4DVCA

Structural and functional studies of tcpg, the vibrio cholerae dsba disulfide-forming protein required for pilus and cholera toxin production
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SNAAQFKEGEHYQVLKTPASSSPVVSEFFSFYCPHCNTFEPIIAQLKQQLPEGAKFQKNHVSFMGGNMGQAMSKAYATMIALEVEDKMVPVMFNRIHTLRKPPKDEQELRQIFLDEGIDAAKFDAAYNGFAVDSMVHRFDKQFQDSGLTGVPAVVVNNRYLVQGQSAKSLDEYFDLVNYLLTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 1.2 A resolution crystal structure of TcpG, the Vibrio cholerae DsbA disulfide-forming protein required for pilus and cholera-toxin production
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Vibrio cholerae
total genus 61
structure length 184
sequence length 184
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4dvcA00
1B8XA 3N9JA 2H8LA 5G1LA 4BVYA 2DJKA 3UJ1A 4NV5A 1Z9HA 2CVBA 1SL2B 1U88A 3IAS2 3D6IA 1XIYA 1ZGNA 4POBA 3M1GA 3ERFA 5D9VA 3F4TA 4K2DA 5IMFA 4V2NA 2XBQA 4YH2A 1ML6A 4WEYA 2LRTA 3M9JA 3FZ9A 3ZMLA 2VCWA 4V2MA 4NXIA 3BCKA 5D8IA 3FHKA 1K0DA 2GTUA 9GSSA 4K0NA 4EDYA 4KA0A 4G2EA 5IMVA 1A2JA 1W89A 4ACSA 4IBPA 2LKUA 1JFUA 2CZ2A 1TRUA 4ZL7A 3A3TA 1AIUA 2JSZA 2V32A 4AGSA 2VAFA 1Z7RA 3FKFA 2H76A 4ZL8A 2ES7A 1PA3A 4ZILA 4GQCA 2VD0A 2K6VA 3GTUB 4YAPA 3NIVA 1S3DA 2JACA 3HCZA 3ED3A 4DSSA 4EE0A 2FWHA 3Q19A 1TTZA 1W4VA 3A5WA 2Z9SA 1CQHA 4XS1A 1O73A 1OKDA 2H1DA 2X8HA 1WE0A 1OC3A 3KGKA 4MLYA 3EMXA 4K7IA 4MJBA 4KAEA 4ECBA 5DJLA 5A4VA 3L78A 3CBUA 5ECQB 2NDOA 2IN3A 2ZCTA 4EKZA 4LL4B 3QD9A 4HU9A 4MZCA 4MJAA 2R5GA 1XCCA 3UL3A 3DGQA 2ZUPA 3I9V2 5CNWA 2RLIA 2PBJA 3RDWA 3M0FA 1A23A 4X1UA 1SKRB 5DCHA 5G1KA 3HYPA 3WGDA 2AJQB 4HS1A 4FH8A 3TOUA 3CRUA 2A2SA 1SJ6A 3DD3A 4EDZA 1AC1A 4HI7A 1UN2A 2YJHA 1T8EB 2FA8A 4WKWA 1USBA 1X9SB 1ZYQB 2RUEA 3PINA 1ZYEA 1NHOA 2WS2A 1QK8A 1AW9A 2L4QA 3DMLA 2EIRA 4K9ZA 1B4QA 1SKWB 2CV4A 2K8VA 1WMJA 2XHFA 5H5RA 3KP9A 3VLNA 3F8UA 2BJXA 1EZKA 4X0XA 2PU9C 3A2VA 3RHBA 2YPMA 5KN0A 2OADA 4PQ1A 1R5AA 3GHAA 1GSSA 5CRHA 4MA9A 2VO4A 1YJ6A 5ECRB 1GWCA 4HU7A 4CHSA 2MMAA 3ZVJA 2P0GA 1XWGA 5ECNB 2GLRA 3HKRA 3GMFA 2VM2A 1A24A 1F37A 1MEKA 2WB9A 3DRNA 3HXSA 5D9XA 1F3AA 2B3SA 3VWWA 3TCOA 2B1KA 3ZIVA 5DQYA 2R6KA 3EC3A 2EIOA 2FY6A 5G5EA 1YKCA 2B1LA 1R5PA 2IFQB 4GSTA 3HDCA 5ECKB 1JZRA 2B6MA 4RUVA 2V6OA 4KDXA 1XWCA 3HZ4A 2YWOA 3IA1A 4IN0A 2B5EA 1FW1A 1SK1A 1G0TA 3CSHA 4GLTA 1I5GA 4D73B 2BMXA 3MWHA 4F2IA 2GT5A 4EUYA 4AF2A 2VL2C 2MYGA 3ZFLA 3QDNA 1AQXA 2C3QA 1TW9A 2PN8A 4MMMA 3KH7A 5IMDA 5KN3A 3GSSA 4O7HA 3VI7A 1YEXA 1A8LA 2KP2A 2JZSA 4K6XA 3KZQA 4WBRD 4WF5A 1U6TA 1XWAA 3M8NA 4MK3A 17GSA 4POMA 4FYUA 3QCPA 3ME8A 2K8SA 1UC7A 3RPPA 3EU3A 2NBSA 1F3BA 2FWGA 4PQHA 4OWYA 2MMNA 3J7Yk 1GNWA 1F9MA 5D93A 2H0IA 4TVEA 2H74A 6GSTA 4RI6A 2DMLA 2ZNMA 1TJDA 3FR3A 4H86A 4ECJA 5LNKe 1T4ZA 5FWGA 2E2GA 4ZBBA 3E0UA 3MAKA 5CO3A 5GZZB 2V2GA 2X99A 4G10A 4AJ7A 4XRAA 1XWKA 4QQ7A 3IBHA 4I5QA 2VLVA 3C71A 4ZXGA 22GSA 2DIYA 1EEMA 1XW6A 3BCIA 18GSA 1O85A 5C04A 1DBYA 4XS4A 2BTOT 3KMOA 3I43A 5ELAA 3R2QA 1K0MA 1PRXA 3KH9A 1URMA 1ERVA 4XHMA 3UOMA 2FGXA 2GZYA 1V58A 1GTUA 4IQAA 1S3AA 3FEUA 3F3QA 2X64A 3TGZA 1WIKA 1J9BA 3D5JA 2VOCA 5IIZA 3SBCA 3DYRA 4PNGA 2E7PA 3TRQA 1HQOA 1X5DA 5ID2A 1KEBA 1Q98A 3ZITA 1FVJA 3QAWA 2FD3A 1BAYA 2YWMA 3HVSA 2LJRA 1M99A 6GSUA 1KTEA 4J57E 1SD8A 4KUNA 4DVCA 4ZBAA 1TOFA 1JZOA 1RW1A 1XOBA 6GSWA 3CMIA 3VURA 2RIIA 1HD2A 1OKTA 3HA9A 2GS3A 2DBCA 2FWFA 5H5SA 1B48A 1GSFA 2JSYA 5DDLA 2GSSA 3O76A 2QGVA 20GSA 3RBTA 4JU5A 5GSTA 4I97A 2O8VB 3TJJA 1VRSD 1TRVA 4IVFA 1OYJA 2IWTA 2H70A 2E0QA 4G19A 3TJGA 2H71A 3F9UA 1XXUA 3TKRA 5JWOB 3MNGA 4EO3A 2LQOA 2WULA 4IKHA 1B9YC 1SK0A 2WZ9A 1OC8A 3GV1A 2HYXA 2WFCA 1PMTA 1RQMA 5EPFA 5IPGA 2I3YA 1SJIA 3WYWA 1H4OA 2GSTA 5CAXA 1MD4A 3FW2A 3QFBC 2K9FA 4AJ8A 4XCSA 4TKYA 3VWUA 1MDJA 2YOIA 2C0FA 3L0HA 1GTBA 1TK0B 2AHEA 1GP1A 2F8FA 4HJ2A 5F8BA 1SU9A 5ECMB 1QUWA 2CX4A 5E59A 3GH6A 1M9BA 2JADA 1WOUA 4N11A 5IO0A 2XPEA 2OACA 2LTKA 5J9CA 2MZCA 1OVNA 2P5RA 5IMZA 1GSEA 1U3IA 1OAZA 3G7IA 3TJKA 4PQIA 1YDKA 4QL7A 1B9XC 4OD7A 4Z7XA 2VM1A 2RUFA 2L57A 4PNFA 5ECIB 5GAND 2CAIA 2GSRA 4MZWA 2H19A 1SL1B 1H75A 1FB6A 1JLVA 1HYUA 1M9AA 1TXXA 4YAVA 2OE0A 4K1FA 2TIRA 4JR6A 3VPQA 1M0UA 5ECSA 3GN3A 3W6GA 2DSAA 3F6FA 5DJMA 2IMIA 3LJRA 3DKSA 3QMXA 2HZEA 2C3TA 2I81A 4GRFA 5AIVA 5J4UA 1V9WA 3FK8A 5J3RA 1A2MA 4AJ6A 5D96A 1VGLA 2IMDA 1BYEA 5HQPA 3WT1A 5LCZA 4JZQA 1S3CA 4HDEA 3ISOA 4BWSA 4NPBA 3LWAA 5AISA 3HJMA 3D0ZA 3LYPA 3ZZXA 4X43A 2GSQA 3QR6A 4NHZA 3RPNA 2G2QA 2HE3A 4TR1A 2E2MA 1K3OA 5F06A 2A4VA 3TB2A 3D21A 4NAXA 4ZBDA 1YF0A 1GTIA 1GSYA 2FA4A 4GSNA 1X5CA 1FB0A 3H79A 3APOA 4HUAA 3WGEA 4GWRA 4OCEA 3DVWA 4ECIA 3KTLA 2H1GA 3GH9A 3LGCA 2IJYA 1TDIA 5EVOA 2EIQA 1NHYA 1XPVA 5B7CA 3TKPA 1OE8A 1E2YA 1XZOA 2IL3A 1DSBA 4NV2A 3ZL5A 3GRXA 5JCGA 8GSSA 2XC2A 1PD21 3TKQA 3KP8A 5CRWA 5G30A 4KCEA 6GSSA 5FHIA 4WXTA 3TJBA 4EC0A 1T3BA 2N5AA 1UA5A 1SJZA 2VL3A 2LS5A 4O32A 1O8XA 3GKNA 4I8BA 2F51A 5GSSA 3EWLA 4IGJA 3VI5A 3Q74A 3EURA 1KNGA 4HQSA 2HLSA 4HOJA 4PURA 2H0HA 3SWLA 2HXKA 1DUGA 2PVOC 1HNCA 3I69A 1A2LA 1THOA 3GFKA 1JZWA 4IHUA 4YQUA 4FYCA 2H72A 1BG5A 4O92A 2FCHA 3E3EA 2GZZA 1ZMAA 3W8JA 4DSRA 3GL5A 1WPIA 1YKAA 4TN8A 3W8SA 2X8CA 5ABRA 1GSQA 1R26A 4KGIA 1T7PB 3P2AA 2I1UA 3P90A 4MPFA 5AGYA 1O6JA 1M2AA 3G7JA 4MF5A 3ZYWA 3VWVA 3GKXA 1T4YA 4BL7A 1U87A 3DVXA 1RK4A 3PGTA 3EINA 2G0FA 1X5EA 5CP1A 2OE1A 5ENUA 3G9BA 1XW9A 3J7Yb 5DALB 1EOGA 2R2JA 3IK7A 3F4RA 1EOHA 2P31A 1Z3EA 4LMWA 2H1AA 2XBIA 1YEPA 4IS0A 2RM6A 4ZL9A 3H8QA 2B7JA 2L6CA 1GUMA 3CSJA 3L9UA 3F4SA 4L5LA 3GTUA 4TXOB 4GXZA 3ZRDA 2JZTA 4E8HA 1K0AA 1AAZA 4JBBA 4MH3A 1SENA 4G9HA 3PR8A 4QL9A 1TU8A 4MF6A 3BD2A 1R4WA 1PSQA 1BEDA 12GSA 3CSIA 3KXOA 3HY2A 2C80A 4OO4A 1TRWA 2C4JA 3A2WA 5A4WA 2VCVA 3QAVA 3M9KA 3F6DA 4MJEA 2LNSA 2N5BA 4KW6A 2V6KA 4RI7A 5KN1A 5J9BA 3ZLPA 1SD9A 1KBNA 5KEJA 1XVQA 3ZIJA 1VF4A 4WETA 1XOAA 5IO2A 1A8YA 3RHCA 3F3RA 2OBKA 1OC9A 4O5RA 2FUG2 2HRNA 4V1Ag 1ACVA 1V98A 4OFMA 5IMAA 3KEBA 6GSVA 1GUHA 3GURA 1WP0A 1QGVA 4CDOA 1EWXA 3TDGA 2L59A 2IIYA 1ERTA 1K0NA 1MDIA 4WR4A 3NOFA 4KB3A 3GX0A 1FAAA 1HNBA 3D4TA 4Q5RA 5D73A 2PUKC 1SL0B 1ZL9A 4FO5A 2VLTA 1PN9A 4BWQA 3IPZA 2JZRA 3UIWA 4L0UA 11GSA 5IOXA 4EL1A 3S9FA 2PVQA 2H6YA 3LEFA 2J23A 4TR3A 1V40A 2B5XA 2HFDA 1X9WB 4K0GA 4F03A 2QSIA 2DLXA 2AB6A 1GLQA 2GQMA 2O87A 5DAKA 3GKKA 3UVTA 3TKSE 2TRCP 1QMVA 2C1YA 2VL2A 1BJXA 5J5NA 2DC5A 4PXOA 3CTGA 3QFAC 1DE1A 3DIEA 1FVKA 4YQVA 3IE3A 3GL3A 3IV4A 4KDYA 4IP6A 3L4NA 2O7KA 4LMVA 4MABA 4F9ZA 1J08A 2LUSA 2K18A 2VL9A 3UAPA 1SYRA 1YY7A 5F05A 3VK9A 3LFLA 2V1MA 1TI1A 3TJFA 2LRNA 2R3XA 2YANA 5IQYA 1F6MC 2HNLA 4DSSB 1EV4A 3GIXA 1ILOA 1SYXA 3DXBA 2OKAA 2AYTA 5B8BA 1EGRA 2PPTA 4N10A 13GSA 3GNJA 1EP8A 3K8NA 3D22A 2YWNA 1N8JA 4N30A 2ALBA 4LA1A 2B5YA 2IFQA 3KM6A 2HSYA 1M7TA 2OBIA 2M80A 3DWVA 3ZREA 3D4MA 1J0FA 3FR6A 2IMKA 4WR5A 3ZMKA 4J2FA 2AV4A 4D73A 3C7MA 4FYBA 2HT9A 2F3MA 2OJLA 2CQ9A 3V1WA 6GSXA 4HZ4A 4JEDA 5B8AA 3WD6A 2M46A 4K7OA 4OCFA 3L9SA 4ID0A 4IQ1A 3FZ4A 19GSA 3F0IA 2VLUA 2C0EA 3CTFA 1QQ2A 1GL8A 1LJRA 1M2BA 4P3YB 4BPYA 2AAWA 2PERA 5IOWA 5D9TA 4KNDA 5HR3A 2KP1A 1VF3A 2M72A 3OR5A 14GSA 1O7UA 3TKSC 1JZDA 1FOVA 4GCIA 3TOTA 2CVKA 2MBTA 1FO5A 2P5QA 2YCDA 2YZHA 1ST9A 3LG6A 4ULXA 1O8WA 3P7XA 2KUCA 1PL1A 4OMVA 3TRXA 4TR0A 4MDCA 3JCML 3H1NA 5IPHA 2PGTA 2LNTA 3U5RE 3EYTA 4EXJA 3HZ8A 2D2ZA 3AY8A 1ERUA 4TOPA 4XS6A 1Y6EA 4RQXA 2VCQA 3ZFBA 3HJPA 5G31A 4HQZA 1I9DA 1PKWA 4LL1B 3C1SA 4TR4A 3CYNA 1PKZA 2CAQA 5HR0A 5IMCA 4MF7A 1WRYA 4PUAA 1XVWA 2VIMA 4F0CA 4NWYA 1WWJA 2GQLA 2MMOA 1TP9A 3LYKA 3QOUA 2H6XA 1EEJA 2B7KA 2TRXA 3KIJA 3KMNA 2H0GA 5B6NA 3KJYA 1X0RA 2O89A 2N5FA 3GYKA 3GSTA 2WGRA 2L5LA 4MPGA 1ZOFA 1K3YA 3GX8A 2ON7A 6GSYA 1T1VA 1TK5B 1NW2A 1QFNA 3KCMA 3L9VA 3QAGA 5INYA 2DJ3A 2JL4A 2GVPA 1Z7PA 4EVMA 4XRDA 2ON5A 5G2ZA 4JE1A 2FHEA 2GZPA 4MH2A 3TKSA 2QC7A 3Q6OA 5JCWA 2HRFA 3EMPA 1G6YA 2IMEA 3KTBA 1BX9A 5G5FA 7GSSA 2WRTA 2OA7A 16GSA 2H66A 2REMA 4FIWA 1QXHA 3BBYA 3VPTA 4POLA 3ERGA 1YZXA 4KX4A 1MTCA 2YNXA 4KH7A 4RQRA 3ZTLA 4BA7A 1AQWA 2RM5A 1ZCPA 3H4KA 4ZIJA 1ABAA 2CX3A 3IK9A 3PH9A 1XWBA 5ECPB 1EV9A 2H73A 4KSMA 1LU4A 2NTOA 1GULA 5DBQA 5HFGA 1OC9B 4WBJA 4K7NA 1U3AA 3GA4A 1M2DA 1ON4A 2YN1A 2DJJA 3IHQA 2WCIA 4KDUA 2IPAA 1VF1A 5F07A 3O6TA 4OFTA 4N0VA 1TU7A 2CA8A 1B4PA 3HD5A 1SK2A 5LD0A 1GH2A 2I9HA 3C73A 3FY7A 2DJ2A 4XS4B 1X9MB 2LJKA 1GTAA 2PMTA 1F2EA 4L5OA 1DE2A 3APQA 3WGXA 1N2AA 5CREA 2H1BA 1YQ1A 5DAKB 5IM9A 4N0ZA 2GDRA 1V2AA 3HHVA 3IDVA 2LQQA 4YQMA 1PGTA 2VCTA 1XBSA 2R4VA 5JCUA 3P8WA 5C00A 4F0BA 2YV9A 1PX7A 4ML1A 5ID2B 4XIHA 2MMZA 3TRPA 3CRTA 4HEA2 5L71A 1TK8B 4GSSA 3HJOA 2DIZA 3EE2A 3RAZA 1ERWA 1LBKA 3M3MA 1CQGA 2C0DA 3O3TA 4IJ3A 4LLRA 4IELA 4XTSA 5HR1A 3IAM2 1MDKA 2DMMA 4L0WA 3TUEA 2H30A 2A2RA 3ZVJD 5AN1A 1XFLA 4L8EA 2GQKA 3UMAA 3EVIA 4DSQA 3EU4A 5ECOB 3DEXA 4IJIA 4KCAA 4IP1A 4PGTA 4E8EA 5EL8A 5ELGA 3VWXA 1O81A 2LJAA 1GRXA 3C1RA 4GQFA 3FZ5A 2VCZA 5FT3A 1VF2A 2YV7A 2IMFA 4Q5NA 1A0RP 5JWRB 4ECCA 2H75A 5KN2A 2F9SA 2HZFA 2VUPA 2LSTA 3LXTA 2QKEA 2XPDA 2C8UA 1TKDB 2GT6A 1PX6A 2YP6A 4ZB8A 4DEJA 4PX1A 4F82A 2L5OA 3ERWA 4NHWA 5HR2A 3F63A 2WJUA 2VCXA 3N5OA 1AXDA 3NZNA 2H01A 4HZ2A 3MSZA 4MP4A 4TRXA 1GSUA 1GUKA 4GF0A 1EGOA 5B6MA 4PUFC 3LXZA 2C0GA 4CW9A 2LRCA 2O85A 1OE7A 1TI3A 1T00A 4V2LA 4EF0A 4I2UA 5HFKA 2MBSA 5E4WA 1Q4JA 2L6DA 3E9JB 1FG4A 1AUCA 5J41A 1GNEA 3IXRA 1G6WA 1YF1A 2KHPA 3H93A 1PL2A 5GAPD 1C72A 3FR9A 4ML6A 2FLSA 3HVVA 5D9WA 1R7HA 1IYIA 4ISDA 2YJ7A 4WF4A 4I6XA 2LEGA 3GKMA 3KD0A 4BVXA 1Y25A 2WDUA 5CRGA 2AUVA 5DQSA 5JWQB 1UVZA 5CRDA 4J56E 3VFIA 4K8MA 1WJKA 5COHA 5EY6A 3ME7A 1AQVA 1ZZYA 5HFIA 1V57A 3C8EA 3LQ7A 1A0FA 2R37A 2HI7A 4HJMA 4POKA 3FZAA 3UVHA 2CZ3A 1K0CA 3FRCA 4ZB6A 1IYHA 2HSHA 2HZEB 3UEMA 3IC4A 2PWJA 1XW5A 3BOAA 5DCGA 4Q5QA 2DJ1A 1GSDA 3QPMA 3UARA 1K0OA 3IRAA 5ECHB 5DVBA 5DALA 3UBKA 3GUSA 3IOSA 3LORA 10GSA 4KE3A 4ZB9A 2CT6A 4MCUA 1FHEA 4TR1B 3WT2A 1G7EA 1NSWA 4NMUA 1Z6MA 5F0GA 5CYYA 2LV3A 4ILFA 4IW9A 2I4AA 4GTUA 4JR4A 3UBLA 2KOKA 1THXA 5H5QA 4TW5A 2YWIA 1GLPA 4KSOA 5A4UA 1K3LA 2F8AA 5A5KA 2H6ZA 4TXOA 2JU5A 3I6AA 2GGTA 2J9HA 1Z5YE 4I2TA 1BQ7A 1NM3A 3HVXA 4MJCA 4OFNA 3FYGA 4Q5FA 2FNOA 1PQNA 5AIXA 3IR4A 2NPBA 2C3NA 2YZUA 3A2XA 5ECLB 1G7OA 1K0BA 3U6VA 1HNAA 1Z6NA 4OO5A 4MZBA 3CXGA 4JRRA 1SKSB 2CVDA 2NVLA 2KLXA 3APSA 2DJ0A 2OE3A 3Q18A 2X8GA 3LSZA 3G7YA 1E6BA 1JLWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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