3GKKA

Insights into the alkyl peroxide reduction activity of xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate/ligand complex structures
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
159
structure length
156
Chain Sequence
AMTDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the alkyl peroxide reduction pathway of Xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate-ligand complex structures
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 44
structure length 156
sequence length 159
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gkkA00
1O8XA 1ZL9A 3DGQA 2RM6A 3KTBA 4XS1A 3VWWA 5IMDA 2YV9A 3DWVA 3LYKA 4NHZA 16GSA 4NHWA 5COHA 1AXDA 1M99A 4ZB9A 1PSQA 1PA3A 4RI7A 5G5FA 2LNTA 3APSA 2JSZA 3SWLA 5DJLA 5ELAA 4TRXA 3M9KA 2H71A 4K6XA 2AYTA 1A0RP 3VLNA 2R4VA 3QAWA 1GTIA 5ECPB 4HQZA 4I2UA 4POKA 5IOXA 3KMNA 4K0NA 1BG5A 3Q6OA 2IFQA 2GZYA 5ID2A 4MH2A 3GL5A 3KCMA 1PQNA 3HYPA 4BWSA 3D4TA 3L0HA 2PBJA 4RI6A 1K3LA 2RUEA 4CDOA 3GSTA 1SD9A 3QFAC 4ZL7A 2ON7A 4J56E 4PUAA 5DVBA 2HZEB 2H0GA 4ZB6A 1PD21 4NPBA 3NOFA 1K3OA 3VPQA 4OO5A 5CP1A 1NHYA 3LEFA 1Z7RA 2BTOT 3H1NA 1YZXA 2C3QA 3ZRDA 4RQRA 2H74A 4PNGA 1OC9A 2HZFA 3ERWA 6GSTA 2H1GA 4XHMA 2GSSA 4MZBA 3TKQA 5J9CA 2VL2C 2ES7A 1TRUA 3ISOA 1U6TA 2WJUA 4AJ7A 5JCWA 2LSTA 3P8WA 4CHSA 5ECQB 2WGRA 3ME8A 5CYYA 3M3MA 4MJBA 5ECSA 1URMA 4WBRD 2F9SA 1E6BA 1B9XC 2YN1A 4EC0A 1SJIA 4WBJA 2ON5A 1SYXA 3L78A 2L59A 2RM5A 3CRUA 3TJJA 2LJAA 5LCZA 3H8QA 2FWGA 3ZZXA 12GSA 2IN3A 2AUVA 5GSSA 4XS4B 3HHVA 4GSNA 3G7YA 4AGSA 3UBLA 1XVWA 5IMFA 3QCPA 1MDKA 1XBSA 1PN9A 1EV4A 4ECIA 3GL3A 3HD5A 3A2WA 5LNKe 2OJLA 3U5RE 4NV5A 5GAND 4FYUA 2M72A 4TR1B 5KN2A 2MZCA 2YZHA 4DSSA 5A5KA 3DEXA 1I9DA 2O7KA 2V32A 4KAEA 2KOKA 1ZMAA 2HSHA 4ZL8A 5EVOA 2I4AA 2H76A 2DSAA 2LRCA 2K18A 1OVNA 22GSA 2C1YA 5HR1A 1HNCA 2WB9A 4HS1A 1T8EB 2KLXA 2YJ7A 4D73B 1BEDA 5JCUA 2HLSA 2GSRA 4NWYA 1J08A 4YQUA 2B5XA 2C4JA 4MZWA 4IKHA 4LMWA 3CTGA 4K2DA 1K0DA 3GH6A 1TJDA 3TB2A 1LJRA 3KH7A 5DALA 3P2AA 1TU7A 3FR3A 5IOWA 3ZFLA 2L4CA 5LD0A 2JZRA 6GSUA 2L6DA 1YY7A 4WF5A 4IJ3A 2VL2A 4Q5QA 3FR6A 2VCWA 1HD2A 2DJ1A 3VI5A 2H01A 4JU5A 3TGZA 1YKCA 2B7JA 5F06A 4MH3A 1OKTA 5G31A 3QAGA 4GWRA 1O8WA 2LRTA 1WP0A 1F3BA 1K3YA 3WD6A 4TR4A 1OE8A 5INYA 1OAZA 2FD3A 5J9BA 1B4PA 3GURA 3MSZA 4MJEA 1OC8A 3TDGA 2IWTA 4ZBDA 3TJBA 4WKWA 2R37A 2H1AA 2YZUA 2VO4A 5ECIB 2OBIA 2FA4A 4OFNA 3MDKA 5B8AA 2B1KA 3TKRA 2LQOA 2QSIA 2EIRA 3ZIJA 5FHIA 1GNEA 2B1LA 4MLYA 2IMDA 4TVEA 2B6MA 3HY2A 3CYNA 1R7HA 2CZ3A 5HFKA 3F3RA 2PVQA 3PGTA 1WWJA 4IS0A 3GYKA 3M1GA 3QFBC 4WF4A 4O7HA 1JZWA 3F9UA 1A8YA 1MD3A 1IYHA 3UVTA 4EDYA 3IRAA 3BJ5A 1OC3A 1K0BA 1A2JA 2D2ZA 2A2RA 3ZVJA 3G7JA 3LYPA 3CRTA 4IJIA 2HRNA 2N5FA 2V6KA 1BAYA 2GDRA 1RW1A 3EWLA 2BJXA 1EZKA 2DC5A 2Z9SA 4E8EA 1TP9A 1KNGA 2OE3A 4OWYA 3EVIA 1CQGA 3ZREA 3HJMA 1MDIA 4AJ6A 1A2LA 2B3SA 3IAM2 1SL1B 4V2LA 3KEBA 4WXTA 2LUSA 5J4UA 2X8HA 4FYCA 3ZYWA 2H6ZA 1SL0B 2FUG2 1ST9A 4TXOA 1TU8A 2H1DA 1DBYA 1XWBA 3GH9A 2G2QA 1U3IA 2GVPA 1T4ZA 1M9BA 1PMTA 3IV4A 2H70A 1XCCA 1Z9HA 2H8LA 2CT6A 3G7IA 2FNOA 3FZAA 2IFQB 5ID2B 2X8CA 5A4VA 4N0VA 2FLSA 1K0CA 4AF2A 5EL8A 1ABAA 13GSA 2DIZA 2V6OA 3UVHA 1GSEA 1O73A 3TCOA 2CZ2A 4PQ1A 1X9SB 19GSA 1S3AA 1T3BA 5D9XA 3WT2A 2H6XA 3I6AA 4IVFA 1V98A 4LMVA 3GTUA 3EU4A 3TOUA 5HR3A 1V57A 5H5QA 4EKZA 3O3TA 2VD0A 4N11A 1OC9B 1F37A 14GSA 3EE2A 3I43A 2QC7A 4EDZA 3KXOA 20GSA 1XW9A 1A8LA 5CNWA 3VURA 4NXIA 5B7CA 2I1UA 1F6MC 3WT1A 1YDKA 1ERWA 3C1RA 1TI1A 4KSMA 5ECNB 1AIUA 2CX4A 1NSWA 2PERA 3HVVA 2K6VA 1WJKA 1UC7A 4I2TA 2I9HA 3UL3A 2JZTA 4KDUA 4NAXA 1NHOA 2FCHA 1J0FA 4L5LA 3DD3A 1GUMA 3CBUA 2DJ2A 2HFDA 4WEYA 3L4NA 3TRPA 3WYWA 4J57E 1ERTA 1H75A 1YEXA 3O6TA 4BWQA 2YP6A 1A2MA 3HJPA 3D4MA 3MNGA 1SU9A 2L6CA 3ERGA 3D6IA 4PQHA 5HR2A 5F07A 2GTUA 2YJHA 1JFUA 4ECJA 5C00A 2IMIA 4RUVA 3C7MA 4EE0A 4ECBA 5B8BA 8GSSA 5ABRA 1G7EA 4YQVA 3DVWA 4DSSB 4V1Ap 4MF7A 2CAIA 3GMFA 4OCEA 4GCIA 4KUNA 5B6NA 1Z6MA 1H4OA 1O6JA 4JRRA 4PXOA 5CRGA 4H86A 3IXRA 2CQ9A 4TN8A 2GLRA 4L8EA 5F05A 2VLVA 4Z7XA 4N0ZA 5IMCA 4IN0A 1R5AA 4V2NA 1VF3A 2H73A 1ML6A 5F0GA 3V1WA 3GV1A 1V9WA 1GL8A 4I97A 2TIRA 3N9JA 2WULA 3F63A 4MDCA 4LLRA 3IR4A 3LXZA 3PH9A 1Z5YE 2VCVA 2MBSA 3W8SA 1XW5A 2H0IA 1QK8A 1SK1A 5AN1A 4BVYA 4G9HA 4N30A 3APOA 5GAPD 4L0WA 4MZCA 4O5RA 3TOTA 3C8EA 5DCGA 4DVCA 5DALB 5CAXA 4V2MA 3GHAA 5KN0A 4ULXA 2DBCA 3TRQA 1FVJA 3NZNA 3Q18A 1O7UA 3QDNA 3GFKA 1XIYA 2AJQB 2KP1A 2A4VA 4KNDA 1LU4A 4L0UA 1NW2A 1ON4A 3BBYA 2ALBA 2EIQA 4F0BA 2LTKA 3EINA 1TW9A 5G2ZA 1F2EA 3GIXA 4XS6A 3TRXA 1SKSB 4O92A 4EUYA 3QOUA 4YQMA 3EYTA 4Q5FA 4IHUA 2C0GA 2PU9C 1R26A 1ZYEA 2RLIA 1M2BA 3N5OA 2YCDA 3KP9A 5AISA 3D22A 4MCUA 1GH2A 2OBKA 3D21A 2PVOC 5G5EA 1O85A 1EOGA 2F3MA 2L5OA 2PMTA 4ZXGA 5DAKA 2TRCP 2GSTA 4GF0A 4P3YB 3PR8A 2K8VA 1DE1A 1N2AA 2VD1A 1T00A 5IQYA 1A0FA 1E2YA 3I69A 3J7Yk 1S3DA 4EL1A 5IIZA 2LV3A 2VL9A 1B4QA 3VWUA 3R2QA 4HI7A 1JZDA 1HYUA 1AQWA 1AC1A 3HKRA 1PX7A 4TR0A 4JEDA 1RK4A 4F03A 5FWGA 5HR0A 2YWIA 4G19A 2CA8A 3A5WA 2FHEA 3WGDA 3P7XA 2L4QA 2GSQA 3RBTA 1DE2A 3C1SA 2L57A 4QL9A 4ZBBA 2BMXA 3FRCA 2GQMA 3ZLPA 4PUFC 4QL7A 1ZGNA 5ENUA 4ZBAA 2H0HA 1TXXA 1GSDA 2EC4A 4X43A 3KTLA 5JWRB 3FHKA 3NIVA 1MD4A 2I3YA 3F4TA 1TKDB 1W89A 2AB6A 2HT9A 3UBKA 4MP4A 1GP1A 4IQ1A 3EC3A 2ZUPA 4KCEA 3E3EA 1F9MA 1PGTA 4X1UA 1JZOA 5FT3A 5IO2A 1G6YA 2YWNA 2DJ3A 1XOAA 1Z3EA 4TXOB 3FY7A 2LJKA 1GTUA 17GSA 4BPYA 3GKNA 3KP8A 2C0EA 3EMXA 4K1FA 2X99A 2GGTA 4IGJA 3L9UA 4ECCA 3HZ4A 1PX6A 2B5EA 3CSHA 3W6GA 5ECLB 1VF2A 3TKPA 1JZRA 2XC2A 3F4RA 3RHCA 2M46A 1GSFA 3UIWA 4HJ2A 3GX0A 3F6DA 4JZQA 3KGKA 1K0AA 3IBHA 2IMFA 1T1VA 1SK2A 2IJYA 4XCSA 3GKKA 4PQIA 2NBSA 2YOIA 3IHQA 1G6WA 4BVXA 2C0FA 2YANA 4WETA 3BCIA 9GSSA 2N5AA 3GTUB 4IP1A 5D9WA 3L9SA 3HVSA 2H6YA 2VCZA 2P5RA 3LXTA 1M0UA 2E2MA 5ECMB 5CRDA 1GLPA 3FEUA 4I8BA 4MMMA 4G2EA 1WOUA 1SYRA 4IBPA 2C80A 2H66A 2LKUA 1FO5A 1UA5A 4K7NA 2DLXA 11GSA 2E0QA 4K7OA 1WE0A 1OE7A 1QXHA 3DKSA 1GTBA 2GZZA 1FVKA 5JCGA 3FW2A 4IP6A 4JR6A 5DJMA 2TRXA 1YJ6A 6GSYA 4EF0A 4OFMA 1GLQA 3E9JB 1W4VA 3ZITA 1FB6A 4KGIA 4JR4A 4YAPA 2YWOA 5C04A 1B8XA 1T7PB 1SKRB 2LJRA 2V41A 1HNBA 4NMUA 4HQSA 1YF1A 5A4WA 1MTCA 1PL1A 4I5QA 4OO4A 3CXGA 4HOJA 5DQSA 2GT6A 3GX8A 4GQFA 2CAQA 4EO3A 4HU7A 5DQYA 1B48A 3H93A 3UARA 4OMVA 1GNWA 1QGVA 3QR6A 1V2AA 4DSRA 2ZCTA 4ACSA 1VF1A 3CMIA 2QKEA 3ZL5A 3L9VA 5D93A 1HNAA 1IYIA 4E8HA 2L5LA 1AW9A 3HA9A 2IPAA 3DXBA 3ME7A 2CV4A 1SL2B 2MMZA 3A2VA 1V58A 1USBA 4V1Ag 2F8FA 1SD8A 2E7PA 1BX9A 4KCAA 2R5GA 4JE1A 5B6MA 4K7IA 2CX3A 1JHBA 4KH7A 1AAZA 2P31A 1WRYA 1X0RA 1WIKA 1M2DA 2FGXA 1EP7A 4K8MA 6GSXA 2J23A 1Q4JA 3LGCA 1X5CA 1QQ2A 4HU9A 3M8NA 6GSSA 3EU3A 2C0DA 4N10A 5GSTA 3Q19A 3CTFA 2WFCA 2F8AA 2MMOA 1DSBA 4I6XA 5L71A 1Z6NA 2AAWA 3IK7A 2JU5A 1TI3A 2R3XA 2DMMA 3LWAA 2KP2A 2LRNA 1SENA 1Z7PA 5J5NA 4MABA 5CREA 3TJKA 1WPIA 1K0NA 2O8VB 1B9YC 1EV9A 3S9FA 3I9V2 2XPEA 4GSSA 4KB3A 1V40A 1XZOA 3VPTA 1ZYQB 4MJCA 5CO3A 3DVXA 3F3QA 5AIVA 2H1BA 4OD7A 5ECOB 1OYJA 4FO5A 5DAKB 3KJYA 2R6KA 6GSVA 2JZSA 4TKYA 5H5RA 4LL1B 3DRNA 4KSOA 1PKZA 4XIHA 2VM2A 2WCIA 1FOVA 10GSA 4TW5A 2A2SA 1UN2A 3CSJA 2OKAA 4KDXA 3BD2A 3US3A 2YWMA 5IO0A 1F3AA 5IMVA 3FK8A 4X0XA 1EEMA 1GWCA 1X9WB 1GUKA 1C72A 1GSSA 4HEA2 3FZ9A 2VLUA 2P0GA 1GTAA 4OCFA 1UVZA 3MAKA 2PN8A 3AY8A 4GSTA 2NTOA 1XOBA 2VIMA 2X64A 1XWGA 4ID0A 2JADA 5ECKB 4O32A 1PRXA 2DJ0A 2FWFA 2C8UA 1ACVA 2WS2A 3KD0A 5IPGA 5D9TA 1CQHA 1VGLA 2G0FA 5CRHA 2H30A 2PPTA 4ZIJA 1TTZA 4IQAA 1YEPA 4F2IA 1S3CA 4HJMA 3IK9A 5DCHA 1TDIA 1M7TA 3E0UA 2C3NA 3IC4A 3ZMLA 4MPGA 2J9HA 4MA9A 2GS3A 5ECRB 5IPHA 4GRFA 1GSYA 3LSZA 2XPDA 4TR3A 3WGEA 2MYGA 2MMAA 3FKFA 3M0FA 4ZB8A 3DMLA 4POBA 3TUEA 5HFGA 1EGOA 4GQCA 3FZ4A 3RAZA 3VFIA 1XPVA 3IE3A 1Y25A 1VRSD 3C73A 3TKSC 4YAVA 2OACA 1JLWA 4PGTA 5D73A 2OADA 2HE3A 3LG6A 3H79A 4POMA 5DBQA 1TOFA 3CSIA 3PINA 1FW1A 2KHPA 3D5JA 2I81A 2DJKA 3KH9A 1PKWA 1KEBA 4F82A 1I5GA 4MK3A 4CW9A 1ZZYA 3ZFBA 2WZ9A 2VLTA 2EIOA 1QFNA 3JCML 4LA1A 3KM6A 4PURA 3ZVJD 1BQ7A 2WDUA 4HZ4A 1GSUA 3FYGA 4XTSA 3J7Yb 1AUCA 4IW9A 2PUKC 2OE0A 4GLTA 3ZMKA 4EXJA 2H19A 1M2AA 1FB0A 5IMAA 5HFIA 3LJRA 1THOA 1N8JA 1ILOA 2IL3A 3ED3A 1G0TA 2F51A 1X5DA 2CVDA 5E4WA 2VL3A 2FWHA 5IMZA 4XRDA 1EGRA 3OR5A 2OE1A 4F9ZA 3DIEA 7GSSA 1WMJA 1FHEA 1XW6A 3HXSA 3IPZA 1AQXA 3SBCA 1GULA 2GZPA 3HDCA 3IAS2 4JBBA 1BJXA 3QD9A 2DJJA 2GQKA 1R5PA 2NPBA 2HZEA 3O76A 3FZ5A 1XFLA 5G1KA 3GSSA 3MWHA 5KEJA 3ZTLA 5CRWA 3F8UA 1RQMA 2HSYA 5D8IA 1QMVA 2R2JA 1EEJA 4IELA 5H5SA 1O81A 1QUWA 5JWQB 2DIYA 3A3TA 3BOAA 2LNSA 1TRWA 3LORA 3QAVA 2OA7A 1XWKA 2GQLA 2CVKA 2YNXA 3UOMA 2IMEA 2VCXA 4ZILA 1J9BA 2V1MA 4EVMA 3IOSA 3TKSA 4KX4A 2FY6A 2HYXA 4DEJA 6GSWA 2HI7A 3F0IA 1BYEA 2VUPA 1GUHA 4GXZA 1ZOFA 1NM3A 3F4SA 4Q5RA 2O89A 2XHFA 3GKMA 4BL7A 2AHEA 5JWOB 1SKWB 1U88A 5G30A 5AIXA 5J41A 2V2GA 1U87A 4G10A 2NDOA 1U3AA 1YKAA 3G9BA 4XS4A 1XWCA 1LBKA 3F6FA 1R4WA 4ML6A 1YF0A 4PX1A 2ZNMA 2P5QA 3FR9A 4WR4A 3QPMA 3W8JA 4WR5A 2DMLA 2WRTA 3KMOA 3H4KA 5A4UA 2N5BA 1EP8A 2VOCA 5KN3A 3UEMA 4TR1A 1ERVA 1TRVA 5D9VA 3RPNA 2MMNA 1TK5B 3RHBA 4AJ8A 3C71A 2HNLA 3TJFA 3UAPA 5F8BA 1SJZA 1KBNA 2H72A 1GSQA 4MPFA 3HCZA 4HDEA 1T4YA 5J3RA 3BCKA 3WGXA 1Q98A 2O85A 4J2FA 5DDLA 2KUCA 4D73A 5G1LA 1SJ6A 3GNJA 2QGVA 4MF5A 4MJAA 1GRXA 2NVLA 3RDWA 2RUFA 1XXUA 2YV7A 4FIWA 5E59A 5EY6A 4QQ7A 1FG4A 2K9FA 2LQQA 5D96A 5EPFA 3GRXA 3HVXA 4KE3A 5AGYA 3TJGA 1EWXA 2GT5A 3ERFA 2XBQA 1A24A 4FYBA 2JSYA 3UJ1A 2IIYA 2O87A 2E2GA 4L5OA 1TRSA 2M80A 3EMPA 3GN3A 3VI7A 1PL2A 3U6VA 1XVQA 4Q5NA 2HRFA 2HXKA 2B7KA 3KZQA 1A23A 3VK9A 3Q74A 5ECHB 3GKXA 4TXVA 4TOPA 3APQA 2AV4A 2REMA 4HUAA 18GSA 1X5EA 1K0OA 4K0GA 2VAFA 3QMXA 2PGTA 3LQ7A 3GA4A 2LS5A 3IDVA 4F0CA 1Y6EA 2RIIA 4YH2A 3HZ8A 2CVBA 2B5YA 2H75A 2VCQA 4DSQA 1SK0A 3KIJA 2YPMA 3EURA 2PWJA 1THXA 3LFLA 4FH8A 1MEKA 1ERUA 2JL4A 2XBIA 1EOHA 3HJOA 1YQ1A 1G7OA 4OFTA 4KDYA 3D0ZA 3RPPA 4PNFA 2VCTA 4KA0A 5KN1A 4KW6A 3P90A 4ML1A 2LEGA 2C3TA 3IA1A 1KTEA 1OKDA 1JLVA 1ZCPA 1XWAA 4ISDA 1FAAA 4GTUA 2IMKA 2FA8A 3TKSE 3DYRA 2FWEA 2JACA 1TK0B 1M9AA 2K8SA 4LL4B 4ILFA 3GUSA 1HQOA 4RQXA 1VF4A 4ZL9A 2VM1A 4POLA 2MBTA 4K9ZA 1TK8B 1X9MB 5HQPA 1K0MA 4XRAA 5IM9A 3VWXA 4BA7A 3A2XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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