3TJJA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c245a mutant in sulfenylated form
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
167
structure length
166
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 59
structure length 166
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjjA00
4K6XA 2YNXA 4F2IA 6GSYA 4XHMA 2H6YA 3D22A 3UJ1A 3H93A 5DQSA 1PRXA 4I2UA 4PURA 4Q5NA 1PX7A 4X0XA 4BPYA 5G2ZA 5A4VA 3I69A 3GKMA 5HR2A 2GQKA 3F6FA 16GSA 1EEMA 4OCFA 5CAXA 2H76A 1S3AA 2WFCA 4ZB6A 5HFGA 4POMA 4DEJA 1GSYA 2L6DA 2YCDA 4TR4A 4EE0A 1FVKA 1K3YA 4GTUA 1TKDB 4K7OA 4I97A 2VL9A 4KSOA 3D6IA 3IK7A 2CVDA 4MZWA 3CSHA 3A5WA 1URMA 4IGJA 4L5OA 1X0RA 2LRNA 4YQVA 1TRWA 5KEJA 3IAS2 3WT2A 1O8XA 3QD9A 4J2FA 2KP2A 2DBCA 3GURA 3M8NA 5KN3A 2H01A 5DJMA 1GNWA 1H75A 1K0DA 1MDIA 3MDKA 1A0RP 1ERTA 4OD7A 4O7HA 5CO3A 4WBRD 3EC3A 3IOSA 2YWIA 1LU4A 5D8IA 4TR3A 1AC1A 3C73A 5GSTA 5DALA 1G0TA 2L4QA 3F4TA 2V32A 3CRTA 2I4AA 5COHA 1OE8A 1GRXA 1FB6A 4XS4B 4WR4A 5J9BA 4OFNA 1PKZA 2GDRA 3ZZXA 4MH2A 3IV4A 1T4YA 5EY6A 1WWJA 2YWOA 1XVQA 1NW2A 2N5FA 1WIKA 3HXSA 3FW2A 4TRXA 4FYBA 4K0GA 3HDCA 4OMVA 3BD2A 2C1YA 5LNKe 2GS3A 1EZKA 4P3YB 4JR4A 5ENUA 3HA9A 4PGTA 4MABA 2X8GA 4F9ZA 4ZBAA 1TRSA 3EVIA 4JU5A 3KMOA 4MPFA 1G7OA 5DAKA 2VLTA 4HU9A 3ERWA 4J57E 2YWNA 2ZCTA 3HVSA 2DJJA 2V1MA 3ZMLA 3K8NA 2F9SA 2FHEA 2WGRA 3GL3A 4HJMA 4ZB8A 4I5QA 3KMNA 1XW5A 4E8HA 2IN3A 4TVEA 3TRPA 2VCQA 2HZFA 1Y25A 4FIWA 5AIXA 4JRRA 2IIYA 4F0CA 2LQQA 4FH8A 4JR6A 4ZL7A 1M2BA 2FWEA 2FA8A 1XXUA 2F8AA 2YJHA 3ZL5A 5J3RA 3G7JA 1PQNA 6GSSA 2DSAA 3GH6A 2DJ2A 1GWCA 1SK0A 2C3NA 4CDOA 2HSYA 2H6ZA 3KTLA 2GSRA 3TDGA 3O3TA 1CQGA 1XW6A 4IVFA 2LJAA 1ZGNA 2OJLA 4G10A 4RI7A 2FA4A 4ECCA 2MMOA 3CTGA 2LQOA 4G2EA 4MPGA 3Q18A 1EGRA 2LTKA 4AGSA 1HNAA 2DIYA 5G1LA 5H5SA 3M9KA 4TR1B 2YN1A 3ISOA 5KN2A 3PGTA 1V57A 3H79A 4XRDA 3MNGA 2F3MA 2I1UA 3A2VA 2WJUA 5DCGA 5D9XA 2GLRA 1V9WA 5JCGA 3IAM2 4PNFA 4PQ1A 3L9SA 4O92A 5AIVA 3P7XA 3TOUA 3FEUA 1W4VA 1XFLA 2FWFA 1RQMA 1GSDA 1TK5B 1SJIA 4RI6A 4MF6A 3V1WA 1QGVA 1B4QA 5FWGA 2H1GA 5DJLA 1V2AA 2IMDA 4DSSB 1Z7RA 1ON4A 4MJCA 4POKA 5D73A 2LUSA 5GAND 4BVYA 5CRWA 4K7NA 1SD8A 3HJMA 2LEGA 4RQRA 2L57A 1JZRA 4O5RA 5IQYA 5ECPB 1K3LA 2IMEA 2G2QA 2H72A 3G9BA 1FVJA 1AUCA 3D5JA 4K2DA 1XW9A 3QOUA 2GZPA 4LA1A 1AQWA 4ML1A 3L0HA 2QGVA 2C8UA 3TKSE 5A4UA 5ECIB 4EL1A 3FHKA 4PQIA 4V2LA 2D2ZA 3RHCA 1ZZYA 1VF2A 3IBHA 1PL1A 2CX3A 5C00A 3US3A 1U6TA 2VL2C 2PPTA 2V6KA 3D4TA 3ERGA 3LG6A 3HKRA 1SK2A 3GN3A 2WZ9A 3NOFA 3KJYA 2JADA 3DMLA 1PN9A 1JHBA 4EF0A 3NIVA 3ME7A 4HEA2 4JBBA 3HYPA 1F2EA 3HCZA 3IC4A 1TK0B 1B48A 5ECOB 1R5AA 2LJKA 1UC7A 4MLYA 4L8EA 3F4SA 2VCVA 1TU7A 2R6KA 2TRXA 3KZQA 4BVXA 3GKKA 3RPPA 2LNTA 2H0HA 5JWOB 1XOAA 2YZHA 3EMXA 1LJRA 2RIIA 1PL2A 1YY7A 2OBIA 2VCTA 4N0VA 2VAFA 1VF3A 5ECQB 2HRNA 3MAKA 3HVXA 2O87A 2JZSA 3NZNA 4ILFA 3Q74A 4KSMA 1GTBA 2L6CA 6GSTA 3CSIA 2VUPA 3UIWA 3EE2A 1QXHA 3DYRA 2OBKA 3RBTA 2DC5A 2R3XA 3W6GA 4FYCA 1ZL9A 4PNGA 2PERA 1TXXA 5HFKA 1GSEA 1XWCA 4IP6A 5JWRB 2FD3A 3E3EA 4Q5RA 5HR3A 3LFLA 2H1DA 2WS2A 2IFQA 4WKWA 2CVBA 1JFUA 2GSTA 5INYA 3VLNA 5AISA 1WJKA 2L4CA 3GA4A 2HE3A 3DIEA 3A2WA 1XPVA 5ABRA 2VM1A 4HQSA 3KEBA 5DCHA 3EYTA 3KP8A 2VM2A 2L5LA 4KAEA 1OKTA 5CRHA 5KN1A 4YAPA 3WYWA 4GSTA 2AHEA 5GZZB 4NV2A 3ZVJD 2JZTA 1F3AA 5LD0A 5KN0A 2QSIA 2KLXA 1TTZA 2DIZA 2GTUA 3FR6A 3QCPA 2N5BA 3S9FA 2CAQA 4N10A 1UVZA 1PMTA 5ID2A 2RM5A 2B5EA 3GL5A 4NHWA 5DDLA 4X1UA 1S3DA 5IMDA 1Z3EA 4GWRA 5ELAA 1M99A 5IM9A 4JEDA 3FKFA 1OAZA 7GSSA 1GL8A 4HOJA 3LQ7A 5IO0A 1M2AA 2R4VA 1M2DA 1F3BA 3DXBA 5F0GA 1XWBA 4V1Ap 2M46A 1KNGA 4V2MA 1UN2A 2B1LA 4PXOA 1WPIA 4N0ZA 3HHVA 4ID0A 2H6XA 1SYXA 3VI5A 2LKUA 1GUHA 1M9AA 2H8LA 3M3MA 3MWHA 1OYJA 4K8MA 3TKQA 2YZUA 2YOIA 4ZBDA 3VK9A 4KB3A 5DBQA 2M80A 1V58A 3ZFBA 3M1GA 1J08A 4V1Ag 1K3OA 1VGLA 1KTEA 1HNBA 5IMFA 2GT6A 2VD1A 3BCIA 4EVMA 3P90A 2LRTA 3KTBA 4IELA 2VCZA 1DSBA 4FO5A 3AY8A 2QC7A 6GSXA 2B7KA 1EV9A 2VCWA 1A8YA 1M0UA 2E0QA 1W89A 2A2SA 4GRFA 1FB0A 3IR4A 1Z5YE 4ZL9A 4GXZA 2EIQA 3QFBC 4OO5A 3WT1A 4OFTA 1SKSB 1SJZA 4KA0A 2H73A 4MF7A 4MJBA 1AQVA 1GULA 4PUFC 3ZLPA 2VLVA 3L78A 3UOMA 5ECMB 3DVWA 4RQXA 3UBKA 1ML6A 4K0NA 2MBTA 4IBPA 3F9UA 1GH2A 1WE0A 1BAYA 4MDCA 1T7PB 2ES7A 4TXOB 2FWGA 4V2NA 2IMFA 1X9MB 1O6JA 1K0CA 3N9JA 3CMIA 5ECKB 5IMVA 3C8EA 1T00A 3FR9A 2VL2A 2KHPA 4IJ3A 6GSVA 1OC3A 2H74A 4OFMA 1N8JA 4HQZA 3UVHA 1JZDA 2ZNMA 3LJRA 2X8CA 14GSA 2JZRA 5F8BA 1VF1A 5ECHB 6GSWA 1IYIA 2H75A 3CXGA 5F07A 4TOPA 1AXDA 2F51A 4XS4A 1TOFA 2HZEB 2NBSA 1OC8A 2PU9C 4LMWA 3UEMA 3CBUA 1SKWB 3BCKA 1FW1A 5JCUA 2MZCA 3VWWA 2C4JA 4WXTA 2P5QA 1TK8B 1KBNA 2NTOA 3ZIJA 5GAPD 3EWLA 1BYEA 2XBIA 3APOA 3GH9A 4JE1A 4GSSA 4WBJA 1JLWA 3P2AA 5IPGA 10GSA 18GSA 1GSQA 3GTUB 4WF4A 1K0NA 3KP9A 1MD3A 1Z9HA 4MZBA 1Z7PA 2DMLA 1O7UA 1X9SB 2A2RA 2KOKA 1BQ7A 2HZEA 4O32A 1OKDA 1ST9A 5IO2A 2EIRA 2WCIA 2MMZA 1F6MC 1S3CA 3OR5A 4XS1A 2I81A 1K0BA 2B5XA 3F63A 5D96A 1SK1A 2XBQA 4YAVA 4HZ4A 1XBSA 1TI1A 1SJ6A 3ZTLA 3LYKA 1YEPA 3TJGA 2LV3A 2DJ0A 1F9MA 1YEXA 1YF1A 2HRFA 2BMXA 4DVCA 2J23A 2AJQB 1TJDA 4IN0A 5CP1A 1GTUA 3BBYA 1ERUA 3I9V2 2H30A 2I9HA 3L9VA 2C3QA 4NHZA 5HFIA 4DSQA 4EC0A 3GKXA 4YH2A 1M7TA 1USBA 2AB6A 4EDZA 4HDEA 1OC9B 1EGOA 2OA7A 1EP8A 4ECJA 3HD5A 3TCOA 4L0UA 5L71A 1E6BA 3ZRDA 1ZCPA 1PKWA 4D73B 2B3SA 2TIRA 3BOAA 4HJ2A 1O8WA 1QQ2A 3VURA 1EEJA 2LNSA 2VOCA 3SWLA 3TJKA 2B7JA 2JSYA 3EINA 1JZOA 4TR1A 1MDKA 4WR5A 4KCEA 3D4MA 4GQCA 1PD21 2P5RA 2NDOA 1V98A 4BWQA 2C0EA 2IL3A 1KEBA 3GHAA 1BX9A 2PWJA 4IS0A 1UA5A 3D0ZA 2G0FA 4X43A 4ZXGA 4N11A 2H70A 4POLA 3FZ9A 2GQMA 3L4NA 3Q19A 5B8BA 3DEXA 1O81A 3WGXA 1ZYEA 2FY6A 4HI7A 1EV4A 5DVBA 1R4WA 2RUFA 2GGTA 2AV4A 1Q4JA 3IK9A 5E59A 4DSSA 2LRCA 2P31A 2H19A 4XS6A 4QL7A 1YKAA 4MA9A 2CX4A 1T4ZA 1PA3A 4XRAA 1MEKA 2ON7A 5IOWA 2F8FA 4GSNA 3HY2A 5IMCA 3O76A 3TOTA 1G6YA 3EU4A 8GSSA 4AJ6A 2OE0A 3KD0A 1SD9A 1K0AA 4RUVA 2HSHA 4EXJA 4KDYA 4HU7A 2RLIA 4GCIA 1QMVA 2L59A 3VFIA 3FZ4A 5AGYA 2MYGA 2CVKA 2AYTA 1ABAA 17GSA 2NPBA 3G7YA 3GMFA 3JCML 3CYNA 4PQHA 1R26A 2IPAA 1YQ1A 1I9DA 1T8EB 2OADA 4IKHA 1MTCA 2H1AA 1N2AA 3ED3A 1JLVA 4LLRA 2XC2A 3DVXA 1WMJA 3O6TA 2YV7A 1R7HA 4MF5A 2E2GA 4ECIA 2JACA 1EP7A 2OKAA 4HZ2A 3U5RE 2HXKA 4KCAA 3RPNA 3I6AA 5ELGA 2YP6A 1ZMAA 3QAVA 3H1NA 1XWAA 4YQMA 1ERWA 1A23A 1X5CA 5FHIA 4ZIJA 3ZREA 3DRNA 1SU9A 4TKYA 4N30A 3TGZA 1A8LA 3QMXA 1B4PA 1XOBA 3RHBA 3H8QA 4MP4A 3HZ4A 2H0GA 2REMA 4I8BA 2WRTA 4IQAA 4I6XA 1PGTA 2LJRA 4TR0A 3GRXA 4CW9A 1Y6EA 3I43A 4K9ZA 3LSZA 1YDKA 3QDNA 3VPTA 4KGIA 4G9HA 5B6MA 4KUNA 3GV1A 2M72A 1DE2A 2WDUA 2K8SA 3TJFA 2O89A 2KP1A 4ZL8A 1TDIA 5EPFA 2H66A 2PGTA 1R5PA 3C1SA 3F6DA 3WD6A 3DWVA 2B6MA 1V40A 4HS1A 3ME8A 2A4VA 3GYKA 2V2GA 2VIMA 5H5QA 3P8WA 1QK8A 2FGXA 1DUGA 1TRVA 5HQPA 1J0FA 3H4KA 6GSUA 4GLTA 3GSSA 2XHFA 2GVPA 2VD0A 1TP9A 1GSFA 3APSA 3F3QA 3TUEA 4KH7A 4POBA 5G1KA 4NXIA 5J4UA 2KUCA 5JCWA 2X64A 2HNLA 1U3IA 2H1BA 1X5DA 2DJKA 2X8HA 3FR3A 5ECLB 2WB9A 2RM6A 3KGKA 3TRXA 4OCEA 4JZQA 1ERVA 3RDWA 1GTAA 2DJ3A 4G19A 3QFAC 4BWSA 2DLXA 5E4WA 3KH7A 4LL1B 1HQOA 2XPDA 1WRYA 2C0DA 4K1FA 5HR1A 3LWAA 1FHEA 2I3YA 3GSTA 2HYXA 3LEFA 3A2XA 4Q5QA 3KM6A 3M0FA 20GSA 3F4RA 3CTFA 3SBCA 5ECSA 1BEDA 3E9JB 3W8SA 1GSSA 5EVOA 5DALB 2R37A 4WEYA 1E2YA 1QUWA 5EL8A 5B6NA 5IPHA 2CV4A 3ZIVA 1ZYQB 3VWVA 2BJXA 1LBKA 1U88A 1G7EA 5B7CA 3UVTA 1GP1A 1YJ6A 2K9FA 5ECRB 5CNWA 2X99A 3LYPA 4IJIA 1X5EA 1PX6A 1K0MA 1Z6NA 4KDUA 5FT3A 3TJBA 3Q6OA 2H0IA 1GUMA 2V6OA 1TU8A 2LS5A 3UARA 4BA7A 1FOVA 4OWYA 1GLPA 2PVQA 1T3BA 3C1RA 3IDVA 2E2MA 2R2JA 1U87A 1XZOA 1O73A 4WETA 5D9WA 5F06A 4YQUA 1TW9A 5D9VA 1GSUA 3FYGA 3TKRA 2O85A 1NHYA 3BJ5A 3TKSC 3G7IA 4IW9A 5DAKB 3UBLA 4FYUA 4NV5A 4EUYA 3RAZA 1O85A 3EU3A 1SENA 2DJ1A 3F0IA 4TXOA 1A0FA 1GTIA 3D21A 1VRSD 4CHSA 1FG4A 1I5GA 1X9WB 3CSJA 1CQHA 2ALBA 1BG5A 5G30A 3PINA 3QAGA 4TW5A 5C04A 1J9BA 2OE3A 1EWXA 1AW9A 4ZBBA 3GIXA 3QR6A 3FY7A 5GSSA 1SKRB 13GSA 2IMKA 2VLUA 2V41A 5CREA 2IMIA 5HR0A 2LSTA 4ISDA 4AJ8A 1ZOFA 4NAXA 2PN8A 12GSA 1Z6MA 4NWYA 2PVOC 2K8VA 3U6VA 4H86A 1F37A 4TN8A 2HI7A 2IWTA 2YV9A 1A2LA 5A4WA 1A2MA 3FK8A 1TRUA 1Q98A 2OACA 2O7KA 3A3TA 1BJXA 3PR8A 4ML6A 3HJOA 2H71A 2CQ9A 1SL0B 4J56E 1YZXA 5G5FA 2FUG2 2YJ7A 3GX0A 2TRCP 4EDYA 5A5KA 3GTUA 1SL2B 4F82A 1NHOA 1VF4A 4L0WA 3KIJA 1WOUA 2Z9SA 3L9UA 2ZUPA 1GUKA 3WGDA 4HUAA 2JSZA 4EO3A 1A2JA 4MK3A 1A24A 4PUAA 3IHQA 11GSA 2ON5A 1C72A 1SL1B 5J9CA 3APQA 2GZYA 1RK4A 3IPZA 5B8AA 2J9HA 4MMMA 4KNDA 4OO4A 1GLQA 3FZ5A 3ZITA 4AJ7A 3IA1A 3QAWA 5F05A 3N5OA 3DKSA 4F0BA 2XPEA 5CRGA 3HJPA 4IQ1A 4MZCA 4IHUA 5G5EA 3IXRA 3LORA 4KX4A 3DGQA 4MJAA 1MDJA 2C0FA 2C0GA 5DQYA 2CT6A 2O8VB 1OC9A 1DBYA 2HFDA 2N5AA 2MMNA 4LL4B 1SYRA 2P0GA 4ULXA 4PX1A 1NM3A 1AAZA 2B1KA 4IP1A 3CRUA 3M9JA 4D73A 2BTOT 5D93A 4MCUA 3ZYWA 2VL3A 3E0UA 1B9XC 2B5YA 3VI7A 1DE1A 4Z7XA 5J5NA 3UMAA 2C3TA 1YKCA 2CZ3A 4K7IA 22GSA 9GSSA 2MBSA 2CAIA 1B9YC 3ZFLA 2E7PA 1THXA 5IMZA 4LMVA 2K18A 1RW1A 3KCMA 1XVWA 2FLSA 2YANA 2DMMA 1U3AA 5J41A 1K0OA 2CZ2A 4MJEA 2GQLA 3HZ8A 3LXZA 1XCCA 3R2QA 4NPBA 5G31A 2CA8A 3QPMA 3J7Yb 1JZWA 3W8JA 3VPQA 3ZVJA 4KE3A 1T1VA 5IIZA 4E8EA 3ZMKA 3C71A 1NSWA 4L5LA 4ECBA 1QFNA 2PUKC 3EMPA 5AN1A 19GSA 2EC4A 1HNCA 3TRQA 1ILOA 1XWGA 3HVVA 3FRCA 3ERFA 3GKNA 1TI3A 2IFQB 4AF2A 1EOGA 2GSQA 3MSZA 2YWMA 3GX8A 3TKSA 3IRAA 1H4OA 2EIOA 3GUSA 3WGEA 4GF0A 4WF5A 3TKPA 4QQ7A 4MH3A 4ACSA 3IE3A 4KDXA 3GFKA 4I2TA 5IOXA 3PH9A 1IYHA 2GZZA 2YPMA 3LGCA 3VWXA 4NMUA 2RUEA 3UL3A 1XWKA 2FCHA 2PBJA 5H5RA 2NVLA 5CRDA 1GNEA 3LXTA 4DSRA 2AAWA 5ID2B 2AUVA 1MD4A 3TB2A 3VWUA 1YF0A 5CYYA 5JWQB 1AIUA 1G6WA 1B8XA 1PSQA 2HLSA 3KH9A 1FAAA 2HT9A 2FWHA 2C80A 4XCSA 4QL9A 3UAPA 2GSSA 4XIHA 5LCZA 2IJYA 1HYUA 1EOHA 2L5OA 5IMAA 3DD3A 4GQFA 5ECNB 3F3RA 4BL7A 3FZAA 2OE1A 1THOA 1XIYA 3J7Yk 3EURA 1ACVA 1HD2A 4ZILA 2FNOA 2WULA 3TJJA 5D9TA 4Q5FA 4ZB9A 2JL4A 2MMAA 3C7MA 4F03A 1OVNA 3F8UA 2GT5A 4TXVA 3GNJA 2PMTA 4KW6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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