3UIWA

Zebrafish grx2 (apo)
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
PGLSSSACGQFVQDIVSSNCVVIFSKTTCPYCKMAKGVFNEIGATYKVVELDEHNDGRRLQETLAELTGARTVPRVFINGQCIGGGSDTKQLHQQGKLLPLIEQCRPCCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A New Mode of Iron-sulfur Cluster Coordination in Glutaredoxins is Crucial for Axonogenesis
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Danio rerio
molecule keywords Glutaredoxin 2
total genus 31
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uiwA00
1XOAA 4ZL8A 4MF7A 3G7JA 1GP1A 3RPNA 2CX3A 2HLSA 1EEJA 2DC5A 4IW9A 2P0GA 2FWFA 1ABAA 6GSWA 2ZNMA 5HQPA 2WFCA 4N0VA 3A3TA 1R5AA 2FA4A 1USBA 2DJKA 3ZMLA 2E2GA 4G9HA 3GSTA 4Q5NA 2C0EA 3WT1A 1XWGA 3GN3A 1O6JA 2VL3A 3VI5A 2H6YA 2GSTA 4MH3A 1SU9A 1BG5A 5JWOB 2HNLA 1JZOA 1YKAA 5G1LA 2FD3A 2IMIA 2R6KA 3ME7A 3QAVA 2RM6A 3GTUB 2AJQB 1PRXA 5H5RA 4RUVA 1W89A 2E7PA 3UIWA 3VWWA 4XS4A 3EURA 1B9XC 1WOUA 2DJ3A 3HCZA 1R4WA 4PXOA 2TRXA 5ECHB 2B7JA 2LUSA 4F03A 3DVWA 2I4AA 3ZRDA 4KGIA 3SBCA 1K0BA 3IAM2 1WPIA 5IOXA 1Y6EA 3GYKA 4TKYA 3E3EA 4HS1A 4K7IA 2GGTA 5B8BA 1A0RP 1GSYA 3GH9A 1SK1A 4JBBA 5AN1A 3KH9A 3SWLA 4I2TA 1YKCA 1E2YA 2L57A 4V1Ag 1B48A 1BAYA 2YV9A 4XS6A 5DALA 5ECMB 1I9DA 1GH2A 3TKSC 4KSOA 3UEMA 2C3TA 1GSEA 3US3A 3FW2A 1HNCA 5ECQB 2ES7A 4ZILA 4ZL7A 4HZ4A 5CP1A 1V9WA 3M1GA 2E2MA 3TOUA 3GH6A 1OKDA 3EYTA 4K7OA 1Q4JA 2FWEA 3VWVA 1K0DA 4HU9A 1AIUA 4OO4A 3F3QA 2AB6A 4TXOA 2VUPA 2B7KA 4MF6A 2JZRA 1XOBA 4BWQA 1T1VA 3EU4A 1SD8A 1ZMAA 2JACA 3FZ4A 3TJBA 4KH7A 1X5EA 2DJ0A 1JZDA 5DAKB 5B6MA 1RW1A 1VF4A 2KLXA 3VPQA 2WDUA 4N11A 5IM9A 5DCGA 1K3YA 4FYUA 3F8UA 1X5CA 1XWAA 2O87A 2QSIA 4MF5A 5F07A 4D73B 1B4QA 1AQWA 1OE7A 2TRCP 3KP9A 3ZTLA 2KHPA 2OBIA 5DVBA 2VM1A 3UVHA 2IL3A 5FHIA 4O7HA 3KTBA 4CHSA 2L4QA 4LMWA 3CTGA 2REMA 1VF3A 3ZREA 2QKEA 3MDKA 3C1SA 2OBKA 3GA4A 3UBKA 5G30A 1F3AA 5HR1A 3LXZA 1QMVA 1BYEA 3FZAA 1Q98A 2NPBA 4MJCA 3H4KA 1PGTA 2OE3A 3G7YA 2M46A 2GQMA 4HJMA 5J9CA 5A4VA 4OMVA 2FY6A 1TI1A 1HNBA 1GSQA 3APSA 2LEGA 3WT2A 4OFMA 3L9SA 3U5RE 1CQGA 1GTUA 2PERA 3AY8A 1XXUA 1ZZYA 2G2QA 3IPZA 4XHMA 5JWQB 4MPFA 3KTLA 3LEFA 4IP6A 1B9YC 3OR5A 4TR3A 1Z6NA 2VCXA 1YY7A 5DDLA 4OFNA 2WGRA 4HQZA 2J23A 4WKWA 5ID2B 1YQ1A 4KSMA 2HRFA 2GDRA 1F6MC 5CYYA 2ZCTA 4NHZA 4Z7XA 3ZZXA 5J3RA 2MYGA 5COHA 4YQVA 2IMKA 1GL8A 1HD2A 4GF0A 1JZRA 1EP7A 4N10A 5JCWA 3DWVA 1K0NA 1K0MA 2B5YA 3WD6A 1TJDA 4L5OA 2OE0A 1AQVA 2CV4A 2NBSA 4I97A 6GSUA 1FOVA 1TW9A 2AV4A 4F0BA 3KMNA 5JWRB 1TXXA 5L71A 3GRXA 3QD9A 3GIXA 1WRYA 3DYRA 2YWIA 3C71A 4KDUA 1SKRB 4KB3A 1MDJA 3GSSA 1A8LA 1UC7A 4MDCA 2L6DA 2NVLA 1B4PA 4ZBDA 2WS2A 4IVFA 1ERUA 4KW6A 4HI7A 1EOGA 4PGTA 4TR1B 3O3TA 9GSSA 3E9JB 3RAZA 1O8WA 2A2RA 5B7CA 2RLIA 2R4VA 3KZQA 4HOJA 2O8VB 4EDYA 2CZ2A 4X0XA 3CYNA 4OO5A 3HJOA 1TDIA 3IK7A 2HZEB 2R37A 2YV7A 5KN1A 1N8JA 3KXOA 1XIYA 3ZMKA 1M2DA 3VWXA 3QR6A 5J41A 4J57E 1GTAA 1TOFA 2K6VA 3Q74A 3W8JA 4PURA 3UVTA 2DBCA 2AAWA 3QDNA 4WF5A 4G2EA 2HSHA 3K8NA 3H1NA 3DKSA 3DVXA 3ZFBA 4BVXA 1YJ6A 2CVBA 1TP9A 2DSAA 1U87A 2RUFA 4EL1A 2YZUA 1YEPA 4ZL9A 1THOA 3GV1A 2YN1A 3IDVA 3TJJA 5H5SA 3IRAA 1SL2B 4LL4B 2VAFA 1TRWA 19GSA 1AAZA 1Z6MA 3HJPA 2H1GA 1TK8B 4GQCA 2F9SA 2OACA 2N5FA 3PGTA 1R26A 3J7Yb 5IMFA 1A23A 3TKPA 1ZOFA 5CO3A 4ECIA 5G31A 1M9AA 2PUKC 4GTUA 4WR4A 2CT6A 4POBA 2KUCA 3LORA 2X99A 4ID0A 2FWHA 3ZLPA 4QQ7A 3ERGA 2CAIA 1XVQA 1XWCA 3IV4A 1KBNA 1M9BA 3UAPA 2B1LA 5CREA 5CRDA 5B6NA 3UBLA 2E0QA 1G7OA 2VO4A 4YQUA 3GKKA 4CDOA 3A2VA 2LRTA 1OVNA 2FHEA 5IO0A 2C0DA 1TKDB 3UARA 1AQXA 2V41A 5ENUA 2VM2A 1TRSA 4WBRD 4KNDA 3LYPA 4KCAA 4AJ8A 1YZXA 3L9UA 3HDCA 5LCZA 3DRNA 2GTUA 2PVQA 4GLTA 1A0FA 1F37A 3G7IA 4JRRA 2LQOA 4IS0A 3ZIVA 3C7MA 3VLNA 3IAS2 2JL4A 2I1UA 13GSA 1ZCPA 2PWJA 4FH8A 3KH7A 4K7NA 4JR6A 4ZB6A 4MH2A 2IFQB 3DMLA 4FIWA 4PQ1A 2O7KA 3BCKA 1AXDA 2ALBA 1GSSA 5IO2A 2C3NA 1Z7RA 2P5RA 1FB0A 1N2AA 1NHYA 3GMFA 4ML6A 3J7Yk 1AC1A 2GT6A 4YQMA 3UL3A 1GSUA 4TN8A 3HZ4A 2FCHA 1UA5A 4XS1A 3A2XA 4KUNA 3HYPA 4AJ6A 3GKMA 4OCFA 5ECOB 2DJJA 3QOUA 3IC4A 1PD21 1ZYEA 3DGQA 4V2MA 3KJYA 4EE0A 3QCPA 4MCUA 18GSA 4DSQA 5IMZA 3L0HA 2C0GA 2H76A 1X9SB 3D21A 3HJMA 3I9V2 4NV2A 4K2DA 2LS5A 2GSRA 3KCMA 3FZ9A 2C1YA 3GNJA 4GCIA 1DE2A 5DJMA 4POLA 3I43A 1KEBA 4PX1A 3TJKA 3HKRA 2MBTA 3G9BA 3LJRA 5IMDA 1IYHA 1EGOA 2LQQA 3TOTA 1KTEA 5EPFA 2GQKA 22GSA 5GAND 1QFNA 5AGYA 4F2IA 1FHEA 1XWKA 5GZZB 2VL2A 6GSYA 1GLQA 3RDWA 2JSZA 3ZVJA 1I5GA 1FB6A 3GX0A 1URMA 5G5EA 1SKSB 1NM3A 4MMMA 2A2SA 4PNFA 4EKZA 3LYKA 4F82A 1U3IA 4KA0A 4O5RA 5EL8A 1SD9A 3ZIJA 3HZ8A 4LMVA 4O92A 4EO3A 2B1KA 5IPGA 4IJ3A 4PUFC 4JR4A 2AHEA 2LJRA 1V40A 5D93A 4OWYA 4XS4B 2F3MA 3V1WA 4AF2A 4G19A 5G5FA 3WGEA 6GSSA 5DBQA 1OYJA 1C72A 4TR4A 1KNGA 4TRXA 5FWGA 4GQFA 5CRHA 1TK0B 2XPDA 4EC0A 3FZ5A 1QUWA 4L5LA 4MK3A 2C4JA 1R7HA 3U6VA 1DE1A 2LV3A 2B5XA 4ILFA 1FO5A 1THXA 5D96A 1MD4A 7GSSA 4MZCA 5F0GA 1T00A 3FK8A 2HZFA 1HQOA 2WB9A 1ILOA 4FO5A 3ERWA 5D9XA 4L0UA 2H0HA 5DALB 1GUMA 3LFLA 3TRXA 3QMXA 2HI7A 5ECIB 3GKXA 2GVPA 3FY7A 1XWBA 4F9ZA 3W6GA 1OC9A 4FYBA 4PUAA 5G2ZA 4L8EA 2NDOA 4MJEA 1SYRA 4IGJA 2H70A 1HYUA 1NHOA 4J56E 4I6XA 2GZZA 1GWCA 2V6KA 2O89A 1J08A 5GSTA 2V6OA 4MABA 2WRTA 2X8CA 3VFIA 1WJKA 5J5NA 3VURA 5HFIA 5GAPD 3BBYA 2VL2C 4IBPA 1XVWA 4WBJA 4TXOB 2YWMA 4K6XA 1XW6A 2MMZA 3M3MA 1BJXA 1JLWA 4V2LA 2XPEA 4BA7A 2EIQA 4MA9A 2M72A 3HHVA 5KN3A 1O8XA 3ZITA 4WF4A 2EC4A 4I2UA 1IYIA 2GZYA 4GSSA 4XCSA 4IQ1A 3GFKA 4HUAA 2FWGA 5E59A 4WEYA 2BTOT 2H71A 1M99A 2C0FA 2ON7A 4QL7A 4NXIA 4K0GA 2GZPA 2JSYA 3I6AA 3MNGA 4IHUA 3N9JA 3NOFA 3P8WA 2BMXA 1MD3A 4PQHA 1OC3A 3F63A 2H6ZA 2CX4A 3KMOA 4TR0A 5CRGA 5D73A 1ML6A 2HT9A 3A2WA 3D4TA 3FHKA 4KDYA 1ERWA 4Q5RA 1SL0B 1T3BA 1EGRA 4HJ2A 1T4YA 4X1UA 2FA8A 2LRCA 3TKSE 1TRUA 1DUGA 3BD2A 3IK9A 3CRUA 3TCOA 3EC3A 5ECPB 1SL1B 2LNTA 2FLSA 3F6FA 2PU9C 2PN8A 2YJHA 4JU5A 2YWOA 2L5OA 1TRVA 3WGXA 2OADA 4GWRA 2JZSA 2V32A 6GSTA 10GSA 2IMDA 3TKQA 3EMXA 2K8VA 2RUEA 5AIXA 4POMA 2YNXA 2Z9SA 4ECJA 1G0TA 2OA7A 3GKNA 1ST9A 3F4SA 2IMEA 4MP4A 5ECRB 4EVMA 2YCDA 1GNEA 3APQA 2F8AA 5H5QA 5INYA 2HRNA 4LA1A 2HFDA 3H8QA 5ECNB 2YANA 3EVIA 2DIYA 3CMIA 3ZL5A 3F9UA 1EWXA 2YPMA 1XW5A 3MAKA 2YWNA 3PINA 1QGVA 4YH2A 4RQRA 3PR8A 2QGVA 2KP2A 1OKTA 2AUVA 2XHFA 3LWAA 1O7UA 4OD7A 1VGLA 3F3RA 5C00A 3ERFA 4GXZA 4ZBAA 3GHAA 3ZFLA 5IOWA 4POKA 2LKUA 1GSFA 5EY6A 3A5WA 2P31A 5HR3A 3CSHA 1EZKA 1PN9A 2LNSA 3Q6OA 3TGZA 1OAZA 1V2AA 4WETA 1T8EB 3Q19A 5GSSA 1GULA 2BJXA 4HEA2 5CRWA 2B3SA 3H93A 4MZWA 1U6TA 5IPHA 1ZYQB 4DSSA 1LBKA 1V58A 3LXTA 4Q5QA 3RPPA 4HU7A 4GSNA 4YAVA 4P3YB 4XRAA 1G7EA 1MTCA 4JE1A 1GTIA 1PX6A 3NZNA 1AW9A 4E8HA 5JCGA 1SKWB 4ML1A 1A2JA 1CQHA 2VLTA 4ULXA 1QXHA 4BL7A 2VIMA 3M9JA 2QC7A 4K0NA 1K0CA 2H1DA 2V1MA 4AJ7A 4L0WA 2P5QA 2VLUA 3DIEA 5E4WA 4MZBA 2F51A 3VWUA 1JZWA 3VI7A 2H75A 1Z5YE 3N5OA 4DEJA 1OE8A 2LJKA 1VF1A 2EIOA 3TRPA 1F2EA 3Q18A 1PA3A 3C73A 1HNAA 3MWHA 3GL5A 3QFAC 1G6WA 3D0ZA 17GSA 3QFBC 3DEXA 3KIJA 3GTUA 4ZBBA 4LLRA 1FAAA 2PMTA 2JU5A 1H4OA 3PH9A 1WE0A 1A24A 4ZB8A 2H19A 11GSA 3VK9A 2VCWA 3IHQA 4NPBA 2CQ9A 3F6DA 1TTZA 4FYCA 4RI6A 5ELAA 4WXTA 3ZYWA 2M80A 3ISOA 4IELA 1YEXA 3LQ7A 1MEKA 1DSBA 1F9MA 3TDGA 5ECKB 5KEJA 2YP6A 4EF0A 2XC2A 2DIZA 3KGKA 3O76A 1ON4A 5DJLA 2K9FA 5IIZA 2GQLA 1OC8A 4F0CA 2DJ2A 4BPYA 3C1RA 2AYTA 1SJIA 1YDKA 4RI7A 3P7XA 3GX8A 1WWJA 4GRFA 4KDXA 2IN3A 2WZ9A 2MBSA 2N5AA 2C3QA 1PX7A 2JZTA 6GSXA 3HVXA 3KP8A 5ELGA 3WYWA 4AGSA 2H01A 3LGCA 3FRCA 2C8UA 4EXJA 2FGXA 2OJLA 4KE3A 1FVJA 2H73A 5IMAA 3HXSA 4V1Ap 1EV9A 2H0IA 2H74A 5G1KA 1EP8A 3D6IA 4QL9A 5F06A 2LSTA 4I8BA 4MPGA 4RQXA 1A8YA 3H79A 3QAWA 4GSTA 5JCUA 2X64A 2RIIA 5D9WA 3APOA 2DLXA 5DAKA 3L9VA 1RK4A 2OKAA 2ON5A 1SK2A 2CAQA 2GS3A 4BVYA 3MSZA 3FR9A 2HSYA 4D73A 1MDIA 2VCQA 1DBYA 2VCTA 4IP1A 2LTKA 5A4UA 1XCCA 2LRNA 1X9MB 4XTSA 1VRSD 2R5GA 3VPTA 5C04A 2C80A 3I69A 1GTBA 2H0GA 4OCEA 5HR0A 4N0ZA 2VCZA 6GSVA 5ABRA 5ECSA 2F8FA 2HXKA 1G6YA 1ZGNA 1F3BA 2YOIA 2NTOA 8GSSA 3DD3A 1GUKA 1XW9A 1R5PA 3EU3A 3R2QA 2IMFA 3LG6A 3KD0A 2HYXA 4HDEA 1GLPA 4ECBA 1K0OA 1BX9A 1ZL9A 3IA1A 2JADA 2I81A 1JFUA 1W4VA 2VL9A 1ERTA 1SJZA 5CAXA 4DSRA 4IQAA 2VOCA 3GURA 2PVOC 2K18A 4XRDA 1FVKA 1O85A 5LD0A 1M2AA 2ZUPA 3O6TA 4XIHA 5DQSA 2O85A 1WIKA 4ISDA 1A2LA 2R2JA 4E8EA 1V57A 2X8HA 4NHWA 4TVEA 3QPMA 2KOKA 5ID2A 3L4NA 2KP1A 4JEDA 3CXGA 3NIVA 4V2NA 1BEDA 1YF0A 2DMLA 5J4UA 3RHCA 1GRXA 5KN2A 1FW1A 1Y25A 4J2FA 2CZ3A 1K3OA 1S3AA 4K1FA 3UJ1A 3HY2A 1TU8A 2MZCA 1K0AA 3IOSA 5D9TA 3D4MA 4PQIA 1X0RA 3QAGA 2H1BA 1A2MA 2VD0A 5CNWA 1OC9B 2DMMA 1TK5B 2MMAA 5IMCA 1PMTA 1LU4A 2VD1A 1AUCA 4N30A 4LL1B 3JCML 1PQNA 16GSA 3ME8A 3FYGA 1Z3EA 2WCIA 3TJFA 3F4RA 4IN0A 2OE1A 3IE3A 3M9KA 1JHBA 4TW5A 1XFLA 2XBIA 5F8BA 1SYXA 2CA8A 1PSQA 3HA9A 2L4CA 4IKHA 3TUEA 1TI3A 4PNGA 4TR1A 4NV5A 1E6BA 4ACSA 2GSSA 4YAPA 2D2ZA 5D9VA 4K8MA 1SK0A 3TJGA 1YF1A 3CRTA 3EMPA 4NMUA 2B6MA 3HVVA 4BWSA 1QQ2A 2MMNA 2IWTA 2MMOA 1GNWA 2IJYA 2HZEA 2K8SA 5KN0A 4ZB9A 1PL2A 3FKFA 3FR3A 3F0IA 3C8EA 1GSDA 1XPVA 2IIYA 2CVKA 2HE3A 3M0FA 3D22A 1ERVA 4EDZA 1J0FA 1UN2A 2I3YA 3GL3A 4NWYA 2WJUA 3CSIA 1S3CA 2X8GA 2I9HA 1T7PB 1WP0A 5DCHA 1U88A 1H75A 2B5EA 3ED3A 5AIVA 14GSA 3L78A 4O32A 5J9BA 2RM5A 3P90A 2VLVA 2V2GA 5HFGA 1GUHA 1O73A 3DXBA 1SENA 1XZOA 2H66A 2GLRA 4MLYA 1O81A 4DVCA 1U3AA 1X5DA 1EOHA 4KX4A 5IQYA 4HQSA 1V98A 3F4TA 4ZIJA 2EIRA 1S3DA 4KCEA 3UOMA 3EWLA 1ACVA 3HD5A 3BJ5A 1M2BA 3W8SA 2YJ7A 5EVOA 1M7TA 2WULA 4NAXA 1EV4A 1NW2A 1PL1A 1Z9HA 4TXVA 1Z7PA 2L6CA 4MJAA 4G10A 5HFKA 3D5JA 4H86A 5D8IA 3TB2A 2CVDA 1MDKA 1VF2A 3WGDA 5IMVA 3IR4A 3CSJA 4WR5A 4I5QA 4KAEA 2N5BA 4CW9A 3CTFA 5DQYA 3RBTA 4ECCA 5A5KA 2PBJA 3EINA 3ZVJD 2H30A 2DJ1A 4IJIA 2H1AA 1WMJA 1RQMA 2LJAA 4OFTA 3KEBA 4HZ2A 3CBUA 3FEUA 3BOAA 1LJRA 5FT3A 3UMAA 1UVZA 5AISA 3M8NA 5B8AA 5ECLB 3GUSA 12GSA 1XBSA 4TOPA 2A4VA 3E0UA 2IPAA 5HR2A 3LSZA 1TU7A 2FUG2 3IBHA 2IFQA 1SJ6A 3S9FA 2VCVA 2GSQA 3HVSA 4JZQA 2L5LA 2R3XA 1FG4A 2L59A 3EE2A 1T4ZA 2H6XA 3FR6A 3BCIA 20GSA 1J9BA 3TKRA 1PKZA 4K9ZA 3KM6A 4DSSB 1X9WB 2J9HA 1K3LA 5F05A 1EEMA 4ZXGA 2XBQA 4MJBA 2G0FA 3P2AA 1M0UA 2H72A 2GT5A 4X43A 2FNOA 2YZHA 2TIRA 4EUYA 2PGTA 5LNKe 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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