The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
82
|
structure length |
82
|
Chain Sequence |
NTQTVLPFTGLNTPNGVAVDSAGTVYVTDHGNNRVVKLAAGSNTQTVLPFTGLNTPNGVAVDSAGTVYVTDHGNNRVVKLAA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Computational design of a self-assembling symmetrical beta-propeller protein.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Pizza2 protein
|
| molecule tags |
De novo protein
|
| total genus |
12
|
| structure length |
82
|
| sequence length |
82
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| chains with identical sequence |
B, C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-06-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5F53 A; 3WWF A; 5CHB A; 4ZCN A; 3WWB A; 3WW7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2PW8 H; 1K9O E; 2A7J A; 3ENS B; 3MTY A; 4P00 A; 2GDE H; 3P6Z B; 3RXS A; 3VB4 A; 1GL1 A; 2F43 B; 1P05 A; 3TK6 A; 4MNW A; 5C94 A; 1DXW A; 4KKD A; 3GCT G; 5EXM A; 4GVU A; 1HJA B; 2CF8 H; 2BY7 X; 2RDL A; 1O0D H; 1C2E A; 4WH8 A; 1HAZ B; 3SYJ A; 1FPH H; 1UTN A; 1SFI A; 3OE7 D; 6GCH F; 1XUH A; 4HTC H; 2BLO A; 1A1R A; 2BOH B; 1RTK A; 2QY0 B; 1RD3 B; 4UFG H; 3ZVE A; 1TBR H; 2BD4 A; 2FS8 A; 1O2O A; 1DX5 M; 1H8E D; 4KTC A; 2Z9G A; 3PMB B; 4ABJ A; 1N6X A; 1UVO A; 1P01 A; 1TYN A; 3VGC B; 4WF8 A; 2BZA A; 3W95 A; 2CJI A; 4BTI B; 1YWU A; 1MZD A; 3LGI A; 1TA6 A; 1NPM A; 2OC1 A; 2ZFP H; 2RFK C; 1TQ0 B; 3A7X A; 1O2H A; 3GY4 A; 1CO7 E; 1K21 H; 1C5P A; 3HKJ B; 4Z0K A; 4XFQ A; 1JIM A; 2KCO A; 4KTU A; 3RUO A; 3DD2 H; 1P2Q A; 1EB1 H; 3RXR A; 1SSX A; 5B6O A; 1QUR H; 3GY7 A; 2W6I D; 3K6Z A; 2GDD A; 2A7H A; 1E36 B; 4YES B; 1CE5 A; 1NFX A; 4A6L A; 8EST E; 3EE0 B; 3UQO A; 1YLN A; 2AMP A; 1O2I A; 1FN8 A; 4AFS A; 2ZDM A; 3M3T A; 4OGY A; 1AGJ A; 4WY3 A; 1C5T A; 1WTG H; 1AKS B; 2VJ1 A; 1TNG A; 3E0N B; 1L2E A; 2G00 A; 1FIZ A; 2D26 C; 5EIY A; 4YZU A; 2GX4 A; 1RIW B; 1MTU A; 4XBB A; 4BOH A; 4DUR A; 4JZ1 A; 3A8D A; 3GS9 A; 2AFQ B; 1AFQ B; 1F2S E; 2SGF E; 1YLC A; 3P70 B; 3SHC H; 1TBZ H; 2LEL A; 3SQE E; 5C20 A; 3V12 A; 4CR9 A; 1GL0 E; 1A0H B; 1SQA A; 2M5T A; 2BLV A; 2VVC A; 1OYT H; 2OQ5 A; 3HPT B; 2XOK D; 1S85 A; 2ZFT A; 3PMH B; 1TQ7 B; 1HYL A; 1GBA A; 3AAS A; 2ZGX H; 3Q76 A; 2W5E A; 3ZZB A; 3E8L A; 2Y7X A; 2KZ4 A; 3OU0 A; 1IQI A; 3TGK E; 1GBK A; 4ABE A; 2H2Z A; 2PKA A; 4NSY A; 1V2J T; 1Z8J B; 2V3O H; 3HAT H; 4FUD A; 2YNA A; 1SKY E; 1IAU A; 4YLQ H; 1NFU A; 2PSY A; 1T4U H; 2VGC B; 3LKW A; 2KCA A; 1KXB A; 2YNB A; 1WV7 H; 4D7F A; 3HGN A; 1AIX H; 4F48 B; 4K1S A; 2SGQ E; 1ZPC A; 2HNT F; 1V2R T; 1ELC A; 5IYT A; 1A0J A; 2A2Q H; 1DS2 E; 3B23 B; 1B5G H; 1ARB A; 2PP6 A; 1GI3 A; 1UCY E; 3MO3 A; 4IC6 A; 3RXK A; 4SGB E; 1D9I A; 2PGQ B; 2QE7 D; 1ELA A; 2H5C A; 4J2Y B; 3LGU A; 4INK A; 4NFE A; 2Q6D A; 3SNB A; 1O2N A; 1ELF A; 1GI7 B; 1HAV A; 1VIT G; 1Z1J A; 1BOQ A; 3SOR A; 3MWI U; 1SGI B; 1XUJ A; 1QL8 A; 1O3A A; 2W3K A; 3MU4 A; 1JBU H; 2HRV A; 1A3B H; 3MI4 A; 1Z6J H; 4X6N A; 5CHA B; 4XD7 D; 2HLC A; 1O2U A; 2P59 A; 3PV5 A; 1JRS A; 3A86 A; 2AIP A; 1A61 H; 3L3T A; 1TNJ A; 3N7D A; 2AEI H; 2WV9 A; 4YOG A; 3MU5 A; 4NIV A; 3VEQ B; 5DKM A; 2ZG0 H; 2VNT A; 3F6U H; 1V2V T; 1SGC A; 5DN6 D; 4AX9 H; 1SGT A; 5A8Z A; 2ZHE H; 3LGT A; 3M3V A; 3A89 A; 1ZTK A; 1BMF D; 1Z6E A; 2BD5 A; 1S5S A; 1KDQ A; 1MKW H; 3F9H A; 1DFP A; 5I46 H; 1YLD A; 4Q7X A; 2F83 A; 5EQR A; 1UCY K; 1O2Z A; 2VIO A; 5GJ4 B; 2CMY A; 2NU1 E; 1BA8 B; 2WHX A; 5A8Y A; 1G30 B; 1NM6 A; 3TPI Z; 1E1Q D; 1F0S A; 1P12 E; 1XXD A; 3A8A A; 1P2I A; 4UFF H; 1XUF A; 4O97 A; 1ELE E; 1SLV B; 4BNR A; 3A7T A; 4WME A; 1MQ5 A; 1MUE B; 1RJX B; 5C17 A; 1O2T A; 3U69 H; 3EA8 A; 4YM9 A; 3PO1 B; 4H6T A; 1O33 A; 3SJ8 A; 1S0Q A; 1PFX C; 1OWK A; 4BTT B; 3D23 A; 3TH2 H; 3QTV H; 1BTX A; 3LGW A; 1BQY A; 1C2I A; 4GSO A; 4XBC A; 1P2J A; 3SI4 H; 1GI0 A; 1CGH A; 2UWP A; 4NA8 A; 1EP5 A; 5HIY A; 3T62 A; 3QGJ A; 4MNY A; 2ZEC A; 1O3H A; 2ZDK A; 4KGA A; 1ETR H; 2V6N A; 1HB0 B; 1ZTJ A; 1GI6 A; 1FUJ A; 1YGC H; 4FUJ A; 8GCH G; 2ZFF H; 1F92 A; 1GCD A; 4GPG A; 4B6F A; 3EGK H; 6GCH G; 1CHG A; 2F4L A; 1Y5A T; 1VGC C; 1NRS H; 3KF2 A; 4A5T S; 3FP6 E; 2FM2 A; 5EPN A; 4AN7 A; 1DE7 H; 1CSO E; 2ILN A; 1GVK B; 1AHT H; 2GKV E; 3ZZ4 A; 1MCV A; 3DSO A; 3ZZ7 A; 1BTH H; 3BTQ E; 1YPK H; 4CHA C; 1TOC B; 3PWB A; 1ZJK A; 3JZ2 B; 2R3Y A; 1HPG A; 3PV4 A; 1PQA A; 2BVR H; 3BEI B; 1SMF E; 4CBN A; 3A84 A; 1K1P A; 1GCT C; 3A8B A; 3KQB A; 2BM2 A; 1LO6 A; 1D3P B; 5G4B A; 4NIY A; 4DW2 U; 3BIU H; 5B6L A; 3ZZ3 A; 1QCP A; 1XMN B; 1GBJ A; 2XNI A; 3LIW A; 3F9E A; 1H1B A; 5GPI B; 4RKO B; 6CHA B; 3OY5 U; 4Y10 E; 2C90 B; 2VIV A; 4A1V A; 5TCC A; 1LQE A; 2BOK A; 3TGI E; 3MYW A; 4WH6 A; 3F1S B; 1SLW B; 3U9A H; 1WQS A; 1AZZ A; 1O3D A; 1E0F D; 2FXR A; 1OKX A; 3UR9 A; 2WV5 A; 1LHD H; 1GBH A; 2EEK A; 9LPR A; 2NU3 E; 4A1T A; 2Z94 A; 1QZ8 A; 4ABF A; 1TPS A; 2RCE A; 3VB7 A; 3K9X B; 2JKH A; 3T5F H; 4JYU H; 2WPK S; 1O3E A; 2LP6 A; 1ZMN A; 2G52 A; 4DT4 A; 2L74 A; 1HXE H; 1J9C H; 2XXL A; 2PTC E; 1C4Y 2; 2WYG A; 1BHX F; 1O2G H; 5HIZ A; 2XWA A; 4JMY A; 1O2W A; 1GHY H; 1EXF A; 2CV3 A; 1W3C A; 2OQU A; 2OCV B; 2P95 A; 2BD2 A; 3PLP A; 3AW0 A; 3TGJ E; 2XRC A; 3ZVA A; 1L1J A; 2PSX A; 2DE8 A; 3M5M A; 2J98 A; 3MO6 A; 4A1X A; 3LGY A; 1D3T B; 4B76 A; 4ZHM U; 2ZWL H; 5DP8 A; 1SBW A; 1YPM H; 1G9I E; 3OEH D; 2Y80 A; 1C5Y B; 3TJU A; 1ZTL A; 1ELT A; 4BAN B; 4Q80 A; 1EQ9 A; 5SGA E; 4M9F A; 2O8M A; 1AO5 A; 3GCT F; 3SOS A; 3GCH C; 3SND A; 2R2M B; 1HJA C; 3RLY H; 1C1N A; 1HAX B; 1O3G A; 4ZUH A; 3RC6 A; 1C1S A; 2VVU A; 5JB9 S; 1BJV A; 1E35 B; 1NT1 A; 1YPJ H; 1FY4 A; 2XND D; 1AMH A; 1GI1 A; 1KXE A; 5E0J A; 1EAT A; 5FAH A; 1GMH F; 4ZHA A; 1RRK A; 1NU7 B; 2XC0 A; 4TY6 A; 1HAH H; 5F8Z A; 2ZGB H; 3V13 A; 1Z7K A; 1BUI A; 4GAW A; 5E0G A; 4ISH H; 2EY4 C; 1IQH A; 5T1V A; 3P8N A; 1BBR E; 3MNB A; 2IJO B; 4Y79 A; 1CHO G; 1CT0 E; 2C8X B; 3WWF A; 2OC7 A; 3VGC C; 3ZVG A; 2OXS A; 1YM0 A; 2M2A A; 4ABG A; 2PV9 B; 1XUI A; 3RU4 D; 2VIN A; 3RXL A; 3SUE A; 3EAJ A; 1TGN A; 3B8J A; 1JXP A; 4JZE H; 2R9P A; 1EKB B; 1C5N H; 3SNC A; 1W2K H; 2OBO A; 4NZL A; 2GCT C; 5E0H A; 5EXN A; 5FBI A; 3T26 A; 1EOJ A; 2FOD A; 3MH5 A; 2VB0 A; 3GCN A; 2YMS B; 4K60 A; 4X1R U; 1EAU A; 2IPQ X; 3DFJ A; 1O2V A; 2BDA A; 1ZOM A; 2A0Q B; 1NY2 2; 1MAY A; 4OM9 A; 2G8T A; 1MTN B; 1O3I A; 4TT3 D; 5FBE A; 2V3M A; 4Y6D A; 5FX6 A; 4HZH A; 3RXE A; 4B6E A; 5A09 A; 3Q3K A; 5KEC A; 4X2Y A; 2F9N A; 1O2R A; 3F9G A; 2QXI A; 4A7I B; 2D2D A; 4Q7Z A; 1L0Z A; 1GI4 A; 1C5W B; 3ELA H; 2Z9K A; 4AOR A; 1ZPZ A; 3STI A; 3KCG H; 2ZHQ H; 3T28 A; 1AFQ C; 1O2P A; 3NXP A; 1O2J A; 3QK1 A; 4Y7A A; 3RLW H; 4OS1 A; 2IN2 A; 1ACB E; 3AAU A; 2A1D B; 3ZV9 A; 3UQV A; 1J16 A; 3O8R A; 1H9H E; 3H7T A; 1EPT B; 5HM2 A; 1AN1 E; 2WZQ A; 3QZQ A; 5C5O A; 3TJV A; 1MQ6 A; 1KLT A; 1O2Q A; 1BCU H; 1ZRB A; 1ZPB A; 4MPX A; 3TIT A; 1FX0 B; 2ODP A; 4JZD H; 1KXC A; 2F9V A; 1SGF G; 1LHE H; 1TRN A; 4MDS A; 1FY8 E; 1OP0 A; 3RXI A; 2ZFQ H; 1TAL A; 2VGC C; 2ZU3 A; 1EFR D; 1GGD C; 1XUK A; 1VCP A; 2A45 B; 3AVZ A; 4NCY A; 1HV7 A; 1OX1 A; 3FZZ A; 3KGP A; 1SL3 A; 2RDE A; 2PTN A; 1JIR A; 4LZ4 B; 1GI5 A; 4WWY A; 4TWW A; 1QTF A; 1MU6 B; 1WCZ A; 2A5A A; 2JET B; 1BML A; 2B9L A; 5GXP A; 4WMF A; 1UK3 A; 1W8B H; 1ZLR A; 1WU1 A; 1VIT F; 2XBY A; 2Y5H A; 5LPF A; 4NZQ A; 4MVN A; 2P8O B; 1D3Q B; 1SI5 H; 2FOA A; 3TU7 H; 1UCY H; 3RC5 A; 1P9U A; 3BTM E; 2ZKS A; 5EOK A; 5C1X A; 2A7C A; 3RXU A; 3CS7 A; 2TGA A; 5A8X A; 1ANC A; 4DII H; 1AE5 A; 2R0K A; 4Q7Y A; 1WUN H; 4MPW A; 4ISN A; 2OC8 A; 2A5I A; 1KXF A; 1D3D B; 2QXJ A; 4X8T H; 1DWC H; 2SNW A; 5T6F A; 1O5E H; 1BRU P; 4FU8 A; 1LQD B; 3MH7 A; 1FI8 A; 1D6W A; 1D6R A; 3PYH A; 3UWI A; 1FNI A; 3NPS A; 4K5Z A; 2HGT H; 4R8T B; 2FES H; 3D65 E; 4ZCN A; 4OS5 A; 1SFQ B; 4HG6 A; 2J97 A; 4ZRO A; 1LVB A; 2Z3E A; 4K3J A; 5LPE A; 1BIT A; 2FTL E; 3VPK A; 1RXP A; 1QA7 A; 1QQU A; 1EJM A; 1C1O A; 1YPG H; 1OSS A; 2A32 A; 2HAL A; 4MQA A; 1O34 A; 5FCR A; 1E38 B; 4Y8X A; 3F3B A; 4ACA A; 1O30 A; 4ZKR U; 3TIU A; 3RMM H; 4I32 A; 3NRL A; 3PO1 C; 3KQD A; 5JPM H; 3RXD A; 2Y81 A; 1MTW A; 1P2N A; 2ZCK P; 4F49 A; 1TE0 A; 1AWF H; 2XWB I; 1SGR E; 2C93 B; 4BXS A; 1O2Y A; 3ZVB A; 4B73 A; 4O03 A; 3TNS A; 1WBG B; 2IJD 1; 2XTT B; 1ZSJ A; 3U8T H; 1FAX A; 4KP0 A; 2R3U A; 2QAA A; 1YP9 A; 3SGB E; 2ODQ A; 3VXF H; 2UWL A; 1GBT A; 3LDX H; 1GG6 C; 2FLB H; 4K8Y A; 5E2O A; 3U28 C; 4IBL H; 8GCH F; 2ZTY A; 2B0F A; 1XVM A; 4ISO A; 3EE7 A; 1C1M A; 2ZA5 A; 3SU1 A; 3VB6 A; 3WWB A; 1CQQ A; 4Y76 A; 3A82 A; 1MH0 A; 2FIR H; 1GVL A; 1H8I H; 2GT8 A; 1GMH G; 4VGC B; 2BDY A; 3NUM A; 4ABA A; 1QRW A; 1A46 H; 2PKS B; 1EZU C; 1BTW A; 1IQG A; 2B7D H; 2KAI A; 1GDN A; 4XE4 A; 2V3H H; 1OWH A; 1TX6 A; 2ZDV H; 2WYJ A; 3EA7 A; 1EAS A; 3SGA E; 5FXL A; 4MLF B; 4U30 A; 1GBF A; 1O5F H; 1O2M A; 4WVP E; 3MU0 A; 1XKA C; 3BTT E; 3P8O A; 3H7O A; 1GHX H; 2WPD D; 3M61 U; 2UUF B; 4ZAE A; 2QA9 E; 3GCO A; 2PUX B; 4Z1M D; 3M3S A; 4QT8 C; 2BX4 A; 4BAO B; 3I78 A; 1HCG A; 4AB9 A; 1DM4 B; 3UPE A; 1WQV H; 2ZHD A; 1ELV A; 6CHA C; 4ZHL U; 1SC8 U; 1UK4 A; 1UTK A; 3HKI B; 2ZF0 H; 1UVP A; 4INH A; 2VH6 A; 2BTC E; 2BQ7 B; 3DA9 B; 1O3O A; 1HBT H; 4OS7 A; 4GHT A; 2KCY A; 1THP B; 1P09 A; 1ETS H; 1QBN A; 1YPH E; 2C8Y B; 1OWI A; 1FV9 A; 4D76 A; 4BXW A; 1YYY 1; 4ZKS U; 2BLQ A; 3VG8 A; 2ZDA H; 1C1R A; 1EP6 A; 1ELG A; 1SB1 H; 3NCL A; 1FPC H; 1PPG E; 5HMA A; 2NU0 E; 3SQH E; 2GZ8 A; 2KM0 A; 3BEU A; 1O38 A; 3I77 A; 1BZX E; 5EU8 A; 1THR H; 2P3T B; 1VIT H; 2V35 A; 2VWO A; 3A8C A; 1K1M A; 1EST A; 1GDQ A; 3S69 A; 3SU6 A; 3T29 A; 1C5V A; 3U8O H; 1G3D A; 3FVF B; 4ZKO U; 3OX7 U; 4NG9 H; 2BXT H; 1HDT H; 1KTS B; 4R0I A; 1AVX A; 3U1J B; 1ZJD A; 2G4T A; 1F5L A; 1SGD E; 2AGG X; 2G5V A; 5FHT A; 1HAP H; 1SHY A; 1GBD A; 4ZXY H; 4NWK A; 4X6O A; 2SGE E; 3FFG A; 2FOC A; 1TGB A; 3F0O A; 2K0Q A; 2BDC A; 2WSS D; 1H9L B; 1CGI E; 1UTP A; 1V2U T; 1NFY A; 1C5M D; 1OOK B; 2L6O A; 2UUJ B; 4K8B A; 1BJU A; 1V2L T; 6EST A; 4H42 U; 1AB9 B; 1F7Z A; 1O3N A; 1C1U H; 3SUF A; 1A3E H; 4Y0Y E; 1AD8 H; 3D62 A; 4B71 A; 1P2M A; 1UTM A; 2EI8 A; 3F68 H; 4WMD A; 1ETT H; 4O3T A; 3GYL B; 3C27 B; 4IS5 A; 1O3J A; 3RMN H; 4NGA H; 3BTD E; 1P03 A; 1SOZ A; 2FOE A; 1XX9 A; 5FPS A; 3MOC A; 1CHO F; 2FYQ A; 2G55 A; 2GT7 A; 2ANW A; 3RXG A; 1O2S A; 5EW2 H; 4D7G A; 3HGP A; 2WUC A; 1ELD E; 3VB5 A; 1UTO A; 1NFW A; 3QX5 H; 2WPM S; 4BAQ B; 1T8O A; 4ISI H; 4X8S H; 1O3L A; 1PQ7 A; 4ABD A; 3B9F H; 2JH5 D; 1V2T T; 4MPV A; 3TJO A; 5GND A; 2CHA B; 1YPL H; 1BBR H; 3LH1 A; 1C4V 2; 2Z3D A; 2P3U B; 4AFZ A; 2GP9 B; 1ID5 H; 2PWX A; 4IMQ A; 1W0Z U; 1MBM A; 1KTT B; 5ESB A; 4THN H; 3W94 A; 4B2A A; 1HUT H; 2Z9I A; 3BG4 B; 5C2Z A; 3A7V A; 1QL7 A; 2VVV A; 4JK5 A; 3RU4 T; 5LH8 A; 1ZHR A; 3PWC A; 1YKT A; 3BSQ A; 1MTN C; 1DWB H; 2BLW A; 1Y5B T; 1EX3 A; 1FMG A; 3E90 B; 5DP7 A; 1VCW A; 3SU4 A; 1PPF E; 2PUQ H; 5ABW A; 1ZHP A; 2OD3 B; 2ZPS A; 1XUG A; 2ALP A; 4FU7 A; 5TCA A; 3A87 A; 1GHV H; 1HJ9 A; 1HIA A; 2WV4 A; 2FOH A; 3E0P B; 1A5H A; 1O35 A; 4I7Y H; 2F9O A; 2JH6 D; 1AVW A; 1T31 A; 3E1X B; 1QY6 A; 1V2O T; 5GIB A; 1TON A; 2HLD D; 1FON A; 1EPT C; 1CT4 E; 3MMG A; 1TB6 H; 4XOJ A; 1SVP A; 3CEN A; 3MU8 A; 1QJ1 B; 4GHQ A; 3OTP A; 1LVM A; 2ASU B; 3URC A; 5ETX A; 3SV8 A; 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