3UL3A

Structural insights into thioredoxin-2: a component of malaria parasite protein secretion machinery
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
RLQQNGSNIINGVNMKNTVIVLYFFAKWCQACTMQSTEMDKLQKYYGKRIYLLKVDLDKNESLARKFSVKSLPTIILLKNKTMLARKDHFVSSNDLIALIKKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural insights into thioredoxin-2: a component of malaria parasite protein secretion machinery
doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 29
structure length 103
sequence length 103
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ul3A01
2GTUA 2VL2C 5AISA 2PERA 2LQQA 1GSUA 1M2AA 4KH7A 3KM6A 1TJDA 4IHUA 1WOUA 3F0IA 5HR0A 1FB6A 3E3EA 2H74A 5J9CA 3VWUA 1G7OA 2V2GA 4RUVA 2PU9C 2WS2A 5ELGA 2C4JA 4N11A 5ELAA 3RPNA 3LXZA 2AYTA 3HYPA 5IPHA 1J0FA 2FD3A 3H79A 2GGTA 2C0EA 2C0GA 2HZEA 2LRNA 4OD7A 3LFLA 3VI5A 2F8AA 2HSYA 1EP7A 3KCMA 2K6VA 1BQ7A 1YY7A 4NWYA 1K0NA 5A4WA 3R2QA 3ME7A 4HU7A 5C00A 4D73A 4DEJA 2EIOA 3GH9A 2IN3A 2FWHA 2GZYA 2DSAA 2C0FA 3BOAA 2H30A 5IOXA 3ZFBA 2KOKA 1GSQA 3IAS2 3IK7A 2H71A 4GQFA 1EV9A 5KEJA 2IIYA 4JR6A 4TXOA 3ERFA 3ZIVA 3F63A 2LJKA 4K0GA 3DRNA 3C8EA 3FHKA 1CQGA 2IJYA 5IOWA 1SK0A 5IM9A 4O92A 1SL1B 4ML1A 4GLTA 4NMUA 1ZGNA 2IPAA 2QKEA 2QC7A 4MCUA 3FZ4A 1E2YA 2WRTA 4K8MA 4V2NA 5ECHB 2D2ZA 3PGTA 3L9SA 4IJ3A 1I9DA 2VAFA 3Q19A 1HNBA 4FYUA 1U6TA 1OKDA 1K3LA 5D9WA 3TRXA 1Z7PA 3FW2A 3TKSA 3FKFA 1XWKA 2HZFA 3A3TA 2OE1A 1EEMA 3EURA 2XPEA 3VK9A 3TKRA 3HHVA 5HR3A 2E0QA 3KP9A 2YN1A 5EL8A 3IOSA 4JE1A 1VF1A 5C04A 2N5FA 4ID0A 3A2VA 2LJAA 3CXGA 2WULA 2GT6A 3A5WA 1T7PB 1K0AA 5IMDA 4POMA 3HD5A 3OR5A 1PN9A 3TJGA 1S3AA 3GTUA 5IMFA 5DAKA 4N0ZA 4RQRA 5IMVA 1AUCA 1PMTA 1XW5A 5CRWA 4LMWA 4EVMA 4BA7A 3GNJA 1LBKA 1SL2B 5E59A 4JR4A 4G10A 2L4QA 3WD6A 4FH8A 4TW5A 2OA7A 3DVXA 4HQSA 3E9JB 5HFIA 3HVSA 4N0VA 2R5GA 3ZREA 5AGYA 1YKCA 2GSRA 3H4KA 3L9UA 2H01A 3HVXA 2A2SA 1TI1A 7GSSA 5E4WA 3SBCA 4MPGA 1QMVA 3J7Yk 5L71A 3D5JA 5J4UA 2IFQB 5HR1A 2IMDA 2PGTA 2YANA 5D8IA 4I8BA 1V58A 3VWWA 5GAND 5G2ZA 2IMEA 2FA4A 3ZIJA 4HZ4A 2REMA 1NHOA 4HU9A 1TU7A 2HNLA 2I4AA 3CTGA 3IK9A 2H0GA 2JZTA 1SENA 2TRXA 4AGSA 3APSA 5KN0A 2NVLA 1K3OA 2I9HA 1A8LA 6GSSA 1LU4A 2Z9SA 4P3YB 2L59A 2NPBA 3M8NA 5LNKe 3ZYWA 2HRFA 2MMOA 3LYPA 4ECCA 2H19A 2YWNA 4RI6A 1ZMAA 1B4PA 5CRHA 2RUFA 2CX3A 3IAM2 3VPQA 10GSA 4NHZA 2P5RA 4L0WA 3C1SA 5J5NA 2H6ZA 2YCDA 2H6XA 3GUSA 2HXKA 4V2LA 2JL4A 5DQSA 2L5LA 3M9JA 5IMAA 5LCZA 3KMNA 2M46A 5D93A 1N2AA 5JWRB 4OFMA 5IPGA 1OC9B 1A0RP 4DSSA 2XHFA 1O73A 5G5EA 3BD2A 4MJCA 4MJBA 4HI7A 1B4QA 4PUAA 4Q5QA 4ILFA 4KE3A 5GAPD 2B7JA 2R6KA 2O85A 4F0CA 5CREA 5JCGA 4CW9A 2H1DA 1URMA 1ERWA 3APQA 3CSIA 3EMXA 4XS4B 1GSDA 4PGTA 3RAZA 1YF1A 3VPTA 2PVOC 3GL5A 2V32A 4MZCA 4TOPA 1K0MA 1Z3EA 3ZL5A 2RM6A 2X8HA 1XIYA 1TU8A 1JZDA 2HSHA 2R37A 5ID2B 1U87A 1X5EA 5A4UA 6GSYA 3GL3A 2TRCP 4X0XA 1F3AA 2AB6A 1R5PA 2BTOT 2PPTA 4X43A 5AIXA 5F0GA 1IYIA 4ZBAA 4K6XA 2B7KA 4TR1A 2HRNA 2V6KA 4Z7XA 2CZ2A 1EGRA 2HE3A 1PD21 3W8JA 3H8QA 1F6MC 1WPIA 5F06A 3HCZA 3JCML 2JACA 2C8UA 1RQMA 4NPBA 2FLSA 4KDXA 5GSSA 5ECPB 1XOAA 5JCWA 1MDIA 2B6MA 2H72A 4I2UA 3MDKA 4BL7A 4QL7A 3GIXA 2NTOA 1IYHA 2WGRA 1OYJA 3QR6A 3LJRA 1G6YA 1THOA 2V6OA 4PX1A 2MYGA 1GLPA 3F4RA 1PKZA 5DVBA 1B9YC 3M3MA 2B5EA 2LS5A 2PBJA 4K7IA 3UMAA 4MJAA 3IA1A 1ST9A 2EC4A 2B1LA 1ZYEA 2JU5A 3QAGA 3M1GA 4F9ZA 4NXIA 1BX9A 2YWIA 4BWSA 2GSQA 3G7JA 3GV1A 4XIHA 4EKZA 4ZILA 1BYEA 4EC0A 2VCQA 2YOIA 2VCWA 2R4VA 4PXOA 3FZAA 3QFBC 2JSZA 2GZZA 3TDGA 3IV4A 1HD2A 2R2JA 2JADA 1H4OA 2B5XA 2VLVA 4EUYA 1JZWA 2LQOA 4O7HA 1SJZA 4ECBA 4MF6A 4BWQA 2FWGA 1RW1A 1N8JA 4MH3A 4XRDA 3G7YA 3HKRA 4Q5FA 4BPYA 3Q18A 3GFKA 4ZB8A 20GSA 2J9HA 2ON5A 1J9BA 1ACVA 2EIRA 4GWRA 2YWOA 4E8EA 5HR2A 2HLSA 5JWQB 2VL3A 3KP8A 3I9V2 1A2LA 4V1Ap 5D96A 1A0FA 3Q6OA 2AHEA 4LMVA 2C3QA 1Z5YE 3FRCA 1WRYA 4GCIA 1EGOA 1EV4A 4KDUA 4HJ2A 4IQ1A 3HY2A 4BVYA 3GRXA 2YWMA 3GN3A 1BJXA 1OKTA 5CYYA 5IIZA 3QD9A 2ZCTA 3D6IA 4HS1A 4OCFA 3RBTA 3D4TA 3QCPA 4JEDA 1QXHA 3IXRA 1VGLA 2MBSA 3H1NA 4MK3A 5IO2A 4ZBDA 1TRSA 1ZYQB 2L4CA 4MLYA 1VF3A 3LGCA 4MP4A 1EZKA 1ERUA 2M80A 4ML6A 5H5QA 2PVQA 1FG4A 3TUEA 3GKKA 3A2WA 2X8CA 2JZRA 2NDOA 4KW6A 3FYGA 2O89A 4EDZA 4MZWA 3RHCA 4L5LA 5IQYA 4HJMA 1SJ6A 4EF0A 3EVIA 3FZ9A 3UARA 1O85A 4POKA 1Q4JA 3QPMA 1B8XA 4KAEA 4KGIA 1JHBA 2C3TA 2YZHA 4KCAA 1K3YA 5DALB 1O6JA 3Q74A 4WXTA 5G31A 2VL9A 6GSUA 4J56E 9GSSA 1FOVA 3VURA 1U3IA 1W89A 1KTEA 3L9VA 5EVOA 3C7MA 3ERWA 5EY6A 2V1MA 1TTZA 4LLRA 1PRXA 2YV7A 2FNOA 2VL2A 1XWGA 3AY8A 4K7NA 1YF0A 4WEYA 2DMLA 1AW9A 4TVEA 5CRGA 3WT1A 2CA8A 4OO5A 4IN0A 1O8WA 4POLA 1SD8A 2XC2A 4HOJA 1OE7A 2LSTA 3N5OA 4EDYA 3S9FA 2YPMA 4GSSA 1I5GA 4XHMA 1R4WA 4HDEA 3UVHA 2F3MA 2GSSA 2P31A 2A4VA 3F6FA 1TK8B 2OE3A 1QQ2A 3GH6A 4ZL9A 5CP1A 3ZFLA 2IMIA 5EPFA 2DIZA 1TP9A 5G5FA 2N5BA 3LYKA 2O7KA 3GYKA 3GX8A 2XBQA 1GNWA 4WR5A 3EE2A 1Z7RA 1WWJA 1GTUA 1U3AA 19GSA 5COHA 3W8SA 2YNXA 2PN8A 1VF2A 2IMKA 3WYWA 1E6BA 1QK8A 3CBUA 2O87A 4KDYA 5B7CA 5LD0A 2IMFA 2ZUPA 1R5AA 2FGXA 1ERVA 3VWXA 1S3CA 1GRXA 1OAZA 12GSA 3CSJA 4NV2A 3D4MA 3KTLA 4GF0A 3EWLA 4IBPA 5IO0A 1X5DA 14GSA 1AXDA 2E2GA 1KNGA 1SYXA 2B1KA 3V1WA 1GP1A 4EE0A 4I97A 2CZ3A 2WCIA 3O6TA 5DBQA 1XW9A 4WBRD 4OCEA 3VWVA 5KN1A 3UEMA 1EEJA 1G7EA 2J23A 4PNFA 4I5QA 3DEXA 2CVKA 2FWFA 3L78A 4ACSA 3WT2A 3BCIA 3I43A 1DE2A 5HFGA 1M2DA 3TB2A 3FR6A 1JLVA 4IELA 3ZMLA 4Q5NA 2MZCA 5H5SA 5JCUA 5J3RA 2X8GA 3F4SA 1PL1A 4WR4A 5CAXA 2E2MA 4AJ6A 5ECNB 2VD1A 5HQPA 2CVBA 3HA9A 1AQVA 4MPFA 2IFQA 3KZQA 1R7HA 1EOHA 1MTCA 1DBYA 2OBKA 2OE0A 1ERTA 2G0FA 1UA5A 2ON7A 2G2QA 3KGKA 2KP1A 4GRFA 3LXTA 13GSA 3VLNA 1ML6A 3C1RA 3KMOA 4KUNA 3QAVA 2VIMA 5FWGA 2LV3A 2AV4A 2K18A 4YAPA 1MDKA 4ZB9A 5ENUA 4IP6A 2K8VA 1PSQA 1SD9A 6GSVA 1V57A 3C73A 1SK1A 2C0DA 2DJ0A 2CT6A 3GHAA 4YQUA 3K8NA 3D0ZA 3ISOA 3QAWA 4PURA 1Z9HA 4K0NA 1G0TA 1HYUA 1JFUA 2R3XA 2I81A 4GTUA 1QUWA 2CQ9A 4TKYA 3I69A 2DBCA 3EYTA 1M7TA 4MF7A 3US3A 1PL2A 2IWTA 2HYXA 2MBTA 2OADA 4V1Ag 2GS3A 2CAQA 1SJIA 1O81A 4KSOA 4TRXA 4PQHA 2M72A 1JZRA 3UVTA 4XRAA 2DLXA 2H0HA 2VO4A 4EXJA 3J7Yb 1XW6A 22GSA 3IRAA 1OC9A 2AUVA 1X9MB 4KCEA 3F3RA 2VD0A 1B48A 3CSHA 2L6CA 4HZ2A 2VM2A 3TGZA 2VCZA 2B3SA 2KLXA 2B5YA 2YV9A 3W6GA 4IKHA 1V2AA 2HFDA 4DVCA 1YZXA 2E7PA 3C71A 1OC8A 2WDUA 3M0FA 4ZXGA 4BVXA 4XS4A 4EL1A 5ECIB 3HDCA 3F4TA 3TKQA 3UJ1A 2JSYA 1T00A 1K0DA 1YJ6A 3MWHA 2GSTA 4KX4A 1XWCA 5ECKB 1Z6MA 4JZQA 3TJFA 1XCCA 1TDIA 3ME8A 5ID2A 3DIEA 2VLUA 3CRUA 4FYBA 1BEDA 3F8UA 3UIWA 4ULXA 2C1YA 3FZ5A 3DKSA 4ZIJA 2N5AA 1GUHA 3KH9A 3N9JA 3GSTA 1GSFA 2BMXA 1T1VA 3FR9A 1F2EA 2HZEB 1HQOA 4CDOA 1UC7A 2F51A 3KTBA 1V40A 3FK8A 2L5OA 1BG5A 1ZL9A 2ES7A 3TKSE 4N10A 3RDWA 1ZOFA 4OFNA 2RM5A 1T4YA 3H93A 4CHSA 1C72A 3LSZA 1A2JA 3O3TA 4LA1A 2P5QA 4QQ7A 4D73B 4IS0A 1JZOA 1UN2A 3CTFA 3WGEA 1G6WA 1WJKA 3FY7A 2DJKA 1MDJA 1FB0A 3M9KA 2P0GA 2F9SA 3IHQA 1XPVA 1AC1A 1M9AA 4F82A 3TJBA 4ECIA 1XVQA 1PKWA 2H6YA 5D9TA 4N30A 3EMPA 4TXOB 4PNGA 4PQ1A 3KJYA 2LRTA 3SWLA 4L5OA 11GSA 2IL3A 5G30A 3UL3A 2H8LA 4FYCA 3VI7A 3DGQA 4NAXA 2AJQB 1AIUA 1HNCA 3CMIA 3EU4A 1KBNA 4YQMA 5D9VA 1X0RA 3NOFA 4AF2A 1MD4A 2ZNMA 3HZ8A 5B6NA 1GUKA 1YDKA 2C80A 4G2EA 1KEBA 4POBA 3TKPA 1A24A 2CVDA 3QMXA 4OFTA 2H73A 3BBYA 2ALBA 1EP8A 2L57A 4JBBA 4O5RA 2VOCA 4ZB6A 4GXZA 1PX7A 4F2IA 3GMFA 1AQXA 3FR3A 2L6DA 3RHBA 3TJJA 4WETA 3HJMA 3ZZXA 5ECOB 2C3NA 2LUSA 2OBIA 4KSMA 3QDNA 1OVNA 1V98A 5A5KA 1O8XA 4H86A 5HFKA 3IPZA 4MF5A 1EWXA 2CV4A 2F8FA 4ZL7A 3IC4A 5B8BA 18GSA 1O7UA 3LG6A 2X99A 5DJMA 2XPDA 4KNDA 3KH7A 3TOUA 4KA0A 5KN3A 2DJ3A 4I2TA 5CRDA 4RI7A 1A2MA 1OE8A 4K1FA 17GSA 1OC3A 4GSNA 1TKDB 1NSWA 3FEUA 4FIWA 5CO3A 5IMZA 1CQHA 4OWYA 1SL0B 2RIIA 3GTUB 1AQWA 5DAKB 3LEFA 4I6XA 3BJ5A 3GKXA 2BJXA 3PH9A 1XBSA 1GTBA 5DCHA 2VCTA 5ECQB 4IVFA 2CX4A 2GT5A 1QFNA 4XS6A 3E0UA 1K0BA 3NIVA 2H75A 4WF4A 1PX6A 5FT3A 2EIQA 3F3QA 4QL9A 2DMMA 4NHWA 4WF5A 2RUEA 2DIYA 4G19A 2FWEA 1M9BA 1YEXA 2LRCA 6GSWA 1H75A 1Y25A 3I6AA 3WGDA 2WJUA 3DD3A 3GSSA 3IDVA 5ECLB 3GX0A 1PGTA 2H76A 3UBKA 3TJKA 1VF4A 4IW9A 3DWVA 1XWAA 1XZOA 3TRPA 3PINA 5AIVA 1XVWA 5D9XA 3D22A 4HQZA 4LL1B 1WMJA 5CNWA 5DALA 4YAVA 1DSBA 3O76A 4IGJA 3ZITA 4G9HA 3L4NA 1GSYA 1K0OA 2TIRA 3GKNA 1NHYA 3CRTA 1RK4A 1A23A 3IE3A 2OKAA 2A2RA 1HNAA 5GSTA 5D73A 3HVVA 1USBA 4EO3A 3P2AA 4PQIA 2H70A 1M0UA 1PQNA 2WZ9A 3ZMKA 1SKSB 3GA4A 4ECJA 1GUMA 1GWCA 1XOBA 1S3DA 1SKWB 2OACA 4FO5A 1THXA 2PMTA 3F6DA 5J41A 1TRWA 2MMZA 3DXBA 5B8AA 4E8HA 4TN8A 3ERGA 3TCOA 2YP6A 1T4ZA 3UAPA 1GNEA 3DYRA 1V9WA 3TRQA 1FW1A 4IP1A 2JZSA 4MZBA 4K2DA 1SU9A 2GZPA 2AAWA 1NM3A 1YQ1A 1SK2A 4TR0A 4K7OA 2O8VB 4ISDA 4F0BA 2GVPA 1LJRA 4MH2A 2I3YA 1NW2A 3NZNA 5IMCA 1WP0A 1YEPA 2K9FA 4AJ7A 2WFCA 4IQAA 1TRVA 3U5RE 2YJHA 1GH2A 3ED3A 2H0IA 16GSA 3ZVJD 1GLQA 1AAZA 1BAYA 1R26A 3MNGA 4OO4A 1QGVA 4XCSA 3P7XA 1J08A 1F3BA 1ABAA 4MJEA 1K0CA 1MEKA 4DSSB 3ZRDA 2LNTA 1TRUA 4F03A 4ZL8A 3PR8A 5F05A 1T3BA 4L8EA 3KD0A 2I1UA 1T8EB 1TOFA 1DE1A 2V41A 1PA3A 1U88A 4TXVA 4GQCA 1GTIA 8GSSA 3A2XA 2VCXA 4IJIA 2H1BA 1Y6EA 2VM1A 4DSQA 5ECSA 5G1LA 4XTSA 1TK0B 3GURA 2WB9A 2FHEA 2DJ1A 4AJ8A 1FVJA 2NBSA 2LTKA 3U6VA 3EINA 3HZ4A 3UOMA 4DSRA 2LEGA 3HJPA 1XWBA 1ZCPA 5F8BA 2KHPA 4JRRA 5DJLA 4MDCA 3EC3A 2CAIA 1TW9A 1YKAA 2GLRA 4TR1B 5H5RA 1SKRB 2GDRA 3KXOA 1TXXA 2FUG2 3P90A 3MSZA 3TOTA 4NV5A 3RPPA 3QOUA 2OJLA 5A4VA 1GSSA 1FHEA 2MMAA 3ZVJA 4LL4B 1ON4A 3HJOA 4Q5RA 4JU5A 3MAKA 2VUPA 3F9UA 2QGVA 1WIKA 3APOA 3L0HA 2K8SA 4MABA 3P8WA 1ILOA 2KP2A 2LJRA 3IBHA 5ECMB 1GL8A 3KIJA 1JLWA 2VLTA 3DVWA 6GSXA 5ABRA 5B6MA 4ZBBA 4J57E 3GKMA 3DMLA 1EOGA 1TI3A 4RQXA 2HT9A 5GZZB 1F37A 1DUGA 1GSEA 3D21A 4O32A 2QSIA 3ZLPA 2X64A 2VCVA 2RLIA 4TR4A 4J2FA 6GSTA 3G7IA 1XFLA 2LNSA 2XBIA 4KB3A 4OMVA 2FCHA 5DCGA 5DQYA 1XXUA 1B9XC 3LQ7A 4X1UA 4YQVA 1M99A 3ZTLA 3EU3A 1VRSD 4V2MA 2FA8A 5J9BA 5INYA 5F07A 1F9MA 1FO5A 1FAAA 2H1GA 1X9SB 2DJJA 5G1KA 1A8YA 2DJ2A 3VFIA 4TR3A 5JWOB 2H1AA 3WGXA 2PWJA 1FVKA 2YJ7A 4L0UA 3HXSA 2LKUA 3IR4A 1GULA 2PUKC 4WBJA 1GTAA 1MD3A 3LORA 4GSTA 2DC5A 5FHIA 1X5CA 2FY6A 2MMNA 3KEBA 4XS1A 5ECRB 1WE0A 3LWAA 4MMMA 1UVZA 4YH2A 1SYRA 2YZUA 1ZZYA 3G9BA 2GQKA 2GQMA 5AN1A 3TKSC 2H66A 1TK5B 1X9WB 3QFAC 4HEA2 2GQLA 4HUAA 2HI7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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