD9A 1BEDA 4H86A 4TR3A 2FGXA 1ERUA 4G10A 3CYNA 4NPBA 1YKAA 3VWWA 1GWCA 1OYJA 1TOFA 2YV7A 1JZWA 1R5AA 4K9ZA 1PKWA 5KN3A 4F0BA 3IXRA 1TDIA 5ECHB 4QL9A 4L8EA 4BA7A 4XS4B 3A3TA 4ZL7A 6GSSA 1ACVA 3ZFBA 3A2WA 1SL0B 5FWGA 2DJKA 3FRCA 4MDCA 3H1NA 1F6MC 4PURA 5AGYA 2J9HA 4X43A 2YJHA 4MPFA 4GQFA 4MA9A 4MJCA 2ALBA 4RQXA 4AGSA 2YPMA 1YEPA 1A2LA 4I8BA 4PNFA 1BX9A 2ZUPA 4MMMA 2GZYA 2MBSA 1Z6NA 1TRVA 3TRPA 1RQMA 4K7IA 3KZQA 1J0FA 1T3BA 5HFIA 3VPQA 5IO2A 5IMFA 4XHMA 3ME8A 2C0GA 5HR1A 3ZREA 4MPGA 4K2DA 4NAXA 5D8IA 3D22A 4EL1A 1OC3A 1V98A 2CV4A 3IA1A 5JCUA 2ON7A 2RUFA 4F0CA 2V1MA 3KMNA 4GTUA 3A2XA 2C0DA 2YZUA 3G7IA 2FHEA 4EE0A 5EY6A 4PGTA 4MF5A 1DE2A 3HY2A 3TKQA 1GRXA 3BOAA 3HKRA 3E3EA 3PGTA 1KTEA 1A0RP 3ZVJD 1F2EA 2VCTA 1ILOA 1Z5YE 3ZITA 1G6WA 3PINA 1A8YA 5E4WA 1AC1A 11GSA 2HZFA 6GSVA 2YV9A 1TI3A 2HSYA 4N11A 2X64A 2EIRA 1NHOA 3PH9A 5H5QA 3IC4A 2H73A 2FNOA 5F07A 1MD3A 2I4AA 1THOA 2VCZA 4F9ZA 3HCZA 3DIEA 1YKCA 5G5EA 4J2FA 4MJAA 4HDEA 1V9WA 5G1KA 1ERVA 2O89A 1K3OA 1QK8A 4IP1A 4XS4A 2R5GA 1SKRB 2HE3A 4ZXGA 4MF6A 1HNBA 3TRQA 5CRHA 1G0TA 2OE3A 2E0QA 3Q18A 1K0MA 3FYGA 4TOPA 2GSRA 2GT6A 2L5OA 3BBYA 1SK2A 3FZ5A 1GTUA 1Q98A 1TRUA 18GSA 1PD21 5B6NA 3LYKA 4HU7A 3WD6A 1GL8A 1MTCA 4GWRA 3DMLA 5CP1A 3TDGA 4G9HA 2A2SA 2KLXA 3IPZA 3GNJA 4GRFA 3APQA 1NSWA 4MZWA 4K1FA 3G9BA 3DWVA 3AY8A 4WBJA 1VF1A 1ML6A 2DC5A 4TRXA 2AJQB 3O76A 4TXOA 3N5OA 4JE1A 5DCGA 2IN3A 4ILFA 3QMXA 4YH2A 4OMVA 1U6TA 3TOTA 2FUG2 1PX6A 5A4UA 3GSTA 3HJPA 4KW6A 4FIWA 4IJ3A 2IMDA 3D4MA 3QAVA 4AJ8A 3FKFA 2V32A 4HS1A 4IP6A 1C72A 5IQYA 3TOUA 4MK3A 2LV3A 5ECQB 1M2DA 2YJ7A 1O73A 3LXZA 1IYIA 1W89A 2H76A 3GN3A 3I6AA 3IAS2 3TB2A 1XPVA 4X0XA 3ZL5A 3FZ9A 2FLSA 3D0ZA 4I6XA 5CRGA 1GH2A 2H75A 3TJFA 5IMZA 2DJ1A 2LRCA 2C4JA 5JWOB 4GLTA 4K6XA 3UMAA 1XWAA 1FG4A 1ZCPA 3C73A 5ID2A 2GZZA 2NBSA 3KP8A 1MD4A 2AAWA 5F8BA 1MDJA 2KUCA 4EDYA 3QAWA 1B48A 4MJEA 3GMFA 2H6XA 1Y6EA 2PVOC 3UVHA 1FVKA 1PQNA 1O85A 1TRSA 4MABA 1PL2A 2H74A 1SENA 4OCFA 3ZZXA 2V2GA 3HZ8A 1XIYA 2F51A 4HUAA 5JWRB 3ERFA 4NV5A 4K7OA 2XHFA 2BJXA 3EINA 4YAPA 5B6MA 3TJKA 4IKHA 3VI7A 3GTUB 4OO4A 1N8JA 1ST9A 2GDRA 1K3LA 3CSHA 3US3A 5AISA 4JRRA 2QGVA 5DALB 1M0UA 1S3CA 1J08A 1SK1A 4ULXA 4XS6A 4XRAA 1GUMA 4DSRA 1QXHA 1GSSA 4WXTA 1T4YA 2C3QA 1EOGA 2WGRA 3H93A 2WULA 4KAEA 2IMFA 4MH2A 4PX1A 3R2QA 5JWQB 1GSEA 1FB6A 3QFBC 2VOCA 2VD1A 1U87A 3TJGA 3DVWA 6GSXA 1TRWA 2XBQA 1WIKA 5F0GA 1FW1A 1QMVA 2DJ3A 2HYXA 3GH9A 3D5JA 4GCIA 2L57A 3IR4A 3G7JA 3J7Yb 1HYUA 3APSA 2H0GA 2WRTA 2OJLA 1R26A 4DSQA 5CAXA 3IK9A 4PNGA 2P0GA 2WS2A 5LNKe 3E9JB 3J7Yk 2YN1A 4OFMA 5AIVA 4ZILA 2JZTA 4OO5A 1A0FA 1OC9B 3DYRA 2F8FA 2VCVA 4YQUA 3KXOA 4MH3A 1EV4A 1AQWA 3EC3A 3HDCA 3MDKA 5IPHA 4YAVA 4DSSA 1K3YA 3SWLA 2OBKA 1BAYA 3FK8A 5CRWA 3Q6OA 3ZYWA 2H70A 3L78A 2IL3A 1R5PA 3GIXA 3O6TA 2I81A 4TXVA 1TU7A 1V40A 3GKKA 2GT5A 4OD7A 2YOIA 1Z6MA 3Q19A 4WF4A 1GSYA 4DVCA 1XW9A 3KTLA 7GSSA 2H0IA 4PQ1A 4F82A 4GSNA 3M9JA 1XW6A 1H4OA 4F2IA 2I3YA 4Q5FA 3UJ1A 1JZRA 3KCMA 1W4VA 5A4VA 1DUGA 3GX0A 1QGVA 1V58A 5AIXA 3KJYA 1EEMA 1AW9A 2FWHA 2YWOA 3GTUA 2H1GA 4LMVA 4BVYA 1XXUA 4D73A 2K18A 1B4PA 2GVPA 2A2RA 4Z7XA 1UN2A 5DALA 2VL3A 4BL7A 1QUWA 1JLWA 4MZCA 1GUHA 3ZIJA 2X8HA 5EPFA 1TW9A 4KUNA 3ZIVA 3GH6A 2JL4A 5CO3A 2PUKC 2LQQA 2GLRA 3GKMA 4EVMA 3LGCA 1X5CA 4KGIA 5ECPB 3C1SA 4POLA 5B8AA 4X1UA 2F8AA 2B3SA 5ECLB 2C3NA 4ECJA 3ERGA 4XTSA 4I2UA 4EC0A 3F4RA 1GULA 4ZB9A 1GNWA 2HZEA 3FZAA 1U3IA 3F6FA 2IMKA 2L4QA 5ELGA 1BG5A 3M3MA 3QFAC 2GQKA 4CW9A 3BCIA 2ON5A 1OC9A 1KBNA 3LORA 4TR1B 5IIZA 1EZKA 2TRXA 1AXDA 1GTIA 4EDZA 1GLQA 4NXIA 4KDYA 3CRUA 4EKZA 1B4QA 3TKRA 5LCZA 5ENUA 2WZ9A 4DEJA 1ZYQB 4POMA 2L6DA 4J57E 3FY7A 1F9MA 3TRXA 2G0FA 3NOFA 3P7XA 4NHWA 2DJ0A 3PR8A 4IJIA 3WGDA 4KB3A 1A24A 2YANA 4V1Ag 3GURA 4I97A 1PRXA 2H1AA 4L5OA 1O6JA 1TP9A 2I9HA 1GSFA 2HSHA 2PPTA 3RAZA 2FD3A 20GSA 2PVQA 4TXOB 5EVOA 3F4TA 4K0GA 5IMCA 1M9AA 5J9BA 2MMAA 3QDNA 1PSQA 5DJMA 2DMMA 1EV9A 3DKSA 5JCGA 4BWSA 4FH8A 4POKA 5A4WA 4MF7A 5KN1A 2YWNA 4TVEA 2L5LA 4ISDA 1WOUA 1XWKA 3APOA 1T00A 4KCEA 4GXZA 2P5RA 4ZBBA 5IPGA 5HFKA 1F37A 4IQ1A 3D21A 1YQ1A 3CSIA 5E59A 2WJUA 3GHAA 4N30A 3GA4A 2L4CA 1BJXA 1XCCA 4ECIA 4Q5RA 3WT2A 4JR6A 6GSUA 2JSZA 5ID2B 1VF4A 5ELAA 4RI7A 1DSBA 2VUPA 1JLVA 2YWIA 1A2MA 2G2QA 2VCXA 1VGLA 3EMPA 3ERWA 5D9VA 3HYPA 3F9UA 1A8LA 2CT6A 3KH9A 17GSA 4KSOA 2RM5A 2RM6A 2B5XA 2VCWA 3LXTA 4OFNA 3DGQA 4XCSA 13GSA 1PMTA 3F3QA 2LJRA 1X5EA 4E8EA 2MBTA 1O8XA 4TR1A 3P90A 4KX4A 5ABRA 2MMNA 2DBCA 2YWMA 3C8EA 2H8LA 4CDOA 2C80A 3QD9A 1GSDA 5DDLA 2RLIA 4KNDA 2JZRA 3ISOA 2EIQA 2E2MA 5AN1A 4N0ZA 3CTFA 5J41A 1OKDA 4IQAA 2BTOT 3TUEA 2TRCP 2XBIA 1GUKA 2B1KA 2LQOA 1SK0A 1PX7A 3FR3A 2LTKA 1YF0A 3LFLA 3WT1A 1G6YA 4EF0A 1T1VA 1FB0A 2N5AA 5D9WA 3KP9A 3ZLPA 4O7HA 3HXSA 1GSUA 4ZB8A 2K8SA 4ZL8A 3I43A 3L9VA 3NZNA 1OKTA 1HNAA 4FO5A 4WEYA 1U88A 1K0DA 2CZ3A 3C71A 4AF2A 2YNXA 2OA7A 4ZIJA 4WETA 3N9JA 1OAZA 4HZ2A 3I69A 2OE0A 2GS3A 1RW1A 5H5SA 5GAPD 2AB6A 4TR0A 1SD8A 2OBIA 1LU4A 5HR3A 1HD2A 5GSSA 5H5RA 2CAQA 4JZQA 3HVXA 4WKWA 4DSSB 2GGTA 3BJ5A 2HXKA 3FEUA 4IS0A 5ECKB 1T8EB 4RI6A 4BVXA 3CBUA 4HZ4A 1XOAA 3U5RE 3BCKA 5IOXA 3D6IA 3VURA 4BWQA 1DBYA 3VWUA 1OE7A 2IPAA 2LSTA 2FCHA 2GSQA 2NVLA 5G31A 3IBHA 4QQ7A 1AQXA 5JCWA 4IN0A 14GSA 6GSYA 1R7HA 4QL7A 2YCDA 1GNEA 2X99A 4IBPA 2AV4A 2R2JA 3L9SA 1K0BA 1JZDA 4D73B 4Q5QA 3LG6A 1Z7PA 3P8WA 2B7JA 1AUCA 4AJ7A 1XFLA 3TKSA 3TKPA 10GSA 2CZ2A 5D96A 4HU9A 4WR4A 4YQVA 4HEA2 4ECCA 2KP1A 1AAZA 4FYUA 3BD2A 5KN2A 1Z3EA 1EP7A 3EYTA 4V2NA 4HI7A 2MMZA 1TJDA 1KNGA 1F3AA 4TKYA 4ZBDA 3WYWA 2M80A 4NHZA 3F8UA 1G7EA 2CX4A 2QC7A 5D9XA 3TCOA 3TJBA 2WB9A 2VL2A 2PMTA 2HZEB 4JR4A 2H19A 5LD0A 2C0FA 3M0FA 2NTOA 4EO3A 2IWTA 2OKAA 5D93A 1SJIA 2F3MA 2FWFA 2IIYA 1WE0A 4JU5A 1XWBA 2H72A 4F03A 1YDKA 2B1LA 1AIUA 2NPBA 5INYA 3L4NA 2JADA 1M2AA 1B9XC 3EVIA 5L71A 4POBA 1VF3A 2C1YA 4NMUA 4V2MA 4MCUA 3KEBA 2LKUA 5CNWA 1PKZA 1O8WA 4TW5A 3ME7A 1H75A 4J56E 4XRDA 3EU3A 3CRTA 2HFDA 6GSTA 1LBKA 1OC8A 1SJZA 3L0HA 4AJ6A 2LRNA 1CQGA 1T4ZA 4L0UA 4ZBAA 3H8QA 6GSWA 5F06A 5IM9A 9GSSA 2CQ9A 5C04A 1MEKA 2KHPA 5DVBA 3FW2A 1U3AA 4MJBA 1SYRA 1TK8B 4GF0A 2MYGA 1YF1A 2ZNMA 4K7NA 2JU5A 2H01A 1UC7A 2WDUA 2LS5A 1THXA 2P31A 1ZYEA 2OACA 3IOSA 2PU9C 2C8UA 4BPYA 1ZMAA 1EP8A 2WCIA 4K0NA 1X5DA 1RK4A 1XVWA 1JHBA 1TU8A 3M1GA 2E7PA 1TK5B 5J4UA 4RQRA 3NIVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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