3TKSA

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 in three different redox states
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
197
structure length
196
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 63
structure length 196
sequence length 197
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tksA00
1NM3A 4WXTA 1GSSA 3UEMA 2K18A 3L4NA 2HYXA 2PU9C 1YY7A 4D73A 3O76A 1SJZA 2IMDA 2X8CA 5COHA 2KLXA 2MBSA 1SK1A 2OACA 2DJKA 3TJJA 4ILFA 1DSBA 5IMVA 1TRVA 2NTOA 1ABAA 3EINA 4KDXA 5DQSA 3EMPA 3TDGA 1THXA 3L9UA 4ZIJA 1A0RP 2KOKA 4QL7A 2VLVA 4DSRA 2B5EA 2I3YA 3GA4A 1OE8A 2L57A 1TP9A 1YEXA 3U6VA 1T1VA 1BEDA 3GH9A 3KTLA 4POBA 2C0EA 4O5RA 1RK4A 4J56E 5INYA 2HSYA 4AGSA 3KH9A 3ZVJD 5IOXA 1TKDB 1N8JA 3TKPA 3H1NA 1A8YA 3CRUA 4F0CA 4N0ZA 3HD5A 2HZFA 4LLRA 3TUEA 3U5RE 2VO4A 4TR4A 1HNBA 1C72A 2PWJA 1XBSA 2GQLA 1ZZYA 1URMA 5FWGA 4XRDA 4TN8A 2J23A 1R5PA 2YNXA 2AB6A 3SBCA 4LMWA 5DQYA 4EDZA 3SWLA 3E9JB 1JLWA 3ME8A 4IQ1A 3GNJA 3N5OA 1YQ1A 4WF4A 2C3TA 2R2JA 4MCUA 3KGKA 1EV9A 4V2MA 1O85A 4MPGA 1GLPA 2CVDA 1K3YA 1ACVA 3ZIVA 1CQHA 4MF7A 2DC5A 2C3NA 2H6YA 1GSYA 3EC3A 3QCPA 5HR3A 5ID2A 1Y6EA 3DYRA 2GSQA 5ECOB 4GCIA 2WFCA 1O73A 2JACA 4I8BA 2R6KA 3GKKA 3ME7A 2GQMA 3EVIA 1Z7RA 2YZHA 2YWNA 5DALB 4YQMA 2GZPA 1V40A 5J9BA 2VLUA 9GSSA 4HZ4A 2CA8A 3P7XA 4ML1A 1FAAA 1XOBA 3FR9A 3IE3A 3QDNA 4JU5A 2ON7A 4FYCA 1HYUA 1OYJA 2PN8A 1MDKA 3KD0A 2MZCA 2CX3A 2TRXA 6GSXA 5ECIB 1K0BA 4BVYA 4NAXA 1TRWA 2LJKA 3VWUA 2L5LA 3Q74A 5G5EA 3G7IA 1W89A 3BOAA 1U87A 4K0NA 4AJ7A 6GSSA 1G6WA 1XWKA 1GNWA 2VL2A 1GL8A 2XHFA 3PR8A 1QUWA 4KE3A 4PX1A 2H6XA 2N5BA 2LRTA 1IYHA 4HU7A 7GSSA 2YV9A 1QMVA 4PUFC 5D9WA 4DVCA 3LWAA 3M9KA 1YF1A 4EKZA 2RM5A 2PVOC 3J7Yb 2MBTA 3A2VA 1X9WB 1G7EA 1X0RA 1GTUA 5GZZB 1PN9A 3MNGA 2H8LA 2HE3A 2GZYA 3CSHA 1LU4A 1ML6A 4ZB8A 1USBA 5ECRB 4PQIA 1PD21 1E2YA 16GSA 5D73A 5IMDA 3LXZA 4IW9A 2WB9A 4LL1B 5FT3A 1A8LA 2HFDA 5ELGA 4MJBA 4XS4A 1XW6A 1VGLA 4MP4A 1TRUA 4AJ8A 2IJYA 5ECQB 2FWFA 3IV4A 4MJCA 4RI7A 4MMMA 1M0UA 1A24A 1Z6NA 2PMTA 5F0GA 2G0FA 1V9WA 2FWGA 4G19A 3BCKA 1SKSB 4I5QA 5ECKB 2O85A 3LQ7A 1OVNA 4HS1A 2FUG2 1SENA 5G30A 1UVZA 3WYWA 2P0GA 2O7KA 2YWOA 1R4WA 1TI1A 2DJ3A 1KNGA 2FWEA 4MPFA 2FCHA 4GSNA 1OE7A 2ZNMA 4JRRA 3ED3A 2GZZA 4K7NA 1T8EB 3E3EA 1UA5A 1H4OA 1ST9A 1B9XC 2DBCA 1XZOA 3FZ9A 3IAM2 3VFIA 1GSFA 4YAPA 4IGJA 6GSYA 2LSTA 2O87A 1SKWB 4HDEA 1GLQA 2CVBA 4V2LA 1FHEA 1OKDA 1OC9B 5CYYA 3D4TA 4ML6A 1TK8B 1GSUA 5LNKe 1XVWA 3IA1A 5C00A 3D5JA 1VF2A 1M9BA 4L0UA 3Q18A 3MWHA 3HZ8A 4ECBA 4F82A 5CREA 2GLRA 3NIVA 3M1GA 4IVFA 2CQ9A 3WT2A 2HI7A 4OMVA 5IMCA 2YN1A 3ERFA 4IS0A 1X5DA 4EUYA 2ZCTA 2ALBA 4TRXA 4TR1A 5A4UA 2R37A 3W8SA 3VURA 3IPZA 3ZREA 3V1WA 4HEA2 2I1UA 1XWBA 1J0FA 2M72A 3O3TA 4EDYA 3C71A 3LFLA 2PGTA 1K0MA 3L78A 4GF0A 4ZL8A 1OAZA 1SYXA 2LV3A 3RPNA 3LEFA 2JU5A 2PVQA 3KJYA 3ERGA 1XWAA 4XS1A 1XW5A 3GSSA 5IM9A 4PURA 5CO3A 5HR1A 4KCAA 1DE1A 4K2DA 2B1LA 4PUAA 4KH7A 3ZIJA 1M9AA 1X5EA 4EVMA 5ENUA 3RDWA 4OFMA 3ZLPA 4V1Ap 4ZBAA 3FEUA 1J08A 4MABA 2P5RA 3P2AA 1EZKA 1F3AA 4FO5A 4OFNA 1BX9A 3F3QA 1Y25A 2PERA 4OCFA 2WZ9A 2IIYA 1DE2A 4OWYA 3BD2A 4OO5A 2IPAA 5LCZA 2GTUA 2YWIA 5H5RA 3PH9A 1K0OA 1Z3EA 1IYIA 3GV1A 4E8HA 5FHIA 2HT9A 1EEJA 5ELAA 3HA9A 1TOFA 3GRXA 3LG6A 4O92A 4TR1B 3LORA 10GSA 1XVQA 2HXKA 4V1Ag 3BCIA 3JCML 2WJUA 5JCWA 3C1SA 1AQWA 3IR4A 3VPTA 1ON4A 2N5AA 2GT5A 2TRCP 2R3XA 3VWXA 3CTGA 2IMKA 2V1MA 4KGIA 4Z7XA 3D6IA 3KM6A 2GT6A 2VLTA 3GUSA 4TXOA 2K6VA 3DD3A 1F3BA 3KTBA 3KCMA 3TKRA 5DALA 2H72A 1O6JA 1EOGA 1A23A 4GTUA 2J9HA 3G7YA 2KHPA 3KP8A 3FR3A 5GSTA 3CSIA 3K8NA 3P8WA 2I4AA 3UJ1A 4EE0A 2FD3A 3GYKA 4L0WA 1F9MA 3ZL5A 1NSWA 1VF4A 2VCWA 5E4WA 4KSMA 2PBJA 1K0DA 5HR2A 2AHEA 5A5KA 1YZXA 1TW9A 2YPMA 2L4QA 4E8EA 4GSSA 3GKXA 3IDVA 2XPEA 3TKSE 4H86A 2BMXA 3ZITA 1FG4A 3TRPA 1BJXA 2DIYA 3CRTA 3DRNA 3A2WA 4POLA 2N5FA 4JR6A 2NVLA 4ID0A 3GKNA 2O8VB 1A2MA 2G2QA 2YCDA 4JE1A 1M2BA 2F8AA 3ZFLA 5J9CA 2X64A 2YV7A 6GSTA 3QAWA 3IK9A 3BJ5A 2GDRA 4XCSA 1SKRB 4OCEA 4LA1A 3WGEA 1JZDA 5F07A 3RBTA 2C80A 4ZB9A 1EGRA 2HLSA 4X0XA 3EWLA 4K6XA 4WR5A 2WRTA 3UBKA 4TXOB 4NV2A 1S3CA 4F2IA 2VL9A 5GAPD 1PSQA 3F3RA 4HQZA 2VCVA 4K9ZA 2H74A 4ISDA 2QGVA 5G1LA 1SYRA 1PGTA 1H75A 5IMFA 4IJIA 1Z9HA 2NBSA 3M3MA 4KNDA 1V58A 1G7OA 4MF5A 4KUNA 2LJRA 4YAVA 3ZVJA 3GX8A 2V6OA 2OADA 2FWHA 3RHBA 2HZEB 1SJ6A 3TOTA 5LD0A 4XIHA 1ILOA 2IWTA 3I9V2 4WR4A 4N11A 3FYGA 2CVKA 5IPHA 1XIYA 3H93A 4XRAA 3GL5A 1DBYA 3CXGA 3ISOA 3UMAA 2F51A 5EL8A 5AIVA 1Q4JA 1FW1A 4X43A 3N9JA 1O7UA 4J57E 2MMAA 1XWGA 2MYGA 4POMA 1BG5A 1U3AA 2GS3A 1ERTA 4MH3A 3FR6A 2E0QA 1M2DA 2VL3A 1EWXA 3D22A 5EY6A 2QSIA 5E59A 1RW1A 2EIOA 3F8UA 13GSA 2FLSA 3G9BA 2KUCA 3LYKA 2WDUA 3HHVA 3L9VA 1R5AA 3LGCA 5KN1A 5A4VA 2X8GA 5JCUA 1ERWA 4DSSA 17GSA 3AY8A 3FRCA 3M9JA 2QC7A 4K7OA 3QAGA 3FZ4A 4FH8A 2H71A 1OC9A 2MMZA 2WULA 1GULA 1M7TA 1DUGA 2L6DA 5ABRA 4Q5QA 1KTEA 1OC3A 2CZ3A 1VF1A 2X8HA 3KXOA 4RQRA 6GSUA 2C0FA 2IN3A 3RPPA 4IHUA 4AJ6A 2DJ0A 2REMA 2IL3A 1TK0B 4G9HA 3MDKA 4WBJA 2MMNA 5KN2A 3GHAA 2VIMA 3LXTA 3GFKA 3HYPA 2FGXA 1MD3A 2GSRA 2VUPA 4BVXA 5B6MA 2YP6A 5D96A 1VRSD 2I9HA 5EVOA 2K9FA 4LL4B 5ECHB 5D9XA 2OBIA 3VI5A 4ULXA 1GUHA 2O89A 1FVJA 1EEMA 3C1RA 1PX6A 5A4WA 5IIZA 1MDJA 1WP0A 3PINA 4RI6A 1VF3A 3UL3A 5J41A 2P31A 1TJDA 1K3LA 1ERVA 3UAPA 4JBBA 1JZWA 2R5GA 4MZBA 1TXXA 3TOUA 4PNFA 1WMJA 4F03A 2F9SA 2LRCA 4RQXA 5KN0A 1TU7A 3ZZXA 5DBQA 3TGZA 4IELA 1SL1B 2F8FA 3Q19A 2YANA 5AGYA 3HJMA 1I5GA 1R26A 4K8MA 2DIZA 6GSVA 2ZUPA 3A2XA 1K0NA 3WGDA 2NPBA 1HNCA 3GX0A 2A2RA 5G1KA 1GTAA 2A4VA 4MK3A 2OKAA 1GWCA 4OO4A 4EC0A 4BWQA 2KP1A 1THOA 4TW5A 1ZCPA 2CV4A 3ZMLA 2VL2C 4DSSB 11GSA 5EPFA 1GRXA 5JWOB 4NHZA 2C4JA 3ZRDA 3RHCA 1GUKA 1FB6A 1BQ7A 1SJIA 1K3OA 1YF0A 5IO0A 2LKUA 4I97A 2ON5A 3UBLA 1T4ZA 3A5WA 1B4QA 2VD1A 3QPMA 4EF0A 1HNAA 4ACSA 1EGOA 4XTSA 2EIQA 4AF2A 3L0HA 3DXBA 1KBNA 4HUAA 4O7HA 4MZCA 4G2EA 1HQOA 2RUEA 1BAYA 3NOFA 4MF6A 1ZMAA 6GSWA 5AIXA 3QFAC 2YJHA 1O8XA 3UVHA 1XWCA 5DAKB 18GSA 2VCZA 3CYNA 4NPBA 2DMMA 2VD0A 2D2ZA 2HSHA 5J4UA 4F9ZA 1ZGNA 4TVEA 1AQVA 4J2FA 4MJEA 3C73A 2HNLA 1Z6MA 4K1FA 3FKFA 1XXUA 4ECIA 1JZOA 4FYUA 5JCGA 3WT1A 4TKYA 5B7CA 1F2EA 1B9YC 4BPYA 5B8AA 2B5YA 1A2JA 3IAS2 2IMEA 4F0BA 3LJRA 2E7PA 2H1BA 3GTUB 12GSA 3UOMA 4Q5RA 3HVVA 5G2ZA 4IP6A 4V2NA 3HDCA 5D8IA 2A2SA 1O8WA 1YEPA 1T00A 2PUKC 3APQA 3M0FA 5J3RA 1JLVA 4ZL7A 4QL9A 1YDKA 1OKTA 4ZB6A 1WJKA 1T7PB 2RM6A 2GVPA 1PQNA 2JZRA 3TRXA 5G31A 5GAND 1QGVA 2DMLA 4MA9A 4YH2A 4NHWA 2CAQA 1PX7A 2JZTA 1MEKA 4TR3A 2AV4A 3FW2A 4MZWA 2DSAA 2MMOA 1J9BA 1JZRA 4ECJA 4G10A 3WD6A 8GSSA 1GUMA 2H0IA 4CW9A 1GTIA 2IFQA 2AYTA 4K0GA 2JSYA 4IJ3A 2JZSA 1XW9A 1OC8A 1Z7PA 5ECLB 1CQGA 4HJ2A 5DCGA 1AQXA 3M8NA 4KA0A 3F6DA 1FO5A 3P90A 1G6YA 4QQ7A 4ZILA 3W6GA 5D9TA 19GSA 5IQYA 5HFKA 2B7KA 1JFUA 3D4MA 3VI7A 4PXOA 4KDYA 1BYEA 3VWWA 4KCEA 1LJRA 1I9DA 2C0DA 1M2AA 3F6FA 5AISA 3LYPA 2OBKA 3ERWA 3D0ZA 3VK9A 3OR5A 20GSA 3NZNA 3LSZA 4HJMA 3KMOA 1ZYEA 3FY7A 3W8JA 3KZQA 1JHBA 2H1AA 1W4VA 5D9VA 3HKRA 1SK2A 1WIKA 3GKMA 1GH2A 2FY6A 2E2GA 4NXIA 4N0VA 5CRHA 4BL7A 2VM2A 4TOPA 1AXDA 5F8BA 4DEJA 2K8VA 3H79A 1YKAA 2HZEA 4WF5A 3QFBC 5DDLA 2AJQB 3KMNA 2QKEA 2H75A 3QR6A 2FHEA 5DJLA 2OA7A 4YQUA 3TKSA 1Q98A 2P5QA 4GLTA 2RLIA 3IHQA 4MLYA 3HY2A 1AAZA 14GSA 2LS5A 2OE3A 2C3QA 4Q5NA 3DWVA 4IP1A 2HRNA 4O32A 2IFQB 3QD9A 3DEXA 2DJ1A 3MSZA 2C8UA 2EIRA 2YWMA 2M80A 3IC4A 4I2UA 4EL1A 1WPIA 2LQOA 1S3AA 3D21A 3HXSA 5HQPA 1FVKA 4IBPA 4WBRD 3IOSA 5G5FA 1E6BA 1O81A 3KP9A 1PA3A 2LUSA 3TJKA 4MH2A 4NMUA 2H30A 1YKCA 2RUFA 3KH7A 4TXVA 2C1YA 3GL3A 2H19A 2LJAA 3DKSA 1S3DA 1RQMA 1U6TA 1TTZA 2H6ZA 2B3SA 1EP7A 5C04A 4D73B 1ZOFA 2WGRA 2XBIA 3TJBA 1ZL9A 3CBUA 3EMXA 1Z5YE 3I43A 1AIUA 1WRYA 2FA8A 3CTFA 3F4RA 4MDCA 2C0GA 3HCZA 2H1GA 3G7JA 4N10A 5IOWA 3GH6A 4XHMA 4KDUA 2B6MA 1TRSA 1ERUA 2JADA 1V2AA 4PQHA 2L4CA 5HFIA 1MDIA 1QK8A 2KP2A 3IK7A 5H5SA 1GTBA 2BTOT 3DVXA 1QFNA 2B7JA 2EC4A 4GWRA 4DSQA 3TCOA 5B8BA 5J5NA 3R2QA 2DLXA 1T4YA 2LNSA 2LQQA 2LNTA 3H8QA 1NW2A 4PGTA 5H5QA 4WETA 3DVWA 2GQKA 1SD8A 4ZL9A 3TB2A 1F37A 4IQAA 4BWSA 3KEBA 2L6CA 4MJAA 1KEBA 3GIXA 4OFTA 2WS2A 3S9FA 2H01A 3KIJA 3TKSC 1B4PA 4I2TA 4IKHA 2Z9SA 2H73A 3F4SA 1PRXA 4XS6A 1XFLA 2I81A 1K0CA 1AW9A 1WE0A 2VOCA 1PKZA 4RUVA 2VAFA 1TK5B 3I69A 1PKWA 2IMFA 4HI7A 4KX4A 2TIRA 5F06A 4HOJA 1SL2B 5ID2B 4WEYA 1NHOA 3ZFBA 2OE1A 2PPTA 4EXJA 4IN0A 3MAKA 3FHKA 4WKWA 1V98A 1V57A 4PNGA 3EU4A 3HZ4A 2X99A 4POKA 2V41A 3Q6OA 3WGXA 1AUCA 3HJOA 1ZYQB 2HRFA 3DIEA 1K0AA 4L8EA 5B6NA 5KEJA 1G0TA 2H1DA 2DJ2A 3UVTA 3EE2A 5DAKA 2E2MA 2YZUA 3CSJA 4OD7A 5F05A 3F9UA 3E0UA 3GURA 3UIWA 1A2LA 2BJXA 1AC1A 4ECCA 2H70A 4HQSA 4EO3A 4BA7A 1PL2A 5CP1A 2DJJA 2IMIA 1WWJA 1R7HA 2AAWA 3GMFA 1GNEA 4NV5A 1PMTA 1QQ2A 3J7Yk 4JEDA 2VCTA 2JSZA 4I6XA 2LTKA 4JZQA 3UARA 3DGQA 1EP8A 2GSSA 4GQFA 3GTUA 1XOAA 4JR4A 2AUVA 4FIWA 5AN1A 1PL1A 2H66A 3EURA 5CNWA 5KN3A 5GSSA 1FB0A 1UC7A 2V2GA 5D93A 4L5OA 4CHSA 1N2AA 3VWVA 2LRNA 3GN3A 5ECSA 3FZAA 2M46A 2H76A 4KW6A 3TJGA 3FZ5A 3APOA 1MTCA 3A3TA 3F4TA 1NHYA 5IO2A 3HJPA 1U88A 3IBHA 3FK8A 5IMAA 2L5OA 1SD9A 4ZBBA 5DVBA 1MD4A 1YJ6A 4X1UA 1XCCA 5IMZA 2XC2A 3TRQA 2XPDA 3PGTA 3RAZA 2H0GA 3TKQA 4KSOA 2V32A 5CRDA 3C7MA 1TU8A 4N30A 2CAIA 3APSA 2VCQA 3BBYA 4GQCA 1WOUA 2YJ7A 3CMIA 3C8EA 1SL0B 4GSTA 4XS4B 1X5CA 2L59A 1X9MB 2ES7A 4PQ1A 1EOHA 3F63A 5IPGA 4ZBDA 2F3MA 1LBKA 1X9SB 4NWYA 5L71A 22GSA 2LEGA 1EV4A 2CZ2A 5CRWA 4KAEA 2B1KA 5JWQB 2NDOA 1HD2A 2XBQA 2JL4A 5JWRB 1FOVA 1TDIA 2OJLA 3HVXA 4ZXGA 1U3IA 2FNOA 3F0IA 2B5XA 5HFGA 2GGTA 5DCHA 1M99A 1GP1A 2RIIA 4HZ2A 4GRFA 1B8XA 3ZTLA 1QXHA 3VPQA 3GSTA 4K7IA 2VM1A 1XPVA 3VLNA 5HR0A 1T3BA 3L9SA 3QAVA 4LMVA 5CRGA 4HU9A 5DJMA 3EYTA 3QOUA 3TJFA 3H4KA 5ECMB 1F6MC 4P3YB 3US3A 3EU3A 3ZMKA 4FYBA 4CDOA 1SU9A 2V6KA 1UN2A 4L5LA 2YOIA 3IXRA 2FA4A 1B48A 2VCXA 5CAXA 1GSEA 2GSTA 1A0FA 3I6AA 2R4VA 1GSDA 4YQVA 4KB3A 2WCIA 2H0HA 3QMXA 4GXZA 3ZYWA 4Q5FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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