3MNGA

Wild type human prxv with dtt bound as a competitive inhibitor
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
APIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Evidence that Peroxiredoxin Catalytic Power Is Based on Transition-State Stabilization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-5, mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 161
sequence length 161
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3mngA00
4MZCA 2LRNA 4QL9A 2DC5A 2LJRA 4L5LA 3E3EA 3PGTA 1H75A 4GSNA 3L0HA 4WR5A 3LQ7A 2DJKA 3O76A 6GSTA 4L0WA 2QKEA 2GDRA 5IPHA 1AAZA 4MH2A 4EUYA 2CZ3A 2JU5A 3C1SA 5CYYA 5H5RA 1QK8A 1WJKA 4KSOA 5IO2A 3P2AA 1TRVA 3BJ5A 2QSIA 1EEMA 1Z9HA 2E2GA 2OE3A 3IV4A 1K3YA 4X0XA 5HQPA 1WP0A 3CXGA 3FHKA 3DVXA 2WCIA 2QC7A 1SKRB 1GLQA 2H74A 1M2DA 2I1UA 17GSA 4MZBA 1WPIA 3G7IA 4CW9A 4FYUA 2CX4A 3QAVA 4K6XA 3BCKA 3HHVA 1AQXA 3APSA 1GWCA 2V6OA 2X64A 3GIXA 4KUNA 2L57A 2GSTA 3IXRA 4G10A 2Z9SA 4EL1A 1X0RA 1R7HA 3CRTA 2H76A 2D2ZA 14GSA 2ZNMA 3O3TA 1N8JA 3FZ5A 4K2DA 3OR5A 4V1Ap 3F8UA 4F03A 1SL2B 4KE3A 4K1FA 1F9MA 1GP1A 2DBCA 1V40A 5DQSA 1DBYA 4KSMA 2YP6A 2LSTA 3IE3A 4OMVA 3WT2A 1R26A 4OO4A 1AQVA 2XBQA 5HR1A 1TW9A 3JCML 1ZGNA 3IDVA 3BCIA 3MAKA 12GSA 3ZVJA 2MBTA 2WULA 1K0MA 1NHYA 2L6DA 4HOJA 3TKPA 1FVJA 4IHUA 1DE1A 3ERWA 3IOSA 3M1GA 1O6JA 1Z3EA 3VWXA 3VFIA 2OKAA 2ON7A 3L9VA 1T1VA 1KEBA 3ZREA 4EO3A 4DSSB 4TN8A 1ABAA 1IYIA 4ZBDA 2NPBA 4ZXGA 3I43A 3ZZXA 3F4SA 1ZL9A 1THOA 2F51A 3TB2A 2ON5A 5ECQB 1A2MA 4G9HA 4POLA 3IAS2 2VL3A 1ILOA 1VF1A 2LTKA 1GLPA 4K0GA 2L59A 2I81A 2OA7A 5G1LA 3W8JA 4XRDA 2O7KA 19GSA 1ST9A 1RK4A 4FO5A 4YAVA 2PN8A 3KH7A 2H1BA 2FD3A 5ELAA 4Z7XA 1KBNA 1ZMAA 4K9ZA 4DSRA 4PUFC 2I9HA 3RAZA 2VL9A 5JWOB 3IAM2 1TI3A 5JCWA 5ID2B 4G19A 4GSSA 4HS1A 4LL4B 2H66A 8GSSA 3HJMA 4ECBA 3C7MA 2CZ2A 5D9TA 2EC4A 2H01A 3A2WA 2PWJA 4MJCA 4I5QA 3S9FA 3LYKA 4Q5FA 4ZIJA 1Q98A 4K7OA 2P5RA 3KXOA 2OE0A 1I5GA 3Q18A 5D9VA 5IMVA 2FGXA 1PRXA 5D96A 2FHEA 1HNCA 2GQKA 2ZCTA 3QFBC 1G6WA 2RM6A 3GKNA 3HXSA 4HZ4A 2JSYA 1U87A 5CO3A 2LV3A 3FEUA 3H93A 2KLXA 2WZ9A 4L5OA 2JACA 4NPBA 3Q6OA 2HZEA 3BBYA 4KA0A 5CAXA 3RPPA 1TRUA 4F0BA 4PX1A 2CVDA 1SL1B 3VI5A 2H8LA 1GTBA 3KJYA 4HQZA 3QAGA 3WD6A 1YY7A 18GSA 1Z5YE 2FWEA 1MD3A 3PINA 1M7TA 3TUEA 2J23A 4OWYA 3KTBA 1O8XA 1TJDA 3PH9A 2H71A 3GSTA 3TKSE 3KCMA 2PMTA 4D73A 3M0FA 2GSQA 4BA7A 1F3AA 3IPZA 2FY6A 1TOFA 2FWFA 1M9AA 2YPMA 3F0IA 20GSA 4XHMA 4WETA 3GSSA 5DAKA 1GRXA 1ERUA 3UMAA 5KN3A 1K3OA 3GURA 2LQOA 2H75A 3L78A 3WGDA 4WBRD 5F8BA 1FVKA 3Q19A 4NHZA 2TIRA 3IK7A 5D9XA 3TJFA 1XCCA 3VK9A 1CQGA 3VWUA 4XCSA 1YZXA 1OYJA 1ERWA 3L9UA 5J3RA 2A2SA 2IMEA 2B7JA 4IGJA 4QL7A 2VUPA 2B1LA 2KOKA 2GGTA 4OFTA 5HR0A 1SJIA 2HSHA 3TJBA 4GQFA 2R5GA 3ZFLA 2OBIA 1PSQA 2MMZA 2V41A 3F4RA 1JHBA 1FB0A 2DLXA 4MPFA 2H1GA 1A24A 2JZTA 3TJGA 1GSQA 5JWQB 3D4MA 1VGLA 2GSSA 4GF0A 4ZBAA 3US3A 4ID0A 2AV4A 4ZL9A 1HNAA 4K0NA 4RQXA 4MJBA 6GSSA 2C0DA 6GSXA 3C73A 3EMXA 4F9ZA 3UAPA 1YDKA 3NOFA 5HFKA 5C04A 4KAEA 2DIYA 1K0OA 1GTAA 3A5WA 4JU5A 4HJ2A 1A8LA 2IMFA 16GSA 3F4TA 2L4QA 5G1KA 1K3LA 2V2GA 3KP9A 4Q5QA 1TDIA 5DQYA 2JZRA 1K0DA 1KTEA 2H70A 2MBSA 3DD3A 4YQMA 3ZTLA 4KDXA 1HYUA 4TVEA 2NTOA 5ENUA 5DDLA 1TI1A 5ECPB 2GT6A 3HCZA 1M2BA 4TW5A 4DEJA 4O32A 9GSSA 2VM2A 3D4TA 2F9SA 2WRTA 3NIVA 5INYA 2HRFA 1U3AA 1BX9A 5A5KA 1T4YA 5ECHB 4TXOB 2H1AA 1B4PA 1YF1A 4ECJA 3M8NA 1JZOA 5KEJA 4K7IA 2XC2A 3APOA 1GUKA 4AGSA 4WKWA 5LD0A 2HFDA 1ACVA 3CBUA 1GSDA 3UBLA 1T3BA 3VWWA 3V1WA 3VWVA 4WBJA 1QMVA 3A2VA 1TU7A 4RI6A 1PL1A 2XPEA 4L8EA 3QFAC 1XZOA 1JZRA 5GAND 1K0AA 1VF2A 1SJ6A 3G7JA 1UN2A 2OE1A 3QMXA 3TJJA 4TR4A 2C3QA 2H19A 4MJEA 5LCZA 3CSIA 1EGOA 5D8IA 3DYRA 4LL1B 2AJQB 11GSA 4YQVA 1YF0A 3FRCA 1B8XA 3GFKA 1GSFA 5J9CA 2H6YA 2YJ7A 2VM1A 1KNGA 2VL2C 1G6YA 3U6VA 3L9SA 4IS0A 1Q4JA 1FB6A 1TTZA 4HI7A 2ES7A 2XHFA 3FK8A 3F6FA 2R2JA 2B7KA 1SKSB 2VCVA 2VD0A 1SD9A 2V1MA 2WJUA 1EP7A 3U5RE 1R5PA 4CHSA 2X8CA 3A3TA 4PQ1A 2VLUA 5G30A 4ACSA 2H6ZA 1PN9A 3WGEA 2P31A 6GSYA 1TK0B 3MSZA 3UJ1A 1A2JA 1SK0A 3UVHA 2YWMA 2LRCA 4TR1A 1S3CA 2N5FA 3HY2A 4PURA 5IMCA 1YKAA 2P5QA 4NHWA 3RPNA 2PUKC 3W6GA 3BD2A 4KW6A 2CA8A 3TRPA 3WT1A 2YNXA 3UL3A 3VI7A 3GN3A 3VPQA 2CAIA 1QQ2A 3KP8A 4N10A 1XBSA 2OADA 5KN0A 1WRYA 4MJAA 1N2AA 2MMOA 1TP9A 2LKUA 5JCUA 4KNDA 1EV4A 1ZYEA 2LJAA 5IO0A 3G7YA 3GA4A 3N5OA 5ECMB 1V98A 3IBHA 4V2MA 2HLSA 3ERFA 3KM6A 3EWLA 2B5YA 2L6CA 13GSA 1O85A 1MD4A 1XW5A 3ERGA 2PGTA 5CP1A 1GTUA 3F9UA 1GSUA 2O85A 4JRRA 5ECSA 2VLVA 3C71A 5H5SA 2IL3A 3I69A 5AN1A 1Y25A 5A4UA 1JZDA 2C0EA 2X8GA 5B6MA 5IQYA 3K8NA 2GLRA 2RLIA 3DMLA 2L4CA 3UOMA 3HVSA 3D22A 4JEDA 3HD5A 1TK8B 4POKA 2FA4A 3ZFBA 1EWXA 4EDZA 3Q74A 1XVQA 2M46A 4TR3A 5ECRB 2IFQB 1GULA 2YOIA 1URMA 1EGRA 3D5JA 4RUVA 3WYWA 4FH8A 3KIJA 2YWIA 4ZILA 4JZQA 4ML6A 3NZNA 1B48A 1MDIA 5FT3A 3ME7A 3H8QA 2C1YA 2NBSA 4MK3A 4JBBA 5HR3A 5ECIB 5G5FA 1UVZA 3EE2A 1X5CA 1GSEA 2AB6A 3H79A 4I6XA 1Z7RA 2H0IA 1XW9A 2KUCA 4J2FA 10GSA 4N11A 2AAWA 5GZZB 2GS3A 1BQ7A 1M99A 1USBA 2K18A 5J4UA 3TOTA 5DALA 5EL8A 4XS4A 2A2RA 4EDYA 4D73B 2C80A 3TJKA 2XPDA 4LLRA 3P8WA 3WGXA 4XRAA 1J9BA 2PPTA 3GX8A 1YEPA 4HEA2 5JWRB 2NVLA 4HUAA 2B5EA 1X5DA 5DAKB 1QFNA 1T7PB 2VLTA 4MDCA 2L5LA 2R37A 2DMLA 3GH6A 3MWHA 1FO5A 2CX3A 4OFMA 2GSRA 1V58A 3TDGA 1R4WA 1J0FA 3P90A 4GLTA 4NAXA 5KN1A 4ZB6A 5DCGA 1OKTA 5AIXA 3ZIJA 1OKDA 4MF5A 1YQ1A 4Q5RA 1JFUA 2WDUA 1B9XC 4DVCA 2YCDA 1G7EA 1MEKA 4GQCA 5KN2A 2VCWA 2VO4A 4WEYA 1T00A 2PU9C 4ZB8A 4YAPA 1PA3A 3QAWA 3HKRA 3CSHA 2KHPA 5CRHA 4TOPA 3CYNA 4KB3A 2K8SA 4X1UA 1XWKA 5IPGA 2FWGA 4CDOA 4F82A 3ZITA 1WMJA 3MNGA 4FYBA 4O92A 5D93A 1OC9B 4GCIA 1AIUA 4MLYA 4IVFA 5IOWA 2L5OA 2X8HA 4PNFA 1X9MB 1GSYA 1RQMA 4PUAA 1OAZA 1SL0B 4PGTA 1X9SB 2LS5A 2VL2A 3LWAA 1VF3A 4POMA 1FG4A 2FA8A 2PBJA 1ERTA 1EV9A 4V2LA 5A4WA 2YWOA 3TRQA 5ABRA 3J7Yk 4QQ7A 3ZMKA 4TR0A 3DXBA 1SD8A 4FIWA 3DIEA 4IW9A 3GTUA 3I6AA 2IWTA 5AIVA 3FR6A 3KD0A 1PL2A 5CRGA 2IN3A 3UVTA 5A4VA 4GWRA 22GSA 2NDOA 3FZ9A 1F6MC 1OC8A 2C8UA 2OACA 4N30A 1SYXA 1O73A 4IP1A 5EY6A 2IJYA 1PD21 2JL4A 1TRSA 5D73A 4E8HA 4JR4A 4AJ8A 4ECIA 3D0ZA 5DCHA 1O8WA 5GAPD 4J57E 4X43A 3W8SA 2C0GA 4IBPA 4WR4A 1PKZA 5J5NA 2VCXA 2VCQA 2HT9A 3TOUA 3ZYWA 4N0ZA 1T8EB 4XIHA 2FWHA 4IELA 1UC7A 4LMWA 1NW2A 2GT5A 3F3QA 1TKDB 4EVMA 3GKMA 2HZFA 2LEGA 4K7NA 2V32A 2FNOA 2YV7A 5B6NA 1X9WB 1FOVA 3SBCA 1AXDA 3HDCA 2AUVA 4BVXA 3EMPA 1E2YA 1AUCA 1XWCA 2GZPA 1VRSD 4DSQA 1JLVA 3VURA 1XW6A 1F37A 1AQWA 2ZUPA 1XPVA 1HD2A 2B3SA 5DVBA 1EEJA 3KGKA 3GV1A 1X5EA 2GQMA 2QGVA 3MDKA 4G2EA 2BTOT 5DJMA 3HJOA 1Z7PA 4J56E 1CQHA 3J7Yb 4POBA 5F06A 5HFGA 1RW1A 1SK1A 1EOGA 3A2XA 3IR4A 4AJ6A 1M0UA 3DRNA 4PQIA 3CSJA 3EYTA 1XFLA 4WF5A 4LA1A 2C4JA 4I2TA 2RM5A 3H1NA 3FR9A 3HYPA 3M3MA 2C0FA 3ED3A 1B4QA 4BPYA 1YJ6A 4IN0A 5GSTA 2IMDA 5DJLA 2JSZA 3F3RA 2C3TA 5CREA 3IA1A 1F2EA 2R4VA 3QOUA 5HR2A 3EC3A 1QGVA 5FWGA 3QCPA 1OVNA 2YN1A 4MF6A 3ZIVA 5J41A 3TKQA 2I4AA 3FKFA 2WS2A 2KP1A 1PMTA 1TXXA 3DEXA 2PVQA 4IJ3A 3LEFA 4TRXA 4MP4A 4AJ7A 4V2NA 1AW9A 4PXOA 2I3YA 2IMKA 2O8VB 4TR1B 1E6BA 2CT6A 4L0UA 4MA9A 4OFNA 3TKRA 1GNWA 2DJJA 4ISDA 4P3YB 3TGZA 3TRXA 1GL8A 2VOCA 3RHBA 1GTIA 2P0GA 1W89A 4GSTA 3GMFA 3PR8A 5COHA 3QPMA 5AGYA 4BVYA 1JZWA 3HJPA 4V1Ag 3HVXA 5IMFA 3C1RA 3IK9A 3CTGA 4RQRA 3F63A 2YANA 3QD9A 1U88A 3ZLPA 4ILFA 2VD1A 1F3BA 2BMXA 4WXTA 1XXUA 2YJHA 4EE0A 2YZHA 3FZ4A 4F2IA 3LYPA 1NM3A 1ZYQB 4H86A 3KMNA 1GUHA 3RBTA 1V2AA 4K8MA 2J9HA 1BEDA 2REMA 2VCTA 4MPGA 2H30A 1U6TA 4TXOA 4ECCA 2O87A 2ALBA 1WE0A 3EURA 1GSSA 1YEXA 3FYGA 5FHIA 5EPFA 3IHQA 2FUG2 4BWSA 2DJ0A 4MCUA 3UEMA 4IJIA 1WIKA 3CMIA 1VF4A 3LJRA 3I9V2 4JE1A 4E8EA 1BYEA 1EP8A 1S3AA 2F3MA 2M80A 5C00A 2EIOA 3UIWA 3GYKA 2FLSA 3EU3A 3TCOA 5CRWA 3EU4A 2DJ1A 3ZVJD 3DVWA 3EINA 2HXKA 1A2LA 4ULXA 2N5AA 4ZL7A 1GH2A 2JZSA 3LXZA 5CNWA 1XVWA 1A0FA 2V6KA 1LBKA 4FYCA 3KTLA 3ZL5A 2AHEA 3QR6A 2LUSA 4HJMA 1T4ZA 3F6DA 4EXJA 2MYGA 3VPTA 2GZZA 4MH3A 3E0UA 2C3NA 1PX6A 5IOXA 2LNSA 3H4KA 2G0FA 1FAAA 4KCAA 4OCFA 4GRFA 1QXHA 4EF0A 1XOAA 3LGCA 4OO5A 5DALB 4XS4B 2YZUA 1K0BA 3LORA 4EKZA 3D21A 4HU7A 5B8BA 2O89A 1I9DA 2LQQA 2LNTA 3LSZA 2OBKA 2LJKA 2GZYA 1B9YC 2H0GA 4BL7A 5B8AA 1ML6A 1M2AA 2HZEB 1AC1A 1BAYA 1GUMA 1PX7A 1NSWA 3ZMLA 1XOBA 2IPAA 2YV9A 4LMVA 2TRCP 3KEBA 4NMUA 5ELGA 2GQLA 3KMOA 5ECKB 2HE3A 1LJRA 2FCHA 3TKSC 4HQSA 2K6VA 3O6TA 6GSWA 1SENA 4XS6A 2H1DA 1MTCA 3QDNA 1MDJA 4JR6A 1HQOA 1A0RP 4ML1A 1G7OA 4HZ2A 2IIYA 5G5EA 1C72A 2H73A 2H6XA 2MMAA 4DSSA 2K9FA 3LFLA 4BWQA 2TRXA 3GRXA 2H0HA 1U3IA 5F07A 5EVOA 3EVIA 2BJXA 3RDWA 4NV2A 1FHEA 4ZB9A 1PQNA 1EOHA 2KP2A 1MDKA 3DGQA 2GVPA 4HU9A 2HYXA 3IC4A 3HZ4A 1R5AA 6GSVA 2EIRA 3KZQA 2DSAA 1SYRA 2IFQA 4KDYA 2HRNA 4KCEA 1SJZA 5JCGA 1EZKA 2H72A 1O81A 2E2MA 4O5RA 1A23A 2MMNA 2F8AA 4IKHA 3GTUB 1G0TA 1XWGA 2DIZA 3M9KA 2B6MA 4TXVA 5IMZA 4EC0A 4RI7A 5IMAA 2CQ9A 5DBQA 5ID2A 1ZZYA 2WGRA 4F0CA 3GKKA 5HFIA 3HA9A 2B1KA 1OE8A 5F0GA 2IMIA 5E59A 3R2QA 1UA5A 6GSUA 4XTSA 2RIIA 2WFCA 2VIMA 2DJ2A 4N0VA 3SWLA 2WB9A 2N5BA 3FY7A 4O7HA 3UBKA 5ECLB 3LXTA 3GKXA 2R3XA 4NV5A 1TK5B 3GHAA 1QUWA 2M72A 3RHCA 4HDEA 2CV4A 2E0QA 1JLWA 3G9BA 2AYTA 4MZWA 1THXA 1ZCPA 4I97A 1PGTA 4PNGA 4KH7A 4MF7A 3GUSA 2CVBA 5GSSA 4I2UA 5G31A 1NHOA 1SKWB 3LG6A 3GL3A 2EIQA 5H5QA 5L71A 3CRUA 2MZCA 4GTUA 1SK2A 1V57A 2JADA 5IMDA 3GX0A 4TKYA 3VLNA 5J9BA 5LNKe 4OCEA 4I8BA 1Z6NA 1K0CA 7GSSA 1J08A 2A4VA 2K8VA 5G2ZA 1XIYA 2XBIA 1XWBA 4AF2A 2HI7A 3L4NA 1TRWA 3GH9A 2RUEA 1ON4A 3ZRDA 1TU8A 2VCZA 2YWNA 1M9BA 1DUGA 1SU9A 3E9JB 1K0NA 1S3DA 1OC9A 3DKSA 3FR3A 1W4VA 1ZOFA 1BG5A 3HVVA 3M9JA 2PERA 3FZAA 4MMMA 3GL5A 2B5XA 2PVOC 4KDUA 2E7PA 4ZBBA 5ECNB 2HSYA 2F8FA 3KH9A 2R6KA 5CRDA 3UARA 4KX4A 1WWJA 4NXIA 2X99A 1ERVA 2VAFA 5B7CA 5IIZA 4Q5NA 2GTUA 3GNJA 4MABA 1PKWA 1A8YA 3CTFA 5E4WA 1O7UA 5AISA 3HZ8A 2G2QA 1BJXA 1V9WA 4NWYA 4PQHA 2LRTA 1IYHA 1H4OA 3ISOA 1YKCA 4GXZA 4XS1A 5D9WA 1WOUA 1LU4A 4IQAA 1DSBA 4YQUA 1OC3A 3ME8A 2CAQA 2OJLA 1XWAA 1FW1A 4YH2A 5IM9A 1Z6MA 4WF4A 3FW2A 3BOAA 2HNLA 4OD7A 3D6IA 3IRAA 4IP6A 2DMMA 3N9JA 4KGIA 1GNEA 3DWVA 1HNBA 2RUFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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