3ZL5A

Crystal structure of schistosoma mansoni peroxiredoxin i c48s mutant with one decamer in the asu
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
LLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVSPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Switching between the Alternative Structures and Functions of a 2-Cys Peroxiredoxin, by Site-Directed Mutagenesis
pubmed doi rcsb
molecule keywords PEROXIREDOXIN I
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 54
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zl5A00
2PERA 2F8AA 1JLVA 4N0VA 3W8SA 2FNOA 2KHPA 3GH6A 1UVZA 3VI7A 4I2TA 5HR0A 4AJ7A 1EP8A 3M3MA 3KD0A 2VCQA 4KH7A 3SBCA 3TJJA 4XTSA 3ZIVA 3E3EA 2H74A 2VD1A 3LYPA 3IHQA 3ED3A 1J08A 1GRXA 1JZOA 1I9DA 1T4YA 1TI1A 1K3OA 2YPMA 4L0UA 2YNXA 1JZWA 1XW6A 2MYGA 2P31A 2GT6A 1NHYA 2MBTA 3ERFA 2B5EA 2DJ0A 2OACA 3W6GA 2P0GA 2I9HA 1HNBA 4IVFA 5H5SA 3GTUB 4GQCA 1M9AA 1XPVA 1V40A 3TJKA 2VLTA 5IPHA 4TXOA 4HZ2A 4OFMA 2JL4A 9GSSA 4ZB8A 17GSA 3UMAA 2L57A 4HS1A 1AAZA 1ERTA 1QGVA 6GSVA 4V1Ap 1SKWB 2GS3A 5GAPD 2LJKA 1PKZA 5IMZA 2X8GA 2M72A 3APSA 5G2ZA 6GSYA 1DUGA 3H79A 1GSSA 4WETA 2E7PA 1GTUA 1XOBA 1Z9HA 2WZ9A 1IYIA 3LYKA 3ZFBA 2BJXA 4TR0A 2R3XA 5LNKe 2VCZA 4FO5A 1WE0A 2HE3A 3RPNA 4ZL8A 3HVVA 3FR3A 4KA0A 1EEMA 3H4KA 3ME7A 1XW9A 3L9SA 2I4AA 4K8MA 3CSIA 2CAIA 1VF4A 5ECLB 1GTBA 1Y6EA 2WDUA 1K0MA 2A4VA 5ECIB 1XWGA 3C71A 4Q5NA 3DMLA 14GSA 4I2UA 5DJMA 1K3LA 1QQ2A 3UIWA 2H0GA 3DVXA 1F2EA 2B7JA 3GA4A 1GSYA 2C0DA 1T1VA 4YH2A 1K0OA 4POMA 2F51A 4XS1A 3DKSA 2YN1A 1LU4A 5GZZB 5EPFA 3EURA 4WBRD 1GUKA 1QXHA 1AUCA 3EWLA 4IW9A 4MABA 4V2LA 1GLQA 2ZUPA 2TIRA 2VD0A 3FW2A 4V1Ag 3HHVA 1WPIA 3HKRA 1OKTA 4MPGA 2R4VA 2LV3A 3DXBA 1X9SB 2YCDA 3KXOA 3KEBA 2IMIA 3CBUA 4IQAA 2DBCA 4G10A 1TRSA 6GSXA 3IOSA 3TUEA 1SL0B 5ECOB 1TRVA 2H30A 2DJ1A 4PQIA 4HI7A 4MZCA 3HD5A 2L4CA 2HI7A 5DBQA 2J23A 4KW6A 5D96A 3EU4A 1XXUA 3TGZA 2DMLA 1T4ZA 4OFTA 3FZ4A 4J2FA 2F9SA 1PD21 4YQMA 1EWXA 4K9ZA 4MJCA 2FHEA 2I1UA 1X5DA 5LD0A 3PINA 1QUWA 1G7OA 1M2BA 3M1GA 1BJXA 2YP6A 1FB0A 3CTFA 2CX4A 3FRCA 3ZFLA 2VL9A 2H1DA 3A5WA 1VGLA 5E4WA 2YWNA 4RQRA 2I81A 6GSSA 3CYNA 4JE1A 4PXOA 2H66A 5A4WA 4NHWA 2B1KA 1CQGA 3EYTA 3GH9A 1V98A 3W8JA 1XWAA 1SYXA 1W89A 2CV4A 1URMA 4BWQA 1PX7A 3D4MA 1JZRA 3KGKA 1GTAA 3F4RA 3M9KA 2MZCA 3GV1A 3HA9A 4KDUA 1XVQA 3J7Yk 2JZTA 3C7MA 20GSA 4KCEA 4FYBA 3UBKA 2BMXA 4X43A 2DIZA 3QDNA 3KMOA 1EOGA 5B7CA 2K6VA 1O8XA 2YWMA 1DSBA 1SK2A 3RPPA 4EO3A 2HZEA 2C0FA 4KDXA 1EEJA 1PRXA 2ZCTA 5A4VA 2MMZA 1FG4A 5EVOA 1Z7RA 2H01A 2GVPA 3EC3A 4L5LA 1G7EA 1GH2A 8GSSA 2B7KA 3L78A 1YKAA 1TP9A 2PVQA 1YKCA 3E0UA 1FW1A 1ML6A 4ECBA 3KTLA 1M7TA 5ID2B 1HD2A 2GQLA 5COHA 4EL1A 4GSSA 1SU9A 3I69A 2VCWA 1O8WA 4I8BA 4EXJA 4OD7A 4IQ1A 3GKMA 4ZBDA 1RW1A 5DCGA 4JZQA 4OO5A 5HFKA 2OE3A 3GL3A 3GUSA 3WYWA 5G5FA 2H0IA 5KN0A 4K0GA 3U6VA 6GSUA 1GP1A 2AJQB 3BD2A 2YZHA 1T00A 2AHEA 4HJMA 4IN0A 1M99A 1EP7A 1A23A 1OKDA 4ECIA 3KM6A 2C4JA 2CZ3A 3GX8A 5J9CA 1THOA 3QCPA 2WJUA 4MJAA 3C1SA 3H1NA 4IHUA 4L0WA 4ZL7A 2JSYA 1G6YA 2CT6A 2YZUA 3GX0A 4POBA 1J9BA 1K0DA 4WKWA 2FY6A 3VLNA 4N11A 2IFQA 4MK3A 4WBJA 3GURA 1ACVA 5LCZA 4OFNA 5IMCA 2HZFA 2WULA 2RUEA 2PPTA 5D9TA 4BA7A 1KTEA 2CA8A 2ALBA 4BVYA 4DSSB 4F2IA 5HFIA 1T3BA 4PNGA 1M2DA 3A2VA 2KUCA 2V2GA 1EV4A 2E0QA 3GKNA 2OBKA 3RBTA 4PQHA 3TKSC 16GSA 3TDGA 3TOUA 4CDOA 4Q5RA 4XS4B 3S9FA 2VO4A 1XZOA 4JR4A 2HSHA 1KEBA 2F8FA 5ECQB 3F3QA 5JCUA 1SKRB 5IMAA 3WD6A 1ABAA 4QL9A 2D2ZA 5INYA 3BOAA 4PURA 2LRNA 5L71A 2H75A 3F63A 3TKSA 4DVCA 4Q5QA 1A0RP 3GKKA 1GSDA 2LEGA 5FT3A 3LXZA 4E8EA 5AIVA 1OC8A 1M9BA 1V9WA 5CREA 1F6MC 1ZCPA 4BVXA 3QMXA 1A2JA 5J41A 3IPZA 2IJYA 3LQ7A 3N5OA 3WGEA 1U3IA 1EZKA 1OC9A 4BPYA 5CO3A 1K3YA 1OYJA 1HNAA 2R37A 4NPBA 1TW9A 1SD9A 3M0FA 3P8WA 3IK9A 3GL5A 1U3AA 4MZWA 4GQFA 2KOKA 2TRCP 2L6DA 2OE0A 3BCKA 2F3MA 2OA7A 4HU9A 1TU7A 1Z3EA 3LWAA 4GSTA 4D73B 1VF3A 1QK8A 3LEFA 3APOA 2H1GA 2TRXA 5DJLA 5ECPB 1TK8B 2CVDA 1O73A 1UN2A 2L5OA 1B4PA 5DALA 5D9VA 4JBBA 5F06A 4K6XA 2CVKA 1FHEA 1GSFA 1SENA 2NDOA 2K18A 2REMA 3PGTA 2V6KA 2V41A 3TCOA 1YEPA 4LL4B 4DSQA 4ECCA 4DSRA 2VM1A 5HFGA 3TJGA 5JCWA 5IM9A 5DVBA 4KSOA 3DWVA 5G1KA 2FCHA 4XCSA 3F9UA 5D93A 1AW9A 3NOFA 3BCIA 3F6DA 3VPQA 4HOJA 4MDCA 3LXTA 2FD3A 1AIUA 1ZYEA 2AAWA 1VF1A 1O6JA 1ZOFA 4IELA 1Z5YE 1UC7A 3ZMLA 4MF7A 1R26A 3EINA 2H8LA 1FVJA 4KCAA 7GSSA 3QAWA 2B6MA 4G19A 2RLIA 3QD9A 4TOPA 5AGYA 2MMOA 5ECNB 4IP1A 4ZB6A 2M46A 1K0NA 3CRUA 1G6WA 4J56E 4CHSA 4ZILA 5B6NA 5G1LA 2GZPA 2WCIA 1TU8A 1BAYA 13GSA 4GWRA 4PNFA 5J3RA 1B8XA 4KSMA 2LS5A 5IMFA 1GNWA 3EVIA 3VFIA 4TR1A 3GTUA 2VCTA 2RIIA 2VAFA 2N5AA 1M0UA 3KP8A 2GSQA 3KZQA 2FWHA 3L0HA 5G30A 2X64A 3GNJA 2CAQA 4MH2A 2FGXA 1S3AA 3L9VA 1ZZYA 3UJ1A 2B5YA 4JU5A 2IWTA 3O6TA 3M8NA 3HVXA 1IYHA 4TKYA 2LNTA 1MEKA 3KCMA 3G9BA 1OAZA 4PX1A 2LRTA 4PUFC 5DDLA 2GDRA 3IC4A 2VCXA 2ON5A 1EV9A 4EUYA 4YQUA 5HR3A 3HJPA 1QFNA 4F9ZA 2PBJA 1BQ7A 1XWKA 3LG6A 2AV4A 10GSA 2IMDA 5DAKA 3KH9A 2CVBA 5IO0A 3R2QA 1ZMAA 3FR9A 1B9YC 2C1YA 4EDZA 3HXSA 2QGVA 2HXKA 1KNGA 4LMVA 5KN2A 1Z6NA 3KMNA 1N8JA 2AYTA 2HZEB 2LJAA 1YQ1A 1Z7PA 1X5EA 1F37A 4POLA 5CRWA 1XVWA 2YOIA 2V6OA 4N30A 5ECRB 2C3NA 4WXTA 4IJ3A 3IK7A 3UEMA 2HSYA 3APQA 1GUHA 4DEJA 2MMNA 3TOTA 11GSA 3C73A 4AJ8A 4GCIA 4F0CA 4HU7A 3P2AA 2H73A 2NBSA 1ZL9A 4GLTA 2HRNA 3QAGA 1A8YA 3ZZXA 2H70A 2R5GA 1Q4JA 3BBYA 1ERUA 2EIRA 2NTOA 5J5NA 1O85A 4TW5A 3D21A 4EKZA 4ZL9A 2X99A 4NV2A 22GSA 1SK1A 2PU9C 3EE2A 3QOUA 3IAS2 4MLYA 5IIZA 4ILFA 3C1RA 3VWWA 2RM6A 3HZ8A 5AN1A 4XS6A 2PUKC 1KBNA 1TOFA 2YJ7A 1ERWA 1PX6A 5IMDA 5DQSA 5A4UA 3DIEA 3IR4A 1E2YA 4TN8A 4G9HA 2GQKA 1PGTA 4IJIA 4OMVA 3Q6OA 2YV7A 1SK0A 4OCEA 4RI7A 5H5QA 3Q19A 2L59A 5F07A 3A3TA 4MJBA 1V58A 3IAM2 3ZIJA 5FWGA 4RQXA 1GSUA 4LLRA 1CQHA 1MD4A 2VLUA 3TB2A 2VL2C 4V2MA 3IDVA 4F03A 5J9BA 3CRTA 2YWIA 3DGQA 1PA3A 2C80A 5B8AA 1BG5A 1X9MB 4MMMA 4V2NA 4HDEA 3HY2A 2BTOT 1FO5A 2P5QA 1WJKA 1NHOA 1YZXA 1DBYA 3NIVA 2VL2A 2XPEA 2LUSA 1R4WA 4BL7A 5F0GA 1EGRA 2JADA 3ZREA 3EU3A 1I5GA 5ENUA 3LJRA 3VK9A 1TXXA 3UARA 5EL8A 1O7UA 3GN3A 3IV4A 3DRNA 1XWCA 1C72A 1PKWA 1GULA 2YANA 4MP4A 3H93A 1GLPA 2XBIA 4ULXA 5JWQB 4ACSA 4FYUA 4XRAA 4BWSA 3L9UA 2OADA 2V1MA 2HNLA 4K7OA 3A2XA 4F82A 2FUG2 3DEXA 3FK8A 4LA1A 3HYPA 2B1LA 2FWEA 3KTBA 3I43A 2J9HA 1JHBA 3VI5A 2AUVA 1WWJA 3G7IA 3N9JA 3QFAC 1S3DA 1G0TA 4XRDA 2L6CA 3UAPA 4WEYA 3ZTLA 4ZB9A 4KX4A 2HRFA 5GSSA 2G2QA 3O76A 2MMAA 2GSSA 2IMEA 3MWHA 2KP1A 4HUAA 3I9V2 1TKDB 4YAPA 4FIWA 4YQVA 1USBA 2NVLA 2WS2A 4I6XA 1T8EB 1LBKA 5CNWA 1O81A 1ZYQB 4EF0A 1U88A 5D73A 5C04A 4F0BA 1GSEA 3ME8A 4MCUA 4WR5A 2L5LA 3WT1A 3VWXA 3K8NA 4IGJA 1FOVA 2HFDA 4K1FA 3Q18A 2E2GA 3CSHA 3J7Yb 3FKFA 1EGOA 1T7PB 2FWFA 1GUMA 2RUFA 3ZYWA 1V2AA 2LQQA 5DALB 2O8VB 4POKA 2WGRA 2O85A 1FB6A 4RUVA 3TKQA 2KLXA 4TXOB 2GGTA 4I5QA 1ERVA 4ZXGA 3F6FA 2DC5A 4RI6A 4EC0A 4K2DA 1NM3A 3WGDA 4GSNA 2YV9A 3KP9A 2B5XA 4TR4A 3RHBA 5GAND 5ECSA 4DSSA 2H0HA 1R7HA 2OE1A 2GLRA 1V57A 2V32A 3H8QA 1ZGNA 2EIQA 1YDKA 3VPTA 1PL1A 4XIHA 3VWUA 3UVHA 2H19A 3CSJA 3IRAA 3HVSA 4TR3A 4HEA2 2PVOC 5HQPA 1X9WB 1YF0A 4XS4A 3CXGA 4NV5A 4NHZA 5D9XA 3TRQA 2QC7A 4JRRA 5ECHB 1PMTA 3D6IA 4AF2A 1RK4A 4TRXA 2DJ2A 1TRUA 1JLWA 4ZIJA 2DJJA 1H75A 1R5AA 2IMKA 1X5CA 1XIYA 2O87A 2GQMA 4MA9A 3VURA 3HJMA 3G7YA 4ZBBA 3E9JB 4K0NA 4TR1B 5B6MA 3FHKA 4GF0A 5FHIA 3MSZA 4JR6A 1TK5B 1GL8A 1TDIA 3LSZA 3RHCA 2LRCA 4HQSA 1M2AA 1Q98A 3F0IA 1DE1A 3UVTA 2VL3A 2PMTA 5F8BA 4H86A 2GSTA 3FY7A 3CMIA 3NZNA 4QQ7A 2IPAA 1MTCA 4O32A 2A2RA 3MNGA 4GRFA 4MH3A 4NAXA 3GSSA 2YWOA 3RDWA 2DIYA 4X1UA 2I3YA 3D4TA 1SJZA 3FZAA 2WB9A 1SD8A 1H4OA 3ERGA 3KH7A 2H71A 5JCGA 2JU5A 5B8BA 3C8EA 3GMFA 4Q5FA 2GZYA 3FYGA 5AISA 1HNCA 1U87A 3HDCA 4EDYA 3WT2A 1XFLA 4HQZA 2L4QA 1PSQA 4PGTA 3ZMKA 4CW9A 1VRSD 1B9XC 3ZITA 3F4TA 2JZRA 3GKXA 5DAKB 2QKEA 4WF4A 2VOCA 2IL3A 2DLXA 2EIOA 4D73A 1W4VA 1A8LA 2FA4A 1SL2B 2X8HA 2M80A 1TTZA 3AY8A 1AQVA 3D22A 1OVNA 1OC3A 1F3BA 3LFLA 2LQOA 5EY6A 4O7HA 2LTKA 1TJDA 2EC4A 2CQ9A 3L4NA 1TRWA 2LSTA 1A2LA 1NSWA 4ISDA 3HJOA 4O92A 1UA5A 2LKUA 1BYEA 2CZ2A 3ZL5A 2E2MA 5A5KA 3KJYA 4E8HA 5JWOB 4FH8A 4ML1A 3Q74A 5JWRB 5ECMB 1HYUA 1AQXA 1BX9A 4K7NA 3FZ5A 3IA1A 4FYCA 3FR6A 1J0FA 1FVKA 2XPDA 3EMPA 5D9WA 1ILOA 5F05A 3ZLPA 2H1BA 1OE7A 1QMVA 4K7IA 1RQMA 5IO2A 3RAZA 2ON7A 1AQWA 4KAEA 2IIYA 2O7KA 4ECJA 3UBLA 4HZ4A 3U5RE 4OCFA 2O89A 4OO4A 3QPMA 2N5FA 4J57E 2FLSA 1K0BA 2GZZA 2PWJA 5D8IA 1B48A 3TKRA 3P90A 4NMUA 5CRDA 5J4UA 5ELGA 4KE3A 5HR2A 1Y25A 1SKSB 4PQ1A 1SYRA 3GRXA 1GTIA 1XOAA 2C0GA 3F8UA 4X0XA 5ABRA 4IP6A 3CTGA 5DCHA 2AB6A 3V1WA 2C3TA 2KP2A 5G5EA 2VCVA 4OWYA 2ES7A 4KUNA 3ZVJA 3TJFA 2G0FA 2DJ3A 2XHFA 3PH9A 4L8EA 2IMFA 2HLSA 12GSA 5C00A 2XC2A 3P7XA 1BEDA 2H6YA 2NPBA 4EVMA 1XBSA 6GSTA 4GTUA 2WFCA 1GNEA 1VF2A 4LMWA 2DJKA 18GSA 4JEDA 3PR8A 1EOHA 1K0CA 2H6XA 3ERWA 1LJRA 1MDJA 4GXZA 1SJIA 1THXA 3F3RA 3LGCA 4L5OA 4ML6A 4LL1B 5CP1A 2IN3A 2QSIA 5CRHA 3TRXA 4O5RA 1K0AA 4MZBA 1WOUA 5IPGA 2Z9SA 2VLVA 1AXDA 4IBPA 5CRGA 2C3QA 4YAVA 4WR4A 2VUPA 3FZ9A 1SL1B 2DMMA 2PGTA 2WRTA 1Z6MA 3G7JA 4KDYA 2K9FA 4KNDA 2IFQB 5H5RA 5AIXA 1DE2A 2VM2A 4EE0A 1FAAA 3ISOA 5KN1A 3F4SA 4ID0A 4IS0A 2XBQA 5IOWA 3TKPA 3IXRA 4G2EA 4NXIA 2OJLA 1PQNA 4MF5A 6GSWA 1YJ6A 3O3TA 4NWYA 3VWVA 1JZDA 1OE8A 1U6TA 1ST9A 1TK0B 5ELAA 1A0FA 2RM5A 1ON4A 3OR5A 2FWGA 3SWLA 3IBHA 4PUAA 2CX3A 5G31A 2N5BA 4N0ZA 1S3CA 3TKSE 1GWCA 5DQYA 1JFUA 5ECKB 2ZNMA 4XHMA 1A2MA 5CAXA 1AC1A 2A2SA 1MD3A 3D5JA 2GSRA 4QL7A 3A2WA 3MAKA 2K8SA 2C0EA 5HR1A 4KGIA 5IQYA 5KEJA 2HT9A 3DYRA 4HJ2A 1MDKA 5GSTA 2DSAA 3US3A 3ZRDA 3I6AA 2R2JA 1WIKA 3D0ZA 3BJ5A 3ZVJD 3TRPA 3UOMA 1OC9B 1MDIA 1YF1A 1F3AA 3QFBC 4P3YB 2MBSA 5ID2A 2JACA 2JSZA 3GYKA 3QAVA 1A24A 1HQOA 2K8VA 1E6BA 3IE3A 2B3SA 3EMXA 3UL3A 1X0RA 1XW5A 2H76A 3DD3A 1YY7A 4N10A 3DVWA 2LNSA 2OBIA 4Z7XA 5E59A 4MF6A 4I97A 2YJHA 3LORA 2H72A 3WGXA 2C8UA 4WF5A 1XWBA 3KIJA 3QR6A 1TI3A 1B4QA 1N2AA 1YEXA 2JZSA 3GSTA 3TJBA 1PN9A 4TXVA 1F9MA 2VIMA 4MPFA 3GIXA 2GT5A 1PL2A 4IKHA 5CYYA 2P5RA 3GHAA 3MDKA 19GSA 1WP0A 3JCML 4ZBAA 3FEUA 2PN8A 3HCZA 2H6ZA 2R6KA 1XCCA 4KB3A 1WRYA 2FA8A 1GSQA 1R5PA 1SJ6A 4AJ6A 3M9JA 2OKAA 1NW2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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