3U5RE

Crystal structure of a hypothetical protein smc02350 from sinorhizobium meliloti 1021
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
183
structure length
183
Chain Sequence
KTQSNSITLGTRAADFVLPDAGGNLFTLAEFKDSPALLVAFISNRCPFVVLIREALAKFAGDYAGQGLAVVAINSNDAQAFPEETLERVGAEVKAYGYGFPYLKDASQSVAKAYGAACTPDFFLYDRERRLVYHGQFDDARPGNGKDVTGADLRAAVDAVLKGKDVGTTQVPSIGCNIKWTAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a hypothetical protein SMc02350 from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Sinorhizobium meliloti
molecule keywords uncharacterized protein
total genus 59
structure length 183
sequence length 183
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3u5rE00
3TJFA 1XBSA 2N5FA 2AJQB 1A2MA 3QPMA 1A8YA 3TRQA 4XS4B 1KEBA 5DALA 2YZHA 3A2XA 2OA7A 3RBTA 2N5BA 3ZTLA 2P5QA 3GUSA 2GT6A 4EVMA 1Q98A 2IPAA 5CRWA 2REMA 5DVBA 3EMPA 2AAWA 3HYPA 1Q4JA 5ECIB 3EINA 4AJ6A 1EEMA 2R6KA 3TGZA 3GURA 4Q5NA 3UARA 4IQAA 1GLPA 3QMXA 3RPNA 3WGXA 3UVHA 1AXDA 2R2JA 3FYGA 4NPBA 2FWEA 2DIYA 1JZRA 4YAVA 4GCIA 2IL3A 3WD6A 1ERUA 4MJCA 6GSYA 3LXZA 4IBPA 5F05A 4XHMA 5CP1A 4EE0A 1Y25A 4FIWA 3TOUA 3KIJA 4EDYA 1QGVA 2AB6A 2B1LA 4MPFA 1PRXA 3TUEA 2JU5A 2ZNMA 2DJ3A 1OC3A 2ZCTA 3KTLA 1VF3A 4PX1A 1BEDA 4MPGA 4QQ7A 2PVOC 4K1FA 2LEGA 3GNJA 2M72A 4ML6A 1CQGA 1XPVA 1EGRA 2H01A 4HEA2 2IMFA 4I97A 3N9JA 4JR4A 5F06A 2CVDA 2WRTA 4V1Ap 2L6CA 5CAXA 2C3TA 4MJAA 1TW9A 4OCEA 2IJYA 5CRDA 1ZCPA 17GSA 2E0QA 4K7NA 5IIZA 3MAKA 1GH2A 2HI7A 4YQUA 4F03A 1MD3A 1OVNA 1PKWA 3D4MA 4LLRA 4WKWA 1KTEA 3H79A 3GRXA 3CYNA 3CXGA 3UEMA 1QUWA 2P0GA 1GUMA 1YEXA 2DJJA 3DYRA 3FR3A 1TK8B 2LV3A 4D73A 2YJ7A 1GSSA 1XW5A 1SK2A 1GP1A 1UN2A 2CQ9A 4PUAA 1VGLA 4G19A 2V32A 3EU4A 3IR4A 2IWTA 2RLIA 4J56E 2I3YA 3J7Yb 5HFKA 4HQSA 3IAS2 4V2MA 1H4OA 3FZ5A 2H72A 3O3TA 4L0UA 1FO5A 1X5DA 2H75A 4H86A 4TXVA 1EEJA 3M9JA 4ZBDA 2X8CA 1G7EA 1HYUA 4JZQA 2PMTA 2WCIA 4ZL9A 1R7HA 2B5EA 1UVZA 2FCHA 19GSA 2C3QA 3N5OA 4G10A 4IJ3A 4TR0A 2C4JA 2TRXA 3O76A 4XS1A 1K0DA 1VF1A 2DLXA 4GWRA 5JWRB 5KN3A 4KGIA 1Z6NA 4TR1A 5DAKB 4IHUA 2YV9A 3WGEA 4XS4A 2FGXA 1O8XA 4FO5A 3US3A 3GX0A 1OC8A 3HD5A 5D73A 4K7IA 3TOTA 4FYBA 2FY6A 5ECHB 4WR5A 5FHIA 4NAXA 3ZMLA 1FVKA 2FNOA 2JADA 5D9TA 4OCFA 1K0CA 2RIIA 3TKPA 4ULXA 2B6MA 2K8SA 1TK0B 1SKRB 3DKSA 5IMVA 4AGSA 2GTUA 3CRTA 3VPTA 3MWHA 4EKZA 1TK5B 3TRXA 4HJ2A 2WFCA 2GZYA 3TKRA 4WR4A 3M1GA 4MH2A 3APSA 2MBTA 1SJZA 2C0GA 4RI7A 2OACA 1I5GA 4I2TA 4HI7A 1ZYEA 3DGQA 3F4SA 3TRPA 4FYUA 2V6OA 3RAZA 5H5SA 2A2SA 2GGTA 3IOSA 3UMAA 1GSUA 1HNAA 4TW5A 2K8VA 5J9CA 1VRSD 2I9HA 1V2AA 2C80A 3GH9A 2MMOA 4HS1A 4MDCA 3ZREA 1JZDA 5HR1A 3W8SA 2VUPA 5HR3A 1SL1B 4RI6A 2YPMA 2ALBA 4ZIJA 18GSA 1OE7A 1M99A 3CSHA 2H0GA 2IMIA 3HVXA 5ID2B 3GL5A 1BX9A 1TRSA 4OFTA 2LNTA 3J7Yk 1TI3A 1ABAA 1S3DA 1TU8A 3HXSA 4NHZA 2H71A 1I9DA 4ZILA 3CRUA 4MK3A 1USBA 4E8EA 1OKDA 5G1KA 2M80A 3QAGA 20GSA 3IRAA 3FKFA 5DDLA 4YQMA 4MF5A 1W89A 4TXOB 4F0CA 1SK0A 2GLRA 3L9SA 4LL4B 1GUKA 1KBNA 3HKRA 4KH7A 2C3NA 3MSZA 5JCWA 1SL0B 1CQHA 1TRUA 4N0ZA 4MZCA 4ZB8A 1ZMAA 4OWYA 2N5AA 3FR6A 3KGKA 3GX8A 4O7HA 5KN1A 3K8NA 1V98A 3GKNA 4GSNA 2XBQA 3F3RA 5E4WA 4Z7XA 1ZOFA 5DAKA 3GKKA 5C00A 4PXOA 4WF4A 1MTCA 3ZZXA 1V9WA 4ML1A 3EE2A 4I2UA 4K6XA 3JCML 3M9KA 3LSZA 4BL7A 4EF0A 2PU9C 2LRCA 4MZWA 5GSTA 3KXOA 3L9VA 4HQZA 2YP6A 4OFMA 3I9V2 3CTGA 5AN1A 5D8IA 2NTOA 2B7KA 4PNFA 3UJ1A 1ST9A 1HD2A 4MLYA 3IA1A 3MDKA 3UAPA 2XHFA 3G9BA 2VD0A 3IPZA 1LJRA 4DSRA 1M2DA 3TCOA 3G7IA 3KM6A 4TRXA 3DVXA 3HVSA 4NHWA 4MJBA 3IDVA 2PBJA 1TTZA 5EVOA 2HSHA 3KP8A 2GQLA 4N30A 2YJHA 1GNWA 1T7PB 4ECIA 2DMLA 3HZ8A 2D2ZA 2YWMA 3HCZA 4XIHA 4K2DA 4JR6A 2XC2A 3A2WA 2CVBA 5IMFA 1XVWA 2V41A 1WMJA 3R2QA 5ECSA 5GZZB 1M2BA 1DSBA 4IN0A 2DJ1A 1YZXA 4FH8A 1A0FA 1TJDA 5AISA 1F2EA 4RUVA 3D22A 4BVYA 2CZ3A 14GSA 2H66A 1U3AA 3UL3A 2C0FA 2JSYA 5LCZA 5ID2A 4PURA 1T4ZA 3HJOA 3HDCA 3GSSA 1O6JA 1IYIA 1RQMA 1G6YA 3HJMA 4MA9A 1GSQA 3WGDA 3E9JB 3GH6A 4DVCA 3E0UA 1PKZA 4TOPA 3QDNA 2H1DA 4KNDA 2IFQB 4GSTA 2HRFA 3TKSC 4POBA 1M9AA 3QOUA 4TR4A 1TKDB 3TB2A 3VWUA 1K0MA 2GDRA 4TXOA 4TKYA 1V58A 2H30A 1M7TA 2JZTA 4HU7A 1IYHA 1YY7A 2GQKA 3RPPA 4WETA 2WGRA 3RHCA 3GTUB 3TJJA 1K0NA 5IMDA 2EIQA 2H0HA 4V2LA 1JFUA 3VWWA 3F6FA 1R5PA 2FA8A 1T1VA 3OR5A 5CRGA 3VLNA 2L5LA 4HZ2A 3VI5A 2FWGA 2X8HA 5H5QA 3ZIVA 1SYXA 1ERTA 3IXRA 4BWSA 1THXA 2HFDA 4KCAA 4F82A 2R5GA 4KDYA 2KLXA 4MMMA 4KX4A 1BG5A 3CMIA 4ECCA 2L59A 1X9WB 3F3QA 4ECJA 2H6XA 4MJEA 2O87A 5L71A 1JLWA 3DIEA 1Z3EA 3FRCA 5ENUA 5DCHA 2J9HA 3SBCA 1K0OA 3ED3A 3BCIA 3ZFLA 4CHSA 4EUYA 1X5EA 3D21A 2VM2A 5AIXA 2DIZA 2YWOA 2E7PA 3APQA 3LXTA 3U5RE 1ILOA 2JZRA 1TDIA 3RDWA 1BQ7A 1EGOA 2HRNA 3BBYA 4PGTA 1UA5A 3EYTA 4L5LA 5B6NA 1XXUA 4BPYA 3Q19A 2CT6A 6GSUA 3LYPA 22GSA 1SENA 2VCZA 2VCVA 3I6AA 4NV5A 2RUEA 2TIRA 2LQOA 4AJ7A 2PERA 1GSFA 3Q74A 1GL8A 4V2NA 3ERGA 4WXTA 4BVXA 1Z7PA 4QL9A 2GSQA 4LMVA 5IM9A 1EV4A 2PPTA 1EP7A 1SU9A 2DJ2A 5F07A 2LJRA 2QGVA 4O92A 5GAPD 4LMWA 3EVIA 2BTOT 4DSSB 2PGTA 2H8LA 1TI1A 5A5KA 2CA8A 4GQCA 2JL4A 3TJKA 1HQOA 2H1AA 2QKEA 4MP4A 5KEJA 1V57A 4JE1A 1GSYA 3VURA 3UBKA 1M9BA 3C8EA 3LFLA 3A2VA 1B8XA 2YANA 5J41A 2CAQA 3TJBA 1A2LA 1UC7A 3IK9A 4X1UA 3RHBA 2F51A 2L57A 2O85A 4YAPA 2IFQA 1EZKA 3KTBA 1Z7RA 4LA1A 5ECOB 3S9FA 4KSMA 2E2MA 2XPDA 2HNLA 4OMVA 4BA7A 2DBCA 3QCPA 1QXHA 1FVJA 4IKHA 3ERWA 1BAYA 3VWVA 1XWBA 4J2FA 3IK7A 5G30A 2CX3A 5G1LA 5ABRA 1BJXA 1OC9B 2YV7A 1GSDA 3GTUA 2VO4A 4DEJA 1SL2B 4G2EA 4EO3A 1URMA 4KE3A 5E59A 3LORA 4QL7A 1EOGA 1DBYA 3W8JA 1NM3A 2GVPA 2L4CA 5ECMB 1A2JA 5JCUA 1R5AA 2LJAA 3GFKA 1T8EB 2EIRA 2KHPA 1TRVA 4I6XA 3UBLA 5IOXA 3VI7A 4LL1B 2WDUA 1DUGA 3CSJA 2PUKC 1AW9A 4PQHA 2X99A 3U6VA 1FOVA 2R37A 2CV4A 5D96A 1OYJA 1A24A 1AQVA 4PQ1A 1G0TA 2JSZA 2LS5A 5IQYA 3IE3A 5ECKB 2LRNA 6GSVA 2NBSA 2Z9SA 4XRDA 4WEYA 4IP1A 2DMMA 2X8GA 3LGCA 5IMCA 2L5OA 1Z6MA 1GTBA 2PN8A 4L5OA 2GSTA 1QMVA 4L0WA 4XTSA 2MMNA 3D6IA 1KNGA 4PNGA 2LTKA 1FAAA 3H8QA 3DVWA 3AY8A 4KA0A 1U88A 4YH2A 2PWJA 1G6WA 2F9SA 3UOMA 3O6TA 4NXIA 2B7JA 3ZLPA 5CYYA 4K0GA 2L4QA 6GSSA 4ZBBA 3VWXA 3TDGA 3Q18A 5DALB 2I4AA 7GSSA 3P90A 4V1Ag 2GS3A 2XBIA 4GSSA 1B9YC 1FB0A 3GHAA 3G7JA 5ELGA 4ZL8A 3WT2A 3D0ZA 2FUG2 2CX4A 4AJ8A 4MF6A 1PX6A 4KUNA 3DMLA 5GSSA 1XW9A 4OO5A 2KP2A 5DQSA 4ISDA 2JZSA 2C8UA 2F3MA 3TKSA 2H0IA 3E3EA 4HU9A 4EC0A 4F9ZA 2HXKA 2F8FA 2ES7A 16GSA 1AQWA 2OKAA 2H76A 3A3TA 3PR8A 3KZQA 5G5EA 4EDZA 4E8HA 3EC3A 3M8NA 1XVQA 1OC9A 3L4NA 2IIYA 2C0EA 2O7KA 2GZPA 1JLVA 2QC7A 1TP9A 1PX7A 2VLUA 3LEFA 1GSEA 5DCGA 6GSTA 1PSQA 2LNSA 4N10A 4ACSA 1W4VA 1R4WA 4RQXA 1AAZA 4K0NA 1S3CA 1WJKA 1EWXA 2FD3A 2G0FA 1YKAA 2IMKA 3DD3A 2LKUA 3V1WA 1SK1A 3QAVA 1K3LA 4KDXA 4POLA 3QFBC 3KH9A 2H19A 3Q6OA 3CBUA 1ERWA 3DWVA 5F0GA 3GSTA 2HLSA 3EWLA 3KJYA 1Y6EA 2WB9A 1MDKA 1B9XC 2YN1A 3P8WA 2GSRA 3PINA 13GSA 5G31A 2AYTA 4CDOA 4ILFA 1NHYA 5F8BA 1WOUA 3ERFA 1O73A 3LYKA 2YOIA 1RK4A 3VK9A 4CW9A 3CTFA 4XS6A 2O8VB 3SWLA 4TR3A 3KEBA 3GKXA 3LJRA 3GV1A 4X43A 2FA4A 2I1UA 2M46A 4KB3A 5AIVA 2B5YA 2HZEB 1GRXA 3QAWA 2B5XA 2AUVA 1V40A 1SD9A 1SKWB 1C72A 1XFLA 1SYRA 3H93A 1PMTA 3I69A 4EL1A 3F9UA 3IC4A 3LWAA 1N2AA 2VAFA 2H1GA 2FHEA 2H73A 5A4WA 1LBKA 4JU5A 1YDKA 3BCKA 2NVLA 1K0BA 2WZ9A 1A8LA 4TR1B 3GN3A 1ZGNA 3MNGA 12GSA 5A4UA 5LNKe 2DJ0A 1F3AA 2OE0A 1Z9HA 1J0FA 4POMA 3F4RA 3W6GA 3ME8A 2YCDA 2VD1A 2C0DA 3EMXA 1GULA 1WP0A 1DE1A 2CAIA 4F0BA 2I81A 1WPIA 1AQXA 1X5CA 2EIOA 1X9SB 4HOJA 4KSOA 4IP6A 4ZB6A 4GQFA 1F9MA 1Z5YE 3FZAA 3DEXA 4N11A 4O5RA 4POKA 2R4VA 1NW2A 1R26A 2V6KA 1FB6A 3GA4A 5COHA 1U6TA 2YNXA 8GSSA 4L8EA 4OFNA 1TU7A 5D9XA 1SD8A 3P7XA 4ID0A 2LUSA 5C04A 3FY7A 2QSIA 1GTUA 2O89A 3VFIA 3DRNA 2OE3A 4IS0A 5DJMA 2LSTA 1T4YA 4F2IA 3P2AA 3C7MA 2R3XA 1JHBA 2VIMA 2LJKA 2HE3A 4EXJA 1O85A 1XCCA 3HVVA 1M2AA 4IELA 5EL8A 2VL3A 1ML6A 2ON7A 2LQQA 3C71A 3F6DA 1F3BA 5B8AA 2MZCA 1GTAA 1YF0A 1WWJA 4AF2A 4I5QA 3KMOA 1THOA 5J5NA 2GSSA 5H5RA 3PGTA 1U87A 5IMAA 3TKSE 3FR9A 5D9WA 3QR6A 3HHVA 3UVTA 2B3SA 1NHOA 6GSXA 4HJMA 1XOBA 1AUCA 1PQNA 3IHQA 2GZZA 1OE8A 3L78A 4O32A 4KAEA 5HR0A 2MBSA 4WF5A 1SKSB 1GWCA 3TKQA 1GLQA 2V2GA 1PGTA 1X9MB 2VM1A 4MZBA 5G5FA 1XWGA 5KN0A 4ZB9A 2CVKA 2HZEA 1WE0A 3GL3A 2VLTA 2A2RA 2WJUA 4MABA 4RQRA 2JACA 4K7OA 4N0VA 1JZWA 2FLSA 3GMFA 2YWIA 4P3YB 1T00A 5ECRB 1ZL9A 3F0IA 3M3MA 2OBKA 2MMZA 1YQ1A 4ECBA 3GKMA 5INYA 3G7YA 1K3YA 1A23A 9GSSA 1JZOA 2HT9A 2VL2A 3KCMA 2AHEA 4JEDA 3H4KA 4GRFA 1MDIA 5J9BA 2IMDA 3C73A 1XWCA 2VCQA 1NSWA 1RW1A 2LRTA 5KN2A 1EP8A 2L6DA 3NOFA 1GTIA 5FWGA 3ZYWA 5HFGA 4MCUA 3ZIJA 5ECNB 2NPBA 4JRRA 1E6BA 3H1NA 3FW2A 1S3AA 1PD21 5CREA 4KDUA 2EC4A 5IOWA 2H6YA 3HY2A 5JCGA 5IO0A 2K6VA 3TJGA 4MH3A 2VOCA 4MF7A 3KMNA 1ACVA 1U3IA 2K18A 2VCTA 4K8MA 5CO3A 2PVQA 5ECPB 1DE2A 3IBHA 4PQIA 3FZ4A 1OAZA 3C1SA 1SJ6A 3M0FA 3LQ7A 5JWOB 2F8AA 3ZVJA 2KP1A 1ZYQB 1YKCA 5CRHA 3VPQA 1PN9A 3D5JA 4OD7A 4IW9A 3F8UA 3HA9A 1EOHA 1J08A 4JBBA 4ZL7A 4G9HA 1YEPA 3QD9A 1MD4A 1LU4A 5D9VA 3L9UA 4WBRD 3ISOA 1T3BA 4WBJA 4IGJA 1XZOA 5DQYA 2BJXA 4IVFA 4Q5FA 4YQVA 1HNCA 5HQPA 1EV9A 5DJLA 3IV4A 2KUCA 1ON4A 2J23A 3I43A 1O8WA 1O81A 4NMUA 3C1RA 3ZITA 4X0XA 1B4PA 4Q5RA 5HR2A 1XWKA 1K3OA 2HYXA 4GTUA 5GAND 2E2GA 1N8JA 4KCEA 1F37A 3ZRDA 3CSIA 1AC1A 11GSA 2VL2C 2ON5A 2GT5A 1VF4A 5EPFA 2VL9A 4DSSA 4HUAA 1MEKA 2FWFA 1X0RA 4XRAA 3ME7A 2CZ2A 5DBQA 2HSYA 2H6ZA 1FW1A 1K0AA 3D4TA 4ZBAA 1A0RP 2V1MA 1YF1A 4BWQA 5G2ZA 2IN3A 5LD0A 4DSQA 2B1KA 3GIXA 3ZMKA 5EY6A 3IAM2 3F4TA 4K9ZA 5ECQB 5B7CA 2RUFA 4HDEA 1B48A 2K9FA 2VLVA 1AIUA 1MDJA 4Q5QA 2H70A 1XOAA 5A4VA 2MYGA 4GF0A 3NIVA 5D93A 3EU3A 4NV2A 2AV4A 1TRWA 1ZZYA 1TOFA 3UIWA 3PH9A 2GQMA 3KH7A 5ECLB 1VF2A 5IPGA 2YZUA 5B8BA 4IQ1A 2YWNA 1GNEA 2DSAA 2X64A 4PUFC 1ERVA 3FHKA 2MMAA 2H74A 4IJIA 4GLTA 3EURA 5ELAA 1F6MC 2RM6A 1J9BA 4J57E 2XPEA 2OE1A 1H75A 2C1YA 3QFAC 2FWHA 1FHEA 1QQ2A 3GYKA 3L0HA 2KOKA 3ZL5A 5IPHA 2HZFA 1G7OA 3BOAA 3FEUA 4FYCA 2ZUPA 1E2YA 2IMEA 1B4QA 1PA3A 4ZXGA 1PL1A 3BD2A 5CNWA 2WS2A 3ZFBA 4XCSA 1WRYA 3NZNA 10GSA 2OJLA 4OO4A 5FT3A 3HJPA 4D73B 1BYEA 5J3RA 1GUHA 1XWAA 1QK8A 1TXXA 3F63A 1PL2A 2BMXA 4HZ4A 4NWYA 3WYWA 3A5WA 2DJKA 3WT1A 5J4UA 1O7UA 3KP9A 3LG6A 3FZ9A 5IO2A 2P31A 5IMZA 2NDOA 3APOA 3BJ5A 5B6MA 2TRCP 2WULA 2G2QA 4TVEA 2OBIA 5HFIA 3HZ4A 2H1BA 1SJIA 2OADA 2VCWA 5JWQB 2DC5A 1OKTA 3KD0A 2A4VA 1QFNA 3FK8A 1YJ6A 4I8BA 1XIYA 1HNBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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