3TKRA

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 with t118e mutation
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFEHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 65
structure length 197
sequence length 197
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tkrA00
2QC7A 1BYEA 6GSVA 4HZ2A 1LJRA 2GGTA 2ON7A 2PGTA 5AIXA 2XC2A 4D73A 4LLRA 1J0FA 3D21A 4K1FA 2NBSA 1VF3A 2GQKA 4NWYA 4IJ3A 1O8WA 3HVVA 1MD4A 4H86A 3VK9A 5LNKe 5J9CA 4DEJA 2PBJA 4IGJA 4XS6A 1GLQA 4PURA 22GSA 3UVHA 5GZZB 1EP7A 2Z9SA 5CYYA 1A8LA 2GSRA 14GSA 1HNCA 1KTEA 5ECKB 2GS3A 3UVTA 2BMXA 2V6KA 1GH2A 3BCIA 1JLVA 2OJLA 5JCUA 1GSQA 2MBTA 1GSSA 4WR5A 2ALBA 2XBIA 4RQRA 3UL3A 4WETA 2L4CA 3KTBA 3TKSC 2CA8A 1QUWA 4ILFA 5DAKA 4OMVA 3CRTA 3LYKA 3TOUA 1EV9A 4MPFA 2WDUA 3EC3A 2AAWA 3ZIVA 1X9WB 5IPGA 4K9ZA 5CRWA 4GTUA 2VCZA 1M2AA 5IMFA 2H74A 2LJRA 4IJIA 1XFLA 2H6ZA 2E2GA 2YWIA 3LEFA 2VL2C 3W8JA 1JZDA 4JU5A 1EGRA 4IBPA 5EPFA 16GSA 1DE1A 3F63A 1VRSD 3CSJA 2G0FA 2GZYA 4PUAA 1SKSB 3VPQA 3KP8A 1QGVA 4PUFC 3QPMA 4AGSA 1KNGA 2DIZA 3VFIA 1GNWA 2B5EA 1USBA 3GHAA 5IMDA 3H93A 4HQZA 2HT9A 1AQXA 3N5OA 4NV2A 4MF5A 1WMJA 2CT6A 1Q98A 5CRHA 1T7PB 2CAIA 1A8YA 3MWHA 1T8EB 4PGTA 4LA1A 1YKAA 1AQWA 1BJXA 2H1DA 5DDLA 2NPBA 1M0UA 4E8EA 1KBNA 4MK3A 1MTCA 5F05A 4DSSB 4OFNA 1WOUA 4FIWA 5HR1A 1URMA 3PGTA 1ON4A 3D4TA 3UMAA 5G2ZA 3LQ7A 1VGLA 2CZ3A 3CYNA 4YAPA 1DBYA 5JWRB 3NIVA 3KP9A 1B9YC 1J08A 3FEUA 2H1AA 4MF7A 5EVOA 2RIIA 4QL7A 4GRFA 1ACVA 3GKKA 1ZCPA 2AV4A 5HR0A 3IC4A 1NW2A 1XVWA 2TRXA 5ABRA 4DSQA 2EIRA 2IFQA 2H1BA 1SJIA 1T4YA 4RQXA 1XCCA 3GN3A 1JZOA 3TDGA 1GSDA 5ECMB 1H75A 1GNEA 1AXDA 5HQPA 2YV7A 5DCGA 3D22A 2J9HA 3ZYWA 2L4QA 1T00A 2C0FA 1I9DA 1K3LA 1OKTA 3VWWA 2E0QA 3M1GA 2LSTA 3VI5A 2FWGA 1Z6NA 5AGYA 1OKDA 2LJAA 4KX4A 2REMA 1EOHA 4HZ4A 1WJKA 4POBA 2RUFA 5IPHA 3VPTA 4HJ2A 3TRPA 3L9VA 3W8SA 3EWLA 4HS1A 2JU5A 2I4AA 3TKPA 3EINA 2GT5A 2VCTA 4O7HA 5ELAA 2PMTA 3BD2A 3RHCA 5ID2B 1SK1A 4F0CA 4V2MA 4IP1A 5D8IA 2F3MA 4KSMA 3V1WA 2HFDA 1JZWA 2FGXA 4EKZA 2LNSA 2FA4A 3UEMA 1ILOA 5AIVA 4MLYA 1XBSA 2L6CA 1NHOA 5ECSA 2TRCP 3Q74A 1K0MA 4L8EA 3LWAA 4ZILA 1K0DA 4LL4B 4MMMA 4MZWA 1TK0B 4XHMA 4V1Ag 4JEDA 4ZBDA 3APSA 3ZRDA 1F9MA 3ZMKA 2YNXA 2IIYA 2VCWA 1ZMAA 4BVYA 1F3AA 5JWQB 3TKSA 1GWCA 5A4VA 3DVWA 4WF4A 5JWOB 5F0GA 4BPYA 3LG6A 5D9WA 4KW6A 5B8AA 1Y6EA 4J56E 3IDVA 1T3BA 1QMVA 2WGRA 2HZFA 4TR3A 5COHA 3DKSA 1V98A 4GSTA 4K8MA 2PUKC 2P5QA 3O76A 3W6GA 3E3EA 2VL2A 5DALB 3DGQA 4I97A 4OWYA 5G1LA 4IW9A 4KDYA 2OBIA 1PX6A 1XVQA 3D6IA 2VM1A 2OBKA 1G7OA 3QOUA 2MMAA 1F37A 2JL4A 2YN1A 3HD5A 1O81A 2B7KA 2DJ1A 4I6XA 5B6NA 1FO5A 2DMMA 2OE3A 5CAXA 4KB3A 2H30A 1AAZA 4OCFA 3KD0A 3GFKA 2IL3A 4PQIA 4J2FA 3RPNA 1SYRA 5D93A 1TOFA 2V41A 1TW9A 2DMLA 4MA9A 3EE2A 4F9ZA 4MABA 5J41A 4MPGA 2R5GA 4NHZA 4ZL7A 4AJ8A 3FKFA 1T4ZA 4POMA 2XHFA 2H0HA 4BA7A 3HKRA 4IHUA 2PVQA 1HQOA 4X1UA 5IOWA 2HE3A 5H5QA 5HFKA 2VL3A 3Q18A 2CQ9A 3WT2A 4HJMA 3H1NA 5ECIB 2GLRA 2IMFA 2ZCTA 2GQMA 1FAAA 2VAFA 3F3RA 5FHIA 2KP2A 2WZ9A 4MJCA 1FW1A 1BG5A 2B5YA 4ML1A 1ST9A 3MAKA 2JSYA 3CMIA 5LD0A 2RLIA 1JLWA 2L57A 3IRAA 1VF1A 3E0UA 4NV5A 5CRDA 2KLXA 4TRXA 4Z7XA 2IMEA 4AJ6A 3PINA 1JFUA 2MMZA 3IK7A 2LQQA 2OA7A 1UN2A 3QR6A 4KSOA 4JR4A 2V6OA 4CDOA 1O6JA 3G7IA 3FZAA 3HCZA 1A24A 3EYTA 2HNLA 5CREA 5IM9A 3HYPA 1ZOFA 1V40A 2YP6A 1PD21 5B6MA 4EC0A 3MNGA 5AISA 4MJEA 5KN2A 4TOPA 2M72A 5ECNB 1WP0A 5DAKB 3ERGA 2H6XA 3ISOA 1YKCA 1O7UA 1NM3A 2K8VA 3GX0A 4WR4A 1U87A 2XPEA 1ZZYA 2GVPA 2QGVA 1WE0A 2L5LA 5L71A 3IK9A 3FZ4A 4EF0A 3QAWA 2WULA 3OR5A 2VUPA 1QFNA 3O6TA 4IN0A 2JZTA 4MDCA 2YV9A 2YWNA 2KUCA 4ZIJA 1SD8A 4XS4A 1YF0A 3QMXA 3TGZA 4FH8A 2AYTA 3SWLA 2X99A 2NVLA 3DWVA 3UJ1A 2JSZA 3ZTLA 4EDYA 2L59A 3VLNA 3IPZA 4ZXGA 5G5FA 4TXOA 1RK4A 1F6MC 1PRXA 5D9XA 3UBKA 3TJFA 3FR6A 2X8GA 2F51A 2C4JA 1C72A 4FYBA 3E9JB 3F4RA 5DJMA 2ES7A 2H70A 3FK8A 3VWVA 3TOTA 2WJUA 2LNTA 3QFAC 3IBHA 1HNBA 1W89A 5D9TA 2PWJA 2H66A 3LXZA 1K3YA 5DCHA 4GSSA 3TJJA 4KCAA 1SU9A 5IMCA 4G9HA 1GLPA 4GQFA 4K2DA 1A23A 2DJ2A 3JCML 2JACA 5HR2A 2CV4A 1XOBA 4MP4A 3GL5A 5J5NA 2IFQB 2MYGA 3TRXA 1M99A 5J3RA 4TKYA 1YZXA 3HHVA 2E2MA 1ERWA 2YOIA 4OD7A 4ZB9A 3ZMLA 1ZGNA 4XIHA 1A0RP 3P2AA 1AC1A 3EURA 17GSA 2ZNMA 4GQCA 10GSA 2QKEA 4IELA 3APOA 2FCHA 4TR0A 3U5RE 3CTGA 1IYHA 4X0XA 3QAVA 1WIKA 1G6YA 3FR3A 3LYPA 5H5RA 4PX1A 1SK2A 3U6VA 4DSRA 2FHEA 2GSQA 3GKXA 3RAZA 13GSA 2IJYA 4ECBA 2R6KA 2EIOA 3UOMA 1GSEA 2C0DA 6GSUA 1A0FA 4KA0A 1O73A 2LRCA 4AF2A 1OVNA 1OC9A 2MZCA 1F2EA 3H8QA 3HVSA 1GTAA 4BL7A 2DSAA 2B3SA 2KOKA 2CVDA 4O92A 1EP8A 1YDKA 1GP1A 1TI3A 3A2VA 4JR6A 3EU3A 5ENUA 1EEJA 1DE2A 4IP6A 7GSSA 3DYRA 2LJKA 1U3IA 4Q5QA 1JZRA 1ERTA 1S3DA 2MMOA 3C8EA 2GDRA 4YQVA 1X9MB 2WB9A 3TUEA 6GSYA 1TRWA 6GSTA 5F06A 4HUAA 1TU8A 1EOGA 2YCDA 2HXKA 1A2MA 2O7KA 1M9AA 2WFCA 1R26A 3LORA 4ISDA 2IN3A 6GSXA 3O3TA 1HNAA 3KXOA 4BWSA 1B4QA 4HEA2 3M0FA 9GSSA 4Q5FA 4O32A 2JZRA 3HY2A 2H0IA 1TXXA 4KE3A 2EIQA 3EU4A 1NHYA 5IMZA 4PNGA 3GH9A 3D5JA 2K18A 2ZUPA 2OADA 4YQMA 4IQAA 4OFTA 3FZ5A 1HYUA 3GH6A 5DQSA 3EMPA 4I2TA 1R5PA 3KZQA 4JBBA 3QFBC 2A4VA 5G31A 2AJQB 2HSHA 3BCKA 5DBQA 1FB6A 1TK5B 3GV1A 8GSSA 4KDXA 3QDNA 5ECRB 2BTOT 1SYXA 2WS2A 3ME7A 5D96A 3J7Yk 1OYJA 3GRXA 5DJLA 1ZYQB 4RI7A 1K0NA 1Z6MA 3WGXA 4L0WA 3PH9A 3CSHA 5ECOB 3S9FA 1S3CA 4OCEA 4TW5A 4OO4A 2HI7A 2CX3A 1IYIA 3CBUA 3I9V2 3SBCA 3DIEA 4WXTA 4FYCA 2VCXA 1ZYEA 1OE7A 4FO5A 4MCUA 3VURA 2VO4A 4OFMA 5G30A 3GKMA 3D4MA 3WGEA 2B5XA 3HJOA 4K7IA 4AJ7A 3GA4A 2VD1A 4EUYA 1PKZA 2C8UA 1K3OA 3C7MA 4Q5NA 4F2IA 1PL1A 4NPBA 5JCGA 3R2QA 1TDIA 2PN8A 3IR4A 5GAND 1CQGA 1BAYA 1XW6A 2V32A 1K0AA 1XWGA 2FNOA 2H75A 5DVBA 2C3TA 2VM2A 4V1Ap 3GMFA 4ZBAA 3VWUA 5HFIA 2DLXA 3APQA 2H6YA 2OACA 3ZLPA 1XW9A 4WBJA 2DJ0A 4I5QA 1G7EA 1YQ1A 3IA1A 1BX9A 1SD9A 5IO2A 5AN1A 4L5OA 5CRGA 4MJBA 3GTUB 2RM6A 1YY7A 1ERVA 1EZKA 3CSIA 4XRAA 4OO5A 5INYA 3HDCA 4POLA 3MSZA 3J7Yb 2B1KA 5D9VA 1BQ7A 4TR4A 5B7CA 2KP1A 2PVOC 1Y25A 1SJ6A 1DSBA 2GSTA 1Z7RA 2GQLA 1JHBA 3PR8A 3GL3A 4XS4B 1ERUA 1AUCA 4PQ1A 5J4UA 4K7OA 2DC5A 2FLSA 5ELGA 2PERA 3KIJA 5KEJA 3GSTA 1M2DA 4TXOB 3EVIA 3LJRA 3KM6A 4J57E 2H01A 3LGCA 2FWEA 1H4OA 1V9WA 3ED3A 3ZFLA 4F0BA 5JCWA 3ZITA 3LFLA 3HVXA 1K0BA 4GCIA 1XW5A 2K8SA 5F8BA 1PN9A 3IXRA 2FD3A 1M7TA 2B7JA 3IE3A 4ZBBA 2DJ3A 4TR1A 4EVMA 5GSTA 3C71A 4NAXA 1GSYA 5C00A 1Q4JA 3A2WA 3US3A 1MDIA 3GTUA 12GSA 2NDOA 4LL1B 3DD3A 3M9KA 3IAM2 2RUEA 3ZVJA 2EC4A 3QD9A 1WRYA 4BVXA 1I5GA 4G2EA 2R37A 3GSSA 1GRXA 3C73A 1FVJA 3F6DA 4V2NA 5KN0A 2X8HA 5FT3A 4HDEA 3I69A 1U6TA 5J9BA 2LKUA 1SJZA 2AHEA 2YWMA 5D73A 3G7JA 1GSUA 3P7XA 5IMVA 3ZZXA 5KN1A 3ZL5A 1TK8B 2HYXA 1GUHA 2DJJA 1PSQA 4YH2A 3HA9A 2VOCA 2MBSA 4XRDA 2YJHA 4JRRA 2I3YA 4KNDA 2I81A 1DUGA 4E8HA 1RW1A 4ZB8A 2I1UA 3GYKA 4JZQA 1U3AA 1X0RA 1SL2B 4EO3A 1FOVA 4N0VA 3AY8A 2WRTA 1YEPA 3FHKA 1XOAA 3FR9A 2B1LA 1LBKA 1E6BA 3HXSA 2H73A 1GTBA 1OC9B 4N0ZA 2KHPA 4X43A 2VIMA 3WT1A 4IS0A 3F9UA 2HRFA 4ZL8A 1BEDA 4L0UA 3F0IA 4EE0A 1HD2A 5A5KA 2I9HA 1SENA 1WWJA 2CZ2A 4V2LA 2IMIA 3F3QA 3IHQA 3BJ5A 2HSYA 1N8JA 3FY7A 3KMOA 3I43A 4XS1A 1UVZA 3ERWA 3Q6OA 1A2LA 3G9BA 1N2AA 3HZ8A 1U88A 2CAQA 1PL2A 3IOSA 4MH3A 5F07A 2VD0A 4WF5A 2HZEB 1MD3A 1UC7A 4ECJA 4KDUA 4L5LA 4N11A 4TN8A 3P8WA 4LMWA 4NMUA 1T1VA 1GUKA 3Q19A 1TKDB 3G7YA 3KH7A 5HFGA 5HR3A 1TRSA 1QK8A 3H79A 2LS5A 3L0HA 4EDZA 2CVKA 3KMNA 5IO0A 1GULA 1ZL9A 2PPTA 1VF2A 3K8NA 1TRUA 1TU7A 2N5BA 1XXUA 1SL0B 3P90A 1SK0A 1SL1B 2FY6A 5FWGA 5ECQB 1B4PA 3BOAA 2NTOA 2L5OA 4EXJA 1XWBA 1F3BA 2LRTA 1QQ2A 2J23A 4NXIA 4K7NA 3L78A 2C80A 2C3NA 2F8FA 3A5WA 3WGDA 2R4VA 5DQYA 1OC3A 3CRUA 2V2GA 3HJPA 1SKRB 1FG4A 5IQYA 4POKA 3TJGA 5EY6A 3TCOA 1EWXA 2X64A 1MDKA 3I6AA 4GSNA 2OKAA 2HRNA 2OE1A 2LRNA 3TJKA 3TKRA 3F8UA 3BBYA 1TRVA 2RM5A 3UBLA 3F4SA 2HZEA 5A4UA 19GSA 4KGIA 4HI7A 4ULXA 1X5CA 3A3TA 1M2BA 2GZZA 2M46A 4ML6A 4IKHA 1EGOA 2CX4A 3RDWA 2O89A 1AW9A 1YJ6A 3MDKA 2FA8A 3IAS2 3UAPA 1XZOA 1OE8A 2XPDA 1XIYA 3KEBA 1LU4A 2YJ7A 1THXA 1K0OA 2FUG2 3GX8A 5E4WA 5GAPD 2IPAA 11GSA 2DBCA 5CP1A 2F9SA 4KAEA 3KCMA 1QXHA 1O85A 2FWFA 5IOXA 1J9BA 3CTFA 1GUMA 2YWOA 2K9FA 4CW9A 1Z7PA 2PU9C 3F6FA 4IQ1A 3VWXA 2VLUA 1G0TA 2H71A 4DSSA 2LTKA 4K0NA 3TB2A 3FYGA 2H76A 2DJKA 2VCQA 3DXBA 3RBTA 1E2YA 2O8VB 2V1MA 5G5EA 4CHSA 2GZPA 2DIYA 3EMXA 5ECLB 1OC8A 3ZFBA 5A4WA 1PGTA 4LMVA 5EL8A 1M9BA 3CXGA 4Q5RA 4NHWA 1RQMA 4BWQA 2G2QA 2N5FA 4GLTA 4MZCA 3ZIJA 4PQHA 3IV4A 1MDJA 3ZREA 4DVCA 3TJBA 4G10A 2BJXA 4FYUA 5GSSA 1GTUA 3KGKA 2D2ZA 3RHBA 2LUSA 4WEYA 2P31A 2H8LA 3L9UA 2IWTA 3TKQA 4GF0A 1X5EA 2X8CA 4YAVA 1XWAA 2AUVA 4HU7A 3TKSE 1PMTA 1WPIA 3GKNA 2OE0A 4HOJA 2YPMA 3M3MA 1W4VA 1YEXA 4O5RA 1VF4A 1B9XC 5CNWA 2GSSA 5IMAA 1TTZA 3A2XA 3LXTA 2VLVA 2C1YA 2M80A 1NSWA 4HQSA 3NOFA 4PNFA 2LV3A 1V58A 1V2AA 1Z5YE 2C0EA 2A2SA 1TJDA 4ACSA 1B48A 5G1KA 4N10A 2B6MA 2MMNA 4QQ7A 3GURA 3M9JA 1R4WA 1AQVA 5ID2A 4G19A 3QCPA 5IIZA 4KUNA 3KH9A 4QL9A 2IMKA 4RI6A 1PQNA 3GNJA 5ECPB 3QAGA 3FZ9A 2TIRA 3F4TA 3C1SA 4F03A 1X5DA 4IVFA 4N30A 4TR1B 3GUSA 4K0GA 3RPPA 5KN3A 4KH7A 1UA5A 1XPVA 3ME8A 2JZSA 5C04A 1ML6A 4ZB6A 2N5AA 3UARA 2WCIA 1XWCA 3HZ4A 1Z9HA 4TVEA 3D0ZA 4XTSA 4PXOA 3VI7A 1R5AA 2FWHA 1FHEA 4MJAA 5B8BA 1GSFA 4TXVA 1AIUA 3C1RA 5H5SA 4ECCA 5CO3A 3DEXA 2F8AA 4MF6A 4JE1A 3DMLA 2ON5A 2XBQA 2R3XA 3GIXA 1PX7A 3WD6A 1X9SB 1SKWB 3KTLA 4YQUA 3L4NA 3UIWA 1B8XA 4I8BA 1G6WA 2IMDA 2C3QA 2JADA 1YF1A 4WBRD 4XCSA 4ZL9A 4WKWA 2P0GA 3LSZA 3DVXA 2LQOA 1EEMA 1Z3EA 6GSWA 2H1GA 5ECHB 4GWRA 3H4KA 5DALA 3WYWA 1TI1A 20GSA 2YZUA 1OAZA 1O8XA 5LCZA 4RUVA 4D73B 4ECIA 3L9SA 2QSIA 3N9JA 2VCVA 3NZNA 2VL9A 4HU9A 1THOA 1FVKA 2HLSA 5E59A 1FB0A 1GTIA 2P5RA 1KEBA 1EV4A 1S3AA 2YZHA 1GL8A 2R2JA 1XWKA 4EL1A 1PKWA 1K0CA 3HJMA 2H0GA 3TRQA 2CVBA 1A2JA 3ZVJD 3DRNA 1PA3A 6GSSA 2C0GA 2O85A 1CQHA 4MH2A 2L6DA 4MZBA 2GT6A 1MEKA 2A2RA 4F82A 2H19A 2VLTA 3FRCA 2YANA 1TP9A 2E7PA 1R7HA 3M8NA 4ID0A 3ERFA 4K6XA 3FW2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite