3ZL5A

Crystal structure of schistosoma mansoni peroxiredoxin i c48s mutant with one decamer in the asu
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
LLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVSPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Switching between the Alternative Structures and Functions of a 2-Cys Peroxiredoxin, by Site-Directed Mutagenesis
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
molecule keywords PEROXIREDOXIN I
total genus 54
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zl5A00
5C04A 3PGTA 3J7Yb 2LKUA 4MLYA 1VRSD 3A5WA 4WF4A 2J23A 3QFAC 5CNWA 1PMTA 3UVHA 4KE3A 1NHOA 1V9WA 2GSSA 4KDYA 3ZITA 1EEMA 2H1BA 2KP2A 1OAZA 1HNBA 1ILOA 2MBSA 3BD2A 4G2EA 3GTUA 3O76A 4I5QA 2FA4A 5IM9A 5EVOA 2XHFA 1FB0A 2PWJA 4AF2A 2CAIA 1WMJA 2CAQA 4LMWA 4WETA 1C72A 1I5GA 2MMAA 4IJ3A 2KHPA 1HNCA 4IHUA 5A4UA 3TRPA 4XS1A 3KMOA 4WXTA 4MJAA 1YY7A 2P31A 4JR4A 2H76A 5B8BA 2HXKA 3GV1A 4EF0A 4L0UA 3UIWA 4DVCA 4EXJA 1TRSA 3PINA 3RAZA 2IMFA 1TKDB 1K3YA 1LBKA 4JE1A 1T3BA 2P5QA 5DCHA 5IMVA 1K0NA 3F4SA 3VPTA 2C3QA 4TOPA 3OR5A 1BYEA 3IRAA 3D6IA 4F03A 2B7JA 3Q74A 1OKTA 3VI7A 1TRVA 3FZ9A 4YQVA 1MD3A 2NTOA 3EC3A 1Q98A 3DXBA 1GRXA 3KJYA 5D96A 2NBSA 2C1YA 3L4NA 4MZCA 1K0MA 5J4UA 3HYPA 5G1KA 2CX3A 4NHWA 1TRWA 4I8BA 3DMLA 1F37A 3KTLA 4PGTA 17GSA 5ELAA 1YEPA 1X5DA 3WT1A 4K8MA 5CP1A 2VM1A 3VPQA 2B7KA 2JADA 2P0GA 1XCCA 4OMVA 3IE3A 1YJ6A 2FWEA 3ERWA 2LS5A 1I9DA 3HDCA 1X9SB 22GSA 2IMIA 1B4QA 2H70A 1M9AA 5ECPB 1SJ6A 1F3BA 4ECBA 1GSYA 1U3IA 2IN3A 3APSA 1TOFA 4TW5A 1ABAA 1RK4A 5IPHA 4K7IA 3QAVA 3P7XA 3UAPA 5KN1A 5B8AA 3D4TA 2HT9A 5ELGA 2I4AA 5JWOB 2K8VA 3GL5A 1G7OA 3L9UA 3M8NA 2WGRA 2O7KA 3NZNA 2GQMA 4DSSA 4BWQA 1WRYA 2V6KA 1ON4A 3ZLPA 4WR4A 2HYXA 1UN2A 2D2ZA 1BAYA 2V1MA 3CSHA 2HZEA 2M46A 2YJHA 3CRUA 3ME8A 3UVTA 3TJJA 2H8LA 2YWNA 2FWGA 4AGSA 2N5FA 3W6GA 2VUPA 4NXIA 4OWYA 1Z5YE 1THXA 1GTUA 1G6YA 3DWVA 5INYA 3UBKA 4IJIA 1ZGNA 1F3AA 2CV4A 1SL2B 2MMNA 4NWYA 1TP9A 2WDUA 1AAZA 4D73B 1B4PA 5EL8A 2GDRA 1PL2A 1TW9A 4I2UA 4OD7A 4HZ2A 3RPNA 5ENUA 2GS3A 3GKXA 1U6TA 5HR1A 4PNGA 2YCDA 4K0NA 1QGVA 4EE0A 3DGQA 1XVWA 2R2JA 2L6DA 4IW9A 3TOUA 1T4ZA 1LU4A 2H73A 2A2SA 2TRXA 3IK7A 2F8FA 2R6KA 1PKWA 4TR1A 3I6AA 2C0EA 3IBHA 2JZSA 3I69A 1K0OA 2DJ3A 4X1UA 2B1KA 1TXXA 2B3SA 2VAFA 2CVKA 4GWRA 1TK0B 5DJMA 3FR6A 3HZ4A 5D9TA 4V2LA 3A3TA 4L5OA 1A2LA 1O73A 2L4QA 3CBUA 4GSSA 4IP6A 3TDGA 5DCGA 1TI1A 4O7HA 3TKQA 4K7OA 3F63A 5CRGA 1FVKA 5F05A 3WGDA 2R5GA 2RUEA 4TVEA 4POMA 4L8EA 5A4WA 3TGZA 2CVDA 3BBYA 3UMAA 5F06A 4HEA2 4MZBA 2KLXA 1Z6MA 1WPIA 5IMFA 1OC3A 2IMDA 4WKWA 3KH9A 4FH8A 3KH7A 4XCSA 5C00A 1Z3EA 2DJKA 4JBBA 3MAKA 1XXUA 3IOSA 1SL1B 3LYKA 1GNWA 4OFMA 1X9MB 1O6JA 4IN0A 1VF2A 3UL3A 4F2IA 4PQHA 3LJRA 4GQFA 3O3TA 3GN3A 3QPMA 5AIXA 3ZREA 2LEGA 3EMPA 3TJGA 3WD6A 3IXRA 1SL0B 1XWBA 3HKRA 1M99A 1BJXA 3FHKA 3EU3A 3H8QA 1RQMA 3H1NA 2LRNA 4WBRD 4V1Ap 3GNJA 5DJLA 1QQ2A 1PGTA 2FY6A 1ACVA 4G10A 4ECJA 1MDJA 1SD8A 1S3CA 3GHAA 2HZFA 4POBA 3V1WA 5HFGA 1XW5A 5A4VA 5IO0A 1YEXA 2TRCP 1XWCA 4J2FA 3W8SA 3D0ZA 4HS1A 5FHIA 1BX9A 4ILFA 4BA7A 3WT2A 5F0GA 1AW9A 3SWLA 2H19A 3TKPA 2E2MA 3GA4A 3N9JA 3CTFA 3LEFA 3DVXA 5ECMB 1GNEA 3KEBA 1A2JA 2H6YA 2ALBA 2FA8A 3FZAA 2WJUA 2C8UA 1J0FA 3KM6A 2C0GA 3K8NA 4MCUA 4G19A 1YDKA 3LORA 3GH9A 2F3MA 4WR5A 1MDKA 4ZB6A 1FVJA 4AJ8A 5GSSA 1AUCA 9GSSA 1E6BA 3VWWA 1KEBA 3NIVA 4IVFA 1UC7A 2JZRA 3ERGA 5IMCA 4ULXA 1SU9A 2FWHA 6GSTA 1ERTA 18GSA 2PPTA 1GUKA 1R26A 3IHQA 1XFLA 3CMIA 2OBKA 4O92A 3IAM2 4EC0A 2HNLA 2LTKA 3BOAA 1AQWA 3FYGA 2GSQA 2KUCA 1N2AA 2M72A 2ZCTA 4JEDA 1EV4A 1T8EB 3CXGA 4XRDA 1XPVA 2H6ZA 1RW1A 4YAPA 4X43A 4KGIA 2PGTA 4IP1A 4FYUA 2L4CA 1M9BA 2BTOT 3GKMA 6GSUA 4PQ1A 3E9JB 2H01A 4ML6A 4TR4A 4EO3A 1MD4A 2YANA 3ZIVA 3H93A 4OCEA 4F0CA 1JHBA 5DDLA 1GUMA 4ML1A 1SJIA 2IL3A 5F07A 4I2TA 2E2GA 2GT5A 3L0HA 3ZFBA 2N5BA 4MH3A 3L9SA 4KDUA 16GSA 2GVPA 3FR9A 1YKAA 2A2RA 2VIMA 2VM2A 2H1AA 3C1SA 3IA1A 3I9V2 1ZCPA 2H0HA 3GFKA 3CYNA 3LGCA 4MPGA 3TCOA 4H86A 3QFBC 4PXOA 4GLTA 1GTBA 2HFDA 1WWJA 3G9BA 4ACSA 2FWFA 2NVLA 1VF4A 2ZUPA 5AIVA 1KBNA 3ZTLA 4OO5A 4ZL8A 3C1RA 6GSVA 5HR3A 3TJKA 3A2VA 4NPBA 2JL4A 4FYCA 2YJ7A 4XHMA 3RPPA 2C3TA 4DEJA 2WULA 1TU7A 1YQ1A 4KA0A 5ECNB 5J41A 1URMA 1M2BA 4TXOB 3ZFLA 4PURA 2E7PA 2YV9A 2H71A 4MMMA 4ECCA 1B9YC 1DBYA 2B5EA 4FO5A 3LYPA 3RHCA 3FW2A 5E59A 4YH2A 4IQAA 4D73A 5CRDA 2B5XA 2HRFA 1AQXA 1R5PA 5GZZB 3DVWA 4LMVA 2MYGA 5EY6A 1NHYA 3UARA 5CRHA 2GZZA 3HZ8A 4NV2A 4LLRA 1EGOA 3F3QA 4PX1A 1TK8B 4I97A 5D9WA 1K0CA 1XZOA 3E3EA 1B8XA 3F0IA 4MJCA 3DIEA 4YQMA 3TB2A 1EOHA 1WP0A 2VCTA 3CRTA 2O8VB 2GSTA 3HXSA 1ML6A 1JLWA 1H4OA 1FAAA 2R3XA 1FG4A 4ZBAA 4WBJA 1Q4JA 2AYTA 1O85A 1YKCA 3VFIA 1X0RA 3U6VA 4FIWA 1XWAA 1Z7PA 1ZYQB 3ZL5A 2B1LA 1BEDA 3EMXA 1SYRA 5KN3A 1H75A 3EWLA 4XTSA 3C7MA 2HE3A 4POLA 2V6OA 3TOTA 4RI6A 1PD21 1OE8A 1XOBA 1J08A 1U87A 1W89A 4MK3A 3L9VA 2P5RA 3TJFA 3ERFA 5KEJA 5ECHB 2H6XA 2DJ1A 2F9SA 1DE2A 1NM3A 4KB3A 5G1LA 12GSA 4WEYA 5G31A 1V40A 1QXHA 4MJEA 2OA7A 1TJDA 1EWXA 3JCML 1Z7RA 3ME7A 2LQOA 1A0RP 4JRRA 3HHVA 2AV4A 2MZCA 4IKHA 1UVZA 5HQPA 1SK1A 1N8JA 5ECSA 3LQ7A 2JSYA 3VWXA 3KP9A 5D9XA 3ZVJA 1THOA 4POKA 4MZWA 4NMUA 3GMFA 2CZ2A 3DRNA 5IMAA 2GGTA 2Z9SA 1R4WA 1ZMAA 1XIYA 2F8AA 14GSA 3VI5A 5JCWA 1J9BA 1M7TA 1PRXA 1O7UA 3APQA 2C0DA 3P2AA 4RUVA 3ZMLA 2WFCA 3SBCA 2YZUA 4ZBDA 4YAVA 6GSSA 1VF1A 1T00A 2YPMA 2TIRA 2LNSA 5ECLB 2EIQA 2VOCA 3CTGA 4LA1A 1O81A 5G5FA 1ERVA 1EOGA 2LJKA 3ISOA 2LSTA 1MDIA 1CQHA 4GRFA 2WB9A 2NDOA 2FHEA 4KDXA 2IJYA 3G7YA 1VF3A 3HVXA 4HQZA 4EUYA 2V41A 2BJXA 5HFIA 2HRNA 1X5CA 5AGYA 2FGXA 2L59A 2X64A 3HJMA 3LFLA 3M3MA 2H72A 3MSZA 1T1VA 2ES7A 3KGKA 3U5RE 1ERUA 3KTBA 4HJMA 2PUKC 3EU4A 7GSSA 1FB6A 1XVQA 4BWSA 5IO2A 2YWIA 1TU8A 3HVVA 2ZNMA 1SKSB 5CREA 2XBQA 3Q6OA 2HSHA 3GURA 2XPDA 4K6XA 1KNGA 1EP7A 1GSUA 5E4WA 1FO5A 2JZTA 1A23A 1TTZA 2OACA 2I3YA 4Z7XA 2GT6A 3UJ1A 5HFKA 2LRTA 4GSNA 4IGJA 3VK9A 2KOKA 2C0FA 2IIYA 1EGRA 2AAWA 5IOWA 2VL3A 1B9XC 4MF6A 1DSBA 4XIHA 1MTCA 2K18A 3ZRDA 2XPEA 2J9HA 1EZKA 3CSJA 8GSSA 4J57E 1AC1A 2K9FA 4K7NA 2L5OA 3P8WA 1JZDA 4IS0A 5F8BA 2MMOA 5IIZA 3GYKA 4KCEA 3HJPA 2X8CA 4ECIA 1ZZYA 4ZL7A 4MP4A 1JLVA 5DAKB 4L5LA 1X5EA 3VURA 3IDVA 3KXOA 2HSYA 3ZVJD 4XS6A 3QDNA 1JZWA 1A2MA 4PNFA 2VCWA 1A0FA 3EINA 1USBA 3WYWA 3M9JA 1AIUA 3TJBA 1M2AA 3ZMKA 2PERA 1GLPA 2ON7A 2CVBA 1JFUA 2IFQB 5ID2B 2C80A 4MJBA 4HU9A 1GULA 2FUG2 3APOA 4F0BA 3BCIA 5COHA 2DIZA 4OFNA 10GSA 4G9HA 1SENA 2EIRA 4OFTA 3Q18A 3RHBA 2FLSA 4KSOA 3AY8A 1SKRB 1ERWA 3L78A 1PA3A 2C3NA 1IYIA 2JU5A 5JWRB 5JWQB 2PVOC 4IBPA 2OKAA 3VLNA 1GWCA 1K3LA 4MPFA 3QAGA 4ZXGA 2OE0A 2VL9A 2VO4A 3ZZXA 5DQYA 1QUWA 5IQYA 1HYUA 3TUEA 3FEUA 4TXOA 2C4JA 3J7Yk 5LNKe 2YZHA 4ID0A 3C73A 4KSMA 4ISDA 5DBQA 2CT6A 1TI3A 4E8EA 1XWKA 3F3RA 1V57A 3GL3A 2B6MA 1PKZA 3CSIA 3IAS2 4V2NA 1Y25A 2EIOA 3GUSA 1EV9A 3PR8A 3S9FA 2FCHA 2LRCA 3KD0A 4N30A 3LG6A 4GCIA 5DQSA 3GX0A 4OCFA 1GSFA 2GQKA 2DMLA 2RM5A 19GSA 2CZ3A 1K3OA 1IYHA 1JZOA 5HR2A 5GAND 3FK8A 1PN9A 1VGLA 2ON5A 2X8GA 3C71A 3UOMA 1YZXA 1SD9A 2H30A 5ECRB 4V1Ag 1QFNA 1V98A 1XW9A 4QL9A 2A4VA 4WF5A 3HD5A 5D93A 1GSDA 3W8JA 1GTIA 4LL4B 1S3DA 3ED3A 3H4KA 5L71A 3IC4A 2DIYA 4O5RA 1F9MA 3D21A 4L0WA 2VCVA 2FD3A 2V2GA 2PBJA 2WCIA 3HA9A 1PX6A 4TRXA 3IR4A 1SYXA 4KW6A 4EKZA 5JCGA 13GSA 3US3A 1U88A 5H5QA 4HI7A 2G0FA 1T7PB 4KCAA 2YV7A 3HVSA 4TN8A 5H5SA 4BVXA 3DYRA 1GSSA 2I9HA 3MWHA 3QMXA 3EVIA 1A8LA 2GZPA 3TKSE 4TR3A 1M0UA 2F51A 4N0VA 2PMTA 3QOUA 4F82A 2AUVA 3DEXA 3BJ5A 2DJJA 1K0AA 2VCZA 4OO4A 1KTEA 1Z9HA 4F9ZA 4MDCA 1FOVA 3N5OA 5ECKB 4KUNA 2X8HA 1BG5A 5ECOB 3UBLA 1ST9A 5DALB 2L5LA 5CAXA 4XS4A 3LXZA 5A5KA 4Q5NA 4ZL9A 1HQOA 5G30A 1MEKA 4BPYA 3QAWA 3KP8A 4GF0A 4HUAA 5J9CA 1R7HA 1GTAA 2LJRA 3QD9A 3F8UA 4HQSA 1PX7A 4MF5A 3FZ5A 2OADA 4IELA 2R4VA 1O8XA 2X99A 1GUHA 3GTUB 4RQXA 1GSEA 1QMVA 2VL2A 3Q19A 1E2YA 1FW1A 1G0TA 2DSAA 2YWOA 6GSYA 3C8EA 3IK9A 4PQIA 3TRQA 2AJQB 3GX8A 1Y6EA 3LWAA 1F2EA 3H79A 3M9KA 4GSTA 4IQ1A 3G7JA 5IPGA 2DJ0A 1O8WA 3TKSC 1LJRA 3F4TA 2VLTA 5D73A 1XBSA 2WS2A 1UA5A 1GH2A 2LV3A 2WRTA 2H0GA 4BVYA 2JACA 4RI7A 1PL1A 1V58A 3R2QA 3I43A 2AHEA 2MMZA 6GSXA 1M2DA 2YP6A 3E0UA 2RM6A 4HJ2A 3PH9A 4X0XA 3ZYWA 4MA9A 1SK0A 5CO3A 4BL7A 2VCXA 2YNXA 4DSRA 2VCQA 4KH7A 2LUSA 5J9BA 2OE1A 4HOJA 2CQ9A 2L6CA 4V2MA 4XS4B 5AISA 3F9UA 2WZ9A 4MH2A 1WE0A 1XWGA 2H1DA 2DMMA 5H5RA 3M1GA 2QKEA 5AN1A 4ZB9A 3P90A 2VD1A 1SJZA 4HDEA 1OE7A 1GP1A 1EEJA 2B5YA 1HNAA 4HZ4A 3WGXA 4RQRA 1WOUA 2HLSA 5DVBA 4CDOA 2GQLA 2IPAA 2O85A 1T4YA 5B6MA 1K0BA 3F4RA 1OKDA 2QGVA 2N5AA 5CRWA 3LXTA 2QSIA 3GSTA 2FNOA 4GQCA 2OBIA 2I81A 1PSQA 5J3RA 1SKWB 4EDYA 1OC8A 4ZILA 2REMA 5DAKA 20GSA 1U3AA 2LNTA 1DE1A 4TKYA 1K0DA 4MABA 3HJOA 3QCPA 5CYYA 4DSSB 4HU7A 3ZIJA 1TK5B 2M80A 3GH6A 2RUFA 2GLRA 2GTUA 4NHZA 2DLXA 5D8IA 4JU5A 5JCUA 4J56E 2H0IA 5B7CA 2VD0A 3D5JA 3IPZA 4FYBA 5B6NA 2IFQA 5ID2A 3M0FA 3GIXA 1OC9A 2HZEB 3NOFA 4N0ZA 5GAPD 4JR6A 1EP8A 4ZB8A 3KMNA 2XC2A 1R5AA 2DBCA 2H1GA 1B48A 1WJKA 1WIKA 1BQ7A 5G2ZA 3RBTA 1QK8A 2LJAA 5G5EA 2DC5A 4MF7A 1SK2A 1ZL9A 3O6TA 3IV4A 1NW2A 3GRXA 2K8SA 2QC7A 2L57A 3F6DA 3D4MA 3GKKA 3VWUA 2AB6A 5HR0A 1Z6NA 5KN2A 4AJ7A 4EVMA 2HI7A 1GSQA 5GSTA 1NSWA 2R37A 3G7IA 4KNDA 1JZRA 1YF0A 4PUAA 1YF1A 5LD0A 4EL1A 1X9WB 3RDWA 3TKRA 5IMDA 2E0QA 2O89A 3KIJA 2O87A 11GSA 2PVQA 4TXVA 1W4VA 4N11A 3GKNA 1TRUA 2XBIA 2IMKA 3FKFA 3DKSA 2OJLA 4JZQA 4EDZA 1TDIA 2OE3A 4NAXA 3UEMA 3A2WA 4Q5RA 2CA8A 3F6FA 5EPFA 4YQUA 5J5NA 1V2AA 2MBTA 2G2QA 4QQ7A 4TR1B 3MNGA 3FZ4A 2H74A 5D9VA 5ECQB 2VL2C 4K0GA 2RIIA 2PN8A 4Q5QA 4ZBBA 1OVNA 2RLIA 3TRXA 3FY7A 2BMXA 3EURA 1AQVA 5ABRA 2YN1A 1PQNA 4AJ6A 3A2XA 6GSWA 1AXDA 2PU9C 4K1FA 1GL8A 2VLUA 4ZIJA 3HCZA 2EC4A 2YWMA 3DD3A 1GLQA 3D22A 1G7EA 4Q5FA 2IMEA 4DSQA 1OC9B 4KX4A 2V32A 5FT3A 1DUGA 3TKSA 3GSSA 4CW9A 1CQGA 4K2DA 4E8HA 2I1UA 4KAEA 4NV5A 4LL1B 4XRAA 2CX4A 5KN0A 4O32A 1FHEA 5IMZA 5ECIB 2H75A 1ZOFA 4QL7A 1XOAA 4TR0A 2GSRA 4PUFC 1G6WA 2K6VA 3MDKA 4CHSA 5FWGA 5LCZA 1ZYEA 5IOXA 4I6XA 2JSZA 2VLVA 1S3AA 4GTUA 3KZQA 3VWVA 2LQQA 2H66A 3QR6A 3BCKA 1XW6A 1OYJA 2GZYA 2DJ2A 2IWTA 2NPBA 3FR3A 4N10A 5DALA 2KP1A 3KCMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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