4D73B

X-ray structure of a peroxiredoxin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
175
structure length
170
Chain Sequence
DLIPNVKVMIDVRNMNNISDTDGSPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-CYS PEROXIREDOXIN
total genus 57
structure length 170
sequence length 175
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4d73B00
2FD3A 2K9FA 3GKKA 1YKAA 2FWHA 2AYTA 2GQMA 2M46A 1ACVA 1R5AA 2ON5A 1OE8A 2H70A 1XOAA 3HXSA 1YZXA 4HUAA 3MDKA 1O6JA 4ZILA 3TKSE 1KBNA 1NSWA 5JWQB 1FOVA 4JE1A 2B5YA 2YV7A 3HDCA 1A2JA 1VF2A 4MH2A 4XS4B 5CRGA 4IBPA 3HZ4A 3UIWA 3FZ4A 4TXVA 5DVBA 1G6WA 3F3QA 1H75A 4DEJA 2G2QA 4KDUA 2KHPA 2B3SA 4KAEA 3I43A 5JWRB 3A2VA 3NIVA 1XBSA 1SL2B 1G6YA 1WWJA 2VL3A 1JFUA 3MNGA 3FZ5A 3D21A 3A5WA 3GIXA 4K8MA 2ZUPA 2YWOA 1V57A 1M2AA 3KGKA 4JZQA 1AIUA 2KUCA 1XWGA 2MMAA 2GSSA 2RIIA 4MP4A 3RHCA 1DE2A 1F3BA 1EEMA 4HU9A 4L5OA 3RHBA 3TJJA 5HFIA 4OMVA 1GWCA 3N5OA 3W8JA 14GSA 3HY2A 3D0ZA 4N0ZA 2LUSA 2O7KA 5G5EA 3UL3A 2A4VA 4PQHA 3QAGA 3DXBA 2OACA 1V58A 1O85A 2BMXA 1DE1A 4FYCA 4KDXA 3ZFBA 2PGTA 2OBKA 1OC3A 2KP2A 2H1BA 4YH2A 2F8AA 1SKRB 4WETA 1A0RP 3IPZA 4HQSA 4G2EA 1EP8A 1M0UA 3O6TA 1A23A 1T7PB 1SK1A 1AQWA 4IJ3A 1UC7A 4WEYA 1TRSA 4ISDA 2EIQA 5JCUA 2LKUA 5A4VA 1K0NA 2L5LA 2ON7A 1CQGA 1XVWA 2LJAA 4MA9A 1BEDA 1Z7PA 4X43A 3ZVJA 2PN8A 4ZIJA 1K0BA 1QQ2A 2CX4A 2RM5A 2AV4A 3Q74A 5GSTA 1ILOA 2ZNMA 5B7CA 2P0GA 3CMIA 3Q6OA 1AC1A 6GSVA 4TOPA 2HLSA 2TIRA 1VGLA 2B6MA 4NMUA 6GSYA 4DSRA 5DBQA 2GSTA 4L0UA 4HI7A 4QQ7A 1XCCA 4NXIA 4O7HA 2YN1A 4TR0A 3WGDA 1GTBA 1Z5YE 1XWCA 5GZZB 4O92A 1AQVA 3HVVA 4XRAA 3K8NA 2RUFA 3F4SA 5F05A 3RPPA 1DUGA 2VCZA 1Y6EA 7GSSA 3CTFA 3KM6A 3L9VA 4TRXA 2LRTA 2MMZA 4Q5NA 4PNGA 2M72A 4MPGA 2NTOA 4ZB6A 2VCTA 3EU3A 2QSIA 2R37A 3IC4A 5G1KA 4ZXGA 1GSFA 3VPQA 2FUG2 1TJDA 1XVQA 1HQOA 4K7NA 3WT1A 1G7EA 1ZOFA 4FYBA 2MBTA 4I5QA 2A2SA 2GSQA 4D73A 2AAWA 4RI6A 4HS1A 3VK9A 2C0GA 1WE0A 4AJ6A 1SJZA 1YDKA 2FGXA 3L78A 3ME8A 3UOMA 2V6KA 2JL4A 4BWSA 1PSQA 5IM9A 1VF4A 2V32A 4HEA2 2F8FA 4Z7XA 1OVNA 2QGVA 3BD2A 1PL2A 2C1YA 2L4CA 3IAM2 3A2WA 2AB6A 3IE3A 4EXJA 3TUEA 2E2GA 2IFQB 5G30A 1I9DA 3I9V2 4YAVA 6GSSA 3BBYA 1HD2A 5IIZA 1ERUA 3KH7A 1OYJA 2V41A 2QC7A 5DDLA 3APSA 3FW2A 4TVEA 5F8BA 1M2DA 3LEFA 5HFGA 2C4JA 3FEUA 5JCGA 2N5AA 1GTUA 2C0FA 2IFQA 3KXOA 1BJXA 2C0EA 3IK7A 1XW9A 3H8QA 4MABA 3S9FA 1B4PA 4WR5A 3Q18A 1GUMA 2ZCTA 1NW2A 1FG4A 2YWIA 3FR9A 1Z6MA 3M8NA 4KSMA 3ME7A 1GSSA 3HHVA 2X8CA 2VCVA 3ERWA 3L0HA 1MDIA 4KNDA 3ZZXA 4OD7A 4EO3A 3QD9A 1K0DA 1OC9B 3EYTA 2X8GA 2GZZA 4V2MA 1M2BA 5JCWA 2JACA 4RUVA 1HNCA 2DJ3A 3ZL5A 3KP9A 4ZBDA 4OCFA 5J4UA 4MF7A 4BL7A 5C00A 4TW5A 5DQYA 2H19A 4PX1A 5KN1A 2IPAA 2NDOA 3UMAA 1EZKA 3IA1A 4ILFA 2RUEA 3KIJA 3VWVA 3WT2A 3ZREA 4OFMA 3DVWA 5B8BA 5ECMB 2CAQA 5KEJA 1U6TA 2B1LA 3ERFA 4CHSA 2ES7A 1X5EA 2VD0A 1AQXA 5D93A 4TKYA 5G31A 4XRDA 4QL9A 3FKFA 4ML6A 4GRFA 1AW9A 1ERTA 1GUHA 2M80A 3ZVJD 3AY8A 2X99A 3CRTA 2YOIA 1USBA 5IMVA 3D5JA 3TGZA 2ALBA 2FY6A 4AJ8A 3VI5A 4YAPA 3LXTA 2C8UA 3F9UA 4KA0A 2JU5A 1V2AA 1LU4A 2LEGA 3KTBA 2R5GA 3TKPA 1WJKA 2VCWA 3E0UA 1QMVA 5D96A 1M9BA 4X1UA 5CNWA 4KDYA 1A8YA 2QKEA 4JR4A 5G5FA 5LCZA 2C3QA 3C1SA 3IRAA 2WB9A 4Q5FA 1GL8A 2YJ7A 1ML6A 2JSZA 3WGXA 4ECCA 1GP1A 1EGRA 5DALA 5J5NA 1THOA 5J3RA 4MZWA 2NVLA 1W4VA 4L0WA 1K0AA 1WPIA 4DSSB 5ENUA 2B5EA 2HYXA 4V2NA 1Q4JA 2LV3A 1T1VA 1OE7A 1THXA 3GHAA 1XPVA 1NHYA 4EC0A 5KN0A 3MWHA 3EU4A 1O73A 1VRSD 2R3XA 5LNKe 4DSSA 3I69A 3TCOA 5F06A 1GNWA 4E8EA 1IYHA 5EVOA 3QFAC 1GTAA 1URMA 4JRRA 2OKAA 4XIHA 2V2GA 4P3YB 2DMLA 1YEPA 5IMDA 3P8WA 3QOUA 1FW1A 3HJMA 2MMOA 1AAZA 1OKTA 2H1GA 4WBRD 2IWTA 1YF0A 3W8SA 3NZNA 3F63A 5ECSA 5L71A 3MAKA 4KW6A 4KCEA 6GSTA 3ZIJA 2GVPA 4G19A 5ABRA 1FVKA 1K0MA 4TR1B 1ST9A 3M9KA 3H4KA 2GZYA 3MSZA 2H66A 3BJ5A 2OBIA 2YNXA 4TR4A 2LQQA 2GLRA 1V9WA 4I6XA 2HZEA 2DSAA 1HNBA 3TJBA 2I9HA 4WKWA 4ID0A 5CAXA 2CVBA 2OJLA 3TJFA 3DD3A 2VL2C 2R2JA 4GSNA 4TR1A 5HR2A 3LSZA 12GSA 3D4MA 1GRXA 4XS6A 5ECHB 5IO0A 1A0FA 2K8VA 1IYIA 1C72A 1B4QA 2IL3A 2JZSA 2VOCA 1PKWA 3WYWA 1SKSB 1GUKA 2CX3A 1SL0B 5ECPB 1EGOA 2KOKA 4IKHA 3ZYWA 3HYPA 11GSA 2O89A 4AJ7A 1AUCA 2B7JA 3TJKA 1PN9A 3GURA 5C04A 1R26A 2F3MA 3DGQA 2PPTA 4PUFC 1GSDA 1YEXA 2GT5A 2O87A 3CBUA 1LJRA 3D22A 3D6IA 5IMZA 3TB2A 3DVXA 4Q5QA 5F0GA 4KE3A 3KMNA 5DCGA 4BVYA 1O81A 5IMCA 5HR1A 1JZRA 2TRXA 1CQHA 3C7MA 3EC3A 1TXXA 3TRQA 3FRCA 2YPMA 1J9BA 2KLXA 3HVSA 3WD6A 5KN2A 2L59A 1EWXA 3BOAA 5B8AA 5F07A 4PGTA 1ON4A 4N30A 4K1FA 1EP7A 1XW6A 1X0RA 4HOJA 1TDIA 3LWAA 3APOA 4EDZA 2PMTA 2H1DA 1SU9A 2VCXA 1PX7A 3QCPA 5DCHA 3IOSA 3F4TA 4IP6A 3SBCA 4OO4A 1ERWA 4GWRA 1SD9A 2K18A 2VUPA 3EE2A 3RBTA 5HR0A 1B9YC 2HNLA 2H73A 1T8EB 3UJ1A 4GSSA 1ZCPA 1OC8A 3CYNA 5IMFA 1QFNA 5FHIA 1NHOA 2YZHA 5D73A 1M99A 4DVCA 5IO2A 1UN2A 2H72A 1O7UA 2WS2A 3QR6A 1SYXA 4F9ZA 4CW9A 3PH9A 5GSSA 2FCHA 4ECIA 4I97A 3F0IA 2YZUA 4X0XA 3LYPA 4G10A 1TK0B 4J56E 4D73B 1MTCA 4JEDA 1TI1A 2L57A 1DBYA 2GQLA 2V6OA 1B48A 5FWGA 1HYUA 4K7IA 1SJ6A 2H0GA 1EV9A 4AF2A 3C71A 3VWWA 4JU5A 3EMPA 4E8HA 1PRXA 4HZ2A 2XBIA 3CTGA 1OKDA 5ECLB 1F2EA 4O5RA 2DBCA 2JZTA 2CVKA 1FAAA 2I81A 3FY7A 3QAWA 4BA7A 3GKMA 1F37A 4MZCA 1TK5B 4EL1A 1JZDA 3ZFLA 3PINA 5CP1A 5J9BA 5B6NA 4KH7A 1GNEA 4H86A 4NHWA 2REMA 1N8JA 4IHUA 3G7IA 2GDRA 3ISOA 1WOUA 4ZBBA 2CA8A 3GH6A 2I4AA 4V1Ap 4LA1A 2B1KA 2RM6A 4QL7A 3VFIA 3F8UA 5G1LA 1KEBA 2D2ZA 3DEXA 3ZMLA 1ZZYA 4GSTA 2HI7A 3LXZA 2OA7A 3GFKA 2YWMA 1SKWB 1XW5A 3M9JA 1OAZA 4WR4A 2H71A 1U87A 1TRUA 1JLVA 1KTEA 1T3BA 1GULA 2MYGA 2NPBA 2F51A 4MF5A 1EV4A 4POKA 4HDEA 1M7TA 3OR5A 4ZL7A 4YQVA 3L9SA 5ECIB 2VL9A 22GSA 5ELGA 2E0QA 3LJRA 1BX9A 3H79A 1ZYEA 3UEMA 4OCEA 2PUKC 5COHA 2RLIA 3GN3A 4IN0A 3IXRA 1PQNA 3LQ7A 4EUYA 1TW9A 1QXHA 2FWGA 3CSIA 3ERGA 1X9WB 4GF0A 2K8SA 3FYGA 3QPMA 5KN3A 3E9JB 1Z6NA 3EURA 3NOFA 4KSOA 4K0NA 1VF3A 1R5PA 4EKZA 1GH2A 5AGYA 1X5DA 4ULXA 1V98A 2WULA 1SK2A 2LSTA 4LL1B 2CAIA 1JZWA 4NAXA 3M0FA 3Q19A 2J23A 1J08A 4ZB9A 1TRWA 4FYUA 5IMAA 4MJCA 5AN1A 3WGEA 3FK8A 4ML1A 4MMMA 4K0GA 10GSA 3GRXA 1GSEA 2HT9A 3LGCA 3CXGA 1S3DA 2IMKA 2HXKA 1YF1A 4ZL9A 2GZPA 1BQ7A 2HSHA 3N9JA 1PX6A 2YP6A 1S3AA 1K0OA 1UVZA 1TTZA 17GSA 5ID2A 3J7Yk 5DALB 2VAFA 18GSA 3DMLA 2C80A 2VIMA 4IVFA 3CSJA 3KJYA 4OO5A 5CRWA 1PA3A 5DQSA 3HJOA 2PVQA 2DIZA 3GUSA 1XWBA 2L6CA 2MBSA 4YQMA 4MF6A 5DAKA 1BAYA 2PU9C 3IR4A 2VD1A 2H1AA 5AIVA 5H5RA 3JCML 1EOGA 3C8EA 2OE3A 5H5QA 3APQA 1GSQA 5H5SA 5AISA 2R4VA 3GL3A 6GSUA 4GQCA 4L8EA 4LMVA 4GLTA 1TOFA 6GSXA 4JR6A 2P31A 2GSRA 4F0BA 3HCZA 1G0TA 4BWQA 3F3RA 2FWEA 20GSA 5A4UA 2WCIA 5E59A 3LYKA 2DJ0A 1GLPA 3HA9A 4WBJA 1XWKA 3D4TA 2PERA 1TU8A 3P90A 3TKSC 3ZLPA 2H0IA 1E6BA 1SK0A 4MJEA 4MJBA 4RQRA 3HVXA 2VO4A 1X9SB 2GT6A 3GKNA 5INYA 2WRTA 1T4YA 2K6VA 2IIYA 2DMMA 1K3OA 4IGJA 3VLNA 6GSWA 5ECKB 2DJJA 1YQ1A 3GX0A 4FIWA 2FA8A 2YANA 1U3IA 2HZEB 1WMJA 5FT3A 4MH3A 5AIXA 9GSSA 4XHMA 2KP1A 2DJKA 2VCQA 4KCAA 5LD0A 1GSYA 3DRNA 3IK9A 2DJ1A 2F9SA 2NBSA 3TRPA 1UA5A 8GSSA 3EMXA 1Q98A 4G9HA 1A8LA 4K6XA 3EWLA 1J0FA 1TU7A 1XFLA 4NPBA 4K7OA 2P5QA 2XBQA 3US3A 2CZ3A 4XCSA 5D9TA 2FLSA 2XPEA 4MLYA 1XWAA 3IDVA 2BTOT 1SENA 4ZL8A 2DJ2A 3RPNA 4ZBAA 3TOUA 4XS4A 5ECOB 3U6VA 4OFNA 2LJKA 4XTSA 3UVHA 5A4WA 1WRYA 3GSTA 3C1RA 2CV4A 3H1NA 3KZQA 5ECQB 4J57E 3L9UA 1Y25A 4XS1A 3V1WA 5D9VA 2VL2A 2OE1A 3GTUB 2LRNA 3DWVA 4NV2A 4LL4B 1F9MA 3GL5A 2N5FA 4MDCA 4RI7A 5EY6A 3LG6A 3FHKA 1N2AA 2LJRA 3RAZA 3UARA 4V2LA 2O8VB 3GH9A 3QDNA 4LMWA 3GA4A 1XOBA 5DJMA 3GTUA 5IOWA 1WIKA 5IOXA 3LORA 3A3TA 1F3AA 1I5GA 19GSA 1PL1A 4BPYA 1SL1B 1ZL9A 3E3EA 3M1GA 1A2LA 2WZ9A 2OADA 5CREA 2H74A 1ZGNA 4K9ZA 1AXDA 2MMNA 2B5XA 3TOTA 2FNOA 2J9HA 2DLXA 2EIOA 2HSYA 2IMFA 1R7HA 4IQAA 2IMDA 3HJPA 2L4QA 1K3YA 3VI7A 3ZMKA 4MK3A 1W89A 2XHFA 1PKZA 3EINA 2H6YA 3TJGA 1RK4A 3R2QA 1ZYQB 4GTUA 1MD3A 1FVJA 1MD4A 5CRHA 1YY7A 1PMTA 4TR3A 3IV4A 3ZTLA 2MZCA 4O32A 3F6FA 4ACSA 3GSSA 4EF0A 1QK8A 4F2IA 1R4WA 4NV5A 4GXZA 2LNTA 1V40A 4L5LA 2N5BA 4ECJA 4POMA 4PQ1A 2R6KA 4J2FA 3HZ8A 5J41A 4IP1A 1YJ6A 2I3YA 4DSQA 4POBA 2LS5A 3DYRA 1MEKA 2EC4A 2P5RA 2DC5A 5ECRB 3TDGA 4I2UA 5HQPA 2AJQB 1VF1A 2IN3A 1XZOA 4KB3A 1B8XA 3KCMA 1T00A 5CRDA 1QGVA 2LRCA 5CYYA 4ECBA 2H6ZA 3O76A 3DIEA 5EPFA 5ELAA 4BVXA 1SD8A 3TKQA 3QMXA 1H4OA 1TI3A 3P2AA 3TRXA 3VPTA 3M3MA 4ZB8A 1TRVA 2HRFA 2I1UA 1Z7RA 4V1Ag 2AUVA 4HQZA 1SYRA 3GYKA 3ZRDA 2XPDA 5IPGA 2YWNA 4F82A 1A24A 5HFKA 4OFTA 3G9BA 2C3TA 2FHEA 3LFLA 4Q5RA 1A2MA 2VM2A 3UBKA 2JZRA 1KNGA 3KH9A 3IAS2 5JWOB 3DKSA 1XIYA 2C0DA 2IMEA 3TKRA 1ZMAA 2HE3A 3A2XA 4FH8A 3KTLA 2VLTA 1PD21 1EEJA 2H0HA 4KGIA 1U88A 5EL8A 4N11A 2LTKA 4IQ1A 4JBBA 3GKXA 3FZ9A 5GAND 1B9XC 4IELA 4K2DA 3VURA 1MDJA 1FO5A 1HNAA 2X8HA 3KD0A 2HFDA 2B7KA 5E4WA 2HRNA 1ERVA 1E2YA 3KMOA 2WGRA 4HJ2A 3FR3A 2C3NA 4N0VA 3GNJA 4KUNA 2H75A 3FR6A 1O8XA 4YQUA 4MCUA 2IMIA 1BYEA 1QUWA 3ZIVA 1ABAA 2CVDA 1TK8B 1RQMA 4F03A 2E2MA 2YJHA 4EVMA 2E7PA 4GQFA 3G7YA 2VLVA 4PXOA 2IJYA 4I8BA 4PURA 3IBHA 2A2RA 3FZAA 16GSA 1RW1A 1T4ZA 3GMFA 2JADA 2V1MA 1M9AA 3U5RE 5J9CA 1EOHA 2EIRA 4AGSA 3H93A 3HD5A 4LLRA 2VM1A 2OE0A 4RQXA 3PR8A 2VLUA 3GX8A 2CT6A 3G7JA 1GLQA 5D9WA 2G0FA 3UBLA 2O85A 2AHEA 2FWFA 2L5OA 2PVOC 2LNSA 2FA4A 4WF5A 1OC9A 1DSBA 4WF4A 1O8WA 2WFCA 3CRUA 5GAPD 4KX4A 4TN8A 4TXOB 1FHEA 3P7XA 1K0CA 2X64A 5ID2B 3GV1A 1FB6A 4MPFA 5CO3A 2LQOA 1JLWA 3L4NA 5D9XA 1NM3A 1U3AA 2CZ2A 2H76A 4NHZA 4F0CA 3IHQA 4IJIA 1GTIA 2H30A 4GCIA 4PNFA 1YKCA 3CSHA 2YCDA 2JSYA 3I6AA 4TXOA 3O3TA 3VWXA 1PGTA 1TP9A 5DAKB 1SJIA 5HR3A 4FO5A 2BJXA 4MJAA 3ZITA 1TKDB 2PBJA 1Z9HA 4I2TA 3RDWA 3W6GA 1XXUA 4MZBA 4EDYA 5IPHA 2Z9SA 5D8IA 1BG5A 2WDUA 4IW9A 5B6MA 3QAVA 4HZ4A 2WJUA 2CQ9A 3ED3A 4PUAA 3UVTA 1S3CA 1JZOA 3QFBC 5DJLA 5ECNB 4HU7A 3UAPA 3HKRA 1K3LA 4IS0A 5A5KA 1X9MB 4WXTA 1FB0A 2PWJA 2GGTA 1LBKA 13GSA 4CDOA 5IQYA 3KP8A 3EVIA 4OWYA 2XC2A 3F4RA 3C73A 2GTUA 2GQKA 4HJMA 1JHBA 3F6DA 1MDKA 2GS3A 1X5CA 3VWUA 3BCKA 4NWYA 2H6XA 1G7OA 4POLA 2DIYA 4N10A 2TRCP 2H8LA 3SWLA 2YV9A 5G2ZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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