3U5RE

Crystal structure of a hypothetical protein smc02350 from sinorhizobium meliloti 1021
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
183
structure length
183
Chain Sequence
KTQSNSITLGTRAADFVLPDAGGNLFTLAEFKDSPALLVAFISNRCPFVVLIREALAKFAGDYAGQGLAVVAINSNDAQAFPEETLERVGAEVKAYGYGFPYLKDASQSVAKAYGAACTPDFFLYDRERRLVYHGQFDDARPGNGKDVTGADLRAAVDAVLKGKDVGTTQVPSIGCNIKWTAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a hypothetical protein SMc02350 from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Sinorhizobium meliloti
molecule keywords uncharacterized protein
total genus 59
structure length 183
sequence length 183
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3u5rE00
4TOPA 2CX4A 5L71A 5KN1A 3QAVA 1YF0A 2H0HA 1VF4A 2NDOA 4TRXA 1OAZA 5J9CA 2YCDA 4V1Ap 1SJ6A 4FH8A 1TK8B 3EURA 1XWGA 5G31A 3LGCA 3WD6A 2XHFA 18GSA 2XPDA 4POKA 3A2VA 3GX0A 1B4QA 5ECPB 2PWJA 4ZL7A 1R5AA 1TKDB 2PERA 4JEDA 1NSWA 2OACA 1PX7A 4TR1A 5DAKA 3UBKA 4L0UA 5DBQA 1GUMA 3MNGA 1K0NA 5DVBA 1TRVA 2IJYA 17GSA 2R4VA 5ECKB 4MH3A 1SKWB 5ECIB 3F6FA 5HFIA 4MABA 1K3YA 4KX4A 1OC8A 2DJ2A 3EMXA 1NHOA 2GZPA 2H1AA 3KEBA 1A0RP 4ISDA 3ZTLA 4IP6A 5GAPD 4LMVA 1MDKA 4RQXA 1EGOA 4GQCA 1UA5A 2GT6A 2GS3A 1USBA 4BVXA 5AN1A 1GSSA 2CVDA 2JL4A 4NXIA 1GP1A 1GTAA 2H8LA 5DAKB 4RQRA 3GKNA 3Q6OA 2C1YA 4N11A 2GQLA 1KBNA 1ZGNA 2CVKA 1OC3A 1AC1A 2GSTA 4CW9A 4YQMA 2HT9A 4JR6A 2LQQA 4KDYA 3D6IA 4IN0A 4GF0A 3KMNA 1K0CA 4ECBA 1OKDA 3QFBC 3VI7A 3L0HA 5JCWA 3VWXA 4G9HA 1OYJA 3UIWA 3F3RA 2CT6A 2GQKA 2DMMA 2C0EA 3H79A 4IBPA 1B9XC 4MJAA 2FLSA 3OR5A 4NHWA 2H66A 4HU7A 1O6JA 3RPNA 2PVOC 3L4NA 2YZUA 4L0WA 1G6YA 5B8BA 5B8AA 2H6XA 2DJ3A 1R5PA 1TP9A 2I81A 3P8WA 5EVOA 2V2GA 3UMAA 2H72A 5B7CA 1WJKA 2PMTA 1FB6A 1Z7RA 2B1KA 2ALBA 5C00A 2GQMA 1GSFA 5ELAA 3VFIA 5LD0A 4ECCA 3W6GA 3GFKA 4K9ZA 2GZYA 1ERWA 4CHSA 3TCOA 2VAFA 1K0AA 3UEMA 4KGIA 1FB0A 5DQYA 4AF2A 2K9FA 2WZ9A 2H0IA 1B8XA 1GWCA 1X9SB 4ZB6A 3BJ5A 1A24A 1TDIA 4G2EA 1Y6EA 1GL8A 2FD3A 3MSZA 5IOXA 1T4YA 3M9JA 4FYUA 3L9VA 1Q4JA 4J56E 3GUSA 1IYHA 3PINA 3PR8A 1SJIA 4YAPA 1V98A 2OE0A 4XTSA 5F07A 4ULXA 3C1RA 3IPZA 3F8UA 3VWUA 2R2JA 4KDXA 1MEKA 3WGXA 3TKRA 4V2MA 5JCGA 4HUAA 3RAZA 2HFDA 3F6DA 3ZFLA 2PN8A 2LV3A 1MD4A 1V57A 1FOVA 4WR5A 5F0GA 1RW1A 2ZUPA 2H75A 2F8AA 3GL3A 3EVIA 2V32A 3FR9A 1PL1A 1GSEA 4HZ4A 4GCIA 1GTBA 2KUCA 1F6MC 4KCEA 2Z9SA 1THXA 1EEJA 2RLIA 3CMIA 3VURA 2MMZA 1XPVA 4HJ2A 1UC7A 4GLTA 2MBTA 1GNWA 2BTOT 1TJDA 4TR3A 2VD0A 1XBSA 4WEYA 3GIXA 1WE0A 1F37A 3M9KA 4D73A 1G6WA 2I9HA 4BPYA 4BA7A 3D22A 4TN8A 3MAKA 5A4WA 1SL1B 4XS4A 2QGVA 4EXJA 1YZXA 2H01A 2XBIA 3F9UA 2PU9C 2HI7A 4JBBA 2V1MA 1XFLA 1BJXA 1XVWA 5CRWA 2AYTA 3G7IA 1M9BA 4EKZA 3TRPA 3FR6A 4AJ7A 3TKSA 1QMVA 3D4TA 5J4UA 4FIWA 3D0ZA 4OCEA 4HOJA 2HRNA 3APOA 5HQPA 3ISOA 3O6TA 6GSXA 2YWNA 2JZTA 2H1GA 1SYRA 1TXXA 2O8VB 1O73A 2K6VA 1FVJA 2WDUA 1J08A 3IC4A 5D93A 4D73B 1Y25A 3TGZA 2FWGA 4QL7A 1GH2A 5COHA 2L6CA 2LTKA 4TXVA 1DE2A 4IELA 2E7PA 2VUPA 5ABRA 3IK9A 1X5DA 2DMLA 1SK2A 3ERWA 3QMXA 1ZZYA 4KCAA 4HDEA 1NHYA 2RUEA 2NBSA 3WT1A 3O76A 2E0QA 3H8QA 7GSSA 4TW5A 4J2FA 2JACA 1G7EA 2EIQA 3K8NA 3D4MA 3GRXA 2VM2A 3HYPA 2VCZA 4JE1A 2RM5A 1EZKA 3WT2A 1RK4A 3A3TA 3HDCA 4K1FA 1GRXA 1ZOFA 2A4VA 3TKPA 1G7OA 5E4WA 5IM9A 4IHUA 5D9XA 3LQ7A 2B7JA 2B5EA 1X5CA 1HNAA 2E2GA 5GSSA 1O7UA 2TRCP 2RUFA 20GSA 1AAZA 4POMA 1DUGA 4AGSA 1PD21 3LXTA 1M7TA 4DSQA 1TW9A 2DC5A 3TJBA 3WYWA 4L8EA 2FWHA 5ELGA 3EINA 3HVSA 1K0MA 2C8UA 2VD1A 3MWHA 4MCUA 3HXSA 1M2BA 3EWLA 1MDIA 4N30A 5EY6A 5A5KA 2VCWA 2H71A 2MYGA 4MZCA 2EIOA 3A2XA 5LNKe 5AIXA 10GSA 4K0GA 13GSA 1S3DA 4K0NA 5J41A 1EOGA 1JZRA 2LEGA 4PNGA 5IO2A 3DVXA 4XRDA 2VCTA 2O85A 3EU3A 4MZBA 2PGTA 4IKHA 5A4UA 4KSMA 4ZBBA 4PXOA 3CYNA 1TRSA 4AJ6A 4BVYA 3LG6A 3D21A 3LXZA 5FT3A 2MMOA 1GULA 2CQ9A 3GKMA 2GSRA 4OWYA 2HZEB 1MTCA 3DGQA 2X8CA 1ST9A 4KSOA 5DDLA 4OFNA 2GVPA 1YQ1A 4DVCA 3Q18A 4BL7A 2B7KA 3LJRA 4NV2A 4O5RA 3UL3A 4HI7A 1HYUA 4TR0A 1Q98A 3ZZXA 4KUNA 2DIYA 2V6KA 3ZIVA 3KP9A 2YPMA 4KB3A 4KW6A 3UJ1A 1A8YA 5CNWA 4ZL9A 1A2JA 2CX3A 2HNLA 4O32A 3M1GA 4ZB8A 2KLXA 1WMJA 2LNTA 3NZNA 4I97A 1BX9A 2DJKA 3ERGA 1A2LA 1OKTA 2DSAA 3P7XA 4OD7A 2LSTA 1I9DA 3BBYA 4GTUA 2VCVA 3GN3A 3R2QA 3GSSA 2AAWA 2OA7A 1XWCA 3FZAA 1B9YC 1M2DA 5AISA 2JADA 4YAVA 1LBKA 4K2DA 4KH7A 2H19A 5IMFA 2HZFA 1PX6A 2LJKA 2QC7A 3ZVJD 2TIRA 2K8SA 1XWKA 2WB9A 1PGTA 4MP4A 3HZ8A 1R7HA 1T1VA 11GSA 2H0GA 2HE3A 5B6MA 2H76A 4E8HA 2WGRA 3GMFA 3FKFA 5G2ZA 3KH7A 1M2AA 4ZB9A 3AY8A 3KCMA 4F9ZA 3VLNA 1PQNA 5DQSA 4IW9A 2DJ1A 4GQFA 3DIEA 2R37A 4XS1A 3D5JA 4GXZA 3F4RA 3ZITA 2R6KA 2WS2A 5ECHB 1U6TA 2CZ3A 2KHPA 3LYKA 5LCZA 2VLVA 4DSSA 4NAXA 2DIZA 1FO5A 2L57A 5JWQB 3DKSA 2P5RA 1UVZA 4F0BA 3LEFA 2QSIA 3DEXA 4EO3A 2LUSA 1PKWA 4ZXGA 3TKSC 4I5QA 1XWAA 1QFNA 2FGXA 19GSA 2PBJA 2XC2A 3L9SA 9GSSA 4MA9A 2LS5A 3E0UA 3ME7A 2FWFA 2KOKA 4Q5NA 5D73A 3TJJA 4ID0A 2DLXA 5F05A 2DJJA 3WGEA 3DYRA 4V2NA 4IVFA 3LFLA 5IOWA 1BYEA 3ERFA 1GSQA 1Z3EA 3F4TA 4G10A 3J7Yb 3HJMA 4WF5A 1EV4A 1Z9HA 1VRSD 5CYYA 1O81A 1SL0B 4DSSB 2VLUA 3TJKA 3UVTA 1CQHA 3KMOA 3Q19A 3ZVJA 1XVQA 3IBHA 1JLVA 1HD2A 1BQ7A 1R4WA 2ES7A 5G5EA 1V9WA 5IPGA 1JLWA 2TRXA 4E8EA 1TU8A 3FZ9A 4F0CA 4XRAA 1TK0B 1RQMA 4MPFA 3KH9A 3GV1A 1O8XA 1QQ2A 5IMDA 1AUCA 3HD5A 2OADA 1GSYA 2G0FA 3KTLA 2FCHA 2LRNA 1N2AA 3FZ5A 1X9MB 5IQYA 1AQVA 4EVMA 5G1KA 3NIVA 4WETA 4K8MA 5KEJA 2KP1A 4JR4A 1G0TA 2IIYA 5CO3A 3HY2A 2JSYA 2JSZA 2AB6A 3G9BA 3ZFBA 3EYTA 1F3BA 2IL3A 2GSQA 4F03A 5G30A 4MDCA 1JHBA 4IGJA 3GKKA 3IRAA 4MF6A 5D8IA 1WRYA 3ZLPA 3ZRDA 1PKZA 1KEBA 4MJEA 2IPAA 3I69A 3F63A 2M72A 3M3MA 2WCIA 2R5GA 3CXGA 3GNJA 2R3XA 4TKYA 1EEMA 3IAS2 1KNGA 2F9SA 4MLYA 2O87A 3RPPA 1W4VA 3U5RE 4ILFA 4WKWA 3DXBA 5ID2A 4ZBDA 3TDGA 3RHCA 1V58A 2IMFA 1GUKA 4KE3A 4N10A 6GSVA 3O3TA 2IMIA 1XXUA 2CAQA 2OBKA 5HR0A 2YWMA 1EOHA 1N8JA 2GZZA 2V6OA 2MZCA 2ON7A 2H70A 3TOTA 3GURA 4RI6A 1ZCPA 3QCPA 2G2QA 3QR6A 2FA4A 1Z6MA 3CSHA 4V1Ag 4X1UA 4ML1A 2YJHA 3HVXA 2NPBA 3GHAA 3ME8A 3FEUA 6GSWA 4WBRD 4WXTA 4O7HA 3KM6A 3FW2A 2OBIA 4L5LA 4HS1A 3ZYWA 2HLSA 4TXOA 1SD9A 2J9HA 1Z7PA 3I6AA 4NV5A 2L4QA 3HVVA 5IO0A 1YEPA 4K6XA 5ID2B 1PL2A 4RUVA 3ZREA 5INYA 4LA1A 2C3NA 1M99A 3I9V2 6GSSA 1MDJA 4PUFC 1JFUA 4PQ1A 4N0ZA 2ZCTA 2FHEA 3CRUA 5IMCA 4DEJA 2L4CA 3IV4A 4WBJA 2M46A 2LJAA 3E9JB 3RHBA 1FW1A 1ZMAA 1H4OA 4Q5FA 1TI3A 1K0DA 3KJYA 4WF4A 1SKSB 3M8NA 3H93A 3FZ4A 2GTUA 2VIMA 2B6MA 3BCKA 5ENUA 2VO4A 3KGKA 3IOSA 1U3AA 2LKUA 4X43A 4TXOB 2MMAA 1OVNA 2B5YA 5E59A 2L6DA 3RBTA 2EIRA 3HHVA 1HQOA 3VWVA 1ERVA 1OC9A 4MZWA 4XS6A 5H5RA 4IP1A 3F3QA 4FYCA 3JCML 5HR1A 4YH2A 4F2IA 2P31A 2H74A 3CTGA 4PURA 4PNFA 12GSA 3DD3A 2FWEA 2F3MA 1U88A 5CAXA 4HZ2A 3TJGA 2YWOA 1TI1A 3TJFA 3ZMKA 1DSBA 4MF5A 3FK8A 1BG5A 3BD2A 4G19A 4NMUA 5HR3A 1ZL9A 5IIZA 5JCUA 3CBUA 3H4KA 3LWAA 5CRDA 1AXDA 1YF1A 4BWSA 2L59A 2VL3A 1YKCA 3N9JA 2X8GA 5CP1A 3W8SA 1OC9B 5CREA 3IAM2 4XHMA 1M9AA 1QXHA 2GDRA 2HZEA 1XW9A 1T8EB 3SWLA 5D9VA 1B4PA 1IYIA 3KD0A 3KXOA 4IQ1A 4NWYA 3F4SA 2H6ZA 4OCFA 2H6YA 4HU9A 2C3TA 2X8HA 1A8LA 1GSDA 1NW2A 2BJXA 3ZMLA 4EDYA 3IHQA 3APSA 4OFTA 3KTBA 1AW9A 5F06A 3DWVA 2YANA 2RIIA 1URMA 5IMVA 2OJLA 1XW5A 4KA0A 4HQZA 2VOCA 1EWXA 5HFGA 3EC3A 4GWRA 4QL9A 4ECIA 3A5WA 1YEXA 2F8FA 1QUWA 3IR4A 1JZOA 1SJZA 1ABAA 5HFKA 3CTFA 1J0FA 1VF3A 4J57E 4MJBA 2GT5A 1BAYA 3IXRA 3UARA 3UBLA 4EL1A 5DCHA 2VM1A 1F3AA 1XCCA 3MDKA 3V1WA 1EV9A 3IA1A 2XBQA 5IMZA 4I8BA 2IN3A 3QAGA 1GLQA 3VPQA 1SENA 5ECQB 1DBYA 1E2YA 2FUG2 1LU4A 1XOBA 1ZYEA 4AJ8A 2E2MA 5ECOB 2O7KA 2IWTA 3C1SA 2VL2A 2I4AA 4K7IA 14GSA 2NVLA 1LJRA 2L5LA 2HSHA 5AGYA 2AUVA 1TU7A 5B6NA 1X0RA 4IJIA 3BOAA 1PN9A 3GL5A 4GSTA 3WGDA 1I5GA 2YOIA 1WP0A 4KDUA 4XCSA 3EU4A 2YN1A 2RM6A 1ERTA 1AQXA 2LRCA 2CA8A 2YV9A 4DSRA 2HXKA 1SK0A 1S3CA 2H1BA 4JU5A 4OFMA 4GSNA 1YKAA 2VCXA 4YQVA 2H1DA 1K3LA 2K18A 3UAPA 1K0BA 4ML6A 4Q5RA 5D9WA 4BWQA 2JZRA 1O85A 3GSTA 3GTUA 1T3BA 1SK1A 3C8EA 4I6XA 2J23A 4MJCA 2XPEA 4MK3A 1QGVA 1ERUA 5D9TA 4F82A 1SD8A 2EC4A 4LL4B 1AQWA 3M0FA 4OO5A 4YQUA 4RI7A 1T7PB 4EE0A 1ZYQB 16GSA 4TR1B 5JWOB 1ML6A 4X0XA 3EMPA 2C0GA 3KP8A 1WOUA 2HSYA 2OE1A 3NOFA 2FY6A 4K7NA 4MH2A 3CSIA 3US3A 2AHEA 3SBCA 2OE3A 2GGTA 4FO5A 5ECLB 3GTUB 1Z5YE 2PUKC 3TRXA 1CQGA 3LORA 1J9BA 2YV7A 1QK8A 1U3IA 2CZ2A 4EUYA 4O92A 3HZ4A 1YJ6A 1BEDA 3HKRA 22GSA 1DE1A 3PH9A 1M0UA 5C04A 1FG4A 3FRCA 2IFQA 3VWWA 3LYPA 4JRRA 2P0GA 3UVHA 4HQSA 1X9WB 2IMKA 2M80A 4JZQA 5H5SA 4LLRA 2IMEA 3W8JA 1V40A 1XOAA 4H86A 1X5EA 3L9UA 3A2WA 2C0DA 3GH9A 2I3YA 5CRGA 1PMTA 1K0OA 2C3QA 2N5BA 2AJQB 8GSSA 3P2AA 3GKXA 4WR4A 2GLRA 2WFCA 5A4VA 1V2AA 2IFQB 4EC0A 2PVQA 3ED3A 1FAAA 5CRHA 1EGRA 1HNBA 1TTZA 3ZL5A 3QDNA 3G7YA 1ON4A 5GZZB 1S3AA 3ZIJA 3FHKA 1JZWA 1EP8A 3PGTA 1B48A 5ECRB 1NM3A 5J5NA 2WULA 5F8BA 1VF2A 3U6VA 2OKAA 5HR2A 1XWBA 3IDVA 4IS0A 2D2ZA 2JU5A 4NHZA 4K7OA 5ECNB 1TRUA 5IPHA 1JZDA 3APQA 2BMXA 3J7Yk 4POLA 2KP2A 4ECJA 1PSQA 2HYXA 4ZIJA 2B5XA 1GSUA 2A2RA 5EL8A 3C73A 4PUAA 1OE7A 3VK9A 3FR3A 1FHEA 1GTUA 2LNSA 1E6BA 3QD9A 3Q74A 1Z6NA 2JZSA 2DBCA 1TK5B 4POBA 4MF7A 1U87A 4NPBA 5GSTA 4LL1B 3I43A 3QPMA 2ZNMA 1HNCA 2VCQA 3N5OA 2L5OA 5JWRB 3TUEA 2IMDA 2N5FA 5DALA 3DVWA 3H1NA 4GSSA 3TB2A 4Q5QA 2FNOA 1SU9A 1TOFA 3TKQA 2DJ0A 2YWIA 1GUHA 3GX8A 2VLTA 5DJMA 2GSSA 4PGTA 3VPTA 2H73A 1ACVA 2B1LA 2I1UA 5GAND 2X99A 2P5QA 2C0FA 4TR4A 2VL2C 5H5QA 1T00A 4ZBAA 5G5FA 5J3RA 1A2MA 4L5OA 3KZQA 3TRQA 1C72A 4LMWA 2N5AA 2LRTA 2MMNA 3QFAC 5D96A 2X64A 2HRFA 6GSTA 2C80A 4PQIA 3RDWA 5EPFA 3G7JA 3F0IA 1F9MA 3S9FA 5ECSA 5DALB 5G1LA 4EDZA 4MPGA 3HJPA 3EE2A 6GSUA 3BCIA 4IJ3A 5DJLA 1PRXA 1R26A 4ZL8A 4OMVA 1TRWA 4MMMA 2AV4A 2MBSA 4XS4B 4P3YB 3CSJA 3DRNA 2NTOA 4OO4A 4XIHA 4KAEA 3QAWA 1K3OA 2WJUA 4PX1A 1T4ZA 1SYXA 1MD3A 1W89A 3GH6A 2FA8A 1VF1A 3P90A 5KN0A 4CDOA 4GRFA 1O8WA 1WPIA 2K8VA 4EF0A 3E3EA 3C71A 1XW6A 4IQAA 5ECMB 2C4JA 4N0VA 3QOUA 3IE3A 1AIUA 1YY7A 4PQHA 3TOUA 2QKEA 4V2LA 3KIJA 3FY7A 3VI5A 2O89A 1XZOA 4ZILA 2VL9A 3CRTA 1GNEA 4FYBA 5J9BA 2PPTA 1VGLA 1KTEA 3HCZA 3IK7A 1YDKA 1A23A 1H75A 3DMLA 1UN2A 1GLPA 1FVKA 1SKRB 5KN2A 3HJOA 2B3SA 2REMA 2CAIA 1ILOA 4I2TA 2LQOA 3GYKA 2YJ7A 2CVBA 4I2UA 2F51A 2ON5A 4Z7XA 3TKSE 1F2EA 3UOMA 5KN3A 2H30A 1GTIA 1SL2B 4KNDA 2WRTA 1OE8A 4TVEA 1THOA 5FHIA 5FWGA 2A2SA 2YZHA 3LSZA 3C7MA 1WWJA 2YP6A 1WIKA 2CV4A 2YNXA 1XIYA 4HJMA 4HEA2 1PA3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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