3TJGA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c51a mutant in oxidized form
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 57
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjgA00
5ECIB 3M8NA 1C72A 3EC3A 1QGVA 5IIZA 2NBSA 3IV4A 3TKSA 5D9TA 3HYPA 1GSSA 4ZB9A 2RM5A 1R4WA 4L0UA 3CYNA 4WR4A 5ID2B 3DIEA 4GTUA 2EC4A 2MMAA 3G7IA 2PGTA 2H75A 4JZQA 4GSNA 4N10A 3K8NA 1DBYA 2WZ9A 2L5OA 4EVMA 2VCQA 1YY7A 2NDOA 1ML6A 4IP6A 2GT6A 3O3TA 3RHCA 3HCZA 1EZKA 2VM2A 2CZ2A 2IIYA 4KX4A 4OCEA 1ON4A 2OBIA 12GSA 1V40A 2YCDA 3ZLPA 5J9CA 4IQAA 4F2IA 1O81A 2FWGA 2LJAA 2LSTA 1SJ6A 4X43A 2K9FA 4WR5A 4YH2A 1S3DA 4ZXGA 5IPGA 2PN8A 1XBSA 2CT6A 1G7OA 2VLVA 4MF7A 2OA7A 3A3TA 1BAYA 3KP9A 2V1MA 4K1FA 1LJRA 3QOUA 2P31A 2I1UA 1JLWA 3CSJA 2H66A 2FNOA 1O8XA 1ERVA 1KBNA 4HEA2 4PQ1A 4BA7A 4XRDA 2O89A 4TOPA 1KTEA 1S3CA 4O5RA 3DVWA 3ZFBA 2PPTA 4MCUA 1R5AA 6GSYA 3HY2A 3VWWA 4NPBA 3CBUA 2VL2A 3VK9A 4N0ZA 4I97A 4PQHA 2C0GA 1XIYA 2RUEA 4Q5RA 2RM6A 3C1RA 5IM9A 4MLYA 3QD9A 1YQ1A 3FW2A 3VFIA 3TOUA 1Z3EA 2CVKA 4DSRA 1PX6A 5H5QA 2H30A 2TRXA 3GRXA 1J0FA 1HYUA 2AUVA 1SJZA 2KP1A 5GSSA 4O32A 1O85A 1B48A 2YZUA 4MPFA 4MMMA 4NAXA 2CZ3A 3GH6A 4EL1A 1F37A 2XHFA 5KEJA 4JBBA 5DQSA 3LFLA 1CQGA 2DMLA 3WT1A 4XS4A 3ZREA 2B5XA 2LRTA 4MJEA 19GSA 1J08A 3Q19A 2R5GA 4NXIA 1XOAA 3ED3A 5DCGA 2A2SA 4WF4A 2KP2A 1Z9HA 1TKDB 1NW2A 1NSWA 4I2TA 4KCEA 17GSA 3AY8A 3H8QA 2YJ7A 1FO5A 1XWAA 4I6XA 1B9YC 4GQFA 2H70A 3Q6OA 4ILFA 1OE8A 1TK5B 3KTBA 2IMFA 5IOXA 2F3MA 5C04A 3LYPA 2K6VA 1BEDA 4QQ7A 4G9HA 4PQIA 3KEBA 1SJIA 2DC5A 1GLQA 1EP8A 1MD3A 5GAND 3HD5A 3ZMKA 1EGOA 2LRCA 3FY7A 1K0DA 5G30A 5A5KA 3ZFLA 3KMNA 4KSMA 4YQUA 3FZAA 3P2AA 3QPMA 2VO4A 2JACA 2CAIA 5GZZB 16GSA 1GTIA 2V41A 3LORA 1YDKA 2QGVA 2KOKA 2OBKA 3VWXA 2VOCA 3WD6A 2DBCA 2XBIA 3ERFA 1SKWB 3L9UA 2X8HA 2ES7A 5IMDA 4V1Ag 4LMVA 4HUAA 3R2QA 4HS1A 2R37A 2N5BA 3M3MA 2HRFA 5HR1A 3RDWA 3KH9A 1V57A 1TI3A 1AW9A 3APOA 3O6TA 4NV2A 1A8LA 4WETA 4RUVA 1OKDA 5J5NA 1B9XC 2VL9A 2M46A 3QR6A 3DEXA 3F4SA 4K7OA 2P5RA 4OFNA 3F6DA 4V2NA 3H93A 3H79A 4TR3A 2I4AA 1SK0A 2H0HA 1QMVA 3BJ5A 2J23A 2WJUA 1GNWA 3RAZA 2FA8A 2X99A 2G0FA 2L4CA 1BX9A 4PNFA 2KHPA 2CQ9A 4HZ4A 4K7NA 2FWHA 1USBA 1AXDA 3TUEA 3VWUA 2AB6A 2CX3A 1XWCA 3GMFA 5IOWA 1A2MA 1GTAA 3DXBA 4O7HA 4RQXA 4DVCA 4D73B 2DJ0A 1DE2A 1U3IA 1TOFA 1U6TA 3ZTLA 1H4OA 4L5OA 2JZSA 2L5LA 1Z5YE 2LQOA 4OFMA 1EOHA 2K18A 5ECKB 2HNLA 2NTOA 2R6KA 3ZMLA 1X9SB 1JZDA 4NV5A 1I5GA 3HA9A 2YJHA 4AJ7A 2OE0A 1PRXA 1WMJA 2YN1A 4KGIA 2H6XA 3PINA 4GRFA 1TRVA 2H8LA 3MAKA 4EDYA 1T7PB 1TU7A 3KM6A 2M72A 1R5PA 2QSIA 5IMAA 5IO0A 1K0MA 3CTFA 5HR2A 2H74A 1K0NA 2M80A 3FR9A 5G2ZA 4EXJA 1V58A 1ACVA 1WJKA 4CW9A 5ELAA 2LJKA 3IE3A 1GSDA 2NPBA 2OJLA 4GCIA 1R26A 6GSXA 3L78A 2IFQB 1YF1A 3EVIA 1R7HA 1VF3A 1BJXA 1TRUA 3FKFA 4E8EA 2IMDA 1OAZA 2OKAA 3C8EA 3CSIA 4KW6A 3NZNA 5EY6A 5JWOB 3HVSA 1OC3A 2IJYA 4NHWA 5H5RA 2GS3A 3FZ9A 2DJ1A 3GSTA 1SD8A 3FR3A 4EF0A 2LUSA 4KCAA 1LU4A 2YV9A 4PGTA 5FT3A 1DE1A 4LL1B 4MZWA 3VLNA 2V32A 2L59A 2CV4A 3ZITA 5ECHB 3KGKA 3E0UA 4MA9A 1GSYA 3MWHA 4OWYA 5DBQA 2H1AA 2HE3A 18GSA 1TW9A 2H6YA 1TRSA 5ENUA 1XWKA 5F05A 3GIXA 4TR0A 2X64A 2GDRA 2DIZA 4OD7A 2LNSA 3IOSA 1M99A 1N2AA 4JEDA 1YF0A 1ILOA 3LXTA 3UIWA 3BOAA 2B5YA 4L8EA 3RPNA 2DMMA 4LA1A 4GQCA 1U87A 2DLXA 1SL2B 14GSA 3HJMA 1TU8A 3IAS2 4TW5A 2GZZA 3M1GA 5CNWA 1A23A 4IQ1A 3TJGA 4J56E 1XOBA 1GSFA 1QXHA 1F6MC 1YJ6A 4MP4A 2IMKA 3HHVA 2KUCA 3TJBA 1XW5A 1VF2A 2E0QA 5AIXA 8GSSA 4WKWA 2MMOA 2VL3A 4K8MA 1MDJA 3P8WA 1SK1A 5ECRB 3E9JB 3CXGA 1SKRB 2HXKA 5LNKe 4XS1A 22GSA 3KD0A 3IA1A 4RI7A 4L5LA 1OYJA 5KN3A 1GSQA 1SYRA 5EVOA 3TKPA 3FYGA 1AC1A 2O85A 1ABAA 4XIHA 2TRCP 2GT5A 6GSSA 3TCOA 3S9FA 1PSQA 1GWCA 4ML6A 3SBCA 4V1Ap 4EC0A 2YANA 4H86A 4ULXA 5DJMA 3EINA 2EIOA 2C1YA 2FGXA 4XTSA 1QK8A 4TXOA 2C4JA 3QFBC 3TB2A 3QAWA 2HZEA 2B6MA 1URMA 4K0NA 2GSRA 2GZPA 3ZYWA 1E6BA 1EEJA 1FVKA 1V2AA 1O8WA 4CDOA 3LSZA 2H1DA 2BTOT 2H0GA 2VD0A 5ECLB 3NIVA 1XZOA 2VLTA 5IO2A 2G2QA 3PGTA 2O8VB 3GA4A 2C0EA 1M9AA 4EO3A 3F8UA 2LTKA 1PQNA 4JR6A 1A2JA 4MH2A 3BD2A 3GL3A 5DALA 3UL3A 4IW9A 4QL9A 3E3EA 5G31A 2A2RA 3DRNA 5A4UA 1F3AA 2VUPA 5D93A 3ZZXA 1XVQA 3WGEA 3GV1A 1X9WB 2MZCA 2FHEA 1XXUA 1V98A 1SL0B 4K6XA 2HT9A 3F3RA 4ZL8A 2RLIA 1UA5A 1X9MB 2PERA 1GTBA 4HZ2A 3EU4A 3ERGA 2F9SA 3A2XA 2YP6A 1VGLA 4WBJA 4BVYA 1OE7A 3G7JA 9GSSA 3D6IA 4Z7XA 1GUMA 3PR8A 1M9BA 2H1BA 2MBTA 3F4RA 4NWYA 3C7MA 1V9WA 2YWIA 4ZBAA 1GSEA 2N5FA 4HOJA 1A2LA 2OACA 1QFNA 3GHAA 4ZB6A 2H1GA 1K0AA 3J7Yk 3NOFA 3EU3A 1HQOA 4GF0A 2H71A 4Q5NA 2WRTA 2LRNA 1SL1B 5DAKB 1AAZA 7GSSA 3O76A 2O87A 1FG4A 4IJ3A 5IQYA 1WIKA 1T8EB 2H6ZA 3KTLA 3GTUB 3HXSA 1X5EA 3VI5A 3QDNA 4K7IA 3ZVJA 1GSUA 3MSZA 3UVTA 3CTGA 2MYGA 4GWRA 1DUGA 4ZILA 2P5QA 5B6NA 3GN3A 4FYCA 1UN2A 3FZ5A 1Z6MA 2X8CA 3VWVA 2JSZA 2PUKC 2RUFA 3ME8A 3TJKA 2C3TA 2FLSA 4Q5FA 4HU7A 4IN0A 2H76A 3UBKA 5LCZA 3UJ1A 2IPAA 3LGCA 3DD3A 4YAPA 2FA4A 4RI6A 3FHKA 5LD0A 4F9ZA 4BWQA 4MJBA 3L4NA 4JRRA 4IKHA 4EUYA 1ERWA 4KH7A 2B1KA 4TN8A 3PH9A 2ZNMA 1IYIA 3TJFA 1ZZYA 5B7CA 5CAXA 5J3RA 6GSWA 2LEGA 1JZRA 4N11A 5FHIA 1PKWA 4HU9A 2LKUA 5D96A 3D0ZA 2AJQB 1T1VA 2AAWA 3UVHA 1MEKA 4NMUA 5F0GA 2P0GA 3FRCA 4DSSB 4KAEA 1X5CA 3ZIJA 2C8UA 4AJ8A 4I8BA 2H73A 3IR4A 4I5QA 2GSTA 1X5DA 3FK8A 2DJKA 1AQWA 2I9HA 4HJ2A 4TVEA 3WT2A 1WWJA 3UARA 3DVXA 3HJOA 1NHYA 1ZGNA 3BCIA 2V6KA 5G5EA 1XVWA 2V6OA 3QMXA 4YQVA 4KDXA 1LBKA 1PL1A 2YWMA 4POBA 1RW1A 2I3YA 2R4VA 4MH3A 4KDYA 5HQPA 4G19A 4O92A 3IHQA 3TRQA 2O7KA 1JZOA 5EPFA 5E59A 1O7UA 4TR1A 3UOMA 3GSSA 2MMZA 20GSA 4ECBA 5D9XA 1JLVA 1ZMAA 2E2MA 2PWJA 3UAPA 4EKZA 1SD9A 4OMVA 3P90A 3VPTA 3D22A 5F06A 1FAAA 4WF5A 3LG6A 1OC8A 3M9KA 5AN1A 3DGQA 5B8AA 1YEPA 1YKCA 2B1LA 2IL3A 1JZWA 4ECIA 2H0IA 5IMCA 3TKSC 2IMEA 4AGSA 5CRWA 1SU9A 3EWLA 2MBSA 1BG5A 3LWAA 5IPHA 5H5SA 5AGYA 1TDIA 3G7YA 1OVNA 1KNGA 3N9JA 2L6DA 3BCKA 2FWFA 2DJ3A 4TR4A 5ELGA 5HFKA 5DJLA 3KZQA 2GQLA 2V2GA 4PNGA 4ECCA 1W4VA 1U88A 1NHOA 3TGZA 3LJRA 4JE1A 1GL8A 1MDKA 1GP1A 2XBQA 4XCSA 1RQMA 2YZHA 3GUSA 1PN9A 2E7PA 2I81A 4J57E 2LV3A 3TKRA 2OE1A 3I9V2 4ISDA 1J9BA 1MD4A 1QQ2A 4EDZA 1SK2A 4MABA 4D73A 1NM3A 4LL4B 2C80A 2XPDA 5KN0A 1QUWA 5JCUA 4ACSA 4XRAA 3APSA 1WPIA 1O6JA 1OC9B 4HQSA 6GSUA 2PU9C 1CQHA 2WULA 2F51A 2LNTA 2HSYA 4MK3A 3GKXA 4ZB8A 4MJAA 1FB6A 5JWQB 3U6VA 1S3AA 5AISA 4KSOA 2GQMA 2Z9SA 2VL2C 4MJCA 4P3YB 1WE0A 3US3A 5DCHA 1BQ7A 2GQKA 1K3YA 1ST9A 4QL7A 3TOTA 1AUCA 5COHA 1EV4A 5CO3A 2VAFA 4MPGA 1XPVA 1YZXA 5F8BA 3SWLA 4FO5A 1M0UA 2RIIA 4PUAA 3A5WA 1F2EA 2IFQA 5INYA 2VD1A 3CSHA 4DSQA 3F3QA 5IMFA 1K0CA 3WYWA 2J9HA 1VRSD 3VURA 5CRGA 2PVQA 3CRUA 1M2DA 2YWNA 3IDVA 3QFAC 1UC7A 2L4QA 2C0FA 4JR4A 5AIVA 2XPEA 1T4ZA 3P7XA 1K0BA 1UVZA 2VCXA 3EURA 3HJPA 1EP7A 4NHZA 4ZL9A 4AF2A 4V2MA 4WBRD 11GSA 2WCIA 5J9BA 4TRXA 2YNXA 1GTUA 3HKRA 5ECQB 2XC2A 3TDGA 4KA0A 4CHSA 5JCGA 1AQXA 3H1NA 1G0TA 3TKQA 1Y6EA 3RBTA 1M2BA 5ECOB 3TKSE 2FD3A 2GSSA 1FB0A 4F0BA 2HRNA 3I43A 1TK8B 1PX7A 2REMA 4MDCA 3TJJA 5FWGA 3A2VA 2B7KA 1TRWA 5KN1A 1O73A 4PX1A 3CMIA 1FHEA 2EIQA 5ECMB 3GNJA 5G5FA 1A24A 5JCWA 4PXOA 4POMA 2ON7A 1RK4A 5A4WA 1K0OA 2VCWA 4IJIA 4ZBBA 5ECPB 2WGRA 3QAGA 3D4MA 4J2FA 3KMOA 3DWVA 1WP0A 1Y25A 2VCVA 2YV7A 2HSHA 3VPQA 3U5RE 4XS4B 4Q5QA 3W6GA 5J4UA 3ZL5A 4N30A 4LMWA 1THXA 4ID0A 1VF4A 2BJXA 2FCHA 1HD2A 5CREA 5HR3A 1Z6NA 1E2YA 3EMXA 1T3BA 5D8IA 4KUNA 2VIMA 1T4YA 3F63A 2JZRA 2PVOC 4K9ZA 5F07A 4E8HA 4DEJA 4POLA 1GUHA 1M7TA 1VF1A 2GZYA 5ID2A 1TP9A 2AHEA 1PD21 5ABRA 2LS5A 4RQRA 2C3QA 1PGTA 4I2UA 13GSA 2IWTA 3UMAA 2GLRA 4ML1A 4MF5A 2B7JA 5L71A 2DSAA 1U3AA 1JFUA 5J41A 1B4QA 3FEUA 4HQZA 3DYRA 2IN3A 1F3BA 1A8YA 4IHUA 3IXRA 1PL2A 4FIWA 4YAVA 4HDEA 2AYTA 3TRXA 2GVPA 5A4VA 4GSTA 2PBJA 3MDKA 3DKSA 3MNGA 3IC4A 1AQVA 3I69A 4ZBDA 4POKA 2K8SA 2PMTA 1EOGA 5HFGA 1G6WA 2H01A 1H75A 1HNBA 4OFTA 3W8JA 1THOA 3LYKA 3KXOA 1PA3A 1SENA 3CRTA 1Z7RA 2HFDA 4AJ6A 4X1UA 5G1KA 5E4WA 4ZL7A 2R2JA 2GTUA 3IPZA 3L0HA 2WDUA 1Z7PA 3ERWA 1T00A 5IMZA 3ZVJD 1ZL9A 3LEFA 1HNAA 1GLPA 1YEXA 1DSBA 2YOIA 1AIUA 3GFKA 4OCFA 5GSTA 2H72A 3GKMA 5C00A 1B4PA 3IK9A 1TK0B 2KLXA 3HVVA 2C0DA 1EWXA 4TXVA 3GL5A 5KN2A 4G10A 4KDUA 2ALBA 4IBPA 4BL7A 3EMPA 1IYHA 1EV9A 3TRPA 1ZCPA 1MTCA 4TR1B 2B5EA 4JU5A 2CA8A 1TTZA 4WXTA 1ERUA 4IGJA 4YQMA 3FR6A 4F03A 1PMTA 5DAKA 1Q4JA 4F0CA 1Q98A 2VCZA 5B6MA 2YPMA 2QC7A 3GTUA 2VLUA 4GSSA 2FUG2 5B8BA 5ECNB 1YKAA 2L57A 3LQ7A 2E2GA 1I9DA 2VM1A 1TI1A 2D2ZA 1HNCA 4HI7A 2WS2A 3KIJA 1BYEA 2HYXA 1G7EA 1G6YA 5IMVA 2DJJA 4OO5A 4L0WA 4XS6A 4MZBA 5JWRB 3RHBA 1GRXA 1A0FA 3GKKA 3V1WA 3ME7A 4TKYA 4LLRA 3FZ4A 3QCPA 5CRDA 3ZIVA 4FYBA 4X0XA 1W89A 1KEBA 1GNEA 4FYUA 1WOUA 3KCMA 4BVXA 5D9VA 1M2AA 3A2WA 1JHBA 1WRYA 2DJ2A 2CX4A 4IELA 3Q18A 3KJYA 1TJDA 2H19A 5CP1A 2LJRA 3F6FA 3L9VA 1OKTA 2QKEA 5G1LA 1SYXA 3GH9A 4BWSA 2JL4A 4F82A 2F8AA 2MMNA 3UEMA 5D9WA 3WGXA 3F9UA 3HZ8A 2ZCTA 4DSSA 3N5OA 3D4TA 3HDCA 2B3SA 2JADA 4PUFC 3IAM2 4IP1A 2BMXA 2VCTA 2GGTA 3IBHA 3M0FA 2OADA 6GSTA 1XW9A 1FVJA 2NVLA 1B8XA 1XW6A 3WGDA 4EE0A 2OE3A 4MZCA 3UBLA 3G9BA 3C73A 4ECJA 3BBYA 2JZTA 2N5AA 1A0RP 3EYTA 1ERTA 3HZ4A 1MDIA 3C1SA 1XWBA 3GKNA 3D21A 2CVBA 2X8GA 3VI7A 4MF6A 1ZYQB 2R3XA 3KH7A 4G2EA 3APQA 1XCCA 4KNDA 4FH8A 1K3OA 4IVFA 4K2DA 2CVDA 3GYKA 5DQYA 3KP8A 3J7Yb 1XFLA 5D73A 5CRHA 4N0VA 3M9JA 4KB3A 2CAQA 3F0IA 4KE3A 3QAVA 3LXZA 2HZFA 3F4TA 3RPPA 4ZIJA 2JSYA 3DMLA 5CYYA 1X0RA 4K0GA 1K3LA 1N8JA 4GXZA 2DIYA 2AV4A 3ZRDA 1SKSB 4TXOB 2JU5A 1EGRA 2HZEB 2F8FA 1GULA 2HI7A 4GLTA 3C71A 3Q74A 3OR5A 3W8SA 3IRAA 1FOVA 5HFIA 2A4VA 2IMIA 2L6CA 5GAPD 5ECSA 5EL8A 3L9SA 4OO4A 3HVXA 2C3NA 4V2LA 1XWGA 2EIRA 6GSVA 1TXXA 3GURA 4IS0A 1ZOFA 2ON5A 4WEYA 2TIRA 2ZUPA 4HJMA 1F9MA 2LQQA 1PKZA 4BPYA 3IK7A 2K8VA 3H4KA 5DVBA 2FY6A 3ISOA 2WFCA 2YWOA 1OC9A 1EEMA 2GSQA 2WB9A 3GX0A 5DDLA 3I6AA 5DALB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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