3EMPA

Crystal structure of the s-acetanilide modified form of c165s ahpc
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
LINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cysteine pK(a) Values for the Bacterial Peroxiredoxin AhpC
pubmed doi rcsb
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 46
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2008-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3empA00
2JZRA 3GTUB 3FZ9A 3IC4A 2VM2A 3LORA 5G2ZA 2R4VA 1O73A 3L78A 3F3RA 3GUSA 1QK8A 2OBIA 4GWRA 1LU4A 2RM6A 2EIRA 5ECNB 4PX1A 3L0HA 4N0ZA 1IYIA 3KJYA 2RM5A 2WDUA 2GSTA 3P2AA 4HJ2A 5EPFA 1V57A 2OJLA 5F07A 1M2DA 1GSEA 1XWGA 1J9BA 2H1BA 3IAM2 5ENUA 3VURA 4ZBAA 2CAQA 1T00A 3QFBC 3GKKA 4ZL9A 4XS4B 3NZNA 4JR4A 4IQAA 3WT2A 1KTEA 3IAS2 1MDKA 6GSVA 4Q5RA 4HQSA 5D9TA 2M80A 1F3BA 2P5QA 4IGJA 3FHKA 4MJAA 2VLTA 1FHEA 1SKRB 2CA8A 3DWVA 2DJ1A 3W6GA 1EP7A 5AIVA 1SK0A 1K0DA 2IL3A 2H1DA 3C73A 19GSA 1LJRA 5J9BA 1GP1A 5DBQA 1T8EB 4GTUA 4TR0A 1Y25A 3W8JA 4Z7XA 5GSTA 4LMWA 4IP1A 4AJ6A 4Q5NA 5A5KA 3C8EA 4IHUA 4POBA 3Q19A 1DE2A 2YWMA 4EKZA 1XWAA 3GV1A 2NPBA 2C3TA 2HRNA 3F4SA 5JCWA 3NOFA 3G7YA 2B5XA 4K0NA 3ED3A 3F63A 3CRUA 4JE1A 4WF5A 2XBQA 3PH9A 12GSA 3BCIA 4OMVA 4K7NA 2YNXA 1I5GA 1EV4A 2FWGA 1F37A 2B5EA 1A23A 4FYUA 3KTBA 3QR6A 5IMCA 4PNGA 2RLIA 4ZL7A 2R37A 2H01A 2V6OA 4QL7A 2P5RA 5B8BA 5CP1A 1M9BA 2I1UA 2A2RA 2CZ2A 4WKWA 4KSMA 1A2LA 3DVWA 2FUG2 5ECOB 3HVSA 1EV9A 2JU5A 5J4UA 1Z3EA 3H79A 3FY7A 3F6FA 1QMVA 1I9DA 3PR8A 3TJKA 1XWKA 2VL2A 5DQYA 2F51A 4NAXA 3UJ1A 2H8LA 3DD3A 2DJJA 3UEMA 2WB9A 4IN0A 4L0WA 1THOA 1T4ZA 2F8AA 4NHZA 3MNGA 1AQXA 4NV5A 2IPAA 1ML6A 1GL8A 4ECBA 4N0VA 3F9UA 4MP4A 2YWOA 3HD5A 1GSFA 2DSAA 3F4TA 5IOWA 4JRRA 1SJZA 3TKRA 3CSJA 3DRNA 1ZOFA 2WJUA 1YJ6A 5IMFA 2HFDA 2CX3A 2M46A 1B48A 3CMIA 2H66A 3IXRA 2HE3A 1SL1B 1ON4A 3FW2A 3U6VA 5F8BA 2QKEA 2L5OA 2J23A 1ERWA 1OC9A 2FWFA 2YWIA 10GSA 2ZCTA 2C1YA 2WS2A 1THXA 4EXJA 1TI1A 3KP9A 1EZKA 1SK1A 5DCGA 3HZ8A 4LLRA 4ZB6A 4TR3A 1U87A 3P90A 3ZIJA 1YEPA 1AQVA 2HSYA 3FEUA 1HQOA 1GLPA 1XCCA 2WRTA 4HU9A 1XXUA 3HXSA 2PMTA 2EIOA 3KH9A 4OFTA 3DXBA 2C4JA 1XW9A 2R3XA 2GSRA 4EL1A 5D9WA 1F3AA 6GSYA 2XPDA 1V58A 1TRSA 4TXOA 1SK2A 3L9VA 3RPPA 1SL0B 4HS1A 5DDLA 1OAZA 2R5GA 2X99A 1FO5A 3E0UA 3DMLA 1BEDA 1EOGA 2CT6A 3LXZA 5EVOA 4PXOA 2I4AA 4WXTA 1X9WB 1GTIA 3M3MA 3D4MA 1OC9B 2C0DA 1LBKA 1A2MA 4RI7A 3EU4A 2H75A 1W4VA 2F8FA 5CREA 2L6DA 2N5AA 5COHA 2DIZA 1F9MA 2JZSA 3S9FA 4NV2A 2VLUA 2ES7A 4XRDA 1UC7A 4QQ7A 5B6MA 3W8SA 1K0BA 1A24A 1WIKA 3TJJA 3KIJA 4MPFA 4PURA 4BWQA 2H6XA 4V1Ap 1T3BA 1XW6A 2LEGA 3TDGA 4JBBA 3ZYWA 3FZ4A 2DJ3A 2C80A 3MAKA 5CRDA 1PGTA 2I81A 2A2SA 2CV4A 3QD9A 5G1LA 1X0RA 1YZXA 5G5EA 3LYPA 4TXOB 5AN1A 2LNTA 5J41A 4ZILA 4WEYA 5GSSA 4KB3A 2EIQA 3GMFA 4YAVA 4ZL8A 1Q98A 2VCXA 4KDYA 2REMA 2QSIA 4HQZA 2RUEA 1TOFA 2MZCA 5INYA 2O87A 1BAYA 2AUVA 2LKUA 2LNSA 2XBIA 2LJAA 4YH2A 3GL3A 8GSSA 4O5RA 4WBRD 3TJBA 3C7MA 1X5DA 2H6YA 4WETA 2B6MA 3ZMLA 3HA9A 5J3RA 2YANA 3WYWA 2HT9A 1GTUA 3ZIVA 1B4QA 5C04A 1G7OA 4CW9A 3O76A 1YF0A 3HYPA 4MZBA 5IPHA 3GYKA 2D2ZA 4NMUA 2B3SA 3DVXA 3LEFA 3EVIA 2GZZA 2GT5A 2HYXA 3E9JB 5FWGA 2F9SA 2PGTA 5E59A 5IM9A 3ZREA 4NHWA 2FHEA 4F2IA 2IN3A 3LQ7A 4TR1A 5CYYA 2LSTA 3WT1A 1GSYA 2GVPA 3FYGA 3I6AA 5JCUA 3F6DA 3VWXA 2DIYA 1U3AA 1J08A 5L71A 3F4RA 2NBSA 3IPZA 2CVKA 3IHQA 5B7CA 3MWHA 1M7TA 1SKSB 1TU8A 2IMFA 2IFQA 3FZAA 3VI5A 1OYJA 2IJYA 3C1SA 2H1AA 1M0UA 1M99A 4HZ2A 4IELA 1GUMA 4MF7A 1USBA 4I5QA 3IV4A 2XC2A 2IMEA 1A8YA 5H5SA 3GX8A 1SJIA 3A2XA 2GT6A 4JU5A 4K1FA 1O8XA 5A4VA 1GUHA 2FWEA 1IYHA 5HR3A 4POKA 2NVLA 4TR1B 1A0RP 2GZYA 3VWWA 17GSA 2MMAA 2KOKA 4O92A 5FHIA 3RPNA 3ISOA 2L57A 4HEA2 2O89A 3QAVA 4KA0A 4V2MA 1GWCA 1VF2A 2G0FA 3RBTA 2VUPA 4YAPA 2KHPA 3P7XA 1GTBA 2ON5A 1EWXA 1NSWA 2YWNA 3LGCA 2VL3A 1TTZA 1QGVA 4BVYA 2PBJA 3H4KA 2IFQB 2TIRA 1K3OA 4Q5QA 20GSA 1X5EA 3EU3A 5HFGA 4IS0A 3WGXA 2QGVA 2GZPA 4IP6A 4N11A 5IMVA 3TKQA 4OD7A 5IMZA 1XIYA 3G7IA 2GQKA 5AISA 4XIHA 4FO5A 3JCML 16GSA 3TKSC 1G6WA 2VL9A 5CRWA 1EEMA 1SYXA 1DBYA 2CAIA 2DJKA 4MH3A 3WGDA 3IDVA 3M9KA 3HVVA 2P31A 3GSSA 4DSRA 2J9HA 3Q6OA 2JSZA 4HJMA 4ZB8A 5G30A 2B1KA 5IPGA 1PX7A 1TKDB 3L9SA 2DC5A 4HI7A 3TOUA 2HI7A 1PA3A 1VF4A 5D93A 2X8HA 1BX9A 2KP1A 3ZRDA 1OC3A 3KD0A 1MTCA 2B5YA 4KCAA 2DMMA 3QOUA 5DVBA 2YCDA 1KNGA 4OO5A 4AJ8A 3KEBA 1K3LA 4RI6A 1G7EA 2JACA 4DSQA 4TKYA 2X8GA 1ST9A 5CRGA 3VWUA 7GSSA 2OA7A 4EUYA 3ZITA 3KTLA 3D4TA 1WRYA 1HYUA 1FB6A 4IJIA 1ZMAA 2H0GA 5F06A 1XVWA 2KLXA 2OE3A 1GSSA 1YDKA 3HDCA 3ZL5A 2BJXA 4OWYA 1XFLA 4F0BA 3EMPA 4OFMA 4F03A 2VAFA 3APOA 1ZCPA 5G31A 1MEKA 1VF3A 1YQ1A 3TGZA 1EP8A 5ECSA 3MSZA 4IW9A 3EURA 5B6NA 1X5CA 5ECRB 1XVQA 3TKPA 2O7KA 2JSYA 1SD9A 4E8HA 2FNOA 4N30A 1FG4A 6GSTA 3GA4A 3TOTA 1K0OA 4ID0A 3J7Yb 1NM3A 3IR4A 5IO2A 1YY7A 1AC1A 3TJGA 3RHBA 4E8EA 5HR0A 1ZZYA 1XBSA 5AIXA 1X9MB 4L5LA 3G9BA 3BD2A 4OCEA 1K0CA 4ILFA 2LV3A 3ZTLA 4L8EA 2HZFA 5IMDA 2YZHA 22GSA 5KN3A 3RAZA 4O7HA 5JCGA 1M9AA 3HKRA 4ACSA 3PGTA 4POLA 4NWYA 3BCKA 5C00A 2H19A 2LRNA 2VCTA 5DQSA 1TW9A 2R6KA 2P0GA 4FH8A 4G10A 5J9CA 5J5NA 3M1GA 1QQ2A 4CDOA 1TK5B 2AYTA 2OE1A 2O85A 4MJCA 2OADA 3TRQA 3KP8A 3UARA 2N5FA 1UA5A 2CX4A 2B7JA 2H0IA 3ERWA 4TN8A 5IIZA 3UAPA 4F0CA 1ZYQB 2K8VA 1V98A 3K8NA 3ME7A 1Q4JA 3ZMKA 2IMDA 3QAGA 3N9JA 3GN3A 4PUFC 4MPGA 1XOBA 1BG5A 2HLSA 3CSIA 1TK0B 2GTUA 4MJEA 3GNJA 2ALBA 1Y6EA 4GF0A 1OVNA 3IOSA 3ZFLA 2IMKA 3A3TA 3P8WA 1BYEA 1WMJA 1XWBA 3I43A 2N5BA 4IVFA 3APSA 2YV7A 1EGOA 1WE0A 1E2YA 2K8SA 5ELGA 4OFNA 1A0FA 5D9XA 1S3AA 4MF5A 2H1GA 4MH2A 1SD8A 2JADA 3A2VA 2YP6A 3RHCA 1G6YA 1PSQA 2RIIA 3TUEA 2LQOA 5H5QA 2DMLA 2FGXA 5D96A 11GSA 4XRAA 1GSQA 2AJQB 3KM6A 1FAAA 4WBJA 1SKWB 1ZL9A 4EVMA 3IA1A 3QDNA 5IMAA 3LFLA 2X8CA 5EY6A 4YQMA 3AY8A 1R4WA 3N5OA 4EE0A 3IRAA 2PVOC 3FRCA 3I69A 4IKHA 1WPIA 5JWRB 2KUCA 5GZZB 4WR5A 4XTSA 1B4PA 3PINA 2VL2C 3UBKA 3ZFBA 1JZWA 4OO4A 1ACVA 1VF1A 4ECCA 1SENA 4H86A 3Q74A 1K0AA 1ERVA 5HQPA 1PX6A 1MDJA 1F2EA 3UMAA 4ML1A 3CTFA 4EF0A 2LTKA 2OE0A 3O6TA 1GSUA 1QUWA 3FR6A 1HNCA 2PUKC 2M72A 3GH6A 1FOVA 2FA4A 1FB0A 4MF6A 1O8WA 4XHMA 2H73A 1NHYA 2K6VA 5ECIB 2WULA 2GQMA 3C1RA 1RW1A 4K8MA 2B7KA 2FY6A 3TKSA 4K2DA 1R5PA 3R2QA 2YJHA 1S3CA 2BTOT 3GIXA 3J7Yk 1V9WA 3E3EA 2E2MA 4KNDA 1X9SB 3GFKA 4MJBA 3FKFA 6GSUA 4XS6A 4GSTA 3FZ5A 1KEBA 3ME8A 6GSSA 4BA7A 2C0EA 4XS1A 1F6MC 2LRCA 2AV4A 4KW6A 2HSHA 4EDYA 1R26A 2FWHA 4GSNA 1EEJA 3V1WA 5DJLA 4WR4A 3UVTA 2JL4A 2C3QA 1TXXA 5HR1A 3HCZA 3TRPA 4JEDA 4D73A 2DJ2A 4MMMA 3A2WA 4MCUA 2MYGA 4HZ4A 1T4YA 3TRXA 5KEJA 3HJPA 5D9VA 4HU7A 2H74A 5ELAA 4PNFA 1S3DA 2WGRA 2FA8A 3HJOA 4MZWA 3QAWA 1DSBA 1R7HA 5ABRA 2AAWA 1EOHA 2NDOA 4NPBA 3VPTA 2PN8A 4GQFA 4GQCA 4AJ7A 4ZXGA 2WCIA 2HXKA 6GSWA 2H72A 5DJMA 4FYCA 3GRXA 3VI7A 1WP0A 1BJXA 5ECMB 1O6JA 2PPTA 4TVEA 5F05A 3GKMA 3LXTA 4HDEA 3APQA 4XCSA 1N8JA 5B8AA 1GLQA 2F3MA 1N2AA 2A4VA 2V32A 3KZQA 3TKSE 4BPYA 2E7PA 4WF4A 2IMIA 3QMXA 2YV9A 4ZBBA 4PGTA 2C0FA 1TP9A 1PRXA 4HUAA 1FVJA 4D73B 3EC3A 1WWJA 2KP2A 4G9HA 2G2QA 2X64A 5AGYA 18GSA 3FK8A 3QPMA 5E4WA 2QC7A 5IO0A 3VWVA 1CQGA 1W89A 2LUSA 2ZNMA 1H75A 2VLVA 4X0XA 1A2JA 1FW1A 3DIEA 2LJRA 1JZOA 2I3YA 3LWAA 1TRUA 1TJDA 1HNBA 2XPEA 4L5OA 3ZVJA 5ID2A 5IQYA 3UBLA 1RK4A 2GSQA 1AXDA 2YPMA 2VCZA 4V2LA 2PU9C 1QFNA 3CBUA 2VIMA 3D0ZA 1TU7A 4I2TA 2L59A 2VOCA 1JHBA 5HR2A 2V2GA 2OKAA 1NHOA 4Q5FA 2VD1A 3DYRA 3UIWA 5LCZA 3C71A 2AHEA 2VCWA 2O8VB 5H5RA 1SL2B 4GLTA 4FYBA 3ZVJD 3ZZXA 2L6CA 1SU9A 2JZTA 1GSDA 1GULA 1YEXA 1JLVA 5D73A 1TDIA 4I2UA 2V1MA 3EWLA 2TRXA 5IOXA 3HVXA 4NXIA 3LJRA 2V6KA 3QCPA 3D21A 5LNKe 4ECIA 3DGQA 3VLNA 3GURA 3VPQA 3RDWA 5CAXA 4AF2A 2WZ9A 3O3TA 5CO3A 3F8UA 2PERA 4KDUA 5ID2B 3I9V2 1Z9HA 5GAND 2CQ9A 2B1LA 3LYKA 1JZDA 3LSZA 3ERGA 2NTOA 3EE2A 1GTAA 2LS5A 3EMXA 3TB2A 5CNWA 1QXHA 4TW5A 4LL4B 4EC0A 1EGRA 3M8NA 4MABA 1XZOA 6GSXA 3H93A 3TJFA 4YQUA 1H4OA 13GSA 1Z5YE 4GXZA 1XW5A 1DUGA 3H8QA 1PN9A 2ZUPA 4LL1B 2DLXA 2L5LA 1ABAA 4YQVA 2HZEA 4F82A 5ECKB 4V1Ag 4K7IA 5D8IA 5DCHA 4X1UA 2RUFA 5HFKA 2MMNA 3TCOA 3IK9A 2GLRA 1HD2A 3BBYA 4TRXA 2C8UA 1YKCA 2YN1A 1GNEA 3US3A 3Q18A 2E0QA 2K9FA 3L9UA 4J2FA 5G5FA 5EL8A 1SYRA 1KBNA 2Z9SA 4MLYA 1AAZA 4ECJA 5ECQB 3UVHA 1U88A 4KCEA 3IBHA 3FR3A 3LG6A 1B8XA 1AQWA 1Z6MA 1XWCA 1GUKA 3WGEA 4QL9A 2H0HA 3QFAC 3L4NA 4KUNA 1GRXA 4J56E 1CQHA 1PQNA 2FD3A 4LA1A 4I97A 1MDIA 1DE1A 3KXOA 4KH7A 5GAPD 3SWLA 1K0MA 1JFUA 4KSOA 3A5WA 1PKWA 5G1KA 4ML6A 5FT3A 1NW2A 1UVZA 2CVBA 9GSSA 5DAKA 1ERTA 1GNWA 1E6BA 3DKSA 4G2EA 2HZEB 2VO4A 1YKAA 5JWOB 3D6IA 3KMOA 1M2AA 2H71A 4FIWA 4BVXA 4KGIA 2IIYA 5ECPB 1ZGNA 3KMNA 1OE8A 3IK7A 3GX0A 4I8BA 2XHFA 2DBCA 2GS3A 4IQ1A 2YJ7A 4P3YB 4L0UA 2H70A 14GSA 3CSHA 4N10A 1K0NA 4MK3A 4TR4A 1PL1A 4BWSA 4K6XA 1B9YC 3CRTA 1BQ7A 1Z6NA 4KAEA 3UOMA 1OKTA 2L4CA 4OCFA 2LRTA 4DVCA 1JLWA 2VM1A 4PQIA 2H76A 2MMOA 3HHVA 3OR5A 4TOPA 4ULXA 1TI3A 3H1NA 3BJ5A 4DSSA 4BL7A 4PQ1A 3HY2A 3CXGA 5JWQB 4K0GA 1HNAA 2C3NA 5A4UA 2AB6A 1XPVA 3ZLPA 1AW9A 4AGSA 1OE7A 5DAKB 1TRVA 3IE3A 2PWJA 2ON7A 1MD4A 5HFIA 1PMTA 2K18A 4TXVA 1O81A 2LQQA 2MMZA 4MA9A 2H6ZA 4CHSA 2IWTA 5KN1A 3DEXA 3NIVA 2OACA 4K7OA 2HRFA 1FVKA 1TRWA 4POMA 2GGTA 3UL3A 3M9JA 2OBKA 3F3QA 1AUCA 4PQHA 2MBSA 3MDKA 3EYTA 2V41A 1R5AA 3ERFA 1VGLA 5DALA 3GHAA 1JZRA 2TRCP 4JR6A 1MD3A 3GL5A 2EC4A 4ISDA 2YZUA 1OC8A 4F9ZA 5ECLB 4EDZA 1OKDA 2GSSA 2PVQA 3M0FA 2LJKA 3FR9A 5CRHA 1TK8B 2CZ3A 4RUVA 3EINA 4DSSB 4HOJA 1Z7RA 2VCVA 1GH2A 3F0IA 1K3YA 4G19A 4V2NA 4IJ3A 4GRFA 4O32A 3GH9A 1WJKA 1ERUA 4MDCA 1RQMA 1T7PB 3U5RE 3D22A 4KDXA 2L4QA 1Z7PA 2MBTA 2E2GA 2YOIA 1T1VA 1YF1A 1C72A 3KGKA 1G0TA 3VFIA 3HJMA 3GKNA 3CYNA 1URMA 2R2JA 4KE3A 3D5JA 3GSTA 2VCQA 2H30A 4MZCA 2FLSA 1O85A 4ZIJA 5ECHB 3KCMA 2I9HA 1XOAA 2GDRA 1SJ6A 3GTUA 2HNLA 2GQLA 1ZYEA 1A8LA 1VRSD 3CTGA 1J0FA 4GCIA 1AIUA 2CVDA 5DALB 4I6XA 3GKXA 4IBPA 4PUAA 2BMXA 2FCHA 4J57E 4X43A 5A4WA 1U6TA 4DEJA 2C0GA 4JZQA 3WD6A 1PL2A 1M2BA 4EO3A 3G7JA 4RQXA 5LD0A 4LMVA 3KH7A 3VK9A 1V2AA 5KN0A 4GSSA 3BOAA 4XS4A 1PKZA 1B9XC 2VD0A 5F0GA 1O7UA 4ZB9A 2WFCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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