3IXRA

Crystal structure of xylella fastidiosa prxq c47s mutant
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
161
structure length
159
Chain Sequence
GSHMNIGDTLNHSLLNHPLMLSGSTCKTLSDYTNQWLVLYFYPKDNTPGSSTEGLEFNLLLPQFEQINATVLGVSRDSVKSHDSFCAKQGFTFPLVSDSDAILCKAFDVIKEKTMYQVIGIERSTFLIGPTHRIVEAWRQVKVPGHAEEVLNKLKAHAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical and Structural Analysis Indicates that PrxQ, a Cys Based Peroxidase from Xylella fastidiosa, possesses high reactivity towards hydroperoxides
rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xylella fastidiosa
total genus 55
structure length 159
sequence length 161
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ixrA00
2K8VA 3F3RA 4MH3A 4IP6A 3QFBC 5CP1A 4N30A 4BVYA 3HY2A 2GSRA 3Q74A 1K0CA 2C8UA 4BWQA 2IJYA 2P5QA 5G30A 3M9KA 1YQ1A 1TK0B 2H73A 2B7KA 2ES7A 2FA8A 2JZTA 5CRGA 3F4SA 3D6IA 2HSYA 3K8NA 3VWUA 3ZVJA 2YCDA 5J3RA 1Q4JA 1K0AA 4Q5RA 5JWQB 4HS1A 2VL2A 2R37A 1BG5A 3I9V2 5DALA 2LNTA 3GH6A 4KX4A 2GDRA 1TU7A 4GQFA 5D9TA 4N0ZA 3HZ4A 1XXUA 1VRSD 2H0HA 3GV1A 1SJ6A 2GSTA 2V41A 1GSFA 2YJ7A 1GLPA 3KP9A 1M99A 5FWGA 4JZQA 2H74A 2OE3A 1XCCA 1FAAA 4LA1A 3DEXA 5H5QA 4D73A 4MZWA 4EUYA 3HCZA 5ECRB 3WYWA 2C0FA 4O32A 4DEJA 2L5OA 3PINA 2HYXA 2H1BA 2YWMA 4XTSA 5D9WA 4DSSB 1EWXA 1Z3EA 3LJRA 1GULA 1SD9A 5JCGA 2QSIA 2VLUA 3KH9A 1SJIA 1AQWA 4DSRA 2FUG2 3GX0A 3GKXA 1XVQA 4CHSA 2E0QA 3G7YA 4IJIA 4HOJA 2REMA 2YANA 1O8WA 1T4ZA 3LXZA 2E2MA 3TJBA 3EMXA 4XS4A 4AJ6A 4NV5A 5J9BA 4N0VA 5D9XA 2LTKA 3EC3A 2IWTA 3R2QA 2JADA 2HE3A 1GNWA 2YV7A 4NMUA 1JHBA 3IA1A 4TR1A 1OC8A 1X9SB 2FNOA 2CAIA 3VK9A 4POKA 2XBQA 2FWGA 5INYA 2R3XA 3E9JB 4MJEA 3ZIVA 1XFLA 1AQXA 5H5RA 4GCIA 1V9WA 5F07A 2D2ZA 1OC9B 2CT6A 2IN3A 3A2WA 3QDNA 1Z6NA 2DJJA 1F2EA 3QPMA 2V1MA 1A8LA 4MPFA 1MDIA 4PQ1A 3IHQA 2MMAA 1KTEA 3IAS2 3FZ5A 3KIJA 1EP7A 1QXHA 3C71A 1B4QA 1Z7RA 2ALBA 3C1RA 5G1KA 1U6TA 3GRXA 2ZNMA 4V2MA 3E0UA 3O3TA 3MAKA 5ECLB 2GGTA 2VCXA 1SU9A 4WF5A 1I9DA 1GSYA 3WT2A 1F3AA 2G2QA 5AIXA 4ZB6A 3BOAA 2HI7A 2HLSA 2G0FA 3GL5A 4KNDA 1J9BA 1U3IA 5E4WA 1GTUA 1XWAA 4G10A 1O81A 3WGXA 4CDOA 5KEJA 1V2AA 1XBSA 3H8QA 2FHEA 1OVNA 2YZUA 4WR5A 1PMTA 4KAEA 4OCFA 3EE2A 1FHEA 2LNSA 1O7UA 2CX3A 3GKKA 4WXTA 1XOBA 3IE3A 11GSA 3DMLA 2FLSA 1WPIA 1VF1A 2RUFA 6GSUA 5HQPA 2YN1A 2H1GA 4F0BA 2M80A 3L0HA 3Q19A 3ZTLA 1K0MA 4KW6A 4OFMA 5IMZA 3WGEA 5LNKe 2CAQA 2KP2A 3D0ZA 3GNJA 1PX6A 1FOVA 2QKEA 1B8XA 3LORA 5ECMB 4WR4A 1C72A 3IRAA 3KTLA 2ZUPA 4BPYA 4K0NA 3SWLA 4I2UA 2C0DA 1S3DA 4TR4A 3ZLPA 4PGTA 2O85A 4IJ3A 4OD7A 3GL3A 1K3LA 2VIMA 3RDWA 4G2EA 1M2BA 1GNEA 5B6NA 3EINA 1H4OA 19GSA 2CVKA 4TXOA 3SBCA 1XWCA 4NHWA 1A0RP 1AC1A 2AB6A 2LQOA 5C04A 5GZZB 3CRUA 3UEMA 3F6DA 2PU9C 3FZ9A 3I43A 1WIKA 3VLNA 2VL2C 2V6KA 2YWNA 1MD4A 3HVVA 3ZL5A 4IKHA 3NOFA 4ID0A 2DIZA 1WMJA 4K2DA 5DALB 4O7HA 2WCIA 5IMCA 4POBA 2B6MA 4XS1A 2LKUA 1EZKA 5DAKA 2N5AA 3HJOA 5HFIA 4ZL8A 1XW9A 3IK7A 1YJ6A 5KN2A 5G5EA 2R5GA 3ZIJA 1T3BA 4TKYA 1JZOA 1T4YA 1EEMA 4D73B 4MH2A 3M0FA 3DIEA 4JU5A 3U5RE 4O92A 3RHBA 3TJKA 3VI5A 2HZEA 5IM9A 5IO2A 3EMPA 3C7MA 5F0GA 4XRDA 1ERVA 1AIUA 3DRNA 3IK9A 4GRFA 4KDUA 5CO3A 3APOA 4F9ZA 5LCZA 1QK8A 5FT3A 3KM6A 1J0FA 1BX9A 4MK3A 1OYJA 4MZCA 7GSSA 4KB3A 2TIRA 3HD5A 2AUVA 3A5WA 3KH7A 3HA9A 3ERGA 3IPZA 4GF0A 3TDGA 3O76A 4EO3A 2X8GA 4TW5A 4FYCA 4TR1B 5IMFA 4V2NA 5ENUA 4JR4A 4X1UA 4F2IA 1PRXA 1AXDA 1K3YA 2GT6A 1LBKA 1M9AA 1K3OA 1B9YC 3QAWA 3PGTA 1TRWA 1GTIA 4K1FA 1TRUA 1N8JA 1X5CA 2H71A 2GVPA 3DXBA 9GSSA 1LU4A 3ZITA 2C3NA 1U87A 2C4JA 1F6MC 1GTAA 2F51A 1TI1A 4MF7A 3E3EA 4WF4A 4ILFA 1TOFA 5ECIB 5ECOB 5DCHA 4HQSA 3HXSA 2LJRA 3F3QA 10GSA 1VGLA 3L78A 3LXTA 1ZCPA 4Q5NA 1EGOA 4KSMA 1BJXA 2PGTA 5ELGA 3P90A 3HVXA 3KD0A 1EOGA 5J41A 4JRRA 2R2JA 2OADA 1PKWA 2XC2A 4I2TA 2J9HA 2L5LA 5DCGA 4YQMA 2K18A 1U88A 3QAGA 1A2MA 1FB6A 4LMWA 2RM6A 1OKDA 5JCWA 5J9CA 2H0IA 1Z9HA 4L8EA 1XVWA 4K9ZA 1V58A 2Z9SA 3IXRA 2WRTA 2MMZA 1T1VA 4AJ8A 4KUNA 1NHYA 3GX8A 4LL1B 3HZ8A 3QCPA 1CQGA 5B6MA 1M2DA 2CVDA 4E8EA 1UA5A 2VO4A 4ECBA 4WBJA 3UBLA 4Q5QA 4CW9A 2DMMA 3CSIA 2ON5A 2KUCA 2HRFA 1HYUA 5F05A 1FB0A 4YQVA 2OACA 1HNCA 3KCMA 2C80A 1ERWA 4YAPA 1K0NA 2LJKA 2A2SA 3VWWA 4EXJA 2H6ZA 2TRCP 3DVWA 2EIQA 1K0OA 2H1AA 4IQAA 2LJAA 1ST9A 1BQ7A 3EVIA 1WWJA 3QD9A 3EU3A 3UIWA 5J4UA 3RPNA 3FR3A 2NBSA 3DGQA 4IVFA 3LGCA 4GLTA 1OC3A 1F9MA 4GSTA 4L0UA 1TXXA 3MDKA 2LQQA 3EU4A 1EV9A 5EY6A 1QMVA 3KGKA 1I5GA 1Z7PA 3H1NA 4PX1A 4MJAA 3BCKA 4ULXA 1A0FA 1R26A 3G9BA 4XHMA 2GS3A 4OWYA 1WE0A 4H86A 2LEGA 3CMIA 3CRTA 1ZMAA 1DE1A 2K6VA 1CQHA 1ABAA 2HFDA 4PUFC 3TKPA 2VAFA 5DAKB 3UARA 1TKDB 1SD8A 2X8HA 4JEDA 2L59A 5CNWA 1MDKA 4WEYA 1PN9A 2R6KA 2F3MA 4NPBA 1GP1A 1ZYQB 2B5EA 4MCUA 2VD0A 2C0EA 3A2XA 12GSA 4IW9A 3LSZA 2VLVA 1V40A 2LUSA 6GSXA 1TRVA 2DLXA 4MP4A 5HR1A 2IMKA 4HI7A 1A23A 2HZEB 4IN0A 5EPFA 4I5QA 1TW9A 3ZVJD 1EOHA 4KSOA 1ZL9A 20GSA 4PUAA 1YDKA 1TJDA 5A4WA 1M7TA 3W8JA 3KP8A 3M3MA 3H79A 2VCQA 2IMIA 3VPTA 2H01A 5DVBA 1T00A 1ZYEA 3G7IA 1VF2A 4XIHA 1VF4A 4HZ2A 4JBBA 1TDIA 5HR3A 3JCML 1M9BA 5ID2A 3QOUA 4HQZA 2NPBA 2O8VB 4MABA 2R4VA 3TRPA 4KGIA 4F82A 3NIVA 2FD3A 2GZZA 2HSHA 1UN2A 2C3TA 5D73A 2B1LA 1NW2A 1WRYA 1SYRA 1TRSA 4LMVA 5B8AA 1KEBA 2I9HA 4OFTA 4KDXA 1OE8A 5GSTA 4RQRA 5COHA 2YPMA 3QMXA 2WJUA 4Z7XA 1K0DA 2H6XA 2FA4A 5IOXA 1A2JA 4RI7A 2VM1A 4AJ7A 5DJLA 1YZXA 3IAM2 4OCEA 1A8YA 1ML6A 4NWYA 2VD1A 4FIWA 4OMVA 3KTBA 2XPEA 4I97A 4KA0A 3IC4A 4J2FA 5EVOA 2IIYA 4G19A 2A2RA 4FO5A 1XWGA 3FK8A 2KLXA 3EURA 5AIVA 1E2YA 4ZL7A 1M0UA 3ZFLA 3PH9A 4EE0A 2JL4A 3IOSA 4WETA 4O5RA 4OFNA 1PD21 3C1SA 1QGVA 4EF0A 4K7NA 3LWAA 3L9SA 4YH2A 2OE0A 4QL9A 3UBKA 5ECSA 1OE7A 4IBPA 2J23A 3ZMLA 4X43A 4FH8A 3GMFA 2B5YA 1X5DA 2YZHA 2YOIA 2LSTA 3IR4A 4EDZA 17GSA 2M72A 3HKRA 2LS5A 1AUCA 3ED3A 2IL3A 4GTUA 1N2AA 4XCSA 2GLRA 2PERA 1ERUA 2B5XA 1NM3A 3GKNA 3F0IA 3ZREA 2ON7A 2KHPA 2CZ2A 1IYHA 2FWEA 2P0GA 1MTCA 1XWKA 1EV4A 3GTUA 5IPHA 2E7PA 3WD6A 1R5AA 5D9VA 2LRCA 1FG4A 2VLTA 1PX7A 2L57A 4JE1A 4IQ1A 3F4RA 3RBTA 1BYEA 1KBNA 1EEJA 8GSSA 2H8LA 5HR2A 18GSA 3TKSE 2HZFA 2FWHA 3GURA 3GHAA 5IO0A 3GN3A 2MZCA 4N11A 1MEKA 1AQVA 3N5OA 2DMLA 3F6FA 3GA4A 4NXIA 4MA9A 5ECNB 1FVKA 3CXGA 1XW5A 6GSYA 3MWHA 3LEFA 2IMEA 3BBYA 1GSSA 2YJHA 3C8EA 2CVBA 2KP1A 1BAYA 3EWLA 3TKRA 3TJJA 1PKZA 4GQCA 1O85A 1YEXA 3TRXA 3FR9A 2MMNA 1JFUA 3TB2A 4ML1A 2I1UA 2EIOA 2WGRA 1G6WA 2WFCA 2C3QA 3CYNA 2WULA 4XS4B 3TJGA 3H4KA 4K0GA 4TN8A 3DVXA 1V57A 1J08A 2K8SA 4K7IA 2DJ2A 4E8HA 5G5FA 2OJLA 2PPTA 3F9UA 2DC5A 2QC7A 4BA7A 3TUEA 4NHZA 1JZDA 3S9FA 5IOWA 4IP1A 4BVXA 1ACVA 3W6GA 4WKWA 1XPVA 5AN1A 2PMTA 1NSWA 4TRXA 5F8BA 2WDUA 1OKTA 3CTFA 4KE3A 1YF1A 1OAZA 3FEUA 2B1KA 4TVEA 2YWOA 5B7CA 2VM2A 1JLVA 3WGDA 1ERTA 1ZOFA 4KDYA 1A2LA 3DWVA 2GQMA 4GWRA 4BWSA 1G7EA 3VPQA 4V2LA 3W8SA 3ZFBA 3ZMKA 4NAXA 3LYPA 3HYPA 3A3TA 3BD2A 3V1WA 2GT5A 3LG6A 1RK4A 2JSZA 5CRHA 3P8WA 5HFGA 3BJ5A 1PSQA 5DQSA 2XBIA 5JWRB 2L6CA 4ECJA 5CREA 2DJ0A 2VL9A 3IBHA 5ID2B 2C1YA 1SENA 2I3YA 3FKFA 3HJMA 4EDYA 2VCTA 2AHEA 1HNAA 3AY8A 3UVTA 2VOCA 4AF2A 2O89A 1JZWA 4QL7A 5CRWA 2RLIA 1W4VA 1PL1A 3LYKA 2CX4A 2JZRA 1WOUA 2I4AA 2PBJA 3ZRDA 6GSWA 1E6BA 4I6XA 1H75A 4FYUA 3D22A 3D5JA 2OKAA 3HVSA 1THXA 1DBYA 4J57E 1O6JA 1THOA 4MPGA 2AYTA 2AJQB 3L9UA 1TK8B 3RPPA 2L4CA 4RI6A 2VCVA 1XIYA 2AV4A 3FZ4A 5D93A 1T8EB 5CRDA 4HU7A 2DJ1A 2IFQA 3DYRA 5HFKA 5ABRA 4YQUA 2FY6A 1SKRB 5IMDA 5L71A 3PR8A 3F8UA 1HQOA 2VCZA 2H70A 1KNGA 3UOMA 1ZZYA 1FW1A 4OO4A 4GXZA 5G1LA 4HU9A 5J5NA 3FR6A 4JR6A 4NV2A 4MDCA 4XRAA 1ZGNA 4DSQA 1YY7A 2X64A 2MYGA 1S3CA 4L5LA 2DBCA 2A4VA 1X5EA 2B3SA 4EKZA 1PL2A 5G2ZA 2HT9A 4TR3A 3I6AA 3KEBA 3Q6OA 3TOTA 2XHFA 1G0TA 2P31A 3GUSA 2HNLA 4ZBAA 1PA3A 1SL1B 3LFLA 1G6YA 2VCWA 1SYXA 2RM5A 3KMOA 5H5SA 4TXOB 6GSTA 4GSSA 2YP6A 3GTUB 2DIYA 5G31A 2C0GA 3L9VA 3F63A 2OBIA 2BTOT 2NVLA 4ECIA 3U6VA 4HJ2A 1IYIA 1SK0A 2H75A 3J7Yb 3EYTA 2GZPA 5CYYA 4PQHA 1SKWB 3GYKA 1QUWA 1MD3A 1X9MB 4XS6A 2WB9A 1YEPA 2V6OA 5A5KA 2YV9A 2H76A 5KN3A 4KCEA 2RUEA 3I69A 4MF5A 1USBA 2QGVA 1Q98A 1F3BA 2GTUA 3TRQA 4QQ7A 2H0GA 3MSZA 3VFIA 4ACSA 2PVQA 3GKMA 5EL8A 3D4TA 5HR0A 4ZBDA 4MF6A 1YKAA 1XW6A 5C00A 1VF3A 3VWVA 2IMDA 4EVMA 5AISA 2H66A 3HJPA 2GZYA 2WS2A 5GSSA 13GSA 2AAWA 4N10A 2CV4A 2VUPA 4PXOA 3KXOA 2XPDA 3GH9A 4PQIA 4ZBBA 3UVHA 1GSQA 2KOKA 2OBKA 1B4PA 4POLA 2JU5A 1DUGA 1RW1A 22GSA 1TU8A 3GSSA 1Y25A 4ISDA 3APSA 3M1GA 4Q5FA 4HEA2 3CBUA 3A2VA 3GFKA 1V98A 2F9SA 5DQYA 1ON4A 1TI3A 2NDOA 4MJCA 3BCIA 4IELA 2L4QA 4POMA 1JZRA 1DE2A 3FHKA 3KMNA 1JLWA 1X0RA 2MMOA 4ZB9A 4K6XA 5IIZA 3OR5A 4J56E 1Z5YE 3UL3A 1M2AA 4RQXA 1SK1A 1FO5A 4EC0A 1GLQA 2VL3A 1XOAA 1GSUA 1O73A 3UJ1A 5CAXA 1GH2A 1RQMA 5GAPD 1TTZA 4ML6A 14GSA 3O6TA 4F03A 1Z6MA 1TK5B 1U3AA 2PWJA 2NTOA 1W89A 1UC7A 2OE1A 2LV3A 4DVCA 2DJKA 3ERWA 4OO5A 2PVOC 1PQNA 3ISOA 4K7OA 3RHCA 4L5OA 2GSSA 3UAPA 5B8BA 5KN1A 1SK2A 4HUAA 3ZZXA 3GIXA 2YWIA 3CSHA 5ELAA 2LRNA 1MDJA 2M46A 3N9JA 4IGJA 3P2AA 3TKSC 4G9HA 2FWFA 5LD0A 3CSJA 4YAVA 5E59A 3VURA 5IMAA 1T7PB 4ZL9A 2O87A 3IV4A 3TKQA 4LLRA 4I8BA 4ZIJA 2P5RA 5JWOB 5JCUA 4DSSA 6GSVA 2H6YA 4KH7A 3WT1A 5DBQA 4ECCA 2H30A 2GSQA 2F8AA 5IQYA 4F0CA 1BEDA 1O8XA 5A4UA 1EP8A 4TR0A 3TJFA 4V1Ag 5A4VA 1B9XC 3DKSA 1PGTA 3US3A 1F37A 5D96A 3KJYA 3G7JA 2HRNA 2IFQB 2V32A 2CZ3A 3FY7A 4P3YB 1B48A 2O7KA 3QFAC 4ZILA 1GUMA 2JACA 5F06A 3TGZA 2PUKC 2K9FA 3DD3A 2H1DA 2E2GA 3CTGA 2RIIA 5DJMA 1SL2B 2MBSA 3ME8A 1GSEA 5D8IA 1HNBA 1GL8A 3D21A 3H93A 3QAVA 3ZYWA 1X9WB 1FVJA 2V2GA 2N5BA 5GAND 4PNFA 5DDLA 1GUKA 1OC9A 4ZXGA 4BL7A 5ECPB 2H72A 2TRXA 2DSAA 5IPGA 1QFNA 2FCHA 1NHOA 3P7XA 2X8CA 2CA8A 1YKCA 3FW2A 1K0BA 1SL0B 3ME7A 4X0XA 1YF0A 2CQ9A 1WJKA 3HHVA 4RUVA 2L6DA 2IPAA 2BMXA 4MJBA 2HXKA 1SJZA 4MZBA 1UVZA 2EIRA 5IMVA 1GRXA 3RAZA 3D4MA 3Q18A 5ECHB 2F8FA 2WZ9A 3L4NA 3ERFA 2DJ3A 4KCAA 3TCOA 1TP9A 1GUHA 4HDEA 1GWCA 1HD2A 1R4WA 4HZ4A 4K8MA 4IHUA 4AGSA 4TXVA 1DSBA 4LL4B 4WBRD 2EC4A 16GSA 1URMA 2FGXA 5AGYA 4MMMA 4V1Ap 1GTBA 1AW9A 3M9JA 3FZAA 2YNXA 3TOUA 1G7OA 1QQ2A 1GSDA 1Y6EA 4TOPA 4HJMA 4GSNA 4FYBA 4PURA 5ECQB 3VI7A 2I81A 3VWXA 2X99A 3FRCA 3NZNA 3UMAA 3FYGA 3C73A 4IS0A 6GSSA 1WP0A 1LJRA 1SKSB 4EL1A 3J7Yk 3LQ7A 2JSYA 3GSTA 4PNGA 3MNGA 2JZSA 2B7JA 2ZCTA 2BJXA 2MBTA 3QR6A 1A24A 2N5FA 1XZOA 2GQKA 3IDVA 3KZQA 3M8NA 5ECKB 1S3AA 2GQLA 1ILOA 4L0WA 1AAZA 2H19A 2LRTA 4MLYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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