3ZVJA

Crystal structure of high molecular weight (hmw) form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
MVLLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 33
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zvjA00
5D96A 1GULA 3CMIA 3CRTA 4MF7A 4HI7A 3Q74A 2A4VA 2FWFA 1JZDA 4PURA 2X99A 2DIYA 4PUAA 2OBIA 4ZIJA 4RUVA 1YF0A 2VCZA 3GL5A 1TW9A 4DSQA 3FHKA 4BA7A 2CAQA 2KOKA 1H4OA 3IK9A 12GSA 5B6MA 2H71A 4GLTA 4ILFA 1GTIA 1R7HA 2FWHA 2FWEA 3A3TA 4DSSB 4MH2A 4BVXA 14GSA 4F0BA 4OO5A 3ZFLA 1SD8A 5IOXA 3IRAA 2M80A 4KDYA 4WKWA 3GYKA 3CBUA 3CXGA 1V58A 1B8XA 3GKKA 5CO3A 4PQHA 4J56E 2AUVA 4KUNA 2WB9A 1T00A 4V2MA 2TRXA 2RIIA 5CP1A 2MZCA 3EMPA 5DCHA 3FEUA 1O81A 2PPTA 3MWHA 1XXUA 2JZTA 2M46A 1JFUA 4HOJA 2E2GA 5HFGA 1GNWA 3DVXA 5HR2A 5EPFA 3ME8A 1OVNA 4E8HA 1YKAA 1T4ZA 2GZYA 3KMOA 1ZMAA 2V41A 3QAWA 10GSA 1ZL9A 3LEFA 1T3BA 3TRXA 2C3NA 1GLQA 4WR5A 2LRTA 1GSDA 1AQVA 2Z9SA 2L6CA 1HNCA 4WEYA 1UN2A 4MJCA 4TOPA 4MPGA 5KN1A 2H72A 2KP1A 4POBA 3GKNA 4YQUA 4MF5A 2QGVA 4O5RA 2DBCA 3O3TA 3ISOA 4V1Ap 5ECHB 4PUFC 2QKEA 4I97A 2H73A 4K2DA 3VURA 1PKZA 3I6AA 2MYGA 1C72A 4P3YB 3BCKA 4MZBA 4DSRA 1TOFA 4MPFA 1OC9B 4ZBBA 2IMKA 1GUHA 5J3RA 3GNJA 3GX8A 2HSYA 3KH9A 3RDWA 2MMAA 5A4WA 1EP8A 6GSYA 5J9CA 5HR0A 3ZFBA 5AN1A 3TRPA 1BX9A 4K9ZA 1Z7RA 3ME7A 1M0UA 3GN3A 2BTOT 1MDKA 2H30A 2MMOA 3LG6A 4RQXA 1XWBA 1TP9A 3DGQA 5G5FA 3QOUA 1XCCA 1WP0A 3ZTLA 1XIYA 3RAZA 1EEMA 3UJ1A 4GQCA 4MABA 3IHQA 1AIUA 5CRWA 1NHOA 4LMVA 2J23A 4I2TA 2ZUPA 4MZWA 5IMCA 4FO5A 1M99A 2H66A 1ZGNA 2N5FA 1MD4A 1ACVA 1EP7A 4PNFA 1F6MC 4V2NA 2GTUA 4TR3A 1R26A 1GSEA 1UC7A 2RM5A 5JWQB 3G7JA 2YZUA 1F3AA 4MF6A 3ERFA 2XPDA 3TB2A 3CRUA 1A8YA 4XRDA 2LS5A 1FW1A 4KW6A 2AB6A 2K18A 1FHEA 2VL2A 2GZPA 1TU8A 3APQA 3UEMA 1JZWA 2F51A 5DAKB 4IELA 5CYYA 5A4UA 5J9BA 2JACA 4ECJA 2I1UA 3H79A 18GSA 2AJQB 2V1MA 1XVWA 2C8UA 2REMA 1GP1A 2H19A 4ZL7A 4NMUA 3DIEA 5B8AA 1ERVA 3GHAA 1GSFA 2HYXA 4TR0A 4KCAA 2LNSA 5ECQB 2WDUA 4F03A 4EE0A 3R2QA 2CZ2A 2H1AA 4PGTA 2IN3A 2HSHA 2ON7A 3KJYA 4XS1A 1SJ6A 1MTCA 3HHVA 4HDEA 1SKWB 3IPZA 4GF0A 3N9JA 1TRSA 3F3RA 1OC9A 1K0OA 4TN8A 5KEJA 4NHZA 2LUSA 4FYUA 5G2ZA 1TXXA 3EURA 2GQKA 2RUEA 8GSSA 3A5WA 3UAPA 4EC0A 5DJLA 2B6MA 2YJHA 3ZIVA 2H1GA 4IKHA 4XCSA 4OO4A 5JWOB 1SL2B 1GSUA 2VLTA 4NV2A 1PMTA 4PQIA 5ID2B 3QPMA 3P7XA 4GTUA 1OYJA 1YEPA 1TK8B 2F8AA 1PKWA 3FW2A 1B48A 3F4RA 2YP6A 1V98A 4L0UA 1NSWA 1NW2A 1QMVA 3UMAA 2OA7A 3LORA 1QQ2A 3KM6A 5F0GA 1MDIA 2XC2A 2OJLA 3TKSA 1XWKA 1NHYA 4HJMA 1IYIA 2DJ3A 1UA5A 3CYNA 2H8LA 4MK3A 3GL3A 3VWUA 3HXSA 1K0CA 2IMDA 3H1NA 2X64A 4K1FA 1ABAA 1M9BA 3DRNA 5DCGA 4AJ8A 2C4JA 1BEDA 1THOA 1HD2A 5ENUA 2FNOA 3ZMLA 3ED3A 3S9FA 2YCDA 2L5LA 3A2XA 2CZ3A 3FY7A 3GMFA 4EKZA 4GRFA 5HR3A 5ECOB 1GRXA 4ECCA 5DAKA 2AV4A 2LRNA 2I4AA 3C8EA 5IMVA 1V2AA 1TKDB 1GTUA 1TK0B 2DC5A 2RUFA 2KHPA 1LU4A 5KN2A 1XW9A 2HFDA 1ERUA 5G5EA 1PX7A 1WRYA 3GA4A 3WGDA 9GSSA 5AIVA 20GSA 3RPNA 3Q6OA 2OBKA 3N5OA 4EUYA 2O8VB 4GSSA 1AXDA 6GSVA 4TXOB 3ZVJA 2C1YA 2OE1A 1ZYEA 5DQYA 2QC7A 3ZZXA 1Z5YE 4H86A 1QGVA 3HKRA 2PMTA 3E3EA 5D8IA 1F9MA 4ZB6A 3KP9A 3IK7A 5HFIA 4HQZA 2WRTA 3DVWA 1T1VA 2PERA 5G31A 2GZZA 1OC3A 1VRSD 2VLUA 3M3MA 4MJEA 4MA9A 2N5BA 2R5GA 1V40A 4JR4A 5A4VA 2EC4A 4EXJA 2VUPA 1KNGA 2OACA 3TRQA 2GQLA 2IMEA 4F2IA 4KNDA 3EYTA 3O6TA 1E2YA 4ISDA 3M1GA 4OMVA 3ZIJA 3US3A 2K8VA 13GSA 5H5SA 3GV1A 5LD0A 2VD1A 3WYWA 3CSHA 1NM3A 4XS6A 3TOTA 1YZXA 2B1KA 3LYPA 3BCIA 1K3YA 2QSIA 5EY6A 2VCVA 4GWRA 5IM9A 4FH8A 1PSQA 1I9DA 1T8EB 5ECRB 5JWRB 2MMZA 2R2JA 3D21A 3W8SA 4ZL8A 1PGTA 2DJ1A 1PRXA 3VLNA 1GTBA 1PL1A 1LJRA 5GSSA 2CVKA 1SD9A 1URMA 2VAFA 3IBHA 2YZHA 3FZ9A 5GAPD 1ZYQB 2GGTA 4MJBA 2B3SA 1BG5A 3C73A 3P8WA 3C1RA 1EWXA 4WETA 1OKTA 3TKPA 1WIKA 3EINA 3F63A 1T4YA 4OCEA 1F37A 3H4KA 3QD9A 1AW9A 1PL2A 2OKAA 4IQAA 4JU5A 2EIQA 4ACSA 4I5QA 3EMXA 5D9XA 3HA9A 3RHCA 3TKRA 3DWVA 4ECBA 2NBSA 4KSOA 2VLVA 4TXOA 2LQQA 1YF1A 3IV4A 5F8BA 1U87A 4YQMA 3TUEA 1XVQA 1Z3EA 3HZ4A 5J41A 2LJAA 5CNWA 3VI5A 3PINA 3IA1A 3FR9A 4ML6A 1SK1A 2H70A 4NWYA 2GT5A 2YWIA 1JZRA 4GCIA 2HZEB 1DUGA 1X9MB 1YEXA 4K7NA 3D0ZA 2R37A 2ZCTA 1SK0A 4I2UA 2YWNA 3WT2A 4LL1B 4EDZA 4F82A 5CRDA 3HZ8A 3ZYWA 5IQYA 2L5OA 2DJJA 3RHBA 3HJOA 2YNXA 2ZNMA 3IE3A 2C0DA 5JCGA 3IAM2 2O87A 1O8WA 3TKSE 2ON5A 2PBJA 3EE2A 3E9JB 5E4WA 4MH3A 2MBSA 3LQ7A 4GQFA 4JRRA 4BL7A 4IW9A 2GLRA 1FG4A 2IIYA 3UARA 4F9ZA 3QDNA 1BJXA 3U6VA 4JBBA 3OR5A 3GH9A 3TJBA 3I43A 3LYKA 5COHA 1ST9A 2F8FA 1WOUA 2KLXA 3DEXA 2YV9A 3F0IA 2VCTA 6GSXA 5IMFA 4GSTA 3GTUB 1M2AA 3IC4A 2TIRA 5DBQA 2ALBA 1S3AA 5HFKA 1V9WA 2E7PA 5G1LA 3J7Yb 2PVQA 2AHEA 1WE0A 1YKCA 5DJMA 2KP2A 3GX0A 2DJ2A 1MEKA 2HLSA 1TK5B 2FD3A 3PGTA 4HEA2 3BD2A 2HT9A 1THXA 4GSNA 3ZRDA 1G6WA 2R3XA 5ECKB 5IPHA 3W6GA 3GURA 3LSZA 1XPVA 1X5DA 4O7HA 3EWLA 2CAIA 3GIXA 11GSA 4IGJA 5E59A 2P31A 4O92A 4KCEA 2HXKA 1USBA 1O73A 2VO4A 1XW6A 1HNAA 2M72A 2YOIA 3IR4A 1QUWA 3UL3A 2LSTA 4DSSA 2HZFA 3QFAC 3UVTA 2NPBA 1M9AA 1K3OA 3GSTA 1J08A 4FYBA 2LRCA 2H1BA 2DJKA 3O76A 4WR4A 2HNLA 5EVOA 3C1SA 5IPGA 2HZEA 3TJJA 22GSA 4XS4B 5INYA 1U3AA 2JL4A 2P5QA 1FB6A 1XW5A 2I9HA 2TRCP 3UOMA 3V1WA 3CSJA 4X1UA 1IYHA 2WFCA 2BMXA 2VOCA 4IS0A 1N8JA 4FYCA 4IBPA 1ON4A 1QXHA 1S3CA 1GUKA 5ECMB 1G0TA 4PNGA 5DQSA 3CTFA 3M0FA 2VCWA 4Q5FA 2WS2A 4ID0A 5C00A 1E6BA 1ILOA 2YN1A 7GSSA 4O32A 3KTLA 3ZITA 1M2DA 1EEJA 1XWCA 2I81A 5AISA 1KBNA 2GSSA 1BYEA 3IAS2 4D73B 4YAPA 1V57A 2K8SA 3GTUA 1Z7PA 1X5EA 2H01A 1M2BA 1K3LA 3Q18A 3IXRA 2IL3A 4ULXA 3LGCA 3APSA 1CQGA 2FWGA 5DVBA 1O85A 4AGSA 5ECLB 4NXIA 2IJYA 5CAXA 19GSA 4TR1B 3CTGA 2VM2A 4XIHA 2YWOA 6GSUA 1TTZA 1XBSA 1GUMA 3NIVA 4E8EA 4HUAA 3ZMKA 4MP4A 3H93A 1GL8A 1TRWA 1W4VA 4OFMA 2X8HA 1EGRA 1YDKA 3G7YA 2C0GA 2VD0A 2B5YA 2FCHA 4I6XA 1SENA 5DALB 3GFKA 4Q5NA 3D22A 3KIJA 3ERGA 3A2VA 4WBRD 3I9V2 3D5JA 1SKSB 2B7KA 1FAAA 4LMWA 2LEGA 2O7KA 3DD3A 2H75A 3HJMA 4YAVA 4IJ3A 1X5CA 1ZZYA 2XBIA 3KD0A 2GSQA 1U88A 4QL9A 1X0RA 4AJ7A 4ECIA 3KGKA 3PH9A 2MBTA 3HDCA 2FHEA 1KTEA 2E2MA 3IOSA 3KZQA 1FVJA 3TGZA 3IDVA 2NVLA 4L5OA 1XFLA 4IVFA 3VPQA 4TRXA 5IOWA 1BQ7A 4BPYA 2XHFA 2FGXA 2CVDA 1A2LA 3WT1A 4WF5A 2MMNA 4L8EA 1ZOFA 3JCML 1BAYA 4HJ2A 3QCPA 2O85A 2JZSA 2FY6A 1GSYA 3GH6A 5GSTA 2JZRA 1TI3A 4ZBDA 1Y6EA 2H6YA 1QFNA 4IP1A 3HVXA 2V32A 2NTOA 3TJKA 1Z9HA 4JEDA 1SL0B 4CHSA 1AAZA 2D2ZA 4NPBA 2B5XA 5J4UA 4G9HA 1AQXA 4D73A 1A24A 3NOFA 3M8NA 3P2AA 4PX1A 1DE2A 1X9WB 1J9BA 1ZCPA 4FIWA 1EOGA 2YV7A 3L0HA 1A0FA 3VFIA 3QR6A 2HI7A 1TDIA 3LWAA 5B7CA 1VF3A 3SWLA 4MMMA 1FB0A 5GZZB 4LL4B 1SKRB 1Q98A 4OFNA 5ECIB 2A2SA 5ID2A 5ABRA 3F6DA 5LCZA 2IMIA 2PWJA 1SYRA 3KTBA 4EVMA 3FYGA 1I5GA 4IJIA 2VL9A 1O8XA 4AF2A 1B4QA 3QAVA 3EU3A 1ML6A 3TOUA 1XOAA 1A23A 1N2AA 1Z6MA 5J5NA 4JR6A 3QMXA 2K9FA 4K7IA 1FO5A 16GSA 1OE8A 2HRNA 4HU9A 3F4SA 1EGOA 5DALA 4ZBAA 3L78A 4MZCA 1RK4A 5H5QA 2JSZA 3M9JA 1TRVA 4WXTA 1DE1A 3LFLA 1VF4A 4HS1A 1GTAA 1K0NA 1ERWA 4K0NA 1TU7A 3RBTA 4N10A 2FA8A 3EC3A 2H6XA 3C71A 3C7MA 4TKYA 3HD5A 2K6VA 2CT6A 2KUCA 1S3DA 3D4TA 2H6ZA 5F05A 3CSIA 4L0WA 5AIXA 3VWWA 2IFQB 5JCWA 4ML1A 1AQWA 1OC8A 4BVYA 3VWVA 3F6FA 4RI7A 4WBJA 1XOBA 3L9SA 2OE3A 1WPIA 4XRAA 4F0CA 3ZVJD 2O89A 1HYUA 3KCMA 1K0MA 1TJDA 1JHBA 2YANA 3QAGA 2A2RA 4OD7A 4PXOA 3L9VA 4KB3A 4WF4A 4NHWA 2CX3A 1XWAA 4KDUA 1SJZA 2VL3A 5IO2A 1X9SB 3MSZA 2V6OA 2H0HA 1EZKA 3Q19A 3UBLA 4KGIA 3KH7A 2HRFA 6GSWA 5GAND 4Z7XA 1PD21 3L4NA 4LA1A 3GUSA 4ZB9A 2OE0A 2L57A 5IMZA 5IMAA 2DJ0A 2BJXA 4QL7A 1H75A 2WGRA 1U6TA 2C3QA 3BBYA 1FOVA 3UVHA 2IPAA 3TKQA 2L6DA 2C80A 2B7JA 1Z6NA 2P5RA 2WJUA 5D9VA 2N5AA 3EU4A 3ZL5A 2NDOA 4JE1A 1XWGA 3DMLA 3F3QA 3SBCA 3HJPA 4ZXGA 4YQVA 2PUKC 2GSRA 4EDYA 2OADA 2CX4A 3QFBC 1JLWA 4MLYA 1GNEA 2PGTA 5D9WA 4CDOA 2B5EA 2PN8A 3KEBA 5EL8A 2LV3A 4X0XA 1AC1A 4DEJA 4LLRA 5G30A 2GS3A 3F4TA 3FZAA 4Q5RA 5F07A 2YPMA 3KXOA 4V1Ag 2LNTA 2WCIA 1OAZA 1B9YC 1O7UA 2HE3A 2JSYA 1DSBA 1O6JA 3VK9A 4MJAA 2IFQA 2ES7A 4POMA 4BWQA 5CRHA 3WGXA 3J7Yk 2C0FA 4L5LA 4QQ7A 4KA0A 4IQ1A 3DYRA 5G1KA 3WD6A 17GSA 2VL2C 5D9TA 4GXZA 3ZLPA 2VM1A 2P0GA 5ECPB 2H76A 2EIRA 3GKMA 4POLA 3VI7A 1B9XC 1A2JA 4EO3A 1JZOA 3HVSA 2FUG2 2G0FA 2PU9C 1YJ6A 4DVCA 3G9BA 1EV4A 2X8GA 2FLSA 2DMMA 2YJ7A 3MNGA 4KSMA 2LJKA 1XZOA 5FWGA 2DLXA 3BOAA 1RQMA 1OKDA 4N30A 1CQHA 5ELGA 3U5RE 3UBKA 4J2FA 1GLPA 2X8CA 2C0EA 4OWYA 2L59A 3FZ4A 2L4CA 4HQSA 2H74A 1SYXA 4I8BA 3HVVA 3DKSA 3E0UA 1U3IA 2R6KA 2XBQA 5KN3A 1K0BA 2CA8A 2JADA 1PA3A 2WZ9A 5IIZA 1R4WA 5AGYA 4Q5QA 2G2QA 2EIOA 4AJ6A 2YWMA 1Q4JA 2DIZA 4MDCA 2CVBA 4IN0A 1K0AA 6GSTA 3W8JA 2C3TA 3WGEA 3L9UA 1PX6A 4ZILA 4XTSA 2F3MA 5D93A 3A2WA 2J9HA 1G7OA 1TRUA 4K8MA 4N0VA 1GWCA 4ZB8A 2F9SA 3FK8A 3D6IA 4EF0A 3KMNA 2GT6A 2RM6A 4G2EA 3BJ5A 3LXZA 4HZ2A 2GDRA 3TKSC 2LKUA 3GSSA 2H0IA 4K7OA 1QK8A 2V6KA 1EOHA 4G10A 2H1DA 3D4MA 5L71A 1HNBA 3M9KA 1W89A 3TJFA 1R5PA 5ECSA 3HCZA 4JZQA 6GSSA 3VPTA 3TDGA 5B8BA 3G7IA 4HZ4A 1F3BA 5LNKe 1PQNA 1SJIA 4N0ZA 4TR4A 5H5RA 3LXTA 5CREA 2IMFA 3F8UA 3I69A 2AYTA 2JU5A 1VF2A 1SL1B 1EV9A 2I3YA 4RI6A 1RW1A 1M7TA 2AAWA 4KE3A 4POKA 4K6XA 4CW9A 3EVIA 5IO0A 3UIWA 3KP8A 4KX4A 1DBYA 2LTKA 4IP6A 4ZL9A 4XS4A 1R5AA 1A0RP 3FRCA 3GKXA 1YY7A 2DMLA 2LJRA 1PN9A 4X43A 2WULA 1G7EA 3DXBA 1JLVA 3GRXA 4V2LA 1ERTA 4KAEA 4NAXA 1TI1A 5KN0A 3FR6A 4KH7A 1LBKA 1WJKA 5IMDA 3VWXA 1AUCA 3FKFA 4RQRA 5FHIA 4PQ1A 1MD3A 3HYPA 3NZNA 5DDLA 1SK2A 1UVZA 3K8NA 3ERWA 3MAKA 1A2MA 1VGLA 1T7PB 4IHUA 5B6NA 1GH2A 2GVPA 3P90A 2FA4A 4KDXA 4MCUA 3APOA 1WWJA 1FVKA 4HU7A 4YH2A 2B1LA 2E0QA 2CQ9A 1SU9A 5HQPA 1K0DA 5FT3A 4NV5A 1KEBA 2VCQA 1MDJA 5HR1A 2XPEA 5C04A 4TR1A 3FR3A 4K0GA 1GSQA 3F9UA 2L4QA 1J0FA 5ELAA 4OCFA 1VF1A 1HQOA 1OE7A 2VCXA 3RPPA 4TVEA 1GSSA 2IWTA 4EL1A 1Y25A 2V2GA 4XHMA 3MDKA 2VIMA 3TCOA 2GSTA 2DSAA 3LJRA 1G6YA 2R4VA 3HY2A 3PR8A 4J57E 2GQMA 1YQ1A 2RLIA 3AY8A 1B4PA 1F2EA 4OFTA 4BWSA 3TJGA 2PVOC 4TW5A 4N11A 5F06A 5D73A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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