4BPYA

Crystal structure of the c90a mutant of the sco copper chaperone protein from streptomyces lividans
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
175
structure length
162
Chain Sequence
QAATVLDKPFEKPDLVLTDTQGKKYDLREQTAGKPTLIYFGYTHPDVAPLTMNNIAVAKKQLSQAEQDKLRVVFVSTDPERDTPAALGKWLKGIDPQIVGLTGEFDTIQAGARTLGISIDPPGTQVVAFSPKSDAGYVLYGEDATVDDYTKDLPKLIKGENP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Mechanistic Insights Into an Extracytoplasmic Copper Trafficking Pathway in Streptomyces Lividans.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Streptomyces lividans
total genus 48
structure length 162
sequence length 175
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4bpyA00
1PSQA 2N5BA 3HVXA 2RM6A 2K18A 1XWKA 2JZTA 4KX4A 5GAND 1GUHA 2C3TA 1O8XA 3DKSA 3L9VA 2I9HA 2DSAA 3HKRA 2D2ZA 2CVDA 1EOHA 2XPDA 5KN1A 4I97A 3F4TA 2VAFA 5E59A 4JEDA 4QQ7A 1USBA 3TJGA 1XWCA 2XPEA 1XZOA 1SU9A 3EURA 3K8NA 1A2JA 4MJAA 2H01A 1R7HA 3LG6A 3LXZA 4TR0A 2VCVA 3H1NA 1B4PA 5ELGA 3I43A 2GT5A 2B6MA 3UBKA 1U6TA 5G31A 2V1MA 4O7HA 4XS1A 2YZUA 4NHZA 4JZQA 4HI7A 2VLVA 3ZREA 5IMVA 3HYPA 1WPIA 1SL2B 1FO5A 1YF1A 3VI5A 4NV5A 4HEA2 3LORA 3TJBA 1BEDA 2IN3A 2WJUA 2LV3A 1BG5A 3LJRA 1BAYA 4AJ7A 1JZOA 1AW9A 3CRTA 1PL1A 3C73A 3EWLA 4IQ1A 3WGXA 4XCSA 1IYIA 3RPNA 2X64A 2B1LA 4HDEA 1SKSB 4OO4A 5B8BA 4J56E 5D9VA 2B3SA 1NW2A 1S3CA 2O87A 4KCEA 4ZBDA 1X9MB 1M0UA 2CAIA 3ZMKA 5AIVA 2LKUA 4KNDA 1JLVA 2VLTA 1GSEA 3EINA 4KDYA 1E6BA 3ERWA 1WWJA 3ZZXA 1EV4A 1J08A 3ZMLA 3VWUA 2H0IA 2X8GA 3E0UA 5CP1A 5IQYA 1JZRA 2TRXA 3TRQA 6GSSA 1GUMA 1TW9A 3TCOA 3Q6OA 2X8CA 4TXOA 1YZXA 2WDUA 2OA7A 3H93A 4KSOA 5DJLA 3VWXA 1K0CA 1TKDB 1KNGA 2HLSA 5A4WA 3Q18A 1U87A 2M46A 2N5FA 1Y25A 2LNTA 2HT9A 1Y6EA 3IBHA 1EV9A 2HE3A 2R5GA 3H4KA 5COHA 3VURA 2L59A 2GZPA 2YWIA 1PD21 4DVCA 1M2BA 2YV9A 4RQXA 4ZILA 3NZNA 4IVFA 2LRNA 2O8VB 5LCZA 5ABRA 1EEJA 1MEKA 2GSRA 3IXRA 2GSQA 4G19A 3J7Yb 1ERTA 2IMEA 5DQSA 1SJ6A 1X5CA 2GQKA 5ECOB 3GFKA 4WR4A 1V57A 1JFUA 20GSA 1BJXA 2VOCA 2V41A 4XS4B 12GSA 4Q5RA 4ZL8A 1AQWA 4PXOA 2EIRA 1EP7A 1TK5B 4ZXGA 2P0GA 3FW2A 4FYCA 5AN1A 1JZWA 1XVQA 4JE1A 1WP0A 4LLRA 2R4VA 3F8UA 2L4QA 1GRXA 4MABA 3IK7A 4WBRD 3OR5A 4NWYA 1DE1A 2DC5A 5IMAA 4KH7A 3C1SA 4IP1A 3CMIA 5CREA 1G6WA 2FNOA 5F06A 4N10A 3L78A 1TP9A 4JBBA 2HZEA 5D93A 2PN8A 3GV1A 3J7Yk 1ST9A 4WF5A 2E0QA 3ZITA 2JZRA 1MD4A 1TDIA 4HU7A 3HZ8A 3HJMA 2IJYA 2R3XA 2PVQA 2H74A 3GYKA 3VWVA 5FHIA 1G0TA 2HFDA 3UVHA 2TRCP 1O85A 3QOUA 2YWNA 1RK4A 2OBIA 5DQYA 1DBYA 1B9YC 2B5EA 3F3QA 1XWAA 3D22A 4J57E 1SL1B 2OADA 4XHMA 1NHYA 5DCGA 3KGKA 1DSBA 2CZ2A 3P2AA 4FH8A 3PGTA 13GSA 2C0DA 3TJJA 4RUVA 4ZBBA 3M8NA 3IPZA 2KOKA 19GSA 3EMXA 5H5QA 2VCQA 3QFBC 1V9WA 3MNGA 3GRXA 2VCZA 5JCGA 3L9SA 2B1KA 2DBCA 2DMMA 2GSTA 4TXVA 3EVIA 3QR6A 1K0DA 1XWGA 1VGLA 3QCPA 3LGCA 3TB2A 4G2EA 4MF7A 3M9JA 2PERA 4IJIA 1M99A 2RIIA 3FKFA 4F03A 5CRDA 4ECBA 1HNAA 1VF4A 1FAAA 4POLA 2DJ2A 3CSIA 4K6XA 4N11A 1U88A 4EC0A 2LQQA 4WETA 3IV4A 1DE2A 4RI6A 5ECHB 4MMMA 1ZZYA 2DIZA 1HD2A 3TKSE 3PH9A 1HYUA 4NMUA 4QL7A 2F8AA 4DSSA 3GMFA 1XW9A 2FUG2 4MPGA 1IYHA 3IE3A 5IO0A 5CRGA 3WT2A 4XTSA 1HQOA 2QGVA 2H6ZA 2G2QA 3KXOA 2L6DA 3GKNA 2G0FA 3Q74A 4HQSA 4CHSA 2PUKC 3O6TA 4TW5A 1GNEA 3ZYWA 4KGIA 6GSUA 3NIVA 4I5QA 1YJ6A 4IN0A 1S3DA 2IMIA 3HVVA 3U5RE 3UIWA 3FR9A 3ISOA 1TOFA 3KTBA 1J9BA 1Z3EA 1F3AA 5A4UA 3EC3A 1XWBA 1FG4A 2C3NA 5J3RA 1I9DA 4YAVA 4JU5A 3KIJA 5KN2A 4MH3A 4TRXA 1T1VA 3DIEA 4ULXA 3CBUA 4ZL7A 2H75A 3APQA 1C72A 4IJ3A 3LFLA 1YEPA 2H71A 4BVXA 4O32A 1V40A 1QFNA 3GL5A 4GSTA 2FWGA 2CVBA 2ON7A 1CQHA 4POBA 4O92A 3APSA 4L5LA 5DCHA 3LXTA 4F0CA 2GQLA 2L57A 2KP2A 4PNGA 2I4AA 1F37A 2H8LA 2MMAA 5GSTA 6GSVA 1I5GA 3FY7A 2R37A 2VCTA 5LNKe 2CT6A 4F0BA 1M2AA 2P31A 3QD9A 1ZYEA 4V1Ap 1LU4A 5AIXA 4WF4A 4BWSA 2B5XA 2EC4A 4XS6A 5DALB 1AC1A 3SBCA 1V2AA 1XW5A 2WGRA 5D9XA 4TXOB 1PQNA 5GAPD 1XVWA 2C0EA 2IWTA 4V2LA 1SK1A 3Q19A 3ZLPA 3BBYA 1RQMA 4L0UA 3ZIJA 4I2TA 3A5WA 4E8HA 1LBKA 2AB6A 3TGZA 2EIOA 1ERUA 4HOJA 4LMWA 2FHEA 1NHOA 5ECNB 3A2VA 2PVOC 4GLTA 5INYA 1F9MA 3FZAA 3TJFA 2KLXA 1K3LA 2MMNA 1OKTA 2E7PA 5ID2B 4F9ZA 2I1UA 1AXDA 1ILOA 3I6AA 3F9UA 2M80A 2A4VA 2BMXA 3GSTA 5HR1A 3ZVJD 5DDLA 1GWCA 3FEUA 1MDJA 3IR4A 1XXUA 3FR6A 5HR3A 2F3MA 3GH9A 5IMCA 4MPFA 4KCAA 2L4CA 4I6XA 1OC9A 1SJZA 1FVKA 2HZEB 4WEYA 4NAXA 1B8XA 3FZ5A 1GSDA 2CZ3A 3G7JA 2MBSA 1ON4A 2RM5A 2GT6A 3UAPA 3UJ1A 1GL8A 1JZDA 1WIKA 1PX6A 1QUWA 3I69A 1EGRA 1TJDA 3IDVA 3IHQA 4K7NA 1OE7A 4PX1A 1Q98A 1WE0A 2EIQA 2AJQB 4ILFA 2GGTA 1WRYA 1Z5YE 4G10A 5B8AA 2C8UA 3DYRA 4XRDA 1TXXA 2YV7A 4MA9A 2IMDA 3SWLA 2FLSA 4X43A 5JCUA 2YJHA 5F07A 1PGTA 4WXTA 1O6JA 1WOUA 1GLQA 1GH2A 1K0BA 5C00A 3WGDA 1VRSD 5FWGA 2PWJA 3QAGA 4ML6A 2E2MA 3KZQA 4BA7A 3KJYA 2N5AA 5C04A 4N0VA 1O73A 4XRAA 2LJRA 2IFQB 1SD8A 3GA4A 4V1Ag 4OFNA 3P90A 3EE2A 2DJ1A 2X99A 1GUKA 1Q4JA 17GSA 2DLXA 4Q5FA 3WYWA 1THOA 5J9BA 1MDKA 1Z9HA 3TDGA 3GKXA 2VL3A 1FHEA 1XCCA 5KEJA 2JADA 4AGSA 4IELA 2DJ3A 4D73A 3TRPA 1YDKA 3TOUA 1AQVA 2CX4A 1N2AA 11GSA 1ZGNA 1K3YA 4HUAA 1GSQA 3GHAA 1V58A 2HNLA 1TRWA 5H5SA 5JWRB 4RQRA 2XBQA 2YZHA 1KBNA 4IBPA 5HFGA 1XPVA 3HHVA 1QK8A 1TI3A 3HJOA 4WKWA 2H6YA 2FCHA 1XIYA 6GSXA 1DUGA 1OE8A 2KUCA 4GWRA 1PKWA 1AIUA 3HVSA 3BJ5A 3NOFA 1GNWA 3DVWA 2AV4A 5E4WA 2MBTA 3QAVA 4ZB8A 4H86A 3BCIA 3V1WA 3EMPA 4PNFA 5IPHA 3FHKA 2QKEA 4OD7A 1GP1A 2HRFA 1M7TA 4EE0A 2O7KA 4NHWA 4CW9A 4TR1B 2GVPA 1EZKA 3LQ7A 4TN8A 1B4QA 2WB9A 1ZOFA 1EP8A 3FRCA 4MLYA 4MZWA 2GTUA 1A8YA 3A2XA 5DBQA 3JCML 4BVYA 2FA4A 2OBKA 2Z9SA 3QPMA 4K7IA 6GSTA 3CSJA 2VM1A 2AYTA 1A0RP 4LL1B 4MJEA 4AJ6A 2ZUPA 5J5NA 2AHEA 1GULA 4ZBAA 3TJKA 4HU9A 1XOBA 1X5EA 2L6CA 4GQFA 3AY8A 5CRHA 4RI7A 3D5JA 4F2IA 1GTAA 1A2MA 2H6XA 4PURA 4PGTA 4ZB9A 1SYRA 3VPQA 1YF0A 2HRNA 1MTCA 4Z7XA 1M2DA 2V2GA 2NBSA 2LQOA 2IMFA 3D4MA 1R5AA 5G1LA 3GX8A 2YJ7A 2VCWA 5FT3A 3MWHA 2M72A 1ML6A 5CYYA 3GTUA 1BQ7A 5G5FA 1V98A 1ZL9A 4BWQA 2V6OA 2H1BA 3ZRDA 1TRUA 3UOMA 2CAQA 4K0NA 5CNWA 2VD0A 4YAPA 4PUFC 4MCUA 2H1GA 3WD6A 3H79A 1GSYA 4NPBA 4O5RA 2LSTA 1OVNA 4OFTA 1FW1A 2YWOA 1ZYQB 3ZIVA 4HZ4A 2AAWA 2JU5A 4P3YB 3VPTA 1CQGA 5G2ZA 2A2RA 1K0OA 1YKAA 2DJ0A 2PMTA 1UN2A 1ERWA 5ECIB 5J9CA 1TTZA 3EU3A 1TK0B 3W8SA 4PQIA 2C0GA 4MK3A 4YQVA 3M9KA 4OCEA 1EOGA 4KSMA 4KUNA 2FY6A 4OFMA 1TU8A 2XHFA 1A2LA 3WGEA 1LJRA 2H0HA 2K8SA 2BTOT 2C80A 5IMDA 5ECKB 4EKZA 4XIHA 2RUFA 4AF2A 2DJKA 2REMA 3BD2A 1OC9B 5EL8A 4XS4A 2ALBA 3BOAA 1UC7A 3CYNA 5F8BA 1SD9A 3KM6A 4ZB6A 3TKQA 3TKSC 1GTIA 3ZTLA 3LWAA 1M9AA 4MZBA 2JL4A 4I2UA 5KN3A 1BYEA 2B5YA 3HDCA 2OKAA 3UVTA 2OJLA 5IPGA 1ERVA 3VFIA 2DIYA 2PBJA 1U3AA 4OO5A 2GZYA 3KTLA 2VIMA 4YQUA 1FOVA 5CAXA 4LL4B 3LYKA 4BL7A 2GLRA 3TOTA 4ACSA 2YCDA 3P7XA 2ES7A 3EYTA 3W6GA 2FWFA 3ZVJA 5D9TA 3O76A 2MMZA 2QC7A 4TOPA 2H1AA 3IAM2 2JSYA 4FIWA 3LEFA 4GF0A 4IP6A 3TUEA 3LYPA 1R5PA 3UMAA 3U6VA 1TU7A 4HJMA 1SL0B 2YPMA 5HQPA 1NM3A 2ZNMA 3FYGA 1ABAA 5G1KA 3R2QA 4ZL9A 5JCWA 1KTEA 3VI7A 3HZ4A 2R2JA 2V6KA 5ECRB 4K7OA 4PQHA 1FVJA 4MP4A 4GRFA 2OE3A 2P5QA 2AUVA 3QMXA 5ECLB 5F0GA 4MJBA 2B7KA 1YQ1A 2H72A 2MYGA 4F82A 1KEBA 3KEBA 1F6MC 3L0HA 3G9BA 2H70A 1T4ZA 3C7MA 2C1YA 3DVXA 4MZCA 4K9ZA 4KDUA 3FZ9A 3DWVA 2ON5A 1T7PB 2X8HA 4KW6A 2FA8A 1A0FA 1PL2A 3RHBA 1G6YA 2I81A 1GSFA 5AGYA 3KP9A 3IRAA 4IW9A 3KH7A 5ECMB 2GS3A 2VO4A 4TR3A 1S3AA 4FO5A 3G7IA 3US3A 1B9XC 4EO3A 6GSYA 1N8JA 1SENA 3F6DA 2H76A 2VCXA 1OAZA 2P5RA 3L9UA 2MMOA 4CDOA 2CVKA 2GSSA 2WCIA 4GQCA 2WFCA 3KH9A 5HFIA 3DEXA 4YQMA 4X1UA 1WMJA 1PA3A 3ERFA 2H1DA 2WS2A 1ZMAA 3GX0A 2H73A 2YOIA 2YANA 5F05A 1AAZA 1T3BA 3ERGA 3GSSA 2KHPA 3GKKA 2JZSA 1SK0A 3GIXA 4L0WA 4YH2A 4IHUA 2MZCA 4IGJA 3GL3A 4E8EA 2HI7A 5EVOA 2YNXA 2E2GA 3FK8A 3IA1A 1X9WB 1QMVA 5G5EA 1QXHA 2H0GA 5D96A 3IOSA 3GUSA 3F63A 4EVMA 2PPTA 4JRRA 2FWEA 3RPPA 10GSA 3P8WA 1J0FA 4OMVA 5JWQB 1TRVA 3MAKA 1Z7PA 2H30A 3QDNA 2IMKA 3APOA 1YEXA 5B6NA 3N9JA 3F4RA 4GSNA 1VF3A 2JSZA 4JR6A 1GTUA 1Z7RA 3GTUB 5J41A 4X0XA 4WBJA 1NSWA 5DAKA 1PX7A 2WULA 2C4JA 3VWWA 1VF1A 1OC3A 1JLWA 4MJCA 3E3EA 5IMFA 4HQZA 4LMVA 2IL3A 4V2NA 3CXGA 3RBTA 5DALA 4K1FA 2CQ9A 3UEMA 2NTOA 18GSA 4L8EA 1K0AA 3RDWA 7GSSA 2J23A 1SKRB 2DMLA 3HCZA 3PR8A 3GN3A 4KE3A 3F6FA 2VD1A 3IK9A 3KCMA 4GCIA 1UVZA 2VL9A 2CX3A 4HS1A 2A2SA 5ECPB 4DSSB 2C3QA 3BCKA 3G7YA 4K0GA 5B6MA 3TRXA 1B48A 1M9BA 3GNJA 3D0ZA 3HXSA 5EPFA 1JHBA 22GSA 4TKYA 4GTUA 4MDCA 2BJXA 1O7UA 4PQ1A 5B7CA 2LRCA 4LA1A 1XOAA 3TKSA 3D21A 2LEGA 4N30A 2VLUA 4TVEA 5ID2A 2TIRA 2HXKA 5ECSA 1GLPA 1VF2A 4EUYA 2HSHA 2HZFA 3H8QA 4Q5NA 2XC2A 2FWHA 1AQXA 3ZL5A 4N0ZA 2VUPA 2NVLA 3LSZA 2IIYA 2LTKA 3A3TA 1K0MA 1X5DA 3S9FA 1Z6NA 2VL2C 3WT1A 1Z6MA 1SK2A 2FD3A 2LRTA 4QL9A 5L71A 1HNCA 3W8JA 1URMA 3D6IA 3O3TA 3RHCA 1SKWB 2WZ9A 3N5OA 4MH2A 5IOWA 1EGOA 2F8FA 3L4NA 1X9SB 3M3MA 4FYUA 3CSHA 5IOXA 2H19A 1EEMA 1XW6A 2RUEA 5A5KA 4NV2A 1FB6A 1OC8A 4GSSA 2L5OA 1F3BA 5LD0A 3MSZA 2I3YA 4ECCA 1A24A 5HR2A 2CA8A 1G7OA 4ECJA 5J4UA 4JR4A 3VK9A 1R26A 3EU4A 3HY2A 2CV4A 6GSWA 3KD0A 2K8VA 4PUAA 5GSSA 1K3OA 4MF5A 5D9WA 1GSSA 1PKZA 1RW1A 3M0FA 4KAEA 2R6KA 2IPAA 1U3IA 3ME7A 4ID0A 5JWOB 3MDKA 4EXJA 2FGXA 3C1RA 3DGQA 1FB0A 1H75A 1MD3A 2YP6A 4ISDA 4L5OA 1A23A 1T8EB 1TK8B 1GTBA 2QSIA 1BX9A 4POKA 5DVBA 2IFQA 5KN0A 5IIZA 1E2YA 2J9HA 2PU9C 1OYJA 3CRUA 3RAZA 1SJIA 2NPBA 3F0IA 1THXA 1GSUA 5G30A 3CTFA 3I9V2 1T00A 4HJ2A 4DEJA 2JACA 1MDIA 3QFAC 4EDZA 1TI1A 3F4SA 1XFLA 4WR5A 5HFKA 3VLNA 1A8LA 16GSA 3DD3A 2LUSA 4TR4A 3KP8A 3M1GA 3ZFBA 3ZFLA 4MF6A 2VM2A 2DJJA 3ME8A 3GH6A 1YY7A 3FZ4A 4KA0A 1ZCPA 4ML1A 1R4WA 4V2MA 2OE1A 2F51A 2XBIA 4EL1A 8GSSA 4G9HA 3KMOA 3IC4A 4AJ8A 1G7EA 2ZCTA 2OE0A 1OKDA 2GDRA 2B7JA 1XBSA 4J2FA 5IMZA 4KB3A 2O89A 2LJKA 2HYXA 2RLIA 4TR1A 2GZZA 3IAS2 1H4OA 3TKRA 3GKMA 1TRSA 1W4VA 3TKPA 3C71A 2H66A 4Q5QA 2LNSA 4K8MA 4EDYA 14GSA 1EWXA 2F9SA 4FYBA 2OACA 1UA5A 4ZIJA 5GZZB 4BPYA 4IKHA 1PMTA 2HSYA 5ECQB 5EY6A 3E9JB 4K2DA 1PRXA 5ENUA 5A4VA 2YN1A 1PN9A 3GURA 2K9FA 4HZ2A 1QGVA 4ECIA 2KP1A 3ED3A 3FR3A 3HJPA 2LJAA 4EF0A 1QQ2A 3D4TA 5DJMA 3QAWA 1HNBA 5CO3A 1K0NA 1AUCA 4NXIA 5D8IA 3A2WA 5DAKB 3HD5A 1WJKA 3UARA 3F3RA 5H5RA 2C0FA 2V32A 3C8EA 1YKCA 3UL3A 3DXBA 2LS5A 2NDOA 3PINA 1T4YA 2K6VA 1W89A 4OWYA 3DRNA 4KDXA 1F2EA 2WRTA 2GQMA 4D73B 5IO2A 3HA9A 3KMNA 2L5LA 3CTGA 4DSRA 5HR0A 4IQAA 2YWMA 5D73A 4DSQA 5CRWA 2O85A 3UBLA 2PGTA 1X0RA 4POMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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