3ZYWA

Crystal structure of the first glutaredoxin domain of human glutaredoxin 3 (glrx3)
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
DLNLRLKKLTHAAPCMLFMKGTPQEPRCGFSKQMVEILHKHNIQFSSFDIFSDEEVRQGLKAYSSWPTYPQLYVSGELIGGLDIIKELEASEELDTICPKAAENLYFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of the First Glutaredoxin Domain of Human Glutaredoxin 3 (Glrx3)
rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN-3
molecule tags Metal binding protein
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zywA01
3LWAA 1W89A 4IQ1A 3ED3A 2CAQA 2B7KA 1ERWA 1JZRA 2IN3A 2I81A 3U5RE 2CQ9A 1NM3A 5ECOB 1HD2A 2WULA 1HNCA 4XHMA 1Z6NA 2L5OA 4EXJA 1F2EA 3TRQA 4YH2A 2LJRA 3IAS2 1WJKA 2PVOC 2YV7A 1YQ1A 2CV4A 4P3YB 2OADA 4G2EA 2MMAA 5ECKB 5IQYA 3I6AA 4MJCA 2VL2C 5COHA 3L78A 2B7JA 3WT2A 1ACVA 2MMOA 3TUEA 1U3IA 3UOMA 6GSYA 8GSSA 2C0EA 2HXKA 2O7KA 3TGZA 3QMXA 1GLQA 3KGKA 1XOAA 2FA4A 1NSWA 3E3EA 3HZ8A 1JLVA 2C80A 1OKTA 1OAZA 5ECIB 1FAAA 2EIQA 3LYKA 5GSTA 3IPZA 4AJ6A 2DBCA 1XWGA 5DALA 1R5PA 2VCQA 3TCOA 1TI3A 4IVFA 3DEXA 3CRUA 3EWLA 4I2UA 6GSSA 3IXRA 2H0HA 3KZQA 3KP9A 1A8LA 4XCSA 1V2AA 2X8HA 4ZILA 2GT5A 2JSZA 1H75A 5IPGA 2GSRA 3ZFBA 2GLRA 4TKYA 3C71A 1UC7A 4KAEA 2H0IA 4AJ7A 5AGYA 1SKRB 2LJAA 4FIWA 1FW1A 1FHEA 3HY2A 4Q5RA 2WJUA 3ZZXA 1BQ7A 3FY7A 5HQPA 3A2WA 2O87A 5LCZA 1XOBA 2IMIA 2WFCA 3O6TA 1SKSB 2YOIA 1G7OA 5IIZA 2L5LA 4NAXA 1JHBA 2L59A 4NV2A 4TN8A 3UVHA 1MTCA 4ECJA 4ZXGA 3L9SA 2DJJA 2YWIA 2C3NA 2JZTA 3KMOA 4EDZA 1GLPA 2OKAA 2VLTA 3DGQA 5D73A 3GNJA 1OC8A 4OD7A 1FVKA 4WF4A 3F8UA 2D2ZA 4XTSA 3DKSA 3J7Yk 5IO0A 3G7IA 1O8XA 2RIIA 4Q5FA 2JU5A 4OCEA 3KCMA 3OR5A 3TKSE 3CRTA 3D6IA 3LXTA 3L4NA 1LU4A 2GZPA 3LFLA 4QQ7A 9GSSA 4AJ8A 2LV3A 2FY6A 3KP8A 1O85A 3EURA 4POBA 5G31A 3TRPA 1EZKA 2GZZA 4KNDA 1XXUA 3RDWA 1O7UA 2HFDA 2H1BA 5D93A 1Z6MA 6GSUA 1TRVA 3TJGA 1S3CA 3KXOA 2FLSA 3GV1A 4RI7A 4GSNA 2E2MA 1UVZA 2XHFA 1I5GA 1THXA 1U6TA 4NV5A 1GNWA 2PBJA 1BEDA 4MJBA 4K0NA 2IIYA 5F07A 5D9TA 1ON4A 5EVOA 1U3AA 1TRWA 1G7EA 1HYUA 5ECQB 2CT6A 3Q18A 1SL2B 1ZMAA 1THOA 5JCUA 1ML6A 2C0FA 5GAPD 4ID0A 4HU9A 4GSTA 1SJZA 5ECMB 5CRDA 2C0DA 2HRFA 4IW9A 1OC9A 1Z7PA 1ERTA 2IMFA 1TDIA 5IMAA 2LNSA 5IOWA 2AJQB 2WDUA 2I9HA 2JADA 3D21A 2JACA 1J08A 3CXGA 2H0GA 4I5QA 3RBTA 3FR3A 4HEA2 3ZL5A 1N8JA 2FNOA 3EMPA 4WEYA 4F9ZA 5D9XA 1YY7A 4TXOB 3KJYA 1DSBA 3VURA 5KEJA 1TK0B 3VFIA 3FZAA 5J5NA 1M99A 1XWBA 1K3LA 3FZ5A 3ZIVA 4CHSA 3O76A 4PNFA 1GSUA 1X5DA 2F51A 1XW5A 3GRXA 4MK3A 4X0XA 3EU3A 3ZIJA 2HZEB 5DQYA 3RHCA 3TKRA 2BMXA 3GMFA 4GQCA 4EC0A 3F63A 5J4UA 1TU8A 3FEUA 4MABA 5INYA 4PNGA 4N0ZA 2LNTA 4IJIA 2V32A 10GSA 5C00A 1OE8A 4HQZA 4WETA 5KN0A 3PINA 3VI7A 2B6MA 5H5SA 1GSYA 3GFKA 2OA7A 2H73A 3I9V2 2C4JA 3GUSA 1EP7A 3GURA 4KSMA 1W4VA 2B5XA 3UBKA 1ILOA 2VL3A 1YF0A 5F8BA 4X43A 1A2LA 1GTBA 3GL5A 3QCPA 3IBHA 5EY6A 4X1UA 3HYPA 4J2FA 3P90A 2X99A 1V9WA 3WT1A 1EV4A 2VL9A 3GYKA 3N5OA 2HI7A 5D9VA 2IJYA 3H4KA 1YEXA 3UVTA 3F3QA 4J57E 3K8NA 5LD0A 3QOUA 4L5LA 5D9WA 4WR4A 4NPBA 1X9MB 4MH2A 2ES7A 2B1KA 1WWJA 3NIVA 5B7CA 2AYTA 1CQHA 2PVQA 4ZL7A 1F37A 1EOGA 3TRXA 4BPYA 5ELAA 1PSQA 1WP0A 2JZRA 3QAVA 4DEJA 2YWOA 5DAKB 4HI7A 2H01A 3HD5A 3IOSA 1PKZA 5FT3A 1GSDA 2ON5A 3VWVA 1XWCA 1GUMA 1K3YA 2WCIA 5GSSA 1HQOA 2PERA 2P5RA 1G6YA 1RQMA 2H71A 5ABRA 4HUAA 1NHYA 3C1RA 2KP2A 1VRSD 2NDOA 2L6CA 3GH9A 1GSSA 1UA5A 1IYIA 4MZCA 1B8XA 4TXVA 5B6MA 3P8WA 5DCGA 1KEBA 2P0GA 1OYJA 3UARA 1XFLA 20GSA 3GTUA 3TOTA 1OKDA 3APSA 4K7IA 4HU7A 2CX3A 4KUNA 3F4SA 2YN1A 1PMTA 4ZBDA 3QR6A 1EGOA 5DALB 2IFQA 5FHIA 4LLRA 4FYCA 1QMVA 1ERVA 3SBCA 2EC4A 2MYGA 3F4RA 2K8SA 2B5YA 5ID2A 1PGTA 3BD2A 5IMVA 1PD21 4FYBA 3ERWA 5EL8A 2FWFA 1SL0B 2DMMA 3GX8A 4TR3A 3ZYWA 4GXZA 2V2GA 3E9JB 4JR6A 1T1VA 3TOUA 2YPMA 4KSOA 4LMWA 2N5FA 1YDKA 2PN8A 2FD3A 1A0RP 3HVVA 4KH7A 2HLSA 5DJLA 3FRCA 18GSA 3A5WA 3H79A 3VK9A 3Q6OA 4IP6A 16GSA 4GTUA 1PN9A 1K0OA 3HXSA 1TK8B 2CZ2A 6GSTA 4L0WA 5HR3A 2GQLA 1F9MA 4O7HA 3IK9A 3ZTLA 3DVWA 1VF2A 3HA9A 1X5EA 2TRCP 1JZOA 3G7JA 1TTZA 3G9BA 4I2TA 3VPQA 2P5QA 5HFGA 1F3BA 2MMNA 2VM2A 3ZLPA 2LRNA 4K7NA 1V58A 1XBSA 4MMMA 3EC3A 3KEBA 4ECBA 2LUSA 5CREA 3J7Yb 1G0TA 4JBBA 2V1MA 4BWQA 2B5EA 1SD9A 4OCFA 2AV4A 3HVXA 5GZZB 3DRNA 1USBA 3ME7A 1TRUA 5AISA 5KN2A 1FO5A 1WRYA 1U88A 5G5FA 5CRHA 2KOKA 4HQSA 4ISDA 4I6XA 1B9YC 4KB3A 5CAXA 3F0IA 3QAWA 2IMEA 5A5KA 2O85A 2WB9A 4IBPA 3US3A 3PH9A 4V1Ag 1Z9HA 1XWKA 2OJLA 4JZQA 3DXBA 2VAFA 1F3AA 1EGRA 2M46A 2GDRA 3IK7A 2XPEA 2DIZA 1XVQA 5F06A 3F3RA 3LG6A 4BVYA 2H1GA 3A2VA 1SK0A 1XW6A 3VWWA 2H6ZA 3QAGA 1FG4A 3E0UA 2VUPA 1EWXA 5J3RA 2YWMA 1ZOFA 5A4UA 1K0MA 4BVXA 4ML1A 2YWNA 2TIRA 4F2IA 1SL1B 2X8GA 1WOUA 5G5EA 6GSVA 3IAM2 3TJBA 3HJPA 4IKHA 4LA1A 1GL8A 1TRSA 4IJ3A 2K8VA 4XRDA 2HNLA 3L9VA 4ZIJA 1BG5A 3L0HA 1LJRA 2QC7A 3GL3A 1QK8A 4OFMA 1WMJA 3HHVA 4EO3A 2TRXA 4RQRA 3F4TA 5DJMA 2CVDA 2L6DA 2DIYA 3MWHA 19GSA 3ZVJD 2B1LA 5CYYA 1HNBA 2C3TA 4NMUA 1AAZA 3NOFA 1PRXA 3KM6A 2GSQA 1A24A 1V57A 4N11A 3KTBA 2VM1A 4K0GA 1EP8A 1MEKA 2HYXA 3EYTA 3IR4A 5ECNB 1DE1A 2FA8A 4JR4A 2FGXA 3DIEA 5CRGA 1V98A 3EU4A 4IS0A 7GSSA 3GHAA 1KNGA 3HKRA 5JCGA 4KDXA 1X9SB 3RPNA 1TI1A 1O8WA 4KX4A 1AUCA 2RM5A 4GF0A 5IMZA 2OBKA 3CTGA 4KCEA 1B4PA 1M2DA 3QPMA 2OE1A 3TDGA 1SK1A 1PKWA 2PMTA 4K9ZA 1Z3EA 5F05A 2H6XA 4O92A 5G1LA 1ST9A 4EVMA 3WGXA 1XPVA 4OO5A 3AY8A 2JZSA 1AW9A 3KH9A 4XS6A 2GQKA 3CSJA 3UBLA 5H5QA 1F6MC 1VGLA 1GSFA 4Q5NA 1GSQA 3WYWA 3F6FA 2HE3A 3D4TA 4KE3A 1QQ2A 2G0FA 3QD9A 1XZOA 2LKUA 2HZFA 4EDYA 5ECLB 1X0RA 3N9JA 1AQVA 5DVBA 1C72A 1Q4JA 1E6BA 2E2GA 3ERFA 3FK8A 4WKWA 3BBYA 3GKXA 2VIMA 2AB6A 3CMIA 2L57A 4E8HA 3D22A 5HFKA 2FCHA 1TP9A 1SK2A 3O3TA 2R2JA 3HDCA 1TW9A 4V2LA 2FWHA 3MDKA 1PX6A 1T3BA 4H86A 2KHPA 1Y25A 4V2MA 4YAPA 3WD6A 2I1UA 5HR2A 6GSWA 5ECHB 4TVEA 3KH7A 1BX9A 2LRCA 3IHQA 4PXOA 2LQQA 5JWRB 3U6VA 2GT6A 5J9BA 2PWJA 1U87A 2YZUA 2IL3A 3LSZA 4PQIA 3ZREA 4ACSA 1YJ6A 1A0FA 3KIJA 3M9KA 4N10A 4ZB9A 1OVNA 4PUFC 1TOFA 4KW6A 1K0BA 1FB6A 3LORA 1SYRA 4GRFA 2IMDA 3FW2A 1GNEA 1GWCA 2BTOT 3RPPA 2X64A 3C8EA 4XS4A 4AGSA 4DSSA 2ZCTA 3Q19A 2LJKA 4BA7A 5AIXA 1YKCA 5HR1A 3H1NA 1HNAA 4L8EA 1GSEA 2DSAA 2IFQB 3CTFA 3EE2A 5JCWA 1DBYA 2DJKA 3EINA 2NTOA 1I9DA 2HRNA 3CYNA 2MZCA 3LEFA 3RAZA 4OFTA 5ID2B 5DBQA 4KA0A 4TR1A 4ZL9A 5DDLA 2DJ2A 5L71A 3M0FA 2YANA 3GSSA 1M2AA 1R7HA 3IC4A 1G6WA 1EEJA 3D4MA 1IYHA 4IQAA 2GGTA 1ZGNA 2VLUA 3FYGA 4G10A 4PQHA 4K7OA 3DD3A 1M0UA 3CSIA 3KTLA 3QFBC 4EF0A 1ZL9A 4HOJA 3APOA 3A2XA 2EIRA 5E59A 3UMAA 4NHWA 4L0UA 2GVPA 5B6NA 5ECPB 1K0AA 2YCDA 4MF5A 1GP1A 1K3OA 1N2AA 4YQMA 1YEPA 5AIVA 1AQXA 3CSHA 5DQSA 4YAVA 3FHKA 4F0CA 1BJXA 3EMXA 1VF1A 3BJ5A 3S9FA 1TU7A 3ERGA 4YQVA 2M72A 3GSTA 4XRAA 2GTUA 1Q98A 1BAYA 2KP1A 3KD0A 5CNWA 4F03A 2A4VA 1VF3A 2NVLA 4HDEA 3CBUA 3M8NA 3I43A 3QFAC 5ENUA 4RI6A 2R3XA 3ME8A 4K1FA 1S3AA 4EUYA 1MDJA 6GSXA 2FHEA 3I69A 2RUEA 4ECIA 2FUG2 2H70A 4CDOA 2GSTA 1AQWA 4AF2A 1AIUA 4LL4B 4KDUA 2GS3A 2VOCA 4ZB6A 2H19A 2PPTA 3F6DA 4ECCA 1GH2A 3D5JA 5G1KA 1Y6EA 2FWEA 4HZ4A 1QGVA 1NHOA 2O89A 5B8BA 3P7XA 2DJ0A 2H66A 3C1SA 5DCHA 2LSTA 2H8LA 2YNXA 4NWYA 3ZMKA 4TRXA 3Q74A 2ZNMA 4ZB8A 5IM9A 2XBIA 4EE0A 3PR8A 2YJHA 2P31A 2CA8A 3BOAA 3IA1A 2REMA 1T7PB 2IMKA 2CX4A 1TK5B 3MNGA 1O73A 4JRRA 3TJKA 13GSA 1PL1A 4XS1A 3UL3A 1R26A 1SJ6A 1A8YA 2M80A 4HZ2A 3PGTA 5D8IA 1DE2A 1J9BA 4O5RA 3H8QA 5F0GA 3SWLA 1SU9A 2H76A 5DAKA 5CP1A 1RW1A 1B4QA 2L4QA 2CVBA 3DYRA 3HZ4A 1GULA 1OE7A 3NZNA 1RK4A 1GRXA 1SYXA 3VLNA 1YF1A 3C7MA 1T4ZA 2JSYA 2RM6A 2NPBA 2R4VA 5ECSA 4MZBA 1E2YA 2K9FA 4MJEA 1JFUA 1EOHA 3LQ7A 3V1WA 2ALBA 2XBQA 2K6VA 4FH8A 4D73A 1DUGA 3GA4A 3ZMLA 1T00A 1PA3A 2F8AA 2Z9SA 3LGCA 4O32A 5EPFA 2E0QA 1XCCA 3UAPA 2V6KA 4LL1B 3DMLA 4MJAA 4N30A 5KN3A 1TXXA 5IMDA 1PQNA 4WBRD 2YV9A 4WBJA 1FOVA 4RUVA 2OBIA 4OWYA 2GZYA 3TJFA 2C0GA 5CRWA 3HVSA 2DMLA 1O81A 2KUCA 4OO4A 14GSA 4ZL8A 1ZCPA 1JZWA 3BCKA 3VWUA 3LXZA 4TW5A 2NBSA 2VCWA 4IN0A 1GUHA 4OMVA 1ERUA 4OFNA 4TR4A 2CZ3A 3W8SA 1GUKA 1PL2A 4WXTA 4WR5A 3C73A 1XWAA 2LTKA 1WPIA 1OC9B 3FZ9A 3FKFA 2H75A 4PQ1A 2MMZA 4JE1A 1GTUA 3G7YA 4QL9A 2E7PA 2FWGA 2RUFA 5ECRB 2N5AA 1M9AA 4MP4A 3W6GA 4DVCA 1JLWA 2V6OA 1Z5YE 1MD4A 3GX0A 2QGVA 2WZ9A 1GTAA 3GKNA 3VI5A 4MZWA 4ZBAA 2H1DA 22GSA 5LNKe 2QKEA 3TKQA 3TB2A 2GQMA 4F0BA 2LS5A 2XPDA 1Z7RA 4GQFA 3RHBA 4POKA 2V41A 4GSSA 4N0VA 5D96A 5H5RA 17GSA 1B9XC 1R5AA 1K0NA 4MDCA 1B48A 2R37A 1A2JA 2G2QA 4HJMA 5A4WA 1O6JA 2A2RA 4J56E 4XS4B 4DSSB 2H1AA 2HSYA 3IRAA 4GCIA 5C04A 3TKSC 4GWRA 1SJIA 1J0FA 3ZVJA 1XVWA 4Q5QA 2YJ7A 2DC5A 2DJ3A 2PU9C 4KDYA 2VL2A 2H6YA 4MLYA 1XW9A 1JZDA 4ZBBA 5G30A 2B3SA 4TR1B 3BCIA 1V40A 5AN1A 1LBKA 2J23A 1M9BA 2DJ1A 3FZ4A 2CVKA 3GIXA 4YQUA 5B8AA 4HJ2A 2BJXA 3P2AA 4F82A 3DWVA 1YKAA 1VF4A 3UJ1A 2X8CA 1MDKA 4G9HA 4FO5A 5ELGA 1KBNA 2MBTA 3R2QA 5IMFA 3ZRDA 5GAND 2O8VB 2CAIA 5KN1A 1ABAA 3IE3A 4POLA 4DSQA 2R6KA 3GKKA 4NHZA 4ILFA 2VCXA 3L9UA 3GH6A 1A23A 3HJOA 4PUAA 3LYPA 2OACA 4MPFA 3HCZA 1PX7A 2N5BA 4KCAA 4I97A 2YP6A 2PUKC 4BWSA 2LRTA 2C8UA 4Z7XA 1M2BA 4E8EA 2WGRA 2MBSA 1SKWB 2AUVA 2VO4A 4K2DA 5HR0A 2HT9A 4QL7A 3ISOA 2HSHA 1QUWA 1FVJA 3M3MA 4DSRA 3GTUB 2WS2A 4HS1A 4PGTA 3FR6A 3WGDA 4MA9A 2K18A 4TR0A 4POMA 3APQA 2VCZA 1EV9A 5IMCA 4MH3A 2WRTA 4MF6A 3LJRA 2ZUPA 4IGJA 4FYUA 4MCUA 2L4CA 2F9SA 3VWXA 1BYEA 2VCVA 1AXDA 4RQXA 1KTEA 1ZYQB 2OE0A 1CQGA 3ZFLA 2VLVA 1QXHA 1WIKA 1T8EB 4V2NA 4ML6A 1EEMA 2R5GA 1TJDA 4PX1A 1NW2A 4G19A 1X5CA 3MSZA 4K8MA 5IO2A 4IHUA 3TKSA 4XIHA 4MF7A 3JCML 5G2ZA 1S3DA 5IPHA 5J41A 4LMVA 4KGIA 1FB0A 3TJJA 4IELA 4PURA 3TKPA 2I3YA 1MDIA 3W8JA 2AAWA 4TOPA 1R4WA 1ZYEA 5FWGA 1URMA 4BL7A 1MD3A 2GSSA 1K0DA 3EVIA 2DLXA 3H93A 5A4VA 11GSA 2ON7A 2YZHA 1YZXA 3IV4A 4GLTA 3ZITA 2XC2A 3HJMA 3IDVA 4TXOA 4NXIA 4V1Ap 12GSA 2LEGA 3GN3A 2H74A 2IPAA 4JU5A 3UIWA 2H72A 2H30A 4K6XA 1K0CA 2J9HA 2VD0A 5JWQB 1X9WB 3D0ZA 4WF5A 2HZEA 2C1YA 4MPGA 2LQOA 3FR9A 5IOXA 2A2SA 2AHEA 1TKDB 1GTIA 1A2MA 1QFNA 4D73B 2PGTA 2F8FA 2IWTA 3UEMA 3MAKA 4IP1A 1SENA 3M1GA 4L5OA 3M9JA 2JL4A 1WE0A 1XIYA 5CO3A 3WGEA 2F3MA 2OE3A 1OC3A 4EL1A 4I8BA 2EIOA 3QDNA 3VPTA 5HFIA 5J9CA 2KLXA 2VCTA 3GKMA 2RLIA 2C3QA 4EKZA 3F9UA 2QSIA 1SD8A 1UN2A 1H4OA 2VD1A 4ULXA 4CW9A 5E4WA 1AC1A 1T4YA 3KMNA 2I4AA 5JWOB 4JEDA 3DVXA 1M7TA 3A3TA 1ZZYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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