4AF2A

C61s mutant of thiol peroxidase form e. coli.
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
QGIDPFTMSQTVHFQGNPVTVANSIPQAGSKAQTFTLVAKDLSDVTLGQFAGKRKVLNIFPSIDTGVSAASVRKFNQLATEIDNTVVLCISADLPFAQSRFCGAEGLNNVITLSTFRNAEFLQAYGVAIADGPLKGLAARAVVVIDENDNVIFSQLVDEITTEPDYEAALAVLKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of an Orthorhombic Crystal Form of a `Forced Reduced' Thiol Peroxidase Reveals Lattice Formation Aided by the Presence of the Affinity Tag
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 52
structure length 175
sequence length 175
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4af2A00
2MMAA 4MP4A 2LNTA 2DJJA 3ERGA 2WB9A 3C1RA 4HS1A 1GSQA 2TRCP 4G9HA 5J41A 1T1VA 2IMFA 3PH9A 1JZWA 4TN8A 3ZFBA 1H4OA 4PGTA 1GWCA 4WF4A 5IMVA 1SYXA 1HYUA 2LJKA 1GSFA 2DJ2A 5IOWA 1TRWA 3CBUA 5HR2A 20GSA 2F9SA 4Q5NA 2LRNA 1AXDA 4ZBAA 3IBHA 1GP1A 2FHEA 5ECOB 1WRYA 3HJMA 2IMKA 4X0XA 5D9VA 3ERWA 3US3A 4TOPA 2FCHA 1HQOA 5ELGA 1KBNA 2CVBA 2GQKA 3QCPA 2LQQA 5F06A 2CZ2A 4E8EA 4AJ7A 1A0FA 1PRXA 2C3QA 2B5YA 1N8JA 1T8EB 2A2SA 1ZGNA 1EZKA 4WXTA 4HI7A 1XWKA 3FEUA 4IKHA 4RUVA 4BA7A 3H79A 2AUVA 3GX0A 4NV5A 1OYJA 5G1LA 1OC9A 3KMOA 2H1GA 2NDOA 4ECBA 3Q6OA 1ML6A 2HE3A 2OBKA 4HEA2 1A2LA 3GRXA 2DJ0A 2V1MA 5FHIA 1ILOA 2VLUA 2H6YA 4IN0A 2LV3A 3LORA 5B8BA 4HUAA 5G30A 3JCML 1K3YA 5L71A 2NTOA 5IMAA 2HFDA 2FNOA 4NHWA 2F3MA 4HJ2A 1LJRA 1T4YA 4JR4A 5DQYA 4GQCA 2DMMA 3VWUA 4EE0A 2H1BA 3ZRDA 4AF2A 2L5OA 3F3QA 3UAPA 1BQ7A 3KMNA 3DIEA 2VL9A 5JWRB 2A4VA 1XOBA 1XFLA 5DCGA 4XS4A 4DSSA 2GSRA 2LRTA 2N5AA 3DVXA 3TJBA 5JCGA 2CA8A 4WBJA 3KTBA 1GTIA 4BVXA 3IA1A 1MTCA 5FT3A 2YWOA 4GQFA 2YZHA 4IP1A 4D73B 2B7JA 4EVMA 2YP6A 4WR4A 3M0FA 1ZYEA 5CREA 5DJLA 3PGTA 5CRHA 4TR0A 3G7YA 3IAS2 2O7KA 1HNBA 1XWBA 1G6YA 3IPZA 3E0UA 2WDUA 3NZNA 4GSNA 4WF5A 1A8YA 4N0ZA 1V2AA 3APSA 4IP6A 1K0MA 1SJZA 1O7UA 4LL4B 1G0TA 1K0OA 2LQOA 2LS5A 2JADA 1X0RA 4TXOA 5IMFA 3P7XA 3M3MA 2LKUA 11GSA 2C1YA 1AQVA 2VM2A 1V57A 4KGIA 5FWGA 2RUFA 4N11A 3BOAA 3NIVA 1BYEA 3TKQA 4K6XA 4HDEA 5DAKA 2P31A 4O5RA 1U87A 2MYGA 2DSAA 5ABRA 3F4SA 4O92A 2CAQA 1OKDA 2V32A 2FY6A 5E4WA 1XXUA 3M8NA 1J9BA 4LMWA 1FB6A 4IQAA 2WULA 2JZRA 3RPNA 2PPTA 1PKZA 5DBQA 1QGVA 3WT2A 3Q74A 5D73A 1X5DA 2ZUPA 2VAFA 1AQXA 1DBYA 1Z6NA 2LEGA 3D4TA 1SKWB 2VIMA 2XBQA 2VCQA 1XBSA 2HYXA 4KDXA 4F0BA 2OACA 1QK8A 3IK9A 1WPIA 2K9FA 2FWEA 4JU5A 1GNEA 1R4WA 4TRXA 4KB3A 3PR8A 3F9UA 2O87A 2OE1A 1AIUA 4ZB8A 2JU5A 4MJEA 4ULXA 2NPBA 1ABAA 4DSRA 1YF0A 5D93A 3ZMKA 5HR0A 3GH6A 3RHBA 5CYYA 1O8WA 1T4ZA 4MJBA 3KTLA 2IWTA 1TI3A 4JBBA 1H75A 3FW2A 2CQ9A 4JR6A 5A5KA 3L78A 4RQRA 3TJJA 5LNKe 4MCUA 4LLRA 1ERVA 3LQ7A 4OCFA 2J9HA 2H73A 3TKSC 3I69A 6GSTA 1S3CA 1GNWA 3EINA 2VD0A 3S9FA 2F8AA 3HVVA 2YJHA 3BJ5A 3HVXA 3G7IA 1M9AA 3F6FA 1JZOA 2YCDA 4EC0A 1ZMAA 4O7HA 5ECSA 2L4CA 2DJ1A 1XCCA 2GS3A 1YDKA 4EDZA 2AJQB 2CAIA 1TRUA 4RQXA 1GSSA 3GUSA 3OR5A 1LU4A 2V2GA 1I5GA 2RM5A 1FVJA 2YNXA 4GSTA 1V58A 3GFKA 1Q98A 3C71A 3QR6A 2IL3A 3A3TA 4NMUA 1EP7A 3H1NA 2PN8A 4XCSA 3DWVA 6GSUA 4IQ1A 3HD5A 2K6VA 5F0GA 1NHOA 3QD9A 2H74A 1OVNA 5AGYA 1XW5A 5ECNB 2EIQA 1O81A 2I81A 1HNCA 2OE0A 2OBIA 1TJDA 4ZL9A 5KN2A 3D6IA 2DIZA 3LXZA 3WGXA 1EOHA 5IM9A 1GSYA 2GT6A 4N10A 1MD3A 3F0IA 3F8UA 4L0UA 1PX6A 1B48A 2O8VB 3GSSA 2OADA 2CX3A 1UN2A 1GLPA 3HHVA 4NWYA 3KM6A 1U3AA 1UC7A 4MABA 2O89A 2M46A 4PX1A 2HRNA 4OFMA 4MJAA 3UVTA 3VPQA 1Y25A 3IDVA 1A0RP 2CVDA 5EL8A 2B1LA 5JWOB 2IPAA 2GSSA 5GSTA 2WS2A 2YN1A 5CAXA 1PL2A 3EVIA 5JCWA 5GSSA 3LJRA 1W89A 3J7Yk 1G7EA 2CV4A 4KAEA 4JEDA 4HQZA 5J9BA 5CO3A 1O6JA 4FO5A 1XW9A 2PUKC 3R2QA 1B9YC 3NOFA 2YZUA 6GSYA 3C8EA 4K9ZA 2YV7A 1X9SB 1TDIA 3VI7A 4X1UA 1J0FA 2K8SA 2XC2A 4Q5FA 2IFQB 2R6KA 5IMCA 2KOKA 1ACVA 3CXGA 4CW9A 2A2RA 2LJAA 3E9JB 4IELA 4I2TA 2P5RA 3HA9A 1AQWA 4IGJA 3WT1A 4MPFA 1TXXA 4FH8A 3FYGA 1X9MB 2L5LA 1OE7A 3P90A 1VF4A 3UOMA 2EIRA 3LGCA 2C0EA 3GTUB 2ZNMA 3ZIVA 4F03A 1IYHA 3TRPA 2YWMA 4GLTA 3ERFA 1ERWA 3QAVA 2X8GA 1EP8A 4WR5A 5F07A 1R26A 1JHBA 3L9VA 5B7CA 1A8LA 1MDKA 2IMEA 2GQMA 1VF3A 1R5AA 2MMZA 3QAGA 1OAZA 3UJ1A 3F6DA 2R3XA 6GSVA 2OA7A 3C1SA 5GZZB 4ISDA 2QC7A 1GULA 3L0HA 2GZPA 2DJKA 4EUYA 1XWAA 4XTSA 4KDUA 3EMXA 2TIRA 1C72A 4ECCA 2H0GA 4D73A 4ZBBA 2X64A 1ST9A 1K0DA 3TJGA 2GDRA 5A4WA 1EV9A 3P8WA 1GLQA 4F2IA 5CRGA 3UEMA 6GSXA 3UARA 3QPMA 2DBCA 4QL9A 5IOXA 5D9XA 1WOUA 4J56E 4ZILA 3UMAA 2FD3A 1M9BA 3BCIA 1TKDB 3MWHA 1B4QA 1FVKA 1ZL9A 1B4PA 3G9BA 2CZ3A 10GSA 3RHCA 1SKRB 1KTEA 3GN3A 2M72A 1BJXA 1OKTA 4GF0A 2H6ZA 3FR6A 1M7TA 3CTGA 5J5NA 4Q5QA 1EGRA 2X99A 2R4VA 3GKKA 1YJ6A 2MBTA 5DCHA 1A24A 2X8CA 3CSHA 3HKRA 1Z5YE 2LUSA 4ZB9A 4RI7A 4FYBA 2VD1A 1EV4A 3HZ8A 1IYIA 3RAZA 2AB6A 1PA3A 3ZVJA 2WRTA 4V2LA 4EXJA 3GL5A 3SBCA 1SK2A 2RM6A 2P0GA 5IO0A 2VCXA 1KEBA 5G5FA 3LFLA 4PUAA 3C7MA 4ZBDA 2VL3A 2VCZA 2X8HA 3MSZA 2XPEA 5HFKA 1URMA 3U5RE 3KZQA 2HXKA 4V2MA 4WBRD 4K7IA 4ZL7A 2VCWA 2AAWA 1Q4JA 4FYUA 4DSQA 2OJLA 3LYPA 3KIJA 5IQYA 3RBTA 5AIXA 1AC1A 4I2UA 1WJKA 2PBJA 2IIYA 1F37A 2H71A 2MZCA 3D22A 1MDJA 3L9UA 17GSA 3M9KA 1T3BA 2VL2A 4ID0A 3KCMA 4HOJA 4Z7XA 2XPDA 1GSUA 4WKWA 2MMNA 3A2XA 1SK1A 2E2MA 2Z9SA 4OO4A 1EWXA 1PGTA 4OCEA 4E8HA 3TRXA 9GSSA 2E7PA 5A4UA 1K0AA 1SKSB 2IMIA 5ECQB 2C4JA 2JSYA 4V1Ap 1XOAA 3FKFA 3IAM2 2FWGA 3CSIA 2GTUA 3CYNA 3O76A 4ML1A 4LMVA 1B8XA 3V1WA 3UBKA 5ECMB 1ZYQB 1JZRA 2VL2C 1YKAA 1TU7A 4OFTA 3GX8A 1RK4A 1ZZYA 4MA9A 4OMVA 3ISOA 2RIIA 2JSZA 4JZQA 2B6MA 5IPHA 2HSHA 2F51A 2ON7A 5G1KA 5G31A 1ERTA 4MJCA 3HZ4A 1E6BA 3GHAA 4MDCA 3O6TA 1TTZA 1PN9A 3EU4A 4LL1B 4OD7A 3TKRA 1QMVA 4F9ZA 4ECIA 3L4NA 3H8QA 4FYCA 2N5BA 1PMTA 1DUGA 1JZDA 3FK8A 1XW6A 4KCEA 1O73A 4K7OA 5EPFA 4Q5RA 1SENA 1V98A 4AJ6A 1NHYA 2EIOA 2H01A 5F8BA 1K0NA 3F4RA 1TRVA 2PWJA 4ZIJA 4MF5A 3TKPA 5ECKB 4HU7A 4HZ4A 5KN3A 4NPBA 3DXBA 3ZLPA 5ID2B 4JE1A 4XRAA 2KUCA 5JCUA 5DDLA 3FRCA 2PVQA 1QFNA 3CMIA 2KLXA 1W4VA 5IMDA 3F63A 5C00A 4EL1A 3TB2A 4I97A 4DEJA 3KGKA 1O8XA 3PINA 1TOFA 3A2WA 1M2AA 2H1AA 3DD3A 4QQ7A 4L5OA 3LXTA 4DVCA 4QL7A 3ZREA 1SJ6A 1YEPA 4CHSA 5DALB 1Z7PA 1THOA 1XIYA 1G6WA 2GSQA 3KH7A 1RW1A 4H86A 2J23A 3VK9A 1TU8A 3DEXA 2IFQA 4BL7A 3VPTA 5ECPB 2LJRA 2FLSA 5ECRB 2VLVA 1WE0A 1SL1B 2VCTA 1YY7A 1E2YA 14GSA 3CRTA 1GUKA 1CQHA 3P2AA 2FA8A 1O85A 1TW9A 4MZWA 3FR3A 3MDKA 4OWYA 3GKXA 3IK7A 4XS6A 3VURA 3GTUA 1F3AA 1U88A 3N9JA 4K7NA 3IRAA 2K8VA 4G19A 3ZIJA 5LCZA 12GSA 4HJMA 2QSIA 1PL1A 4TR1B 3FZ4A 5DJMA 2NVLA 4YQVA 1J08A 3LEFA 3HYPA 2DC5A 4XS1A 1PQNA 3A5WA 1UVZA 2ZCTA 1BG5A 3IHQA 2HT9A 1M99A 1PX7A 2L57A 5J9CA 5AISA 3FHKA 2IJYA 2H70A 3ED3A 3WD6A 1VRSD 3GL3A 1M2BA 1UA5A 1ZCPA 5D9TA 4I5QA 3HVSA 4HZ2A 1PD21 1AW9A 1DE2A 2B5XA 3EWLA 1F3BA 4GRFA 3RDWA 4GXZA 1F6MC 4TW5A 3DRNA 1XVQA 1YF1A 3ZTLA 1A23A 5JWQB 4POLA 4NV2A 3EE2A 3KEBA 5HFIA 4MH3A 3EYTA 2VUPA 2XHFA 3TCOA 4J57E 1OC8A 4PUFC 3F4TA 1SD8A 2WZ9A 5H5SA 5INYA 3ZYWA 1BX9A 2V41A 3LYKA 1X9WB 3Q19A 2YPMA 3ZL5A 3EURA 4MH2A 4XIHA 2H6XA 2V6KA 1SYRA 1GTUA 2HI7A 4V1Ag 5HFGA 2YJ7A 4YAPA 1NM3A 2CVKA 1GUMA 2TRXA 4KUNA 4IJIA 2CT6A 4ILFA 2DLXA 2LTKA 2PU9C 1WMJA 4ML6A 4YQUA 3KP9A 5KN1A 1SJIA 3KP8A 3VWWA 5GAND 5IIZA 2F8FA 1F9MA 4ACSA 2PVOC 5J4UA 3W8SA 4BVYA 1FAAA 4YAVA 2PGTA 2MBSA 1TP9A 1R7HA 3UIWA 2B3SA 4XHMA 1K3LA 4OFNA 4GTUA 1DSBA 4ZL8A 1AAZA 2YWIA 3QFBC 3FR9A 4LA1A 2B1KA 1MD4A 2FWHA 5G2ZA 2YOIA 2GZYA 4L8EA 1FW1A 4K0NA 2H76A 4ZB6A 4V2NA 13GSA 2WFCA 4KH7A 5D8IA 3TJKA 1MEKA 4EF0A 1GUHA 2VM1A 5A4VA 1TK5B 4IVFA 2I9HA 2CX4A 3IV4A 3DGQA 4POBA 1G7OA 3H93A 3KH9A 3BCKA 5CNWA 2GSTA 2C0GA 1B9XC 1NW2A 3GV1A 1V9WA 2JZTA 3HDCA 1YZXA 2REMA 4YH2A 2D2ZA 4L5LA 1Z9HA 2LNSA 3DYRA 4PNGA 1F2EA 1X5EA 2GQLA 4K8MA 4WEYA 3N5OA 5IO2A 2HRFA 3ZITA 2H0IA 2I4AA 1ON4A 3FZ9A 3QMXA 4KNDA 1YQ1A 4K1FA 5HQPA 3FZ5A 5ENUA 3TDGA 5DQSA 3TOTA 1U6TA 3I43A 2KHPA 4N0VA 4I8BA 1A2JA 3LG6A 1U3IA 2FGXA 4POMA 1EEJA 1YKCA 4TR3A 4NHZA 3E3EA 3O3TA 4F0CA 1WWJA 4BWQA 3KD0A 2H0HA 1SD9A 3GKMA 3TJFA 3AY8A 3Q18A 4KCAA 2FWFA 4J2FA 3EU3A 5LD0A 3LWAA 4ECJA 5D9WA 1N2AA 4WETA 1BAYA 22GSA 2YWNA 4EDYA 1HNAA 1GH2A 2G2QA 1Z7RA 5E59A 2DJ3A 3U6VA 3HY2A 3TKSE 3WGDA 3GMFA 3SWLA 1MDIA 5B8AA 2PMTA 2WCIA 1OE8A 4HU9A 3W8JA 4K2DA 2G0FA 2WJUA 3GSTA 4MPGA 1FOVA 4G10A 4K0GA 3GYKA 4TR4A 3UVHA 1GSEA 2RLIA 4JRRA 2HZFA 2L6DA 4ZXGA 3MAKA 8GSSA 4NAXA 2VCVA 4CDOA 4FIWA 3VLNA 2JACA 5ID2A 3KXOA 4GCIA 5ECIB 3M9JA 3K8NA 4I6XA 4GWRA 2GVPA 4AJ8A 2YV9A 4MMMA 4KDYA 4PQHA 1USBA 5H5RA 4IW9A 2IMDA 3FZAA 3BD2A 1FHEA 4KA0A 5AN1A 2MMOA 4TKYA 5IPGA 2R5GA 2HZEA 16GSA 5H5QA 5CRDA 5DALA 1OC9B 2WGRA 5C04A 2C3TA 1EOGA 3GA4A 4PQ1A 4TXVA 4PNFA 1PKWA 3CRUA 5B6NA 2AV4A 2L59A 3H4KA 4X43A 6GSWA 3ZFLA 3QFAC 2NBSA 4L0WA 1DE1A 4MF7A 4RI6A 2HNLA 3QAWA 3HJPA 1THXA 5D96A 2V6OA 3FY7A 1K0CA 4OO5A 4G2EA 1RQMA 5CP1A 3D0ZA 3WYWA 1A2MA 1AUCA 4TR1A 1SU9A 2AHEA 3D5JA 3VFIA 1SL0B 4XS4B 2PERA 4DSSB 1JFUA 3ZZXA 4KSOA 5J3RA 2XBIA 2H19A 3WGEA 5KEJA 1SK0A 3TUEA 3APOA 4KE3A 3APQA 4POKA 3BBYA 4N30A 1QQ2A 4PXOA 4EO3A 3DKSA 2B5EA 2FA4A 4BPYA 1X5CA 2GGTA 3TKSA 5ELAA 5EY6A 3ZVJD 3W6GA 2E0QA 3IR4A 2O85A 2AYTA 1WP0A 2VO4A 5DVBA 2LSTA 4TVEA 3L9SA 7GSSA 2H8LA 3C73A 4KSMA 3IC4A 5GAPD 2HZEB 1EEMA 2H66A 2ON5A 3VWVA 4P3YB 4IBPA 3CSJA 1M2DA 1TK8B 4TXOB 1K3OA 2JZSA 5HR1A 4XRDA 1VF1A 1K0BA 2RUEA 3TRQA 3UL3A 1GRXA 3IOSA 1S3DA 1XVWA 5ECLB 5DAKB 5CRWA 4GSSA 4IHUA 3M1GA 4KW6A 1VF2A 6GSSA 2E2GA 4KX4A 2YANA 3J7Yb 3DVWA 4MLYA 2P5QA 5ECHB 3DMLA 3ME7A 1Z6MA 2R37A 3GIXA 1ZOFA 1T7PB 3EMPA 2K18A 2VOCA 4HQSA 2C0FA 1XZOA 3A2VA 1WIKA 1SL2B 1PSQA 2VLTA 4F82A 2M80A 1FG4A 1T00A 3GKNA 4MZCA 1FO5A 1FB0A 4MK3A 3GNJA 1XWCA 2H75A 5KN0A 3D21A 3ME8A 2B7KA 3IE3A 1OC3A 2KP2A 3F3RA 1I9DA 4AGSA 1Y6EA 2GZZA 3QDNA 2C8UA 1LBKA 2GT5A 2KP1A 1V40A 1EGOA 3I9V2 2HSYA 1GL8A 3CTFA 2I1UA 2N5FA 1NSWA 4PQIA 1M0UA 1ERUA 2C3NA 1Z3EA 1HD2A 3VI5A 3QOUA 3VWXA 3ZMLA 2QKEA 3UBLA 1GSDA 1JLVA 2C80A 4YQMA 4EKZA 1TK0B 1BEDA 2H1DA 2JL4A 1TI1A 1GTAA 2OKAA 2IN3A 5G5EA 4IJ3A 2H72A 3MNGA 18GSA 3IXRA 4BWSA 3TOUA 1YEXA 3RPPA 1VGLA 5IMZA 2BTOT 3GH9A 2ES7A 1XPVA 2BJXA 2DMLA 3I6AA 2HLSA 3HJOA 3G7JA 3GURA 19GSA 1QXHA 1S3AA 2QGVA 1KNGA 2R2JA 3KJYA 4MZBA 4MF6A 4O32A 2DIYA 2EC4A 2H30A 5COHA 2L4QA 3EC3A 5F05A 2C0DA 3TGZA 5EVOA 2ALBA 5B6MA 2L6CA 4NXIA 3LSZA 2I3YA 4IS0A 2FUG2 5HR3A 1QUWA 1JLWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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