3GKMA

Insights into the alkyl peroxide reduction activity of xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate/ligand complex structures
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGSTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFSAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Insights into the alkyl peroxide reduction pathway of Xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate-ligand complex structures
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris
total genus 51
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gkmA00
3VPTA 3TUEA 2LQQA 3W8JA 4MLYA 2CAIA 3F8UA 1J0FA 2ZNMA 1SYXA 2LEGA 4JBBA 5ECNB 1K0BA 3EMXA 1WOUA 4EUYA 1B48A 3U5RE 3LSZA 4D73B 4I6XA 1M9AA 1WP0A 3ERWA 3QFAC 4GXZA 1NM3A 4P3YB 2L4CA 3VWVA 4OCEA 2VD0A 5C04A 1KEBA 1I9DA 1WIKA 2VL2A 5G1KA 4ZL9A 5IOWA 2CX3A 5DCGA 6GSVA 2GSSA 2H74A 2JU5A 2O85A 1MD4A 3ZVJA 5IO0A 3NZNA 4MH2A 4HJMA 1M99A 2NVLA 2H75A 4V2MA 1ST9A 5ECPB 2GT5A 5D9WA 1YZXA 2YNXA 3DWVA 2H70A 4ZBBA 2OKAA 3TGZA 3EU4A 3W6GA 3TB2A 5LNKe 1FO5A 3RPNA 3GL5A 3E0UA 1RK4A 2LKUA 3G7YA 1YKAA 5ID2A 2CQ9A 5JCGA 2MZCA 1GLPA 4KCAA 1T4ZA 2HI7A 5CYYA 2F51A 2HFDA 5F0GA 2HZFA 1VF4A 3S9FA 3GX8A 3DGQA 1SK2A 1ZMAA 3FZ4A 1BAYA 5H5SA 3HDCA 3UJ1A 2R3XA 2YN1A 3CRUA 3ZFLA 1U3IA 2LUSA 4OWYA 4TR1B 4NPBA 1XWBA 2IIYA 3C1RA 2DJ2A 2GTUA 4WF5A 3QOUA 2GQMA 2KUCA 1Q98A 2HYXA 3F0IA 2R5GA 1ZOFA 3RHCA 2V1MA 3HVVA 5IMDA 5F05A 3I9V2 1CQHA 1U3AA 1SL0B 2GZYA 2PBJA 4TW5A 4D73A 1YF0A 1X5CA 5CRWA 2VAFA 3N9JA 2WRTA 1OC9B 4WR4A 1HYUA 5DJLA 4PUAA 3P8WA 3BD2A 2H72A 3VWXA 3F3RA 1U88A 4OCFA 2K6VA 1TI3A 2YWMA 4V1Ap 2JSZA 2LTKA 2OE3A 3VURA 2AAWA 4MJAA 4EDZA 2IMEA 3L4NA 5ECKB 3US3A 3VI7A 2GVPA 1YDKA 3D21A 1A8LA 1TXXA 3KZQA 2EC4A 1V57A 5HR2A 1TKDB 1SK1A 2DJ1A 4L8EA 4KA0A 1FOVA 4O32A 3IK7A 2IPAA 3IA1A 4YQMA 1GH2A 3ZVJD 2NPBA 1S3DA 2AUVA 5J9BA 2LNSA 4MP4A 4CHSA 2KP2A 4TR1A 1WWJA 3ZFBA 2LJKA 4BVXA 4IQAA 1S3CA 3EMPA 2JACA 3GX0A 1TJDA 3CSHA 2DJJA 3IC4A 2XHFA 4Q5QA 5HFKA 4YAPA 2LS5A 1HQOA 3I69A 1JHBA 2KP1A 3D0ZA 1K3LA 2IL3A 3GMFA 4ISDA 1WE0A 1SKRB 1QUWA 1K0MA 3TJJA 1SD9A 1X9WB 1XWKA 4X0XA 2JL4A 1V58A 3IOSA 1N2AA 2QSIA 5J9CA 3G7IA 4XS6A 2DJ0A 2AJQB 4F82A 1IYIA 1UVZA 4WKWA 4MJEA 1GNWA 4KAEA 5F07A 3HCZA 1YKCA 2OA7A 5J3RA 5AIXA 1ACVA 3BBYA 4GQCA 1OC9A 5DQYA 4KDYA 2O8VB 1JZDA 2IJYA 4KDUA 2HE3A 3UBLA 1EP8A 2K8VA 3FR9A 1M2AA 3KXOA 3C7MA 4EDYA 4RUVA 1MDKA 1F2EA 3VK9A 1Z3EA 3V1WA 3TRXA 3IV4A 1URMA 5HR0A 5FHIA 1K0AA 1ZYEA 2HSYA 2WFCA 4GSSA 1B8XA 1SL1B 1R5AA 4XCSA 17GSA 1V40A 1AXDA 4CDOA 2DBCA 3DRNA 3TJKA 3IK9A 1K0OA 4FYUA 1FVJA 3KP9A 2H6YA 1ZZYA 3RDWA 1IYHA 4J56E 2CVKA 1ZGNA 2R37A 3TJGA 3ZMLA 4ZIJA 3HY2A 4LL4B 1SU9A 2PVQA 3Q19A 2CAQA 4E8EA 2CA8A 3APQA 2WULA 4HI7A 5G2ZA 1A0FA 1Y6EA 5G5FA 4ZILA 3ME7A 2IWTA 4XRAA 2GSRA 3IDVA 4ML1A 5KN0A 13GSA 3O76A 1OYJA 3FW2A 3HZ4A 5ELGA 3F4SA 5HQPA 4KH7A 5KEJA 2DIYA 3D4TA 2FWHA 2NTOA 4FH8A 1NHYA 4V2LA 1EV9A 4QQ7A 2CVDA 1RQMA 2CX4A 4K0GA 3FZ5A 2QC7A 4NAXA 4N10A 3RBTA 3UMAA 1T3BA 3LYKA 2FWEA 3HD5A 2N5AA 1ERVA 1SJZA 2JZTA 2PVOC 4Z7XA 3GKMA 2FGXA 5F06A 5CP1A 1R5PA 2F8AA 4ECJA 3CTGA 5JCUA 3QAGA 2G2QA 3WT2A 4NMUA 1TRSA 1H75A 4MPGA 1MDJA 2F9SA 4K2DA 4ZBAA 2C8UA 9GSSA 2GZPA 1WPIA 2VCZA 1GTIA 3UARA 4MF5A 1BQ7A 3IR4A 3I6AA 5LCZA 4JE1A 2YV7A 4F0BA 4KSMA 1ZYQB 5AGYA 2H76A 1GSQA 4DSRA 1GTBA 1GWCA 1JFUA 2F3MA 3FY7A 1O85A 1U87A 2V32A 4WEYA 4PNFA 5CO3A 3KP8A 5D93A 2FWFA 2OACA 5DAKB 1PD21 2TRCP 2WDUA 5ECRB 2GS3A 4V1Ag 1ZL9A 3DVWA 2ON5A 4E8HA 4GTUA 5IQYA 1PGTA 2L5LA 1E2YA 1B9XC 4PQIA 3TKPA 1QK8A 3GN3A 2HT9A 5GSSA 1XVQA 1QFNA 1GUHA 1XW9A 3A3TA 3GURA 4PQHA 2VOCA 1A2LA 1B4PA 22GSA 2XPEA 4ECCA 4ULXA 1SJIA 5DQSA 4MZBA 4MF6A 4IP6A 5IMVA 1PA3A 2VM2A 3MAKA 3KTBA 1PL1A 1F3AA 4MJBA 3KIJA 2YWNA 1O8WA 1T1VA 4EE0A 3F6DA 2LQOA 2HLSA 2LRTA 2IMKA 2C3NA 1T4YA 1CQGA 4O92A 2GZZA 4NV5A 3ZIJA 5J41A 2H0HA 1EP7A 2FHEA 1GSEA 2LRNA 3ZTLA 3FRCA 5HFGA 1JZOA 3IAM2 1J9BA 1LU4A 4Q5RA 3UAPA 4GRFA 4WF4A 3ERGA 2KHPA 3H4KA 2L6DA 5DALB 4IJ3A 3GHAA 4BL7A 2PERA 3Q6OA 2C3QA 1FAAA 3GRXA 2MMAA 5D9XA 3LJRA 4RI7A 5IMFA 3DIEA 1SJ6A 3WGDA 2NDOA 2TIRA 4F0CA 3KD0A 3TRPA 2XBIA 1SKSB 3RAZA 5DAKA 2VM1A 1YEPA 2K8SA 3EURA 3GTUB 2HRFA 3F3QA 3DYRA 2CZ2A 3LQ7A 1S3AA 2LJRA 2PWJA 4TR4A 4GSTA 1AAZA 4GF0A 2H73A 3GNJA 2VCWA 1HNBA 2A2SA 3ME8A 6GSUA 4Q5FA 3MWHA 1X0RA 1YQ1A 1A2JA 2C0EA 4TRXA 2VO4A 2O7KA 2I81A 3ZITA 1F37A 2ZCTA 3P90A 3F6FA 2VL9A 1OC8A 3TJFA 1XFLA 1ERWA 3C73A 4N11A 1ABAA 4J57E 5EPFA 2L5OA 4HS1A 4BA7A 1QXHA 1DE1A 3ZYWA 1FB0A 3MDKA 1O8XA 1VF3A 4FYCA 3VI5A 3KJYA 4IGJA 1A23A 1PKZA 1GSYA 5ECMB 2FUG2 3WT1A 4LL1B 4KNDA 4ZXGA 3VFIA 5A5KA 4IS0A 3U6VA 5B7CA 1LBKA 4L5LA 2C0FA 1JZRA 4NHWA 2AYTA 1RW1A 1G6WA 2AB6A 3QD9A 4DSQA 2HNLA 4IJIA 3GL3A 5GZZB 4RQXA 4HDEA 6GSTA 5CNWA 5DALA 4K7OA 4LMVA 1F3BA 1A8YA 4ACSA 1PKWA 4JEDA 5GAND 3C71A 5F8BA 4AJ8A 4N30A 5ELAA 5H5RA 4BVYA 1FVKA 1FG4A 4KSOA 1KBNA 4DSSB 6GSXA 4RQRA 2YWOA 16GSA 2BTOT 2DMLA 5CREA 4POMA 2E2GA 2C0DA 1XCCA 1J08A 3CBUA 4NWYA 1ZCPA 4XIHA 5H5QA 3GTUA 1UA5A 3RHBA 2E7PA 5A4UA 1EOHA 1XPVA 3EYTA 1XVWA 1DBYA 1XOAA 4KUNA 1X5DA 1QMVA 1LJRA 1JLVA 1OE7A 4HUAA 1UN2A 3MNGA 5L71A 3SWLA 3L78A 3PR8A 3M9JA 4YQUA 3O3TA 2LJAA 3GFKA 3UEMA 3K8NA 3EVIA 3KMNA 2PGTA 4MDCA 2C1YA 2MMNA 3FKFA 4AF2A 1TK0B 3FZ9A 3TKSE 5JWQB 4LA1A 4I5QA 4YAVA 3EWLA 4K8MA 2B1KA 5B8AA 3KGKA 2A4VA 1PSQA 2XBQA 1F9MA 2H1DA 3LYPA 3CTFA 4JU5A 2JADA 2CT6A 2GQLA 5LD0A 3L9UA 2B6MA 2YWIA 2P0GA 5IM9A 4IKHA 1GULA 1VRSD 2VLTA 1PQNA 2GT6A 4I8BA 1GTUA 3H1NA 4MK3A 7GSSA 11GSA 3N5OA 3GKNA 1XWGA 4MZCA 3J7Yb 3TJBA 3A5WA 3IAS2 1TTZA 1ERUA 3JCML 4AJ7A 3QMXA 5ECOB 3GIXA 4Q5NA 1XIYA 1HD2A 4LMWA 4JRRA 3AY8A 3ERFA 4K0NA 2OE1A 2HRNA 5D9VA 3ZIVA 2DSAA 4ZB6A 10GSA 3IE3A 3ZLPA 2QGVA 2VCTA 3A2WA 1AUCA 4IN0A 3TDGA 4NXIA 3Q74A 1T8EB 4TXOB 2IMIA 1GSSA 2H71A 4OO5A 1FB6A 4MZWA 1SYRA 1NW2A 1SK0A 2H1AA 2IN3A 1SD8A 2VUPA 4MH3A 1K0DA 2JSYA 1XXUA 2VIMA 4K7NA 5EL8A 2DC5A 4QL7A 1GSFA 2YCDA 4IBPA 2QKEA 5B6MA 3TCOA 5GSTA 3L9SA 2DMMA 4NHZA 2BMXA 3TKQA 4FO5A 4K1FA 2A2RA 4JR4A 1THXA 2X8CA 1H4OA 4PX1A 2M46A 1WJKA 4BWQA 5A4VA 2MMOA 3FR6A 3DD3A 4IVFA 2X64A 3EU3A 3GKKA 3HJOA 4MA9A 1Y25A 2Z9SA 3CRTA 1AW9A 1YEXA 1ILOA 4N0ZA 2VLVA 2EIRA 1MEKA 2RUFA 2WJUA 2H0GA 5FT3A 3PGTA 3TOTA 3FR3A 3QR6A 2YJ7A 2L57A 3O6TA 3H93A 3ZZXA 5DDLA 2I4AA 2PN8A 3EE2A 1Z7RA 3R2QA 1TW9A 3KTLA 4MMMA 1O81A 2I1UA 1PL2A 1G0TA 1ERTA 1B9YC 20GSA 1WRYA 2X8GA 3QAWA 2WZ9A 3BJ5A 3GA4A 6GSSA 1EOGA 2WGRA 4K6XA 1HNAA 4KGIA 1N8JA 1KNGA 1XOBA 4ECIA 3GSSA 4GCIA 4XRDA 4HQSA 4ZBDA 2H1GA 2V2GA 3GUSA 4TXOA 3WD6A 2H66A 3DVXA 4J2FA 4OFMA 1A24A 1TDIA 3APOA 3ZRDA 1GTAA 2KOKA 2RUEA 1YJ6A 1T00A 4WR5A 3TRQA 3HHVA 3F63A 5E4WA 2FCHA 1XWAA 5D73A 1JZWA 4TKYA 2I9HA 3M0FA 1OC3A 2JZRA 5DVBA 3L9VA 1K3YA 1Z5YE 2HXKA 3DMLA 4PNGA 3GYKA 4ID0A 1M2DA 2OBKA 1GNEA 1GSDA 4OFNA 3WGEA 3SBCA 5G1LA 2I3YA 3W8SA 1DE2A 2RLIA 2WCIA 2KLXA 5G31A 2VLUA 4BWSA 5CRDA 4G10A 14GSA 3IBHA 5GAPD 3L0HA 5IMAA 2L59A 5HR3A 5CRGA 3A2XA 4YQVA 1A0RP 3ZL5A 3D6IA 2PMTA 1PX6A 3HZ8A 4EC0A 4XHMA 1EEJA 2LNTA 1AC1A 1G6YA 5COHA 1I5GA 2GQKA 3HA9A 1KTEA 2C0GA 3KEBA 3C8EA 1Q4JA 1TP9A 4K9ZA 1EEMA 2M80A 3WYWA 2B1LA 1GL8A 1PX7A 2YV9A 2N5BA 2L4QA 1TK8B 2H30A 1MTCA 3LORA 2ALBA 2FA4A 4OMVA 4HOJA 1FHEA 2IFQB 1OKDA 3LGCA 1USBA 5B8BA 4HQZA 2MBTA 3G9BA 3J7Yk 3TKSC 1Z6MA 1Z9HA 1O7UA 2HZEB 3UVTA 2FY6A 2R6KA 3A2VA 4DEJA 3BCKA 4TN8A 2MBSA 5IMCA 1EWXA 4AGSA 1O73A 1TOFA 2E0QA 2RM5A 3BOAA 4XTSA 1K0CA 3UIWA 12GSA 4IP1A 5EVOA 3H8QA 1M7TA 1TK5B 1BJXA 4KX4A 3UOMA 5JWOB 4IQ1A 4TR0A 3DKSA 3ED3A 5ECQB 1MD3A 1YY7A 5C00A 1OKTA 5ECSA 2HSHA 5HFIA 4YH2A 4TR3A 1BG5A 2J23A 3D4MA 3KM6A 3D22A 5ECLB 4HZ2A 3PH9A 1W4VA 4KDXA 1R7HA 2VCQA 2WS2A 4IELA 4O7HA 4ZL7A 2VCVA 2DLXA 1BEDA 1QQ2A 2DJ3A 2H6ZA 1Z7PA 3P7XA 1ON4A 4F9ZA 3FHKA 4POBA 1XW5A 5INYA 1GUKA 4ZL8A 3RPPA 1M9BA 4MJCA 4FIWA 1TI1A 3F4RA 2DIZA 1OVNA 4F03A 2N5FA 1XWCA 1AIUA 4KW6A 2FLSA 1M0UA 1XZOA 4EXJA 2IMFA 3IRAA 3LXTA 1PRXA 6GSWA 2IFQA 2B7JA 2P31A 5E59A 2CV4A 1X9MB 3GKXA 4X1UA 5IOXA 2AHEA 4RI6A 5JWRB 3HVXA 5D8IA 1PMTA 4GLTA 4WETA 2H6XA 3NIVA 2HZEA 5G5EA 3FZAA 4POKA 3VWUA 4CW9A 3TKSA 1BYEA 4PURA 3QDNA 3LEFA 3KMOA 2YZHA 5ECIB 5IPHA 1OE8A 5A4WA 4XS1A 5AIVA 3ZMKA 2R4VA 5IO2A 3Q18A 2D2ZA 4ML6A 3QAVA 3M3MA 4GWRA 3BCIA 3GH9A 1QGVA 3D5JA 4JZQA 2GSTA 4X43A 3LWAA 4WXTA 1U6TA 2MMZA 3NOFA 5ENUA 4L0WA 2LSTA 3EINA 3KCMA 1R26A 1GLQA 5FWGA 2M72A 4KB3A 3DXBA 3M8NA 4G9HA 4OO4A 5IMZA 3LG6A 4DVCA 4MCUA 4XS4B 2PU9C 2C3TA 1HNCA 2XPDA 2B7KA 3WGXA 1TRUA 1T7PB 1GSUA 2O87A 3LXZA 4TXVA 1VGLA 2YANA 3GSTA 4I2TA 4G2EA 5KN3A 2WB9A 2C4JA 4K7IA 2FNOA 5DCHA 3F9UA 4MF7A 5CAXA 3HYPA 2FD3A 3F4TA 5AISA 2H8LA 3IPZA 3CMIA 5DBQA 4POLA 1AQWA 4IW9A 4OFTA 4EO3A 3C1SA 1NSWA 2H01A 19GSA 3M9KA 3TKRA 1EZKA 2GDRA 1GRXA 2H0IA 4LLRA 4EKZA 5HR1A 2F8FA 3KH9A 2PUKC 4N0VA 2X99A 2ES7A 4DSSA 1JLWA 1K0NA 5ECHB 1XBSA 4L5OA 1SENA 3HXSA 1NHOA 1OAZA 1PN9A 3QCPA 1G7EA 2P5RA 2OE0A 5IIZA 2YZUA 2G0FA 3FEUA 2C80A 4BPYA 2E2MA 1O6JA 2B5XA 2J9HA 4F2IA 2V6OA 1VF1A 3I43A 5KN2A 1MDIA 4I97A 5AN1A 3HJMA 4HU9A 3APSA 2GGTA 3GH6A 2VD1A 3VWWA 1Z6NA 2MYGA 5EY6A 3VLNA 2CVBA 4I2UA 2REMA 1THOA 1C72A 3UVHA 2LRCA 2OADA 3ISOA 1SL2B 8GSSA 4XS4A 5J5NA 3CSIA 3GV1A 4PQ1A 1TRWA 4WBRD 3IXRA 1EV4A 1B4QA 4O5RA 3CXGA 2ZUPA 3G7JA 3QPMA 1V98A 5G30A 1X5EA 1BX9A 4KCEA 1DSBA 3TOUA 3UL3A 2PPTA 4PUFC 5B6NA 3IHQA 1XW6A 2CZ3A 3H79A 2B5YA 4TOPA 2AV4A 4WBJA 2GLRA 4PXOA 2B5EA 4OD7A 5D96A 2DJKA 3LFLA 2NBSA 2H1BA 3OR5A 3CYNA 3M1GA 3CSJA 4HJ2A 4GQFA 3FYGA 4TVEA 3VPQA 2EIOA 4AJ6A 5KN1A 2RIIA 1TU8A 1UC7A 2VL3A 4NV2A 1AQXA 4ZB8A 2VCXA 1FW1A 2R2JA 1V9WA 2FA8A 2VL2C 3HKRA 4PGTA 1GUMA 3DEXA 2BJXA 2YOIA 4KE3A 2RM6A 4ECBA 5IPGA 1A2MA 4FYBA 2O89A 2GSQA 2FWGA 5J4UA 2YJHA 2YP6A 2V6KA 3HJPA 3ZREA 1R4WA 3QFBC 2OBIA 2B3SA 4HZ4A 1W89A 4JR6A 2JZSA 1K3OA 5ABRA 4ILFA 5DJMA 2EIQA 2YPMA 4H86A 1EGRA 4HU7A 2ON7A 6GSYA 1EGOA 4V2NA 2TRXA 1F6MC 1G7OA 2LV3A 2OJLA 1TU7A 1TRVA 3KH7A 2V41A 5CRHA 1X9SB 5ID2B 1E6BA 2X8HA 4EF0A 4GSNA 1WMJA 2IMDA 1GP1A 2P5QA 3MSZA 3EC3A 4QL9A 4L0UA 1ML6A 4ZB9A 4MABA 2L6CA 3PINA 4G19A 2H19A 18GSA 2XC2A 5D9TA 5JCWA 2K9FA 2K18A 3FK8A 1M2BA 3HVSA 3E9JB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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