3TJK | Genus

Total Genus 64

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	64
sequence length	195
structure length	195
Chain Sequence	LHLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVAPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Peroxiredoxin-4
publication title	Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	64
structure length	195
sequence length	195
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2011-08-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3tjkA00

3TOTA 1H4OA 1YDKA 1EP8A 5EPFA 3MSZA 2H1GA 2B7KA 4Z7XA 2VUPA 2E2MA 2GSRA 2EIQA 2HE3A 4K7NA 2OE3A 2V6OA 1VF3A 2BMXA 4F03A 4TVEA 4GSNA 1K0DA 1T7PB 2P0GA 2IMKA 2X8GA 5DALA 3QD9A 1B9YC 2OBIA 1YF1A 2MMNA 4K7IA 6GSSA 4MP4A 1YEPA 2N5BA 4L8EA 1DSBA 2HLSA 18GSA 3LYPA 1GH2A 1THXA 4ECIA 1YY7A 2YWOA 4HJ2A 3JCML 3UOMA 3TKSE 5G30A 1WRYA 2FA4A 4F82A 4I6XA 3I43A 3ZIJA 2N5FA 3M1GA 1PX7A 1OC9B 1T4ZA 5G5FA 3G9BA 1ERUA 3TKSC 1SENA 7GSSA 4O32A 3F0IA 5AIVA 2V41A 3UJ1A 1JLVA 3GFKA 4Q5RA 4RUVA 1F9MA 5IMVA 4BVYA 2NDOA 3GSSA 2GZPA 3TJBA 3FR3A 2CVKA 4WBRD 4NHWA 2BTOT 4J2FA 3UVTA 5IMZA 3E9JB 4WKWA 3HVSA 3UBKA 3KTBA 4HZ2A 4EF0A 1ABAA 1H75A 3APSA 3HYPA 2RIIA 1JZDA 3LFLA 2H6XA 6GSYA 5D9TA 3Q18A 3FZ4A 4JRRA 4E8EA 3VPTA 1PA3A 1FHEA 4ECBA 4JBBA 3GURA 4IS0A 3G7YA 4CDOA 8GSSA 3IA1A 2LQOA 3GTUB 2CX3A 4PGTA 2GSQA 2L57A 1IYHA 1TDIA 3RHBA 3DXBA 1BX9A 3VLNA 1ERVA 2ZCTA 1GL8A 4ZILA 1LJRA 1FW1A 4AJ6A 1NHYA 3VI7A 3IC4A 1ML6A 2G0FA 4NV2A 1PX6A 4AGSA 3LXZA 1TK0B 1ZCPA 3TJFA 1G6WA 3HDCA 1EEMA 1SK0A 1AUCA 4J57E 5CAXA 5J5NA 1JZWA 2X64A 1ZZYA 2YPMA 3FZ9A 4DEJA 3BBYA 4PURA 4F0BA 5CRDA 2K6VA 4POLA 2O89A 2VLVA 3UARA 2HRNA 5ECLB 1JLWA 3WD6A 4HU7A 2PU9C 3RPNA 4GF0A 1SYXA 3GIXA 5KN1A 2WB9A 3ZMKA 1PRXA 1M99A 4POBA 4MZWA 3US3A 3H8QA 4EXJA 1R4WA 3J7Yb 2KHPA 2CVBA 5ECKB 1TU7A 4ID0A 1U88A 2P5RA 4OFNA 3E0UA 1HYUA 1K0MA 3CBUA 3BOAA 2AV4A 2H0HA 4V2NA 3TRPA 5J9CA 3ME7A 4JU5A 4RI6A 4GRFA 2EC4A 3DD3A 2XBIA 1UVZA 4K6XA 5J3RA 2B6MA 5H5QA 3LSZA 1Y25A 4YAPA 3M9KA 1PKWA 4OCEA 4TKYA 1ON4A 3GKXA 2G2QA 4J56E 5ABRA 3TKSA 3UAPA 1F3AA 4K2DA 3KM6A 2L59A 3H93A 2MBTA 2B5XA 3FR6A 3HA9A 3I69A 5ECSA 3HVXA 4POKA 3NOFA 5CRGA 1PKZA 1E2YA 4HDEA 3MNGA 2V6KA 4DSRA 2CT6A 2B1LA 3CYNA 4EKZA 4HUAA 3M9JA 1V40A 2K8VA 3NZNA 4X0XA 2LRTA 3VURA 4HEA2 3WT1A 1X5CA 2VL2C 1AC1A 4YQUA 3S9FA 2EIRA 2FY6A 3GNJA 1M0UA 3UBLA 4KNDA 4XTSA 3CSJA 4KE3A 4FYCA 3IV4A 3D22A 3CRUA 4PX1A 1YKAA 2IMIA 4L5OA 5GSSA 5CNWA 2XHFA 2IMDA 2MMOA 3D4TA 1GLQA 4KDYA 4P3YB 22GSA 4ZBAA 3F9UA 4IN0A 4LMVA 5ELAA 3GHAA 20GSA 1K3OA 2WCIA 1XFLA 3ZFBA 2OACA 5DCGA 1V9WA 3VK9A 1AW9A 3UL3A 4QL7A 1GSUA 1BAYA 2GZZA 2O87A 5AIXA 5ECMB 5EVOA 3TKRA 3KMNA 4L0WA 4MH3A 3VWWA 3V1WA 5KN3A 2L6DA 3L9UA 2HZFA 3FW2A 2LNSA 2L4QA 5FWGA 2LJRA 1M2AA 2H70A 5IOXA 2OKAA 3ME8A 1YQ1A 3LJRA 1SJZA 4HJMA 3GL3A 3LXTA 4KB3A 2I9HA 2IWTA 4MDCA 5B8AA 2CAQA 4ML1A 1AQXA 4V2LA 2H1AA 4ILFA 1S3AA 2ON7A 3M3MA 1URMA 2YZUA 3TKQA 1G0TA 3KIJA 3MAKA 4IBPA 5LCZA 1XPVA 4BWQA 4BWSA 1GSYA 5IOWA 1VF1A 3D6IA 1O8WA 1X0RA 1WIKA 3CXGA 4HU9A 3UMAA 3HKRA 2L4CA 4MK3A 1B8XA 1XOAA 3EMPA 2TIRA 3QFAC 3TRXA 1CQHA 2PPTA 2C1YA 4DVCA 4D73B 1JHBA 3ZFLA 5IMAA 3APQA 3ERGA 1XWBA 2FNOA 1MEKA 3IE3A 5GAPD 1SD9A 1YF0A 5JCGA 3VPQA 2H74A 3EWLA 4FH8A 4XIHA 1TI1A 1GTIA 3EE2A 3RPPA 4G19A 3ZTLA 2O7KA 1G7OA 1MDIA 4PQIA 5JCUA 2R6KA 1TTZA 2GGTA 2NBSA 3U5RE 2I1UA 1HNCA 1R26A 3LG6A 4OFTA 3QDNA 3ZVJD 4CHSA 5EY6A 5F05A 3KP8A 4ZB9A 4LLRA 2VL2A 4KA0A 3SWLA 4KCEA 3C8EA 4IVFA 3KXOA 4TW5A 3O6TA 3LYKA 4Q5NA 1VGLA 1MTCA 2PUKC 4I2UA 2MMAA 2GSSA 1EWXA 5HFGA 4N0VA 4ZL8A 1X5DA 3PR8A 4KSOA 3IHQA 5ECRB 5D9WA 3F3QA 1OAZA 4MA9A 2WFCA 1Z7PA 3QPMA 2FCHA 5ECIB 4MJEA 1V57A 5JCWA 4MPFA 3KTLA 2HXKA 1EGRA 3HXSA 2WDUA 1OC8A 3CTFA 1A2LA 1O85A 3BCIA 3GX0A 3LQ7A 2CAIA 1LBKA 1A2MA 2NPBA 4IHUA 1EP7A 2X8CA 3UIWA 1SL1B 3LWAA 2WZ9A 4PNGA 3HZ4A 3H79A 3ZREA 11GSA 2D2ZA 2VCQA 1T8EB 2GDRA 1SKRB 1J08A 3Q74A 3ZMLA 2YCDA 2YV9A 1I9DA 4YAVA 5AGYA 3VFIA 3QAVA 1X5EA 2IFQB 3TJGA 2LNTA 4MABA 3IBHA 5GAND 2XBQA 2FLSA 3I6AA 1GUKA 3KD0A 2OBKA 1KEBA 3TGZA 1QXHA 2RUFA 3H4KA 5ECHB 1FAAA 4N11A 1MD4A 1A8YA 4TR0A 19GSA 1YKCA 1OC3A 2LRCA 1X9SB 2CX4A 4MF5A 2HZEB 1M9BA 3O76A 4XS4A 1E6BA 1LU4A 4G10A 4K7OA 3HJPA 4G9HA 4ZBBA 3KEBA 1WE0A 4BPYA 2PWJA 3CMIA 5C00A 1EV9A 4ZB6A 1TP9A 3RAZA 1NHOA 4ISDA 2YZHA 2GT5A 3P8WA 1N2AA 1BQ7A 1KBNA 3TB2A 5CRWA 3C71A 4HQZA 4KAEA 2IMEA 1FB6A 2F51A 3IK9A 2VL3A 1PN9A 5FT3A 2LEGA 5A5KA 2H6YA 4TXOA 2H8LA 1HNAA 1VF2A 4LMWA 2CVDA 5AN1A 3FHKA 2KP2A 4XRAA 4X43A 3OR5A 1I5GA 3P2AA 2H0IA 2REMA 1FVJA 2L6CA 1S3DA 1TU8A 4KUNA 14GSA 2V2GA 3LORA 6GSVA 2VCZA 3HVVA 4EE0A 2K18A 5D9VA 2HI7A 5HFKA 3ERWA 3IR4A 4OFMA 1RQMA 2E2GA 3WGDA 5H5RA 3F8UA 2F9SA 2LJKA 4OO4A 2IMFA 1ERWA 3M0FA 2VOCA 1XW9A 4GQFA 1TOFA 3D0ZA 2VL9A 1MDJA 3DEXA 2PMTA 3HCZA 2QSIA 4EL1A 4RQXA 1JZOA 3DRNA 1SKWB 4N10A 5ECPB 2R3XA 1GNWA 2DJ3A 2PVQA 5G5EA 1WOUA 1IYIA 4GWRA 1V2AA 2JACA 4LL4B 5ELGA 2PGTA 2H19A 4ZXGA 4QL9A 3F4SA 3ZYWA 5IQYA 4OMVA 1DUGA 6GSTA 4I2TA 4BL7A 5E59A 3DVXA 1AXDA 2YN1A 2IN3A 1S3CA 1TK8B 3G7IA 5DALB 2GS3A 4NWYA 3VWXA 2IL3A 5DJLA 16GSA 1XIYA 4NHZA 5DDLA 1K3LA 2VCVA 3TCOA 1SYRA 1GSSA 2R37A 1THOA 5G1LA 3FR9A 3HJMA 2FUG2 3HY2A 4ML6A 4BA7A 1V58A 1DE1A 3GYKA 3UVHA 3LEFA 1Z6NA 2H1DA 5DAKA 2DC5A 2OE0A 4ZB8A 5IM9A 4HS1A 1TXXA 3FZAA 1NW2A 4TR4A 4WR4A 3VWUA 1Z6MA 2WGRA 2H30A 1JFUA 4PUFC 3C73A 5LNKe 1Y6EA 4GTUA 2CQ9A 4OO5A 3RHCA 2AJQB 2V1MA 1EZKA 1KNGA 2O85A 4KSMA 2MYGA 2GQMA 2H76A 4EDZA 4FYUA 2YANA 3KH7A 1FG4A 5COHA 3DIEA 4TXOB 4XHMA 2RM6A 4KGIA 3HHVA 4LA1A 5INYA 2A2RA 3H1NA 1GNEA 5IO0A 1B48A 4MJBA 2DIZA 2YNXA 3A2VA 1ILOA 2M46A 2FA8A 1QGVA 5AISA 3D21A 1SJ6A 4NMUA 1R5AA 3IXRA 1GTBA 1A23A 1A8LA 3ZZXA 3IAM2 1M2BA 2JZTA 1Z9HA 2K8SA 5IMDA 1SD8A 1QUWA 2KLXA 3UEMA 3GKKA 5A4WA 2K9FA 4JE1A 2IPAA 1R5PA 3HZ8A 2WRTA 3J7Yk 1QFNA 1GWCA 1QQ2A 2H72A 1GTAA 2OADA 1MDKA 3KH9A 4TN8A 1EGOA 2C80A 3TKPA 4E8HA 1RK4A 1XW6A 2YOIA 2VCXA 1VF4A 1GSEA 3CRTA 1Z3EA 4POMA 1AQWA 1WWJA 1OKDA 2DSAA 3EMXA 2YJ7A 2DMLA 1USBA 4MPGA 5G31A 2NVLA 3EINA 3PINA 3NIVA 4AF2A 2RM5A 1ACVA 2HRFA 1OE8A 2H75A 1YZXA 2A4VA 5IIZA 1OE7A 4F2IA 2JL4A 5HR0A 1HNBA 4IJIA 4MF7A 1Q98A 2LS5A 2J9HA 6GSWA 1YJ6A 3FKFA 1J0FA 1XW5A 4I5QA 2LV3A 3GMFA 2B7JA 1G6YA 3DVWA 4ACSA 1XCCA 4XRDA 1FOVA 3U6VA 1YEXA 1AQVA 2WS2A 2I4AA 3CSHA 4MMMA 2VIMA 5KN0A 1A2JA 2ZNMA 4K0NA 1PD21 3ZLPA 4WEYA 1PGTA 1EOHA 3KP9A 4MCUA 5B8BA 2DJ1A 1XWCA 2KUCA 2VAFA 1F2EA 4GLTA 4EDYA 2QKEA 2JADA 4TRXA 2H6ZA 1WPIA 4WBJA 3FYGA 1OVNA 2LRNA 1GLPA 1M7TA 2MZCA 1TI3A 4WETA 5CRHA 1J9BA 1PL1A 5DVBA 1U6TA 1R7HA 1O81A 4RQRA 2GT6A 1W4VA 2F3MA 4JR6A 4IQAA 4YQVA 3LGCA 4ZIJA 5J41A 1SL0B 5IPHA 1GP1A 1Z5YE 3CTGA 4KCAA 6GSUA 1TW9A 1Z7RA 2JU5A 1F6MC 1SL2B 1XWKA 2GTUA 4JEDA 2PVOC 3M8NA 4IKHA 3N9JA 2B1KA 2JSZA 2LKUA 3DKSA 1TJDA 4O7HA 4ZL7A 1VRSD 5ECNB 2VD0A 1XWAA 4MJAA 1DE2A 1TRUA 1WMJA 1TK5B 3F3RA 5J9BA 3W8SA 3TJKA 3BCKA 4N0ZA 5JWOB 13GSA 2MBSA 1GSDA 1BYEA 1SKSB 5D9XA 4TXVA 2C0EA 2JZRA 1PMTA 3KZQA 3Q19A 3ZITA 1B4QA 2FD3A 5L71A 4TR3A 3F63A 2A2SA 2HNLA 4GCIA 3TRQA 3D4MA 4HI7A 3A3TA 4WXTA 4FIWA 2FGXA 2L5OA 4ZL9A 1WJKA 2H73A 3GX8A 5CYYA 2C0GA 3GUSA 2H1BA 2XPEA 4NPBA 2XC2A 4PXOA 2KOKA 4TOPA 2F8AA 2EIOA 4PQHA 2B3SA 2AAWA 4HOJA 2DJ0A 5HR3A 3VI5A 1ZOFA 2GLRA 3GSTA 2DJ2A 5IMCA 2Z9SA 2C3QA 1OKTA 5D73A 3ISOA 2C0DA 2OA7A 1GRXA 1SU9A 2FWGA 1GUHA 3DWVA 2DBCA 3QOUA 2R4VA 2TRCP 3IPZA 4XCSA 5F0GA 2HFDA 4TR1A 2YV7A 3KJYA 3FEUA 5A4VA 6GSXA 4DSSA 4KW6A 2ZUPA 4PUAA 4EVMA 4PNFA 3SBCA 3MWHA 4HQSA 1KTEA 1K0BA 1ZL9A 3RBTA 3GRXA 3PH9A 1X9WB 5CREA 5GSTA 2C4JA 4XS1A 1PSQA 1U3AA 4GXZA 1DBYA 2LTKA 1F37A 3A5WA 1T4YA 3G7JA 1XVWA 3GA4A 3QAGA 1K3YA 4G2EA 3GL5A 5HQPA 1M9AA 2R2JA 5ECOB 2GSTA 2DMMA 1XOBA 4MF6A 4WR5A 2VLUA 3P7XA 1GSFA 5JWQB 2GZYA 5DJMA 1N8JA 3ZVJA 4YQMA 2LQQA 2OE1A 3QAWA 4FYBA 3PGTA 5ID2A 1K0OA 3VWVA 3FRCA 2H71A 1T00A 4LL1B 3BD2A 3RDWA 4KDXA 1GUMA 4CW9A 3TUEA 1NSWA 4O5RA 2ES7A 3IDVA 9GSSA 5LD0A 4OCFA 3K8NA 2WULA 3WGEA 3IOSA 5DBQA 2AYTA 4OWYA 1M2DA 1T3BA 4F9ZA 3Q6OA 4H86A 4BVXA 1ST9A 4V2MA 2I3YA 4KH7A 3DYRA 4DSQA 2VLTA 3QFBC 3QR6A 1UC7A 1EOGA 2CV4A 4NAXA 1FB0A 1O7UA 4NXIA 4EO3A 3EURA 4GSSA 4X1UA 2C8UA 3ZRDA 5G1KA 4I8BA 3F6FA 2VM1A 2B5EA 5EL8A 4IW9A 2FWFA 4IP1A 1XWGA 3DGQA 3HD5A 1O6JA 3F4TA 2PERA 1K0CA 1EEJA 12GSA 3L78A 1QK8A 4Q5FA 4MZBA 1TRVA 3L4NA 2J23A 1C72A 2F8FA 1FO5A 1XVQA 1XXUA 3FZ5A 2FWHA 2VD1A 2LUSA 1GTUA 2JSYA 2HSHA 5H5SA 2BJXA 5A4UA 3IAS2 4K9ZA 3E3EA 4XS4B 2YJHA 4D73A 2YWNA 4V1Ag 4ULXA 3EVIA 3C1SA 3AY8A 3A2XA 4V1Ap 2AB6A 2IIYA 4TR1B 3ZL5A 5HR2A 4KDUA 4DSSB 1GULA 1AAZA 3APOA 1TKDB 2H0GA 2VO4A 3DMLA 2MMZA 4PQ1A 2HSYA 5F8BA 1BJXA 5B6NA 3I9V2 3ERFA 1ZGNA 2WJUA 3GKNA 4JZQA 2B5YA 1Q4JA 2ON5A 1UA5A 3W8JA 1ZYEA 1SJIA 1FVKA 1NM3A 3FK8A 4XS6A 1WP0A 1SK1A 3GKMA 5IPGA 1A24A 3BJ5A 4ECJA 4MZCA 3TDGA 1QMVA 1U87A 2X8HA 3F6DA 5C04A 4K8MA 4FO5A 5D93A 2E0QA 1BEDA 2RUEA 3WGXA 1B9XC 3EYTA 5D8IA 1W89A 5IMFA 2HYXA 5ID2B 4Q5QA 10GSA 5GZZB 4K0GA 2N5AA 4EC0A 2KP1A 4AJ7A 5ECQB 4IQ1A 3ZIVA 1K0NA 4L5LA 2RLIA 1BG5A 2C3TA 1B4PA 3TJJA 2PBJA 2O8VB 1CQGA 2AHEA 5B6MA 2YWMA 4IP6A 2JZSA 1EV4A 3EU3A 2VCWA 3KGKA 1JZRA 1XZOA 2H66A 2CA8A 1HQOA 4NV5A 5KEJA 3FY7A 2LJAA 1XBSA 4HZ4A 4K1FA 3KCMA 1SK2A 1UN2A 2NTOA 5D96A 3EC3A 4MJCA 2IJYA 5G2ZA 1X9MB 4N30A 1T1VA 1A0FA 3IRAA 1PQNA 3C1RA 3WT2A 2TRXA 4IGJA 3GH9A 3EU4A 2M72A 2IFQA 3GH6A 5KN2A 2XPDA 1MD3A 1HD2A 2DIYA 4MLYA 5HR1A 2M80A 2YWIA 5B7CA 2V32A 2PN8A 5ENUA 2GVPA 2H01A 3MDKA 4F0CA 4QQ7A 5CP1A 4AJ8A 1ERTA 2I81A 5DAKB 4O92A 2VCTA 1O8XA 1OC9A 3ED3A 2C0FA 3N5OA 4OD7A 1V98A 3D5JA 5DQSA 5F07A 2HZEA 3C7MA 5DQYA 1OYJA 4WF5A 2AUVA 3P90A 4EUYA 3L9VA 3O3TA 3WYWA 3IK7A 3F4RA 4L0UA 1PL2A 2QC7A 4GQCA 2CZ2A 1TRWA 3L9SA 2L5LA 2GQKA 1AIUA 2CZ3A 5HFIA 4RI7A 2DLXA 17GSA 2X99A 5E4WA 1G7EA 2DJJA 3QMXA 1K0AA 4I97A 4KX4A 2OJLA 2P5QA 4IELA 3L0HA 4GSTA 5FHIA 1GSQA 4WF4A 2C3NA 3R2QA 4ECCA 4JR4A 4ZBDA 2QGVA 1RW1A 5DCHA 1TRSA 5F06A 5JWRB 4YH2A 5CO3A 3GTUA 1ZYQB 1ZMAA 1U3IA 3W6GA 3CSIA 5IO2A 2DJKA 2P31A 4IJ3A 2YP6A 3HJOA 3TOUA 2VM2A 4MH2A 5J4UA 2GQLA 2LSTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3TJKA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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