3ZVJD

Crystal structure of high molecular weight (hmw) form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
MVLLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITLNDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKHGEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 33
structure length 168
sequence length 168
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
D PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zvjD00
1F9MA 1GSDA 1U6TA 2X8GA 3EINA 1YKCA 4WR4A 2VLUA 4BVXA 2CVDA 3ZIVA 2HI7A 2TRXA 4GCIA 3IAS2 5D73A 2V2GA 3FZ9A 2LRCA 3TRQA 1V9WA 1ON4A 4K0GA 20GSA 4TRXA 2LNSA 3SWLA 3RBTA 1YDKA 4POLA 1X5DA 4BWQA 4POKA 2QC7A 2GGTA 3RPNA 2FY6A 2PPTA 1XCCA 3BJ5A 1AQVA 1WRYA 2JZTA 1EP8A 3UVHA 3V1WA 2N5BA 6GSVA 3NOFA 4KDXA 1B9XC 2GVPA 6GSTA 1E2YA 1GRXA 2GS3A 2CX3A 3GTUB 1K0BA 2VCXA 1RW1A 1NSWA 3GL3A 2R4VA 3ZVJA 4RQRA 1LBKA 2GZZA 3IA1A 1VF4A 3FW2A 4Q5QA 2ON7A 4ZB8A 3CSJA 1GTBA 2FWHA 1SYRA 3Q19A 3VWVA 3KEBA 2WGRA 3M0FA 1DSBA 2FA8A 3F3QA 3CXGA 4KSMA 2NTOA 5AIVA 1O8XA 2GQMA 4O5RA 1TU7A 3FHKA 1KBNA 3P90A 4MJBA 4ZBBA 4XCSA 4MH3A 4DSSA 3JCML 1R4WA 4IJ3A 4NV5A 4YAPA 3PINA 5ID2B 2C1YA 5H5QA 3DYRA 2ZCTA 4WR5A 4RI6A 5J3RA 1XFLA 2CX4A 3UOMA 1OKTA 2CT6A 1V98A 4KAEA 3CMIA 4YH2A 4ZL8A 8GSSA 1XVWA 5KEJA 5H5RA 3Q18A 3GRXA 1R7HA 2YJHA 1TW9A 5DALB 3P2AA 2IMEA 4I97A 1MDIA 2EIRA 2NVLA 4KUNA 1WOUA 2JZSA 2O8VB 1PA3A 5HFKA 3RPPA 1Z7PA 3L9VA 1I5GA 5CRHA 1C72A 4Z7XA 4ZL7A 3C1SA 3M9JA 2I81A 3HHVA 5EL8A 4V2NA 3HY2A 2WB9A 3DXBA 2FWFA 2LJKA 4YQVA 2H71A 3CYNA 5ECMB 2JSYA 2VAFA 4J57E 1SU9A 3GV1A 3HD5A 4ECCA 5GSSA 1JLWA 1VF3A 2L5LA 2I9HA 4NMUA 3ERWA 4N0VA 2H72A 3O3TA 3M8NA 2RUFA 4BA7A 1WWJA 3QFAC 3EMPA 1ML6A 4HZ4A 3M1GA 3VI7A 1TRSA 1TOFA 1GNWA 1OKDA 3E3EA 6GSXA 1GTAA 2FGXA 2JADA 4OFTA 3LXZA 4OO5A 3TKPA 5ELAA 4POBA 5ENUA 1WIKA 3HDCA 2WFCA 1K0DA 4D73B 3HKRA 4GSSA 2C3QA 4MA9A 2VCZA 5KN2A 2H76A 3KZQA 2I4AA 5IO2A 2WDUA 2OJLA 5KN1A 1M2AA 4FYCA 3D6IA 5JCWA 1K0AA 3TKRA 4BL7A 4JR6A 2KHPA 1FB6A 2LTKA 1GNEA 2E7PA 2H0GA 4LA1A 4TR1A 1AIUA 3Q74A 3GKXA 2C3TA 3VK9A 3EC3A 4KE3A 1ZYEA 4K7IA 2VCTA 4GQCA 3TGZA 1QGVA 4EKZA 2L57A 5F06A 1Y6EA 2LQQA 1T3BA 5HFGA 3P7XA 3D22A 1SK2A 5ECPB 3GH9A 3VI5A 4TXVA 4ULXA 4EL1A 1XZOA 2VL2A 4JBBA 3EE2A 3H4KA 4V2LA 3GHAA 3VWWA 1M0UA 2BJXA 3J7Yb 5IM9A 4OFMA 4I2TA 1GUMA 2P5RA 4IELA 3KH7A 3H93A 2LJRA 2RUEA 5ECKB 4KSOA 3ZTLA 2OE1A 3KTBA 1VF1A 1SL1B 1BAYA 5DVBA 1YEXA 1AUCA 4X1UA 2LS5A 1EEJA 3GSSA 3APSA 5B8BA 1M9AA 3UJ1A 3F63A 4HJMA 4LL1B 1Y25A 2PGTA 3F9UA 4ZILA 2L6CA 4FH8A 5ELGA 2MBTA 4GWRA 2PBJA 2B7JA 2NPBA 4H86A 2MMZA 3HA9A 2DIYA 2C0DA 5IMDA 3L9UA 4CW9A 3A2XA 4XS6A 3FZAA 2CV4A 4TXOB 1O6JA 4I5QA 4BVYA 4GTUA 2CZ2A 6GSUA 3IR4A 4MDCA 2G2QA 1JZOA 4MK3A 12GSA 2DJ3A 2ALBA 2GTUA 1DE1A 2FUG2 3DD3A 1PSQA 3U6VA 4OWYA 2A2RA 2FLSA 3DVXA 5IPHA 3GSTA 2B5YA 4DSSB 5IO0A 1Z7RA 5A4VA 4JU5A 2NDOA 5EVOA 1BJXA 5D96A 5JWQB 2YPMA 2HE3A 5DJLA 1GSEA 2XPEA 4XS4A 4MCUA 5CO3A 4AGSA 3O76A 1XWGA 4EE0A 7GSSA 2FCHA 2RM5A 3APOA 3WT1A 4IQ1A 2C0EA 3ZYWA 2FNOA 1GSUA 4F0CA 1EEMA 1G0TA 4N10A 3CSHA 1BX9A 5DAKA 5EY6A 5G1LA 2H1DA 4O32A 2QGVA 1HD2A 4MF7A 3FR3A 3EMXA 3GKNA 1LJRA 1ZGNA 1G6YA 4V1Ag 2PWJA 3GX0A 1T00A 3KJYA 4WBRD 5HFIA 4EO3A 2TIRA 3PGTA 4TR0A 3FK8A 1USBA 4HU7A 3LYKA 3KTLA 2GQKA 2R3XA 2E2GA 3RDWA 2IWTA 2BMXA 3C73A 5CRDA 4I6XA 3PH9A 4J2FA 1SKWB 5IIZA 2VD0A 3CSIA 3RHBA 2O87A 3TCOA 2M72A 3F0IA 4XRDA 2VM1A 5CYYA 3EURA 1GWCA 2XHFA 3QAWA 3CTFA 2QKEA 2F8AA 1GSSA 2CVBA 4MP4A 4G10A 3GUSA 3TKQA 1ILOA 1X5EA 4YAVA 1THOA 2OKAA 1PKZA 1PD21 2R6KA 2IJYA 2VCQA 1A0RP 3QPMA 4V2MA 1QMVA 3BBYA 4IP1A 2WJUA 1SD8A 3TJBA 2VIMA 5HR0A 2F9SA 1WPIA 4FIWA 1FW1A 3VFIA 3QDNA 1TJDA 1XW9A 1LU4A 4MJEA 2ZNMA 2HSHA 2VD1A 4DVCA 3I43A 5G1KA 2YV9A 1Z3EA 3G7JA 1TKDB 3TUEA 2A4VA 4HQSA 1QUWA 1B4QA 2DJKA 4EDZA 1ABAA 1KTEA 1RK4A 3HVXA 2LKUA 1BQ7A 1O8WA 3TRXA 4ECJA 4MJAA 5IMAA 2LRNA 4ML6A 2GDRA 2LSTA 1U87A 2OE0A 1VRSD 2YWMA 2PVQA 5AN1A 6GSSA 1ZZYA 3ISOA 3ZZXA 2J23A 4KCEA 4HDEA 2DBCA 2E2MA 4HUAA 1K3LA 2LV3A 1AAZA 3OR5A 5F0GA 2H1BA 5AISA 2VL9A 1X9SB 5D9TA 4NWYA 3BCIA 2ON5A 4ZBDA 1MD3A 3PR8A 2X99A 1A0FA 1XXUA 4WKWA 4XS1A 3ZMLA 3VWXA 4HU9A 3IPZA 1PL2A 2V6KA 3FY7A 1GUHA 1UC7A 1GSQA 5B6NA 3KP9A 2HNLA 3UL3A 4ZIJA 2MYGA 2PERA 3FZ4A 3ZL5A 3A2VA 2MBSA 1Q4JA 4ZBAA 1SK1A 16GSA 2K8VA 4TOPA 3Q6OA 2JZRA 4ECIA 4F2IA 2B1LA 4HS1A 4PGTA 4X0XA 2HZEA 5DCGA 2C0GA 2YWOA 1DE2A 1J0FA 2GSSA 4YQUA 2H01A 3LGCA 3ZVJD 2MMNA 3CRTA 1PQNA 2NBSA 1ZCPA 2WCIA 1O73A 4WEYA 3HXSA 4F0BA 1A8LA 1SKRB 4O92A 3QCPA 2LEGA 5IMZA 1F2EA 2L4CA 1XWCA 3C8EA 1EV9A 4XS4B 4TW5A 1VF2A 2P31A 2R37A 2OA7A 3IE3A 1EV4A 4GSNA 3N5OA 5KN0A 3C1RA 4JRRA 5GAND 4MZBA 2DJ1A 2L5OA 5HR2A 2IMIA 2HLSA 2L4QA 2P5QA 2X64A 1PN9A 3MAKA 2AUVA 2XBQA 2CAIA 2IMKA 2PMTA 3TKSC 5F05A 1MD4A 1SL2B 3ED3A 4Q5RA 1R26A 3RAZA 1FVJA 2XBIA 3G7YA 4MPGA 2R2JA 3MNGA 3IK7A 1QQ2A 5ECNB 2V1MA 1EGOA 3IHQA 4K7NA 3ZFLA 3A5WA 3TRPA 2BTOT 4DSRA 1QXHA 1ERUA 3EU4A 2GT6A 1W4VA 2LJAA 18GSA 2HXKA 3H79A 3TDGA 3D5JA 5FHIA 1TRWA 3EWLA 2H6XA 2CZ3A 1GLQA 2K9FA 2C4JA 4IKHA 5GSTA 1ERVA 1MDKA 5D9VA 3GMFA 1TK0B 3FR6A 14GSA 3ZREA 5JCGA 1YQ1A 2DJ0A 4WF4A 3GN3A 1EOHA 2VCWA 1BEDA 4JR4A 1TK8B 3D4MA 1TP9A 3L4NA 4JEDA 5INYA 5GAPD 3WGDA 2YV7A 4E8HA 3KM6A 3J7Yk 3C7MA 2H30A 1JHBA 3DEXA 4PQHA 2VLVA 4L0UA 4LL4B 1V58A 5E4WA 19GSA 4FYUA 4WBJA 5ECIB 1Z6MA 5IOXA 2LRTA 4MZWA 2OBIA 1FVKA 1HYUA 1XOAA 2GLRA 3C71A 5DQYA 2I1UA 3K8NA 1TRVA 2MMAA 5LCZA 4L8EA 1CQHA 2LQOA 4G9HA 1F3AA 4ZB9A 3UVTA 1GSFA 4EXJA 4JE1A 3RHCA 4GSTA 2AV4A 4FYBA 3QOUA 1YF1A 4IW9A 5G5FA 6GSYA 2F8FA 2WRTA 4GLTA 4OCFA 1F37A 3IDVA 1WE0A 3BOAA 3WD6A 1THXA 2X8CA 1WP0A 1OAZA 3ERGA 2DMLA 3EYTA 1FHEA 1O81A 10GSA 2AYTA 1X5CA 1OVNA 4ISDA 1Z5YE 4RI7A 4BWSA 2OBKA 3UARA 5ECSA 5CRWA 1PX6A 3ZITA 1MTCA 2H70A 2IMDA 4WXTA 2JSZA 5IMVA 4LLRA 1EGRA 5DBQA 1SENA 2H6YA 3TOUA 2AHEA 3UIWA 1F6MC 4ML1A 2FWEA 3VWUA 4K7OA 2CVKA 4KCAA 1GUKA 4IJIA 1R5AA 2HZEB 3KMNA 4LMVA 1M7TA 1ZMAA 4CHSA 2V32A 2HRNA 1V57A 2M46A 1TK5B 2JACA 2G0FA 2OE3A 2TRCP 1OC9A 1SJ6A 1R5PA 5B6MA 5CREA 3GL5A 4XRAA 2IFQA 4HOJA 13GSA 2H1GA 2O85A 1YJ6A 2PUKC 5LD0A 3LG6A 3A2WA 2J9HA 1GULA 1K0NA 5L71A 1GH2A 3ZRDA 4BPYA 2H6ZA 3FEUA 1A24A 2RM6A 3MWHA 2OACA 4EC0A 3LQ7A 3VPQA 3HZ8A 3U5RE 3A3TA 1V2AA 3L78A 4ZL9A 4RQXA 4RUVA 4OO4A 5CNWA 2VUPA 3UBLA 3HYPA 2CAQA 1TDIA 5C04A 1QFNA 5G31A 1A2LA 1G6WA 3TKSA 3M9KA 1TRUA 2LUSA 3APQA 3IBHA 1EWXA 2CQ9A 2KLXA 5H5SA 1SJIA 3CRUA 2YCDA 1GL8A 1TI1A 3G9BA 3TJKA 3IV4A 4NXIA 5G5EA 5F8BA 3CBUA 1T4YA 1NW2A 3LSZA 3KP8A 2F3MA 4IBPA 2L59A 4Q5NA 4KW6A 3AY8A 5ECOB 3FYGA 2GSQA 1TI3A 3GNJA 5KN3A 1M2DA 5IPGA 2YN1A 4QL7A 4EUYA 3FZ5A 1I9DA 3BD2A 1IYIA 4K1FA 3HJMA 1MDJA 1X9WB 2DJJA 3DVWA 3W8JA 2O7KA 4PXOA 4PUAA 3HCZA 3M3MA 1GTUA 2XPDA 1X0RA 1B4PA 4ID0A 4EF0A 1XW5A 4ECBA 4LMWA 2IMFA 4TR1B 1GTIA 3LFLA 2KP2A 4CDOA 2DJ2A 1JZDA 1B48A 6GSWA 1CQGA 3QR6A 3F4SA 1SYXA 4MPFA 3F8UA 1FB0A 5ABRA 2KP1A 3TKSE 3DRNA 1S3AA 2DC5A 2FHEA 3EU3A 3IC4A 2L6DA 3IK9A 5J9BA 3R2QA 2WULA 4EDYA 1ZOFA 1AW9A 1K0OA 2HSYA 4AJ6A 1OC8A 4KA0A 3I6AA 4GQFA 2B6MA 1FO5A 3IAM2 1XIYA 1B9YC 2FD3A 4E8EA 1OE7A 2VL2C 3TJJA 4X43A 1A2MA 1J08A 2D2ZA 4K6XA 3VURA 4L5LA 3UBKA 2H8LA 1T8EB 1M9BA 2QSIA 1UA5A 3G7IA 5AGYA 1N2AA 1YZXA 2PN8A 3NIVA 5ECLB 1XW6A 2F51A 1ACVA 1K3YA 2V41A 2GQLA 1XWKA 5E59A 4MZCA 1TU8A 1OYJA 2HZFA 3E0UA 2N5AA 2K18A 4NV2A 4QL9A 5DCHA 3FRCA 4F03A 4MF5A 5FWGA 4IVFA 1JLVA 3FKFA 3HVVA 3ZMKA 3GA4A 1TXXA 4NHZA 2VLTA 2B3SA 1Z6NA 4F9ZA 1PX7A 2FA4A 3WYWA 1OC9B 3TJGA 1NM3A 4PX1A 1A2JA 2AJQB 3SBCA 1SKSB 5HQPA 2IFQB 4KDYA 1PKWA 22GSA 4HJ2A 4IN0A 4TXOA 5J9CA 1Q98A 1UVZA 2H0IA 4YQMA 5CAXA 5ECRB 1PGTA 4ILFA 3GIXA 4HEA2 2HYXA 4F82A 4AF2A 1HNAA 4L5OA 1SJZA 1FG4A 3WGXA 4NPBA 4MF6A 2B5XA 3UMAA 2CA8A 3D0ZA 3D21A 4Q5FA 3LJRA 2YZHA 3L9SA 4I2UA 2H1AA 4IP6A 2WZ9A 1AXDA 4EVMA 2VL3A 3ME7A 1U3AA 2GSRA 1JFUA 2DLXA 3QFBC 5F07A 1W89A 5JWOB 5DAKB 3LORA 2AAWA 3F3RA 4QQ7A 4PQIA 1RQMA 3LEFA 5D9WA 3GX8A 2E0QA 2GZPA 3KGKA 2YP6A 3IXRA 3L0HA 1O85A 1Z9HA 3GFKA 4GF0A 4ZXGA 4GRFA 3F6FA 3LYPA 2H75A 5B8AA 1OE8A 2VOCA 4WETA 3P8WA 4J56E 4IS0A 1V40A 1K0MA 2C3NA 3IRAA 4XIHA 4PNGA 4K9ZA 4DSQA 5IQYA 2WS2A 3S9FA 1S3CA 5A4WA 3IOSA 2MMOA 2JU5A 3KH9A 5GZZB 2C8UA 1G7OA 2H66A 2YOIA 2RIIA 1M2BA 2M80A 2VCVA 1PL1A 4O7HA 3UAPA 5ECHB 2P0GA 3HJOA 1S3DA 2DIZA 5CP1A 1IYHA 2ZUPA 2DSAA 2DMMA 1A23A 4KNDA 3E9JB 3F4TA 5J41A 1VGLA 5G30A 1J9BA 3H1NA 1YY7A 5FT3A 5D9XA 2HRFA 1T4ZA 1BYEA 2R5GA 4TN8A 2O89A 4FO5A 3LXTA 1AC1A 1XBSA 3HJPA 3F4RA 2EC4A 1ERWA 4PURA 5J5NA 3GH6A 1UN2A 2KOKA 2H0HA 1ZYQB 2IIYA 5B7CA 5JCUA 1SL0B 5G2ZA 4I8BA 3KD0A 5IMCA 1JZWA 1FOVA 3TB2A 4K0NA 2YWNA 5ECQB 1HQOA 3QMXA 3ZFBA 2HT9A 2IPAA 3KMOA 3LWAA 4KDUA 3GYKA 1AQXA 1GP1A 1PMTA 5A4UA 4OD7A 2VO4A 4HQZA 1URMA 1K3OA 5D93A 3MDKA 1AQWA 3I9V2 2C0FA 1DBYA 2GSTA 2K6VA 1SD9A 3ZIJA 5DDLA 3TOTA 3GURA 4TR3A 5IMFA 2B7KA 2K8SA 2YNXA 3W8SA 4IGJA 4ACSA 4MMMA 5C00A 4G2EA 5LNKe 4KX4A 1XWBA 2HFDA 4AJ8A 1F3BA 1DUGA 1WMJA 3F6DA 1XPVA 2H73A 3GTUA 3FR9A 4NAXA 4MJCA 4MH2A 4MABA 3GKMA 4HI7A 3VLNA 4NHWA 1GLPA 2YANA 5EPFA 5CRGA 2MZCA 4HZ2A 1JZRA 2YJ7A 4N30A 1XWAA 5HR3A 2X8HA 2VM2A 1U3IA 1E6BA 1PRXA 1B8XA 1NHYA 1M99A 3HZ4A 3N9JA 2XC2A 3DWVA 3EVIA 5A5KA 1EP7A 4TR4A 4IQAA 3KXOA 3DMLA 2GT5A 2FWGA 2PVOC 5D8IA 3CTGA 4OCEA 1ZL9A 4MLYA 3DIEA 5J4UA 1OC3A 4G19A 3W6GA 3TJFA 1GSYA 1H75A 5ID2A 2EIOA 1T7PB 2IN3A 1ERTA 3WT2A 5DJMA 1KNGA 9GSSA 4P3YB 2YZUA 1H4OA 1HNBA 5JWRB 4V1Ap 3QD9A 2GZYA 4N0ZA 2A2SA 3HVSA 4POMA 2JL4A 1YF0A 1G7EA 2H74A 5DALA 1N8JA 2IL3A 1U88A 3QAGA 2V6OA 1X9MB 2OADA 3O6TA 3MSZA 4JZQA 1ST9A 2AB6A 3DKSA 5COHA 1XVQA 3VPTA 2B1KA 3BCKA 2PU9C 4PQ1A 3I69A 5DQSA 3ME8A 4KB3A 2N5FA 4IHUA 4KH7A 4GXZA 3GKKA 2KUCA 1YKAA 1EOGA 3H8QA 4PNFA 5HR1A 3QAVA 3D4TA 4WF5A 4K8MA 4KGIA 2EIQA 3ERFA 2C80A 17GSA 4PUFC 1O7UA 4TVEA 4XHMA 3KIJA 4ZB6A 4XTSA 1BG5A 3NZNA 4L0WA 1EZKA 1SK0A 4TKYA 2LNTA 2B5EA 2YWIA 3US3A 4N11A 1TTZA 11GSA 3ZLPA 1MEKA 4D73A 3WGEA 2Z9SA 1HNCA 2REMA 3DGQA 4DEJA 3KCMA 1A8YA 1XOBA 1YEPA 5AIXA 4AJ7A 2I3YA 4K2DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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