3TKSE

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 in three different redox states
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 65
structure length 197
sequence length 197
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
E PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tksE00
5DALA 5HQPA 4MK3A 2VD1A 1K0NA 1G0TA 4JR4A 3H93A 3QR6A 3TKQA 3IK7A 3M9KA 1T1VA 1DE2A 2HYXA 3NOFA 3FZAA 3M8NA 2CX4A 1XVWA 5DQSA 3VFIA 1B9XC 1K3OA 2V32A 3GMFA 4WEYA 3KTBA 2PN8A 2DC5A 1XPVA 2GVPA 3GKXA 5F07A 3Q19A 2HLSA 3ME8A 1FG4A 3GN3A 1A24A 3IXRA 3GH6A 1TKDB 2X8HA 4PUAA 5CP1A 3QD9A 1FAAA 2R37A 2HRNA 1J0FA 1FW1A 1XWAA 2H70A 3GSSA 4CDOA 1U87A 1T4YA 4IW9A 4IHUA 4GSTA 3D21A 4WETA 4F82A 2B6MA 2L6DA 2OE1A 2K8SA 2YZUA 4NMUA 2A2SA 3ERWA 3EURA 2GS3A 4YH2A 3D5JA 4LL1B 2PUKC 5EL8A 5AIVA 4GLTA 1A8YA 1MTCA 4HOJA 2YWOA 5DDLA 4HZ4A 3VWXA 1U3IA 2PU9C 1A0RP 4K0GA 4X43A 1PSQA 3A2VA 2HE3A 3QFAC 5IOWA 4ZBAA 1FO5A 2H0GA 2RM6A 1W4VA 5AN1A 1QK8A 2OADA 2E7PA 2J23A 1AW9A 5FT3A 4K1FA 3K8NA 1EGOA 3RPNA 9GSSA 4EDZA 1K3LA 1N2AA 4NHWA 3RHBA 1TTZA 4X1UA 2H71A 1OVNA 2YCDA 1TI1A 2PVQA 3FW2A 2GZPA 4DVCA 5KEJA 5F8BA 1GH2A 2LTKA 3LXZA 2YN1A 4GXZA 1F3BA 2M46A 3F8UA 3ZVJD 2J9HA 4RI6A 2VCTA 3W8SA 4KW6A 2HXKA 5LD0A 4K7IA 2VCWA 3GUSA 5GSSA 4V2NA 1XOBA 1I9DA 2ALBA 1KNGA 3TKRA 3M1GA 2YWNA 2VOCA 2KUCA 2WGRA 1KBNA 4WF4A 3RPPA 4GCIA 3MNGA 3FZ4A 4NPBA 4ECIA 1GUHA 4PQHA 1DSBA 4O5RA 2R5GA 3EC3A 2GSTA 1GLPA 2L6CA 4ZB9A 1UVZA 2IMDA 1UC7A 2HSYA 3EWLA 2O7KA 2IMEA 5IMVA 1F2EA 3IOSA 4ECBA 1K0AA 1SENA 5GSTA 1YF0A 1B8XA 5ECOB 5EY6A 3UBKA 4O32A 4K6XA 1OYJA 2XC2A 4ZBDA 1GRXA 1V57A 5FHIA 4MMMA 5H5RA 4FO5A 1ABAA 4QQ7A 5ECKB 5F0GA 4RI7A 1PA3A 4IJ3A 1TP9A 3QAWA 3F3QA 3TJGA 3HJOA 5DJLA 3QFBC 4FH8A 3TGZA 4EF0A 3WGDA 3FR3A 4XRAA 3ZTLA 1XWKA 1BYEA 3KGKA 4WXTA 4J57E 2H75A 4ZBBA 1M7TA 4Q5RA 4NAXA 2VUPA 4GWRA 2YWMA 2K6VA 1U6TA 1JLVA 1K0MA 2JADA 3CBUA 2PBJA 1OC9B 1R5AA 2YNXA 1BEDA 3O76A 3L9VA 4NWYA 4ML6A 1NM3A 4GTUA 4TR1B 1XW9A 4H86A 1SJIA 4GQCA 4POMA 5HFIA 3DYRA 3NZNA 1V9WA 1ILOA 5IM9A 3PH9A 4GSNA 1PX6A 4HU9A 3H1NA 4BWSA 4KCEA 3RDWA 4WR4A 1J9BA 2H19A 3UARA 2DBCA 2R6KA 5B6MA 1E2YA 5A4WA 1OKTA 3Q6OA 4QL7A 1FVKA 1V2AA 3F4SA 5EPFA 4OO5A 5ECLB 2DMLA 3IDVA 20GSA 1XFLA 1GSUA 3KM6A 1MDIA 2PVOC 4JE1A 4L0UA 3D4TA 2B5XA 4K7NA 2YWIA 2ZNMA 4HUAA 2DLXA 5ECHB 3DRNA 3GIXA 3FY7A 1PGTA 2JACA 4J2FA 1SK0A 4HZ2A 2FD3A 2IN3A 3J7Yk 4KUNA 1SYXA 4JZQA 2MYGA 2QC7A 3I6AA 1SJZA 4J56E 1LU4A 2I1UA 2BMXA 4MZBA 5DJMA 3QOUA 4EDYA 5ECNB 2G0FA 3I9V2 3OR5A 1WMJA 6GSSA 3TJBA 5LNKe 2CVDA 4G19A 5HFKA 1XXUA 1GNEA 1PQNA 3KP9A 3HZ4A 5IMAA 2C0EA 2F8AA 4Z7XA 2F51A 5CNWA 5DAKB 3IR4A 4BA7A 2AUVA 3VLNA 1EP7A 2VCZA 5CYYA 2JL4A 1O7UA 4I2UA 3LQ7A 2P5QA 1GL8A 3DIEA 1O8WA 1V40A 3GV1A 1ST9A 3F9UA 3BOAA 3QAGA 4GF0A 4XTSA 1WOUA 4TN8A 1A0FA 1ERTA 1JLWA 2GLRA 3GSTA 5AIXA 3LWAA 4ISDA 2DJKA 1M2AA 2C3TA 2VCVA 4TW5A 3ED3A 2FWGA 4KSMA 2Z9SA 1A2JA 2AAWA 1PMTA 4HEA2 2AV4A 5B8AA 2H6XA 2LS5A 4JEDA 1M9AA 1F9MA 3E0UA 3CRUA 5ECSA 4WBJA 4WKWA 3L4NA 4BVXA 2O89A 1TK8B 1X5CA 1ZL9A 3GNJA 2P0GA 4MA9A 5GAPD 2CQ9A 5ECQB 2LRCA 2AJQB 1URMA 2LUSA 2L4QA 5AISA 4JU5A 2KLXA 3A2WA 2GZYA 1GTBA 3AY8A 4XS6A 3U6VA 3ZZXA 2I3YA 2JU5A 5INYA 2LJAA 4IBPA 5HFGA 2FNOA 4DEJA 3LYKA 2ES7A 3WGXA 2CAQA 2V41A 2N5AA 5G31A 1UA5A 3F4RA 2OBKA 3UMAA 1Z9HA 3CSHA 2X8GA 4YAPA 5CRWA 2KOKA 3KIJA 5IMCA 2IMKA 3F6DA 3P8WA 4N0VA 5A5KA 3A3TA 2LEGA 5E4WA 1NHOA 3EMXA 5D9TA 3TOTA 3LORA 1A8LA 1ZCPA 3EE2A 2FLSA 4IS0A 2RUEA 3TKSE 3HA9A 5ENUA 1T3BA 2FY6A 1QQ2A 3UBLA 3FYGA 2H8LA 1R7HA 5DVBA 2DIYA 5DAKA 1M2DA 3ZFLA 3ZL5A 4OMVA 3IE3A 2C0GA 2O85A 2GGTA 4ZB6A 3C71A 1ZYQB 4PURA 4HS1A 1U88A 5ELAA 1YKAA 3TOUA 4KNDA 1FOVA 1PD21 2GT5A 3HJMA 8GSSA 1FB0A 1GLQA 10GSA 2O87A 4CW9A 3IA1A 2N5FA 4TR4A 5ECMB 2YV9A 3LJRA 3RBTA 2B1KA 4NHZA 1AAZA 2K9FA 4E8HA 5DCGA 3GH9A 1THXA 4PXOA 4ZL7A 5J9BA 4F2IA 1ZMAA 2JZRA 4X0XA 4OFTA 3UVTA 1X5DA 4V1Ap 4AGSA 3D0ZA 2QSIA 7GSSA 2X64A 3S9FA 1SL0B 3DEXA 5D8IA 4ECJA 3ZIVA 4KGIA 12GSA 1H4OA 5FWGA 2LNTA 1G7OA 2L57A 3TB2A 3BBYA 1YEXA 4ML1A 5KN0A 1Z6MA 2V6OA 2IMFA 2HFDA 1KEBA 3C1RA 2ZCTA 2VCQA 4ID0A 4D73A 3KH9A 1XOAA 1XCCA 1K0BA 2B5EA 4MCUA 3FKFA 5ECPB 2PERA 4PGTA 2OACA 4MDCA 1JFUA 1B9YC 2ON7A 3LGCA 2FWFA 3QAVA 6GSTA 5DBQA 1UN2A 1JZOA 3MSZA 4LL4B 4GQFA 3QCPA 1PKZA 4PUFC 4GRFA 4NV5A 1SYRA 4AF2A 3WT2A 2NTOA 2JSZA 3F4TA 3C8EA 1G6WA 2H1BA 3JCML 3E3EA 3CMIA 1XWCA 1MEKA 3CTGA 2A4VA 1SJ6A 1TXXA 4V1Ag 1Y6EA 3ZLPA 1EP8A 1YJ6A 3H8QA 1DE1A 3FRCA 5G1LA 5IIZA 3HKRA 3L78A 1AUCA 2XHFA 3U5RE 5JWRB 3IAS2 1GSSA 2AYTA 3P2AA 3LXTA 2GTUA 3FZ9A 3W6GA 5CO3A 4V2MA 3ZMLA 1SU9A 11GSA 1O8XA 3GX8A 4IP1A 3KH7A 4DSSB 2VCXA 2C80A 4ACSA 1S3AA 4MPFA 3WYWA 1PX7A 3D22A 2P5RA 1K0CA 3H79A 3HCZA 4K0NA 1NW2A 5CAXA 1ERVA 4POKA 1S3CA 2X99A 1PL1A 2CVBA 3DMLA 4L0WA 1SKSB 5F06A 3F6FA 3BCIA 1KTEA 3NIVA 4I2TA 1F3AA 1TRVA 3VPQA 1XWGA 1M9BA 1X9SB 3IBHA 2H74A 3W8JA 4ZL9A 3LYPA 2A2RA 1YDKA 5B6NA 3TJFA 4HJ2A 1XVQA 3L9SA 2VD0A 4P3YB 3I69A 2H1DA 4JBBA 2H1AA 3GHAA 1SD9A 2WB9A 1CQHA 5C00A 3LFLA 3GFKA 3EVIA 2IL3A 2CAIA 1ZYEA 2HNLA 3ERGA 1Z6NA 5G2ZA 1GSDA 3FEUA 4OFNA 4RUVA 1LBKA 5JCUA 2NDOA 4Q5FA 1TW9A 22GSA 3DD3A 3DWVA 3QPMA 2V1MA 6GSWA 2PPTA 3HVSA 4MH2A 1YY7A 1XW5A 2MBSA 1WPIA 4YAVA 2XBIA 3CYNA 2MMAA 1M0UA 5H5QA 3VURA 2H76A 2H6YA 2E2MA 3KTLA 3P90A 2F8FA 4DSRA 3EMPA 4N11A 2R2JA 1T4ZA 4KCAA 1Z5YE 1AIUA 2CX3A 2O8VB 1GTAA 4EKZA 1O6JA 3HHVA 1ZGNA 4IKHA 1EOHA 3G9BA 1SD8A 2PMTA 1R26A 2C8UA 5J41A 5ELGA 4YQMA 3CTFA 1EV4A 4F03A 5ECRB 4I8BA 1YZXA 3D4MA 4G9HA 1C72A 2REMA 5CREA 3FR9A 16GSA 4WR5A 1W89A 1G6YA 2BTOT 2N5BA 1THOA 1MD3A 2I9HA 2IIYA 1GSFA 1MDJA 4IVFA 1TU7A 2YANA 2WS2A 4TOPA 1I5GA 2HZEB 3RAZA 4G10A 1TRSA 2WULA 3HVXA 2GQLA 2CZ3A 4MF7A 3IHQA 4RQXA 3APSA 2XPEA 2H0IA 5D93A 2DIZA 1USBA 4DSSA 4DSQA 3O3TA 3ERFA 1R4WA 4OO4A 3RHCA 5IMFA 1BAYA 5DCHA 1EOGA 2H72A 4HDEA 2PWJA 2LRTA 4IGJA 2FWHA 4ZXGA 4KE3A 1JZRA 1Q98A 2DSAA 1OE7A 1OAZA 1PRXA 3LEFA 4XIHA 4Q5NA 4K2DA 4PNGA 1IYIA 6GSXA 3G7JA 5JCGA 1WRYA 4BL7A 3HYPA 1QFNA 1BQ7A 3SBCA 3KP8A 4FYUA 4L8EA 4N10A 2MMNA 4K9ZA 4AJ8A 3WGEA 1OC9A 5IMDA 13GSA 1T8EB 2K18A 1Y25A 2H6ZA 1BJXA 5G5EA 2H0HA 4EE0A 3IC4A 2KP1A 3CSJA 4TR1A 4ZL8A 3LG6A 2LQQA 4I97A 1RW1A 3PGTA 2HI7A 3A5WA 4PX1A 2FWEA 3UJ1A 5KN2A 3UIWA 5A4UA 3O6TA 1T7PB 1VGLA 3WT1A 3MWHA 2V6KA 4YQVA 2AB6A 2M72A 4F9ZA 2OE0A 4PQ1A 2DJ1A 4IJIA 3GX0A 4TXOB 4V2LA 2CVKA 1ON4A 5KN1A 5COHA 2CZ2A 1GSQA 2EC4A 2VL9A 1TK5B 2TIRA 4PNFA 3GL5A 3GRXA 3MDKA 1X9WB 2WDUA 3BCKA 3US3A 1TRWA 3IK9A 1EEJA 4MJAA 2C0FA 2H1GA 1PN9A 5IPHA 2TRCP 1XBSA 4MZCA 2C3NA 4ULXA 2F3MA 1B48A 1K0DA 3UOMA 2HZEA 2G2QA 1V98A 1FB6A 3VWUA 1AC1A 2YV7A 3E9JB 2IJYA 1EGRA 2LQOA 2K8VA 3CXGA 2R3XA 1HNAA 3APQA 2YZHA 4JR6A 4XHMA 1HQOA 2IWTA 3M9JA 1GP1A 4FYBA 1ERWA 1AQVA 4F0BA 3G7IA 3DKSA 1ACVA 3GURA 4PQIA 1OC8A 2V2GA 2FUG2 3ZFBA 3ZREA 3TKSA 4MLYA 4L5LA 2VLTA 3SWLA 3KEBA 2L5OA 1DBYA 2DJ3A 4WBRD 2LV3A 3IAM2 1EWXA 3H4KA 4XS4B 4HU7A 2CA8A 1VF2A 4POLA 5HR0A 1U3AA 2KP2A 3F0IA 1BX9A 2RLIA 3ZYWA 2VLUA 1QGVA 3TJKA 5JWQB 4LMVA 1RQMA 3V1WA 4EXJA 1WE0A 6GSUA 4HI7A 5IOXA 3FHKA 4ZILA 4O92A 2IFQB 3HVVA 3KCMA 6GSYA 3ZVJA 3ZIJA 1O85A 4MPGA 2RUFA 2VIMA 1ERUA 3J7Yb 2YPMA 3DGQA 2WJUA 4YQUA 4XCSA 1DUGA 2NBSA 2HZFA 3Q18A 2TRXA 4MJBA 17GSA 2OA7A 4BVYA 4MF5A 1SK1A 1OKDA 4HQSA 3VWVA 2EIQA 2JSYA 5D73A 2R4VA 1F37A 5ID2B 3KJYA 4MJEA 3HJPA 1SL1B 2RIIA 5IQYA 3FK8A 2M80A 4IQ1A 5LCZA 2GSRA 4TXOA 3BD2A 2L5LA 2GQKA 2L59A 2KHPA 2ON5A 1YQ1A 2HRFA 4KX4A 5JWOB 4OCFA 3ZMKA 5J4UA 2XBQA 3HY2A 3VK9A 3MAKA 3C7MA 3ME7A 2VAFA 1SK2A 1GTUA 3D6IA 3GA4A 5E59A 2GDRA 3DVXA 2NVLA 3TDGA 1M99A 2BJXA 3KMOA 4MJCA 1PKWA 4FIWA 1GTIA 2LRNA 5CRGA 1H75A 4KA0A 1VRSD 2H66A 5CRHA 5B8BA 2CV4A 3HZ8A 1ZOFA 2WRTA 3FZ5A 3A2XA 4MABA 2LNSA 4KH7A 3C1SA 1GSEA 2L4CA 3TKSC 3KZQA 1N8JA 1SKWB 4O7HA 1FVJA 3VWWA 2FCHA 2GZZA 1TRUA 2VO4A 2B7JA 3P7XA 4WF5A 2C3QA 4K7OA 5GZZB 4RQRA 1B4PA 3IRAA 4ZB8A 3R2QA 4LMWA 3M3MA 2C0DA 4LA1A 4BWQA 1QMVA 1TU8A 5IO2A 4ILFA 4L5OA 3DXBA 1QXHA 2MZCA 2B7KA 1VF3A 5G30A 3IV4A 3L0HA 4I6XA 2GSSA 1O81A 2OBIA 4KDUA 3TCOA 1QUWA 4XS4A 3TRPA 1T00A 3M0FA 1YEPA 2E0QA 1X5EA 3GTUB 1K3YA 4OCEA 3CRTA 3WD6A 5G5FA 1OC3A 1AQXA 4G2EA 4KDXA 2MBTA 1EZKA 1MDKA 2F9SA 2FA4A 5IMZA 1TDIA 3IPZA 1CQGA 5AGYA 4NV2A 2HT9A 2IFQA 4FYCA 4EO3A 3G7YA 3HD5A 1B4QA 4CHSA 3VI5A 3FR6A 4MP4A 5HR3A 1HNCA 1GNWA 4ZIJA 1TI3A 2CT6A 5A4VA 3HDCA 1Z7PA 5IO0A 3KXOA 2C4JA 1X0RA 2H73A 1XZOA 2P31A 4QL9A 4Q5QA 2VL2A 2GSQA 5J5NA 5ID2A 1VF1A 1WIKA 1EV9A 2EIRA 3I43A 1TK0B 2OE3A 4TRXA 4AJ7A 2DJ2A 4I5QA 2OJLA 5F05A 3F3RA 5H5SA 1Q4JA 3APOA 2B1LA 2WCIA 2XPDA 1SKRB 3L9UA 4XRDA 4TVEA 1XWBA 2LKUA 1F6MC 4KB3A 5D96A 3GYKA 2LJRA 2VM2A 5KN3A 2I4AA 5B7CA 2QKEA 1GUKA 5D9XA 3HXSA 5ECIB 3QMXA 2B3SA 1HNBA 4IQAA 2E2GA 4GSSA 5ABRA 1WJKA 3C73A 1JZWA 3GKKA 4K8MA 3ISOA 3ZRDA 4MH3A 2DMMA 1TOFA 2DJJA 3UVHA 1S3DA 1G7EA 1XW6A 5D9VA 3EU3A 1OE8A 2B5YA 1R5PA 2IPAA 2H01A 4EC0A 4N30A 5JCWA 3N9JA 5IPGA 2FA8A 4LLRA 3PINA 5L71A 5J9CA 5CRDA 3GKNA 3UL3A 4F0CA 4HJMA 3LSZA 3N5OA 3VI7A 1JHBA 3KD0A 2YP6A 4XS1A 1TJDA 3TUEA 3CSIA 2WFCA 5DALB 4OFMA 18GSA 1M2BA 2GQMA 3GTUA 2VL2C 5D9WA 1HD2A 3UEMA 3PR8A 1WP0A 19GSA 1RK4A 2JZTA 2RM5A 2OKAA 1VF4A 3UAPA 1E6BA 1PL2A 4EL1A 5HR1A 1ZZYA 4N0ZA 4IELA 2MMOA 1GULA 6GSVA 3TRXA 5EVOA 1Z3EA 4IN0A 3DVWA 2VLVA 4KDYA 2H30A 3EU4A 1XIYA 4TR3A 4E8EA 4TR0A 4KSOA 2ZUPA 5HR2A 4TXVA 1K0OA 1J08A 1LJRA 3VPTA 2DJ0A 4EVMA 5G1KA 2PGTA 5C04A 2VM1A 2D2ZA 1A2LA 1EEMA 1V58A 1Z7RA 1AXDA 2GT6A 4KAEA 1GWCA 2C1YA 2VL3A 1YKCA 3KMNA 3F63A 1GUMA 3TRQA 14GSA 2YJHA 4EUYA 4JRRA 3GKMA 2X8CA 2YOIA 4BPYA 2MMZA 1IYHA 1ML6A 2FGXA 1NSWA 5GAND 3ZITA 2HSHA 4NXIA 2NPBA 4HQZA 4IP6A 2LSTA 5DQYA 4OWYA 1YF1A 1FHEA 4TKYA 3TKPA 1O73A 1A23A 3EINA 3GL3A 1WWJA 1SL2B 1NHYA 1GSYA 2EIOA 4MF6A 3Q74A 1JZDA 2FHEA 5J3RA 2QGVA 3EYTA 2IMIA 2WZ9A 4D73B 1HYUA 2JZSA 1BG5A 4POBA 1MD4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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