3US3A

Recombinant rabbit skeletal calsequestrin-mpd complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
EEGLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSIYVFKEDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKNKDSEHYKAFKEAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGYEFLEILKSVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Calcium-binding protein
molecule keywords Calsequestrin-1
publication title Glycosylation of skeletal calsequestrin: implications for its function.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 103
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3us3A03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3us3A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3us3A02
2LQOA 2PUKC 3I69A 1GSUA 2HSHA 3DD3A 4IBPA 5C00A 4V1Ag 1YJ6A 5IPHA 2WZ9A 4EDYA 4QQ7A 3UVHA 3UARA 3LFLA 4F0BA 2VM1A 2FD3A 4KE3A 1O85A 4IS0A 2DJ0A 2LQQA 3RPNA 3EMPA 3IA1A 2LRNA 3IC4A 4KAEA 1H75A 3CYNA 4O32A 1PL1A 1Y6EA 2D2ZA 3GTUA 2IJYA 2H1AA 6GSUA 1M2BA 2PN8A 5ECHB 5J4UA 1XWKA 5G31A 1KNGA 4WETA 3GKKA 4K2DA 4YH2A 2JZTA 1K3LA 5LCZA 1ST9A 3F9UA 1OE8A 3ZL5A 4OWYA 4K8MA 2B5XA 2DJ3A 4KNDA 4IGJA 4WR4A 3LGCA 4TR3A 1X5DA 2GVPA 2L4QA 5ECMB 2V6KA 4AGSA 1G0TA 3GV1A 4I8BA 2NTOA 2ON7A 1GSDA 1FB0A 1R7HA 4XS6A 1Z7RA 3TJKA 3MAKA 3EE2A 2FA4A 2IL3A 2LV3A 1YQ1A 1JLVA 4MZBA 5HFIA 3V1WA 1FB6A 2L6CA 2B7KA 2VLUA 4J57E 1AQWA 5ECIB 1S3CA 3IBHA 4TR0A 4IJ3A 2F9SA 1PQNA 4CDOA 3BCIA 4WR5A 3ZVJA 4NAXA 3PGTA 3K8NA 4RI7A 4ZIJA 4ZILA 1JZWA 2YJ7A 5HR1A 3KM6A 3Q6OA 2R2JA 4WKWA 3A2VA 2I4AA 1XWCA 2FWFA 1TP9A 1F2EA 3VURA 5EVOA 1J0FA 1X9WB 1EGRA 3APQA 3BJ5A 4JU5A 4E8HA 1JHBA 2XBQA 3MWHA 1EEJA 5KN2A 4PNFA 1O73A 2CVKA 1A2LA 2YOIA 5F8BA 1PKWA 14GSA 4POMA 1URMA 2H70A 2VIMA 4FIWA 2FHEA 1PGTA 2ZNMA 3J7Yk 2IFQA 3GNJA 3S9FA 3W8SA 1SYXA 2H0HA 3LWAA 4MCUA 1M9AA 1SJIA 1AQXA 1YF1A 4MF5A 4NMUA 4EUYA 5HQPA 2KLXA 1TDIA 1YKAA 8GSSA 3GKMA 4L0WA 4KGIA 1X9MB 4MMMA 2PERA 1WRYA 5DCHA 4LA1A 4MZWA 2CX4A 4ZBDA 5D9TA 1AQVA 2H1GA 2OJLA 4F03A 3HYPA 4BWQA 3M9JA 2DJ1A 3EYTA 2HNLA 4FYCA 2RM6A 1A0RP 3F8UA 2AB6A 2C0EA 3VK9A 1AUCA 2MBSA 3QFBC 3TRQA 2P5QA 4TRXA 3ZYWA 3IAM2 3F63A 1CQHA 1WE0A 2LSTA 2L57A 4ML6A 2GSTA 5DAKA 2OACA 2H0IA 3U6VA 2CZ2A 4FH8A 3HHVA 3VLNA 4O7HA 1SL2B 4DSSB 2PGTA 1V98A 2E2GA 4PNGA 1RW1A 5ECPB 3ZRDA 1WJKA 1EWXA 1HNCA 1BAYA 5IMVA 1VF3A 1ERWA 4KDYA 5D93A 2R4VA 1MDJA 2WDUA 2H19A 3IDVA 1PL2A 1KBNA 3CTFA 5ID2B 5G1KA 4XCSA 5B8BA 4NWYA 4KW6A 1TRWA 3HJMA 2EC4A 1TW9A 2LNSA 2GGTA 1TTZA 2R6KA 4OMVA 1JZOA 2PU9C 5ELGA 3FZ4A 3RHBA 5G30A 3ZFBA 3EU4A 1Y25A 4YAPA 4WF4A 4PQIA 1ERVA 2V6OA 3QOUA 1SKWB 2G0FA 3QCPA 3QPMA 1T3BA 3NIVA 1TI3A 5F07A 3WT1A 1K0NA 4POLA 4O92A 4D73A 1ZMAA 3LXZA 5CRWA 3HZ4A 2DSAA 2VL2C 4MJCA 5KN1A 3E0UA 5G1LA 3DVXA 4OO5A 1TRUA 1WIKA 4HS1A 3GMFA 1HYUA 1ZGNA 2IPAA 3A2WA 4EO3A 5GAND 3D5JA 4IQAA 2HSYA 4XIHA 1U6TA 3WD6A 4P3YB 1KEBA 3QAGA 1O8WA 4L8EA 5B8AA 1LU4A 1YZXA 1GP1A 2LS5A 1GRXA 2GQKA 3TJJA 3N9JA 4GTUA 1A8YA 1OC9A 1ZZYA 2YWMA 4HZ4A 3M1GA 1B48A 3WGDA 2F51A 5ELAA 1FVKA 3C7MA 2YZUA 5LD0A 5DDLA 2KHPA 1V40A 4KB3A 4F82A 1VF4A 2H74A 1JZDA 2N5AA 3RPPA 1Z5YE 3QFAC 5DBQA 2GZYA 4RI6A 1XFLA 1VRSD 1XWAA 5ENUA 2AUVA 5F05A 1T4ZA 1ZYQB 2F8AA 1Z7PA 4H86A 3F4SA 2WULA 4X43A 2WB9A 5E4WA 1F3BA 3F3RA 1LJRA 5J41A 1YKCA 2WGRA 2G2QA 5B6NA 3A2XA 1A2JA 1V2AA 4EDZA 1M7TA 3UL3A 2WCIA 1TXXA 1TKDB 3HJOA 3M9KA 3CTGA 1G6WA 3M8NA 1VGLA 2Z9SA 1GUMA 4V2MA 2GTUA 1GUKA 2L6DA 3CRTA 4EKZA 2WS2A 3ERFA 4PUAA 4IJIA 5IQYA 3DMLA 4K7IA 1MD4A 3ZIVA 4LMWA 2B5EA 4PX1A 2CZ3A 2GT6A 3GFKA 1GULA 1SYRA 4ZB9A 4GLTA 2GQLA 2DIZA 3P8WA 4TKYA 3ZZXA 1ABAA 2O85A 4ECBA 1ACVA 5AIVA 3BOAA 1EV4A 4HQZA 5HFKA 2GSSA 2H1DA 4MDCA 4BWSA 5IOWA 1SK2A 3ED3A 3KMOA 2PMTA 4F9ZA 4WXTA 3TB2A 2CAIA 2HZEB 3GURA 2EIQA 1NW2A 6GSXA 1DE2A 2DJKA 1HNBA 5LNKe 4N10A 4IKHA 1GUHA 1K0DA 4XRAA 1K0OA 3NZNA 1EZKA 1ILOA 3KMNA 1X9SB 3EU3A 2OADA 1BJXA 1GLPA 2JACA 1X0RA 1BQ7A 3IR4A 2DJ2A 3DVWA 2DJJA 4BA7A 3W8JA 2KOKA 1QGVA 2HZFA 4MJEA 3D4TA 2LRCA 2YCDA 3G7IA 11GSA 3HCZA 4N30A 4TR1B 1ERUA 2QKEA 4LLRA 1SD9A 2MMZA 1TRSA 6GSSA 1TJDA 2B3SA 1XW6A 2I9HA 3CBUA 3DKSA 3ZLPA 1BX9A 2PBJA 5DJMA 3UBKA 2M46A 1HQOA 3TRXA 2I3YA 2TIRA 1OKDA 1J08A 4RQRA 2LEGA 4X0XA 3APSA 3GKXA 2ALBA 2LJRA 3GL5A 4NV2A 5ECSA 4POBA 5ECKB 1MDKA 3O6TA 4TXOA 2PVOC 4HU9A 3F6DA 4ACSA 4FYUA 4K9ZA 3KIJA 2VCWA 4K6XA 4XRDA 3EMXA 3HDCA 2WRTA 3D6IA 4IELA 3C71A 1R26A 3ZITA 4PQ1A 3W6GA 6GSWA 3GH9A 4Q5NA 1DE1A 2PWJA 5ID2A 3IHQA 2K9FA 4NXIA 3GL3A 4ISDA 1U3IA 4EE0A 1XZOA 2CA8A 1SL1B 4J2FA 4HEA2 5GSSA 2R5GA 2PVQA 3FY7A 4JBBA 3TDGA 1XBSA 1M2AA 3ERGA 3WGXA 1MEKA 1NSWA 4N0ZA 3TKPA 3IOSA 6GSTA 2K18A 2VL9A 3H93A 4I6XA 3Q74A 3UOMA 4WEYA 1PKZA 1TK5B 1EGOA 3RBTA 2VD1A 4X1UA 1ON4A 2RUFA 1T8EB 2GSQA 2HE3A 2REMA 1BYEA 1DSBA 2DMMA 3ZVJD 5IMZA 3DEXA 3VFIA 1ERTA 2B1LA 2QC7A 3GSTA 3VWWA 2RM5A 2H76A 4EL1A 1V9WA 1THXA 3BD2A 3LXTA 5IMFA 3KEBA 2VCZA 2O7KA 4ID0A 3QR6A 1WOUA 2XPEA 1B9XC 3FEUA 2FWGA 4KCEA 5G5FA 4OFNA 3IK9A 1OKTA 19GSA 2YV7A 1EOHA 1M0UA 3ZMLA 2VO4A 1NM3A 7GSSA 5DALB 9GSSA 4KCAA 5CRGA 3ME7A 3A5WA 3N5OA 1A0FA 1FVJA 5IOXA 4RUVA 3G7JA 2AAWA 3LSZA 4GWRA 1H4OA 4HUAA 2GSRA 2E0QA 3DYRA 4GQCA 1GSQA 1K3OA 3CSHA 1K0BA 5CYYA 4Q5RA 3LYPA 2KUCA 1FOVA 1X5EA 3PH9A 3CSJA 5IM9A 5JCUA 2X8CA 3D22A 4MF6A 4ULXA 1QQ2A 1SK0A 4DSRA 16GSA 2GZPA 1N8JA 1CQGA 3HJPA 1EV9A 3A3TA 3LG6A 5DVBA 2YWOA 4JR4A 1F3AA 5H5RA 3SWLA 3H79A 1B4PA 2HT9A 1FAAA 1T4YA 1TI1A 2FCHA 3FK8A 5F0GA 2VCVA 4HOJA 2K8SA 3GTUB 4GSSA 1GLQA 2HRNA 1SD8A 2H30A 2IMDA 3TCOA 5CRHA 2FUG2 2YNXA 5D8IA 1USBA 4JE1A 3VWUA 3TUEA 2O89A 4EVMA 3GKNA 1YEPA 2VCTA 4K7OA 2E2MA 1O6JA 2F8FA 3EINA 1HD2A 2WJUA 4HI7A 3J7Yb 5D9VA 4YQMA 1IYIA 2RIIA 1XIYA 2OKAA 4NHWA 3US3A 1BEDA 1SENA 1VF2A 3FR3A 1Z3EA 2RUEA 1EEMA 5KN0A 3CXGA 3KGKA 3LORA 3D0ZA 1QK8A 2LRTA 5CAXA 2OBKA 3R2QA 4ECIA 2NDOA 3FYGA 4HJ2A 4G9HA 1U3AA 4OFMA 2LUSA 4WF5A 1T00A 4YQUA 1F6MC 1FHEA 2GLRA 2OE0A 1JZRA 2NBSA 4BL7A 4JRRA 3HA9A 3ZMKA 3FKFA 4OFTA 3TKSC 4GSTA 3IAS2 3O3TA 3EURA 1OVNA 3P90A 1XW9A 4N0VA 4ZBBA 1XPVA 3GUSA 2DMLA 5HFGA 4ECJA 2VOCA 1YY7A 4HZ2A 3L9SA 1S3AA 4KDXA 3DRNA 4AJ6A 3I43A 2H72A 5IO2A 2CVDA 1UVZA 4JEDA 4K0GA 1KTEA 4BPYA 2C0FA 3KJYA 2C4JA 2IFQB 3VWVA 4CHSA 4LL4B 2MMAA 4IW9A 2FNOA 4ZL7A 3TJGA 3UMAA 3VPQA 2I1UA 1NHOA 2IIYA 4OCFA 3GA4A 5KN3A 5C04A 1RK4A 4PUFC 4XHMA 3WYWA 5EY6A 3UEMA 1T7PB 2IMEA 2H73A 4QL7A 1UA5A 3KTLA 4Q5FA 2ES7A 2P0GA 1XWBA 5DCGA 2FLSA 2H6XA 5FT3A 1YEXA 4XS1A 2J9HA 2AHEA 1THOA 1I5GA 4V2LA 1OC8A 5ECLB 2VM2A 4NHZA 2JSYA 2A2RA 3L78A 18GSA 3AY8A 2MBTA 2P5RA 2LNTA 3OR5A 2YWNA 2XC2A 5H5QA 1MDIA 2YJHA 4MF7A 5GAPD 2H75A 20GSA 1GTAA 2EIOA 4EC0A 4MK3A 1B9YC 4XS4B 1PX6A 1T1VA 1PMTA 3IK7A 5ABRA 2YANA 3UAPA 1C72A 1S3DA 1HNAA 3QMXA 5G5EA 2CT6A 2OE3A 4F2IA 1E2YA 3IXRA 5G2ZA 4G10A 4TW5A 1W89A 3IE3A 4DEJA 1YF0A 5D96A 1EP8A 2LJKA 2V1MA 5CP1A 2X8GA 4WBRD 5IMCA 2X99A 4MPFA 2WFCA 5J9CA 3GX0A 2YZHA 2B1KA 4IN0A 5HR0A 1B4QA 1K0CA 5DALA 2C1YA 3DIEA 5JWOB 3KZQA 4E8EA 5EPFA 1A2MA 3H1NA 4AJ7A 4G19A 3NOFA 3KCMA 3IV4A 3UJ1A 4POKA 3M3MA 4FYBA 1K3YA 3E3EA 3QD9A 1XXUA 4GXZA 1GNEA 1GTIA 3ISOA 4MP4A 1XCCA 3MNGA 1SKRB 2BTOT 4D73B 4IP6A 4JR6A 1SJ6A 2JU5A 2H6ZA 2L5OA 3HZ8A 3L9UA 2H71A 2LJAA 3EC3A 5CRDA 1XW5A 3RHCA 1VF1A 2DIYA 1TK0B 4J56E 2MMNA 5FWGA 2I81A 3E9JB 5ECRB 4IP1A 4DSQA 2H1BA 4KSOA 3DGQA 2B5YA 1G6YA 2E7PA 1JLWA 3VPTA 2VCQA 1B8XA 1ML6A 5COHA 2XHFA 3G9BA 5GZZB 3LQ7A 1Z9HA 1GSEA 2O87A 3O76A 2ON5A 4MH3A 4DSSA 3U5RE 1OC9B 2B7JA 2CAQA 1GTBA 3L4NA 1AXDA 4ZXGA 3G7YA 1SJZA 2VUPA 4HQSA 3FRCA 1I9DA 4HU7A 5ECOB 2JZSA 5A4UA 3KP9A 4NV5A 6GSVA 2C80A 5FHIA 2C3QA 4OO4A 17GSA 2VL3A 1R4WA 4MJAA 3TKRA 1A24A 3C73A 1N2AA 4MPGA 5JWRB 10GSA 2VLVA 4TN8A 5INYA 3F0IA 4ZBAA 3H8QA 3FR9A 3GH6A 3GHAA 5A4WA 2A4VA 5HR2A 2IMKA 4GF0A 3F4TA 4I5QA 2MYGA 4HDEA 3P2AA 1XWGA 2IMIA 4GCIA 1FG4A 5B7CA 4Z7XA 4ECCA 2L59A 1ZYEA 2AYTA 3UBLA 2H66A 2OE1A 1AC1A 3VI5A 2R37A 2HXKA 3I9V2 2OBIA 3ME8A 5IIZA 1G7EA 1NHYA 2FWHA 3EVIA 4OD7A 4QL9A 1Q4JA 4GSNA 2O8VB 4DVCA 5KEJA 1QMVA 4GQFA 4KA0A 2BMXA 2KP1A 1O81A 2JADA 3H4KA 3KTBA 2GQMA 2TRXA 4O5RA 1ZOFA 1O8XA 2CQ9A 3C1SA 1LBKA 2KP2A 1DUGA 4MJBA 1RQMA 4IHUA 4EXJA 1TU7A 1F9MA 4ZL9A 3GSSA 1SL0B 2JL4A 4PXOA 3M0FA 4ZB8A 2YP6A 2PPTA 3GX8A 1V58A 2XPDA 3FW2A 5J5NA 2FGXA 5AGYA 1AW9A 1OAZA 4WBJA 3FZAA 1W4VA 5D73A 5CREA 5EL8A 3TJFA 5A5KA 2AV4A 1Q98A 4YAVA 2TRCP 1M9BA 2IWTA 3KXOA 4IVFA 1V57A 4F0CA 4K1FA 3GYKA 2N5FA 1PN9A 3HXSA 4ILFA 1M99A 1TU8A 3C8EA 4LL1B 2HFDA 2IMFA 4AJ8A 4KH7A 4LMVA 2C8UA 2IN3A 3HY2A 3WT2A 3GN3A 3VWXA 1K0MA 5AN1A 1Z6NA 2QSIA 1FO5A 1GWCA 5L71A 1OC3A 3BCKA 3FZ9A 1J9BA 2YN1A 3L9VA 1EOGA 5JCWA 2ZUPA 1GSYA 2N5BA 1R5AA 4KDUA 1F37A 1PA3A 4BVYA 4TXOB 4CW9A 4XS4A 1QXHA 3HD5A 1U88A 1WMJA 4KSMA 4OCEA 5IMAA 3DXBA 2AJQB 2LTKA 1PX7A 2HYXA 2C3TA 3CMIA 4MZCA 2HZEA 4MH2A 13GSA 2GZZA 3APOA 3KH9A 2V2GA 4ML1A 1WWJA 1PRXA 5CO3A 4EF0A 1QFNA 1TRVA 1MD3A 2MMOA 4TVEA 3IRAA 2X64A 1GTUA 2VD0A 3QAWA 3UIWA 2M80A 3F6FA 4I97A 2VLTA 22GSA 3EWLA 5H5SA 3VI7A 3F4RA 1U87A 1XOAA 4ZL8A 2C3NA 12GSA 2CX3A 4GRFA 4L5OA 1TK8B 1XOBA 2H0GA 1BG5A 2HRFA 1A23A 1WP0A 2OA7A 2XBIA 4TR1A 2GDRA 2MZCA 1R5PA 3HKRA 1PD21 5JCGA 2JZRA 3FR6A 3D21A 3RDWA 1XVQA 5IO0A 3C1RA 5DQYA 5DJLA 1X5CA 3QDNA 2JSZA 2R3XA 4MA9A 1TOFA 2H6YA 1OE7A 4I2UA 2YPMA 3Q19A 5JWQB 4ZB6A 2EIRA 4IQ1A 2DC5A 4MLYA 4HJMA 3D4MA 4YQVA 2HLSA 2K8VA 4I2TA 6GSYA 3WGEA 4AF2A 2HI7A 1XVWA 4PQHA 1FW1A 4V2NA 3TKQA 2NPBA 1JFUA 4NPBA 5AISA 1SKSB 3GRXA 2K6VA 3TJBA 1UN2A 2GT5A 1GH2A 3ZFLA 3TGZA 3ERWA 3CRUA 1YDKA 1GNWA 2RLIA 2VCXA 2BJXA 2C0GA 3Q18A 1AAZA 4K0NA 2VAFA 3KD0A 5J3RA 3TRPA 4RQXA 5ECQB 2CV4A 1G7OA 2L4CA 1E6BA 1UC7A 5E59A 5IPGA 2CVBA 5B6MA 5GSTA 3PINA 2ZCTA 4MABA 2F3MA 1ZL9A 5IMDA 2J23A 4JZQA 2GS3A 3FHKA 5D9XA 1GSSA 4TXVA 4TOPA 1QUWA 4L0UA 3TKSE 1MTCA 3I6AA 3ZREA 2C0DA 1WPIA 2X8HA 2DBCA 2VL2A 1SU9A 4KX4A 1GL8A 2B6MA 5DAKB 2L5LA 3L0HA 1GSFA 2YWIA 3TOTA 1EP7A 3TOUA 3GIXA 3HVXA 1ZCPA 4Q5QA 1M2DA 3P7XA 4G2EA 3HVVA 1SK1A 2H01A 1IYHA 3HVSA 5ECNB 3FZ5A 4V1Ap 2P31A 3UVTA 2YV9A 3LEFA 4L5LA 3KP8A 1A8LA 2V32A 2H8LA 3TKSA 3KH7A 3JCML 4N11A 1AIUA 5HR3A 1K0AA 1Z6MA 5J9BA 5AIXA 1PSQA 1OYJA 2DLXA 3ZTLA 5CNWA 3LJRA 3MSZA 3SBCA 5D9WA 1DBYA 4FO5A 3F3QA 3DWVA 2M72A 2NVLA 2QGVA 2FA8A 5A4VA 4PURA 1O7UA 3IPZA 4PGTA 2V41A 3ZIJA 3LYKA 5F06A 3RAZA 3CSIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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