3WT1A

Crystal structure of the b'-a' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase (reduced form)
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
GSPLIGEIGPETYSDYMSAGIPLAYIFAETAEERKELSDKLKPIAEAQRGVINFGTIDAKAFGAHAGNLNLKTDKFPAFAIQEVAKNQKFPFDQEKEITFEAIKAFVDDFVAGKIEPSIKSEPIPEKQEGPVTVVVAKNYNEIVLDDTKDVLIEFYAPWCGHCKALAPKYEELGALYAKSEFKDRVVIAKVDATANDVPDEIQGFPTIKLYPAGAKGQPVTYSGSRTVEDLIKFIAENGKYKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox-dependent conformational transition of catalytic domain of protein disulfide isomerase indicated by crystal structure-based molecular dynamics simulation
doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Humicola insolens
total genus 65
structure length 244
sequence length 244
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2014-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wt1A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wt1A01
3IA1A 5ECNB 3Q19A 5IMAA 2EC4A 3UOMA 4ACSA 4ILFA 4AJ8A 1ZYEA 4J57E 1TKDB 2LQOA 1WWJA 2VO4A 2F3MA 1TTZA 2QKEA 4XIHA 2CX4A 4FYUA 1H75A 1FHEA 2GSSA 2K9FA 3BBYA 4N0VA 5H5QA 2MMZA 1JZWA 5G30A 3DXBA 5CYYA 3M0FA 3Q74A 4QQ7A 3VLNA 4RUVA 1B48A 1TOFA 2CAIA 3TKSE 2C0DA 2GQLA 1BAYA 1ZGNA 4PUFC 4CHSA 1PKWA 3ZRDA 2FWFA 3GH6A 2DJ3A 4JE1A 3RPNA 5GAPD 2BTOT 3LFLA 1X5DA 4MMMA 4HU7A 5H5SA 3D6IA 1DSBA 1ML6A 3M9JA 4J2FA 2CT6A 2PBJA 4ZB8A 9GSSA 2H6XA 2ZNMA 5DJMA 4BWQA 2OE0A 2AB6A 5ENUA 4XHMA 2B5YA 1EWXA 2ZCTA 4WR5A 1UN2A 2H6ZA 3TRXA 4DSQA 1XOAA 2IL3A 2PWJA 4RQXA 3HA9A 2H01A 3BJ5A 3E3EA 3K8NA 1TI1A 3ZFLA 5ECHB 3KIJA 2LS5A 2WS2A 4HJ2A 5HFKA 4POLA 3ZYWA 1SK1A 4EC0A 2CAQA 2FY6A 2G2QA 1EP8A 4I6XA 4DSSB 2MZCA 2OADA 1O81A 4IBPA 2RM6A 2VCWA 4FYCA 4MLYA 2RLIA 4KSOA 3KTBA 4WF4A 5C04A 1CQGA 3U5RE 4EF0A 2VLTA 5IQYA 3LGCA 5D73A 3L4NA 2L5OA 3HJOA 3GKKA 5IO2A 4GXZA 1DUGA 3CTGA 3IC4A 3KJYA 4OWYA 1V57A 2JACA 2H19A 3EC3A 2YWMA 2JZSA 1AXDA 2PUKC 1GWCA 5F07A 2V41A 4JEDA 4F0BA 4L0WA 2JL4A 13GSA 1T7PB 4FIWA 4P3YB 3GYKA 1U88A 1RQMA 2V6OA 5ELAA 2DSAA 3ZITA 2YZUA 3ME7A 1J0FA 3KH9A 2L6DA 2VL9A 4IW9A 3W6GA 4Q5RA 1M99A 1X9SB 2VCXA 4ZB9A 3LWAA 5ABRA 2H8LA 2P5QA 4TXOB 2MMNA 4ML6A 4HQZA 1EV9A 1K0CA 3QPMA 4X1UA 3TJBA 1KTEA 1W4VA 2EIOA 1BX9A 2JSZA 3M8NA 1G7OA 1BG5A 4PNGA 3F9UA 1JHBA 3M1GA 1V98A 4NMUA 2H71A 3GFKA 3BD2A 17GSA 3PGTA 3DGQA 1SKRB 4HI7A 1T4YA 1F37A 4IKHA 5HR3A 4KDUA 1PX7A 1XW5A 4PGTA 4WXTA 5IIZA 3IXRA 2MMOA 1PQNA 1Y6EA 1YF0A 3BCIA 1OKTA 4GTUA 4KCEA 5ELGA 1V58A 4JU5A 1WRYA 2NDOA 4XRDA 3UVTA 3DVXA 4AGSA 2DJ0A 1SL1B 2K8VA 1B9YC 4V1Ag 1XWAA 4O32A 4PQIA 2R2JA 4TN8A 3P7XA 1DBYA 5JWOB 2LUSA 3QFAC 1NW2A 3IAS2 3TKPA 4XS4A 4OFTA 2GSQA 3O3TA 1GSEA 3G9BA 4RQRA 3TJFA 2DJ2A 1XIYA 2A4VA 4FYBA 3EINA 3GL5A 1WP0A 3ERFA 5HFGA 3LYKA 1B4PA 1EOHA 3QFBC 2WFCA 3C7MA 4QL9A 2B5EA 4GQFA 1A2JA 14GSA 1O73A 1XZOA 5DBQA 1OC3A 5B8AA 2IIYA 3TCOA 2I1UA 1EEJA 3WD6A 2HSHA 4OFNA 2MYGA 3RAZA 1PD21 2C4JA 1K0NA 1MEKA 3R2QA 3QAWA 1GNWA 1THXA 4ZILA 1B8XA 3U6VA 3QOUA 1GRXA 2KLXA 2C0EA 4KGIA 3FHKA 2VL2A 4G10A 3WT1A 3I69A 3VWVA 2AV4A 3DYRA 2OE3A 3AY8A 3QR6A 1SK0A 4DVCA 4IS0A 1WJKA 2N5AA 2NVLA 1TU8A 4ML1A 4V2LA 3APQA 1A8LA 4HS1A 3EYTA 4N11A 5LNKe 3CSJA 2NBSA 6GSWA 4OFMA 1ERVA 4JR4A 5C00A 1N8JA 2IJYA 3A5WA 2XHFA 3IK9A 2OACA 1T4ZA 2J9HA 3A2VA 2V2GA 1O8XA 5IMFA 2GSRA 3GSTA 3LEFA 5ECQB 5D9XA 2OJLA 4F03A 3GKMA 2DIZA 3BOAA 2FA8A 1WOUA 4TR1A 1FW1A 4BWSA 4POBA 2M72A 1FB6A 4LA1A 3ZMKA 1GSQA 2YCDA 5F0GA 3ISOA 1GSYA 3CBUA 3G7JA 1XWGA 1GSUA 3EMPA 1OAZA 2IWTA 5KN1A 4NXIA 1SYXA 3HKRA 3VURA 4NAXA 3FZAA 1YY7A 3APOA 5E59A 5IMCA 1SKSB 4XTSA 1MDKA 4K7OA 4N0ZA 5IPHA 2K6VA 2VD0A 3F4SA 3IRAA 5COHA 5DCGA 1HNAA 5GSSA 2C1YA 3TB2A 3GKNA 4OO4A 1J08A 1SYRA 1XVWA 4E8EA 2HLSA 3LSZA 3HJMA 4RI7A 1SL2B 1ZYQB 2YP6A 3GL3A 3QDNA 2C3TA 1OKDA 4K6XA 5A4WA 3ZIVA 4NHZA 20GSA 3SBCA 1UC7A 2EIRA 3ZZXA 3TRQA 3IDVA 2O8VB 1Q4JA 1RW1A 3GX8A 3S9FA 1F2EA 2PVQA 2AUVA 3CTFA 1GTUA 1PN9A 1S3AA 3OR5A 4XRAA 4HJMA 1XPVA 2IMEA 2YV9A 3FZ4A 1EV4A 1PSQA 2KHPA 4ECJA 2B3SA 3VWXA 3A2XA 2OA7A 1K0DA 2H66A 1R7HA 1Q98A 4NV5A 2FHEA 4N30A 6GSTA 1QQ2A 4EO3A 1WIKA 4ZBAA 4G19A 2QC7A 5G1LA 1PRXA 3SWLA 2R6KA 2JZTA 3HZ4A 1URMA 5GZZB 1TW9A 3D21A 4HEA2 3WT2A 4DEJA 1KNGA 4ULXA 1TP9A 4AJ7A 2ALBA 2YN1A 1B9XC 4KX4A 3RPPA 3UBLA 5EVOA 4MPGA 5DQSA 3IHQA 2GDRA 1PMTA 3US3A 3KZQA 5CRHA 5DALA 2DIYA 3QMXA 5ECSA 5AIVA 5J4UA 5ECLB 1TK5B 3O76A 1G7EA 5A4UA 2KOKA 3DRNA 2DJKA 2C0FA 2KP2A 3N9JA 5A5KA 4OMVA 5HR2A 4I2TA 3CMIA 2HNLA 5J9BA 3DWVA 1OE8A 3IPZA 4Q5FA 4GSTA 5KN2A 2Z9SA 3PINA 1VF3A 2K18A 8GSSA 1JZDA 4XS4B 4F0CA 2KP1A 3EU3A 3D0ZA 3D5JA 5CRWA 5INYA 3UL3A 1EGOA 6GSXA 2PPTA 3C73A 2XPEA 2DLXA 4MH2A 1CQHA 4MZCA 2C3NA 4JZQA 4MZBA 4PX1A 1VRSD 1ZZYA 4OO5A 1GLPA 1OC8A 1EP7A 5IMZA 4G2EA 3C8EA 4ZL9A 2VL2C 1PX6A 2B1LA 1SKWB 4YAPA 3ZVJD 2FCHA 2KUCA 1M2BA 4MDCA 4K0GA 4HUAA 3HXSA 2XBIA 2PMTA 2YNXA 1FAAA 2M80A 3MNGA 3KCMA 2AJQB 2R3XA 5JCWA 5DCHA 2LEGA 4YQVA 1GSSA 1G0TA 4WKWA 2CV4A 1YEPA 4L5LA 3F6FA 4PXOA 3I43A 1HD2A 3KMNA 5L71A 3KP8A 4TKYA 1JZRA 19GSA 4ECIA 1THOA 4MP4A 3TKSA 2O89A 3UARA 5GAND 1KBNA 3W8JA 5G5EA 4K9ZA 3VI7A 3DEXA 3CRTA 1T00A 5B6MA 4PUAA 2L4QA 2JADA 1GTAA 2WRTA 3M3MA 5IOWA 5JCGA 2H0HA 5ECMB 2VLUA 3DD3A 1KEBA 3EWLA 2B5XA 4KAEA 2DJ1A 3KTLA 1K0MA 2FWGA 1I9DA 3IOSA 5B6NA 2YZHA 3C1RA 5ECIB 2AYTA 4TR1B 4ZIJA 3UVHA 3KEBA 2GVPA 2REMA 1XWKA 2LKUA 4QL7A 4EKZA 4J56E 2LNTA 2DMLA 3Q18A 2IMIA 1NSWA 1MD4A 3FEUA 1ST9A 3E0UA 2QGVA 3HY2A 4CW9A 1PKZA 3F63A 5IMDA 4LL4B 2O7KA 2E7PA 4F2IA 3GURA 2R5GA 2P0GA 1NHYA 2GQMA 3TUEA 1QMVA 1N2AA 3ZIJA 2FD3A 2H74A 2H0GA 1O6JA 4IN0A 2RUEA 2OBIA 1LJRA 3MSZA 3HVVA 3WYWA 3FY7A 2M46A 3HJPA 2GLRA 5F06A 2IN3A 2ES7A 4ISDA 1B4QA 3G7IA 1T3BA 1XWBA 4KNDA 2LQQA 3PR8A 4BL7A 4K0NA 1GL8A 3O6TA 1Z9HA 3N5OA 5IPGA 5J41A 5G5FA 3VWUA 4ZL7A 5ECPB 1TJDA 5FT3A 3VPTA 5GSTA 1S3DA 3CSHA 2CVBA 4EDYA 1QGVA 1FB0A 2H1GA 1MDJA 2YV7A 1M0UA 3F6DA 2HYXA 4PQ1A 3L9UA 1ZL9A 2OE1A 3FYGA 5CNWA 2V32A 2YWIA 2VCTA 3F8UA 2FWEA 5LCZA 1OVNA 1VF1A 1K0AA 2VIMA 4WF5A 4MJCA 3I9V2 4NPBA 3PH9A 4IP6A 2PU9C 3GN3A 2HRNA 4MF6A 3HZ8A 3DIEA 3TGZA 2JZRA 2VOCA 3HD5A 2WGRA 3IBHA 1YQ1A 1M9BA 1V40A 5CO3A 2F51A 4HZ4A 1WPIA 2HSYA 2CA8A 5D8IA 5HQPA 3F4RA 3APSA 4AF2A 1ERWA 1ON4A 2HZEA 2GZZA 2C3QA 5KEJA 1HYUA 11GSA 1YZXA 5AIXA 5DALB 4F9ZA 2D2ZA 1NM3A 1TDIA 5A4VA 1FVKA 3GRXA 2IFQA 1M9AA 2GZYA 1YJ6A 2C8UA 4O92A 3GH9A 4ECCA 3EVIA 3CSIA 4EXJA 3LXTA 2B7JA 1GUHA 4MA9A 3MAKA 2A2RA 4KH7A 5ID2A 3D22A 1ABAA 2I4AA 3G7YA 1M7TA 3ZFBA 3KM6A 2L57A 4ECBA 1AAZA 3H8QA 3D4TA 2YWOA 2HZFA 4WR4A 16GSA 1TK0B 1UVZA 5DQYA 4JR6A 1VF2A 1K0BA 2JU5A 1XBSA 4TXVA 4Q5QA 2R4VA 4JRRA 4K7NA 1SU9A 4LMWA 3KD0A 1F9MA 5DAKB 1X5CA 3QAVA 4WBJA 4ZBDA 1C72A 1AQVA 5EY6A 3RHBA 1R5PA 1TI3A 2H72A 3ZL5A 2J23A 5EL8A 1TRWA 1M2AA 2ZUPA 5IM9A 6GSYA 5F05A 2RUFA 2I9HA 3CYNA 2WDUA 5D9WA 5HFIA 1O8WA 2L6CA 1TRUA 4ZL8A 5G31A 2LNSA 4PURA 2G0FA 2DJJA 1AQWA 3H93A 2YWNA 4BA7A 3CXGA 4IVFA 4OCFA 1TU7A 5HR1A 1V2AA 2YOIA 4GRFA 2OBKA 1YKAA 5F8BA 1BQ7A 4FO5A 2F9SA 1PL2A 3P2AA 2RIIA 1OE7A 2B6MA 2A2SA 4EL1A 1X9WB 1MD3A 4GF0A 1ZMAA 3ZMLA 3ED3A 2RM5A 4IP1A 1J9BA 4MK3A 3V1WA 1U87A 1XFLA 3EE2A 4KUNA 1USBA 1SJ6A 4YQMA 4POKA 2H30A 1MTCA 4N10A 2NPBA 2N5FA 3VWWA 4IJIA 2HFDA 3TDGA 4PQHA 3ME8A 3GTUA 1K0OA 4NWYA 3UAPA 1A23A 5CP1A 3GHAA 4X0XA 5DVBA 4ZBBA 1Z7PA 3HHVA 4CDOA 4GSNA 4KB3A 2H6YA 3MWHA 2MBTA 3E9JB 2BMXA 4ID0A 1GUMA 4AJ6A 3GUSA 4L8EA 3ZVJA 4TR4A 4TVEA 3TJGA 2VLVA 4HU9A 1G6WA 4FH8A 2DC5A 2DMMA 2QSIA 1HQOA 2FNOA 2H73A 5E4WA 4MJBA 3J7Yk 3WGEA 4E8HA 1K3LA 1V9WA 3IV4A 1F3BA 3M9KA 3IE3A 5KN0A 3FZ5A 5CREA 3KMOA 4I97A 1BEDA 1FG4A 2F8FA 3HCZA 1GTBA 1T8EB 2H70A 5ECRB 1Z6MA 2FLSA 1SJZA 2MBSA 4IHUA 5CAXA 4MPFA 2FA4A 5B7CA 2V6KA 3P90A 4WEYA 3HYPA 3NZNA 3L9SA 4YQUA 1XW6A 7GSSA 3FKFA 4I8BA 2XPDA 4F82A 5HR0A 2FGXA 3VFIA 2GSTA 4KW6A 1AQXA 2K8SA 1GP1A 5G1KA 2TRXA 2ON5A 5B8BA 5DDLA 4KE3A 4OD7A 3KH7A 1YKCA 1HNBA 1GSFA 1A2MA 5DJLA 2GZPA 2H1AA 3KGKA 2H1DA 4ZXGA 4TRXA 1IYIA 3LJRA 2LTKA 2TIRA 4D73B 5DAKA 5FHIA 2HZEB 3GNJA 3I6AA 5EPFA 1VF4A 4KA0A 2LRCA 3EU4A 5JCUA 4MABA 4GSSA 2B1KA 3ZREA 4BVXA 4L0UA 4G9HA 2LRTA 1Z6NA 2JSYA 2IFQB 2XC2A 4BVYA 2GT5A 5ECKB 3HVSA 2GGTA 2LV3A 3WGXA 2PGTA 4WBRD 1GUKA 4KDXA 3GX0A 3FW2A 4LLRA 2VCZA 6GSUA 1S3CA 2GS3A 3UIWA 5ID2B 4V2NA 2V1MA 2VAFA 4IGJA 1AIUA 3LXZA 1BJXA 1R4WA 1TK8B 2O85A 2WZ9A 2GQKA 3EURA 1GULA 1Z5YE 4EDZA 3FR3A 1DE2A 1FO5A 4X43A 1HNCA 4HQSA 1K3YA 5J9CA 2CZ2A 4O5RA 5D9TA 1TRVA 1WE0A 2X64A 2H75A 4K2DA 4V2MA 10GSA 3GKXA 1IYHA 2DBCA 1YDKA 3QCPA 5KN3A 3JCML 3LORA 1GTIA 3W8SA 3QD9A 1XOBA 4YH2A 1XW9A 4TR0A 1AW9A 2YJ7A 1OC9B 3GSSA 3ERWA 3TRPA 1ZCPA 1O7UA 1ERTA 4K8MA 12GSA 5ECOB 2AAWA 2O87A 1GH2A 1MDIA 5D96A 1X5EA 1EZKA 2PERA 1VGLA 2P31A 2WB9A 1SL0B 4XS1A 1TXXA 2VCVA 2F8AA 3ERGA 3TJKA 4WETA 3NIVA 2E2GA 3DMLA 3LYPA 4V1Ap 3H79A 3IR4A 4MZWA 1LU4A 1E6BA 3DVWA 4I5QA 3ZTLA 1W89A 5G2ZA 2C0GA 2IMKA 4GWRA 3C71A 3TOUA 2WJUA 3LQ7A 3MDKA 2NTOA 2VM2A 3CRUA 1A0FA 3GIXA 5AISA 4KCAA 3GMFA 1A2LA 2CVDA 4HZ2A 1JZOA 3TJJA 3GTUB 2WULA 4XCSA 18GSA 2L5LA 4MF5A 1R26A 3RBTA 1LBKA 4NV2A 1YEXA 4GQCA 1X9MB 1U6TA 4KDYA 2LJAA 2LJKA 1QFNA 2HE3A 4H86A 3UJ1A 3J7Yb 2X8CA 1EGRA 1U3AA 4LMVA 4D73A 5FWGA 4TR3A 1SD9A 1XXUA 1Z3EA 3HDCA 2VM1A 1E2YA 4O7HA 3BCKA 6GSVA 2P5RA 2ON7A 4IQAA 6GSSA 4GCIA 1SJIA 2IMDA 4IQ1A 1UA5A 3EMXA 3D4MA 1DE1A 1ACVA 3C1SA 2LSTA 2C80A 1JLWA 4MCUA 3TKQA 2IPAA 4K7IA 1A8YA 1QUWA 1RK4A 2VL3A 3QAGA 3VPQA 2X8HA 3FRCA 3RHCA 2E0QA 2L4CA 4DSSA 2VUPA 1X0RA 4TOPA 3LG6A 4LL1B 2PVOC 1PL1A 1OYJA 1XWCA 4RI6A 1Z7RA 2R37A 4HOJA 5AN1A 3F0IA 2HT9A 4MF7A 3KXOA 5IMVA 3FR6A 4DSRA 3TOTA 2X8GA 1SENA 1YF1A 4GLTA 3GA4A 4KSMA 3L9VA 4EUYA 2VD1A 4L5OA 4IELA 1NHOA 3RDWA 2YJHA 2HI7A 2H76A 3UEMA 2E2MA 2I81A 3UBKA 2YANA 1AUCA 1H4OA 2OKAA 4Q5NA 1EOGA 4PNFA 3F3QA 4TW5A 2PN8A 3TKSC 2WCIA 5J3RA 1QK8A 5AGYA 3L0HA 2H1BA 1SK2A 3HVXA 1EEMA 3GV1A 1FOVA 3A2WA 1BYEA 2H0IA 2L59A 1OC9A 2IMFA 1A24A 5D93A 2FWHA 1U3IA 5JWQB 2XBQA 1A0RP 1K3OA 3WGDA 4K1FA 2CQ9A 4Z7XA 1GNEA 2MMAA 1WMJA 4TXOA 1GSDA 4I2UA 1PA3A 5CRGA 1F3AA 3NOFA 3VK9A 4OCEA 3P8WA 1SD8A 1O85A 3TKRA 1I5GA 3IK7A 2N5BA 2HRFA 5LD0A 2HXKA 3DKSA 3ZLPA 1ZOFA 3FR9A 4POMA 2B7KA 1FVJA 5D9VA 4ZB6A 3F4TA 3FK8A 2X99A 1ERUA 2GTUA 22GSA 2FUG2 2AHEA 2TRCP 5IOXA 1XCCA 2CZ3A 2LRNA 1F6MC 3F3RA 3L78A 4MJEA 4BPYA 5CRDA 3VI5A 2CVKA 1ILOA 1T1VA 2CX3A 1TRSA 3H4KA 1PGTA 4JBBA 2LJRA 2EIQA 1GLQA 3H1NA 3UMAA 1G6YA 5H5RA 4XS6A 4NHWA 1JFUA 1AC1A 2VCQA 1Y25A 5JWRB 4MH3A 4YAVA 4MJAA 2I3YA 5IO0A 1R5AA 1QXHA 1JLVA 4HDEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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