3GKKA

Insights into the alkyl peroxide reduction activity of xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate/ligand complex structures
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
159
structure length
156
Chain Sequence
AMTDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Insights into the alkyl peroxide reduction pathway of Xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate-ligand complex structures
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris
total genus 44
structure length 156
sequence length 159
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gkkA00
3KZQA 3IK7A 5CNWA 3D4TA 5ECSA 2HXKA 1HNAA 2EC4A 3IHQA 2LNSA 3L9VA 1MD4A 2AUVA 1NSWA 3QFBC 3SWLA 1WRYA 1O85A 3F8UA 4OCEA 1MD3A 5C04A 4ILFA 1M0UA 3LEFA 4FYBA 5B6MA 5FWGA 3M9KA 2XPDA 4K2DA 2PGTA 4EDYA 1WIKA 1GH2A 4OO4A 3A2XA 2L6DA 1PX6A 2GT6A 3ED3A 3Q18A 2LQOA 2VCVA 5IO2A 2P31A 4POLA 1X9WB 4IJ3A 3TCOA 1QK8A 1K0CA 4CW9A 1TK8B 3G7YA 3IR4A 3H8QA 3H1NA 3UVHA 2H71A 1AQXA 1XBSA 4NAXA 3L4NA 3DIEA 3Q6OA 1ACVA 3IOSA 4YQMA 4CHSA 5LNKe 5IMDA 5ECKB 3I69A 2O7KA 5J5NA 4K8MA 2GT5A 5ECMB 5JWOB 5D9VA 1Q98A 4LL4B 3DD3A 1MDIA 2LRTA 4NPBA 1GTIA 1XVWA 1HYUA 2VL2A 1TI3A 3IA1A 2GZPA 2L59A 2I3YA 3WT2A 3GX8A 2DIYA 3P7XA 1XWBA 1GTAA 2IWTA 4KE3A 1WOUA 3HJMA 5IQYA 3GA4A 2GQMA 3TOUA 3G7JA 2H1DA 4ISDA 4PQHA 1EV9A 2YWMA 1GUMA 3LGCA 4YH2A 2ZCTA 3HD5A 1K0AA 4ZBBA 5H5QA 1R4WA 5IMAA 1LBKA 3TJJA 4WKWA 1PKWA 5G5EA 3C71A 1SKRB 3TJFA 4ZILA 4I2TA 2VUPA 4Q5RA 1FB0A 3W6GA 2VM1A 3CBUA 4IQAA 1ZL9A 4NV5A 2HZEB 1FW1A 2HSYA 14GSA 2F8FA 1NHYA 2WZ9A 3GNJA 2RLIA 5COHA 4GQCA 1SK0A 2IMFA 2VL2C 4RI7A 2K8SA 4EC0A 1QFNA 4ZL8A 4KX4A 4WETA 4XCSA 3F4TA 5DBQA 4D73B 2QC7A 4HZ4A 1GSSA 4KDUA 1Z6NA 2KUCA 1M99A 2WCIA 2M46A 1OC9B 5ID2A 1URMA 2C0DA 2VL9A 5G30A 3DVXA 2C0GA 5IMVA 2LNTA 3GTUA 3WGXA 1H4OA 1QQ2A 2E2MA 4MABA 3CSHA 4O5RA 5GAPD 4XRDA 3KP9A 1DE2A 5LD0A 5HFIA 2MMAA 1KEBA 2X8HA 1DE1A 2P0GA 4ID0A 1S3DA 1KNGA 2VIMA 18GSA 1ABAA 5FT3A 1PGTA 1T3BA 3CMIA 5J3RA 4O92A 3WT1A 4X0XA 2YANA 1A0RP 2WGRA 1SJZA 3GHAA 3I6AA 3VWXA 1AQVA 2EIQA 3E0UA 1V57A 4LL1B 1I9DA 3FW2A 2GSRA 2OBKA 2WRTA 3WYWA 4HDEA 1TDIA 1ERUA 3UJ1A 3HZ8A 5G2ZA 5CRGA 3IAS2 1GUKA 1T7PB 4IKHA 4IN0A 5ENUA 4MMMA 3KMNA 1X9SB 3WGDA 3NOFA 2O87A 3KCMA 3BJ5A 5GZZB 2D2ZA 5A4VA 3BCKA 1N8JA 3IV4A 2H6XA 1VF2A 3M0FA 1J9BA 2CVBA 5CRWA 2QKEA 4POKA 1AXDA 1FOVA 2XHFA 3DEXA 3N9JA 2IFQA 4KCEA 1Z7PA 3F3RA 1WJKA 1PX7A 4KNDA 4IW9A 1X5EA 2HNLA 3GKNA 5HQPA 5IIZA 4RI6A 3GUSA 5D93A 4MP4A 2FUG2 1ERVA 1U3IA 4WXTA 1ERTA 2X8CA 3KTLA 2PPTA 3IPZA 3GMFA 3ZRDA 10GSA 1GL8A 17GSA 5KN0A 2XPEA 4EF0A 2GDRA 2YWNA 3UVTA 2A2SA 1TP9A 2YJ7A 2V41A 3TRXA 3CYNA 2JU5A 4TVEA 3DGQA 2OE1A 3GL5A 2AYTA 3C1RA 3KJYA 1UN2A 2FA8A 4V2NA 1Z7RA 2V2GA 2KP2A 2RM6A 1WPIA 3FZ4A 3WGEA 1X5DA 1U88A 3HZ4A 4G9HA 1SKWB 1XCCA 2L5OA 2HRFA 3TB2A 5ECOB 3FRCA 2C0FA 4OMVA 4K9ZA 1NM3A 1HQOA 4LLRA 1GNEA 2IPAA 2MMOA 4KH7A 5KN3A 6GSVA 3QAGA 4V1Ap 4WR5A 1FO5A 1EGRA 3US3A 3ZIVA 3Q19A 1NHOA 4EXJA 4K0NA 3FR3A 1IYIA 5CRHA 1OVNA 4BVYA 3KM6A 2P5QA 4DSSA 1G6WA 2YZUA 1A24A 3UMAA 3BBYA 3QD9A 3ERFA 3UOMA 4N30A 3KGKA 2B1LA 3ZFLA 4MDCA 2HE3A 4OD7A 1GTUA 5ECLB 2IJYA 5DDLA 4E8EA 3KH7A 4LA1A 2C80A 2YV7A 1A0FA 4K7OA 5EVOA 1V58A 5D9WA 2H1GA 1LJRA 5DVBA 3HYPA 1IYHA 4MZCA 1B8XA 2E7PA 1JZOA 2VLTA 1UA5A 2NDOA 3L9UA 4G19A 4IS0A 2CQ9A 3CRUA 3EE2A 4ECIA 4WBRD 1OC3A 5D8IA 4GF0A 5L71A 1YZXA 2FLSA 3P90A 1CQGA 3KXOA 3G9BA 1SK1A 3RPNA 4N0ZA 7GSSA 5ID2B 2DJ1A 2HFDA 1XZOA 2FD3A 3GTUB 2CZ3A 3QOUA 3ZTLA 2RM5A 4OFMA 3GKMA 5EPFA 1QMVA 4EDZA 4I97A 5ECRB 2E2GA 3TGZA 3D22A 1XPVA 1EZKA 1MDKA 3APOA 5GSTA 2XBIA 2G2QA 2H74A 3QR6A 1SYXA 4TKYA 1Z6MA 2OE3A 4EKZA 5F0GA 5B7CA 3HXSA 3BOAA 2BMXA 2NBSA 3DVWA 1ERWA 1PL1A 3W8JA 2TRCP 1M2BA 4PXOA 2DMMA 1K0MA 1RK4A 1ZOFA 2O89A 1ZMAA 5DJMA 1O8XA 5IOXA 1PL2A 1UVZA 2B3SA 2CAIA 4V2MA 2I1UA 2LJKA 1U3AA 3VLNA 1THXA 4KSOA 3CSIA 3GIXA 1SD8A 2PMTA 5IPGA 2JZSA 3N5OA 1M7TA 1TRSA 3U5RE 4V2LA 3MWHA 5AGYA 5DJLA 1GSEA 3R2QA 1T00A 2IMEA 5G1KA 1W89A 2VCXA 2PVQA 1OYJA 1EP7A 2FWGA 2VCWA 1JZWA 2NTOA 3LG6A 2JSYA 3MNGA 5H5RA 2K9FA 3IXRA 2F51A 4N0VA 2X64A 1FHEA 4Q5QA 2CZ2A 3IBHA 2IFQB 4HQZA 1TRVA 4EO3A 5CP1A 2YJHA 1F9MA 1K3OA 3GYKA 3WD6A 2B7JA 1WWJA 2CV4A 3QAVA 1B9XC 3W8SA 2F9SA 3ZZXA 1A2LA 4K0GA 2CT6A 1R5PA 4GQFA 4JR6A 5AN1A 1ZGNA 5ECIB 3EURA 3IC4A 4X43A 1A2MA 6GSTA 4MZWA 4ZB9A 4BVXA 1F2EA 5CYYA 4KA0A 3TKPA 1T4YA 1XIYA 4XS4A 2VCQA 4FIWA 4MJEA 3ISOA 4ML6A 3U6VA 5HR0A 5B6NA 3UBLA 3DWVA 1OC8A 1TRWA 3I43A 1T4ZA 1WE0A 4LMWA 5JCUA 2OA7A 2JZTA 1EGOA 3QPMA 5JWQB 2J9HA 3SBCA 2IL3A 2FHEA 4OWYA 3ZIJA 5HR3A 2FA4A 3KP8A 1T8EB 2GZYA 5F06A 2IMKA 1GSYA 3TKQA 4WF4A 2MBSA 2X99A 4JR4A 1DSBA 4KAEA 1R7HA 3BD2A 4GSSA 1V9WA 19GSA 2GS3A 4V1Ag 3H4KA 3FEUA 5KN1A 4IVFA 1ZYEA 2NPBA 3A2VA 3VI5A 2HLSA 3EC3A 3KD0A 2JADA 5IOWA 1RQMA 5DAKA 4F03A 1LU4A 1K0DA 4MPFA 3FKFA 3KH9A 1O7UA 4ZBDA 4DSSB 3J7Yb 1TK5B 12GSA 4PX1A 4MH3A 3CXGA 1R26A 3ERWA 4MZBA 1XWKA 2JZRA 3VURA 2FY6A 1TOFA 1AQWA 1K3YA 2H75A 2VL3A 3GKKA 4FYCA 2HZFA 3EINA 5AISA 1GSQA 4TR1A 5HR1A 4MA9A 4JRRA 2DJ0A 4Z7XA 3CTFA 1XWGA 3D4MA 3LXTA 2H30A 4HZ2A 4GSTA 1GULA 1V98A 3MSZA 5GSSA 3FHKA 2MZCA 3IAM2 3GSSA 1GWCA 2DBCA 3PINA 2AJQB 1ZZYA 2YOIA 4MJCA 1YY7A 5D9TA 2DC5A 2N5AA 4F2IA 2OADA 3TOTA 1OAZA 4HEA2 2GSQA 1A23A 1SENA 4F82A 3TJKA 3O6TA 3TKSC 3F0IA 3F63A 2V32A 3C8EA 3UEMA 3GV1A 1A2JA 3KMOA 2YZHA 3ZVJA 1AW9A 1B48A 4HU7A 1M2DA 4IP1A 4ECCA 4I8BA 3NIVA 2LJRA 4MJAA 2IMIA 2L57A 4TN8A 5A4WA 1HD2A 2BTOT 2H76A 1EP8A 5IPHA 3A3TA 5C00A 1EWXA 4EVMA 2DSAA 3ZMLA 3EU3A 4ZB8A 3CSJA 2JSZA 4K7IA 4YAPA 3KIJA 3KTBA 3ME7A 4IJIA 2H70A 3TRQA 3J7Yk 1OE8A 3FZ9A 1SJ6A 1O81A 4KSMA 1GNWA 4HOJA 1U87A 20GSA 3GFKA 1PQNA 2VAFA 3PGTA 4KDYA 3E3EA 2LSTA 4L0UA 4KGIA 11GSA 2EIRA 3VK9A 1J0FA 3TUEA 3P2AA 1TRUA 1G6YA 1GLPA 4K1FA 4F9ZA 1Z5YE 1B4QA 5CRDA 4RUVA 3RHCA 3ZVJD 2RIIA 1EOGA 4HJMA 2FWFA 1VF1A 3AY8A 2DJ3A 4HJ2A 4MLYA 2VLVA 5J9BA 3GL3A 1UC7A 3PH9A 4F0BA 3GURA 3DYRA 3HCZA 4ACSA 1V2AA 4IELA 5LCZA 2LKUA 5IMCA 1B9YC 2MBTA 5IM9A 22GSA 3FY7A 2BJXA 4TW5A 2J23A 4AJ8A 1KBNA 3NZNA 2FNOA 2VCZA 2MMNA 4OO5A 2YWIA 3C7MA 3M9JA 3UARA 2FWHA 4FH8A 1N2AA 1YDKA 3DMLA 2HYXA 5IMZA 3APSA 4DSRA 3M8NA 4JEDA 3V1WA 1M2AA 5E4WA 2C4JA 3LYKA 3VWVA 4WBJA 3RPPA 4XS4B 2DJ2A 4K6XA 2R37A 2MYGA 4EUYA 2PVOC 2YV9A 3P8WA 2WDUA 3ZITA 4NMUA 1AIUA 1A8YA 3D5JA 1FB6A 2LEGA 5ECPB 5CREA 3MDKA 4XHMA 4AJ6A 1RW1A 2C8UA 4ECJA 2YN1A 2REMA 2M72A 1CQHA 4KDXA 5DALA 3EYTA 3UIWA 2GSSA 2H72A 3L0HA 4L8EA 2ON7A 4QQ7A 1O73A 2VO4A 1FAAA 4KCAA 4HI7A 1PRXA 1XVQA 2IN3A 1H75A 2ALBA 4L0WA 3D21A 4PUAA 3JCML 4DSQA 1PMTA 1GUHA 2LS5A 2I81A 1KTEA 4MF7A 1VF3A 4KW6A 1J08A 3GRXA 1YEXA 5DAKB 3FZAA 4HS1A 2L5LA 2YP6A 5G31A 1JLVA 2CA8A 5ECNB 1SYRA 4OCFA 2B5YA 4PNGA 5F05A 3GH6A 4PURA 3ME8A 3VFIA 1TTZA 1X9MB 4HU9A 4MPGA 3TJBA 3H93A 4TR1B 3EMXA 5EL8A 2GZZA 1TK0B 5G1LA 3E9JB 4Q5FA 2N5BA 2MMZA 2K8VA 1PA3A 2WS2A 4I2UA 4PGTA 2H6ZA 4HUAA 4XS6A 4I6XA 2WULA 2GQKA 5A4UA 3UAPA 1EEJA 1QXHA 2PN8A 4L5LA 4EL1A 4X1UA 2H1AA 2DJJA 3M1GA 2R3XA 1YEPA 1TKDB 4ML1A 5DQSA 1FVKA 3RAZA 2TIRA 4E8HA 3IK9A 4O32A 2AAWA 4ZB6A 4NV2A 2K6VA 1EEMA 3C1SA 3VPTA 2HT9A 4QL9A 3ZLPA 1GSFA 4TR0A 3GKXA 1TU8A 1K0NA 2C3NA 2KOKA 2YPMA 1SK2A 3O76A 1USBA 6GSUA 5ELGA 5DCHA 1WP0A 2LUSA 4PQIA 2H6YA 4ZBAA 9GSSA 1F3BA 5IMFA 1XOBA 3IDVA 3F4RA 2PBJA 5H5SA 2LRNA 5G5FA 3QMXA 4POBA 2H66A 2KHPA 3LXZA 4BWSA 4LMVA 5AIVA 2JACA 2PERA 1VGLA 1K0OA 2IIYA 2OE0A 6GSYA 3EWLA 4IBPA 4GWRA 2M80A 2CVDA 1BYEA 1X0RA 3FR6A 2C3TA 4JU5A 4I5QA 2VM2A 1TU7A 3VI7A 3PR8A 4G10A 1QGVA 2O8VB 2OACA 2OKAA 1XW9A 2LJAA 4EE0A 1M9AA 5JCGA 4FYUA 1TW9A 1GLQA 2V6KA 3G7IA 4TXOA 5D96A 1BJXA 2V1MA 1S3AA 4O7HA 2H19A 5F8BA 1OE7A 2B1KA 1XW6A 3HDCA 2YCDA 3LSZA 1GRXA 2KLXA 5KN2A 1OKDA 4G2EA 2FWEA 1GSDA 1K0BA 1O8WA 3ZREA 3LWAA 1C72A 4N10A 2TRXA 4ZL7A 4N11A 1XFLA 4TOPA 2C3QA 4MH2A 2CVKA 3VWUA 1ZYQB 3HY2A 1BX9A 5AIXA 2L6CA 3Q74A 4RQXA 2GVPA 3F9UA 3QDNA 1MDJA 1YKCA 2EIOA 1YF1A 5EY6A 3QFAC 4P3YB 1F37A 1TI1A 1T1VA 3C73A 2R2JA 4L5OA 2WB9A 1TJDA 2ES7A 4FO5A 3KEBA 4MCUA 3S9FA 1SL2B 1ST9A 5ECQB 4JBBA 1FG4A 3ZYWA 2H0GA 3TKSA 1PSQA 2YNXA 4GLTA 1MEKA 1BG5A 1THOA 5CO3A 4GRFA 5JWRB 2LRCA 4J2FA 5DQYA 3LFLA 3CTGA 3L78A 2HI7A 3TKSE 3RBTA 4ULXA 1ON4A 5B8AA 2H01A 2JL4A 4BWQA 1AC1A 1I5GA 1XOAA 4J56E 5DALB 1Q4JA 2DMLA 4ZXGA 4MF6A 1YJ6A 3HA9A 3EU4A 1HNBA 3O3TA 3HVXA 1VF4A 4JE1A 5D9XA 3APQA 2ON5A 4YQUA 4J57E 3FYGA 2B7KA 4BL7A 3UL3A 2G0FA 1Y6EA 2A4VA 1PN9A 1G7EA 2PU9C 1DBYA 1JFUA 2ZUPA 1AUCA 4OFNA 1AAZA 3A5WA 2DLXA 1PD21 4BA7A 3TRPA 3VWWA 2H73A 1SL0B 2B6MA 2GSTA 3HVSA 4IP6A 1U6TA 4POMA 4XIHA 2H8LA 2IMDA 1Y25A 1Z3EA 1GP1A 5JCWA 2XBQA 3QAWA 2KP1A 4PUFC 1JHBA 4OFTA 3IRAA 1GTBA 2V6OA 2PUKC 3I9V2 2Z9SA 2CX3A 4PQ1A 3FZ5A 5DCGA 2C0EA 3H79A 5ELAA 3L9SA 1BQ7A 2NVLA 3TKRA 1R5AA 3D6IA 4AGSA 6GSSA 2A2RA 3FR9A 4Q5NA 2CAQA 2H0HA 4GSNA 3A2WA 4YAVA 1SL1B 4HQSA 6GSXA 2RUEA 3F6FA 4IQ1A 3LJRA 1MTCA 2OBIA 2H0IA 4MJBA 1VRSD 2R6KA 1V40A 2F8AA 4F0CA 1SJIA 2QSIA 1B4PA 1Z9HA 4ECBA 4RQRA 1XW5A 2GGTA 4XS1A 4PNFA 4GTUA 1OKTA 3MAKA 4NXIA 2PWJA 4TR3A 5CAXA 4ZL9A 3HVVA 4GCIA 3EMPA 1BEDA 5J9CA 5IO0A 3OR5A 1K3LA 3FK8A 2F3MA 3ZMKA 1WMJA 1NW2A 2P5RA 1M9BA 4NHWA 4XTSA 2ZNMA 3BCIA 2YWOA 1JZRA 4WF5A 2QGVA 4TR4A 4MF5A 1XWAA 1ZCPA 2VLUA 3LORA 1JLWA 4IGJA 2VD0A 1FVJA 1ILOA 6GSWA 3QCPA 4IHUA 4KB3A 1O6JA 4XRAA 2HZEA 5F07A 1XWCA 2VOCA 5J41A 4JZQA 1BAYA 3DKSA 2LTKA 1YKAA 3F4SA 2B5XA 3D0ZA 3RHBA 2B5EA 4AF2A 4TXOB 1G0TA 5J4UA 1SU9A 1JZDA 3F3QA 5HFKA 4TRXA 3GN3A 4D73A 5HFGA 5B8BA 3ZL5A 4TXVA 2HRNA 1QUWA 4YQVA 3HHVA 1OC9A 3DXBA 1ML6A 4WEYA 4H86A 4DEJA 4QL7A 2FCHA 5FHIA 3TDGA 3ERGA 2L4CA 2DIZA 2FGXA 4CDOA 4MK3A 2AV4A 3HKRA 3LQ7A 1F6MC 4ZIJA 5GAND 3CRTA 16GSA 4K7NA 1TXXA 1GSUA 5HR2A 1A8LA 3DRNA 3GH9A 8GSSA 2X8GA 2R5GA 1S3CA 3GX0A 13GSA 2WFCA 1YF0A 3F6DA 1E2YA 2LQQA 4NWYA 4AJ7A 1HNCA 2GLRA 5A5KA 2H1BA 2VD1A 1W4VA 2AHEA 1F3AA 2CX4A 2VCTA 3UBKA 2DJKA 2N5FA 2GQLA 1DUGA 1EOHA 1XXUA 1SD9A 5D73A 3K8NA 2XC2A 2WJUA 3HJPA 2C1YA 3LYPA 2L4QA 5E59A 5KEJA 2E0QA 1SKSB 3HJOA 4NHZA 3IE3A 4KUNA 4DVCA 1X5CA 2HSHA 1EV4A 5ECHB 3EVIA 3ZFBA 3GSTA 4BPYA 1G7OA 4WR4A 1E6BA 3M3MA 2LV3A 2O85A 2OJLA 2I4AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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