3ZVJA

Crystal structure of high molecular weight (hmw) form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
MVLLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 33
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zvjA00
3L9UA 2O7KA 1XWGA 3DXBA 4ZL9A 3KGKA 1XXUA 2TIRA 3WYWA 1QXHA 5IMVA 4EVMA 4HZ2A 1PA3A 4KSMA 4TXOA 1OC8A 2H74A 3VWWA 1JZOA 1DSBA 4KE3A 1V9WA 1O8WA 2PVOC 1THOA 2F8FA 4OFTA 2MMNA 2X8HA 3HKRA 1K0NA 2HYXA 1E2YA 4POMA 1SKSB 3IRAA 4ML1A 1T1VA 2QC7A 2MYGA 4GF0A 2FWGA 1Z7PA 1QUWA 2FLSA 3H8QA 4BPYA 1PX7A 1X9MB 3GN3A 2VO4A 3TCOA 3L0HA 5G30A 1EP8A 2IMEA 1QGVA 4XRDA 2RLIA 4KDXA 4TR1A 1B4QA 3UOMA 3US3A 1GL8A 1IYHA 2PVQA 2IMDA 2WCIA 3ISOA 2ZUPA 4WBRD 2L57A 1GULA 1EV9A 4F2IA 1ON4A 5B8BA 4OMVA 1HNCA 2XHFA 1WJKA 1ZYEA 1Z6MA 1G7OA 4BWQA 1AIUA 1ZZYA 5A4UA 5D73A 3IBHA 3KMNA 2FD3A 3FRCA 3ZMLA 1PL2A 2AJQB 2H6ZA 1O8XA 17GSA 5E59A 1XWAA 2H73A 2K18A 1URMA 2OKAA 5FWGA 3GKNA 1FHEA 5JCGA 5HFKA 5EL8A 2L4QA 3VPQA 1VGLA 2IFQB 1XZOA 5G5EA 1EOGA 1T4YA 1EV4A 2RUEA 1FO5A 2H6XA 4ECJA 3WGEA 3UJ1A 5ID2A 4OFMA 1XCCA 1MD3A 4IBPA 3U6VA 1XW9A 1Z9HA 1TDIA 1E6BA 2J9HA 7GSSA 5ENUA 2CQ9A 2EIRA 3EU4A 5ECKB 2YJHA 5HFIA 3MNGA 3ZFBA 5JWOB 1OVNA 4EF0A 3A5WA 2VL9A 4MDCA 2IJYA 2VM2A 1AQWA 2HNLA 1U88A 4OCEA 1OE7A 4ZB6A 1GTUA 1BAYA 4LLRA 2CT6A 6GSUA 2C3NA 2G0FA 3E9JB 3IAM2 3FK8A 4HDEA 2HXKA 4TRXA 4JRRA 2LS5A 3FZ5A 14GSA 2H72A 3DVXA 3UL3A 2JACA 3MDKA 2IMFA 2GDRA 6GSXA 1THXA 2IL3A 3A3TA 3P8WA 4RUVA 3TKRA 5IPGA 5CRDA 1AC1A 4EXJA 1O7UA 2VCZA 4I6XA 4FIWA 1SJ6A 1OYJA 2DJ1A 2FA8A 1TI3A 1USBA 3CSIA 2VL2C 5INYA 3NIVA 2P0GA 4ACSA 4ECCA 2A2SA 2C0FA 1ZOFA 2G2QA 4ULXA 3TJBA 2F51A 2FWFA 1S3AA 1M2DA 1PGTA 2C0DA 5ELGA 1GWCA 6GSSA 4ZILA 2M80A 3ZVJA 3P90A 3IK9A 5ELAA 2CX3A 1Q4JA 2O89A 4K6XA 1N8JA 1SJZA 4I2UA 2F9SA 4ML6A 2PPTA 5CAXA 5IOWA 4RI6A 2LUSA 1J0FA 3IPZA 2JZTA 2DLXA 4IKHA 2PMTA 1HNAA 3F63A 6GSWA 2VLTA 5ECIB 1V2AA 3TKQA 1OE8A 3P7XA 1PQNA 4AJ8A 1EZKA 2CZ3A 4ZXGA 5JWQB 5LNKe 4ZBBA 4KCEA 5D93A 4P3YB 4QL9A 4K1FA 5IM9A 3GUSA 3HHVA 5A4WA 2B1LA 1GSEA 3KMOA 1A2MA 2V41A 1G6YA 2VCTA 3Q6OA 1B9YC 1MDIA 1O81A 3HYPA 1V57A 4BVXA 1Z3EA 3F4SA 4K7OA 4OO5A 4TKYA 1BYEA 10GSA 2X64A 6GSTA 1OC9B 1WP0A 2AV4A 2HI7A 1EEJA 4MABA 5CP1A 1OC3A 2V2GA 4EL1A 4MZCA 3IR4A 1J08A 4O92A 4IJ3A 4PNFA 3VWXA 1RW1A 1AQXA 3LWAA 1GLPA 2OE1A 1WMJA 3D21A 4KCAA 2BTOT 4Z7XA 1I9DA 2KP2A 2GZPA 5CO3A 1KBNA 1GH2A 3J7Yk 1PMTA 5DAKB 2FCHA 4YQUA 5F06A 4GXZA 4QQ7A 4NV5A 4YAVA 1BQ7A 2K6VA 3GV1A 2WDUA 1SD9A 4AGSA 1YJ6A 1T7PB 4MPFA 5A4VA 4IJIA 3OR5A 4PQ1A 3UVHA 4XHMA 1O6JA 4OCFA 3TJFA 3UIWA 2V1MA 4KNDA 5HR1A 5DCHA 4GQCA 4E8EA 5KN2A 1QFNA 1GRXA 4QL7A 5F05A 3BJ5A 4XTSA 3NOFA 5G1LA 1ILOA 4HZ4A 3ME7A 3TB2A 5H5QA 3KTBA 3ZLPA 3IDVA 1X0RA 3VPTA 3DKSA 4RQRA 2DSAA 5DBQA 3LGCA 4TN8A 2R3XA 3TKSC 3UEMA 1HYUA 4WR4A 4GCIA 3EWLA 1TRVA 4ZL7A 1IYIA 4DVCA 1MD4A 1K3YA 1GSDA 5CRWA 1Y6EA 1I5GA 2YANA 2KLXA 2CVDA 4F82A 5IPHA 5J3RA 1S3DA 4MF5A 1UC7A 2YZUA 2HSYA 4BVYA 1EGOA 5HR3A 2QSIA 4FH8A 5DAKA 2JU5A 3N5OA 3VI7A 2M72A 1RQMA 1JZWA 2RM6A 2VCXA 3EMXA 3I6AA 5CRGA 5F07A 4G10A 2E7PA 1WE0A 2OJLA 2C1YA 1T8EB 2GT6A 1XVWA 3G7IA 4N11A 4N0VA 5HR2A 2LJAA 4HUAA 3FR6A 4HEA2 2ZNMA 2I1UA 4DSRA 1UA5A 3QAVA 3LXZA 4HOJA 1YZXA 5ECOB 3GX8A 4BL7A 1Y25A 4MF7A 1J9BA 1TRSA 5CREA 1SYRA 2IMIA 2C80A 1KEBA 1SK1A 4PUFC 3C1RA 3GMFA 4K0GA 1GSYA 4IVFA 2L5OA 3FW2A 2H01A 1ML6A 3G9BA 2DJ2A 2VLUA 1QMVA 5J9BA 2QKEA 1BX9A 2YCDA 2J23A 5D9WA 5IO2A 1O85A 2FWEA 2X8GA 2WZ9A 3DEXA 5AN1A 3HY2A 3CRUA 5KEJA 4POBA 5JCUA 3L9VA 4K9ZA 4DEJA 4NV2A 4MH3A 3ZL5A 1ZYQB 2OACA 1XWCA 4MCUA 2EC4A 3HZ4A 3F6DA 4K8MA 4KH7A 1M9BA 4NAXA 3L78A 3LXTA 3GTUB 2DMMA 4EE0A 1YEPA 5HQPA 2H1DA 1Z7RA 3DD3A 2WRTA 8GSSA 2VCWA 4RQXA 3H4KA 3L4NA 3F3RA 1DUGA 1F2EA 2ZCTA 1Z5YE 1EWXA 4OD7A 3UBLA 2RIIA 4TW5A 2V6KA 1N2AA 2QGVA 19GSA 3BCKA 3WGDA 2CVKA 3W8JA 4PGTA 2EIOA 2YWOA 4POKA 4PURA 3TKSE 4K7NA 2MZCA 2MMZA 1BEDA 2B1KA 3KCMA 4YH2A 3DYRA 11GSA 3KH9A 5GAND 3QPMA 4ISDA 1FW1A 6GSYA 3ZIVA 3CTFA 3C7MA 3PH9A 1GUKA 4MA9A 3TOTA 3QOUA 3KP9A 2JSZA 5G5FA 4MPGA 4MMMA 2WFCA 3D4MA 1TJDA 4LA1A 2LQOA 2XPEA 4NXIA 3TUEA 5AIVA 3UMAA 3KXOA 3Q74A 3UBKA 1MDKA 5J9CA 1G6WA 1FG4A 3GHAA 2YPMA 4AJ6A 1TRWA 4V2MA 1NSWA 5IO0A 1HQOA 3I43A 4V2NA 3A2WA 3LEFA 2LTKA 5C04A 2YWNA 4N0ZA 4GWRA 1A8LA 3H93A 3RBTA 2CZ2A 4HU7A 5F8BA 5H5RA 1TK8B 1JFUA 2L4CA 4WF5A 2DMLA 1VF2A 1TI1A 5GSSA 4NMUA 3BCIA 1YKCA 2B7JA 5E4WA 3BD2A 4MJCA 2LNSA 1WOUA 2LQQA 2H19A 4O7HA 4ZB9A 1GLQA 4WEYA 1SK0A 5G1KA 2F3MA 3CTGA 2R2JA 4KDYA 4PUAA 2C4JA 3O6TA 1HD2A 5EPFA 3GL5A 1WPIA 3QR6A 3C71A 2IFQA 2H76A 4ZBDA 1W4VA 3TRPA 1TRUA 1T3BA 4L0UA 1YF0A 2HZFA 2FY6A 3HVSA 5ECQB 4Q5QA 4Q5NA 3IAS2 4OWYA 4ECBA 2P5QA 2FGXA 3ZTLA 2GT5A 2H0GA 2H70A 3KZQA 2CX4A 3WGXA 3QAGA 1EEMA 1WWJA 2WJUA 2PN8A 1M2AA 1BJXA 4MZWA 2N5BA 3F4TA 3FHKA 4KGIA 1UVZA 1TKDB 4RI7A 5KN0A 1B4PA 1K0DA 2B7KA 4XCSA 4WXTA 4MZBA 3HJPA 1PL1A 3M9KA 2C3TA 3GKKA 2VD0A 4F0BA 4KB3A 1AUCA 2JADA 3KEBA 2HFDA 2E2MA 3C8EA 4XRAA 1X9SB 4X0XA 2GZYA 1U6TA 5AISA 5EY6A 3I9V2 3W6GA 1XIYA 3ZITA 3PINA 2L6CA 3IC4A 2KHPA 5DJMA 4XS4B 4MJAA 3AY8A 2B5EA 4L5OA 3ZVJD 4XS1A 3F3QA 2RM5A 1X5DA 3DVWA 1A0FA 2BJXA 1K0CA 1H4OA 3EVIA 2KOKA 4JU5A 2H66A 2OADA 1A2JA 4EC0A 3QD9A 4POLA 1V58A 3O3TA 1JZDA 5KN1A 1AXDA 4OO4A 1GTBA 5B7CA 1QK8A 3TRXA 4ID0A 2HRNA 2GZZA 3MSZA 4V1Ag 2I4AA 2PERA 2XC2A 1FB0A 1PKZA 2P5RA 4YAPA 1DE2A 4KUNA 4YQVA 3S9FA 3TJGA 4J56E 3CMIA 3HD5A 3HJOA 2DIYA 2IMKA 6GSVA 4MLYA 4DSSB 1JLVA 5IMAA 1B48A 1X9WB 5IMDA 4N10A 1H75A 3HJMA 2MBSA 5FHIA 4AF2A 1JLWA 3LSZA 3BOAA 1ST9A 2IWTA 1F37A 1XPVA 3HDCA 4FYUA 4N30A 3TGZA 2JSYA 1SYXA 5J4UA 3D4TA 2BMXA 1PD21 1G7EA 4GSTA 4X1UA 2O85A 1LU4A 2YNXA 4XS4A 4HU9A 5ECMB 2HZEB 3G7JA 3KM6A 5G2ZA 4EKZA 1VF3A 1R5PA 3VK9A 3H79A 1F3BA 4IN0A 3E0UA 2I3YA 1NW2A 2GLRA 2DJJA 1OC9A 3U5RE 3ERWA 2O87A 2PGTA 1A0RP 4D73B 1XW5A 1R5AA 3ME8A 1GSFA 2JZRA 2VD1A 2AUVA 3CSHA 1FB6A 3ZIJA 3W8SA 4MP4A 5IQYA 4ILFA 1T00A 4V2LA 3RPPA 1GSUA 2D2ZA 3NZNA 5ECRB 2NVLA 4NHWA 5D9VA 5LCZA 2LV3A 22GSA 3ZRDA 3WT1A 1FOVA 4NWYA 1T4ZA 4DSSA 3UVTA 4KA0A 2LSTA 3FYGA 1ERVA 5IIZA 4PNGA 1PRXA 4KAEA 20GSA 3MAKA 2KUCA 4H86A 3EURA 1GUMA 2IPAA 4F0CA 1GSQA 3DRNA 1ERTA 5GSTA 4IELA 3GIXA 3VWVA 1XOAA 3KD0A 3SWLA 2Z9SA 4HJ2A 2H0IA 2DC5A 3JCML 5ECPB 3GA4A 3Q19A 2DJKA 4F9ZA 1HNBA 3CSJA 4WETA 1AQVA 1K0AA 4Q5RA 3R2QA 4D73A 5ABRA 3EYTA 1TP9A 3M8NA 1NHOA 1GNEA 3IA1A 4TR1B 4KSOA 5IMZA 3IE3A 3ZZXA 5B8AA 2VLVA 1FVKA 3IOSA 3KP8A 2YZHA 2IIYA 4ECIA 2ES7A 4WBJA 1F3AA 2RUFA 4MJEA 1K3OA 1FVJA 1LBKA 5CYYA 5CNWA 3KJYA 1SJIA 2B5YA 4KDUA 2CAIA 2GSSA 5IMFA 2C3QA 3APOA 1XBSA 2TRXA 4E8HA 1X5EA 4JE1A 2H71A 3GSSA 2B6MA 3Q18A 1SL0B 3GL3A 3IXRA 1GTIA 1A8YA 2PUKC 5LD0A 2A2RA 4JEDA 2OE3A 1QQ2A 3F8UA 2LJKA 2AB6A 5ID2B 2GQLA 2H1BA 3IK7A 2GS3A 4HS1A 2NPBA 1OAZA 2E0QA 3GRXA 4IQAA 4WF4A 1M2BA 3RHCA 2DJ0A 4IHUA 4IP6A 1ERUA 1A2LA 1XWBA 1ERWA 3K8NA 3F9UA 3GYKA 3QAWA 3FEUA 2FNOA 5DDLA 3APQA 1OKDA 2GSRA 3EC3A 3M1GA 2OBKA 3N9JA 2VUPA 1PSQA 3TOUA 2P31A 2FUG2 1SL2B 2E2GA 2VL2A 4TVEA 2HSHA 2JL4A 1F6MC 3QFAC 4V1Ap 3ZREA 3F6FA 4KW6A 5HFGA 3HZ8A 3EU3A 1U87A 1YQ1A 4IP1A 1A23A 3VURA 1TU7A 1VF1A 5HR0A 1JZRA 4EO3A 2VIMA 2LNTA 2PU9C 5F0GA 2HLSA 2YOIA 3EMPA 2XBIA 4JZQA 1EGRA 3HVVA 1W89A 1NM3A 2R37A 1U3AA 2H75A 3LYPA 3GTUA 1RK4A 2C8UA 4FO5A 1Q98A 2K8VA 3RAZA 3HVXA 1ACVA 2YN1A 1MEKA 3GH6A 2AHEA 5DALB 3VWUA 3PGTA 1X5CA 5DVBA 1S3CA 1EOHA 4MK3A 4AJ7A 4I97A 5GZZB 4GSNA 5JCWA 2F8AA 5B6NA 1V40A 1B9XC 2FHEA 1TU8A 2K8SA 1M7TA 1SL1B 3A2VA 3GURA 1AAZA 3PR8A 1YDKA 1SENA 2JZSA 3FKFA 2L5LA 2LKUA 3UARA 3J7Yb 4I8BA 3KH7A 2L59A 3CXGA 5L71A 2WS2A 1EP7A 1XVQA 1K3LA 1V98A 1M99A 2AAWA 2VCQA 3TJJA 1GNWA 5COHA 3E3EA 2LRCA 4MJBA 3RPNA 1B8XA 1SKRB 4FYCA 3D22A 3RDWA 2FA4A 3CYNA 1R26A 2X99A 4WKWA 3ZMKA 1O73A 4G9HA 2MMOA 1MDJA 1UN2A 1U3IA 4HI7A 1CQGA 5A5KA 3GNJA 3G7YA 4TXVA 2VOCA 3MWHA 4G2EA 5DQYA 3A2XA 2GGTA 1GSSA 5C00A 4OFNA 2HRFA 1KTEA 1TK0B 2GSQA 2LEGA 2H6YA 2GTUA 4TOPA 3HXSA 4I5QA 4ZIJA 4O32A 5DALA 2NBSA 4JR6A 5GAPD 2CAQA 2CVBA 4BA7A 4TR0A 2B3SA 2WGRA 4JR4A 5JWRB 1YEXA 1VF4A 3GH9A 4IGJA 2M46A 2H8LA 2V32A 2OE0A 2PWJA 3APSA 5ECHB 3D0ZA 1YY7A 5H5SA 1ZMAA 1SK2A 2OBIA 2AYTA 3F0IA 3TDGA 2CA8A 2C0GA 3C73A 1BG5A 1R4WA 1K0BA 5D9XA 1XFLA 5D8IA 3LQ7A 5FT3A 5ECLB 1WRYA 3QCPA 4XIHA 3WD6A 2NTOA 1WIKA 2K9FA 4JBBA 1TTZA 5EVOA 1K0MA 1ZGNA 2I81A 3UAPA 3P2AA 5IMCA 3VI5A 2LRTA 3ERFA 2R4VA 2N5FA 1A24A 3WT2A 4MH2A 3BBYA 3TKSA 2XBQA 1TW9A 3GKXA 3EE2A 1ZL9A 2H0HA 3DIEA 2HE3A 1XOBA 5KN3A 1SU9A 4PQIA 4WR5A 4HQSA 2YJ7A 5J5NA 3D5JA 1ZCPA 16GSA 4IS0A 3FZ4A 4ZL8A 1YKAA 3F4RA 1KNGA 1F9MA 3LYKA 3VLNA 3QFBC 2KP1A 4XS6A 2GSTA 4EDZA 5DCGA 5D96A 3ZFLA 4L0WA 1ABAA 4TR4A 3DGQA 1OKTA 3FY7A 2MMAA 3RHBA 4J2FA 4ZB8A 4CDOA 1XWKA 3SBCA 5D9TA 5AGYA 1C72A 1DBYA 1XW6A 4ZBAA 13GSA 1JHBA 3I69A 4HJMA 2R6KA 3KIJA 3EINA 3FR3A 4EDYA 4LMVA 4L8EA 5DJLA 1M0UA 3L9SA 1NHYA 4IW9A 1YF1A 1PKWA 2H30A 2MBTA 2VL3A 4L5LA 3GSTA 1TK5B 5J41A 2CV4A 2WB9A 3QMXA 1SD8A 4KX4A 1LJRA 3DMLA 4TR3A 2VAFA 4IQ1A 2REMA 2NDOA 2FWHA 3C1SA 3GKMA 2A4VA 5DQSA 4O5RA 3HCZA 4CW9A 2DIZA 2VM1A 5AIXA 1VRSD 2EIQA 2X8CA 4FYBA 2O8VB 4HQZA 4F03A 9GSSA 4X43A 1TXXA 2ON7A 4MF6A 1TOFA 3VFIA 4G19A 3HA9A 2LRNA 4DSQA 1M9AA 3TRQA 2YV9A 2R5GA 4PXOA 3V1WA 4CHSA 1FAAA 3GX0A 1CQHA 3CBUA 4YQMA 3IHQA 4J57E 1DE1A 5G31A 1PN9A 3CRTA 2H1AA 2H1GA 1G0TA 4GSSA 3LORA 2C0EA 1K0OA 2XPDA 2OA7A 3M0FA 2DJ3A 4GQFA 2I9HA 2YP6A 1R7HA 2GQMA 4GLTA 4LMWA 5ECNB 1GTAA 4TXOB 3KTLA 3LFLA 4BWSA 2YV7A 3H1NA 2YWIA 4K2DA 2HZEA 4PX1A 4LL4B 3LG6A 12GSA 3DWVA 2ON5A 2YWMA 5CRHA 1AW9A 4GTUA 1SKWB 5B6MA 3FR9A 4I2TA 3M9JA 3FZ9A 2VCVA 3QDNA 4PQHA 2GQKA 3ED3A 2L6DA 3IV4A 1PX6A 3TJKA 1Z6NA 2V6OA 2WULA 3O76A 1GUHA 2IN3A 4K0NA 3ERGA 2LJRA 4NPBA 5IOXA 2ALBA 5ECSA 1MTCA 4K7IA 3ZYWA 2TRCP 4Q5FA 3M3MA 2N5AA 18GSA 4GRFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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