3TJBA

Crystal structure of wild-type human peroxiredoxin iv
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
170
structure length
170
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 56
structure length 170
sequence length 170
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjbA00
2MBTA 1QUWA 2YCDA 4HUAA 2PMTA 4XS4B 2X8HA 2JL4A 4FYBA 2FLSA 3HVXA 1ZYEA 1O81A 3DVWA 4I6XA 5J9BA 1GNEA 2IFQB 3A3TA 4EL1A 5ECMB 2MBSA 3ED3A 3AY8A 7GSSA 3QOUA 2N5FA 1MD4A 1S3AA 2GTUA 1EWXA 2V2GA 4V2MA 1OKDA 3L4NA 2NBSA 2JZTA 1SJZA 4ZBDA 3P2AA 2HNLA 3HHVA 1AQWA 4MPFA 2KHPA 5HR2A 1WPIA 3MDKA 3LJRA 5HR1A 4GSNA 3KIJA 4K2DA 3HCZA 3EC3A 1BQ7A 3F9UA 5D96A 3BCKA 4NWYA 3G9BA 4K9ZA 3IRAA 2JADA 3J7Yk 2H19A 3TRPA 4TR1B 3UBKA 2XC2A 4BVYA 3QAVA 3TJBA 1A2LA 4K6XA 4GSTA 3QD9A 5B8BA 1JZWA 4IHUA 4O5RA 4N11A 4TOPA 3S9FA 2O87A 1T4ZA 1FB0A 3O76A 1LJRA 1PD21 2LRNA 4NV2A 3CMIA 4OO4A 3K8NA 4GF0A 4ZBBA 4F0CA 4YAVA 2EIRA 3C1SA 3FEUA 2BTOT 4OCEA 3KP8A 1NHOA 4XIHA 2X8CA 4RQXA 1SD9A 3J7Yb 3D4TA 4MABA 1PRXA 1FVKA 4GSSA 3WD6A 2CAQA 1GRXA 1PA3A 3GMFA 1HD2A 1QGVA 4G10A 4KAEA 3APQA 4LMWA 5ECOB 4G19A 2FWEA 3TDGA 5FHIA 4TXOA 4XS1A 4TN8A 3GV1A 1SKWB 4GLTA 3UOMA 1TP9A 3D22A 3GSSA 2C0EA 4ZXGA 2M46A 4ZB6A 2H1DA 2R2JA 3M9JA 4JR4A 4K0GA 1YF0A 3GN3A 2X99A 4RQRA 2OE0A 3A5WA 1ZZYA 3ZVJD 4TR0A 2V6KA 1UN2A 1K0MA 3GH9A 1FO5A 2Z9SA 1G0TA 2A2SA 4BWSA 4WF4A 5DCGA 2HT9A 4GXZA 2YP6A 3QFBC 2L57A 3TJFA 1TW9A 1FB6A 2V32A 1XBSA 3QPMA 1JFUA 1DUGA 1YZXA 4PQIA 2HRFA 1M99A 1VF1A 3M3MA 1I5GA 5ELAA 1HNAA 2CX4A 1SJ6A 2CQ9A 1WWJA 3FZ9A 2REMA 16GSA 2MMAA 1XWAA 2LJKA 2H70A 3VWVA 22GSA 1H75A 3UIWA 1GNWA 3I43A 2O89A 4XCSA 4ML6A 1G7OA 4D73B 1SK0A 3E3EA 2RM6A 4XS4A 1YDKA 2IJYA 2F9SA 2DJ3A 2J9HA 5DQSA 2IFQA 4MJBA 1FG4A 2GSTA 4AJ7A 3R2QA 5ABRA 2VAFA 2MZCA 2L6CA 2C80A 1A8LA 1X9MB 3GH6A 1Z6NA 2H6XA 2X8GA 4ECBA 1MDIA 2LS5A 1FOVA 3DVXA 2I81A 1X9WB 2DLXA 1M7TA 2C3QA 3IAS2 1MTCA 3ZVJA 2KOKA 1GL8A 2FWGA 3WYWA 2C3TA 1Q4JA 2CZ3A 5DALA 1TU7A 5C04A 2G0FA 3O3TA 4PQ1A 3RBTA 1M9AA 1SD8A 2PPTA 2AAWA 3EU3A 1AUCA 2DIZA 4EE0A 2YN1A 4KDXA 4I2UA 1G6WA 1GTIA 5ECKB 1YJ6A 5A4VA 4I8BA 4KUNA 4IN0A 2V41A 4TVEA 1EOHA 4TR1A 4TKYA 2H6YA 2FA4A 5B6MA 1OC8A 5HQPA 6GSXA 1VF3A 4LMVA 3UMAA 3MNGA 1SYRA 1GTBA 2H1BA 1K0CA 1VF4A 1XZOA 1GSSA 1OYJA 4MH3A 1OE7A 4EDYA 2RUEA 5EVOA 1K0DA 3ZIJA 3M1GA 4KB3A 1PGTA 5COHA 4F82A 3TOUA 5A5KA 3RPPA 4YH2A 2VCVA 2B7KA 4IP6A 2AYTA 3TKSA 5B8AA 3GIXA 2FWFA 2O85A 3KMOA 5KN0A 3UVTA 2L5OA 2F3MA 3CRUA 3WGXA 4F2IA 1MEKA 5D8IA 1NSWA 2VCQA 3F63A 1F37A 4LL4B 4PX1A 1W89A 4GQCA 3FKFA 4PUFC 1G6YA 5D9VA 1Y6EA 4KDYA 1U88A 1V58A 5G1LA 3KCMA 3ZFBA 3QDNA 4XHMA 2C8UA 2H76A 1A0FA 3IR4A 5JWRB 3GKXA 2VL3A 4DSRA 3VPTA 1EP8A 2WCIA 2XBIA 1N8JA 4N10A 4Q5NA 3D4MA 5D9WA 4L8EA 2VL9A 2WRTA 1TRSA 5ECPB 1PX6A 2HI7A 4ZL8A 3QCPA 1B9YC 3VI7A 2I1UA 1ACVA 4O32A 5IMVA 4IW9A 2QGVA 3F6FA 4FH8A 1ML6A 4ML1A 2OBIA 4AJ6A 4BL7A 5KN1A 4EDZA 1W4VA 4IBPA 4MF5A 2JSZA 1FHEA 1OC9B 2FA8A 2VOCA 2J23A 2VIMA 4RI7A 1M0UA 1XW9A 2HFDA 1GTUA 2QC7A 1BJXA 5GZZB 2K6VA 2YPMA 3DEXA 3UVHA 1GLPA 1QK8A 3GTUB 2GZZA 4PNFA 1ZL9A 5HR3A 1PMTA 2JSYA 4I2TA 3UARA 3I69A 1O7UA 3ME8A 5J41A 2GT5A 4Q5QA 1SL2B 2DJ2A 2VCXA 2E0QA 1FAAA 2PVQA 3DWVA 4IVFA 2GSQA 1O85A 2F51A 5D73A 2GGTA 2CVDA 2H72A 1SL1B 3TRQA 4MZWA 1TI3A 3F3QA 2AJQB 2IMFA 2H73A 3DIEA 2VL2A 3SWLA 3GHAA 2WZ9A 4HJMA 2B5XA 3UEMA 4OD7A 5CO3A 1Z7RA 5FWGA 1GSYA 3C1RA 4KX4A 1ABAA 2ZCTA 3LWAA 3PR8A 2LNSA 2BJXA 1HNBA 4IKHA 1YY7A 4TR3A 5JCWA 4MJEA 1KBNA 3CSIA 3ZL5A 4E8HA 2ES7A 6GSVA 1TDIA 1OVNA 4FYUA 5HFKA 5KN3A 2IWTA 5F06A 4XRAA 3PGTA 2LUSA 1MDKA 1ZMAA 5A4UA 2XPDA 4IP1A 1T4YA 1NM3A 3ZTLA 1BX9A 2N5BA 1SKRB 4EO3A 4AGSA 4O7HA 2K9FA 3KZQA 5CAXA 1JHBA 4YQUA 3GNJA 2GQMA 2YWMA 1XW5A 3OR5A 3N5OA 2H30A 3GYKA 5IPHA 1ERTA 1XOBA 3MSZA 2JZSA 5IPGA 1YQ1A 4ILFA 1X0RA 1B9XC 4HQZA 1UA5A 4JEDA 5ECNB 5C00A 2RLIA 3GFKA 3HD5A 4POLA 2VM2A 4BPYA 1EV4A 3GA4A 1E6BA 2P31A 2H74A 5CRWA 1YKAA 2PU9C 5AGYA 1K0AA 1O8XA 4WR4A 2P5QA 1TI1A 4DSQA 1YEXA 4WKWA 2HXKA 3RPNA 3UAPA 1GSQA 5H5QA 1O73A 3Q74A 4L5LA 1ZYQB 3ZITA 2HZEA 4ISDA 2FCHA 5G5FA 4WEYA 3CYNA 4ID0A 4ULXA 4CW9A 3BJ5A 1JZOA 4IELA 3DKSA 5DAKB 1VRSD 3IBHA 1QMVA 1GTAA 2BMXA 5D93A 1KEBA 4TXVA 5HFIA 3W8SA 20GSA 1F6MC 3ISOA 2YZUA 3IA1A 2H01A 3VLNA 4OFTA 1TK0B 3VWXA 1EP7A 2VLVA 5J4UA 2P0GA 5KEJA 3FK8A 2CVKA 3BOAA 4K1FA 1EGOA 4POKA 2YJHA 1Z9HA 2LRCA 2DJJA 2C0DA 3RHCA 1SU9A 2H71A 1Z6MA 3JCML 5G5EA 1T8EB 3E0UA 1ZGNA 1PKWA 2OE1A 1U3AA 5EY6A 4XTSA 5ECRB 2EC4A 2ON7A 1TKDB 1A8YA 4JRRA 4MLYA 1K3LA 2CX3A 3BD2A 3GL3A 2OA7A 3P7XA 3M0FA 2YV9A 4WF5A 5IIZA 1BAYA 2KP1A 3VK9A 2AHEA 1OC3A 1ZOFA 1QXHA 3FHKA 4HU7A 2N5AA 4EKZA 2P5RA 3HJOA 4KE3A 2A4VA 5GSTA 3TGZA 3LEFA 2GS3A 1ERUA 2GSSA 3W6GA 2IMEA 1XXUA 3LQ7A 3TKQA 3F4SA 2MMNA 5G30A 2XHFA 4MCUA 5GAND 4PGTA 3FRCA 2LV3A 2WFCA 1GP1A 1AQVA 1XWGA 4AJ8A 3KMNA 1TTZA 3TUEA 4KSOA 2H0HA 3U6VA 2C4JA 1XVQA 1URMA 3D21A 2MMZA 1SKSB 4FIWA 2TRCP 3VI5A 4L0WA 4F03A 1V9WA 3CBUA 2LSTA 1XW6A 5B7CA 2LEGA 2R4VA 5CP1A 10GSA 4KNDA 1Q98A 1T7PB 3C73A 3TKSC 3DRNA 1SK1A 4MH2A 1GWCA 3GKNA 2WULA 4NAXA 4K7NA 1THOA 3IAM2 1C72A 1WRYA 2HRNA 1WIKA 1KNGA 4Q5RA 1J9BA 5G31A 2B5EA 2GQKA 5LD0A 1TRVA 1YKCA 2IMIA 2GZPA 3ZFLA 2R37A 4AF2A 4HZ4A 2XBQA 4TR4A 1SL0B 5IOWA 3H79A 4WETA 4ZB9A 5IMAA 3HA9A 3HVVA 5ELGA 3KH7A 3CRTA 5JWQB 3V1WA 1AXDA 2NPBA 1VF2A 2F8FA 3ZREA 4JBBA 5DAKA 4H86A 1R5PA 3D5JA 4F0BA 3M8NA 4V1Ag 3TJGA 1NHYA 1R5AA 2KUCA 1WOUA 3KGKA 1TOFA 5JCUA 2B1KA 4O92A 4WBJA 5ID2B 3D6IA 5CYYA 2DC5A 4LLRA 4HZ2A 3DD3A 3FR6A 1MDJA 4DSSB 4N30A 5IMZA 4OMVA 2YNXA 1FW1A 4EUYA 1DBYA 4DEJA 5EL8A 2DMLA 3WGDA 1GSUA 3IC4A 5IQYA 3GUSA 1EGRA 2NDOA 4K7OA 3F4RA 5LCZA 1AQXA 3ZLPA 4EVMA 1OE8A 5L71A 18GSA 1M2BA 4F9ZA 1XFLA 2VD0A 4NHZA 4PQHA 11GSA 3HZ4A 4ZL7A 4Z7XA 1RW1A 2VLUA 1R4WA 2HSHA 1X5EA 3PH9A 2YV7A 1A24A 3NIVA 2GDRA 5CRDA 4K8MA 4JR6A 19GSA 4EF0A 1GH2A 2VL2C 3UBLA 2HYXA 1ILOA 5IOXA 1JLWA 2K18A 1OAZA 2YJ7A 2L6DA 3IHQA 5AIXA 3PINA 3BCIA 4MMMA 5ECHB 3HKRA 3SBCA 4PNGA 3WT1A 2H1AA 5DVBA 3RDWA 3ZZXA 2B7JA 5F05A 14GSA 4WXTA 4L5OA 2O7KA 5IMDA 4ZBAA 2MYGA 2GLRA 3GURA 5E59A 2OACA 2ZUPA 1PL2A 2NVLA 1LU4A 1BG5A 4MDCA 3APOA 1TRWA 1TXXA 1GUHA 3FR3A 1RQMA 4WR5A 4D73A 3DYRA 4FYCA 3TJJA 4ZIJA 4GCIA 3QMXA 2LTKA 1R7HA 9GSSA 3LXZA 5CNWA 1B4QA 1TRUA 2DJ0A 4N0ZA 4J2FA 1J08A 3W8JA 3EVIA 3QFAC 4HDEA 1ERVA 4HEA2 2LJAA 2LQOA 2YWIA 1EEJA 1X5DA 2L59A 2R3XA 3LSZA 2IMDA 3ZMKA 2AV4A 3EMPA 2H0GA 3HVSA 4G9HA 1X5CA 4J57E 2H0IA 2AUVA 2KP2A 3GX8A 1HQOA 1NW2A 1IYHA 4JU5A 4JZQA 5F8BA 5IM9A 6GSWA 2B1LA 2FY6A 2JU5A 1PKZA 1XWBA 2K8SA 3HDCA 2PN8A 1ZCPA 1U87A 3L9UA 1BEDA 4NMUA 1N2AA 3KM6A 1PQNA 1AW9A 1WMJA 4NPBA 2H8LA 5J5NA 4MF7A 4GQFA 1O8WA 3EURA 1X9SB 4BA7A 2LRTA 3M9KA 3DMLA 3G7JA 4V2LA 4DSSA 1MD3A 1UVZA 1DSBA 5G1KA 1XWKA 3C7MA 1V57A 17GSA 4E8EA 2DMMA 1K0BA 2EIOA 4TW5A 4NV5A 2VM1A 4MJCA 4KDUA 3L0HA 3EINA 4DVCA 1KTEA 3LYPA 3EWLA 3VFIA 1F3AA 2H6ZA 2E2GA 3MWHA 3VWUA 2GQLA 4QQ7A 3EU4A 5D9TA 3TKPA 3A2VA 3GX0A 4G2EA 1YF1A 1LBKA 1WE0A 4QL9A 2OE3A 4YQMA 3FR9A 3Q6OA 3L9VA 1AAZA 1DE2A 1BYEA 5DALB 5G2ZA 2DBCA 1TU8A 3FYGA 3IXRA 2H75A 3NZNA 4KA0A 4V2NA 1O6JA 2DSAA 1HYUA 1JLVA 3L78A 2VCWA 1PSQA 4POMA 1EOGA 2RIIA 1T3BA 4ZL9A 3ZIVA 1G7EA 3QR6A 1Z5YE 2HSYA 1I9DA 5H5RA 4MJAA 2OJLA 2ZNMA 1THXA 2R6KA 1A23A 3HXSA 3VURA 4ACSA 4X0XA 3F3RA 1IYIA 2WS2A 3GSTA 3H93A 4MZBA 1OC9A 2C0FA 4HOJA 2WJUA 2V1MA 1EZKA 1ERWA 3LG6A 4FO5A 1F2EA 3KTBA 3P90A 4POBA 3GTUA 5LNKe 4NXIA 3D0ZA 2C1YA 2CA8A 3TJKA 1Z3EA 3KEBA 3U5RE 4IQAA 1Z7PA 1U6TA 2OBKA 3C71A 4MF6A 3CTFA 2XPEA 4PXOA 2AB6A 1SENA 2YWNA 5AN1A 2GVPA 4X1UA 3NOFA 3HJMA 3KTLA 2CT6A 5JWOB 4MP4A 2JACA 1V40A 5IMCA 4KH7A 2B3SA 1B8XA 4IJIA 1B48A 3G7IA 2GZYA 1K0NA 4NHWA 2PVOC 3ME7A 2IPAA 4EC0A 3GRXA 4LL1B 2QSIA 3ZYWA 4YAPA 4BWQA 4HI7A 3IK9A 3LFLA 4I97A 3IV4A 4MZCA 2DIYA 2LQQA 4KSMA 4I5QA 4PURA 2C3NA 2NTOA 2OADA 2EIQA 4GWRA 2WGRA 5HFGA 2WDUA 3F8UA 1T00A 2FNOA 12GSA 3I6AA 2FD3A 4CHSA 1UC7A 3WT2A 5B6NA 3LORA 2VO4A 3US3A 2L5LA 2IL3A 2D2ZA 1SJIA 2YANA 3FZAA 3APSA 1TK8B 2VD1A 3ZRDA 4ECCA 1XOAA 3MAKA 3A2XA 3HYPA 5ECIB 3ERWA 1XIYA 1XWCA 1ON4A 1SYXA 1JZRA 4IQ1A 5ENUA 5HR0A 2VCTA 4RUVA 3Q18A 2DJKA 2JZRA 4HS1A 3RHBA 4OWYA 4KCAA 4JE1A 1S3CA 2QKEA 2LNTA 5GSSA 3P8WA 1A2MA 2I4AA 2H1GA 2IMKA 2M72A 3GKKA 5AISA 4LA1A 3TKRA 1M2DA 6GSTA 1S3DA 3HY2A 2I9HA 3KD0A 3Q19A 2HZFA 5F0GA 1RK4A 3C8EA 4RI6A 1FVJA 1PN9A 1AIUA 1GUMA 5ECQB 2A2RA 3RAZA 3F4TA 1A0RP 2CV4A 2KLXA 1AC1A 1TJDA 3VPQA 5EPFA 2H66A 5A4WA 2K8VA 3ERFA 1U3IA 3UL3A 3QAGA 3LXTA 5J9CA 4HQSA 2B5YA 2F8AA 3LGCA 2ALBA 3VWWA 4HJ2A 1K0OA 3L9SA 4ZB8A 8GSSA 3CXGA 1WJKA 3O6TA 4MK3A 2FGXA 5GAPD 3QAWA 3A2WA 1K3OA 13GSA 1WP0A 5INYA 1DE1A 3ZMLA 2I3YA 2M80A 3UJ1A 1CQGA 2VCZA 1GUKA 3IE3A 2LKUA 2VUPA 3GKMA 2B6MA 5DQYA 5IO0A 3ERGA 2FUG2 2HE3A 3CTGA 4IS0A 5J3RA 3F6DA 4BVXA 5CREA 1EV9A 3KJYA 3IOSA 1T1VA 1HNCA 4P3YB 3HZ8A 4YQVA 3FZ5A 3TB2A 3IPZA 1GSDA 4TRXA 3TCOA 2IIYA 3BBYA 4ECJA 1R26A 4MA9A 4OCFA 2E2MA 1QQ2A 3G7YA 3EYTA 1GSFA 4KCEA 1YEPA 3FZ4A 2LJRA 4K7IA 1ST9A 5F07A 2R5GA 3IDVA 1PL1A 5E4WA 4CDOA 1XPVA 3H1NA 4QL7A 4KGIA 2YOIA 3FW2A 2HZEB 5AIVA 2L4CA 4ECIA 4HU9A 3IK7A 1USBA 2TRXA 4N0VA 3GL5A 2VLTA 2TIRA 5DJMA 4V1Ap 1CQHA 1GULA 2E7PA 2PWJA 1VGLA 1OKTA 3EMXA 4XRDA 5D9XA 3H4KA 2MMOA 4X43A 1F9MA 5KN2A 1XCCA 1QFNA 3LYKA 5FT3A 2PUKC 2PBJA 1JZDA 1EEMA 4EXJA 3KH9A 1A2JA 4Q5FA 1TK5B 4IGJA 4OO5A 1Y25A 5ECLB 2GT6A 4MPGA 2C0GA 1B4PA 3TOTA 5DCHA 3H8QA 4TXOB 2CVBA 3DGQA 2PGTA 3TKSE 5IMFA 3CSJA 5H5SA 4OFNA 4WBRD 1V2AA 2CAIA 3KP9A 4J56E 4KW6A 1J0FA 3FY7A 1K3YA 5CRHA 1GLQA 2G2QA 1PX7A 1XVWA 3CSHA 3TRXA 3DXBA 1M9BA 2HLSA 2WB9A 2FWHA 1V98A 5JCGA 4GRFA 2YZHA 4IJ3A 3N9JA 4XS6A 2DJ1A 4PUAA 6GSUA 1H4OA 2YWOA 3E9JB 5IO2A 6GSSA 2L4QA 2PERA 5CRGA 1E2YA 2IN3A 3KXOA 2O8VB 3I9V2 2GSRA 1M2AA 3HJPA 6GSYA 5DJLA 3F0IA 4L0UA 2X64A 5DBQA 3WGEA 2RM5A 1SK2A 4OFMA 2ON5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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