3MNGA

Wild type human prxv with dtt bound as a competitive inhibitor
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
APIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Evidence that Peroxiredoxin Catalytic Power Is Based on Transition-State Stabilization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Peroxiredoxin-5, mitochondrial
total genus 47
structure length 161
sequence length 161
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3mngA00
4TR0A 2I1UA 2TIRA 4XRAA 1ERWA 2MMAA 1WOUA 2OBIA 4BA7A 4IJIA 2C3QA 3CYNA 3LG6A 3TOTA 2HSHA 1ZCPA 1PQNA 1FAAA 3A2WA 2P31A 1K3OA 4HJMA 2BMXA 2GVPA 3M1GA 3PR8A 5HR0A 3J7Yb 3Q6OA 1A2MA 2H6XA 1XWGA 1OKTA 1SU9A 4V2MA 4MJBA 3G7IA 3H1NA 5IO0A 2YJ7A 1TI3A 3BCKA 5AIVA 1WRYA 2YANA 3GRXA 9GSSA 2IWTA 1M2AA 1NSWA 2DJJA 1AW9A 1KEBA 3LYKA 2JSYA 3GTUA 5JWRB 1X9SB 4FH8A 3LFLA 1VF4A 2JZSA 2FUG2 4KH7A 4PQ1A 4JEDA 1GTAA 2RM5A 2DJ1A 3C73A 3ZL5A 4K9ZA 1GSDA 2VL3A 4WF4A 1KTEA 5GAND 2H0IA 4MF6A 5D9VA 22GSA 4KSMA 4ZB6A 3NOFA 2HRFA 4BVYA 3ED3A 3GSSA 2VCWA 3QFAC 1IYHA 1B8XA 2B5YA 3HJPA 1PRXA 1MD3A 1JZWA 2CVDA 5JCUA 2AJQB 4PX1A 2KP2A 2AB6A 2FLSA 5IIZA 3IAS2 2WB9A 3ME7A 5FWGA 2PPTA 3C7MA 3W6GA 3TKRA 1E6BA 4JBBA 1HNCA 3A2XA 3HJOA 3D4MA 1MD4A 3HXSA 1B4PA 1X0RA 3E0UA 4WBJA 1URMA 1OC9B 2IMKA 1PKZA 1X5CA 1JLWA 5HQPA 3D0ZA 2RLIA 3O6TA 3LORA 3KMNA 4ID0A 4F82A 4GRFA 4WETA 3A3TA 1GWCA 3GMFA 1XW6A 4PURA 4EC0A 2IMIA 1A24A 4EKZA 4JRRA 2B5EA 4HJ2A 3US3A 5IMFA 6GSSA 5J41A 1G7EA 3D4TA 2BTOT 3GURA 5E59A 4F0CA 4TR1A 1RW1A 2CT6A 1CQHA 4ILFA 2NPBA 3QAWA 4MA9A 2PBJA 2H19A 1FOVA 1FB0A 4N11A 4KDUA 1RK4A 5F0GA 1Z9HA 1F9MA 2XC2A 1B9XC 2CV4A 1VF2A 4XTSA 5CAXA 3TUEA 1WJKA 8GSSA 2H66A 4XHMA 5CRGA 3M8NA 4F0BA 2L6DA 1XWKA 3HDCA 4MCUA 1XWCA 2VL9A 1EV9A 4RQRA 6GSTA 4V2NA 4ACSA 4DVCA 1C72A 3KH7A 3TJKA 1XFLA 2B5XA 3IV4A 5DCHA 1M99A 5F8BA 2FA8A 2JADA 5EPFA 1O8XA 4WXTA 1SL1B 5DJLA 4PNFA 2NTOA 1J0FA 3WT1A 4JR6A 4PGTA 5A5KA 1DBYA 3QPMA 5LNKe 2ON7A 2CX3A 6GSUA 4OFMA 2PWJA 1ST9A 4L8EA 2PVQA 2JU5A 2OA7A 2ON5A 3C8EA 1K0NA 2QGVA 4BWQA 4AJ8A 2G2QA 4F2IA 2GZZA 3H8QA 3IOSA 4TXVA 3LEFA 3P8WA 4NHWA 2X8GA 2A2SA 5C00A 3TJJA 3EINA 1M0UA 1R26A 1OC3A 1EP8A 4L0UA 1GLPA 1EWXA 4GLTA 4EUYA 1K0OA 3TB2A 3LJRA 2QKEA 3CSHA 4IKHA 1W89A 2MYGA 5KN1A 2GSRA 3GKNA 3GYKA 2WRTA 2VCVA 2H75A 2EIOA 2H70A 1F37A 2H6ZA 4YAVA 3ZTLA 2MBTA 1AC1A 2G0FA 3ERWA 1A0FA 4D73A 2WDUA 2R2JA 4NAXA 2REMA 3VLNA 20GSA 3APOA 1XVWA 3M9KA 4KB3A 5IOXA 3GH6A 1JFUA 2P5RA 1TRSA 1B48A 2V6KA 2MZCA 3UBLA 1X5DA 4TRXA 1F3AA 1OVNA 2OACA 4ECIA 2X64A 4I5QA 1FHEA 3FRCA 2C3TA 4MZCA 1UC7A 3RPNA 1H4OA 3SBCA 4O92A 2WZ9A 3GTUB 1HQOA 2L5OA 1ZOFA 3DMLA 1NM3A 5J5NA 3IA1A 1FVJA 3ZZXA 3KH9A 5AGYA 2K18A 1J08A 3TRXA 4IHUA 1GSQA 3TJFA 2WULA 1QFNA 5ECKB 2N5AA 1OC8A 2FD3A 1OC9A 3ISOA 1SK1A 4ZL9A 3HD5A 5G1LA 1GL8A 3F63A 2DJ2A 3HCZA 4GWRA 3P90A 5DQYA 5GZZB 2HZEA 1SKSB 2WFCA 1Z3EA 2VAFA 3KGKA 2HLSA 3PINA 5D73A 2V1MA 4AJ6A 2GS3A 2QSIA 1ON4A 5HR2A 2L59A 4NV5A 4GCIA 4MMMA 3PH9A 3KMOA 3M3MA 3GUSA 4ULXA 4YQUA 2E2MA 3D21A 2DIYA 2HFDA 3KD0A 5KEJA 1ERTA 4HU9A 5DBQA 1Z7PA 5DVBA 2I81A 1MDIA 5IQYA 1EP7A 2GGTA 4XS6A 2YV7A 4XRDA 2KOKA 5LCZA 3D5JA 1F3BA 4HOJA 2B6MA 2CVKA 1W4VA 3G9BA 14GSA 1QXHA 2YZHA 3DWVA 5J9CA 3ZREA 4KA0A 2JACA 5G1KA 2XPDA 4OD7A 2K9FA 3ZVJA 3UL3A 3DXBA 3KTBA 1YQ1A 3TOUA 3DYRA 2F8FA 4V1Ag 3P7XA 2YJHA 3MNGA 5B8AA 3UVTA 1SL2B 4K8MA 1XOAA 2LQOA 4X0XA 3TRQA 4YQMA 4XIHA 3HVXA 2KP1A 2MMNA 2GQKA 4E8EA 3G7YA 4GF0A 3SWLA 4N10A 4FIWA 1SL0B 1FB6A 2IIYA 2LS5A 4OO5A 1MDKA 4O7HA 2FWHA 4ECJA 2PVOC 4KE3A 4MP4A 5DAKA 1VRSD 1G0TA 1ACVA 4ECBA 3K8NA 1GUHA 5J3RA 5D93A 3UBKA 5G2ZA 1R4WA 2PUKC 3RBTA 3V1WA 2ALBA 4KSOA 2LJAA 4KW6A 5JCWA 3IK9A 4TXOB 1X5EA 1XPVA 2M72A 1Z5YE 2H30A 2DJKA 1PL1A 1TW9A 3QMXA 4EVMA 2YV9A 1SYXA 2O89A 3HZ4A 1SJ6A 5CYYA 5IPGA 2K6VA 2LKUA 1XWAA 5D9TA 3WGDA 4ECCA 1VF1A 1ERVA 3JCML 2JL4A 4OCEA 3EC3A 4LL4B 1N2AA 5HFIA 1GNWA 4K6XA 2H1DA 2J23A 5ENUA 4EDYA 2AV4A 5COHA 4V2LA 2R6KA 1V98A 4O5RA 1AQXA 2I3YA 1LBKA 1TJDA 2HSYA 1T4YA 4I97A 3QAVA 4WEYA 2VCZA 4D73B 2B7JA 1XWBA 5ECHB 3EU4A 3U5RE 2XHFA 4ZBAA 1Q98A 4WF5A 2YPMA 4Q5NA 5A4UA 1FO5A 4AGSA 4I6XA 4K0GA 1LU4A 1G7OA 1JZDA 3IBHA 1TXXA 2H1AA 3F3RA 5DQSA 1I5GA 2GSSA 1YEXA 3ME8A 3WGEA 2VIMA 2LRCA 4I8BA 3VPQA 2VM1A 2DLXA 1WPIA 4Z7XA 5HR1A 4IGJA 3TKPA 4NXIA 3VWUA 1GNEA 5IMAA 2C0DA 10GSA 1BJXA 2FHEA 3UIWA 2LRNA 1K0AA 4KUNA 1HNAA 4MJCA 2HZFA 5ECOB 2B7KA 2C0EA 3A2VA 3W8JA 2YZUA 4KDXA 2HZEB 2V6OA 4HEA2 3ZLPA 1F2EA 1A2LA 5G31A 3IC4A 4J56E 1GH2A 1X9WB 3ERGA 3TJGA 3ZMKA 2MMOA 2J9HA 3D6IA 3ZITA 2EIQA 3QD9A 2P0GA 1VF3A 2VCTA 5ECRB 1JHBA 12GSA 4GTUA 4LA1A 18GSA 2IJYA 2KHPA 3IPZA 3DEXA 5A4WA 3FR3A 3F9UA 3O76A 1OE8A 1RQMA 1MEKA 1TK0B 4CHSA 3FKFA 3WT2A 4GSTA 4PUFC 2YWOA 3FZ5A 4GXZA 4HZ2A 2GT6A 1TI1A 3ZRDA 4L5OA 3FR9A 4NMUA 2O8VB 1KNGA 1BX9A 1QGVA 2M46A 1PX6A 3F4SA 2RUEA 4KCAA 5EL8A 1QK8A 4EF0A 3M9JA 1Y25A 3MAKA 5C04A 1OKDA 1V57A 3LWAA 3IE3A 5J4UA 2VOCA 3RPPA 2H0HA 3GIXA 1TDIA 3PGTA 5JWQB 2V32A 1YZXA 2H76A 5GAPD 2JZTA 3GV1A 1PD21 1DUGA 4GQCA 4HQSA 3VURA 2LNSA 5IOWA 3KXOA 2E7PA 4EL1A 2GT5A 4LMVA 1R7HA 1ZYQB 3FZ9A 4TVEA 3RHBA 1G6YA 1AUCA 4WR4A 4IQ1A 2IFQB 5A4VA 2IL3A 3IR4A 2D2ZA 3IDVA 2E2GA 4MZBA 2B1LA 2R3XA 5DAKB 4DSSB 1UA5A 1NHOA 4CDOA 4TXOA 3TDGA 5KN3A 3W8SA 3HKRA 3FHKA 4PQIA 2VM2A 4NHZA 2O87A 4L5LA 1M9AA 2X99A 1O73A 1WE0A 1XW9A 1S3AA 1NHYA 4XS1A 4RUVA 3TKSC 3ZYWA 1XBSA 2H72A 3GSTA 4HU7A 3CXGA 3FK8A 1YJ6A 2MMZA 2LUSA 1PN9A 6GSWA 3CRUA 1I9DA 1AQVA 5INYA 3EMPA 3G7JA 4MPFA 3ZIJA 2YWIA 1EEMA 1VGLA 5ECPB 4JE1A 1YF1A 1Z6MA 1THOA 2LSTA 2N5BA 2C1YA 3KZQA 1EEJA 2AHEA 5ID2A 2CA8A 3BJ5A 2IMEA 2MBSA 2C0FA 2CZ2A 2H74A 1U6TA 3BD2A 3EMXA 2HYXA 4BVXA 4DEJA 4IELA 1TTZA 4X43A 4IVFA 5F07A 4FYBA 4ZL7A 1XCCA 3IRAA 4O32A 4IP1A 2PMTA 4HUAA 3GX8A 4LMWA 1B9YC 4KNDA 5G5FA 1SD8A 2GSTA 1PGTA 3FEUA 2H1BA 3BOAA 4PXOA 6GSVA 3TKSA 1V2AA 2XBQA 2CZ3A 1GSSA 1IYIA 1JLVA 1TU8A 3QFBC 3C1SA 1K3LA 4PQHA 4G19A 2FGXA 1Z6NA 3Q74A 4IBPA 2XPEA 2GTUA 1Z7RA 4GSNA 5ABRA 3E9JB 11GSA 4AJ7A 2GQLA 2X8HA 3GKKA 5AISA 1AIUA 3UJ1A 2OE3A 2F51A 5ECIB 3LQ7A 5AN1A 1M9BA 5DALB 5GSSA 5H5QA 3UMAA 5FHIA 1B4QA 2GSQA 3DIEA 4MF7A 1K3YA 2P5QA 2RIIA 1GSYA 2B3SA 3HA9A 1ML6A 4Q5FA 2TRXA 1GTUA 2GZPA 4KGIA 1OAZA 1OE7A 3UARA 1FVKA 2OJLA 4OCFA 4IW9A 4IS0A 2H73A 2ZNMA 3KP9A 4NWYA 4TKYA 4HQZA 2A4VA 4NV2A 4XS4A 2FY6A 3UVHA 1K0CA 3KJYA 3LXTA 4FO5A 3Q19A 3HZ8A 2AYTA 1A8LA 1NW2A 3ZFBA 2LTKA 3HY2A 3L78A 2QC7A 2K8VA 5D9WA 1TK5B 3C71A 4F9ZA 17GSA 1M7TA 3LXZA 4MPGA 3C1RA 5FT3A 1TK8B 1F6MC 5GSTA 1ZMAA 2IFQA 2LEGA 1Y6EA 2LJRA 3VK9A 3KEBA 3I6AA 2WJUA 1ZZYA 2L4QA 4AF2A 1PSQA 3F3QA 4PUAA 3LGCA 4DSSA 4MDCA 3EWLA 4ZILA 2F9SA 4DSQA 2LNTA 3Q18A 3GHAA 2F8AA 1EOHA 4KAEA 1UVZA 2VD1A 1DE1A 3KIJA 3QOUA 3TJBA 2NBSA 3VWVA 2LRTA 3FYGA 4HDEA 1HNBA 5B6MA 3WGXA 3L9SA 1E2YA 4G2EA 5HFKA 5B8BA 3E3EA 3EURA 4ZBDA 2N5FA 1TU7A 3AY8A 3VFIA 2E0QA 2EIRA 1AXDA 3OR5A 3L9UA 1YKAA 2HI7A 1XIYA 2CAQA 1USBA 4N30A 4MH3A 2VLUA 2HRNA 3KTLA 4BWSA 3LYPA 5CNWA 3P2AA 2C3NA 4MZWA 1WIKA 2L57A 4J57E 4ZBBA 4G10A 5J9BA 1WWJA 1FG4A 3RDWA 4ZIJA 5B6NA 1SKRB 1O8WA 5F06A 2X8CA 4YAPA 5ID2B 2VUPA 1JZRA 3GKMA 3ZIVA 1GSFA 1GULA 4V1Ap 5G30A 5HFGA 3ZVJD 1AQWA 1R5PA 1KBNA 1BAYA 3LSZA 1GSEA 5DDLA 3GA4A 3NIVA 4N0ZA 1R5AA 1FW1A 5CRWA 3IAM2 4K2DA 4K1FA 1EGOA 2DSAA 2OKAA 3L0HA 3TKQA 4QL7A 1ZGNA 1T3BA 3CTGA 1ABAA 3DVXA 1U87A 2FCHA 2FWGA 4MLYA 1YY7A 5IM9A 3UOMA 1S3CA 2Z9SA 3I9V2 1G6WA 4BL7A 1GUMA 2HNLA 16GSA 3ERFA 5IMCA 1ERUA 2VLVA 5IO2A 5JWOB 1T8EB 1TP9A 5H5RA 5DALA 5D8IA 1TOFA 3L9VA 1A8YA 2L6CA 3DVWA 1GP1A 3MSZA 1T7PB 2PU9C 3IHQA 2IMDA 3HJMA 3GX0A 3F4TA 1SKWB 4KCEA 4Q5QA 5AIXA 1BQ7A 4EDZA 2ES7A 4YQVA 2K8SA 1DSBA 1XXUA 2WGRA 2ZCTA 3KCMA 5CREA 1ILOA 1O6JA 1WP0A 3F8UA 2NVLA 3DGQA 1M2DA 3CSJA 5ECLB 1A2JA 2GLRA 3CMIA 4RI7A 1YKCA 2HE3A 3KP8A 4POLA 2IPAA 4Q5RA 3RHCA 4DSRA 4WBRD 2YN1A 2H1GA 2CQ9A 2LV3A 2I9HA 1PMTA 3VI7A 3QAGA 1H75A 4P3YB 3UAPA 1EOGA 5ELGA 2RM6A 4K7NA 2DJ3A 2OE0A 2O85A 4EO3A 4JU5A 5ELAA 3WD6A 3VI5A 1TRWA 4MK3A 4XS4B 2AUVA 4POMA 3GKXA 2OADA 2B1KA 1SJIA 4MABA 2GZYA 4IQAA 4WKWA 4K7IA 4QQ7A 2BJXA 4GQFA 2PN8A 2VO4A 3CRTA 3CTFA 1QMVA 4ZB9A 2GQMA 4I2UA 3MWHA 4MH2A 3HYPA 4IP6A 2XBIA 4ISDA 3H93A 5CRHA 3MDKA 3VWXA 4YH2A 4TW5A 4OFNA 3H4KA 5EY6A 5JCGA 3UEMA 1WMJA 4POKA 3I43A 1EV4A 4I2TA 4HZ4A 1SYRA 2I4AA 2DC5A 1PL2A 4FYUA 2HT9A 2GDRA 3EU3A 5D9XA 4MJEA 5D96A 3HHVA 3N5OA 1TRUA 1K0DA 4H86A 4ZXGA 1V58A 2F3MA 5DCGA 2WS2A 2R4VA 3F0IA 2FWFA 5LD0A 3WYWA 3U6VA 1YF0A 2TRCP 4OO4A 4RQXA 4G9HA 1LJRA 7GSSA 3CSIA 2YOIA 4CW9A 1J9BA 2OBKA 3F4RA 3R2QA 3QCPA 3ZMLA 2L5LA 3DD3A 3TRPA 1EZKA 3FZ4A 1BEDA 2JZRA 2H71A 4MJAA 3N9JA 3DKSA 2KLXA 2KUCA 3GH9A 4GSSA 2WCIA 1O81A 2CVBA 4JZQA 3TCOA 6GSYA 5ECMB 1XOBA 3APQA 3EYTA 1OYJA 5CP1A 2CAIA 2ZUPA 4K0NA 3NZNA 5G5EA 1AAZA 2YCDA 2VL2C 2YWMA 4RI6A 3CBUA 2VCQA 3HVSA 4MF5A 2C0GA 4NPBA 5ECSA 1V40A 2H8LA 3F6FA 2DMLA 2FNOA 4POBA 1A23A 5B7CA 1JZOA 1SJZA 1GUKA 5DJMA 3D22A 3VWWA 2H6YA 1YDKA 1ZL9A 2VCXA 3M0FA 2CX4A 3QDNA 4KDYA 1QUWA 2V41A 3GL3A 5KN2A 1HD2A 4ZB8A 3FY7A 5IPHA 5E4WA 4TR4A 3TKSE 1YEPA 1GTIA 1S3DA 3S9FA 3J7Yk 1TRVA 3FR6A 3EVIA 1U3IA 2LQQA 2EC4A 3GNJA 1T4ZA 3L4NA 1EGRA 1XW5A 3KM6A 4OWYA 4WR5A 3TGZA 2IMFA 3GN3A 4OMVA 1DE2A 1U88A 2R37A 1T1VA 2M80A 2DJ0A 3QR6A 19GSA 2VL2A 2NDOA 3F6DA 4TOPA 2YWNA 4F03A 1BYEA 5EVOA 1M2BA 1K0BA 1A0RP 2A2RA 2PERA 4BPYA 1BG5A 3DRNA 1QQ2A 2FWEA 2C80A 4FYCA 1O85A 4PNGA 1UN2A 2RUFA 1THXA 4LL1B 1TKDB 4E8HA 3RAZA 1PKWA 2C8UA 2HXKA 2DBCA 3FZAA 3BCIA 2YNXA 3BBYA 4TR1B 4QL9A 1GSUA 2V2GA 1GTBA 2R5GA 2VD0A 4JR4A 4TN8A 4ZL8A 3GFKA 13GSA 1U3AA 4ML1A 5IMVA 4TR3A 1XZOA 2L4CA 1SK2A 2LJKA 4L0WA 2VLTA 2DMMA 2JSZA 3FW2A 4LLRA 1SD9A 3GL5A 4X1UA 2AAWA 4IJ3A 1SENA 3IK7A 4N0VA 4K7OA 1MDJA 1O7UA 3VPTA 2O7KA 4IN0A 5ECQB 5L71A 1PA3A 4ML6A 5IMDA 4HI7A 3IXRA 4EE0A 1N8JA 5CRDA 1X9MB 4OFTA 4XCSA 1HYUA 2C4JA 5KN0A 2H0GA 1K0MA 1V9WA 3H79A 3O3TA 1CQGA 1Q4JA 1SK0A 3EE2A 1MTCA 3HVVA 1GRXA 5IMZA 1T00A 2H01A 2OE1A 4EXJA 5CO3A 5HR3A 5H5SA 3A5WA 6GSXA 1ZYEA 2YP6A 2PGTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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