3HY2A

Crystal structure of sulfiredoxin in complex with peroxiredoxin i and atp:mg2+
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVDPTEIIAFSDRAEEFKKLNSQVIGASVDSHFEHLEWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVSPAGWKPGSDTICPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein Engineering of the Quaternary Sulfiredoxin-Peroxiredoxin Enzyme-Substrate Complex Reveals the Molecular Basis for Cysteine Sulfinic Acid Phosphorylation
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Peroxiredoxin-1
total genus 53
structure length 185
sequence length 185
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hy2A00
2HSYA 4AJ8A 2R2JA 2CV4A 2VL2C 3FR9A 5C04A 2AAWA 4LMWA 3EU3A 1GLQA 3IR4A 1K0CA 4MMMA 5H5QA 4HQZA 4KSOA 1GUKA 1O8WA 2G2QA 1SU9A 2OA7A 5ECMB 1TK5B 1JLVA 4F0BA 2GQMA 1WWJA 4V2NA 3VFIA 1O85A 4RI7A 3EWLA 3TDGA 5DAKB 5CNWA 2GGTA 3W8SA 4FIWA 2H0HA 3LQ7A 4L5OA 1TKDB 4I2UA 1R4WA 1JZDA 3CRTA 2EIOA 1BAYA 1HNBA 3KIJA 1K0BA 1TOFA 5ECHB 1SK0A 1PRXA 3TKSE 5IMVA 2VCTA 4I2TA 2MMZA 1DSBA 3FYGA 1YF1A 2WJUA 2YWMA 4NHWA 2IWTA 4K7OA 3JCML 3CTGA 2YANA 1FHEA 1A2LA 3KH9A 3HCZA 2RIIA 4ZL8A 5IO0A 4D73B 3HJMA 2GS3A 2YWOA 2HE3A 3ZVJD 2N5BA 5IIZA 1EEMA 2AJQB 1PL1A 1ZYQB 5ECSA 2HI7A 4PNFA 3CTFA 1YZXA 4X0XA 3E3EA 2FGXA 1NSWA 2CAIA 4ECIA 2PN8A 1NHYA 1X5EA 4MJBA 4TR3A 4WEYA 4J2FA 1W89A 4DSQA 2DSAA 3R2QA 2I81A 1YF0A 1MDJA 2X8GA 2VL3A 2O85A 5IM9A 2TIRA 1OC8A 2AHEA 2YWNA 2K18A 2DLXA 5DALB 4ZB8A 2WZ9A 3GMFA 2NDOA 4L8EA 3E9JB 4F0CA 4GXZA 3LGCA 5AISA 2QGVA 4MH2A 2ZNMA 5E59A 5D9WA 4DEJA 3LEFA 4PQHA 1G7EA 2JACA 2VO4A 4GQCA 2YV9A 3LORA 3IAS2 3U6VA 3GKNA 2PVQA 2OBKA 4XTSA 1B9YC 2C80A 4MZCA 3ERFA 4NV2A 3VWXA 2XPEA 2GVPA 3VPQA 3UBKA 2FA4A 3GX8A 16GSA 4AJ7A 1NW2A 4ZBBA 1V57A 4F82A 3M1GA 1OYJA 4DSSA 1BEDA 1SL1B 4KA0A 3D0ZA 2IIYA 2M80A 1X9MB 2VM2A 5JCUA 3IOSA 4IW9A 4GSSA 2R6KA 1PGTA 4N0ZA 1V40A 1EOHA 2H0GA 5C00A 1GWCA 3DWVA 1F3AA 2LNTA 2PGTA 2WULA 3EYTA 3ZRDA 1FOVA 1U88A 4XS4B 1S3DA 1RW1A 3TKSC 4MZBA 2XPDA 2YWIA 1FB6A 1XPVA 1AIUA 1X9WB 2IMKA 3TRXA 3F63A 5ECNB 4AGSA 3CYNA 2WS2A 2VCZA 4BPYA 4GSNA 1H75A 4LL1B 2C3TA 1PKWA 5F05A 1BJXA 3Q6OA 4EKZA 3ZZXA 2HFDA 4EC0A 2EIRA 1XVQA 2IPAA 1C72A 3IK7A 3H8QA 3TKPA 2I4AA 2GTUA 4OFNA 5ECLB 5A5KA 4KSMA 2LRTA 4FH8A 3IBHA 3GTUA 4NV5A 4IP1A 4BA7A 1HNAA 1A2MA 3HY2A 2FA8A 1ON4A 5B8BA 4PQIA 1XW5A 1XWBA 5HFGA 1PD21 4HZ2A 4HZ4A 1GLPA 4XCSA 4HU7A 1U6TA 3C1RA 1MEKA 4ZBDA 3ISOA 18GSA 2M46A 3QFBC 2CA8A 2L57A 3HVXA 4HUAA 4IHUA 1DUGA 1TK0B 3ED3A 3UJ1A 3O6TA 2YNXA 3P7XA 1R5PA 4MA9A 1O8XA 2OACA 2DC5A 4J56E 2FCHA 3UARA 2GT5A 4GWRA 3DKSA 1Y6EA 2O7KA 4F9ZA 3QR6A 1F6MC 3W8JA 2IMEA 4XRDA 2DMLA 1Z7RA 2B5YA 2OE3A 3GSTA 5B6NA 1USBA 2PVOC 3TOTA 4ZB9A 1HNCA 3APQA 2NPBA 4TR0A 3DVWA 2P0GA 1PX7A 1LJRA 5HQPA 3L9UA 4ULXA 3GSSA 2V32A 4OFTA 2HRNA 1JZRA 1E6BA 9GSSA 1EGRA 3EVIA 1GTBA 3F9UA 2VAFA 2CQ9A 2H6XA 2JU5A 2YJ7A 4FYCA 6GSVA 5CRGA 4LL4B 5JWOB 5A4VA 2IFQB 4EL1A 4RUVA 2VLVA 3H1NA 1WPIA 5FT3A 2B5EA 1TRUA 3F0IA 5G1LA 4YQUA 5HFKA 4ML1A 3DD3A 3QFAC 5ECRB 3IXRA 2PUKC 1SKRB 1M9AA 3LSZA 4ZXGA 1ZYEA 1HQOA 3KM6A 3H93A 4I8BA 2I9HA 5CO3A 3HJPA 3KTBA 4V1Ap 1J9BA 4Q5QA 4DVCA 2GQKA 4IELA 2MYGA 4L0UA 1SK2A 4MF6A 2YOIA 2F3MA 3GX0A 3KXOA 1O73A 4OWYA 1G0TA 2B5XA 4MLYA 2VD0A 3VWWA 2X8CA 3GH6A 3QD9A 4GCIA 1ZGNA 4I6XA 4TXOB 4E8HA 1KTEA 1M7TA 3VPTA 1EZKA 5FHIA 3OR5A 2AV4A 4Q5RA 2FWEA 3HXSA 3GV1A 4MPGA 2HZEB 2O8VB 5DJLA 5J41A 2H0IA 5EY6A 1YEXA 1YJ6A 1EWXA 3PINA 2MMAA 3NIVA 4G10A 1GSFA 2NBSA 5J3RA 1A24A 2GZYA 1TU8A 3GA4A 3ERWA 2EC4A 3DYRA 3ZMKA 4K6XA 1PSQA 1FO5A 1T1VA 2LRCA 1SL0B 3UL3A 4GRFA 4KNDA 2FWFA 2CVBA 5G2ZA 1HYUA 3APSA 3FW2A 2H30A 2TRCP 3MWHA 1Z5YE 2PU9C 3CSIA 3HDCA 1I5GA 5GAND 1MD4A 5AIVA 2X99A 4MPFA 3LYKA 3UEMA 1OC9A 4WBRD 3DVXA 4CDOA 4BWSA 1V9WA 4G2EA 1QQ2A 2MBTA 2H74A 2OJLA 4WR4A 1PA3A 3HVVA 3LJRA 1B4PA 4O32A 3EE2A 1VF3A 1OKDA 1BQ7A 5CAXA 5DAKA 2I3YA 3ZREA 4KB3A 3KD0A 4TKYA 4V2LA 2JSYA 2C8UA 2ON7A 3C73A 3KJYA 3D6IA 1JFUA 3FZ4A 3DMLA 3GRXA 1AQVA 4PUFC 4YAPA 2ES7A 1XVWA 4OMVA 1SYXA 1XWGA 3GN3A 3G7YA 3HJOA 4MJCA 2C3QA 5IMZA 3WT2A 3V1WA 1Z9HA 3DXBA 3TRQA 3HZ8A 1AC1A 3RPPA 4MK3A 1GH2A 5L71A 3FZ5A 8GSSA 2L6DA 1O81A 3CRUA 4EDZA 4POKA 3FHKA 4D73A 3FR3A 3GKXA 5CP1A 3SWLA 2BTOT 2LNSA 1EV9A 2L4QA 2YV7A 4KH7A 4AF2A 2VM1A 4K7IA 3L4NA 2H01A 3Q19A 1SD8A 3CBUA 1ERTA 2NTOA 1FW1A 4FO5A 2H71A 1B4QA 5HR1A 1TI1A 2JZSA 5IOWA 4IP6A 2KHPA 5DBQA 5IPGA 1B9XC 5JCGA 5D9XA 1U3IA 3IPZA 2ALBA 3NOFA 1Z6NA 1GNEA 3FR6A 4ISDA 4H86A 5H5RA 3C8EA 2CX3A 3EMPA 5B7CA 4HJMA 4TR1B 5IQYA 4KW6A 5ECIB 1I9DA 2QKEA 5DALA 2LQOA 2GSTA 1FVKA 3HKRA 2CX4A 6GSSA 3QCPA 5IMDA 2RUFA 4TW5A 1CQGA 3ZVJA 1WIKA 3ZFBA 4V1Ag 2HYXA 3G9BA 2K8VA 2LSTA 4HS1A 2R5GA 4OCEA 4GTUA 3EU4A 5G31A 1OKTA 1XCCA 2REMA 2TRXA 3O76A 1R7HA 4DSRA 3KH7A 2H1BA 5G30A 3CMIA 3RBTA 1XWCA 1A8YA 1EEJA 3I6AA 3GH9A 1UN2A 4GLTA 2HZFA 5GSSA 4EF0A 1VF1A 1YKAA 2GQLA 5F0GA 3ERGA 3VLNA 5CRWA 4N10A 1N8JA 3ZIJA 4K8MA 4KCEA 1W4VA 2H70A 4POMA 1U3AA 1GUHA 2K6VA 4K0NA 4NXIA 2YZHA 2DJJA 3QAGA 2VD1A 2BMXA 2DMMA 3I9V2 4ZIJA 1X0RA 2QC7A 2HRFA 2LJKA 3L0HA 2N5FA 4MABA 5ELGA 4O5RA 4I5QA 3BD2A 4HI7A 1PN9A 2XHFA 1JZOA 2GLRA 5LD0A 1VRSD 1T4YA 3FZ9A 4G19A 5KN2A 3LXZA 4XS4A 4N11A 2X8HA 2C0DA 2IMIA 2ZCTA 4P3YB 2JZRA 1SJ6A 3S9FA 3CXGA 1XXUA 3UAPA 1IYHA 3A5WA 2O87A 1T7PB 3LYPA 3EINA 3KGKA 1T8EB 4WBJA 2P31A 5D9TA 3UVHA 1F37A 3BJ5A 1KNGA 1XBSA 5ID2B 3UMAA 2KLXA 3VWVA 1TI3A 1ACVA 5G1KA 4TR4A 2VL9A 2IMFA 1XWKA 11GSA 3FK8A 3WGXA 1YQ1A 1GRXA 4L5LA 6GSWA 2WCIA 3GKMA 1MTCA 1T4ZA 2XBQA 4MP4A 3K8NA 4LLRA 3O3TA 4O92A 5D93A 2FD3A 1QUWA 1GSUA 1TRVA 1QFNA 2E0QA 2R3XA 3IV4A 2RM5A 4O7HA 4GF0A 2DJ0A 2HSHA 3A2XA 2K9FA 5D73A 2RUEA 4NPBA 3CSHA 1FVJA 2C4JA 4IKHA 4TRXA 2K8SA 4IQ1A 1ZL9A 4IGJA 13GSA 2MMOA 3IC4A 1LU4A 4KCAA 3ZYWA 1XW9A 4Q5FA 1SK1A 2H1AA 1A0RP 1PL2A 1ILOA 1ERUA 1V98A 2G0FA 4X1UA 3SBCA 3VI5A 4K0GA 4TVEA 4TOPA 3F4RA 1XOAA 6GSXA 1AAZA 3Q18A 3BBYA 2VCWA 1GSQA 3QAVA 4ILFA 1WJKA 3F3QA 4OO5A 5HFIA 2JL4A 2LKUA 2MZCA 1TW9A 1M99A 4TN8A 3TKQA 2VLUA 1TXXA 1XOBA 5AIXA 3M0FA 3VWUA 3A2VA 4IBPA 2WDUA 3G7JA 4PNGA 3M3MA 3LG6A 5F06A 1GSYA 1A2JA 2FLSA 1GSEA 4QL9A 4ML6A 4HDEA 3GL3A 4BL7A 2A4VA 1K0MA 2OE1A 3TJKA 2E7PA 2FY6A 2LTKA 4BWQA 1Y25A 2YZUA 5B6MA 3HHVA 1GP1A 2LS5A 5IMCA 1E2YA 3ME7A 1AUCA 1BYEA 22GSA 1Q98A 4IN0A 5LCZA 2V6OA 5LNKe 4EUYA 5J9CA 3N9JA 1GTAA 4K2DA 1K3LA 1F3BA 4NHZA 3EURA 3NZNA 2HNLA 3LWAA 4BVYA 2LUSA 2B7JA 5INYA 3ZFLA 1XFLA 1Z7PA 2I1UA 2P5RA 5A4WA 1OAZA 4N30A 3I69A 1VF2A 2VL2A 5ABRA 5AN1A 3GURA 1XIYA 2LJAA 2VCQA 3F8UA 1G6YA 1N2AA 5JWRB 3RDWA 1R26A 4XS1A 3DIEA 1ML6A 2GZPA 2LRNA 1VF4A 1QK8A 1Z6MA 1THOA 2F8FA 3Q74A 5KN3A 1R5AA 3DRNA 4POBA 3D21A 4EE0A 2WFCA 3TGZA 1UA5A 3GYKA 4TXOA 2BJXA 1TTZA 1AW9A 2VLTA 1G6WA 2VCXA 2FWHA 5DJMA 2C1YA 1SKWB 1T00A 3FRCA 3GUSA 1G7OA 3RHBA 4N0VA 3ZMLA 3WGDA 2YP6A 3G7IA 4JR6A 4YH2A 2CVKA 3UIWA 4PURA 2YN1A 4HQSA 1LBKA 3MNGA 4RQXA 4PX1A 4PXOA 3IE3A 4OCFA 2F9SA 4EDYA 2XC2A 1TJDA 5GZZB 5AGYA 1M2BA 5EVOA 5JCWA 5E4WA 3F3RA 4K7NA 2RLIA 2OKAA 2AB6A 3FY7A 1PKZA 2FUG2 1WOUA 2LEGA 3UVTA 1YKCA 3J7Yk 1K0AA 1EGOA 3UBLA 2H8LA 1DE2A 1FAAA 1WMJA 2L5LA 3F6DA 4F03A 3KTLA 2V41A 2R4VA 2Z9SA 1WRYA 2AUVA 2GT6A 5D8IA 4OD7A 3F4TA 4KDUA 4MF7A 2VOCA 1YY7A 4I97A 2E2GA 2H75A 3TRPA 2B1KA 1GSSA 1WP0A 3WD6A 3M9KA 2XBIA 2H19A 3M8NA 4JZQA 4OO4A 3VK9A 3RPNA 1GSDA 1A8LA 1GUMA 2F51A 2DBCA 3QAWA 2ZUPA 3TCOA 3KCMA 1H4OA 1F2EA 2E2MA 2VUPA 1FG4A 3KMOA 3KEBA 2YPMA 2PWJA 4ZL9A 5HR0A 1XWAA 4JEDA 1ST9A 4ECCA 3F6FA 4HOJA 2JSZA 3ZITA 2L5OA 1Z3EA 1CQHA 1GTUA 5F07A 2DJ2A 5J4UA 1U87A 4JE1A 3ZLPA 2ON5A 1YEPA 4E8EA 3IHQA 4QL7A 3E0UA 5D96A 3PGTA 2IL3A 3GFKA 4GSTA 4K1FA 1TU7A 3APOA 1V58A 1F9MA 2HT9A 1OC3A 2PMTA 2OADA 3L9SA 2LQQA 2N5AA 4X43A 2L59A 4K9ZA 1PQNA 4IS0A 4OFMA 3HA9A 5A4UA 3U5RE 3L78A 5IMAA 1SYRA 4ACSA 4KAEA 2PERA 4ZL7A 4Z7XA 1T3BA 4QQ7A 1SD9A 5G5FA 4F2IA 2CZ3A 3ZIVA 4NAXA 1JLWA 3P8WA 3L9VA 4J57E 3TKSA 3KP8A 5CRHA 2F8AA 3PH9A 3HZ4A 3TJBA 1OE8A 2WGRA 3TKRA 1RQMA 2HXKA 4CW9A 5DCHA 5GSTA 4DSSB 4TR1A 1B48A 2FHEA 12GSA 1S3CA 2P5QA 1A23A 3VURA 2H6ZA 5G5EA 6GSUA 3TJGA 3CSJA 3WT1A 2LV3A 5IMFA 4XHMA 1GL8A 3QOUA 5ECPB 4WETA 3KZQA 2H76A 4XS6A 3TOUA 1TRSA 3C71A 5J5NA 4EXJA 1ZMAA 1KBNA 2H73A 4XIHA 2IN3A 4JR4A 4POLA 1K0OA 1YDKA 5ECKB 4ZBAA 5HR3A 3RAZA 4HJ2A 3WGEA 1THXA 3D4MA 4EO3A 4YQMA 3EC3A 5B8AA 6GSYA 2GZZA 2M72A 4L0WA 4MJAA 1EOGA 2DJ1A 5F8BA 4RI6A 2H72A 4G9HA 1OE7A 4KDXA 3P90A 2JADA 5CYYA 2X64A 1M2DA 1XZOA 1EV4A 5EPFA 4KE3A 2MBSA 2YJHA 1K0DA 1RK4A 4JRRA 1EP7A 2JZTA 4V2MA 2V2GA 3H79A 17GSA 4BVXA 3C1SA 3GHAA 3GTUB 2B7KA 1TP9A 3LFLA 2L4CA 1HD2A 3MAKA 3BCIA 5H5SA 1QGVA 2VIMA 3DEXA 2EIQA 1DE1A 1NHOA 1VGLA 1XW6A 5D9VA 7GSSA 3IAM2 3VI7A 4WXTA 2GSRA 2WRTA 20GSA 2YCDA 4HU9A 2PBJA 4KX4A 5J9BA 3IDVA 1GTIA 1Q4JA 1M2AA 2B1LA 5GAPD 3D5JA 2FNOA 2H1DA 4IJIA 1ERVA 4KDYA 2C0FA 5ENUA 1OVNA 3ZL5A 5ECQB 5DCGA 1QMVA 5EL8A 5DDLA 5ID2A 4IJ3A 2VCVA 2H66A 5ECOB 4LMVA 3RHCA 2A2RA 1O6JA 2RM6A 4YAVA 3TB2A 5KN0A 1X9SB 5JWQB 1AQXA 5ELAA 3D22A 3US3A 3J7Yb 4MZWA 3D4TA 14GSA 5DQYA 3IK9A 4NMUA 1J08A 1TDIA 1BX9A 4ID0A 2DJ3A 3HD5A 3GNJA 4TXVA 1MD3A 3C7MA 5HR2A 1WE0A 3EMXA 1ZOFA 3N5OA 5IOXA 1TRWA 2KUCA 6GSTA 19GSA 1K3OA 3TUEA 3H4KA 1M0UA 4FYBA 4WF5A 4ZILA 2QSIA 2NVLA 4PUAA 4YQVA 1J0FA 3FZAA 4ECBA 1B8XA 4KUNA 5CRDA 4MJEA 3P2AA 2CZ2A 2H6YA 1MDKA 5FWGA 3A3TA 4PGTA 2FWGA 1TK8B 4MF5A 2DJKA 5IO2A 4XRAA 1QXHA 3W6GA 3WYWA 5CREA 2C3NA 3FEUA 4ECJA 2R37A 1EP8A 2J23A 2B3SA 4RQRA 2AYTA 2WB9A 3A2WA 2B6MA 5KN1A 1O7UA 3LXTA 1FB0A 1JHBA 4LA1A 4NWYA 3IA1A 1ERWA 4WF4A 2KP1A 2GDRA 3GIXA 3TJFA 1X5DA 1ZZYA 1K0NA 2D2ZA 1SJZA 2IFQA 3I43A 3AY8A 3UOMA 4JU5A 2MMNA 2CT6A 10GSA 1V2AA 2H1GA 2CVDA 3HYPA 1X5CA 2PPTA 2OE0A 4WR5A 2OBIA 1BG5A 1ABAA 3GKKA 2O89A 1A0FA 2L6CA 3IRAA 1SL2B 4WKWA 3FKFA 2IMDA 3BCKA 3BOAA 4PQ1A 3ZTLA 1K3YA 2KOKA 4FYUA 1NM3A 4Q5NA 1ZCPA 3TJJA 2HLSA 3HVSA 2V1MA 2V6KA 2KP2A 4JBBA 1PX6A 4MH3A 2DIZA 1MDIA 2J9HA 1M9BA 3ME8A 3MSZA 5IPHA 2GSSA 3GL5A 1URMA 3F4SA 5DVBA 3QDNA 1S3AA 1PMTA 3MDKA 3PR8A 4IQAA 4HEA2 2C0GA 5COHA 1UC7A 3QPMA 1UVZA 4MCUA 1SJIA 4ZB6A 2DIYA 1SKSB 4MDCA 3KP9A 4GQFA 4CHSA 4IVFA 5KEJA 4AJ6A 2HZEA 1KEBA 3QMXA 1DBYA 2C0EA 2A2SA 2GSQA 3M9JA 1AQWA 1AXDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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