3A2XA

Peroxiredoxin (c50s) from aeropyrum pernix k1 (acetate-bound form)
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
243
structure length
243
Chain Sequence
PGSIPLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVSTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLHAESATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRCLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of peroxiredoxin from Aeropyrum pernix K1 complexed with its substrate, hydrogen peroxide
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
molecule keywords Probable peroxiredoxin
total genus 80
structure length 243
sequence length 243
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 3a2xA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3a2xA01
2CT6A 4CDOA 2XBIA 5IMAA 1WWJA 1XXUA 5G31A 3J7Yb 5DBQA 1T1VA 2O87A 4E8EA 5IOWA 2JZRA 3IR4A 4FIWA 1SL1B 3I6AA 2CX3A 3UBKA 5G1KA 2KOKA 5DCHA 3M9JA 2WJUA 1TTZA 3K8NA 3FR6A 4EXJA 1URMA 4I97A 5GZZB 5ECNB 2L5OA 4F0BA 1ZL9A 1FVJA 2H8LA 5ECMB 5CNWA 1BYEA 20GSA 3L0HA 1ERVA 3LGCA 18GSA 5A5KA 1MTCA 4XS4A 1XZOA 4WXTA 1ABAA 3WGXA 3ZITA 2RIIA 5ID2B 5KN0A 1AC1A 1OYJA 2CV4A 1KNGA 3UBLA 1PMTA 1O73A 3KCMA 1WMJA 2B1KA 2H0HA 4I8BA 2PWJA 2R5GA 1UA5A 3BD2A 2H73A 4V2NA 2V41A 1R5PA 2EIQA 4IVFA 2F8AA 4V1Ap 1OVNA 2GDRA 4YAPA 2FLSA 1V9WA 2DJ2A 1VF1A 2E2MA 2QGVA 3EMPA 3HY2A 1BG5A 1K0MA 3HJOA 2YANA 3IAS2 1ON4A 2L5LA 2VLTA 4JRRA 2O7KA 1EGRA 4HZ2A 2F51A 2XBQA 4ZL7A 1DUGA 4O5RA 4OFNA 5HFKA 1E2YA 2K8VA 2L4CA 4YQMA 1GNEA 2XC2A 3ZIVA 5LD0A 1VGLA 1USBA 1ML6A 4MJCA 1QFNA 2OKAA 3I9V2 1HNBA 2NBSA 4K9ZA 3I43A 1TXXA 2LUSA 3CMIA 4HOJA 4KB3A 4IELA 4GF0A 2NDOA 2RUFA 1R7HA 1U87A 3WT1A 2LNTA 5JCGA 2V6KA 2WGRA 3UVTA 2VOCA 4OO4A 1YJ6A 3PINA 4O92A 1ERWA 5EPFA 2X8GA 5COHA 4DSSB 4IW9A 1PQNA 3EVIA 2GQMA 2YP6A 1XW5A 2V1MA 2VM2A 2XPEA 5JCUA 1HNAA 4F0CA 2RLIA 2JL4A 2YWMA 2YV9A 2V2GA 4POBA 4XRDA 4NHZA 1W4VA 3ZZXA 2OJLA 2YOIA 1XOBA 1M9AA 2ON5A 1ST9A 2OBIA 3LG6A 4BWSA 1ERTA 1G7EA 4I2TA 5F06A 3ISOA 2C0DA 2VCQA 2MMOA 4HS1A 2YZUA 3QD9A 2BTOT 4HJ2A 3IAM2 1GP1A 2DJ0A 3TUEA 4F9ZA 4DSSA 1HQOA 2I81A 2C3QA 3IC4A 5KN1A 2DJ3A 3IE3A 1FG4A 1WPIA 4D73B 1K0OA 2C3TA 3GIXA 3HD5A 2OE0A 3H93A 2C0EA 4I6XA 4OCFA 3GH9A 4IN0A 5KN3A 3BCKA 1GTAA 1PX7A 3FKFA 22GSA 5F0GA 4HUAA 7GSSA 5A4VA 1A8YA 3TJKA 1PKWA 3GX0A 2PERA 3DRNA 4RI6A 4KCAA 3GKKA 1IYHA 3KH7A 4ID0A 4MF7A 3PR8A 4ECJA 4CW9A 4GQCA 5DJMA 1OE7A 4K7NA 3WGEA 1WRYA 3QPMA 5AGYA 3J7Yk 1TJDA 1N8JA 2FWFA 3LSZA 4D73A 1A24A 3DVWA 2WS2A 5IIZA 1AQWA 4I2UA 5GSTA 4EUYA 4FH8A 5INYA 2I4AA 4MK3A 2MZCA 2MBSA 1GSYA 5HR1A 3TJFA 8GSSA 4MZCA 5JWQB 4MJBA 2B5YA 4TR0A 3FRCA 3CXGA 3A2VA 2H1DA 1O8XA 2J9HA 2KLXA 3LXTA 3ZMLA 2FNOA 5FWGA 2H01A 3L9SA 4HU7A 2LSTA 2LRNA 2EIOA 1GSSA 11GSA 2LRCA 1YF1A 3D4TA 5ELAA 3UAPA 2HSYA 1VF2A 3R2QA 6GSTA 3CSIA 3GUSA 4E8HA 1F3AA 5J4UA 2GSRA 3GFKA 1GSEA 2M80A 4PQHA 1NM3A 3TOTA 3TRPA 3TOUA 2HZFA 3HJMA 3ZFBA 2F3MA 1XWCA 4V1Ag 4HJMA 1TRWA 2L6DA 2PGTA 3L9UA 17GSA 4N30A 3HZ8A 3WGDA 2B7JA 5E4WA 4BA7A 5ECLB 1GUHA 5HQPA 2YJ7A 1OAZA 2PVOC 4Q5QA 3QR6A 2N5FA 4Q5RA 1YKAA 3P90A 3GV1A 1A2LA 4PXOA 2KHPA 3KP9A 4PGTA 1GLQA 1U3IA 1A2JA 4HI7A 2DC5A 2RM6A 4GCIA 4ACSA 4EDZA 1V57A 3IXRA 5B6NA 3NIVA 1W89A 5IMCA 4DSRA 5D9WA 4MA9A 4XTSA 2L6CA 4PQ1A 3TGZA 5ECHB 3M3MA 4KSMA 4OFTA 4ML1A 1JLWA 4RI7A 2ZNMA 2XPDA 3FZ9A 4O32A 1Z9HA 3DGQA 5DQYA 4BL7A 4MJEA 1K3YA 3HYPA 1K0NA 3LQ7A 3GURA 2HNLA 2XHFA 4ZXGA 2JADA 3RBTA 1SJIA 1OC9B 6GSUA 1SD9A 5HR0A 1B8XA 3CRUA 4K7IA 5G1LA 1WOUA 3BBYA 4KSOA 1GTIA 1SKWB 3VWXA 1QUWA 2KP2A 2AJQB 1TI3A 1Q98A 4TKYA 1Z5YE 2X64A 4TW5A 3FK8A 3H4KA 4EE0A 1JFUA 4KX4A 2L4QA 5CRGA 1AW9A 2RM5A 3EC3A 1ACVA 4HZ4A 5ECKB 1U88A 5IMZA 2O8VB 3HHVA 3Q6OA 3KJYA 4WF5A 1K3OA 5D93A 3QAWA 3H1NA 2M46A 4K2DA 1GH2A 5ECIB 4MPFA 5JWRB 4AJ6A 1YF0A 1OC9A 4O7HA 3G7JA 4K1FA 1BAYA 3TKSA 3VFIA 5EVOA 2HYXA 1FB6A 1XWBA 2A4VA 1MDJA 1EZKA 2H6XA 1WIKA 1XVWA 2WRTA 3EE2A 1F2EA 1V2AA 3Q19A 1TK8B 2YPMA 1ZYEA 1K0AA 3L78A 3ERFA 1VRSD 1MD3A 1Z3EA 3WD6A 2C4JA 3RHBA 4RQRA 2P0GA 2GT5A 2IMIA 2A2RA 2D2ZA 1SYRA 2PMTA 2K8SA 6GSSA 1U6TA 2MBTA 5L71A 3ZVJD 1TRSA 5ENUA 2PU9C 3O76A 3VI5A 4KDUA 4G2EA 2RUEA 3LYPA 3RDWA 4N0ZA 2LS5A 3KM6A 1NW2A 1YZXA 1WJKA 1V98A 2VCTA 1SENA 1XFLA 14GSA 4X43A 2MMZA 4ZBAA 2VCZA 4MCUA 3PGTA 1I5GA 4N11A 4Q5NA 1HNCA 2ALBA 5DALB 5J9CA 2DBCA 1Z6NA 3C1SA 6GSXA 1FOVA 1UVZA 5KEJA 3C71A 3ZREA 4ZL9A 5GAPD 3Q18A 1QMVA 1CQGA 3UARA 4WKWA 5E59A 2VUPA 4X0XA 5ID2A 3FZ4A 3RAZA 1SKRB 2GZYA 2R3XA 5ECSA 1DE1A 4PUFC 5D9XA 3G7YA 2H1BA 3FHKA 1T3BA 13GSA 3ZVJA 2X8CA 2VL9A 1AQVA 2VCWA 2ZCTA 4F2IA 2LTKA 3LEFA 1A8LA 4NXIA 4V2LA 1SK0A 2GQKA 3A5WA 1PX6A 2FUG2 3RPNA 3HDCA 5DALA 3P2AA 4EO3A 3AY8A 4ZL8A 3LXZA 4EC0A 3L9VA 2V6OA 4KNDA 4ZB8A 1GTUA 4GTUA 2LJAA 1TU7A 1J08A 1JZWA 4TR3A 1ILOA 2MYGA 4ULXA 5IMVA 3D21A 3GN3A 1TOFA 3FW2A 4EF0A 3A2XA 2DJKA 2GGTA 3ME7A 1OKTA 3I69A 2DSAA 3BCIA 5H5RA 3VPTA 3EWLA 2QKEA 4LL4B 1S3CA 3O6TA 1BJXA 1YEXA 1X5EA 5FHIA 1AAZA 2VL3A 1VF3A 2JACA 3CRTA 4RQXA 1Y25A 3JCML 2IIYA 5DVBA 4N0VA 2PPTA 2LV3A 1B9YC 2PVQA 4J56E 5C04A 1SD8A 1F6MC 2ES7A 1V40A 3MDKA 3ERGA 2VM1A 5D9TA 2O85A 4DSQA 3LORA 1THXA 2LQQA 5FT3A 1PL1A 1G6WA 4PNFA 2H6ZA 5IMFA 1A0RP 3D22A 2DJJA 3KZQA 2AHEA 3IDVA 4TR4A 1G0TA 5G30A 2LJRA 4KCEA 5H5QA 4TOPA 4RUVA 3F3RA 4OO5A 4CHSA 3IOSA 3ZYWA 3LJRA 1BEDA 4GSNA 4ECIA 2B7KA 2H74A 1F9MA 1T00A 4OWYA 1AUCA 2X8HA 5AIVA 5C00A 2GSSA 5EY6A 1TW9A 3ZFLA 2H6YA 2AAWA 3PH9A 1GSDA 3P8WA 3F63A 4ZILA 6GSYA 2Z9SA 2KUCA 1X9WB 2ZUPA 4OD7A 3GKXA 3WT2A 2N5BA 3GKMA 3FY7A 3GX8A 3KMNA 3DKSA 5AIXA 1OKDA 3UVHA 4YH2A 3BJ5A 2ON7A 4EL1A 4PQIA 2I3YA 2VLUA 3TKSC 1ZGNA 1GSFA 1VF4A 3TJJA 4XS1A 4F82A 1SL0B 1TP9A 19GSA 3F3QA 1ZMAA 3VWVA 2M72A 2H19A 1PRXA 2GSTA 4MPGA 2YWNA 3QAGA 1NSWA 1SJZA 5CYYA 4TXVA 1A0FA 1FO5A 3IA1A 1T8EB 1J0FA 4LA1A 4GXZA 1X9MB 1XOAA 1EWXA 2QC7A 3ZL5A 2GTUA 2HSHA 3MNGA 2JU5A 2G0FA 1H75A 4MF5A 1DE2A 3EU4A 2H66A 3GYKA 4AJ7A 4MH2A 2F9SA 4F03A 3TKPA 1PN9A 4QQ7A 4ILFA 4KDXA 6GSVA 4OFMA 4IP6A 5CREA 2GSQA 4MMMA 1JZDA 4HEA2 4MLYA 1YQ1A 1BX9A 5J5NA 1T4ZA 2YN1A 1HD2A 1B48A 2C1YA 4QL9A 2YV7A 3UJ1A 1RK4A 1DSBA 3QAVA 2AUVA 2CX4A 1SU9A 2PN8A 2N5AA 1K3LA 2E7PA 1TI1A 2WFCA 2DJ1A 5DAKB 2IJYA 2NTOA 5JWOB 3W8SA 2R4VA 5HR2A 3KTLA 4LMVA 2CZ2A 2H0IA 4G9HA 3C7MA 2FD3A 3EMXA 3V1WA 2FWHA 5IMDA 3Q74A 4MJAA 4IBPA 3QDNA 1UN2A 4NV5A 3GMFA 1CQHA 1GUKA 3NOFA 1SKSB 1TU8A 2OADA 1OC3A 1THOA 5IO0A 2B3SA 4ECBA 1Z6MA 3KGKA 4TN8A 4JEDA 2VD1A 1N2AA 5LCZA 3ZIJA 3UOMA 1R26A 2FHEA 5D73A 1EP8A 1YY7A 2CVKA 4POKA 4XRAA 3US3A 4Q5FA 5DAKA 4NPBA 1XW9A 3F6DA 1XW6A 2AYTA 3G7IA 4ZBDA 6GSWA 1EEJA 1OC8A 3F9UA 2YZHA 4YQUA 1B4PA 2DLXA 3EU3A 5G2ZA 3A2WA 2DMLA 2HI7A 2VCXA 4KE3A 1NHYA 2TRCP 3IK9A 3TRQA 3ERWA 4Z7XA 5J3RA 3CYNA 3H79A 3GH6A 1FVKA 1XVQA 1K0CA 1H4OA 3EURA 4G19A 1GLPA 3D5JA 2LRTA 5J41A 1O85A 1OE8A 4TXOB 4JR4A 2VL2A 1LJRA 2VD0A 3ZLPA 2FA4A 4MF6A 3ZTLA 3O3TA 1C72A 3D4MA 4HQZA 3S9FA 5AN1A 1EEMA 3F6FA 2FWEA 4IHUA 2E0QA 3QMXA 1O7UA 4ZBBA 1XWAA 2B1LA 1K0DA 1XCCA 4G10A 3MWHA 3GKNA 2JZSA 1TK0B 1BQ7A 4GLTA 1PKZA 4QL7A 1FHEA 1T7PB 3LWAA 1ZYQB 1XIYA 5A4UA 4IQ1A 1R5AA 4TXOA 3D6IA 1XPVA 1GTBA 5J9BA 3TB2A 2C0FA 3MAKA 1XWKA 4XIHA 9GSSA 2WB9A 4TVEA 1PD21 3RPPA 1GSQA 4IJ3A 3APOA 4ISDA 4JBBA 5IOXA 3UL3A 2KP1A 3C1RA 3DD3A 1LU4A 1O81A 2JZTA 4MZWA 3KXOA 5B7CA 5CRHA 3UMAA 2MMNA 4POMA 1QQ2A 1ZCPA 3FEUA 5H5SA 5CRDA 2OBKA 3EYTA 2HT9A 1AXDA 4GRFA 1XWGA 5DDLA 3H8QA 4KH7A 2CQ9A 3N5OA 2LKUA 4NMUA 4GQFA 4K0GA 2CA8A 3HXSA 10GSA 4YQVA 1KTEA 2IMDA 1QGVA 1MEKA 2CVBA 1Y6EA 4AGSA 12GSA 1GULA 2G2QA 4LL1B 1AIUA 2H30A 1Z7PA 3BOAA 1R4WA 2OACA 2K6VA 1U3AA 5GSSA 2FCHA 3M0FA 4HQSA 5G5FA 3HVSA 1M7TA 4IKHA 2FA8A 2VAFA 4WEYA 3QCPA 5AISA 3C73A 2IN3A 4PUAA 2IPAA 2DIZA 2YNXA 4MDCA 4MH3A 3VLNA 3C8EA 1EOGA 3TKRA 1M2AA 4JZQA 3VURA 5DCGA 2I1UA 1S3AA 2HE3A 4AF2A 4EDYA 4KUNA 4K6XA 4JR6A 4L0UA 3LFLA 2DMMA 3IPZA 1A2MA 5ABRA 2B5XA 5B8AA 3CTFA 3EINA 3DIEA 4XHMA 2YWOA 3APSA 3GTUB 1SYXA 1GNWA 3QOUA 4MABA 3GA4A 2HRFA 1V58A 2C3NA 2IMFA 3F0IA 1SK2A 3VI7A 4EVMA 1K0BA 2VLVA 1SK1A 2J23A 3ED3A 2V32A 1J9BA 2CZ3A 1A23A 2HRNA 2B5EA 4ML6A 4GSSA 3TRXA 5CP1A 5IO2A 2WDUA 1QK8A 4FYUA 5EL8A 3LYKA 1HYUA 2GS3A 3CTGA 2OE1A 4X1UA 3TJBA 4WETA 1JLVA 2H1AA 2E2GA 4NV2A 2IFQB 1KBNA 1X5DA 1PGTA 2A2SA 3GTUA 4I5QA 2C8UA 1ZOFA 4P3YB 3DXBA 4XS6A 1G6YA 4J57E 2NVLA 1EV9A 1EOHA 1SL2B 3TKQA 3OR5A 4IJIA 4JE1A 1RW1A 3M1GA 3VWUA 2P31A 1M99A 5D96A 2P5RA 3HZ4A 1FB0A 4DVCA 3W6GA 3GNJA 2EC4A 2R37A 3GSTA 1YEPA 16GSA 3KD0A 3U6VA 3UIWA 1X9SB 4OCEA 1JZOA 4KA0A 4TRXA 4IQAA 5ECOB 2H1GA 2IFQA 5HR3A 3IBHA 5IM9A 4ZB9A 5CO3A 4KDYA 4ECCA 4WR4A 3UEMA 2VL2C 3F8UA 3HVVA 4XCSA 2HXKA 1O6JA 3P7XA 3ME8A 3FYGA 3KP8A 5ELGA 3SBCA 5KN2A 4PURA 3HVXA 3HKRA 1B9XC 1JHBA 2H71A 2JSZA 3F4TA 3RHCA 4L8EA 2L59A 4OMVA 3F4RA 1X0RA 3CSJA 2B6MA 2HLSA 1Q4JA 4ZB6A 5B8BA 3ZMKA 3GHAA 5F07A 3APQA 2TRXA 3F4SA 4WBRD 3GL5A 1ERUA 3A3TA 3QFAC 1JZRA 4NWYA 4L5LA 2NPBA 2IL3A 1FW1A 3HCZA 4FYBA 3VPQA 2VCVA 3IRAA 2GLRA 3KMOA 3NZNA 1M2DA 5D9VA 2PUKC 4DEJA 5B6MA 5HFIA 4K8MA 4MZBA 2LNSA 3FZ5A 5F8BA 3TCOA 4HDEA 2WZ9A 3IK7A 1F3BA 2GZZA 1GUMA 1PL2A 4JU5A 4FO5A 3TKSE 5GAND 1F37A 4KGIA 4PX1A 3L4NA 2L57A 5DQSA 2HZEB 3KIJA 5D8IA 3U5RE 4BVXA 1EV4A 4L5OA 4WF4A 1GRXA 1M2BA 3M9KA 4KW6A 5G5EA 3VWWA 3KTBA 2R2JA 2YJHA 4K0NA 5JCWA 2IWTA 4GSTA 3FR9A 4LMWA 5IQYA 1WE0A 1KEBA 4K7OA 2HFDA 1M9BA 2C80A 4POLA 2OA7A 3KH9A 3TJGA 2CVDA 2QSIA 1FAAA 4WR5A 1IYIA 3N9JA 3MSZA 4IP1A 3TDGA 1XBSA 5F05A 2CAIA 1NHOA 5ECRB 2H72A 1TRVA 2IMEA 1TDIA 4L0WA 2LJKA 2GQLA 3KEBA 2FWGA 2P5QA 3E9JB 1LBKA 2R6KA 3SWLA 3IV4A 4IS0A 2HZEA 2YCDA 4NAXA 2YWIA 2H75A 3QFBC 1QXHA 1G7OA 2TIRA 2FGXA 3E0UA 1YDKA 2K18A 3DEXA 3G9BA 2OE3A 1YKCA 4AJ8A 3CBUA 2CAQA 1GWCA 3DYRA 4NHWA 1MDKA 2I9HA 5IPGA 2K9FA 5IPHA 4FYCA 3WYWA 2DIYA 4WBJA 3DVXA 3FR3A 2F8FA 1EP7A 2BMXA 1SJ6A 3E3EA 2O89A 1WP0A 3DMLA 4BVYA 4J2FA 5ECQB 2MMAA 1GL8A 2H70A 2X99A 1TRUA 4GWRA 4ZIJA 2WCIA 4BWQA 2GVPA 3W8JA 4IGJA 4YAVA 2H76A 1Z7RA 1O8WA 2AV4A 1TK5B 4V2MA 2VIMA 2PBJA 1UC7A 4EKZA 1EGOA 2WULA 4KAEA 1B4QA 4TR1B 3GRXA 5LNKe 5CAXA 1PA3A 5DJLA 1M0UA 2FY6A 4PNGA 3ZRDA 2LEGA 3HA9A 1GSUA 3VK9A 1X5CA 2BJXA 2LQOA 3GSSA 1E6BA 5HFGA 1MD4A 4BPYA 4LLRA 3DWVA 5ECPB 1TKDB 2EIRA 3HJPA 1T4YA 4MP4A 2GZPA 3M8NA 3IHQA 1I9DA 2JSYA 2VO4A 2C0GA 4N10A 2REMA 2H0GA 3D0ZA 3FZAA 3CSHA 1DBYA 4H86A 2AB6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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