3TKSA

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 in three different redox states
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
197
structure length
196
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Peroxiredoxin-4
total genus 63
structure length 196
sequence length 197
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tksA00
1V9WA 3WGXA 4X43A 2MZCA 1NSWA 4KDXA 2JZRA 2FWGA 2L6DA 2YANA 3KEBA 1XXUA 1ZGNA 1K0OA 2P31A 1Z5YE 4IW9A 5KN2A 3C1RA 4K8MA 5IM9A 1TDIA 1OAZA 2GS3A 4GSTA 1YKCA 4JE1A 2WULA 3EC3A 5DVBA 2WDUA 5H5RA 1TXXA 3BCKA 2ALBA 4RQRA 3ZIVA 3N5OA 2IJYA 3DMLA 1NHOA 3H8QA 3ZYWA 1U87A 2LEGA 5B6NA 2H01A 2X99A 3D5JA 2VL9A 1VF1A 3M9KA 2RM6A 5ECHB 4V2MA 2I3YA 4IJIA 4K0GA 1OE7A 1IYHA 3VPQA 5IO0A 1T4ZA 1GULA 4JR4A 2G0FA 4OFMA 5KEJA 4WR4A 4MCUA 4TKYA 2DC5A 2P5RA 3FHKA 3QOUA 3Q19A 1BG5A 1VRSD 4Q5QA 4O5RA 3TKSA 2VCVA 2V1MA 1OKDA 4TVEA 1TU8A 5DQYA 4ECJA 5GSSA 3IPZA 2C3TA 4D73A 2IMKA 2H0HA 5F05A 4HZ4A 5DQSA 1R26A 2VCXA 3HCZA 1TK0B 1O6JA 3AY8A 2LRTA 3KCMA 3EINA 1QUWA 2OACA 3QFBC 3TRXA 2CVKA 1U6TA 2KP2A 2H0IA 3TKSE 1N2AA 4KAEA 1WWJA 4L5LA 1NW2A 3I69A 2R37A 4KSMA 2VCZA 2H30A 2PVOC 2H1GA 3KIJA 1YJ6A 4KCEA 1LJRA 5J4UA 4K0NA 4ZBBA 1GWCA 2LQQA 1T7PB 2RUEA 2GQMA 4HS1A 4XS4A 3WT1A 2HZEA 2ON5A 3ERFA 3RHCA 2LQOA 1PA3A 2H76A 3IDVA 1KEBA 3A5WA 5ECNB 2HLSA 3KMOA 4WEYA 1W4VA 2RIIA 4GLTA 5ENUA 4TW5A 2IIYA 4G19A 2OE0A 1ACVA 2CVDA 2KHPA 5DBQA 4K2DA 3CTFA 4TXOB 3UIWA 4Z7XA 5ECRB 5A4VA 2HXKA 2PVQA 3GTUA 3VI5A 1TRWA 2D2ZA 2B3SA 3VK9A 1X9MB 4LL4B 4F2IA 1SK0A 4JZQA 5IMCA 3GL3A 1AIUA 1PSQA 2GLRA 5HR1A 3HYPA 3CSIA 5J5NA 4KUNA 3TJFA 3DKSA 1TI1A 2XBIA 2E2MA 3LXTA 3MSZA 4OO4A 4EVMA 1TP9A 4NMUA 1MTCA 2VLVA 3QAGA 5E4WA 3E9JB 3KGKA 2ZCTA 1Q4JA 2EC4A 4WXTA 4JU5A 1WP0A 2FD3A 5DALB 2H6XA 4OD7A 4V1Ag 2JACA 1TKDB 4I97A 1B4PA 3ZVJA 3S9FA 4EL1A 2OE3A 4V2LA 4MPFA 3ME8A 3TJJA 3L78A 4HDEA 4F82A 5B8BA 1TU7A 5GAPD 1EP8A 3DVWA 2HZFA 2HE3A 2YP6A 5D96A 1B9XC 4PGTA 1FVJA 2YWOA 4WBJA 1Y25A 4WBRD 1X9WB 3G9BA 4PNGA 3TJGA 3TOTA 2X8CA 1F37A 3FZ9A 2VIMA 3CTGA 3K8NA 3CSHA 4AF2A 3TKRA 2DJJA 4MDCA 2MMZA 3DXBA 11GSA 2VM1A 1RK4A 5DAKB 2H6ZA 4EE0A 2ES7A 2C3NA 4FO5A 4IQ1A 3C1SA 1GUKA 4JR6A 1LBKA 4MZWA 2BJXA 1SK1A 4ZL9A 5B7CA 1K0AA 4Q5FA 1TI3A 2HRNA 5IMAA 1R5PA 5COHA 1ERTA 1J0FA 1GTUA 1S3AA 4ML1A 2YV7A 2YJ7A 1O81A 1OC9A 3TJKA 5B8AA 1BYEA 2QC7A 4KGIA 3IRAA 3EE2A 2J9HA 2JZSA 2YOIA 3M9JA 2F9SA 4ZB8A 3DIEA 1AW9A 6GSXA 1EV9A 5ECOB 4HEA2 5CREA 1Z6NA 3P2AA 1Q98A 2KLXA 5LCZA 5J41A 2PBJA 3FKFA 1F6MC 5EVOA 3KP9A 3M0FA 2V41A 5CNWA 2JU5A 1VGLA 2HNLA 1KNGA 3TUEA 3UJ1A 2KUCA 3TKQA 1PL1A 4Q5RA 1HQOA 2L5LA 2F8AA 4EUYA 4ZXGA 1B9YC 3GKMA 3L4NA 1Y6EA 4ZB9A 3GSSA 1FB6A 4MF7A 4RUVA 4X1UA 1PKZA 1VF3A 2WB9A 2PMTA 2H6YA 5AIVA 3ZMKA 2VUPA 1B48A 4F0BA 4BVYA 4POBA 1XBSA 3V1WA 2L4QA 20GSA 1ZCPA 1XPVA 2JSYA 3W8SA 3KTLA 3ZFLA 2O85A 4XRAA 3E0UA 4HUAA 2LNTA 1G7OA 1SL2B 2DLXA 3TKSC 3D4TA 5CYYA 5ELAA 3R2QA 1TW9A 2CZ3A 3C7MA 1TOFA 4WR5A 4MJCA 3GURA 3D4MA 3ZVJD 3TB2A 1ZOFA 2C3QA 1JZOA 4RI6A 1GUMA 2JL4A 3F6FA 1T1VA 5EPFA 3LQ7A 3TDGA 4LL1B 1GTBA 1BJXA 1EGRA 4MPGA 4MZCA 3ZZXA 1GNEA 4LMWA 3DRNA 2RM5A 2EIQA 5KN0A 5JWQB 4RI7A 2HT9A 4GRFA 1CQGA 2GQLA 4MZBA 1BQ7A 3FK8A 3IK9A 2YCDA 1UVZA 3F4TA 6GSSA 4NHZA 4HJ2A 3C71A 2B5YA 2P0GA 3IBHA 3ZREA 3EU4A 4BL7A 1ST9A 1G6WA 2FWEA 2GSQA 4DVCA 3KXOA 1BEDA 4BA7A 2YWMA 1E6BA 1W89A 2DJKA 2X8HA 3DVXA 4IVFA 3N9JA 5FT3A 3APSA 4F0CA 5G1LA 3FW2A 4K7OA 1R4WA 5H5QA 3TOUA 3WGDA 1CQHA 6GSYA 3SBCA 4PURA 4K7IA 1GH2A 1H4OA 1ZZYA 2MBTA 2A4VA 5CAXA 5HR2A 3TRPA 4QL7A 3I9V2 3VLNA 1WIKA 2KP1A 1B8XA 4OMVA 4ILFA 4N0ZA 3H4KA 5D9WA 2C1YA 4OFNA 4BWQA 1VF4A 3H93A 3MWHA 3HVVA 4MABA 1I5GA 4EC0A 1A8LA 3Q18A 2B6MA 4CHSA 5HR3A 4K1FA 2H70A 3GIXA 3F9UA 3A3TA 3EMPA 1T00A 2QGVA 1MDIA 4TR1A 17GSA 3UVHA 4NXIA 2V6KA 3H1NA 4NPBA 3IA1A 4FYUA 1JZWA 2B5XA 3LYPA 3QFAC 4BWSA 4X0XA 1ZYEA 2GVPA 4AJ6A 2C0FA 2H71A 2K8VA 3U6VA 3Q74A 4K9ZA 3ZFBA 5DCGA 3VURA 4XRDA 1O85A 2LS5A 3HA9A 5L71A 4OFTA 2IMEA 1X5CA 5CRHA 1JLVA 3KH7A 3VWUA 1URMA 3ERWA 3HHVA 1GTIA 2ZUPA 3L9VA 3KJYA 4EDZA 1OC3A 1A2JA 2LUSA 4WKWA 1ZL9A 1DSBA 1GSSA 1K0NA 2A2SA 2E7PA 3Q6OA 2VOCA 2PUKC 2LV3A 4J57E 4Q5NA 1TTZA 1KBNA 4XHMA 2GGTA 3NOFA 3FZ4A 2JADA 4KDUA 1SD8A 1A2MA 2OBIA 5G5EA 3IE3A 1SL0B 3GKNA 1TRVA 2TIRA 1RQMA 4GCIA 2VD1A 3A2WA 1HNBA 1KTEA 1AQWA 2DJ2A 3GYKA 5CP1A 1TJDA 1ON4A 5HQPA 5J9BA 2VLUA 2YWIA 3LG6A 18GSA 2K9FA 1GLPA 3CXGA 2QSIA 2VO4A 3TKPA 4XTSA 2FUG2 2IL3A 2N5BA 3UMAA 3IV4A 3J7Yb 4D73B 1XOBA 1SKSB 1OYJA 5DJMA 1X9SB 3QDNA 1MD3A 2GTUA 3UAPA 4POMA 2R4VA 3FZAA 1GNWA 1EEMA 2LJAA 4GSSA 3GHAA 2NDOA 4GSNA 3IHQA 1G0TA 3BOAA 2YZUA 1F3AA 4I5QA 2OJLA 5IQYA 3LSZA 10GSA 3HKRA 1YY7A 2M72A 1GSEA 3W8JA 1Z7PA 3VPTA 2JZTA 4YQUA 3W6GA 5ECMB 3ERGA 3QAVA 3F3QA 3LORA 4ISDA 5ECSA 4N10A 1AUCA 2PWJA 1M7TA 5IIZA 4GWRA 12GSA 2LKUA 4XS4B 3BJ5A 3FR3A 5AN1A 2OA7A 3D21A 1GUHA 1PL2A 1SJ6A 2DMMA 2VM2A 2ON7A 4NV5A 1TRSA 2M80A 3ZLPA 3UL3A 1ERUA 4WF4A 4N11A 3DWVA 2GSSA 1PRXA 3QR6A 3HJMA 3FYGA 3MDKA 3QCPA 3RAZA 1GTAA 1ERWA 2CV4A 1EP7A 4EDYA 3PGTA 3TRQA 4FIWA 1F2EA 5DAKA 2FCHA 2PGTA 4HU7A 3P90A 1E2YA 4ZILA 3QD9A 4OCEA 1S3CA 2F51A 13GSA 3UARA 1EOHA 5FHIA 2LRNA 1QGVA 2X8GA 4OCFA 4L8EA 4N30A 4ECIA 3F0IA 3LGCA 1PX7A 3ZRDA 3WGEA 2WRTA 1XOAA 2H73A 3HVSA 1PD21 5CRDA 2FA8A 5IOWA 2X64A 4G2EA 1JLWA 5JCGA 1XIYA 2MYGA 3RPNA 1O7UA 2IWTA 3JCML 3HVXA 3LYKA 4HQZA 2CX3A 4OO5A 1A24A 4YQMA 1BAYA 2IMDA 3HY2A 4DSSB 1FG4A 4IP6A 2MMOA 2XC2A 1XFLA 2GSTA 3QMXA 2V32A 2CVBA 1K3OA 22GSA 5H5SA 4KA0A 1Z7RA 3ZITA 2IPAA 3FR9A 3MNGA 5ECQB 1MDJA 3GUSA 5ID2A 3FY7A 1NM3A 3CSJA 4MA9A 2EIOA 5D8IA 1DBYA 4LA1A 2HI7A 3GKXA 1A8YA 4KNDA 1DUGA 1JFUA 1SL1B 3M8NA 3PINA 2HYXA 4LMVA 4AJ7A 2BTOT 4MF5A 3KM6A 1TRUA 2GT5A 1J08A 4IHUA 4E8HA 1WRYA 4MH3A 3KTBA 3VWXA 1Z9HA 1GSFA 2K18A 3UBLA 1JZRA 3GSTA 1FW1A 2H72A 1M9AA 4V2NA 5D93A 3DGQA 3IC4A 1YEPA 1XWGA 4IBPA 4KH7A 5HR0A 3E3EA 2VAFA 4G9HA 4QL9A 4FYCA 1OE8A 2H8LA 2IFQA 2B1LA 2VCWA 4GQFA 2H1BA 2M46A 1ZMAA 4AGSA 2FA4A 1XWAA 1V40A 1ZYQB 1MDKA 5D73A 1GLQA 2L6CA 1QMVA 1BX9A 4I8BA 1SENA 2WFCA 4TR0A 3TJBA 3FEUA 4F9ZA 1PMTA 3CRUA 3IOSA 2G2QA 2GQKA 2PN8A 3GX8A 3US3A 4LLRA 4BVXA 3NIVA 3PR8A 2PERA 3HXSA 4TR4A 2C4JA 4HOJA 4WF5A 3TCOA 2H74A 2AYTA 2WJUA 3UOMA 2OADA 2H1DA 3EYTA 4AJ8A 4G10A 5AISA 3F3RA 2A2RA 1SU9A 2I81A 4GF0A 2Z9SA 1IYIA 4IN0A 1EV4A 3GNJA 1AAZA 1GRXA 3L0HA 3I43A 3O3TA 3APQA 4XS1A 2H1AA 4FYBA 1PKWA 1UN2A 3U5RE 3ZTLA 3D0ZA 5LNKe 4L0WA 4IGJA 2WS2A 1X5DA 1M0UA 4MMMA 2VL2A 3O76A 4TRXA 4KX4A 2N5AA 1A2LA 3HZ8A 1WPIA 1V58A 4V1Ap 4K7NA 6GSWA 3EURA 3ISOA 5JCWA 4TN8A 2MMAA 4ML6A 5IPGA 1C72A 4K6XA 2OE1A 1DE2A 4J2FA 1FB0A 1YDKA 3RBTA 1SYRA 4KSOA 2HFDA 5G31A 4NV2A 2AUVA 2GSRA 1THOA 3WT2A 1A23A 3IXRA 2CX4A 4XCSA 2GZZA 3GRXA 5IPHA 2RUFA 5HFKA 2B7KA 1XW6A 4KCAA 1XW5A 3LJRA 1V2AA 3UVTA 7GSSA 2F8FA 4KE3A 5B6MA 4ULXA 2YNXA 3O6TA 5ABRA 3KP8A 3CMIA 3LWAA 4RQXA 3G7JA 5F07A 2LNSA 3MAKA 4J56E 2HRFA 3GN3A 3RPPA 4MF6A 2O8VB 5F8BA 1YEXA 2WGRA 4H86A 4OWYA 3KH9A 1ABAA 2J23A 4BPYA 1YQ1A 4EXJA 5ECIB 2PU9C 3F4SA 4HU9A 4KW6A 4YAVA 5AIXA 5ELGA 3L9UA 3LFLA 5DJLA 2CAQA 3LXZA 4PQHA 4PXOA 2VCTA 1EWXA 1YF0A 1EZKA 1HYUA 2K8SA 4ZIJA 5HFIA 2TRCP 3KMNA 3HDCA 2V2GA 3DYRA 1DE1A 5AGYA 1M2DA 4O7HA 2YV9A 3FZ5A 2XBQA 3GH9A 2NVLA 1ERVA 1EEJA 3APOA 1GSUA 5DDLA 3GKKA 2DJ1A 4MP4A 4ZL8A 2NTOA 4TR1B 1GL8A 4MJBA 1EOGA 1JZDA 4HJMA 4ZBAA 1GSYA 3P7XA 2C80A 2LTKA 4KDYA 2XHFA 5G2ZA 2YWNA 1SK2A 2I9HA 1FO5A 2E0QA 4PQ1A 1M99A 4TXOA 4MJEA 2C0GA 1TK8B 5F06A 2NPBA 2P5QA 2C8UA 1JHBA 2R2JA 1YF1A 3GH6A 4ECBA 5D9VA 4PQIA 2MMNA 2ZNMA 5IOXA 2GZPA 2DJ3A 14GSA 4IELA 4O32A 3GV1A 4O92A 3NZNA 3CYNA 4TOPA 1XCCA 2NBSA 5KN1A 2OKAA 3VI7A 3CBUA 5CRGA 5A5KA 4EKZA 1THXA 4DSQA 1QXHA 1RW1A 2LJRA 2E2GA 1QQ2A 5DALA 3CRTA 3UEMA 3D6IA 1HNCA 1K3YA 2R3XA 1H75A 3PH9A 4POKA 1M9BA 2HSYA 1SJIA 1GSDA 1VF2A 4L5OA 2HZEB 4ACSA 1K0CA 3EU3A 1I9DA 4E8EA 3RHBA 1Z6MA 4PUAA 5CRWA 2CQ9A 1XVQA 4FH8A 3ME7A 3BCIA 3KZQA 3WD6A 1OC8A 1F9MA 2IMFA 3F6DA 3A2VA 6GSVA 1J9BA 1GP1A 1PN9A 2WZ9A 1SJZA 5GAND 5J3RA 3RDWA 3QAWA 1A0FA 5G30A 2WCIA 2H19A 8GSSA 1FVKA 2AB6A 3HZ4A 3GTUB 1WE0A 4TR3A 1R5AA 1K3LA 1XWCA 4HZ2A 2CAIA 3P8WA 4N0VA 2N5FA 2LJKA 4DSSA 4IP1A 6GSUA 3J7Yk 1K0BA 5C04A 4NHWA 1OKTA 4CW9A 3EVIA 5IMFA 1N8JA 3IK7A 5KN3A 4ZB6A 4IQAA 2XPDA 4YQVA 2GT6A 1PGTA 1XWKA 5ECKB 4HQSA 5FWGA 2H66A 4POLA 5ECPB 1EGOA 4GTUA 1PQNA 3G7YA 1WOUA 2V6OA 3EMXA 3ZMLA 4IS0A 4JEDA 3VFIA 2BMXA 2H75A 5IMZA 5IMVA 5EL8A 1LU4A 4MJAA 1K0MA 9GSSA 3BD2A 1AQVA 4EF0A 2IMIA 2FWFA 3HD5A 2JSZA 1ML6A 2FGXA 2VL2C 1O8XA 1WJKA 5JWRB 1XZOA 2MBSA 2R5GA 1XVWA 3F4RA 1F3BA 4DEJA 2VD0A 5D9XA 2YN1A 5JWOB 19GSA 4GXZA 1FOVA 3HJOA 4YH2A 1X0RA 4KB3A 1UA5A 2CZ2A 2L59A 2I4AA 3DD3A 2CA8A 2VCQA 1T4YA 1XW9A 2VLTA 2XPEA 3BBYA 4ZBDA 2AAWA 2GZYA 3KD0A 2KOKA 2L5OA 3C8EA 2DIZA 2DJ0A 2I1UA 4PNFA 1MEKA 2DIYA 3GFKA 4IKHA 5LD0A 5G1KA 1FHEA 2FHEA 2AV4A 3LEFA 4YAPA 1QFNA 1V57A 1GSQA 5F0GA 1M2AA 3M3MA 3VWWA 4ID0A 3I6AA 2AJQB 5ID2B 1G7EA 1OC9B 2O7KA 1MD4A 3G7IA 3VWVA 4QQ7A 3D22A 3EWLA 5IO2A 1SYXA 4EO3A 4GQCA 3A2XA 3ZIJA 6GSTA 1V98A 4XS6A 2OBKA 1PX6A 5DCHA 5A4UA 2TRXA 3C73A 2O89A 1U3IA 2EIRA 3GL5A 1AC1A 1YZXA 1S3DA 2REMA 4L0UA 4MH2A 1USBA 4F03A 3FRCA 3H79A 4JRRA 4PUFC 5IMDA 5A4WA 16GSA 5GZZB 1B4QA 2FLSA 5G5FA 3GX0A 4WETA 1NHYA 1X5EA 4PX1A 1M2BA 2DBCA 3F63A 2C0DA 2B5EA 4I6XA 4CDOA 2YZHA 2RLIA 1XWBA 3GMFA 3UBKA 1SD9A 1U3AA 2IFQB 4JBBA 2L4CA 1O73A 1AXDA 2LSTA 2YJHA 1G6YA 3IR4A 3TGZA 2CT6A 1R7HA 3OR5A 1FAAA 4TXVA 4DSRA 4NWYA 1ILOA 2FNOA 2AHEA 4ZL7A 2B1KA 1U88A 1O8WA 1A0RP 2HSHA 5D9TA 4HI7A 1SKRB 4NAXA 1QK8A 2VL3A 2DMLA 2YPMA 3IAS2 1OVNA 3DEXA 3F8UA 5ECLB 3FR6A 4P3YB 2O87A 2L57A 1TK5B 2F3MA 3ZL5A 2GDRA 1AQXA 1K0DA 2IN3A 5J9CA 3WYWA 1UC7A 4ECCA 5CO3A 2FWHA 5GSTA 4I2TA 3SWLA 3QPMA 1T8EB 2B7JA 5E59A 3M1GA 5HFGA 1HNAA 5C00A 4MLYA 3L9SA 4I2UA 4XIHA 2C0EA 5INYA 1YKAA 3GA4A 2PPTA 2QKEA 2H0GA 3ED3A 4IJ3A 3IAM2 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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