3ZITA

Crystal structure of the thioredoxin-like protein bc3987 mutant t8a
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
74
structure length
74
Chain Sequence
KIEVYAQPDCPPCVIVKEFLKHNNVAYEEFDVKKDAAARNRLLYDYDSYSTPTVVIDGEVVAGFQIEKLQQLLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tuning of Thioredoxin Redox Properties by Intramolecular Hydrogen Bonds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus cereus
total genus 22
structure length 74
sequence length 74
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zitA00
3N9JA 1CQHA 3QDNA 4P3YB 2L4CA 4YQMA 4EUYA 2GZPA 4LA1A 2EIRA 3LSZA 2V32A 2MBTA 2H0GA 1DBYA 4KSOA 3GX8A 2HSHA 1H4OA 2VL2A 3D0ZA 1Z6MA 3GL5A 1YF1A 2V2GA 4MF6A 1ERUA 4BL7A 2L59A 1FVKA 3KCMA 2VM1A 3RAZA 3VWVA 1Z9HA 1KBNA 4J56E 1U87A 2H70A 4MJEA 4Z7XA 1GULA 3TOTA 3DVWA 2IN3A 3BJ5A 5IMCA 2M80A 4KX4A 3GMFA 1XOBA 1PX6A 1FAAA 3WT2A 5IMZA 6GSWA 3IDVA 4AJ8A 3LGCA 2WDUA 5JCGA 3F3RA 4HU7A 4DSQA 4GLTA 1Z6NA 4FH8A 5JCWA 3Q19A 2L5LA 3GSTA 4F0CA 5C04A 2PUKC 2HFDA 4ISDA 4MPGA 4GSNA 2VCXA 4DEJA 4NV2A 2LNTA 1URMA 1TU8A 2LSTA 2ES7A 4MF7A 1K0MA 2EIQA 1ON4A 1JLVA 2C0FA 4YAVA 1X5DA 3U6VA 2DIZA 3DWVA 1KNGA 1ERVA 1M99A 5ECLB 2NDOA 4H86A 4BVXA 3F6FA 5IMFA 2B5YA 1O73A 1QGVA 2LUSA 2RM5A 1OC3A 1Y6EA 3M8NA 2C80A 4LL4B 3SBCA 3QD9A 1VF4A 1BJXA 2I9HA 2HLSA 1SL1B 4N10A 5DALA 3M3MA 1GSQA 4N30A 4K1FA 2YV9A 5LCZA 5EL8A 3C8EA 1ILOA 5CRDA 3ZLPA 4N0ZA 3FW2A 4MP4A 4HQSA 3C73A 1J9BA 3GSSA 5IPHA 4NPBA 1A0FA 1A2MA 1JFUA 3CBUA 2GLRA 4DVCA 2TIRA 5IQYA 3F9UA 2FHEA 4XRDA 2CV4A 4WBRD 3K8NA 4KUNA 1EEMA 3UL3A 4OFTA 4F82A 3UAPA 2A2RA 2C0EA 1LBKA 1WIKA 4BWSA 2R6KA 3EMXA 3IPZA 1FB0A 4V2LA 3I69A 3TKRA 5G31A 3D22A 2DBCA 3OR5A 3GX0A 1T4YA 3DMLA 1G7OA 2VIMA 3ED3A 4DSSB 3GKKA 2WB9A 3S9FA 3KH9A 3ZMKA 1M2DA 1M7TA 1SKWB 1NHOA 3A2WA 3C1SA 3GKMA 3DVXA 3CRUA 1TRVA 3HVSA 4IKHA 3DIEA 1VF3A 5ECQB 1YEXA 3WT1A 4L8EA 2GSSA 1R5AA 4NAXA 4G10A 1YF0A 1JZOA 2LV3A 1T1VA 2B5XA 3KMNA 1GNEA 4PNGA 3FHKA 2YWNA 2YPMA 2BMXA 1EZKA 4HUAA 5HR2A 4G19A 3J7Yk 1YDKA 3DD3A 3TDGA 2B5EA 3H8QA 4EC0A 4WBJA 2VCWA 3UJ1A 5J3RA 4WF4A 1ZYEA 5D9XA 1MTCA 5J5NA 4O92A 3QFAC 2VAFA 4LMWA 4ID0A 2LJKA 3TB2A 1SL2B 3UEMA 1Z7PA 1V40A 4EKZA 2V6KA 3O3TA 5G1LA 1T8EB 4GXZA 1XW5A 4E8HA 3O76A 3HJPA 1JHBA 3TOUA 1XVWA 2MBSA 3VWWA 3UBKA 1IYHA 1E6BA 2K18A 2IMEA 4ZB8A 5GZZB 3M9JA 4KCEA 12GSA 1CQGA 2WZ9A 2E0QA 2YNXA 1PRXA 2IWTA 1SK1A 3TCOA 3EYTA 5ELGA 1OC8A 5D9VA 3LFLA 4ZL7A 4AJ6A 3F4SA 2JACA 1Y25A 3F3QA 4MA9A 3ZITA 3UOMA 5A4UA 1G6WA 3UARA 5AN1A 4ECBA 1HD2A 3GNJA 1WJKA 3UIWA 2GS3A 3ERGA 4ZILA 2KP1A 2FWEA 2HXKA 5DCGA 3I6AA 1M9AA 2GSQA 2X8HA 3O6TA 5A5KA 1T7PB 2HI7A 2WFCA 2C0DA 4RI7A 4O5RA 4O32A 3F4TA 2YP6A 2DJ2A 1E2YA 4PGTA 1TKDB 3GN3A 2V6OA 2B1LA 2NVLA 3C71A 4MK3A 4TR1A 3QPMA 4BPYA 3A5WA 4AJ7A 4PNFA 2L6DA 3LYPA 2H6XA 4GCIA 3NIVA 2H72A 1Z7RA 4HJ2A 2O8VB 2WJUA 1T4ZA 3WGDA 5IMAA 1M2BA 5F0GA 2XC2A 2I81A 1TW9A 3GURA 2D2ZA 1ACVA 5HR1A 3ZYWA 1K0BA 3TRXA 2B3SA 4JR4A 1KEBA 2LRTA 3D4TA 4TW5A 5IIZA 3CMIA 2IIYA 4TN8A 2B1KA 2PGTA 5C00A 1HNAA 4IQ1A 3EE2A 3WGXA 2X8GA 2AHEA 4ZBAA 2H1BA 4KGIA 2JZSA 1SKRB 3BCIA 3WD6A 2H73A 5CNWA 2GGTA 3EINA 3KMOA 3IC4A 2CT6A 3R2QA 1DSBA 4OFNA 4TVEA 1U6TA 4JEDA 4F0BA 3KXOA 2VL9A 4Q5RA 2O7KA 2Z9SA 3IA1A 2K9FA 5B8AA 1XPVA 1AXDA 1EP8A 3KP8A 5ECNB 8GSSA 4I2UA 1DUGA 2CX3A 2DJJA 2OE1A 2G0FA 3CSJA 1FHEA 4ZL8A 3H79A 1WWJA 2H66A 2GT5A 4ZXGA 4GRFA 2CA8A 1K0DA 5INYA 3E3EA 3EMPA 22GSA 3C7MA 1B4PA 4IHUA 3AY8A 3F8UA 2L5OA 3H4KA 2DJ0A 2P5QA 3GIXA 1K0CA 3DGQA 3VPTA 1K3YA 3M9KA 1BG5A 4XS1A 5ECOB 1TK8B 5CRGA 3W8SA 16GSA 3FR9A 3IK9A 5CAXA 3TRPA 2X99A 4MZWA 3IK7A 3KIJA 4HDEA 3TKSA 2AJQB 5B7CA 1GSSA 3HXSA 1A23A 3FR3A 2XBQA 2CVKA 4WXTA 1K3LA 1EWXA 1MD3A 2VL2C 5GAND 5IOWA 5G2ZA 4BWQA 2VO4A 3W6GA 5JCUA 3DKSA 4D73A 2JADA 4KB3A 2DC5A 3W8JA 7GSSA 3HJMA 1XWGA 2DMLA 1TRWA 1SJIA 4JBBA 4K6XA 1SL0B 1GTAA 1K0NA 5HR3A 1XWKA 2CQ9A 2JSYA 1OE7A 4FYBA 4WETA 1ZGNA 2YOIA 3D6IA 1UN2A 3KTLA 5DALB 3ERFA 4OO5A 4TR3A 4LL1B 4NXIA 4L5OA 3PR8A 18GSA 1T3BA 1GTUA 1AC1A 5HR0A 1B48A 2FGXA 3ZVJD 2PBJA 1EOGA 2JZRA 5LD0A 5ELAA 3A2VA 5H5QA 1YKCA 2IL3A 3FY7A 2KUCA 1GRXA 3GKXA 1GL8A 1VRSD 3TJFA 1O8XA 1K0OA 3CSHA 4PQIA 4YAPA 2LS5A 2AAWA 1ERWA 3ZMLA 1RW1A 2H0HA 4XS4A 1I9DA 3BBYA 4WR4A 13GSA 2O87A 3DRNA 2WULA 2YN1A 5EY6A 3IXRA 5AGYA 3DYRA 2F8AA 5FHIA 4I97A 1FVJA 3NZNA 1XOAA 4RI6A 5G30A 1GSUA 1DE2A 1EP7A 1FO5A 3EC3A 20GSA 3A2XA 1NHYA 3QMXA 2VCVA 2IJYA 1FOVA 2WCIA 5ID2A 4DSRA 1MDIA 4QQ7A 4PXOA 1GLQA 1GSYA 3FZ4A 2GQLA 2L6CA 4X0XA 4K7IA 4N11A 4EF0A 3VI7A 2YWMA 2MZCA 1N2AA 4YQUA 1B4QA 1A2LA 2VLVA 3UVTA 4WF5A 2YWIA 2JU5A 2YJHA 4K7NA 1F9MA 19GSA 4MH2A 3G9BA 1OKDA 5F8BA 3LORA 5D93A 3QAWA 2VCZA 2NBSA 4CHSA 4HS1A 1QMVA 1A2JA 2EIOA 3QFBC 1UC7A 2GTUA 4MZCA 4EXJA 3IV4A 3RHBA 3FRCA 2YJ7A 1PD21 2IMIA 4MZBA 1UVZA 3ZRDA 4ECIA 4Q5FA 2WRTA 3P7XA 3GKNA 3CTFA 2C8UA 2RIIA 4EVMA 2G2QA 3JCML 5J4UA 2FWHA 2H71A 1OVNA 2MMNA 3L9UA 1U3IA 3GYKA 3IBHA 2CX4A 1B9YC 4EO3A 3RDWA 3US3A 1X9MB 2VCQA 1O8WA 4EL1A 4KCAA 4QL9A 1BX9A 4I8BA 1LJRA 3F6DA 2VOCA 4IJ3A 2YZHA 1XXUA 2KLXA 2JL4A 4L5LA 2PMTA 4KDYA 1PN9A 4XHMA 4QL7A 1GNWA 1O81A 4POBA 5F07A 2YV7A 5IMDA 5GAPD 5G1KA 1UA5A 5FWGA 4ZL9A 4POLA 4E8EA 4K2DA 1SYXA 1S3DA 1F37A 2LRCA 5J9CA 4ZBBA 1TOFA 1ABAA 2LJAA 2OA7A 3FR6A 1SU9A 1TK0B 3G7IA 1ZCPA 3ISOA 4KA0A 1GTBA 3KH7A 1KTEA 2DIYA 4TR1B 4IP6A 2P5RA 4IGJA 4IW9A 4GQFA 2XHFA 3RPNA 4CDOA 5ECPB 4F2IA 5B8BA 1AQWA 4K9ZA 2IMFA 2VM2A 4L0WA 1W89A 1NW2A 3MWHA 2FLSA 2LEGA 3HZ4A 4JU5A 5IOXA 1EGOA 4PUAA 1QK8A 4I5QA 5ECRB 3LEFA 2E2GA 4FIWA 4AF2A 2VD1A 2YANA 5CP1A 2MMAA 1ZZYA 1ML6A 2PVQA 3ZVJA 6GSXA 2M46A 2GZYA 1H75A 6GSTA 2C3QA 2A4VA 1ZMAA 1GUHA 4HQZA 4ACSA 1PX7A 1SD8A 4OMVA 1A0RP 1FG4A 3A3TA 3P90A 5JWQB 3TKPA 2LJRA 2X64A 2C1YA 3QCPA 1WMJA 2H6YA 2N5AA 4ZB9A 2O89A 5D8IA 2HT9A 2OE3A 4AGSA 5HFGA 1XFLA 2PPTA 4ZB6A 5ECIB 4I6XA 4MCUA 2VLUA 4MMMA 1XWCA 1A8LA 4XS6A 4MLYA 1GSEA 4HJMA 4GWRA 1T00A 4IS0A 4KAEA 5IMVA 3EU4A 2YCDA 3EVIA 3KEBA 2CVBA 14GSA 2ZCTA 5EPFA 2YZUA 1HQOA 2H30A 2B7KA 3UMAA 1FW1A 2DJ1A 2FWFA 4HEA2 3H1NA 4K0NA 2C0GA 1WOUA 4ZBDA 3IAM2 1SENA 3FYGA 1A24A 3BOAA 2HRFA 2P0GA 1R26A 3KGKA 5JWRB 2FWGA 3PINA 4V1Ag 4PX1A 1AW9A 2XPDA 3KTBA 2GQMA 3ME8A 1SK2A 2H1GA 2DJ3A 3L4NA 2B6MA 2L57A 5CRWA 2RUFA 2GSRA 4XTSA 4D73B 5HFKA 1HNCA 4IELA 2H1AA 1OKTA 4RQXA 4TR0A 2HRNA 2RLIA 4OD7A 1HYUA 4YH2A 3UVHA 5COHA 3EURA 1OYJA 2MMZA 4KH7A 1PA3A 4KNDA 2J23A 3QR6A 10GSA 4MH3A 5L71A 3HYPA 4NWYA 5B6MA 3Q18A 3RBTA 2F8FA 4KSMA 1Z3EA 2CZ3A 1W4VA 2PERA 4Q5NA 1THOA 5KN1A 5DAKA 2JZTA 2AYTA 1PQNA 1NM3A 1AQXA 4RQRA 4K7OA 4PQ1A 3LJRA 5B6NA 4HZ4A 4FYCA 2VL3A 1AQVA 4HU9A 3BD2A 2JSZA 5J9BA 11GSA 2H0IA 2R3XA 4V2MA 4HOJA 1MDJA 4V1Ap 4XS4B 1K0AA 5FT3A 3TKSE 3L0HA 3MNGA 1ZOFA 2HZEA 1XWBA 2A2SA 5G5FA 1V57A 4WKWA 3D4MA 4G9HA 1Q98A 2N5BA 2ZNMA 2LKUA 3APOA 2GZZA 3I43A 1F2EA 4BA7A 1TU7A 1AAZA 4CW9A 1GWCA 3LWAA 4GTUA 1VGLA 4NHWA 3J7Yb 5ID2B 2R4VA 2REMA 3HZ8A 1YJ6A 2GT6A 5JWOB 5KN0A 4PQHA 1XWAA 1XW9A 3CTGA 2B7JA 1TP9A 2IFQA 5HFIA 3L9SA 1GLPA 1XIYA 1QXHA 2FNOA 5KN3A 4EE0A 3CRTA 2H01A 3IRAA 3VK9A 2M72A 4KW6A 3DXBA 1MD4A 2BJXA 1DE1A 4IJIA 3MAKA 5ENUA 4V2NA 2IMDA 1PKZA 2DJKA 2GDRA 4OWYA 2FD3A 3M0FA 4ZIJA 2XBIA 4WR5A 3F63A 1Z5YE 3FK8A 2HYXA 1GSDA 2K8VA 1B8XA 1V98A 1SJ6A 5CREA 5IO2A 3TJKA 4G2EA 4OCFA 3ZL5A 3G7JA 4NV5A 2BTOT 4X43A 2R5GA 3LXZA 4FO5A 3CSIA 2TRCP 3QOUA 1VF2A 2LRNA 4HZ2A 1F3BA 2VUPA 6GSUA 1ERTA 5DBQA 1YEPA 5AIVA 1U88A 1NSWA 5F05A 2H76A 4ILFA 1R7HA 2H6ZA 3HKRA 1TJDA 3HA9A 4TXOA 3WGEA 2F9SA 3GH6A 3L78A 1TXXA 3QAVA 4ML1A 2V1MA 4IP1A 6GSYA 1BEDA 3C1RA 2V41A 3DEXA 5DQYA 5CRHA 1EOHA 1FB6A 1OAZA 4K8MA 4POMA 1GSFA 1YY7A 3EWLA 5H5RA 1ZYQB 4MJAA 3APQA 2ZUPA 3GL3A 2YWOA 5IM9A 1WE0A 4IBPA 1I5GA 2PU9C 2FY6A 2HSYA 3PH9A 3GV1A 4I2TA 4BVYA 1MDKA 2WS2A 4JZQA 3KZQA 1SYRA 3U5RE 2O85A 1O7UA 4ML6A 1PKWA 3SWLA 1XW6A 3HD5A 2K6VA 4F9ZA 2AB6A 4TOPA 3F0IA 4JR6A 1TTZA 1THXA 2OBKA 2LQOA 5KEJA 1J0FA 5DJMA 1RQMA 1GH2A 3VWUA 4K0GA 2VCTA 2J9HA 3GTUB 3IR4A 1GTIA 3D21A 1O6JA 3WYWA 1G6YA 5D96A 5D73A 2C3NA 2AV4A 1PSQA 4KDXA 2C3TA 2FA4A 4MF5A 2KP2A 3VPQA 2H1DA 1N8JA 3KD0A 3HVXA 4NHZA 3E0UA 4IVFA 2LTKA 3GFKA 3P2AA 1S3AA 4KDUA 1M0UA 1QUWA 5IPGA 1M9BA 3RHCA 1K3OA 4XIHA 2OACA 4LLRA 3GHAA 5A4VA 1TDIA 3HHVA 4MDCA 3FEUA 4JE1A 2LNSA 3RPPA 1G7EA 1F3AA 2EC4A 2ON5A 5E4WA 3TGZA 3L9VA 5CO3A 4IN0A 2ON7A 2F51A 5H5SA 3VURA 4JRRA 3Q6OA 4ULXA 4POKA 1S3CA 4ECJA 2K8SA 5AIXA 1O85A 3TRQA 1X5EA 2H74A 4MABA 1R4WA 3LQ7A 3TUEA 3IAS2 1AIUA 2PN8A 1XBSA 5DDLA 3GUSA 6GSSA 4J2FA 2VLTA 2PVOC 3KP9A 1X0RA 2CVDA 1PL1A 3GTUA 2DSAA 5LNKe 2KHPA 5J41A 3IOSA 1V2AA 4X1UA 1LU4A 2I1UA 1QFNA 3LYKA 4GQCA 9GSSA 2RUEA 1BYEA 1C72A 3CYNA 3LG6A 1TK5B 3HDCA 4TRXA 4XCSA 2E2MA 1TRSA 5HQPA 3LXTA 3BCKA 4EDZA 2H8LA 3ZIVA 2IPAA 1OC9B 4OFMA 2X8CA 4EDYA 1EGRA 1XVQA 2RM6A 1TI3A 3VLNA 3ZFLA 3ERWA 3UBLA 3ZZXA 5ECHB 4DSSA 1X9SB 3MDKA 2CAIA 3KJYA 3FKFA 5ECKB 1VF1A 1WRYA 2IMKA 4PUFC 1X9WB 3M1GA 1TI1A 3MSZA 17GSA 2OKAA 2C4JA 4XRAA 3GH9A 3EU3A 5AISA 3VFIA 4HI7A 3GRXA 4IQAA 2QC7A 2MYGA 2OBIA 5DAKB 1G0TA 4O7HA 1EV4A 2LQQA 3CXGA 3I9V2 4OO4A 5ABRA 2F3MA 4OCEA 1BQ7A 2R37A 2VD0A 3HJOA 3HY2A 1SJZA 4ECCA 1M2AA 1X5CA 3GA4A 4TKYA 2P31A 3NOFA 5A4WA 1TRUA 1V58A 2GSTA 3ZIJA 2N5FA 3QAGA 2HZEB 1YZXA 3TJBA 3TJGA 2E7PA 5GSTA 4MPFA 2GQKA 1USBA 4GSSA 1WP0A 1GP1A 2WGRA 5DVBA 1XCCA 1JLWA 2OE0A 1BAYA 2FCHA 5IO0A 4NMUA 1A8YA 5F06A 2OJLA 5GSSA 2XPEA 3FZ5A 3IHQA 2KOKA 3ZREA 1GUMA 5KN2A 2CZ2A 2PWJA 1B9XC 2NTOA 3H93A 1OC9A 3FZ9A 2FA8A 5D9WA 1EEJA 2ALBA 2AUVA 3IE3A 4MJBA 1MEKA 3ZTLA 2IFQB 3FZAA 3Q74A 1PMTA 1V9WA 2H19A 3TKQA 2I4AA 2DLXA 1R5PA 3HCZA 3APSA 1JZWA 2HE3A 3V1WA 4MJCA 3PGTA 2TRXA 2GVPA 4PURA 3F4RA 1GUKA 1EV9A 5D9TA 1F6MC 3VWXA 1ZL9A 3VI5A 2HNLA 3TKSC 5ECMB 1JZDA 1XZOA 4RUVA 1SK0A 2I3YA 2MMOA 5CYYA 2QGVA 4N0VA 5EVOA 1U3AA 3D5JA 1Q4JA 2OADA 3TJJA 2QKEA 5ECSA 4YQVA 1SKSB 1J08A 5DQSA 3E9JB 2QSIA 1SD9A 1OE8A 1JZRA 1IYIA 1QQ2A 5E59A 2CAQA 3G7YA 3N5OA 3KM6A 4L0UA 1PGTA 4F03A 5DCHA 2H75A 2NPBA 4GSTA 4FYUA 4J57E 5DJLA 1WPIA 1YQ1A 1PL2A 4LMVA 3ZFBA 4KE3A 2R2JA 4TXOB 4WEYA 1HNBA 5G5EA 2DMMA 3P8WA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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