3ZTLA

Crystal structure of decameric form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
180
structure length
180
Chain Sequence
LLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKHGEVCPVNWKRGQHGIKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 56
structure length 180
sequence length 180
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ztlA00
4KGIA 5AIXA 1W4VA 4ZL7A 1HNBA 5G5EA 4CDOA 1JZOA 3ZMKA 1BX9A 4I2UA 3A5WA 3ZZXA 4AGSA 2DJ0A 4DSQA 2CAQA 3VURA 2X8CA 1EV4A 4KB3A 4PGTA 5IPGA 1XWCA 3W8JA 1J08A 3HVXA 1NHYA 3LGCA 1U3IA 1U6TA 5KN0A 2YWNA 3NOFA 4EE0A 3M9JA 1HQOA 4ECBA 1GLPA 2VCZA 1UA5A 3PR8A 3IK7A 5ECIB 5ID2B 4IJ3A 4DSRA 3TJJA 3U6VA 2I1UA 3CSJA 1B9YC 3TCOA 2YCDA 1PMTA 1O8XA 2A2SA 1NSWA 2JZTA 4ZL8A 2LTKA 4ZIJA 2EIOA 4O7HA 1I9DA 1RW1A 3FW2A 1K0BA 1TK5B 3FY7A 2X64A 4QL7A 1B9XC 2NDOA 1X5DA 3F6DA 4I8BA 1SYRA 1F9MA 1X9SB 1MD4A 4J2FA 2YWIA 4ZILA 1XW5A 4I6XA 1TI3A 5D9XA 1G7EA 4IGJA 1N2AA 3MAKA 4MZCA 1AQWA 1YKCA 3EINA 3LJRA 1GUKA 3QDNA 1JLWA 1Q4JA 1RQMA 1VF1A 2YJ7A 1Z6MA 2GZZA 4EC0A 2OE1A 3WGEA 2IJYA 3D6IA 4MH3A 1F6MC 3FYGA 1UN2A 5IMAA 2CX4A 2ALBA 2OKAA 1V40A 4BWSA 4F82A 1SJ6A 5G2ZA 4GQFA 4TRXA 5L71A 4HS1A 1OE8A 4K6XA 3D0ZA 3LWAA 5H5RA 1WP0A 3IDVA 1FAAA 5F8BA 1R26A 3HDCA 2L57A 1ST9A 3E3EA 2XBQA 5AN1A 1PKWA 3C1SA 2B6MA 5JCUA 1WIKA 4MJCA 3K8NA 3M3MA 3VPQA 2H19A 3GHAA 4LMVA 3CMIA 1XW6A 1WPIA 2PUKC 4FO5A 3IRAA 1GSFA 6GSTA 4F0CA 5GSSA 4F03A 2IN3A 1T3BA 4TXOA 4WBRD 1I5GA 3EWLA 2TRCP 1Z9HA 4ML1A 5LCZA 1GULA 5H5SA 5IIZA 3GL3A 1GLQA 1XWGA 5GZZB 1KEBA 4ACSA 2JZSA 1FG4A 6GSWA 4OCFA 1GRXA 1KNGA 4MF6A 8GSSA 1AIUA 2H0IA 1THXA 2YWMA 2I4AA 3WT2A 1ERVA 3D22A 3GA4A 4ULXA 4KSOA 2HXKA 2H6ZA 4KCAA 4L0WA 4OFNA 2H70A 3UJ1A 5JCWA 2V2GA 3GURA 4ISDA 5J41A 2RLIA 1A2JA 2LQOA 1IYIA 2OE0A 3FRCA 3GX0A 3P90A 2F8AA 3IOSA 4WF4A 5JWQB 2WFCA 2GS3A 5F07A 5DVBA 3VI7A 2PERA 4ZB9A 2MMNA 4HZ2A 4O5RA 5A5KA 2FA4A 3CXGA 2VO4A 3ERWA 1VRSD 3VPTA 3FK8A 1A0FA 1SKSB 1SD9A 1R4WA 2IWTA 1DSBA 3ZFLA 1XCCA 3F8UA 4TXOB 2MBSA 1A8YA 2LRCA 1YEPA 4BVXA 4L5OA 2KUCA 3F4SA 2XPDA 2AYTA 3ZRDA 3MSZA 1A2MA 2NVLA 1ZMAA 17GSA 3APOA 2FUG2 1FVJA 1CQGA 1AXDA 3BCKA 2K18A 2E7PA 5ECLB 2H71A 1OE7A 1SYXA 2C3NA 4F2IA 3Q6OA 2R2JA 3APSA 2OBIA 2B3SA 5D9WA 4PX1A 3F0IA 4GSSA 4WEYA 1DE1A 1TU7A 1TI1A 3O3TA 1ZCPA 1ERUA 2EIRA 3KP9A 5CAXA 4NV2A 1GL8A 4WR4A 5COHA 3GMFA 3HA9A 4FH8A 4RQRA 3J7Yb 3SBCA 4WXTA 4ZB6A 3OR5A 5DCHA 2H0GA 1XOAA 1IYHA 3QCPA 1THOA 5KN1A 4I97A 1EZKA 4IQ1A 2I9HA 4MK3A 3L9SA 4JBBA 3A2XA 1HD2A 3G9BA 2A2RA 1ZL9A 2B5YA 5J3RA 1J9BA 6GSSA 5D9VA 4I5QA 2PGTA 2B1LA 4OO4A 1OC9A 2R6KA 2QC7A 4KNDA 2L5LA 1QXHA 1XBSA 2XHFA 3PH9A 1YZXA 3G7JA 1F37A 1BYEA 22GSA 4TR1B 3UVHA 3HZ8A 3F4TA 2IFQA 5CNWA 2O85A 4IQAA 4K7NA 2VCQA 1C72A 2B5EA 3G7YA 2GQKA 1AQXA 5DJMA 1M9BA 1T00A 3BBYA 2YJHA 2H30A 2YPMA 2HRFA 3TKRA 3UOMA 2RUFA 1SL1B 2YV9A 1SKRB 1GWCA 12GSA 1FOVA 2JZRA 4G10A 2WRTA 1PGTA 5DDLA 3ZREA 4FYBA 4WR5A 1XPVA 4TOPA 4OMVA 3GL5A 1K0OA 3Q18A 2HLSA 2J9HA 2JU5A 4J56E 3HVVA 3M8NA 3FHKA 4PQIA 1PA3A 2KP1A 3S9FA 4TR4A 5KN2A 2AV4A 3IHQA 1EGRA 2FGXA 3P2AA 4TXVA 3HKRA 3HJPA 1UVZA 3LG6A 5IMZA 2DJ3A 1AC1A 4DEJA 14GSA 1K0AA 3DKSA 4K0GA 4GF0A 2LQQA 3M0FA 2AB6A 3V1WA 2WZ9A 4HUAA 2VAFA 1OC9B 3I6AA 19GSA 5H5QA 2MZCA 4HEA2 3EMXA 2YV7A 2FCHA 4OO5A 4HI7A 2C1YA 3GFKA 1FW1A 3I9V2 3CTFA 2IMEA 1B8XA 5IO0A 1XFLA 4N10A 1G0TA 2X8HA 1T7PB 1N8JA 1TKDB 3TKSA 3ZITA 5JCGA 1Z5YE 3TKSC 4MP4A 3UEMA 4MA9A 4BA7A 1JZDA 3D21A 4LMWA 2E0QA 2CZ3A 4OD7A 5ENUA 1WRYA 5EPFA 1SL2B 4TW5A 2LNTA 2WULA 1U88A 3HYPA 4PNFA 3FZ9A 2EC4A 1BG5A 1F3AA 2V1MA 2K8VA 4GWRA 1Z7PA 4AJ8A 2ZNMA 2KOKA 2G2QA 4MLYA 1K0MA 1M9AA 2C0DA 3VFIA 1DUGA 1OAZA 1SD8A 4EL1A 5GAND 2MMOA 4KA0A 1M7TA 3PINA 4IP1A 5ECKB 3R2QA 1M0UA 1XXUA 3MNGA 3TKSE 1QGVA 6GSUA 4WBJA 3E9JB 2FLSA 2D2ZA 3KD0A 4NWYA 3UAPA 3N9JA 1PD21 5EVOA 1E2YA 1H4OA 1JFUA 3QD9A 1YF1A 4GRFA 5IMFA 1YJ6A 3WT1A 1K3YA 7GSSA 2P5QA 1ZGNA 1T1VA 4OWYA 3CRUA 3EYTA 4TVEA 1HNAA 2KP2A 1ZZYA 4NXIA 2GT5A 5DAKA 1SK0A 3H93A 2VD1A 1FB0A 3F3RA 2JSZA 1JZRA 4ID0A 4IN0A 3TJGA 1EWXA 1U3AA 1QQ2A 3LXZA 1ILOA 3FR6A 3GIXA 4RI7A 4ZL9A 3TJFA 4KW6A 3O6TA 3CTGA 3RDWA 4PQHA 2F9SA 1BQ7A 2Z9SA 4XRDA 4X43A 1EV9A 1GSYA 2VL3A 2YNXA 6GSVA 4K2DA 5EL8A 2LKUA 2H75A 2L4QA 1TDIA 3EU3A 1PKZA 1B4QA 3TB2A 1M2BA 1RK4A 1A23A 4DSSA 2LJAA 3F4RA 1TRVA 2LRNA 5LNKe 5HFGA 3DMLA 1EOHA 3HY2A 1S3AA 2H01A 2VCXA 5B8AA 3MDKA 1R5PA 4JRRA 4K8MA 2MBTA 4EDYA 1A24A 4N0ZA 5A4UA 3NIVA 1R7HA 3BOAA 5JWRB 1Z3EA 2LV3A 2V32A 3TJKA 3FZAA 5DAKB 1WOUA 3UBLA 2RUEA 4HQZA 1WJKA 1GSDA 1SJIA 2H6YA 5B7CA 4JR6A 2RIIA 2HE3A 2OJLA 4GQCA 1PX6A 2CZ2A 5B6MA 2O8VB 2QSIA 1PL1A 1LU4A 3CSIA 2P0GA 2LEGA 4XIHA 1QMVA 3GKXA 3C73A 3GRXA 4XTSA 3L78A 1JHBA 4POMA 1A2LA 4AJ7A 1NW2A 1YKAA 3VI5A 16GSA 2XBIA 3IXRA 1V9WA 1A0RP 1GUHA 4HJMA 2MYGA 3VWXA 1ABAA 1GSQA 18GSA 4LA1A 4ML6A 3IBHA 3VLNA 2H1GA 3H8QA 1A8LA 3C1RA 4ECJA 2C3QA 4DSSB 5AIVA 2VCTA 3M9KA 1U87A 3H1NA 1AW9A 1XWAA 3QFBC 1WMJA 3P7XA 3SWLA 3ISOA 5CO3A 3H4KA 2L59A 3GKKA 3VWWA 3IAS2 1X5EA 2O87A 20GSA 4TR0A 2VM1A 1GSEA 2DBCA 3ZFBA 1ZYQB 4H86A 4MF7A 3ZIJA 1TRWA 4TR1A 4ECCA 2PU9C 4KUNA 4KX4A 1YF0A 3J7Yk 6GSYA 2FWHA 2OBKA 2GGTA 1SJZA 4GSTA 1FB6A 3HVSA 2IIYA 2E2MA 1SENA 4PUFC 2H66A 3HJOA 1ON4A 5CRHA 2PN8A 3KZQA 4MPFA 3H79A 1TK8B 1TXXA 1M99A 4V1Ag 3F9UA 2JSYA 1XOBA 2VCVA 5HR0A 5ECOB 4G9HA 2HSYA 3RHBA 2YN1A 3CRTA 2ZCTA 1XW9A 3F63A 5E59A 4JE1A 1M2DA 2OE3A 3QR6A 1O85A 4IJIA 3GX8A 4KE3A 4BWQA 3D4MA 4V2MA 4OFMA 2HRNA 1YQ1A 2BMXA 3RBTA 1WWJA 2K8SA 4HJ2A 3EVIA 3ME8A 2R3XA 3FZ5A 3KEBA 2R4VA 2LSTA 2WCIA 3EE2A 4YQMA 1PX7A 1QFNA 5G1LA 2CA8A 2VLTA 5EY6A 5C04A 4DVCA 4P3YB 3M1GA 2P5RA 5D8IA 1X9MB 3UBKA 3WGDA 13GSA 5D73A 4ZBDA 1EP8A 1PRXA 1OYJA 1XZOA 2CT6A 1BAYA 1DBYA 5IO2A 1TP9A 1EP7A 4L0UA 5B6NA 2LUSA 2C0FA 4HZ4A 5JWOB 3QOUA 5ELGA 1F3BA 4XS6A 11GSA 5IMVA 2I3YA 4XS4A 4V2NA 2YZUA 2DJKA 4V1Ap 2YP6A 1B4PA 5CRDA 2KHPA 4MH2A 2PVQA 3VWVA 4NHZA 4QQ7A 3TUEA 2C8UA 2X99A 3KM6A 4HQSA 1W89A 1OVNA 2BJXA 4AJ6A 2H0HA 5IMDA 2VM2A 2CX3A 1Q98A 5LD0A 2VOCA 2GSTA 4NAXA 2CVKA 2PBJA 2VL9A 1TK0B 1TJDA 4RQXA 2F8FA 2L5OA 1GNEA 4K0NA 3LFLA 2IMFA 1WE0A 3QFAC 1NM3A 3ZVJA 4JZQA 4F9ZA 5J9BA 4EXJA 2DJ2A 5G1KA 1PQNA 2BTOT 4O92A 3DD3A 3KTLA 3GSTA 2M72A 4HOJA 3IR4A 3ED3A 2R5GA 3DRNA 2ZUPA 4KDYA 2V6KA 2YOIA 2QGVA 3ERGA 1YY7A 3GH6A 1BJXA 3QAWA 1QUWA 4NV5A 2LJRA 2ES7A 2I81A 1B48A 1MD3A 1FO5A 4GXZA 5ECPB 2H73A 5DJLA 4XS4B 4GLTA 3HD5A 2VUPA 5G31A 2FD3A 4WF5A 1Y25A 3UL3A 1SK1A 5ABRA 3LXTA 5B8BA 4MMMA 4JEDA 2TRXA 5IPHA 1TRSA 5GSTA 3HHVA 3C7MA 1V58A 3CBUA 3PGTA 2YANA 1KBNA 4FIWA 5AGYA 3JCML 1HNCA 2DLXA 3DYRA 4Q5RA 2GVPA 4MABA 4JR4A 4JU5A 1MDIA 1GP1A 4ILFA 3QPMA 1ZYEA 4GCIA 3TRXA 2ON7A 3DGQA 1AUCA 2FWEA 1V98A 4IS0A 1GH2A 1KTEA 1O73A 5HR1A 4POLA 2VL2A 4LL1B 5IOXA 3KMNA 5ECRB 2VL2C 1ERWA 4EO3A 2C4JA 5DCGA 5F06A 2CV4A 3F6FA 4EUYA 3W6GA 2PVOC 3L9VA 2VLUA 4YAVA 2M80A 1EGOA 2GQLA 5HFKA 1FVKA 2GSRA 1OKTA 2JACA 3UVTA 5CRGA 4KCEA 3IE3A 3RPNA 2B7JA 5CREA 5DQSA 1FHEA 2B5XA 3GYKA 4MZWA 2OA7A 2H74A 4K7IA 3ZLPA 2KLXA 3IA1A 1G7OA 2GT6A 2CVBA 2V6OA 2PMTA 4IELA 5CP1A 1OC3A 3KTBA 2CVDA 3FR3A 5E4WA 3KH7A 2DSAA 1SL0B 5F05A 1XIYA 3KXOA 1VF2A 5ELAA 2TIRA 1PSQA 1X0RA 3GUSA 3A2WA 2FWFA 3GKNA 1ML6A 5DBQA 1O81A 3ZMLA 6GSXA 2K6VA 1SK2A 4XHMA 1M2AA 1O7UA 2PWJA 4PURA 4FYCA 4XS1A 2R37A 2XC2A 4V2LA 4XCSA 3U5RE 2NBSA 4TR3A 2VLVA 4Z7XA 4D73A 2IL3A 2C0GA 2H1BA 4X1UA 2P31A 3DIEA 3N5OA 4N30A 1LJRA 1MDKA 5J5NA 3GNJA 4PUAA 10GSA 4EKZA 1PL2A 1TU8A 3F3QA 4MDCA 3KCMA 3WYWA 2RM5A 4KDXA 4BL7A 4I2TA 4G2EA 3TJBA 1DE2A 2OACA 4PXOA 4WKWA 2HSHA 5INYA 4NMUA 3DWVA 3GSSA 2AAWA 2JADA 3TRQA 1USBA 5AISA 4K1FA 4J57E 3TGZA 2GZYA 5HFIA 2IMDA 5HR3A 5G30A 2L6CA 3A3TA 1S3CA 1ACVA 4HU9A 4GTUA 2DC5A 3WD6A 2YWOA 1T8EB 1XVQA 1XVWA 1OC8A 3FR9A 1GSSA 3EMPA 4EF0A 2V41A 2LRTA 1K3OA 3RPPA 3UIWA 5A4WA 4ZBAA 4K7OA 4YQUA 1K0CA 1GTIA 1CQHA 4BPYA 4N0VA 1EOGA 2C80A 1NHOA 2HI7A 2HNLA 2HZFA 5DQYA 4IHUA 1XWBA 2WDUA 5ECHB 1Z7RA 2J23A 1K0NA 2MMAA 2FA8A 2LS5A 4FYUA 4CHSA 4RUVA 4PNGA 3CSHA 2RM6A 1GTAA 4IW9A 1X9WB 2IMIA 3KMOA 2F3MA 4G19A 4D73B 4EVMA 2N5BA 4NHWA 2WJUA 1BEDA 2HZEA 4EDZA 2H76A 5ECMB 4MPGA 3KIJA 5D96A 2B1KA 1JZWA 3BJ5A 9GSSA 2FHEA 3DVWA 1TOFA 3KP8A 3D5JA 2F51A 3CYNA 5IMCA 5ECSA 4E8HA 3LEFA 5KN3A 2EIQA 3US3A 4Q5NA 3HCZA 4MZBA 1SKWB 1X5CA 1QK8A 2NTOA 1SU9A 2H1DA 1LBKA 3LYKA 2C0EA 4KSMA 4GSNA 2M46A 2O89A 4RI6A 2LNSA 2L4CA 3L0HA 3RHCA 1MEKA 1AAZA 1T4YA 2DMLA 4Q5QA 4IP6A 4K9ZA 2AUVA 2G0FA 5D9TA 5D93A 2VIMA 4IKHA 4ZXGA 4POBA 1MDJA 4X0XA 1GTUA 3GTUA 4PQ1A 5CYYA 1T4ZA 5HQPA 1OKDA 1AQVA 2DIYA 2AJQB 2GSSA 4CW9A 1H75A 3HJMA 4Q5FA 4YQVA 2FY6A 2HT9A 3IV4A 1TTZA 1GNWA 3EC3A 3IC4A 4TN8A 3Q19A 1YDKA 3IPZA 3BCIA 2N5AA 4KDUA 4IVFA 2YZHA 4HU7A 1PN9A 2IPAA 4ZBBA 3Q74A 3EURA 5KEJA 3VK9A 4OFTA 4YAPA 2ON5A 2C3TA 2WS2A 2WB9A 2HZEB 1VGLA 4AF2A 2MMZA 5J4UA 4L8EA 1F2EA 3FKFA 3GV1A 1V2AA 2DIZA 4ECIA 2LJKA 1G6YA 2GDRA 2O7KA 2H8LA 3QMXA 1O8WA 5ECNB 5IM9A 1EEJA 2DJ1A 3LQ7A 5IQYA 3L9UA 3G7IA 4YH2A 1S3DA 4NPBA 4KAEA 4LLRA 5HR2A 3VWUA 1TRUA 1V57A 1JLVA 1HYUA 3GTUB 3TOUA 5DALA 3DEXA 1K3LA 2GSQA 3KH9A 5FT3A 3RAZA 1J0FA 5FHIA 5A4VA 2FWGA 3W8SA 2XPEA 3E0UA 3MWHA 4LL4B 1K0DA 2X8GA 2DMMA 1Y6EA 4N11A 4MJEA 3C71A 3ERFA 1ZOFA 4XRAA 2QKEA 3WGXA 1GUMA 2IMKA 3APQA 4MJAA 3KGKA 2GZPA 5F0GA 3TRPA 2GTUA 3O76A 1VF4A 3TKPA 5GAPD 3FEUA 4ZB8A 3DXBA 3HXSA 4HDEA 3LYPA 3ZTLA 4BVYA 1GSUA 4MCUA 3UMAA 5IOWA 2NPBA 3IAM2 2PPTA 4MJBA 3TDGA 3HZ4A 2H6XA 5ECQB 3ZYWA 3GN3A 3IK9A 2A4VA 4WETA 1VF3A 3I43A 3ZVJD 3KJYA 4MF5A 2B7KA 4L5LA 3ME7A 3TKQA 2HYXA 3GKMA 5FWGA 4TKYA 3ZIVA 3TOTA 4E8EA 3A2VA 1YEXA 2VCWA 1URMA 3BD2A 3L4NA 2CQ9A 3ZL5A 2IFQB 5ID2A 5DALB 3NZNA 3P8WA 2GLRA 1EEMA 1XWKA 1G6WA 2E2GA 2REMA 3GH9A 3QAVA 2OADA 2FNOA 4IBPA 2HFDA 4O32A 4KH7A 3D4TA 5J9CA 3DVXA 3EU4A 2H72A 4OCEA 3AY8A 2K9FA 1R5AA 5CRWA 2WGRA 1E6BA 4QL9A 4POKA 1O6JA 2CAIA 1ERTA 2GQMA 2L6DA 2VD0A 3UARA 2AHEA 3FZ4A 4F0BA 3I69A 1TW9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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