3WT2A

Crystal structure of the b'-a' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase (oxidized form)
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
SPLIGEIGPETYSDYMSAGIPLAYIFAETAEERKELSDKLKPIAEAQRGVINFGTIDAKAFGAHAGNLNLKTDKFPAFAIQEVAKNQKFPFDQEKEITFEAIKAFVDDFVAGKIEPSIKSEPIPEKQEGPVTVVVAKNYNEIVLDDTKDVLIEFYAPWCGHCKALAPKYEELGALYAKSEFKDRVVIAKVDATANDVPDEIQGFPTIKLYPAGAKGQPVTYSGSRTVEDLIKFIAENGKYKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Redox-dependent conformational transition of catalytic domain of protein disulfide isomerase indicated by crystal structure-based molecular dynamics simulation
doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Humicola insolens
total genus 68
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2014-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wt2A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wt2A01
4G2EA 1BX9A 3GKMA 1EEMA 1WIKA 4WBRD 3VFIA 3R2QA 3CXGA 2DSAA 5GZZB 1X5CA 4PXOA 2CA8A 5IMDA 1HD2A 2FY6A 2H8LA 2TRCP 2CAIA 3HY2A 1F9MA 2C0EA 4OWYA 5AN1A 1HYUA 4YQUA 1TTZA 4L5OA 2JZTA 5G1KA 4JRRA 2WB9A 2HXKA 1V98A 4MZCA 2FWEA 4TOPA 1MD3A 4IHUA 2V32A 4PUAA 3RPNA 1T4YA 1GNEA 4TXOA 3TKSC 2LEGA 3F6FA 1JZDA 3F3QA 3EC3A 1X5DA 2C4JA 4EO3A 1GP1A 1U3AA 3GKXA 4AF2A 1W89A 3GYKA 1USBA 3CTGA 4MZWA 1YZXA 4HDEA 4WF5A 3FHKA 5DQSA 1AC1A 2CVDA 4H86A 3APSA 1PX6A 1RK4A 5IOXA 4HZ4A 2F9SA 5B8BA 2HNLA 5ECLB 5G31A 2HLSA 1ERUA 1PX7A 3RBTA 4O32A 4HJMA 1O8XA 2NPBA 3GUSA 4MCUA 5AGYA 3HJPA 3UIWA 1X9WB 2AJQB 2GSSA 3HXSA 2CVBA 1AIUA 5IIZA 4TR0A 1HNAA 4KUNA 3DEXA 1I9DA 4MJCA 2B7JA 1LU4A 1A8LA 2H19A 3D4TA 3L9UA 3DIEA 3N9JA 2WJUA 4MJAA 2H1DA 5B6NA 5IMFA 5F06A 3P8WA 3WT1A 3PINA 4F9ZA 13GSA 1Z7PA 3ZYWA 2C3NA 3A5WA 2JL4A 4O92A 2CX3A 2C1YA 4MABA 3F4RA 4O7HA 2RUEA 2E2MA 4LL4B 2OACA 1OKTA 4ZBAA 2FWGA 2X99A 1I5GA 3D4MA 3VWXA 2VM2A 2F8AA 4IELA 4RQXA 3CSIA 4ACSA 2I3YA 2E2GA 5D9VA 1ZZYA 5JCGA 2H71A 5CYYA 3DXBA 3ERFA 3HJMA 2DIYA 1N8JA 1M99A 1F3AA 5ECMB 1V40A 1TXXA 1WP0A 2C0GA 2F3MA 2JU5A 4KNDA 3WGEA 5DVBA 2QC7A 2YV7A 4EXJA 2H72A 1K0CA 2LJKA 4N30A 1PN9A 2VLVA 4J56E 3D22A 4EUYA 3FZAA 1SKWB 2VAFA 1JFUA 1EV9A 4L0WA 2B1LA 1GTAA 1O73A 3I69A 1F6MC 2N5AA 3DGQA 3O76A 1X0RA 1QUWA 5JWRB 3TJFA 3WGDA 2HT9A 5G2ZA 2MYGA 2GVPA 3H93A 4OCFA 1H75A 4BA7A 3C1SA 2VLUA 4MF5A 4FYUA 1M9BA 4XRAA 2A2SA 2GGTA 2LJAA 2GS3A 5CNWA 1M9AA 5LCZA 1XWCA 1A23A 3M1GA 3KH7A 4KSMA 5CO3A 1O85A 1XFLA 4GSSA 4KW6A 5IQYA 1OC3A 2KLXA 2LRTA 2BMXA 3DMLA 5JCUA 3TUEA 1T00A 3FY7A 2NVLA 1OC8A 1YJ6A 4N10A 1ZOFA 4FO5A 2MMZA 1Z6NA 2PVOC 4TRXA 1M7TA 18GSA 1M2AA 3HZ8A 2FA4A 1JZOA 2VCXA 2IN3A 3FK8A 2WULA 5EY6A 3C8EA 4L8EA 1SK1A 1K0DA 4PGTA 4OFNA 1K3LA 2OBIA 1QXHA 5CRHA 4CHSA 4POLA 4V2LA 2YOIA 3F63A 3ZRDA 5KN0A 1Z7RA 1URMA 4POMA 2VCQA 2PGTA 3Q74A 2ALBA 2QSIA 5IMZA 4TVEA 1SKRB 5KN1A 2JACA 3IDVA 1SENA 2YN1A 1M2DA 1CQHA 4HI7A 2RM5A 4TN8A 1EP8A 4ISDA 4P3YB 4ZL8A 3NIVA 3ED3A 1GUKA 3KGKA 5F07A 3F4TA 1DUGA 4XHMA 1FG4A 2JSZA 3LFLA 2B7KA 4E8EA 1XCCA 5HFIA 3M9KA 3Q18A 1SU9A 3CSHA 2ZCTA 3APQA 3CTFA 4TW5A 2GT6A 1WWJA 2VLTA 4K7IA 3TKSA 1SYXA 1NHOA 4RI7A 2EIRA 1ZL9A 4HS1A 2YWMA 3TJGA 4HOJA 5DBQA 1WPIA 4MP4A 4GRFA 4IS0A 1MTCA 3UL3A 3WD6A 4HQSA 1THXA 1R5AA 1XVQA 5JWOB 2MMAA 3RAZA 3U5RE 1R7HA 5GAND 3ISOA 2NTOA 1OC9B 4EC0A 1ZMAA 4L0UA 5ECQB 5LNKe 3LORA 2LRNA 2MMOA 3GHAA 1B4PA 3H4KA 4HJ2A 2VM1A 1NSWA 4MPFA 1BAYA 5IPHA 1GSUA 4LL1B 2OKAA 3KMNA 2X8CA 3LWAA 2D2ZA 3IHQA 3TOUA 2KOKA 2YCDA 1S3DA 4XS4B 2O8VB 4GSTA 3H79A 6GSUA 12GSA 2GDRA 3NOFA 3QCPA 5CP1A 1YKAA 4V2NA 3P2AA 1K0OA 1SK0A 3GH9A 1WMJA 4G19A 4QQ7A 4ECCA 4EKZA 5DALB 4ZBDA 1DE1A 5GSTA 2GZZA 1AQXA 5G5EA 3LGCA 1TRUA 4GXZA 4I8BA 1GSYA 1UA5A 5F05A 5ELGA 2CT6A 2GQLA 4ILFA 5IOWA 3QFAC 5DAKB 3HZ4A 2OE0A 2ES7A 1O81A 4EVMA 1T3BA 3LXZA 4LMVA 1PKZA 1XWAA 2B5EA 3A2WA 1GTIA 3LQ7A 3Q19A 4DVCA 5HR1A 5H5SA 3TJKA 2PN8A 1GUHA 4QL9A 4J57E 2H6XA 1QMVA 1R4WA 3O3TA 1ST9A 4L5LA 3ZREA 2CZ3A 1K3YA 3G7YA 5D9TA 4GQFA 4HQZA 2GLRA 2K9FA 4KCAA 1EEJA 4YQMA 1UC7A 3LSZA 3HVXA 3W8JA 3QAVA 1SL0B 4LLRA 1B8XA 2F8FA 1ZGNA 4K9ZA 3UBKA 3CRTA 3C7MA 4JBBA 1U88A 2OBKA 4ZXGA 1TKDB 20GSA 3TDGA 3W6GA 2K8SA 3DKSA 3VPTA 3WGXA 5JWQB 1FO5A 2OE3A 1XW9A 3HJOA 1T4ZA 2NDOA 3QFBC 1Z3EA 3C1RA 3KXOA 2R2JA 1ERTA 4FH8A 2GQKA 4ULXA 1SJ6A 1TI1A 2DMMA 5G5FA 1Q98A 1B9YC 3JCML 5D96A 3ZTLA 5CRGA 1WE0A 1A2JA 3GTUA 4WR5A 1K3OA 5ID2A 4TR1A 4NHZA 3QAGA 4ECIA 1PL1A 3ERWA 4PQ1A 2FWFA 2LSTA 5H5QA 2HYXA 4KB3A 1A0RP 5D9XA 1A2MA 3ZFLA 1K0MA 3EWLA 1QGVA 1X5EA 3L0HA 1ZYQB 3FW2A 4GQCA 3Q6OA 3TKQA 1OE8A 2N5FA 3O6TA 2LNTA 4OMVA 3ZMLA 2H76A 4MA9A 4ZB9A 2RIIA 1XW5A 1SK2A 3IAM2 1XVWA 4TR3A 2AHEA 2OJLA 3UJ1A 2XBQA 3IA1A 5J5NA 4NV5A 2HZFA 3G7JA 3DVXA 2GZPA 1SD8A 3FR3A 2TIRA 2VCWA 4IJIA 5ECHB 3VWUA 1YEXA 3GN3A 4X0XA 1V58A 1XWGA 2CX4A 3S9FA 4YAPA 1GTBA 1Z5YE 3P7XA 2K6VA 5INYA 1XOAA 4G9HA 5ECOB 4LA1A 2OA7A 3LXTA 1C72A 3HVSA 2IMDA 1EOGA 1DSBA 2O7KA 3VPQA 2XC2A 1QFNA 4QL7A 4OO4A 3TRQA 3RHCA 5AISA 2PERA 1M0UA 3GTUB 2YANA 3VK9A 2C8UA 2LRCA 1TK5B 1SL2B 1BYEA 2VL2C 4TXOB 1EV4A 2V1MA 4PURA 2V41A 2H66A 1PGTA 2B1KA 5HFKA 1JZWA 2CV4A 3VWVA 5CRWA 2OE1A 1ML6A 1OKDA 4NHWA 3TGZA 5CREA 1WOUA 3ERGA 3KM6A 1UVZA 2AV4A 5GSSA 4XRDA 3MAKA 3HCZA 4PNFA 4KDXA 4D73A 4MJEA 1O7UA 3DRNA 1GWCA 4ZB8A 3BOAA 2WGRA 1K0NA 1YEPA 3D21A 4NPBA 1K0BA 2DJ1A 2ON7A 1J08A 3TJJA 1TI3A 1G6WA 9GSSA 4IW9A 2IWTA 3FRCA 4IP1A 1O8WA 2H6ZA 4F82A 5DCHA 4NXIA 3UMAA 2OADA 3TCOA 4PX1A 4BWQA 4K8MA 2L59A 3HDCA 2YWNA 2LJRA 3GURA 5A4WA 1F37A 2VUPA 1WJKA 2J23A 1GLQA 5D9WA 2K18A 4IKHA 3GV1A 5DQYA 4ML6A 1ILOA 1T7PB 3KH9A 2BJXA 4WR4A 3FEUA 2P5RA 1AAZA 2B5XA 1TK0B 4OFMA 1XOBA 3KTLA 1F3BA 4ZL7A 1TRSA 5ECNB 1KTEA 1XW6A 3VURA 4JEDA 2L4QA 4MDCA 1PQNA 2B6MA 1J9BA 4BVXA 1GSEA 2I9HA 1WRYA 1NM3A 4RUVA 3QDNA 3LYKA 2YWOA 1MDJA 1TRVA 3H8QA 4POBA 4GWRA 4AGSA 2DLXA 4Q5QA 2V6OA 4G10A 3I6AA 2CAQA 3UVTA 2RM6A 3SWLA 4KH7A 1GH2A 2PVQA 2YNXA 1KBNA 5KEJA 4MMMA 1PA3A 1PKWA 3FYGA 5F8BA 3J7Yk 1SYRA 4FYCA 4K0NA 1AXDA 5KN2A 3BJ5A 1VGLA 8GSSA 1EGRA 2VL9A 3D5JA 4AJ6A 1A2LA 1A8YA 3M3MA 1THOA 3ZFBA 4WETA 1GUMA 5COHA 1ON4A 4XS1A 2MZCA 3HHVA 1AW9A 3RHBA 5JCWA 2P0GA 2KHPA 3N5OA 3GL5A 1YKCA 2XPDA 1YF1A 3UOMA 1LJRA 3GSSA 4HU7A 5ECPB 3LEFA 1BG5A 1E6BA 2GQMA 1S3AA 4WF4A 3ME7A 3BCKA 4MJBA 5KN3A 3EMPA 1EGOA 3QD9A 2EIOA 3IBHA 1BEDA 4K2DA 4HUAA 4MLYA 1S3CA 4Q5RA 3GMFA 3ZLPA 3KCMA 1SL1B 5AIVA 1GSSA 3UARA 1ERVA 4GCIA 4PQIA 4HZ2A 1RW1A 5HR3A 2H6YA 1PL2A 1U87A 3DYRA 4JR6A 2IIYA 4KDUA 3CYNA 1FHEA 4RQRA 2ZNMA 3TKPA 3V1WA 1HNBA 5B8AA 5HQPA 3GRXA 2O85A 2YZUA 2LQQA 1TJDA 1F2EA 4I97A 3WYWA 4RI6A 2DJ0A 3CBUA 2CQ9A 5GAPD 3MSZA 4XS6A 2V6KA 1CQGA 1JZRA 1OE7A 2BTOT 1ACVA 5B7CA 3EVIA 2E7PA 2IL3A 4K7OA 3IC4A 1JLWA 3OR5A 3M0FA 5EVOA 2FNOA 2G2QA 3PGTA 3UVHA 2PUKC 2HSHA 4IJ3A 5ABRA 4K7NA 4N0VA 3J7Yb 3G9BA 5DJMA 2C3QA 16GSA 3D6IA 4PUFC 2AB6A 4TKYA 4ECJA 4GTUA 3KZQA 4DEJA 5LD0A 1MEKA 1XZOA 3HD5A 1VF3A 4EF0A 4IN0A 3ZIJA 4ID0A 4EE0A 3TOTA 2VL2A 3HVVA 1B4QA 2AYTA 2C80A 2R5GA 2YV9A 2RUFA 3CMIA 2NBSA 1BQ7A 4IP6A 1GL8A 2RLIA 3KTBA 5EPFA 2XPEA 3HKRA 3MWHA 4I2TA 4JE1A 2K8VA 4KSOA 2EC4A 2O87A 3P90A 3VWWA 5IO2A 2LKUA 2FA8A 3HA9A 3FZ4A 2R37A 2YJHA 2H0HA 3E0UA 2I1UA 3PR8A 2FUG2 2REMA 1GSDA 2VD0A 3HYPA 3KMOA 3MNGA 1OYJA 3IK9A 1XWBA 5CRDA 2FLSA 1K0AA 5D8IA 3F6DA 4WXTA 1B9XC 1IYIA 3L9VA 1R26A 1V2AA 3G7IA 4BVYA 3IAS2 2FHEA 2H30A 2WDUA 3TRXA 2CVKA 5ECKB 2R6KA 2LV3A 5F0GA 2PMTA 2P31A 3IR4A 4XCSA 4V1Ag 4FIWA 2L4CA 2YWIA 3ZMKA 1XWKA 4X43A 2JZRA 2C0FA 3I43A 4WEYA 2FGXA 1MDKA 4KA0A 4EDYA 2DMLA 2MBSA 5J9CA 3IV4A 1G7EA 5DDLA 3TKSE 3A2VA 3UBLA 3D0ZA 4XIHA 1TOFA 4EL1A 2WZ9A 2Z9SA 2J9HA 3E3EA 2L6DA 1JLVA 2VCZA 3FZ9A 2YJ7A 1DE2A 2MBTA 4NAXA 5J41A 4AJ8A 2PBJA 3TJBA 1FAAA 1TW9A 1XBSA 1RQMA 5A4UA 6GSTA 2FD3A 1FB6A 3EINA 5E59A 2IMFA 4V1Ap 3TB2A 1KEBA 4OCEA 5HR0A 3IOSA 1DBYA 5HFGA 3GA4A 1VRSD 2PPTA 10GSA 1TK8B 1R5PA 1PMTA 1JHBA 1PSQA 5L71A 4CW9A 2FWHA 1BJXA 2VL3A 3PH9A 4ZBBA 2H1AA 6GSYA 3RDWA 2A4VA 2PWJA 2V2GA 4Q5NA 5IMAA 1SKSB 3KIJA 1HQOA 1TDIA 1UN2A 4N11A 3F8UA 2DJ3A 2LS5A 3ZITA 2WRTA 1QK8A 2WCIA 1PRXA 4AJ7A 2H1GA 1HNCA 3UEMA 2E0QA 3IXRA 2M80A 3H1NA 2LTKA 3FR9A 3U6VA 1Q4JA 2CZ2A 5G1LA 3TKRA 5ID2B 3LYPA 4TR1B 2DC5A 3IPZA 4MF7A 2JSYA 1YDKA 1NHYA 4I6XA 5E4WA 1Y6EA 5IM9A 4Q5FA 1LBKA 4F0BA 1V57A 5IMVA 2JZSA 4F0CA 2IMIA 3M9JA 1FW1A 2YP6A 3GX0A 2KP2A 3MDKA 3GH6A 3VLNA 1VF4A 5ECRB 2HRFA 2H1BA 3QR6A 22GSA 4IQ1A 4NMUA 4GF0A 1H4OA 4O5RA 1AQVA 1GULA 4IBPA 4JU5A 2HRNA 19GSA 3KP9A 1GLPA 1M2BA 2WFCA 4OFTA 2I81A 1G6YA 2GTUA 1YQ1A 6GSXA 3AY8A 4BWSA 5HR2A 4TXVA 4MK3A 3L4NA 1PD21 3ZVJD 2IJYA 2HZEA 7GSSA 1EWXA 1SJIA 2B5YA 5IMCA 2O89A 4MPGA 3ZZXA 2N5BA 4IGJA 1ABAA 3SBCA 5D93A 3IRAA 4F2IA 2QGVA 4WBJA 3KD0A 2R3XA 3QAWA 5D73A 5J9BA 1B48A 2H70A 3KEBA 2HSYA 4POKA 2KP1A 4KX4A 2GSRA 3KP8A 2GSTA 2QKEA 1SJZA 3BCIA 3F0IA 2AAWA 2AUVA 2IPAA 3GSTA 3A2XA 1A0FA 2ON5A 4I5QA 1X9SB 3GKKA 1TP9A 2H74A 3F4SA 1GSQA 4BPYA 1YY7A 2XBIA 1W4VA 5C04A 3A3TA 1OVNA 4WKWA 2VO4A 5B6MA 2TRXA 1MDIA 1QQ2A 1XXUA 3EU4A 6GSVA 2MMNA 14GSA 2L57A 6GSSA 4D73B 4OO5A 2H01A 5A4VA 4KCEA 1OC9A 5C00A 2M46A 3KJYA 2DJJA 4K1FA 1GTUA 1EP7A 4ML1A 5AIXA 5A5KA 3GIXA 5ECSA 3ZVJA 17GSA 4PNGA 3L9SA 3ME8A 4HEA2 4KGIA 4XS4A 3CSJA 5IPGA 2HZEB 1FB0A 4DSSA 2G0FA 4MZBA 4KE3A 2IFQA 1N2AA 3BBYA 1MD4A 3LJRA 1ZYEA 4GSNA 4DSRA 3BD2A 5DALA 4F03A 3GX8A 5FHIA 2HE3A 2VIMA 4YAVA 4V2MA 1E2YA 2L5LA 5FWGA 2H75A 2VD1A 5DAKA 4MH3A 4ZILA 2B3SA 5DCGA 5DJLA 2H73A 2EIQA 4PQHA 2DIZA 4EDZA 3GNJA 1GRXA 2P5QA 1TU7A 4NV2A 4YH2A 4LMWA 5EL8A 3TRPA 3UAPA 1Y25A 2C3TA 2DJKA 2L5OA 3CRUA 4HU9A 3VI5A 1Z9HA 1FOVA 4BL7A 4CDOA 1G0TA 2GT5A 3E9JB 2HI7A 3QPMA 1TRWA 2VCVA 2A2RA 4KDYA 2DBCA 3ZIVA 6GSWA 1T8EB 1GNWA 1GSFA 5H5RA 5J4UA 3US3A 1EOHA 2GSQA 2H0GA 2M72A 2VCTA 1XPVA 1U3IA 2H0IA 2LUSA 2YZHA 1G7OA 2F51A 1NW2A 1ERWA 1J0FA 2X64A 2X8GA 3F9UA 1Z6MA 1KNGA 3EE2A 3IK7A 5CAXA 4YQVA 4DSSB 4ZB6A 2IFQB 4JZQA 3FZ5A 3QOUA 3NZNA 3LG6A 1VF2A 3FR6A 3IE3A 1VF1A 1V9WA 4DSQA 1ZCPA 2DJ2A 4NWYA 4OD7A 4X1UA 2IMKA 4XTSA 5ECIB 1O6JA 11GSA 2R4VA 4ZL9A 3EU3A 4ECBA 3K8NA 1U6TA 3GFKA 4IVFA 2X8HA 3I9V2 4ZIJA 1TU8A 4Z7XA 5J3RA 2YPMA 1FVKA 2GZYA 5FT3A 2JADA 4I2UA 3FKFA 2WS2A 3EYTA 4J2FA 5ELAA 4E8HA 2PU9C 5IO0A 1SD9A 3ZL5A 2IMEA 4MH2A 5ENUA 3QMXA 4FYBA 2VOCA 2C0DA 3C73A 3GL3A 2KUCA 2ZUPA 2LQOA 5G30A 4K0GA 3APOA 3F3RA 4IQAA 1EZKA 1OAZA 2L6CA 3GKNA 4GLTA 3RPPA 3DWVA 2XHFA 4JR4A 2I4AA 3DVWA 3WT2A 2FCHA 1X9MB 4MF6A 1XIYA 1YF0A 2LNSA 4KAEA 3EURA 3VI7A 1A24A 3C71A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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