3TKPA

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 in the reduced form
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 67
structure length 197
sequence length 197
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tkpA00
4YAVA 5ELAA 3GV1A 3DIEA 5GSTA 3GKXA 5FT3A 1PRXA 3ISOA 4HU7A 3KZQA 2LRNA 1K3YA 1ZYQB 4N0ZA 1I5GA 2M46A 1R4WA 4BL7A 2J9HA 5AN1A 1GL8A 2A4VA 3F4SA 2AUVA 4ZBAA 2C1YA 1GLQA 4K8MA 5G30A 5A4WA 1TKDB 1W89A 1YZXA 2OACA 3QDNA 4HJMA 3ZFLA 1WRYA 4L0WA 3FRCA 3ERWA 4MK3A 4F2IA 3HVVA 1O73A 2JZSA 1YY7A 3D4MA 2MBSA 1EEMA 4I6XA 5DVBA 1PQNA 4NV2A 4EXJA 2YNXA 2MMNA 2M80A 1TK5B 1GP1A 1XWAA 3APQA 2VCQA 3IAS2 2MMAA 5HFIA 3KEBA 2N5FA 1V98A 3WGXA 1B8XA 1QXHA 2JZRA 3EVIA 4HOJA 4L5LA 5GSSA 2TRXA 2FY6A 4ZBDA 4K0NA 1SKWB 1K0BA 4WF5A 3ZL5A 3WGEA 2HE3A 3F3RA 4LL4B 1XW5A 3LJRA 4LLRA 4GQFA 1BQ7A 4LMWA 1JZDA 4IN0A 3KP8A 1PX7A 1XPVA 2DC5A 6GSTA 4ID0A 3VI7A 3VWUA 5IMAA 4DVCA 3IA1A 2VIMA 2GS3A 3MDKA 2MZCA 3CRTA 2PWJA 2CVKA 5JCWA 5DALB 6GSVA 3PGTA 1YF1A 5G2ZA 3IR4A 3UVTA 5COHA 2ES7A 4XS4A 1U3IA 3VK9A 3CBUA 2AB6A 2HNLA 1G6YA 2H19A 1OVNA 4DSSB 3M9JA 4OWYA 3LWAA 1USBA 4IJIA 2FCHA 4ZB9A 4MF6A 4QQ7A 2VM2A 4K0GA 4ZBBA 1F2EA 1QK8A 3FZ5A 3DXBA 2V32A 1GTBA 3DVWA 1ILOA 1K0CA 3KMNA 3C8EA 5FHIA 1SD8A 2PERA 2XBIA 3BBYA 3GL3A 5IIZA 4OD7A 1SD9A 3FR6A 5B7CA 1BAYA 4POMA 3H79A 1AXDA 2IPAA 4G2EA 4IELA 4F0BA 1M0UA 4MF7A 3D6IA 1GNWA 2H8LA 1K0AA 1Z5YE 3EURA 1M99A 2H72A 1KEBA 1GH2A 3OR5A 3DMLA 2HZEA 5A5KA 3A5WA 3MNGA 7GSSA 3GNJA 2H0IA 4TW5A 4MPFA 1N8JA 2VD0A 4EL1A 1X9WB 3EC3A 1LJRA 4CHSA 3VI5A 1A0RP 6GSSA 3WYWA 4IP1A 1MTCA 1PA3A 5KN1A 3GKMA 2G2QA 5CRDA 3KH7A 4V1Ap 4PNGA 5J41A 5HR1A 2A2SA 1Z9HA 3HD5A 3CYNA 4AJ7A 4ZL9A 4PNFA 5DJMA 1TRUA 1GSYA 5D9WA 2HLSA 4G10A 2H0HA 3L4NA 4ISDA 4NXIA 5IMVA 2HYXA 4H86A 1R7HA 3QPMA 5E59A 2VL3A 4G9HA 1ZOFA 2H1GA 3APOA 2FA4A 1EOGA 1HNAA 3EMPA 2EC4A 3BOAA 5JWQB 4KCAA 2DMLA 1GUMA 2YWIA 1XOAA 3QD9A 2WGRA 3BD2A 2R2JA 1XXUA 5CREA 4O7HA 2GSQA 1AQXA 2KOKA 1EP7A 3L9UA 3E3EA 5GZZB 3F9UA 3L78A 4BWQA 5F0GA 4AJ8A 1WPIA 2HZFA 2P31A 4PUAA 3GA4A 2H70A 3WT2A 1F3BA 1T8EB 4KNDA 1X5CA 4IS0A 3TOTA 1TDIA 3HKRA 1U3AA 2OE3A 4MPGA 1H75A 2AHEA 4KSMA 4X0XA 1SJ6A 2F3MA 1U88A 2IMDA 1B9XC 4OFMA 3TKSE 5DALA 2IMEA 5B8BA 1B9YC 1O81A 2K18A 4MP4A 2JSZA 1RQMA 3TJFA 2ON7A 4BPYA 2NVLA 3J7Yk 2H66A 3LYKA 2R4VA 2H01A 2DIZA 1WJKA 3QAVA 4DSSA 1BEDA 1JFUA 3FZAA 2O89A 3KGKA 1XZOA 4OMVA 4FYUA 2VL2C 2YWMA 2GQKA 3I43A 2H76A 3N9JA 4LMVA 1C72A 3C71A 2IN3A 5IQYA 1TI1A 2FUG2 3GH9A 4OCFA 2DJ1A 4EO3A 1F6MC 4YAPA 2R3XA 2B1KA 1AUCA 3QAGA 4MZBA 3DVXA 11GSA 1FW1A 4NV5A 4ML6A 1SL2B 4KUNA 4KGIA 3RBTA 4ILFA 2GZZA 4V2LA 1ERVA 3S9FA 3HXSA 2L6DA 4J57E 1GUHA 3KIJA 4CW9A 3KXOA 3UIWA 4X1UA 1GWCA 3IHQA 5DQYA 3VPQA 3FK8A 3ERGA 1OC8A 4ECBA 1PX6A 4TVEA 1I9DA 1M9BA 1A8YA 2FNOA 3E9JB 3N5OA 3GKKA 4K2DA 2RUEA 2GQLA 2NDOA 2LUSA 2MYGA 2WZ9A 1OE7A 1PSQA 2X8HA 1ZZYA 2C3TA 2H73A 4D73B 1ZGNA 3L9VA 2AV4A 3R2QA 3CXGA 1OKTA 4NAXA 3PH9A 1THOA 1QQ2A 2P5QA 3LG6A 4IVFA 4V1Ag 3GSTA 4MLYA 4PX1A 1K0MA 3ZYWA 1HQOA 3LSZA 1SJIA 1DE2A 2PVOC 3GKNA 5F05A 5DJLA 3TJBA 1PD21 3TKPA 5J5NA 2I1UA 2XBQA 5CRWA 4FH8A 4TOPA 2L57A 2N5BA 5IMZA 3RHBA 4JRRA 3GN3A 4MJEA 2C0FA 10GSA 1ABAA 1BJXA 3CSHA 3DWVA 4WBRD 1NW2A 4RI7A 2QGVA 3TJJA 3A2VA 1SL0B 5DCHA 1NM3A 2HRNA 1YEPA 4KDUA 4PQIA 4TR3A 3HDCA 5EY6A 1GLPA 1IYHA 1GRXA 3A2WA 4GQCA 2GDRA 3TCOA 1SK1A 4MH3A 1TK8B 3KCMA 3DGQA 3LORA 3VPTA 3U5RE 3DYRA 3CMIA 4RQRA 2E2GA 2DJ0A 3F0IA 3QFBC 1GSUA 1EP8A 3EINA 4QL7A 2OJLA 2VAFA 4K7NA 5F07A 3F8UA 2VCVA 5AGYA 4MMMA 3TKSA 2H0GA 3GTUB 3TUEA 3BCIA 2XPDA 3LEFA 4PGTA 3TB2A 1SL1B 2VLUA 2I4AA 3P8WA 2QSIA 2BTOT 3JCML 2H1DA 3G7JA 3GRXA 2FWHA 2DSAA 3P7XA 2B5XA 2N5AA 2I3YA 2NBSA 1PKWA 5D9XA 1Z7RA 3W8JA 3GFKA 3UOMA 5GAND 2PUKC 4HZ4A 4FYCA 14GSA 4IW9A 4EE0A 1GNEA 3D5JA 4XS1A 3EYTA 1ACVA 2L5OA 4L0UA 2X64A 1J9BA 3HJPA 3WD6A 3I69A 3M9KA 1WMJA 1HNBA 3APSA 2FA8A 2TIRA 2ALBA 2CAQA 3BCKA 1SKRB 2WRTA 3KMOA 1TRWA 2EIQA 3QMXA 4KH7A 4N10A 1V9WA 2OADA 2YJHA 12GSA 4JBBA 4K7OA 4WF4A 2LJRA 2VO4A 1Z6NA 3M3MA 3FKFA 3LYPA 1AQWA 1GSQA 4TXOB 3GHAA 1WE0A 2KP1A 3IE3A 1PGTA 1G0TA 5HR2A 3RDWA 1DUGA 2L4QA 1JLVA 2I9HA 3DKSA 4GSSA 2OA7A 2C3NA 4WKWA 5KN0A 3F4RA 4HZ2A 1XWGA 4PURA 3VFIA 2R6KA 3QCPA 8GSSA 5HFGA 2DJJA 2LV3A 2CVDA 2IIYA 1FHEA 5IPHA 2BJXA 2CQ9A 5ECMB 1XCCA 4MZWA 1S3AA 3VWVA 1DBYA 3HY2A 1MD3A 3DEXA 4GRFA 3E0UA 5A4VA 4D73A 4WETA 2GVPA 1T1VA 3TRXA 5B6NA 1YEXA 2DBCA 1FOVA 1TJDA 4TR0A 4GCIA 1N2AA 3RPNA 1OC3A 5HR0A 3O3TA 4IQ1A 2HRFA 3I9V2 3LXTA 5HQPA 3GH6A 2GSTA 2GZYA 1U6TA 1GSSA 1Q4JA 4XRDA 5HFKA 2YWNA 4NMUA 2JSYA 2YOIA 2B5YA 4J2FA 5FWGA 1V40A 16GSA 4MH2A 3KP9A 2H1BA 3IC4A 5G5EA 2A2RA 2VUPA 1ZYEA 2NTOA 3GX0A 1B4PA 1TK0B 5L71A 1LBKA 4WR5A 4KAEA 1YDKA 3QR6A 1DE1A 1WOUA 2GT6A 4YQUA 2YV7A 1O85A 1GUKA 4GLTA 5LCZA 3GURA 5D9TA 1SYXA 3WGDA 5D73A 5GAPD 1KBNA 2F9SA 4WXTA 1OKDA 2O7KA 3D22A 3GTUA 2LQOA 4NPBA 5LD0A 1TP9A 1PL1A 2PMTA 5J4UA 3ZIJA 4Q5NA 4KB3A 2DJKA 4EDYA 3PR8A 13GSA 3G9BA 2Z9SA 2DJ2A 2C80A 3ZIVA 2RM5A 2RIIA 3GYKA 3IAM2 2FWEA 4PXOA 3VWWA 3KTLA 2H74A 1T4YA 1ST9A 5CRHA 3Q6OA 4KDXA 3IV4A 5ECHB 1XWCA 3TKRA 3UBKA 1X9SB 1QUWA 1B48A 4ZL7A 1OC9B 3LXZA 2IMKA 2RUFA 3W8SA 3TKQA 2C3QA 2K8SA 4Q5FA 1EEJA 1V57A 3CTGA 2I81A 1A2MA 4OO4A 1U87A 1XIYA 3ZVJD 1B4QA 1G7EA 4YQMA 1TW9A 2H71A 1SENA 4G19A 2IWTA 2OBKA 2PN8A 4HEA2 1VGLA 1GTIA 3ZITA 3HZ4A 2GT5A 5F06A 1TU8A 2DMMA 5ECQB 2C4JA 4K7IA 2V41A 4NHWA 1K0NA 1FVKA 3EE2A 4TXOA 3HZ8A 2VCZA 4F03A 1ZMAA 3H93A 4BVXA 3UAPA 3F6FA 1QMVA 4N30A 3HCZA 3ZMKA 2L5LA 5EVOA 3KM6A 5D93A 5E4WA 1VF1A 1TTZA 2LQQA 1K3LA 2LNSA 1J0FA 1AC1A 4N11A 3ZREA 4I5QA 1A0FA 1K0DA 2VD1A 2ZUPA 4RQXA 3HYPA 4K9ZA 5EL8A 3ZRDA 2OBIA 1VF4A 2WDUA 1MDIA 5A4UA 2HXKA 3UVHA 1GSEA 3F63A 1G7OA 5CO3A 9GSSA 4PQ1A 3GIXA 2GQMA 4TR1B 2HT9A 4O92A 2WS2A 1XW6A 2K6VA 2YJ7A 1MEKA 3LFLA 2EIRA 2QC7A 2IFQB 5ABRA 1EGRA 1QGVA 1NSWA 3IBHA 1FG4A 2TRCP 1BG5A 2XPEA 5G1KA 2YP6A 2QKEA 2M72A 3M1GA 2JL4A 1ERTA 4OFNA 2F8AA 2HI7A 3GMFA 1TOFA 2FWFA 1M2BA 4MJCA 5D8IA 2CT6A 2LJKA 2MBTA 2GZPA 3QAWA 3F4TA 2H6XA 4F0CA 4HJ2A 3D21A 2YCDA 1H4OA 1MDKA 1ZL9A 1UVZA 3AY8A 3UJ1A 4MJBA 1EV9A 2VCTA 1OYJA 6GSUA 3CSJA 4IHUA 2YV9A 20GSA 1YF0A 3EWLA 3HJMA 3SWLA 3NZNA 4JR6A 3IK7A 4IBPA 4HUAA 5G31A 5CNWA 4JEDA 2CAIA 5AIXA 1UN2A 2CA8A 1KTEA 5IO0A 1XW9A 5ECIB 3RPPA 2LRTA 4QL9A 5IMDA 3ME7A 3NIVA 1OC9A 2IMIA 4OFTA 1O6JA 4RUVA 17GSA 2HSYA 4ML1A 1M2DA 2WCIA 2PPTA 1TRSA 3G7IA 4POKA 3WT1A 4GSTA 4FO5A 2FWGA 4L8EA 3IK9A 4JZQA 1PMTA 3F3QA 2EIOA 3CRUA 4GF0A 2H6ZA 4HS1A 3LGCA 5IO2A 1XVQA 2LTKA 3W6GA 3DRNA 4JR4A 1JZOA 1VRSD 2H1AA 3M8NA 1NHOA 3FY7A 5ID2B 4ZIJA 2PVQA 1QFNA 1AQVA 2RLIA 1SKSB 4POBA 2IMFA 1V2AA 2HSHA 4IKHA 5C00A 2HZEB 4KE3A 4ZXGA 3FW2A 3ZFBA 1UA5A 3ZLPA 5CYYA 4TN8A 3TRPA 4GXZA 3FEUA 2CX4A 5IMCA 1Z3EA 3NOFA 5LNKe 4HDEA 3UEMA 1UC7A 3EU4A 4F82A 3TJKA 4AF2A 1RK4A 5F8BA 4BA7A 4Q5RA 3TRQA 1Y6EA 4KW6A 1XOBA 1T7PB 5C04A 2E0QA 2RM6A 4TR1A 2CX3A 3ME8A 2OE0A 4TRXA 1J08A 4J56E 1HNCA 2B7JA 2OKAA 4IQAA 4ZL8A 1MDJA 2IFQA 4AGSA 3K8NA 4ULXA 1GSDA 3M0FA 1URMA 3GX8A 1M9AA 4HQSA 2J23A 4I8BA 3O6TA 6GSYA 2LNTA 4XS6A 1SK2A 5D9VA 2VOCA 4I97A 1A2LA 1R5AA 2L59A 3FZ4A 1IYIA 4L5OA 1GSFA 4PQHA 2JZTA 5ECSA 1S3DA 1SJZA 1Z6MA 1TU7A 3J7Yb 3TOUA 4ZB6A 3HA9A 5EPFA 2R37A 3L0HA 3ZZXA 2MMZA 3EU3A 1EWXA 1PL2A 5ECRB 4OCEA 3RHCA 4V2NA 4Q5QA 4GWRA 2CVBA 4EF0A 4TKYA 2PU9C 3MSZA 2VCWA 2B1LA 2F51A 4MF5A 4P3YB 4V2MA 2ZNMA 4DSQA 2CZ2A 2JACA 1XVWA 3EMXA 4DEJA 1GULA 3Q19A 3HJOA 1AAZA 2DIYA 3H4KA 1RW1A 1A2JA 4TXVA 1YKAA 3ZTLA 19GSA 2B7KA 4POLA 5AIVA 5IOXA 1AIUA 1JZWA 1XBSA 2LJAA 4X43A 2C0GA 1WP0A 4O5RA 4Z7XA 4K6XA 5ECLB 3Q74A 5KEJA 2VCXA 3V1WA 3F6DA 2VL2A 3O76A 2DLXA 4EKZA 1F3AA 1Y25A 1HYUA 4XTSA 1ZCPA 3HVXA 5DQSA 1EGOA 1X9MB 1LU4A 1YKCA 3UL3A 1OE8A 1K0OA 3P2AA 4FYBA 5ID2A 4ZILA 3C1RA 3TKSC 2GTUA 2R5GA 1FB6A 1WIKA 2CV4A 2MMOA 2XHFA 4JE1A 5H5RA 2AAWA 1XWKA 4KX4A 1Z7PA 1YQ1A 1EOHA 3KD0A 3U6VA 3FR3A 3L9SA 2E2MA 4WR4A 3PINA 4XRAA 4XIHA 5H5QA 2FLSA 1ERUA 2YN1A 4HI7A 2V2GA 5KN3A 2V6OA 2LRCA 1Q98A 5G1LA 2GSRA 3FYGA 1K3OA 5B6MA 1GTUA 4NHZA 4EUYA 4GTUA 3H1NA 4O32A 2GGTA 2O85A 1F9MA 1DSBA 4EC0A 3DD3A 1TI3A 2LEGA 1X5EA 1NHYA 4DSRA 1X0RA 1TRVA 1A8LA 2FD3A 3SBCA 5ECKB 1PN9A 1GTAA 3C73A 2B3SA 5DDLA 1W4VA 1HD2A 1R5PA 2YWOA 3FHKA 3LQ7A 2GLRA 3ERFA 3H8QA 4EVMA 1MD4A 2K8VA 5INYA 4KDYA 3VLNA 5ECNB 4RI6A 1SK0A 2OE1A 4F9ZA 3TGZA 4K1FA 2E7PA 3UBLA 2ON5A 4ZB8A 4WBJA 3G7YA 5D96A 4XHMA 3MWHA 3QFAC 1ERWA 3MAKA 1JLWA 1T00A 2KP2A 5IMFA 2AJQB 1E2YA 4MABA 3RAZA 1KNGA 4JU5A 6GSWA 5J9CA 1O8WA 4HU9A 3IOSA 2C0EA 2H6YA 5ECPB 5DAKB 5B8AA 1A24A 4IJ3A 2KUCA 4ECCA 2CZ3A 3FR9A 1FB0A 1O8XA 4MDCA 1ML6A 5IM9A 1AW9A 5HR3A 3ED3A 4BVYA 5JWRB 2X99A 3I6AA 2C0DA 2VM1A 5G5FA 3UMAA 2GSSA 2HFDA 3KH9A 2IL3A 4HQZA 1M7TA 3GUSA 4N0VA 3CSIA 1ON4A 5DCGA 1VF2A 1VF3A 2AYTA 1G6WA 1O7UA 1YJ6A 1FAAA 2V1MA 3Q18A 3FZ9A 4WEYA 2VL9A 5AISA 4CDOA 3UARA 4MZCA 2F8FA 4MA9A 4YH2A 4XCSA 1JHBA 1A23A 2ZCTA 22GSA 2C8UA 2NPBA 2PGTA 2WULA 4EDZA 2KLXA 4BWSA 2B6MA 2YPMA 1CQHA 2O8VB 3A2XA 2YANA 4ACSA 2P0GA 4KA0A 5JWOB 1SU9A 1X5DA 1E6BA 4KCEA 2G0FA 3GL5A 4MJAA 3P90A 4IP6A 4LA1A 5ELGA 4E8EA 3IRAA 4I2UA 3QOUA 1XFLA 4LL1B 4NWYA 5CRGA 3BJ5A 2X8GA 1BX9A 1R26A 2VLVA 2YZHA 1WWJA 1JZRA 2WB9A 2YZUA 3D0ZA 2LS5A 1BYEA 4TR4A 1V58A 5CAXA 2IJYA 3VWXA 3HHVA 1F37A 4GSNA 3CTFA 2VLTA 5DBQA 5J3RA 2H30A 5KN2A 1CQGA 4XS4B 1EV4A 3TDGA 1FVJA 3A3TA 4YQVA 2V6KA 4MCUA 4OO5A 3TJGA 4FIWA 5CP1A 2H75A 3IXRA 4ECJA 3KJYA 1THXA 3C7MA 2LKUA 2LSTA 3IDVA 2XC2A 2PBJA 3US3A 4I2TA 1OAZA 4E8HA 3ZMLA 1PKZA 4PUFC 2L4CA 5H5SA 4KSOA 5ENUA 1XWBA 2B5EA 2JADA 2L6CA 5ECOB 2BMXA 4ECIA 1M2AA 2WFCA 1T3BA 2WJUA 6GSXA 2X8CA 18GSA 2FHEA 3KTBA 2JU5A 4AJ6A 3D4TA 1FO5A 2D2ZA 3GSSA 2DJ3A 2REMA 2K9FA 3HVSA 3C1SA 1SYRA 1S3CA 5JCUA 1EZKA 2FGXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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