3V1WA

Molecular basis for multiple ligand binding of calsequestrin and potential inhibition by caffeine and gallocatecin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
EGLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSIYVFKEDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKNKDSEHYKAFKEAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGYEFLEILKSVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Basis for Multiple Ligand Binding of Calsequestrin and Potential Inhibition by Caffeine and Gallocatecin
rcsb
molecule keywords Calsequestrin-1
molecule tags Calcium binding protein
total genus 104
structure length 349
sequence length 349
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3v1wA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3v1wA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3v1wA02
2JSYA 2BMXA 2VUPA 4ZL9A 2I9HA 18GSA 2IMKA 4MDCA 5DALB 1ERUA 3O76A 2HZEA 1T8EB 4EXJA 3FEUA 2L4QA 3Q18A 2X8GA 5JWOB 3GMFA 1AQXA 2WRTA 1EGOA 1TW9A 5H5QA 3EINA 2B5YA 4E8HA 5LCZA 3NZNA 1WWJA 3KJYA 1FW1A 5DVBA 4YQUA 1X0RA 3TKQA 4ZB6A 3GUSA 1MTCA 2L4CA 4KAEA 1YJ6A 5IMAA 3GFKA 4ILFA 3GN3A 1WJKA 1O85A 5CNWA 3M8NA 4TW5A 4F2IA 5CYYA 4KDUA 3NOFA 1PX7A 4KA0A 4Q5RA 1FVKA 3FZ5A 3HHVA 3U5RE 4NPBA 1MDIA 4PUFC 5HFIA 4HDEA 1XW5A 3GSTA 4IS0A 3RAZA 1YZXA 4IVFA 5HR0A 4J2FA 3D21A 2LUSA 4EE0A 1IYHA 3FR6A 4BVYA 4HZ4A 2O89A 5E59A 4J57E 2FNOA 1TTZA 3HKRA 2N5AA 3JCML 1FOVA 1XWKA 3US3A 1R4WA 3C1SA 3TRPA 1ML6A 1FAAA 4AJ7A 2GS3A 3CSHA 1PX6A 2C8UA 2JACA 1XPVA 3Q19A 1YEPA 5INYA 4FYUA 4RUVA 4JEDA 1M0UA 1SJIA 1TRSA 5CRWA 1OE7A 2K6VA 3D0ZA 2MMAA 3LEFA 2E2MA 2V1MA 2VCVA 3QAVA 4ML1A 4I8BA 1MD4A 3TKRA 1ERTA 3VLNA 2P5RA 5CO3A 4NV5A 1XWAA 4OFTA 2FLSA 5ECQB 3N5OA 3UVHA 3VFIA 4RI7A 4LLRA 5EPFA 3TOTA 2LRCA 3GRXA 4QQ7A 3M1GA 2O87A 2PU9C 3ZITA 3GKMA 17GSA 1Z7PA 2JADA 2EIOA 3KP8A 1ZZYA 4IELA 3GKNA 5KN0A 4D73B 1SK1A 5DBQA 2VM2A 1BEDA 1X5EA 3PGTA 2IL3A 3ZLPA 1N8JA 3IAM2 5B8AA 3VWUA 2FD3A 4GSNA 4KNDA 1OE8A 2DC5A 3HYPA 3DYRA 2V32A 1ERVA 1AUCA 2JZSA 3APOA 5ELAA 5EVOA 4ECCA 2KP2A 4OMVA 3P8WA 3HDCA 5ID2B 1TP9A 2GZPA 3F4RA 3W8SA 1WRYA 3WYWA 2XPEA 4TXOB 1GL8A 3VWVA 1XOAA 3QPMA 2OJLA 2KP1A 1TRWA 5ECNB 2H75A 1U87A 2OACA 2I4AA 3GYKA 4EC0A 1WP0A 5DAKB 4EDZA 5DJLA 2R5GA 1EZKA 5HR2A 5JWQB 2QSIA 3LGCA 5G5FA 3TGZA 3UIWA 1M2AA 3HJMA 1ST9A 1SYRA 4MH2A 2M72A 2FY6A 5GSSA 2PUKC 1WPIA 8GSSA 4XRDA 4MF6A 1O8XA 1QUWA 5J9CA 5H5RA 2HXKA 2XBIA 1GLQA 4MK3A 2RLIA 1SYXA 2NDOA 1B9XC 4ZIJA 3IK9A 4IJIA 3QCPA 3GTUB 1PN9A 1USBA 3IV4A 4ZBBA 4V1Ag 4HJ2A 4D73A 2EC4A 5G30A 2PN8A 2IMEA 4HU9A 4ID0A 1TI3A 1B48A 5ECKB 1V2AA 2LS5A 2IN3A 4IBPA 5C00A 5HFKA 4H86A 4WR4A 2VAFA 1F2EA 1EV9A 1BYEA 4O5RA 5EY6A 3IXRA 2VCWA 1V98A 2XHFA 3KTLA 1SD9A 1OC3A 2KOKA 2CZ3A 2YJ7A 2X99A 2JU5A 1JZRA 3KTBA 1TK5B 2O7KA 4TXOA 1KNGA 1W89A 2HRFA 1NM3A 2GT5A 4K7IA 3BBYA 4GQFA 1JZDA 3HJOA 5D73A 5DAKA 2DIZA 1KBNA 5ECOB 2F8AA 4MA9A 2AJQB 2TRXA 2YP6A 1GLPA 2WZ9A 1T4ZA 5ENUA 3QAWA 5KEJA 3FR3A 1LBKA 5KN2A 4WF5A 3G7YA 6GSUA 3VWWA 5F8BA 4L0WA 1U3IA 4BL7A 4NXIA 2VCTA 2FA4A 2YV7A 1GRXA 4JZQA 4K8MA 3ME7A 2GSSA 1JZOA 3I6AA 3TUEA 1FB6A 2H1DA 2VO4A 1BQ7A 1XWGA 4JBBA 3BD2A 5B8BA 2WFCA 3CMIA 2Z9SA 4MZWA 4LMWA 4HEA2 1F6MC 2PGTA 3C71A 3LG6A 3IA1A 5GSTA 5CREA 2VD0A 5AGYA 2C3NA 5E4WA 3FKFA 1GP1A 1XBSA 5D8IA 2C1YA 1S3CA 3AY8A 4F0BA 4BPYA 3QMXA 3F9UA 3NIVA 1PGTA 4XS1A 2DIYA 1PL1A 2B7JA 1GSDA 3D5JA 5HR1A 1JZWA 3WT1A 4MCUA 2JZTA 1Z7RA 2EIRA 4DSRA 4OCEA 3FY7A 4GF0A 4MF7A 3UEMA 4AJ8A 5CRHA 4ZB8A 2OA7A 4MJBA 5ABRA 3GH9A 3KZQA 2C4JA 3DRNA 2ON7A 4K7NA 3KXOA 3G9BA 1CQGA 2GQMA 4FYBA 1PKZA 5AIVA 4MH3A 3OR5A 1X9SB 3H93A 2B1KA 3HA9A 3P2AA 4OWYA 1A23A 1EEJA 2H19A 4PXOA 3P90A 2YJHA 2N5BA 3WGXA 2C3TA 2LJKA 1O81A 4KW6A 4O92A 3DEXA 3IK7A 4AJ6A 4TOPA 3E0UA 3ZIJA 3IAS2 2MBTA 3TOUA 2CA8A 1GSQA 2G0FA 1OVNA 3IBHA 1FHEA 5ECIB 2ZCTA 3ZTLA 5DJMA 3UVTA 1XCCA 4N10A 2VCQA 3S9FA 1V57A 2F8FA 1A8YA 1K0CA 3ZIVA 3E3EA 3GKKA 1Q98A 1VGLA 2VL9A 1TXXA 2FWHA 3UMAA 4POLA 1GUHA 5CRDA 3FHKA 3F8UA 1SD8A 3KEBA 2LQOA 3DD3A 5F07A 2RIIA 3A2VA 3LXTA 3F3RA 5ECRB 4FYCA 4YH2A 1AC1A 4IJ3A 2EIQA 1F3AA 2C0EA 1K0NA 3FW2A 5ECHB 1YDKA 2IJYA 4N30A 3KM6A 3UL3A 4EL1A 3TCOA 4AGSA 1F9MA 4K9ZA 3RDWA 4BWSA 2FWEA 3VK9A 3H8QA 1A2JA 2G2QA 4EDYA 3EWLA 3HZ8A 3LQ7A 3V1WA 1PKWA 3A2WA 2V6OA 3CTFA 2LNSA 4XRAA 2DMLA 5J9BA 3ERGA 1E6BA 2PVQA 4F82A 22GSA 4OFMA 1TI1A 3F6DA 3TJFA 2VCZA 2CVKA 6GSYA 3ZFLA 1NSWA 2RM5A 2R3XA 3EVIA 3ISOA 5JCGA 1UN2A 1LU4A 2OBIA 4POMA 4ML6A 5G1LA 3VURA 5D9WA 3TRXA 2H1BA 1NW2A 2OE3A 4KDXA 3GSSA 4HS1A 2K8VA 4LMVA 1XVQA 1WOUA 2JSZA 3W8JA 5L71A 3LJRA 2HT9A 1N2AA 3GURA 2QC7A 1J0FA 3CSJA 1GH2A 2OBKA 2K8SA 1F37A 1XWCA 5HR3A 3I43A 2NTOA 3GL3A 3GX0A 2L59A 2GZYA 3GIXA 1AQWA 4ISDA 4PURA 1YQ1A 3H4KA 4PGTA 2KLXA 5AISA 2MZCA 2DJJA 4YQMA 4KUNA 1SL2B 2PMTA 1PD21 1GTBA 4P3YB 4XIHA 4EUYA 4EO3A 5ECSA 4N11A 1GSUA 3D6IA 2ON5A 3VI7A 3EE2A 4PQ1A 3KMNA 2KHPA 5IMDA 4E8EA 4OO5A 5IPGA 1MDJA 1B4QA 1FO5A 1K0MA 1VF3A 4TVEA 2HFDA 2ZNMA 3ZFBA 4L5OA 3WT2A 1URMA 1A2MA 2C80A 4MPGA 4RI6A 3ZMKA 1TK8B 1TRVA 1XVWA 1EWXA 1R26A 4ZL8A 1GUKA 3HD5A 4K0NA 4K0GA 5DDLA 3MAKA 2B7KA 4I97A 3IRAA 2PERA 3QD9A 4MJAA 4MLYA 2RM6A 1NHYA 2F3MA 1GSFA 3FZAA 2PVOC 2CX3A 5IOXA 3MSZA 1FG4A 3M3MA 1GNWA 2OKAA 3DVWA 2YOIA 3C7MA 4K1FA 2I1UA 3CXGA 5AIXA 1BJXA 1GTUA 4GTUA 2DJKA 4POKA 2GVPA 2F9SA 3ED3A 4ZL7A 1K0DA 2LEGA 4I5QA 3F4SA 2C0DA 1KTEA 1OC9A 2GTUA 1K0OA 3L0HA 5J3RA 3TJJA 5GZZB 3ERFA 4HJMA 1DE2A 4HZ2A 4BWQA 2GZZA 4ZBDA 3BCKA 3SWLA 2L5OA 1SL1B 2LTKA 4WBRD 1G7EA 11GSA 1TJDA 4MPFA 2CQ9A 1XW9A 1GSSA 3F0IA 1SK0A 3L78A 2AB6A 2H66A 1TK0B 1MDKA 2LJRA 1ZOFA 2M46A 3M9JA 1X5CA 4XCSA 3QAGA 4PQHA 3TJBA 3BOAA 3K8NA 4O7HA 3IPZA 2LV3A 1TDIA 2AUVA 5D9XA 1ZYQB 1ACVA 2PWJA 2LKUA 4QL9A 4BA7A 5J41A 3QR6A 4KSOA 4GSSA 5IOWA 2R6KA 1BAYA 1TRUA 2H8LA 2WS2A 5B6MA 4K2DA 2GT6A 4KCAA 1SK2A 5CAXA 1SJZA 3MWHA 1EEMA 3Q6OA 3CBUA 1EP8A 4L8EA 3DWVA 4MMMA 2HSYA 2ZUPA 5J5NA 5IO2A 4Q5QA 5ECLB 4NWYA 3LORA 3HY2A 2GLRA 3CTGA 2H71A 4IGJA 2L5LA 2QGVA 3CSIA 4DEJA 4DSSB 2BTOT 2OADA 4MJEA 2AYTA 1K0AA 2CV4A 1J08A 1VF1A 2CX4A 3LYKA 4CW9A 2MMZA 4K7OA 3VWXA 1QFNA 2JL4A 3LFLA 1M7TA 1T4YA 1YF0A 4Q5NA 1YKAA 2FWGA 1Q4JA 2MMNA 3LXZA 2B1LA 3UJ1A 4ZILA 2WB9A 1YF1A 1VF4A 3MDKA 5G5EA 3O6TA 2NVLA 2A2RA 2IPAA 3UAPA 4V2NA 5FHIA 3O3TA 5A4UA 3L9VA 3FYGA 4ZXGA 1U3AA 5B6NA 4G10A 2H0IA 3PINA 3RHBA 2E2GA 5F06A 1QQ2A 4V2MA 1R7HA 2HI7A 2DJ3A 1HYUA 3HJPA 4XS4B 2WJUA 3J7Yk 2HE3A 1JLVA 3DGQA 5G2ZA 2IWTA 4X43A 4FH8A 3D22A 5DQSA 2DJ1A 1RQMA 1EGRA 4QL7A 3W6GA 5F0GA 1XFLA 2HRNA 1A0RP 3KH9A 20GSA 3EYTA 3ZL5A 4PNFA 1K0BA 2MBSA 5C04A 1Z6NA 3A5WA 4DSSA 2K18A 4I2TA 1M9BA 4TKYA 3HVVA 1GTAA 1TOFA 3CRTA 5FT3A 3APQA 1OKTA 4WXTA 1M9AA 4X0XA 5IO0A 2VM1A 2HSHA 2PBJA 5G31A 1GWCA 2DLXA 4JU5A 4RQXA 4OCFA 4O32A 1B8XA 1V58A 2D2ZA 3LWAA 5DQYA 1W4VA 3KMOA 3FRCA 1SKRB 3QFBC 1AAZA 1R5AA 2H6YA 3FR9A 1HQOA 3HVSA 1ZGNA 1TU7A 1EOGA 2GSRA 4WKWA 1K3LA 2B5XA 2IFQB 2JZRA 4HQZA 1ZCPA 5KN1A 1K3OA 2QKEA 6GSTA 4KB3A 5G1KA 1LJRA 1T00A 4HQSA 5IMCA 1SKWB 4I2UA 5ECMB 5EL8A 2RUEA 3BJ5A 4KSMA 4XS4A 4TR1B 2R37A 3IOSA 4JR4A 4G19A 2CVDA 1WIKA 2OE0A 2X8CA 2K9FA 1VRSD 3HXSA 3KH7A 1ZYEA 2P31A 2IMDA 3QOUA 2AAWA 2M80A 3IHQA 1A0FA 5CP1A 3H1NA 4MP4A 2IMIA 2YV9A 5ELGA 4ECBA 4EVMA 4TRXA 3FK8A 1HNAA 9GSSA 1MEKA 2H74A 2CAIA 5IQYA 2H73A 4WEYA 6GSWA 5GAND 2FGXA 4TR4A 3KIJA 5HQPA 1YKCA 4KGIA 3RBTA 5GAPD 5J4UA 1PQNA 1S3AA 2H30A 1O73A 1X9WB 2GQLA 3EMXA 5DCGA 2BJXA 2DSAA 4NHWA 1V40A 2H1AA 2H0GA 1T3BA 1NHOA 1AIUA 2PPTA 4FO5A 1XW6A 2A2SA 1GSEA 1TU8A 1X9MB 1R5PA 2VLVA 4JE1A 2YWNA 4GXZA 4ULXA 2X64A 2VLTA 1EV4A 2R2JA 3UBKA 3LSZA 1PMTA 2I81A 1KEBA 2IFQA 1XIYA 1EP7A 3IR4A 4YAPA 2FHEA 3BCIA 1I9DA 1PA3A 3HZ4A 3UBLA 1JLWA 1G0TA 2H76A 3GNJA 1RK4A 1JHBA 2YZHA 3C8EA 4TR3A 2H0HA 3GKXA 1O6JA 4V1Ap 1Y25A 4TR1A 2VOCA 2B5EA 3G7IA 2LSTA 2VD1A 5A5KA 4GCIA 10GSA 4GWRA 1X5DA 3SBCA 3ME8A 4PQIA 5DALA 1HD2A 1OC9B 4WF4A 3ZRDA 3CRUA 1T1VA 3I69A 1E2YA 4MF5A 3F4TA 4CDOA 3M0FA 4NAXA 3TRQA 4IP1A 3UOMA 4N0ZA 1WMJA 2VLUA 5IMFA 3GA4A 3MNGA 2YCDA 2H6XA 2AV4A 1BG5A 2YPMA 1UA5A 3P7XA 1Z5YE 1PSQA 1H75A 4TR0A 5H5SA 4F9ZA 4JRRA 3KP9A 4WETA 2H6ZA 2O85A 1M2DA 2C0GA 3QDNA 1O8WA 1Z3EA 4IW9A 4LL4B 5D9TA 5A4WA 19GSA 4N0VA 3FZ4A 16GSA 2GSTA 1FB0A 2ALBA 1I5GA 1MD3A 2V6KA 3EURA 1OAZA 4NMUA 4EKZA 2GQKA 2OE1A 4IQ1A 4MZCA 4NHZA 3FZ9A 2C3QA 2GSQA 4WBJA 2X8HA 4DVCA 1EOHA 4IHUA 1UVZA 2YN1A 3IE3A 4POBA 6GSSA 2KUCA 1GTIA 2H01A 4HOJA 3GV1A 4ZB9A 3ZMLA 3M9KA 2HZFA 5IIZA 1XZOA 4PNGA 4GQCA 3ZVJD 3HCZA 1DUGA 1Z6MA 4PX1A 1U6TA 2L57A 1GSYA 4ECJA 2DJ0A 5IM9A 2E7PA 2CT6A 4ECIA 2O8VB 1ON4A 2A4VA 2IIYA 5COHA 3G7JA 1GNEA 1OC8A 4KDYA 4IQAA 1S3DA 2MMOA 5D96A 1Z9HA 3TB2A 3ZREA 1ERWA 4XTSA 3LYPA 3VPQA 1M2BA 1THOA 5CRGA 3DMLA 3WGDA 3A2XA 1C72A 2H72A 1OYJA 3GHAA 4IP6A 1YY7A 2V2GA 4GLTA 5IMZA 1V9WA 3RHCA 3IDVA 4FIWA 5JCWA 1HNCA 2FWFA 3APSA 3EU3A 2LJAA 3DVXA 5JCUA 4MABA 4GRFA 1ZMAA 3TKSC 2FCHA 3ZVJA 2NBSA 3TKSE 1UC7A 4KX4A 2N5FA 2RUFA 1O7UA 2WGRA 1PL2A 1GUMA 2YWOA 1TKDB 4J56E 2HLSA 3GX8A 4RQRA 2LNTA 3HVXA 3PH9A 2XPDA 2VL2C 5FWGA 5D9VA 1ILOA 1T7PB 2B3SA 4TXVA 4I6XA 1H4OA 4CHSA 1QMVA 3PR8A 3A3TA 5ID2A 2VIMA 4BVXA 2LRTA 4LL1B 1SU9A 4V2LA 6GSVA 2V41A 2E0QA 1BX9A 2J9HA 1ABAA 1ZL9A 2YZUA 1Y6EA 2HYXA 4NV2A 2REMA 4PUAA 2IMFA 3TJKA 3DIEA 5JWRB 5IPHA 2ES7A 3QFAC 1SJ6A 3C73A 4XHMA 5DCHA 3KD0A 4HUAA 13GSA 1B4PA 1THXA 1HNBA 2FUG2 2I3YA 4AF2A 5IMVA 2L6DA 3KCMA 5D93A 1QGVA 3VI5A 3IC4A 1QXHA 3TKPA 2YWMA 3F63A 2R4VA 1XXUA 5LD0A 3WD6A 4JR6A 1AQVA 2FA8A 1VF2A 4XS6A 3DKSA 4IKHA 3WGEA 1M99A 2WULA 1B9YC 1DE1A 1G6YA 5HFGA 3EU4A 7GSSA 3R2QA 2XBQA 1RW1A 3GTUA 2DBCA 1JFUA 5KN3A 3TDGA 2XC2A 3I9V2 4MZBA 2CAQA 4Q5FA 2HNLA 4L5LA 2VCXA 1YEXA 2WDUA 3VPTA 2GGTA 2YWIA 3F6FA 2YANA 4G2EA 4OFNA 3J7Yb 3L4NA 2WCIA 2CZ2A 1XWBA 2TIRA 3L9UA 2HZEB 4KH7A 4IN0A 2YNXA 1U88A 3U6VA 2DMMA 1SL0B 4OO4A 2DJ2A 4G9HA 4KCEA 2H70A 1G7OA 4GSTA 1XOBA 14GSA 4HI7A 5A4VA 4Z7XA 2AHEA 4F03A 2P0GA 3RPPA 3UARA 2GDRA 3N9JA 1A24A 3GH6A 4TN8A 2P5QA 5LNKe 4KE3A 4ACSA 1AXDA 3Q74A 1FVJA 2H1GA 2C0FA 3L9SA 1DSBA 2LRNA 1A2LA 3ERWA 4K6XA 4DSQA 5ECPB 4HU7A 3TKSA 1OKDA 12GSA 2J23A 1F3BA 2L6CA 4LA1A 4WR5A 3EMPA 5B7CA 3RPNA 1G6WA 5F05A 1WE0A 3D4MA 4F0CA 1SENA 3C1RA 3KGKA 1GULA 2VL2A 6GSXA 2MYGA 3EC3A 1CQHA 2VL3A 4X1UA 3TJGA 4MJCA 3ZYWA 1J9BA 3GL5A 4YQVA 2F51A 3CYNA 2TRCP 3F3QA 3DXBA 4L0UA 1K3YA 2CVBA 4OD7A 1DBYA 3E9JB 2LQQA 1QK8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite