3TUEA

The structure of tryparedoxin peroxidase i from leishmania major
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
GNAKINSPAPSFEEVALMPNGSFKKISLSSYKGKWVVLFFYPLDFTFVCPTEVIAFSDSVSRFNELNCEVLACSIDSEYAHLQWTLQDRKKGGLGTMAIPILADKTKNIARSYGVLEESQGVAYRGLFIIDPHGMLRQITVNDMPVGRSVEEVLRLLEAFQFVEKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structures of the tryparedoxin-tryparedoxin peroxidase couple unveil the structural determinants of leishmania detoxification pathway.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Leishmania major
molecule keywords Tryparedoxin peroxidase
total genus 54
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tueA00
6GSYA 1PA3A 3IPZA 1GNWA 2AAWA 5ECKB 2IMIA 3CMIA 4CDOA 1DBYA 5G1KA 3W8JA 1SKSB 2LUSA 3LORA 2F9SA 4FH8A 1YKAA 2XPDA 4X1UA 3G7JA 3LWAA 1M7TA 3F6DA 2CAQA 1FOVA 3WYWA 17GSA 1SENA 2JSZA 5B6NA 1EGOA 2MZCA 1ZGNA 5GAND 1ML6A 3ME7A 1S3AA 3KGKA 5CAXA 4MK3A 2V2GA 3TGZA 3CSIA 3QOUA 3VPTA 5ECSA 3HVXA 3MNGA 1Z6NA 1X9WB 3LFLA 4YH2A 1F3BA 3WGEA 1XWBA 4JRRA 4P3YB 5EPFA 5ID2A 5D93A 3L9VA 4KH7A 4ZBBA 3U5RE 4F82A 2L57A 4KW6A 5DJLA 1M2DA 4WBJA 1EWXA 2WDUA 4D73B 4HQZA 1WE0A 2GZZA 4N11A 1ZZYA 1UN2A 5AIXA 1GSEA 4K7NA 2FNOA 5HFIA 4TXVA 3KD0A 4OFTA 1K0DA 3GH6A 5HR1A 4F0BA 1Y6EA 3US3A 4MLYA 2VD0A 3FRCA 5IPHA 1B9YC 3HJOA 6GSWA 10GSA 1KEBA 3IXRA 1PSQA 4KE3A 2WS2A 2GZYA 3QD9A 5IMVA 4HUAA 1TK5B 3C8EA 2YCDA 4QL7A 4NV5A 5ECRB 5G5FA 2OE3A 2L5OA 3FY7A 2P5RA 1HNCA 4ZILA 1EGRA 4NMUA 1SD9A 1AUCA 1GH2A 2IIYA 5A4UA 2QGVA 5ECMB 1R7HA 5IMAA 3K8NA 5IOXA 4IJIA 3ERFA 1R26A 2M80A 1GSSA 2GLRA 2GTUA 3GH9A 2LRNA 4KB3A 2FY6A 3ZL5A 3F4RA 3N9JA 3E9JB 2QC7A 3DD3A 2WZ9A 2FD3A 1VRSD 1SL0B 2OJLA 2BMXA 2EIOA 5E4WA 2R3XA 4EC0A 2VM2A 3QDNA 4OFMA 3RAZA 1TRUA 4PQIA 4MJAA 3KMNA 3KM6A 4ECBA 1DSBA 3C73A 3UIWA 3QAGA 2GGTA 3MWHA 4MZWA 4WETA 4TVEA 3F4TA 3M1GA 3KZQA 4K7OA 1N8JA 3RHCA 1URMA 1LBKA 3O76A 5CREA 1SKWB 4IHUA 4MJEA 1K0BA 3D5JA 3L0HA 3IK7A 3FKFA 1WRYA 2C3QA 4HS1A 3DIEA 2E2GA 5IPGA 1VF1A 4G9HA 3DWVA 2BJXA 5COHA 5ECLB 1V98A 2VCVA 1O85A 2Z9SA 1Z7PA 2QSIA 2VCQA 3HYPA 3ZITA 2OKAA 2HRNA 4YAPA 1KTEA 1DUGA 4L8EA 1VGLA 2YWNA 2M72A 1OKDA 2C3NA 2AUVA 5B8BA 5CRGA 3BOAA 3H4KA 3FHKA 5HFGA 4DSQA 2I9HA 4X43A 5IIZA 2L6CA 3QAVA 2LJAA 3FR3A 3GTUB 5CO3A 2LKUA 1XVQA 3M9JA 2FWEA 1G7EA 4RI6A 2VCTA 4HOJA 4BL7A 2WULA 3LG6A 5J5NA 1GL8A 2LQOA 4I2TA 5IO0A 1UC7A 4F2IA 3D21A 4NWYA 1ERUA 3ZTLA 1DE2A 1AW9A 1M2AA 2VUPA 2IFQA 4TKYA 4EDYA 4AJ7A 2B5EA 4PUAA 1AQXA 3VI7A 1WMJA 4ZL8A 1JHBA 5DQYA 1A2LA 1YEXA 1TJDA 3NOFA 1H4OA 4OCFA 3M9KA 1EP7A 1QUWA 1LU4A 2H19A 4AJ8A 2PGTA 5IMDA 3DVWA 2X8HA 3F3QA 3I9V2 4GSNA 1V57A 1MDKA 3H79A 3IV4A 1QFNA 3BD2A 4XS4B 1TP9A 5JWQB 5JCUA 3CXGA 1XWGA 4I5QA 1QMVA 4EE0A 1FW1A 3VK9A 2IMKA 1I5GA 1PQNA 1F6MC 2IPAA 3VFIA 2ZNMA 1BX9A 1TDIA 2OADA 3WGXA 2WJUA 3D6IA 3GNJA 2B7JA 1R5AA 3GSTA 3BCKA 3C7MA 4XCSA 2H75A 1PMTA 3O6TA 1C72A 1OC3A 4L5LA 3J7Yb 2CX3A 2R4VA 4JBBA 1YKCA 4ISDA 1K3OA 3LYKA 5ECOB 5C00A 4KDUA 4F9ZA 1SU9A 3EMXA 1S3DA 3GURA 4XTSA 3Q19A 1O7UA 5JWRB 1HNBA 4TR3A 2H66A 2YWMA 5G31A 2AYTA 2DIYA 2YNXA 3HJPA 2DBCA 5D9TA 4POBA 1THOA 3ZLPA 4FIWA 3G7YA 2MYGA 3IA1A 2PWJA 4JR4A 4ML6A 3I43A 4KCAA 1RW1A 4K7IA 2PVOC 4D73A 1ACVA 2H1GA 3HXSA 1AAZA 4Z7XA 3ERGA 3GKMA 1BAYA 1O8XA 2XBIA 5FWGA 5F06A 4O5RA 4NV2A 1WOUA 3CYNA 2HXKA 2LEGA 4IS0A 2H6ZA 5ELGA 4TOPA 4IELA 1O81A 4TXOB 3UEMA 1B4PA 2ON5A 4LA1A 4EVMA 1XZOA 3C71A 2AHEA 2CAIA 2B1LA 1F37A 3IAS2 3IDVA 3QFAC 4HQSA 5CYYA 1GTAA 4NAXA 2OACA 5B8AA 2YWIA 1M9AA 1V9WA 1M9BA 5KEJA 2P0GA 4V2MA 1FB6A 5ECIB 1KBNA 3WT2A 5D9VA 3F6FA 2O87A 5JWOB 4JU5A 1U87A 2RUFA 1T00A 2LRTA 4RI7A 3MDKA 4MZBA 1GLQA 1YDKA 1PL1A 3ME8A 5AISA 3EVIA 3WGDA 4O92A 2CZ3A 5ENUA 3TKQA 4F0CA 4QQ7A 2GQMA 4E8EA 2E0QA 3GIXA 1PX7A 3A2XA 1A0FA 3F9UA 1TKDB 4ZBDA 2RIIA 1MD4A 2ZCTA 4FYUA 5G1LA 3EURA 1T4YA 2DSAA 2CVKA 5DVBA 4LMWA 2V32A 1X5CA 1UA5A 4ZB9A 3L9UA 1YF0A 2C0GA 1YQ1A 2H01A 5IMCA 11GSA 3HA9A 4ACSA 3CSHA 1RQMA 1A8YA 1V58A 4DSRA 2HZEB 4GLTA 1G6YA 4PNGA 5H5RA 1TI3A 4EXJA 4POMA 1J08A 5F0GA 2B5YA 1K3YA 2FUG2 1PKWA 5GZZB 2F3MA 1ZYEA 4XRDA 2B5XA 3KH9A 2CX4A 2IN3A 1LJRA 1ZOFA 1YZXA 4N10A 1UVZA 3M0FA 1NHYA 3APQA 2IL3A 5A4WA 4MH3A 5J4UA 3GTUA 2VLUA 4MF7A 2H8LA 4EKZA 1B8XA 5J3RA 3KEBA 2R6KA 1NW2A 4MF6A 2K18A 2YOIA 2NDOA 14GSA 3M3MA 4GF0A 3ZVJD 1XFLA 3ISOA 2K6VA 1M2BA 3ZFLA 1QGVA 22GSA 2B7KA 5HR2A 1E6BA 5EL8A 5ECPB 3EE2A 2HYXA 6GSXA 3V1WA 1K3LA 2KLXA 2RUEA 2IMFA 3L4NA 2I3YA 3IOSA 5H5SA 2LNSA 16GSA 4X0XA 1A2MA 5FT3A 2N5FA 2H76A 1TU8A 2TRCP 2JACA 19GSA 3GL5A 2YWOA 3FW2A 4WR5A 4HI7A 3SBCA 2VL2C 2P31A 2FLSA 4XS4A 2PBJA 1MD3A 1OC9B 2LS5A 1GUKA 13GSA 1USBA 3KMOA 1SJIA 3O3TA 3TOUA 5KN0A 4N0VA 2WFCA 3PINA 1XBSA 3NZNA 4IP1A 1M99A 4TRXA 5LCZA 3UVHA 5GSSA 1HYUA 2HSHA 2K9FA 3P8WA 2FA8A 5CNWA 3ZMLA 5HR0A 4J2FA 4YQMA 2YN1A 3KTLA 3IE3A 1SK0A 3E3EA 4V1Ag 3AY8A 2A2RA 3GRXA 3KH7A 3BBYA 2ALBA 5ABRA 3GUSA 3UJ1A 1YF1A 1Z6MA 5D9WA 3VWXA 3TJFA 1GSUA 1GSQA 4GSTA 1G7OA 2JZSA 1E2YA 2OE1A 4WR4A 1GP1A 1RK4A 5CRDA 2IWTA 2TRXA 1XWCA 3TOTA 5C04A 4WF4A 1TK8B 5A4VA 1Q98A 1PKZA 4KCEA 1T3BA 2EIQA 4HU9A 1HQOA 1PD21 4OO4A 4DVCA 4GSSA 1SK2A 3TKPA 4NHZA 4QL9A 1X5EA 4NPBA 2H71A 1K0MA 5E59A 5KN1A 1TOFA 1G0TA 4XS6A 4PX1A 2GVPA 4J56E 1GNEA 3FR6A 4MCUA 2DJ0A 5ECHB 3F4SA 3NIVA 5DCHA 2RM5A 2FWFA 5IMZA 4FO5A 1B48A 3TRXA 2DC5A 2GQLA 1TRSA 2PPTA 3APOA 3TKRA 4WF5A 4LMVA 4ZBAA 2MBTA 5DALB 1SL1B 1EEJA 1JFUA 1YY7A 3LXZA 3HZ8A 1FO5A 2VL3A 1FHEA 3KP9A 1MTCA 2C8UA 3D4TA 3I69A 4IKHA 1QXHA 3IHQA 5GAPD 1N2AA 2GSQA 1T1VA 4TXOA 2B1KA 2F8AA 2PU9C 3LXTA 1ABAA 4DSSB 3S9FA 3UAPA 3ZRDA 3UOMA 4Q5RA 2CVDA 4KGIA 1CQHA 4YQUA 2JSYA 3TJKA 1FVKA 3UBKA 5AIVA 2N5BA 2L6DA 3FZAA 1TU7A 2BTOT 2JL4A 1A8LA 7GSSA 1WP0A 4KX4A 1F9MA 1J0FA 2IMEA 3UL3A 1JZRA 2HRFA 2VCXA 1X9MB 1X5DA 3PGTA 5KN3A 4K9ZA 3G7IA 2DMMA 4H86A 2VIMA 2J23A 1PX6A 1Y25A 4IQAA 2HE3A 3N5OA 5IMFA 1SK1A 1EEMA 2NPBA 2VL2A 3IRAA 5A5KA 4I6XA 1CQGA 1SYRA 1JZDA 4GXZA 2ZUPA 1GTIA 2KP2A 5IO2A 2LV3A 4BWQA 5J9CA 1Q4JA 2XHFA 4OFNA 3UARA 4RUVA 1I9DA 1XXUA 1ST9A 1IYIA 2QKEA 2KUCA 2K8SA 4OD7A 4PXOA 3FR9A 4K2DA 1XW5A 3KCMA 2RM6A 5CRWA 6GSTA 4E8HA 3QR6A 3UBLA 4GQFA 5B7CA 1SD8A 3C1SA 4HZ4A 3UMAA 5LD0A 4XIHA 3HCZA 3R2QA 3VI5A 4OWYA 2HZEA 1A24A 3KTBA 2MMZA 3CRTA 2YZHA 4ZIJA 4MDCA 5GSTA 2WCIA 1T7PB 2R37A 1ZCPA 2C80A 4BVXA 2JZRA 2PVQA 3GFKA 2FHEA 2LTKA 3LEFA 1QK8A 2H0IA 3D22A 3CBUA 2NBSA 3DRNA 1V2AA 6GSUA 4HZ2A 4WKWA 3HJMA 1XCCA 2G0FA 3GN3A 1H75A 4FYCA 1AQVA 1A0RP 6GSVA 1X9SB 2N5AA 2R5GA 18GSA 2YV7A 3LQ7A 4K0NA 4PGTA 1U6TA 4ECJA 2XC2A 5ELAA 1VF3A 3HKRA 1EZKA 2P5QA 5G2ZA 4N30A 5IOWA 3HVVA 4HU7A 3DVXA 1K0CA 3TJJA 3QAWA 4IBPA 5G5EA 2YJ7A 3TKSE 3ED3A 4G10A 2CVBA 3LSZA 1GUMA 5INYA 2HFDA 2LQQA 5DCGA 1XWKA 1KNGA 3H8QA 1PL2A 2FGXA 5DQSA 2CQ9A 4I97A 1GUHA 2IFQB 4WBRD 3MAKA 3ERWA 3J7Yk 1S3CA 5JCGA 6GSSA 2DJJA 2H70A 2V41A 3WD6A 3TDGA 2G2QA 2JADA 3VWWA 4O7HA 1ZYQB 2FWGA 1OC9A 1XVWA 1OYJA 4AGSA 1MDJA 4KUNA 1TRVA 4LLRA 1ON4A 2PN8A 5F05A 3BCIA 4KNDA 3DMLA 1EOHA 1R4WA 5D9XA 2REMA 2C3TA 2KHPA 3ZYWA 3TJGA 2FWHA 2MMOA 4KSMA 2X8CA 3A2WA 1SL2B 1BYEA 4I8BA 4GTUA 1U88A 3GA4A 3RDWA 1IYHA 1OVNA 1YJ6A 1FB0A 4RQXA 2F51A 3TKSA 2H0GA 4L5OA 1BJXA 3QCPA 4F03A 1OKTA 3Q18A 2HLSA 2WGRA 3JCML 2JU5A 1EV4A 3I6AA 5HQPA 3KP8A 2OBIA 1VF4A 1SKRB 2B6MA 4YAVA 2H1BA 2CZ2A 4KAEA 3LYPA 1F2EA 3CRUA 3F0IA 3APSA 4PQ1A 4TR1B 4G19A 4BA7A 4KA0A 4FYBA 2KOKA 4JR6A 1MEKA 2VLVA 1JZOA 3MSZA 1XWAA 1OC8A 1THXA 2O7KA 1JLWA 1GTUA 2ON7A 1M0UA 1F3AA 3GHAA 4L0WA 3DXBA 1HNAA 4J57E 2F8FA 2LRCA 3DEXA 5DALA 1VF2A 4WXTA 1YEPA 1OE7A 4IW9A 2CA8A 1A23A 2VOCA 1AIUA 5HFKA 1XIYA 3PH9A 2VD1A 3TJBA 1FG4A 1K0AA 2GT6A 1BQ7A 2H1DA 12GSA 1XOBA 3VWUA 4L0UA 4POKA 3VPQA 5DBQA 4BPYA 4DSSA 4MABA 4EL1A 4AJ6A 2LSTA 1W89A 5ECNB 3IBHA 1NHOA 1O73A 3IC4A 4POLA 2CT6A 1K0OA 4ZL7A 3GKKA 1Z7RA 2HSYA 2VLTA 4V2NA 5DDLA 4PNFA 2C0FA 1PRXA 2YANA 2PMTA 4YQVA 4ZXGA 4ILFA 1SJ6A 3HVSA 1GTBA 1FAAA 1V40A 3VWVA 5D73A 2LJRA 1U3AA 5CRHA 4MPFA 2I1UA 4IQ1A 5HR3A 3QPMA 4K0GA 1GSFA 2NTOA 2NVLA 1T4ZA 2V6KA 5DJMA 2DLXA 4MA9A 5KN2A 3GKXA 2H0HA 2J9HA 4HEA2 3BJ5A 2DJ1A 1O6JA 4ML1A 4XS1A 4GCIA 1ZL9A 2RLIA 4K6XA 3HY2A 2VCZA 2HZFA 4MF5A 1JZWA 2R2JA 4V2LA 5DAKB 4CW9A 1JLVA 2KP1A 1WWJA 4XRAA 2DMLA 2MMAA 4MH2A 3RPPA 3H93A 4OMVA 3P2AA 4ULXA 4HDEA 1NSWA 3GL3A 1O8WA 3KXOA 3EU3A 5JCWA 4EDZA 2YPMA 4MJCA 4G2EA 3Q74A 2AV4A 2AJQB 3GX8A 1WIKA 2WRTA 2GSRA 5H5QA 3FK8A 1PGTA 5G30A 2OBKA 1TXXA 3CTGA 4MPGA 3TRPA 2A2SA 2GSTA 4BWSA 3PR8A 4ZB8A 4Q5NA 3U6VA 4MP4A 3GKNA 2IJYA 1B9XC 2LJKA 2OA7A 2MMNA 2L4QA 3RPNA 3ZMKA 5ID2B 4GWRA 5IQYA 2EC4A 2IMDA 2X8GA 1NM3A 1A2JA 5LNKe 3SWLA 4KDYA 2VAFA 8GSSA 4MZCA 2M46A 2HI7A 4N0ZA 3F63A 3ZIVA 4DEJA 2B3SA 2H73A 3G9BA 5D8IA 3ZVJA 2HT9A 1EV9A 4K8MA 2C0DA 4TN8A 4WEYA 2GQKA 3ZREA 3KJYA 1XW6A 2GS3A 3GMFA 5J9BA 4KDXA 1W4VA 3IAM2 3TUEA 5IM9A 3FZ9A 2E2MA 4PQHA 2C0EA 3GV1A 4TR4A 1B4QA 4ECCA 3D0ZA 2XBQA 3ZIJA 3WT1A 1TW9A 2YV9A 5F8BA 5FHIA 4JZQA 2MBSA 3RBTA 3LGCA 3VLNA 2H1AA 2YZUA 2H30A 5B6MA 4HJMA 2YJHA 1GSDA 1WPIA 2C1YA 3HDCA 5AGYA 3DGQA 20GSA 1XOAA 3CTFA 4IGJA 2L59A 2JZTA 4LL4B 2O89A 3EC3A 2FCHA 2O85A 3KIJA 3GSSA 1AXDA 5J41A 1GWCA 3FZ5A 1ILOA 3FEUA 2H6XA 3TKSC 1TK0B 4KSOA 4HJ2A 1J9BA 2FA4A 1ERTA 2HNLA 3L9SA 4IN0A 1ERWA 1OAZA 2GT5A 2XPEA 2PUKC 4JE1A 4OO5A 2C4JA 2DJ2A 1TTZA 4ECIA 2GZPA 3P90A 5EVOA 2CV4A 1EOGA 1BG5A 2D2ZA 4K1FA 3F8UA 3H1NA 1GSYA 4Q5QA 4BVYA 4Q5FA 4MMMA 2VL9A 3ZFBA 2V6OA 4TR1A 2I81A 4EF0A 4GQCA 2EIRA 1FVJA 4I2UA 2TIRA 2DIZA 4ZB6A 3VURA 1AQWA 2I4AA 4LL1B 3QFBC 2X99A 4TR0A 3C1RA 1QQ2A 3EMPA 1X0RA 4OCEA 4CHSA 2AB6A 2O8VB 5L71A 3Q6OA 5ECQB 2H74A 4IVFA 3EU4A 3FZ4A 1DE1A 3IK9A 1WJKA 4XHMA 3W8SA 3A5WA 5CP1A 2WB9A 3LJRA 3DYRA 3TB2A 1HD2A 1Z9HA 3A3TA 1XPVA 4EO3A 3W6GA 3OR5A 2VM1A 3HZ4A 4GRFA 4PURA 4O32A 3DKSA 1ERVA 9GSSA 2L5LA 3GYKA 1GULA 2GDRA 1AC1A 2VO4A 2L4CA 3TCOA 1GLPA 2X64A 1ZMAA 3ZZXA 4JEDA 2OE0A 3FYGA 3E0UA 1K0NA 1MDIA 3GX0A 1Z5YE 1TRWA 2A4VA 2PERA 2GSSA 3P7XA 4NHWA 3EINA 3IR4A 3M8NA 1GRXA 3CSJA 4EUYA 2YP6A 1G6WA 2V1MA 4MJBA 2VCWA 4TW5A 4RQRA 1R5PA 3HHVA 1Z3EA 2H72A 1U3IA 3D4MA 3HD5A 3A2VA 4IP6A 4AF2A 4ZL9A 1SYXA 2DJ3A 1SJZA 2H6YA 5AN1A 5F07A 4V1Ap 2ES7A 3EYTA 3EWLA 3F3RA 2K8VA 3QMXA 1PN9A 5EY6A 4PUFC 1XW9A 1EP8A 2LNTA 3L78A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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