3U5RE

Crystal structure of a hypothetical protein smc02350 from sinorhizobium meliloti 1021
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
183
structure length
183
Chain Sequence
KTQSNSITLGTRAADFVLPDAGGNLFTLAEFKDSPALLVAFISNRCPFVVLIREALAKFAGDYAGQGLAVVAINSNDAQAFPEETLERVGAEVKAYGYGFPYLKDASQSVAKAYGAACTPDFFLYDRERRLVYHGQFDDARPGNGKDVTGADLRAAVDAVLKGKDVGTTQVPSIGCNIKWTAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a hypothetical protein SMc02350 from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Sinorhizobium meliloti
molecule keywords uncharacterized protein
total genus 59
structure length 183
sequence length 183
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3u5rE00
1UVZA 4EKZA 3A5WA 4ZL9A 4CW9A 3TKRA 1HD2A 4IS0A 5LNKe 2YCDA 4GSTA 3NOFA 4GSSA 4MZWA 3TJFA 3KP9A 1T4YA 2AB6A 5FWGA 3KTBA 4LA1A 4HJ2A 4I8BA 2WJUA 3O6TA 1TXXA 4FIWA 1HQOA 5F05A 3BCIA 3VI5A 5H5SA 3WT1A 1LJRA 4AF2A 1K3OA 4FYCA 3VWWA 2L6CA 3D6IA 2YWNA 1V40A 4WF4A 3D4TA 4IJIA 1DSBA 4GCIA 2I9HA 1EOGA 2CAQA 2OA7A 3KIJA 1TRSA 3H4KA 5CRWA 4K7OA 4OFMA 4IJ3A 4TW5A 5D9TA 1T4ZA 3KP8A 2GT6A 2DC5A 2DMMA 5CRHA 1PX6A 3ZIVA 5GZZB 3S9FA 1YF1A 2AHEA 5ECSA 2VUPA 1M2AA 3IDVA 4OFNA 2GZYA 1XFLA 5HFIA 1NHOA 2DJ0A 3ZREA 4KDYA 2LV3A 2K9FA 2YN1A 3IAM2 4TR1A 2R3XA 2R2JA 4LL1B 4KUNA 1GNEA 4TRXA 2FLSA 3UBLA 3KTLA 3GTUB 2AYTA 1JZOA 3VURA 2ON7A 4EL1A 1AXDA 2JSZA 2DIZA 2RM5A 3FZAA 3DWVA 3IK7A 1SK0A 4PQHA 4TR3A 1A2MA 4P3YB 5GSSA 4IBPA 2KLXA 2VL9A 5INYA 3HVSA 2VLVA 2HZEA 4WR5A 3FY7A 3GX8A 5D9VA 3C73A 5H5RA 3TKSE 2VM2A 4KDUA 2YANA 1ZMAA 3GH6A 1WRYA 1G6WA 3US3A 2QSIA 3F63A 2JU5A 3H8QA 5AIVA 1G0TA 2V41A 1GSYA 5CRDA 1WIKA 4EE0A 2LEGA 2B7JA 2BMXA 3P7XA 2MMZA 1XWAA 3GURA 3TUEA 1FO5A 2FA8A 4ZB8A 3HD5A 5ID2A 3N9JA 4HS1A 4BVYA 1ML6A 1O8XA 2GT5A 5KN0A 3TKSC 2QKEA 2K6VA 4G19A 3V1WA 3D0ZA 2VLTA 3FZ4A 3CMIA 5CP1A 2B1LA 4ML6A 2PGTA 2ON5A 1X9SB 4HDEA 2LJKA 3IRAA 1O6JA 1XW6A 1X0RA 5ECNB 1ILOA 3UAPA 2YJHA 1OC8A 3DKSA 4Q5NA 2V2GA 1YQ1A 1EWXA 2VO4A 2H1AA 3DRNA 2IMEA 4BL7A 1QXHA 4HOJA 4XTSA 1X5CA 1GUKA 2CQ9A 2DMLA 3GH9A 3DVWA 2O89A 3MSZA 2VD1A 5ECMB 1WWJA 1FB0A 2J9HA 4J56E 4LMWA 4YQUA 2VIMA 4F03A 2FA4A 1QGVA 1BAYA 2IFQA 1G7EA 2WRTA 4GQCA 4MH2A 3M9JA 2Z9SA 3KH7A 3EINA 3GL5A 5DQSA 1K0NA 1QUWA 1V9WA 3HCZA 1PGTA 5HFKA 4HQZA 2NPBA 1XXUA 5DCGA 1GSSA 1OYJA 2V6OA 5JCGA 2O85A 3E3EA 3F3RA 1TRVA 3UMAA 1R26A 5C00A 3VLNA 1GUHA 3ZMKA 3F6DA 4QL7A 4DSSA 3GSTA 2CA8A 4OO4A 4NHZA 3E9JB 4L5OA 4IKHA 3GYKA 1WE0A 5IPGA 4ID0A 1AQWA 20GSA 6GSTA 5AGYA 4WKWA 4EXJA 4JEDA 5ECIB 1PN9A 2GSSA 18GSA 1TDIA 2HFDA 3RAZA 3WGXA 1FG4A 1HYUA 4JRRA 1GTUA 2X64A 3ZVJA 1G6YA 3CXGA 4XHMA 4O32A 2X8HA 1AIUA 4JR6A 1FHEA 4X0XA 3ERFA 2OE3A 3M1GA 4MZCA 2E7PA 2IMKA 3VK9A 3UVTA 1OE7A 2C3NA 2NBSA 3UBKA 3NIVA 3BJ5A 1M9AA 2RM6A 4HJMA 3CSIA 1C72A 3VI7A 1XVWA 1KNGA 3R2QA 5DDLA 2OADA 5HR2A 5AISA 3QOUA 4PUAA 2IMIA 1HNCA 5DAKB 4XRDA 1SJIA 3GA4A 4O92A 4F9ZA 3IA1A 3GSSA 2H0GA 4K8MA 1PL2A 3DD3A 3GX0A 3TKSA 2PWJA 4TN8A 4OWYA 3GKKA 1OC9B 2FHEA 3GTUA 3C1SA 5E59A 3ZFBA 4TR4A 1JHBA 1YDKA 3L4NA 4AGSA 2DJ3A 1IYHA 1LU4A 1EV4A 4MLYA 1VF1A 3Q74A 3EU3A 1ZYQB 2LSTA 3VWVA 1QK8A 3A2XA 5LCZA 5KN1A 2FNOA 2TRXA 4GWRA 4MF7A 2ZCTA 1H75A 1K0AA 1A0RP 1TKDB 1FVKA 2I1UA 2DJJA 2VM1A 4ZBAA 4XS4B 2FUG2 1V58A 1SU9A 5FHIA 1JFUA 2VCWA 5CYYA 2KHPA 2H71A 4HU7A 2YPMA 1I9DA 3ZL5A 2F8FA 4G9HA 3LJRA 4I5QA 3KZQA 1BG5A 3EU4A 2H1BA 1X5EA 3KD0A 22GSA 1JZWA 2JZSA 4NV5A 4NAXA 4ILFA 3APOA 1B8XA 2HSYA 4HI7A 4KCEA 4LMVA 2LJRA 3VWXA 4I97A 3U6VA 4KSMA 1XBSA 2GZPA 1HNAA 5IQYA 1EV9A 3LXZA 1AAZA 2CVBA 3EMXA 5ECQB 5J9CA 1LBKA 5H5QA 4RI7A 4KB3A 2RUFA 1ZGNA 1K3LA 3TRQA 1AUCA 2DLXA 1K0DA 1YJ6A 2GTUA 4PQ1A 3HHVA 2DJ1A 3GHAA 5ECLB 2EIQA 1THXA 3UOMA 2LQQA 3EYTA 3VPTA 3GUSA 3DXBA 4AJ6A 1FB6A 2YP6A 1UC7A 3HJOA 4IELA 1TRWA 4RQRA 5IMAA 2BJXA 3BD2A 1F6MC 2A4VA 4PUFC 4ZB6A 4IN0A 1EGRA 5G1LA 1GSQA 3TJKA 4Z7XA 4L0UA 5HR3A 1TU8A 3VWUA 3CSJA 3A2VA 1MDIA 3KMOA 2YV9A 1VF3A 3I9V2 4XS6A 3M3MA 3BBYA 4DEJA 5CAXA 4ECCA 2H0IA 2YOIA 2DIYA 2BTOT 3FW2A 4OMVA 1PKZA 4IW9A 6GSXA 1A23A 1ACVA 1E2YA 4GXZA 2K8VA 2CX4A 2MMNA 2C80A 1YEXA 2IPAA 1X5DA 4PNFA 1M0UA 3A2WA 5ECPB 4KX4A 2VCXA 1KBNA 2VD0A 4DSRA 4RQXA 4IP1A 1TU7A 3QAWA 2F51A 3TJJA 1CQHA 1F2EA 2HNLA 3QDNA 2L4CA 3QFBC 3A3TA 3EWLA 4V2NA 1X9MB 1XW5A 3Q6OA 4I2UA 2JACA 3C71A 4FYBA 4V2MA 2WCIA 3J7Yk 2MMAA 1BJXA 2I3YA 2X8CA 1U3IA 2MBTA 4EC0A 3HZ4A 2MBSA 1ZL9A 2VOCA 1FVJA 2MYGA 1XVQA 1ZYEA 4WF5A 3J7Yb 1XWGA 4N10A 3GKNA 4F2IA 1J08A 5J3RA 4HUAA 5IMVA 4ECJA 1GRXA 2HYXA 3PGTA 1TTZA 2XBQA 1B9XC 5AN1A 5G31A 4L5LA 4XRAA 3JCML 1QQ2A 3F4TA 4AJ7A 2EC4A 2H70A 5CNWA 1GWCA 1Q4JA 1SJZA 1RQMA 1O85A 1AQXA 1OE8A 3GL3A 2WFCA 1K0OA 1GSUA 2E2MA 2XC2A 4POMA 4WR4A 2HE3A 4ECIA 5L71A 1GTBA 4GSNA 3FEUA 4F0BA 4KCAA 3ZFLA 4I2TA 3L78A 2N5BA 4EVMA 3TJBA 5GSTA 1OKDA 3DVXA 3CSHA 3EURA 1S3AA 1OC9A 5F0GA 2FD3A 3NZNA 5IPHA 5IMDA 2MMOA 3HYPA 4PNGA 3FYGA 6GSSA 2H6ZA 4JE1A 1MEKA 2XBIA 5FT3A 3GV1A 2FY6A 4MABA 4X1UA 1BYEA 4MP4A 1I5GA 1F3AA 3QCPA 3L0HA 1GNWA 3ME8A 1WJKA 4EUYA 3P90A 5D73A 3RBTA 4BWQA 1ZCPA 2C4JA 3WD6A 2YNXA 2LJAA 12GSA 1EOHA 3RPNA 3G7IA 2LNSA 3QAGA 2I4AA 1O7UA 4XS4A 5F8BA 5IIZA 3U5RE 3W6GA 3D4MA 1XWBA 2X99A 1B48A 5HR0A 6GSUA 3SBCA 2PVQA 4PGTA 3G7YA 4ZXGA 2GDRA 1GLQA 3PH9A 4NHWA 3KH9A 2B5EA 5ABRA 4OO5A 1GULA 5B7CA 4FO5A 3GFKA 2OE1A 2ALBA 1T1VA 3ZVJD 3LXTA 5CO3A 4AJ8A 4MJCA 1MDJA 3IHQA 4N11A 1R5PA 4KH7A 1PKWA 4DVCA 2P0GA 1Q98A 3QD9A 4K7IA 1PL1A 1ZOFA 3FZ5A 4OCEA 5DQYA 2CV4A 2WZ9A 1M2BA 2ZNMA 1MD3A 3C7MA 3ED3A 1U3AA 2H75A 2M80A 2XPEA 3LQ7A 2R6KA 3FRCA 2M72A 2R37A 2M46A 4Q5QA 1RW1A 1JLWA 1GSEA 2YZHA 2CVKA 3LYKA 4BWSA 1THOA 2HRFA 3BOAA 2VL3A 3AY8A 1V98A 3I69A 4PQIA 2WS2A 3H79A 1Z9HA 4JU5A 4V1Ag 3UIWA 3MNGA 3Q18A 1GLPA 4E8HA 1WOUA 4TR1B 1B9YC 2PPTA 1YKAA 3LSZA 3F4RA 2AAWA 2YWOA 4L0WA 1Z7RA 2B1KA 5D8IA 2O7KA 1FOVA 3FR3A 5D96A 2PVOC 3H1NA 2DJKA 2GZZA 1T7PB 5D93A 3LGCA 2IMDA 4N0VA 4Q5RA 4MZBA 2XHFA 2HZEB 2OBKA 2PU9C 1EEMA 1M99A 4XCSA 5J5NA 4KNDA 13GSA 2OACA 1M2DA 3HJMA 2IJYA 1YY7A 1TRUA 5ELAA 4K0GA 1ABAA 1WPIA 3TB2A 3TRXA 2C0EA 4HEA2 2IN3A 3F9UA 3MWHA 5IM9A 2OBIA 1FAAA 2QC7A 2JADA 4POBA 1UA5A 4QL9A 2H8LA 1G7OA 4MF5A 3QPMA 4IGJA 4NMUA 3E0UA 4ZL7A 4NXIA 19GSA 2C0DA 4MCUA 2VL2C 3DIEA 2YWMA 1HNBA 1VF2A 4EF0A 4K0NA 1BEDA 4MDCA 3TOUA 1Z5YE 3M9KA 1A0FA 4HZ4A 3OR5A 3TKPA 1TK0B 1YKCA 1ERUA 2C3TA 4XIHA 4MPGA 1VRSD 3M0FA 1GTAA 1AQVA 16GSA 2GSTA 2EIOA 3GIXA 1S3DA 3F6FA 4MJAA 4IQAA 3F8UA 4ISDA 4ZIJA 5KN2A 1GH2A 4PURA 1F3BA 1SK1A 2H66A 5A4VA 2RIIA 3QFAC 3VFIA 3M8NA 3KEBA 3ZIJA 4EDYA 2H0HA 4IP6A 2WGRA 3PINA 3O3TA 4KSOA 1SYRA 2R5GA 5B8BA 2L5OA 3HXSA 4PX1A 4GQFA 4BVXA 3ZZXA 3C1RA 1NW2A 2PERA 3W8SA 1IYIA 1K0BA 1VGLA 1U6TA 2O8VB 3Q19A 2IFQB 2WDUA 4IVFA 4QQ7A 5LD0A 1XOBA 2LRNA 3EE2A 2WULA 2DBCA 2LS5A 2A2RA 6GSVA 5G5EA 3IR4A 3UEMA 2HI7A 1KEBA 1USBA 4N30A 5DBQA 1XIYA 3APQA 4Q5FA 2A2SA 3MDKA 2E2GA 4EDZA 1ERVA 5JWOB 1QFNA 3QMXA 2R4VA 11GSA 1CQGA 3D21A 1V57A 5ECHB 1AC1A 1DBYA 5KEJA 5D9XA 1XPVA 2H30A 2TRCP 5A5KA 4KA0A 3C8EA 3IXRA 1WP0A 2LUSA 5IO2A 2CZ3A 2LRTA 1M7TA 4MA9A 5ECOB 3L9VA 1GP1A 2CZ2A 5IMFA 1PD21 3GNJA 1TI1A 2GSRA 2FWFA 1DE1A 5ECKB 1R7HA 1A24A 1Z6NA 5B6NA 3F0IA 3K8NA 2F9SA 3P8WA 2FGXA 3GMFA 4O5RA 2WB9A 4RUVA 4ACSA 2V6KA 2NVLA 3ZRDA 5DALB 1WMJA 3ISOA 2ES7A 3FHKA 2EIRA 1TP9A 4FH8A 2LKUA 4IQ1A 4K7NA 4OD7A 1EEJA 5G5FA 1MD4A 2E0QA 2OJLA 4POLA 5G2ZA 3EMPA 1O81A 4TVEA 3UARA 1S3CA 4X43A 2IL3A 3KCMA 1YEPA 2QGVA 1Z7PA 2N5AA 3RPPA 1ST9A 5GAPD 2K8SA 2J23A 2NDOA 2VL2A 5JCUA 4V1Ap 4KE3A 3CBUA 1X9WB 4KDXA 2L4QA 1ERTA 2JL4A 3WGDA 2OKAA 1K3YA 1EP8A 1PMTA 5KN3A 1AW9A 5ENUA 1GSDA 5EL8A 1JZDA 1NM3A 2GVPA 4HU9A 1SKWB 3G7JA 2PBJA 1F9MA 3GRXA 4J2FA 2IWTA 2V32A 2G0FA 4ZL8A 4K2DA 5DAKA 2HSHA 2C3QA 2GSQA 1TK8B 2H72A 3WYWA 2LQOA 2OE0A 2H73A 4WXTA 3FK8A 2NTOA 3TDGA 4O7HA 2KP1A 4MJBA 1N2AA 5DVBA 2FWGA 3IOSA 4TXOB 2O87A 3IC4A 2JSYA 1TJDA 1SD8A 4ZBDA 2GQLA 3FR9A 8GSSA 5J9BA 3G9BA 2GQMA 1PSQA 9GSSA 2C0GA 2CT6A 1R5AA 4JBBA 3GN3A 3KM6A 3KJYA 3FR6A 2YZUA 5IO0A 2VCTA 1PRXA 4NPBA 2B5YA 2HXKA 3GKXA 3PR8A 1W89A 2VAFA 4L8EA 2XPDA 2HRNA 3HJPA 5AIXA 2I81A 4D73B 2F8AA 5A4WA 5HFGA 1URMA 1F37A 5J41A 4ZILA 3LYPA 1ZZYA 2LRCA 3SWLA 3KGKA 3QR6A 1SYXA 3UVHA 4ECBA 3DMLA 1H4OA 3CTGA 4CDOA 5EVOA 2CVDA 5A4UA 2ZUPA 2GS3A 1A8LA 3I43A 4JZQA 3HVVA 2L5LA 2L59A 7GSSA 1TOFA 1B4QA 4YQVA 1SKRB 3N5OA 2L6DA 3RHCA 2P5QA 2HZFA 1ON4A 1SK2A 2H76A 1N8JA 2L57A 3CRTA 3F3QA 5CREA 3I6AA 5COHA 2B7KA 4MF6A 2H19A 3O76A 1MTCA 4LLRA 1SJ6A 3LEFA 5JCWA 1PA3A 5DJLA 1OAZA 3LG6A 2REMA 3F4SA 1J9BA 1KTEA 2P31A 2H6XA 2C0FA 3RHBA 3TKQA 3APSA 4KW6A 2FCHA 1U87A 3D22A 3HVXA 4K9ZA 5G30A 1O73A 1SENA 2VCVA 2YV7A 2H1GA 5IOXA 4KGIA 1RK4A 2H6YA 2B3SA 3ME7A 2V1MA 4LL4B 1OC3A 4WETA 1YZXA 4RI6A 2K18A 1SL0B 1UN2A 3ZITA 3ERWA 2PUKC 2MZCA 4NWYA 2AV4A 1XZOA 1E6BA 2GQKA 4K6XA 2FWEA 2G2QA 1T3BA 1OVNA 1PX7A 2H1DA 3QAVA 4PXOA 2B5XA 2F3MA 1EP7A 5JWRB 1TW9A 4TR0A 2IMFA 2KUCA 2VCZA 3GKMA 4TOPA 2AJQB 3TOTA 4ML1A 3LFLA 5IMZA 1EZKA 3CTFA 5ECRB 3TJGA 3HY2A 5DALA 2PMTA 3HDCA 1W4VA 2P5RA 5IMCA 2HT9A 3DYRA 1Y6EA 3HZ8A 1V2AA 3EVIA 1VF4A 3MAKA 2D2ZA 1U88A 1BX9A 2H74A 1JZRA 4MK3A 1Z3EA 5HR1A 4HZ2A 3UJ1A 3UL3A 3CRUA 1K0CA 4F82A 1SD9A 1GUMA 1DUGA 1XWKA 4WBJA 1GL8A 4K1FA 1K0MA 1BQ7A 3ZLPA 3LWAA 2VCQA 3HA9A 1TK5B 1XCCA 4GRFA 4N0ZA 1YF0A 3FKFA 3FZ9A 3P2AA 1O8WA 4E8EA 4YAVA 1SL1B 3ERGA 3LORA 2H01A 4ULXA 3W8JA 2YJ7A 1NHYA 2AUVA 4FYUA 4MJEA 5DJMA 5G1KA 5B8AA 5F06A 4POKA 4GLTA 4JR4A 2YWIA 3KMNA 5F07A 2LNTA 2GLRA 2GGTA 3WT2A 3TGZA 10GSA 2PN8A 4V2LA 17GSA 4HQSA 4ZB9A 2JZTA 3D5JA 1Y25A 1T00A 1FW1A 5ID2B 3BCKA 1A2LA 4GTUA 1NSWA 3IV4A 1Z6MA 4DSQA 5IOWA 4GF0A 3DEXA 1XWCA 2CAIA 2HLSA 1MDKA 3KXOA 3ZTLA 1XOAA 4WEYA 4BPYA 2DJ2A 1GSFA 5EPFA 2KP2A 4WBRD 4I6XA 1B4PA 3RDWA 5GAND 1SL2B 5ELGA 4MPFA 3IE3A 3H93A 4TXOA 5HQPA 2DSAA 4OFTA 3ZYWA 5DCHA 4EO3A 3IK9A 5EY6A 3VPQA 14GSA 1GTIA 2X8GA 3CYNA 2C8UA 3IBHA 2JZRA 5JWQB 4YAPA 4NV2A 1TI3A 5E4WA 3ZMLA 2C1YA 1PQNA 4TXVA 1QMVA 4KAEA 1JLVA 4MH3A 1A2JA 2CX3A 3L9UA 1SKSB 4YQMA 2LTKA 2N5FA 5CRGA 2VLUA 4J57E 3TRPA 3TCOA 4CHSA 3HKRA 1J0FA 1ERWA 4OCFA 4F0CA 4D73A 4G10A 5C04A 2B6MA 1XW9A 6GSWA 2IIYA 1DE2A 2FWHA 4XS1A 3IAS2 4G2EA 3L9SA 4YH2A 5D9WA 4H86A 2KOKA 2RUEA 2RLIA 4BA7A 2TIRA 3WGEA 1OKTA 1T8EB 3DGQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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