3TKPA

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 in the reduced form
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 67
structure length 197
sequence length 197
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tkpA00
4ZBAA 5ELGA 1X0RA 2KLXA 5E59A 5F8BA 5A4UA 4NV2A 1FO5A 3VWXA 2FCHA 4XS4A 4J57E 4NAXA 5ID2A 2H1GA 4PQIA 3BOAA 3IRAA 3BD2A 3PH9A 1A24A 2FWGA 2L57A 2XPEA 4DEJA 2NTOA 4KB3A 3IPZA 1T8EB 1X5EA 3AY8A 2O85A 4IBPA 2FLSA 3EYTA 1NHYA 2F9SA 3IV4A 12GSA 1U3AA 3BJ5A 5H5QA 3CYNA 3SWLA 3HCZA 4QL9A 4EE0A 5DALB 4HQSA 2VLUA 3E0UA 1YDKA 4AJ8A 1XZOA 2I81A 3IC4A 3UEMA 2VL2A 2XC2A 1XWBA 1G7EA 1ZYEA 3GNJA 5IMFA 3DKSA 3US3A 4EF0A 2CVBA 3UMAA 4K2DA 1OVNA 5F05A 2H66A 2X8CA 2YCDA 2HRNA 2J9HA 2FNOA 5IIZA 3HKRA 1Z9HA 4WETA 2FA4A 1Q4JA 3A3TA 3GTUA 1XWKA 2L4CA 4IJ3A 3Q19A 4K1FA 3D21A 4HEA2 2M80A 3LEFA 1PMTA 1X5DA 3HZ8A 1SL2B 1NW2A 1GLPA 3HJPA 3EWLA 1GSDA 2OE3A 2GS3A 5CP1A 1IYHA 5IO0A 4PGTA 1N8JA 2NPBA 3P2AA 4TR1A 4ECIA 2RM6A 1U87A 2C1YA 1A2MA 1YJ6A 4LL1B 2IMKA 7GSSA 4DSRA 1SK0A 4K9ZA 3KZQA 2IMIA 3WT2A 3APQA 22GSA 2L5LA 3MSZA 1SYXA 2K6VA 3C71A 4EKZA 3LSZA 3KXOA 4MLYA 2YP6A 3RAZA 4KH7A 2VM2A 3GA4A 2HZEB 3DEXA 1AAZA 1EEMA 1A0RP 3TKRA 2DJ2A 4ZB8A 3A5WA 3H93A 2KP2A 3HXSA 2H72A 1X9MB 5ECSA 1A8YA 4LA1A 1NSWA 2WRTA 5CNWA 2JSZA 2KUCA 4XCSA 3EU4A 4MK3A 2FD3A 2RM5A 4IELA 1YF1A 2IMEA 1QQ2A 1SKSB 1Z6MA 3RDWA 4I2UA 1KNGA 6GSVA 3CBUA 3HJOA 1Q98A 2HSYA 5B6MA 1HD2A 4G19A 3CSHA 4KSMA 6GSSA 6GSXA 1Z6NA 1B9XC 2XBIA 1GP1A 4K7IA 1R4WA 4NMUA 5AISA 3VPTA 1JZDA 1FOVA 2R37A 3KH7A 2I4AA 3C73A 1GUHA 4MP4A 3D5JA 2LJKA 2VIMA 4RI7A 3TRPA 1SKRB 4XRAA 3GKNA 2L5OA 5J41A 1I9DA 4RI6A 4IVFA 1XIYA 1TI3A 4GTUA 1GSFA 4QQ7A 2RUFA 1V57A 2G2QA 4IJIA 3C1SA 3GMFA 5DAKB 2MMOA 4JR4A 1VGLA 2H6YA 4XRDA 3GHAA 4RUVA 1XFLA 5GAPD 1I5GA 3VWWA 1BQ7A 5FWGA 4DSSA 2LNTA 4YAPA 2DSAA 3FHKA 3VK9A 3ZVJD 1GTBA 2B3SA 5GZZB 3TRXA 5CRWA 1KTEA 2JACA 2AUVA 1O73A 3GL3A 4PUAA 5COHA 4JRRA 4KAEA 1M0UA 1FB0A 2ZNMA 4MH2A 2FA8A 2HT9A 2PN8A 4ID0A 1KBNA 1ZL9A 3F63A 4H86A 2OBIA 3ME7A 3ZTLA 5C04A 2C3QA 4PURA 2GSTA 1VF2A 2LJAA 1M2AA 1ML6A 3ZL5A 3TDGA 2OADA 2LSTA 3M9KA 4BPYA 4YQVA 1TK5B 1TU7A 4GRFA 5A5KA 4L0UA 2PVQA 4ECBA 4HS1A 3Q74A 3TKQA 1EEJA 4JR6A 3WT1A 3RHCA 4NXIA 2JZTA 5D9VA 9GSSA 4AF2A 5ECRB 5DQSA 4POLA 3KP9A 3WYWA 1WIKA 5KN0A 1OC9B 2OE1A 1SD8A 2OACA 3QAVA 3VURA 3LYKA 3ZVJA 3IBHA 2WJUA 1ABAA 1HYUA 19GSA 4IS0A 2HFDA 4KDUA 3GSTA 5IMVA 6GSUA 3TCOA 2H8LA 4HZ4A 4ML6A 3LGCA 1GTAA 2AYTA 2DBCA 4D73B 3FKFA 3QR6A 2VCQA 1GWCA 5KN1A 3TKSA 2HLSA 2I3YA 2BJXA 1XW9A 4KE3A 3KTLA 1K0CA 4V2MA 4IP1A 2VD1A 3IXRA 2OA7A 1OAZA 1Y6EA 2KHPA 5D93A 3K8NA 4RQXA 2LNSA 1FVKA 2O89A 3ZMLA 1ERTA 3J7Yb 2XHFA 2H0HA 2GLRA 1E6BA 1F3BA 3ZZXA 4MJEA 3FZ9A 5GAND 2MBTA 3RPPA 3TRQA 2IL3A 5AIVA 3D22A 16GSA 2NBSA 3TB2A 2C0EA 1WMJA 5HFGA 3UJ1A 5IMCA 2TRXA 4DSQA 1QGVA 2YZHA 3ZIVA 1TTZA 2C8UA 3VI7A 1PA3A 2DLXA 4I6XA 3G7JA 1C72A 3KGKA 1F2EA 5DDLA 4X1UA 3FR3A 4AJ7A 2C3TA 2ZCTA 1A2LA 4I5QA 3CRUA 3L9VA 3GYKA 2HXKA 4GLTA 1DE1A 2C0FA 4QL7A 2TRCP 2QKEA 5LNKe 3HY2A 5FHIA 1M2BA 2IMFA 1ST9A 1QMVA 1M99A 1X5CA 2OJLA 4FH8A 1BJXA 1QUWA 5CO3A 1AW9A 3FYGA 3QPMA 4TW5A 1YEXA 2L59A 3I43A 4IKHA 3GL5A 2K18A 4TR3A 4Q5FA 1XPVA 3HVSA 4OCEA 3RBTA 2GDRA 3Q18A 4K7NA 1XXUA 1A23A 3GRXA 1URMA 4WBRD 5JCGA 2YN1A 5DCHA 1GNWA 2B7JA 5EVOA 2EIRA 2NDOA 2QSIA 2OBKA 3HVXA 3WGXA 2HZFA 1TRWA 1AUCA 2Z9SA 1J0FA 4J2FA 1LBKA 1BX9A 2F51A 1QFNA 2RUEA 4F9ZA 2V6KA 3TJBA 2YANA 1ACVA 1ILOA 3KEBA 5DALA 3PR8A 2H6ZA 3TGZA 3WD6A 1MD3A 8GSSA 1JLWA 5ID2B 5G1KA 18GSA 4MZBA 5H5SA 4KGIA 2CZ3A 3DWVA 3P90A 1GUKA 4NHWA 5JWQB 3MDKA 1K0DA 5LD0A 1E2YA 4DVCA 5GSSA 3F8UA 5GSTA 4OFMA 3N9JA 2H71A 2HYXA 2C0DA 3D4MA 2CX4A 4MA9A 3A2WA 4ZILA 1B9YC 2YV7A 3HA9A 1CQHA 2GQMA 3KMNA 5IOXA 4EXJA 1Z3EA 4ECCA 3HVVA 1JLVA 1S3DA 2WCIA 2DIYA 3FR6A 3A2VA 4L5LA 4ACSA 4MDCA 4AGSA 1FVJA 4MABA 2RLIA 3P8WA 3M1GA 4MJAA 3PGTA 1FB6A 14GSA 1V98A 1NM3A 4NWYA 1VF3A 4N11A 1PD21 4N0VA 5IPGA 3WGDA 4HJ2A 11GSA 1GSYA 3GX8A 5D73A 4G2EA 2IN3A 1PL2A 3TJGA 1YZXA 3ERWA 3D4TA 4LLRA 2LRTA 5EL8A 3LFLA 4HDEA 3EMXA 1UN2A 2FWHA 1EGOA 1PGTA 1FG4A 1F9MA 2O87A 4N0ZA 3V1WA 1GNEA 1J08A 1GTIA 5HFKA 1Z7RA 2XPDA 1XWGA 1ZMAA 4OO4A 4CDOA 2B6MA 2CVKA 3HDCA 1TDIA 2ON7A 3LWAA 3GKMA 5HR3A 2VD0A 4MH3A 2DIZA 2H6XA 1T00A 5CRGA 3EURA 2D2ZA 4KA0A 4MJCA 2IFQA 3FZAA 1XWCA 1JFUA 4LL4B 1DBYA 3G9BA 4EL1A 3QCPA 4FYCA 2LEGA 4PUFC 1G6YA 4TR4A 3HYPA 5IOWA 4V1Ag 2K8SA 4BVYA 3LYPA 5CYYA 5DQYA 1K0NA 4ZL8A 1GSEA 2LV3A 4G9HA 2AB6A 2G0FA 3ISOA 3F6DA 3M9JA 1PKWA 4TN8A 2H0IA 3W8SA 2K9FA 5DVBA 3UVHA 1Y25A 4MF7A 2ES7A 3FK8A 1G7OA 1Z5YE 1SK1A 2P0GA 2TIRA 1JZOA 2E2GA 4HZ2A 1EGRA 3P7XA 4P3YB 3APSA 3EINA 3APOA 2GQKA 1EWXA 3QOUA 3F4RA 1A0FA 1DSBA 2VCVA 5AIXA 1AIUA 5ECKB 2AV4A 5G31A 3GURA 3FEUA 1MDKA 2B7KA 3H1NA 1O81A 5DJMA 3H79A 5DAKA 3TJKA 2H76A 1FAAA 2OE0A 1X9WB 4E8EA 4RQRA 4JBBA 5IO2A 1OC3A 2K8VA 2IWTA 1IYIA 1HNCA 2H70A 3UARA 1V58A 1SKWB 3QD9A 3EMPA 1B48A 4GQCA 2VCWA 1WPIA 3IK7A 2CVDA 5INYA 1M7TA 2X8GA 2MMNA 2PWJA 1BEDA 1T7PB 2LJRA 2X99A 2EIOA 1TOFA 2GZZA 3KH9A 1NHOA 3U6VA 2H73A 2B1KA 1K3LA 3GKKA 4EDZA 1N2AA 4GQFA 3ZLPA 1G0TA 2ALBA 4BA7A 2AHEA 3O3TA 2X64A 5HR1A 3KP8A 1TU8A 1GL8A 1S3CA 4OWYA 4HOJA 2DJJA 3QAGA 1CQGA 1MDIA 4GSNA 4O5RA 2GT6A 2WGRA 1O7UA 4LMWA 2BMXA 1HQOA 1ERUA 3CTFA 4KX4A 1M2DA 3SBCA 4MMMA 2GSSA 3ZFLA 2GQLA 1YKAA 4XTSA 1YEPA 4NV5A 4YH2A 2N5AA 3LXTA 4ZBBA 1JZWA 1WOUA 5E4WA 2OKAA 3D6IA 4K8MA 3ZREA 2H30A 2P5RA 4MJBA 1F37A 3O6TA 1MDJA 2GTUA 4J56E 2MBSA 1SU9A 3W8JA 3F3QA 3MAKA 2I9HA 4ISDA 3TOTA 4ILFA 3W6GA 2MMAA 4O92A 2GZYA 1W4VA 1TKDB 3IAM2 4D73A 2B5EA 2GSRA 1MTCA 1M9BA 2IPAA 5C00A 4YQMA 3VWVA 2F8FA 1GSQA 5DBQA 4IN0A 2V41A 3GX0A 1JHBA 1OE7A 2CT6A 3WGEA 1GTUA 3VI5A 3F0IA 2V6OA 5IMAA 1G6WA 3VFIA 5CAXA 2GZPA 1SENA 2YJHA 1V9WA 3LQ7A 5IMZA 2JL4A 4WR5A 3I69A 1SL1B 3S9FA 1HNAA 2A4VA 3C1RA 3IK9A 1FW1A 4TXOB 1TRUA 5EPFA 1LU4A 2C80A 3UBLA 5J5NA 2DMLA 4IQAA 4IW9A 1VRSD 4KDYA 1TP9A 2VLVA 4PXOA 5HFIA 4GSTA 3JCML 3DVWA 3BCIA 1EV9A 6GSWA 3VPQA 1PQNA 2A2RA 2LRNA 2VCXA 4KCAA 3L9SA 2ZUPA 5IQYA 2N5FA 4MF6A 1K0OA 5A4VA 3L9UA 4TVEA 5KN3A 4F0CA 4XIHA 4PQ1A 2L6CA 3NOFA 1ZYQB 3I9V2 1TJDA 3J7Yk 3DIEA 4POMA 2LUSA 4ULXA 4NHZA 4MF5A 3ZRDA 2WFCA 4KDXA 3G7IA 2FWFA 2VUPA 3L4NA 3N5OA 2DMMA 1SD9A 3UAPA 2YPMA 1AQWA 3F9UA 17GSA 2LRCA 2HSHA 3ZFBA 3IOSA 4X43A 1EOHA 3BBYA 2VO4A 3CTGA 3TKSE 3LG6A 3TKSC 4POKA 2J23A 4ZL7A 2DJ1A 2DJKA 1PX7A 2IIYA 1EP7A 3MNGA 1YY7A 5ELAA 1ERWA 1PKZA 2C0GA 1YQ1A 3FZ4A 4EC0A 3E9JB 3HJMA 20GSA 4I97A 3GSSA 3DD3A 5D9XA 1M9AA 2DJ0A 5L71A 2JZRA 5DCGA 4JZQA 2O8VB 3IR4A 2E7PA 3KD0A 1OKTA 4FYUA 2CX3A 3CSIA 2C4JA 6GSTA 4ECJA 1ON4A 5J9CA 1GRXA 3KTBA 1GULA 2C3NA 1YF0A 5J9BA 3EVIA 1XCCA 4ZL9A 1QXHA 3ZIJA 4XS4B 1SJIA 5F06A 2YNXA 1VF4A 5DJLA 4OCFA 1O85A 4WR4A 2LS5A 1X9SB 1SK2A 1ZOFA 2F3MA 3KMOA 5JCWA 2REMA 3A2XA 2H75A 1OE8A 3G7YA 1U6TA 4HQZA 1UA5A 2VL3A 3H8QA 5G30A 3ME8A 1WJKA 3LORA 2YWOA 1PN9A 1THOA 3IHQA 3KM6A 4JE1A 4KUNA 3VWUA 1UC7A 1EZKA 5ECHB 2MMZA 2XBQA 2E0QA 3ED3A 2B5YA 1PL1A 4PX1A 1PX6A 4HU7A 2PU9C 3GV1A 2QC7A 4K0NA 2YWMA 5AGYA 2AAWA 3L0HA 2YJ7A 1OC8A 1XVWA 1TW9A 2PUKC 3C7MA 1SYRA 1A2JA 5IM9A 1DUGA 4WEYA 2PERA 2YWIA 3F4TA 1F6MC 4GF0A 4TR0A 2LKUA 2VCZA 1GSUA 3M8NA 4F0BA 1TK0B 3GTUB 3QFAC 4XS6A 2I1UA 4E8HA 5JWRB 1SJZA 2FWEA 4JEDA 1B8XA 3FY7A 3D0ZA 5LCZA 2NVLA 3U5RE 3ZITA 3NIVA 2VCTA 1B4PA 1WE0A 3KCMA 5JCUA 5ECQB 2GT5A 3LXZA 2GVPA 5D9TA 3UBKA 2R2JA 2VL2C 5ENUA 5JWOB 3IDVA 1USBA 1WWJA 2HZEA 4TR1B 4L5OA 3FR9A 2O7KA 3EC3A 1K0BA 3TKPA 5ECOB 2MZCA 1ZCPA 2CQ9A 3F4SA 1HNBA 3UL3A 3VLNA 4BWQA 4V1Ap 1K0AA 5IMDA 2ON5A 2R3XA 2FY6A 2X8HA 5AN1A 1SJ6A 1PSQA 1MEKA 2YZUA 1ZZYA 3DVXA 1GH2A 5HQPA 1TRSA 2IFQB 2EIQA 5ECMB 3DYRA 3F3RA 6GSYA 4HI7A 2RIIA 1XWAA 4EVMA 2JZSA 1WP0A 2R5GA 4WKWA 2CAQA 1V2AA 2FUG2 5KN2A 5B8BA 3DRNA 3DXBA 13GSA 1O8WA 3GH9A 3TUEA 4ML1A 3CMIA 5B8AA 4ZXGA 4MPFA 1EP8A 1GSSA 2R4VA 2H74A 2PMTA 1XW5A 1T1VA 2V2GA 5FT3A 2IJYA 2YV9A 2GSQA 4V2NA 2H01A 2WZ9A 2WULA 4O7HA 1UVZA 5F07A 4AJ6A 2KP1A 2F8AA 1ERVA 2H1AA 4G10A 1V40A 4MZWA 4F03A 3QMXA 4N10A 5H5RA 3HZ4A 2DJ3A 2AJQB 2E2MA 4HU9A 5EY6A 3QFBC 1DE2A 5J4UA 2HRFA 3E3EA 3QAWA 3DGQA 2VL9A 3ERGA 2L6DA 4JU5A 1AXDA 4HJMA 2N5BA 2HI7A 3C8EA 4MPGA 2H19A 1LJRA 4K0GA 1JZRA 1B4QA 3H4KA 1T3BA 1XW6A 1R7HA 4I2TA 4KNDA 1RQMA 3M0FA 2VLTA 2WDUA 3IA1A 1ZGNA 4OFNA 4OMVA 4IGJA 3KJYA 2FGXA 5D96A 1H75A 1QK8A 3CXGA 3KIJA 1K3OA 3IAS2 4XS1A 4DSSB 3TJJA 3FRCA 4PNGA 2WB9A 2VOCA 4TOPA 3ZMKA 3UVTA 4KCEA 4ZB6A 1U3IA 1K0MA 1R5AA 1O8XA 4POBA 4F2IA 2B1LA 2R6KA 2VAFA 2V32A 4F82A 4K6XA 1W89A 4YQUA 3QDNA 4Z7XA 1TI1A 2CAIA 3M3MA 4ZB9A 1Z7PA 3BCKA 3ERFA 1OC9A 3NZNA 1BG5A 1AC1A 3OR5A 1YKCA 3GKXA 5CRDA 1FHEA 4MCUA 1RK4A 2MYGA 4L8EA 5KEJA 3GH6A 2DC5A 1TK8B 1H4OA 1T4ZA 3I6AA 3IE3A 1PRXA 1XOAA 2FHEA 5ECIB 4EUYA 4FO5A 4WXTA 4Q5QA 4PNFA 5ECLB 5G5EA 3GUSA 4PQHA 2LTKA 1WRYA 2P31A 2LQOA 1EOGA 1O6JA 5ECPB 2KOKA 1RW1A 5A4WA 4FYBA 4HUAA 4BL7A 1R5PA 1XVQA 2M46A 2YOIA 3GFKA 3HD5A 3EE2A 3HHVA 3CSJA 4O32A 3O76A 4ZBDA 1A8LA 1K3YA 4N30A 3L78A 1OKDA 4GCIA 4WF5A 1AQVA 4KW6A 1THXA 2HNLA 2QGVA 1GLQA 4TXOA 2V1MA 2H0GA 4OFTA 4WF4A 4IP6A 3TOUA 3MWHA 3RPNA 4X0XA 3LJRA 2PGTA 5IPHA 2JU5A 4GXZA 2LQQA 3FW2A 1OYJA 1XOBA 1MD4A 2JSYA 5G5FA 5G1LA 4CW9A 2CV4A 1GUMA 2B5XA 4GSSA 5B7CA 4I8BA 4FIWA 4LMVA 2GGTA 3UIWA 2YWNA 1T4YA 4L0WA 2CA8A 1BAYA 3RHBA 2CZ2A 4WBJA 2P5QA 4KSOA 4NPBA 5HR2A 4TRXA 4K7OA 2JADA 4Q5NA 4BWSA 4BVXA 4OO5A 1VF1A 5CRHA 2WS2A 2H1BA 5F0GA 4TXVA 3CRTA 1EV4A 3Q6OA 5B6NA 4MZCA 3FZ5A 4YAVA 2A2SA 4CHSA 3DMLA 2PPTA 2L4QA 3R2QA 5HR0A 4OD7A 4ZIJA 3GIXA 1S3AA 2HE3A 4V2LA 1KEBA 4Q5RA 4TKYA 5D8IA 2M72A 5ABRA 3ZYWA 10GSA 4IHUA 1TXXA 3EU3A 1U88A 2EC4A 2VM1A 4EDYA 1BYEA 3UOMA 5ECNB 4GWRA 4EO3A 2PVOC 2BTOT 1TRVA 4IQ1A 1AQXA 2PBJA 3GN3A 4XHMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite