4DVCA

Structural and functional studies of tcpg, the vibrio cholerae dsba disulfide-forming protein required for pilus and cholera toxin production
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SNAAQFKEGEHYQVLKTPASSSPVVSEFFSFYCPHCNTFEPIIAQLKQQLPEGAKFQKNHVSFMGGNMGQAMSKAYATMIALEVEDKMVPVMFNRIHTLRKPPKDEQELRQIFLDEGIDAAKFDAAYNGFAVDSMVHRFDKQFQDSGLTGVPAVVVNNRYLVQGQSAKSLDEYFDLVNYLLTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 1.2 A resolution crystal structure of TcpG, the Vibrio cholerae DsbA disulfide-forming protein required for pilus and cholera-toxin production
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Vibrio cholerae
total genus 61
structure length 184
sequence length 184
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4dvcA00
2K18A 3FY7A 2H0IA 3G7JA 4LL4B 2GZPA 2YANA 4JR4A 3F0IA 1QQ2A 3HYPA 5A4VA 1WP0A 4EXJA 3IBHA 3EU3A 3HVVA 4KSMA 1Y6EA 1U3IA 2CVBA 5ECKB 2H74A 5F06A 3TJJA 2GTUA 2IMFA 2MBSA 4K9ZA 2WJUA 5D9TA 2ZUPA 2FA8A 2NPBA 2YJ7A 2PWJA 3VWVA 3WT2A 2A2RA 3LSZA 3IAS2 4CHSA 1N8JA 2LKUA 5FHIA 4NHZA 1Z9HA 3TUEA 2EIOA 2H01A 4OD7A 2IJYA 2PPTA 4FH8A 2O87A 1R5PA 4HU9A 2YOIA 4O92A 1I5GA 2PUKC 4N0ZA 1YZXA 3UIWA 2L5OA 4MA9A 3TKPA 2XC2A 1XVQA 1I9DA 5EY6A 3WT1A 11GSA 1HNBA 5DQYA 4V2MA 5CREA 1M9BA 1E2YA 2WULA 1YDKA 1NSWA 2KLXA 3C1SA 1TRUA 2C8UA 5HR0A 2DJ1A 1OKDA 2GSSA 1V9WA 3GIXA 1X9WB 4DVCA 4ZL8A 1OVNA 2HSHA 3Q19A 1DUGA 4Q5NA 1TJDA 3N9JA 5CO3A 2HE3A 1Q4JA 4L0WA 3LYPA 1EEMA 3FRCA 3QFAC 3HKRA 4TKYA 1RQMA 2H76A 2H1BA 3ZLPA 1B48A 2JZRA 1CQHA 4OMVA 1QK8A 3PINA 4LMWA 1U87A 5IPHA 3UEMA 1U3AA 3KCMA 2RM5A 1IYHA 1OKTA 1PGTA 3JCML 2CT6A 2VCVA 2CVDA 3L78A 2LQQA 1F6MC 2LJKA 5IOWA 4HDEA 1OE7A 1J0FA 4IKHA 3ZRDA 1K3YA 2AB6A 4XTSA 4PUFC 4N10A 3WD6A 1NM3A 3KM6A 3GV1A 4GQCA 3ZMLA 2XBIA 1BQ7A 4OO5A 1SKRB 3FR9A 2I9HA 3KGKA 3RHBA 2ALBA 3KTBA 5B6NA 3A2XA 2DIZA 5HFGA 3UARA 2K8VA 2L6DA 2HZEA 1M7TA 2HZEB 3I9V2 1KBNA 2A2SA 2ZCTA 1SYXA 1ZZYA 2LEGA 2PMTA 1YKCA 4CW9A 3FEUA 3TDGA 4LA1A 5J9CA 3RBTA 4AJ8A 5CAXA 3EWLA 1XWBA 5G31A 3CSIA 3HDCA 3IA1A 2RUEA 2XHFA 3EE2A 5B8BA 4G19A 1Y25A 1MD3A 4POLA 2L59A 1URMA 2GDRA 3QOUA 3GA4A 1NHOA 2XBQA 3DWVA 3GURA 2LTKA 4ILFA 2PBJA 4TVEA 3TKSA 2FWEA 2IMKA 3P2AA 4RQXA 1MTCA 1XOBA 3R2QA 3H8QA 4XCSA 2K9FA 1OC9B 1JLWA 2GSTA 3G7YA 1WIKA 1AUCA 3SWLA 3EVIA 2H1GA 13GSA 1HQOA 1LBKA 1SL1B 4MP4A 4MZCA 5EVOA 3Q6OA 1TTZA 4D73A 4EF0A 1V57A 2H70A 2O85A 3TOUA 5ABRA 4JRRA 3ZYWA 2H66A 1M2BA 1K0AA 2YN1A 3OR5A 1VF2A 1A24A 2WGRA 2H6XA 1F9MA 4IVFA 4KCAA 2CA8A 2H73A 4K7OA 3LGCA 1B9XC 3MWHA 4FYUA 4FO5A 2QKEA 4G10A 1TRVA 2LSTA 5G1KA 1K0CA 2EC4A 1FB0A 2LS5A 3IK7A 5ELGA 1EGOA 3FW2A 1SD9A 1SL2B 4KA0A 4ML6A 1BG5A 3F8UA 1A2MA 3E3EA 3EURA 1TDIA 4LLRA 5JWOB 4ZL9A 5ECOB 2HI7A 4WBRD 5D9WA 4PQIA 3ZIJA 3QAWA 3GL3A 4NHWA 3KXOA 1QGVA 1Z6NA 4X1UA 3S9FA 3L4NA 1UA5A 2P31A 4EVMA 4GCIA 2DSAA 4HJ2A 2N5BA 1TK5B 5DBQA 2FGXA 2IPAA 1VF3A 2OE1A 3H79A 1OYJA 3TJBA 2GS3A 3A5WA 1O81A 1JZDA 3HY2A 3RHCA 4GXZA 1QFNA 1ABAA 3VI5A 3FR3A 2YP6A 3VPTA 4ZB6A 3TJKA 3NIVA 4L5OA 4XIHA 1M0UA 4QL9A 2FCHA 4MABA 4PQHA 1JZOA 4PNGA 5CRGA 2VCZA 2VOCA 3KH7A 2CZ2A 1PL1A 5E4WA 2CX3A 4F0BA 1MDIA 4MDCA 2LRTA 3FZ9A 2DJKA 2LRNA 5JCWA 2C0FA 6GSYA 2FWHA 4POMA 3GH6A 4KW6A 2VAFA 1SK1A 3ISOA 2OACA 2JU5A 3GTUB 1XFLA 2V6OA 2GQLA 4HI7A 2AHEA 4HU7A 4YH2A 1A2LA 4KCEA 2ON5A 3FHKA 2YPMA 2B5XA 4PUAA 5DALB 3HJMA 1PKZA 2QC7A 2ON7A 3IRAA 5B6MA 2VCTA 4BVXA 2H72A 3EINA 5DJLA 4TR0A 2H0GA 1OC3A 1JLVA 4AJ7A 1AXDA 1GSSA 6GSSA 1K0DA 2OE0A 4BPYA 1A2JA 2F8FA 4GTUA 4ECCA 4HS1A 3GKKA 4GQFA 3O6TA 4KNDA 2CAQA 3KH9A 3F6FA 3TOTA 5ECNB 3IPZA 1FO5A 3TKRA 3F63A 2NBSA 3NOFA 2N5FA 3ZFLA 3CTFA 5ID2A 2HNLA 5ID2B 2R5GA 1USBA 3HVSA 2GQKA 4EKZA 5G30A 3FZAA 2MZCA 1GTAA 4E8HA 1JFUA 1PX6A 4O7HA 4G2EA 5AGYA 4HQSA 2LNTA 3VFIA 1GLQA 5JCUA 1GSQA 2VLUA 2PGTA 5IMZA 4ACSA 4WF5A 2C0DA 5DAKA 1K3LA 2LJRA 4IQAA 4F2IA 5DAKB 2DJ2A 5ECMB 2VL2A 1M9AA 3IV4A 2FNOA 3QFBC 2R6KA 4XRAA 5ECQB 3ZZXA 3GX0A 4IJ3A 4WF4A 5EL8A 1PN9A 2DIYA 1PRXA 2C3NA 4GF0A 2WDUA 4IGJA 5ECLB 4Q5RA 5IMCA 1R7HA 5IMDA 5F8BA 2O89A 4F82A 2F8AA 3LXZA 1W4VA 3G7IA 2HZFA 2DMLA 3QPMA 5HR2A 4XS1A 3APSA 2X64A 1XZOA 3VWWA 1T1VA 4IJIA 2HT9A 4WKWA 2J9HA 4WETA 3D22A 3PR8A 4JEDA 3FK8A 1AC1A 4YAVA 5CRDA 1AQXA 3CRUA 5E59A 4ZB9A 4MJEA 4PXOA 2GVPA 5C04A 1NHYA 4V1Ap 3J7Yk 4XS4A 5IQYA 2YV7A 1Q98A 1THOA 6GSTA 3MAKA 1XW9A 1XBSA 4F0CA 3H4KA 2TRXA 6GSXA 5F07A 3ERFA 1ACVA 5GSSA 1WWJA 3D0ZA 2O7KA 4DEJA 4TR1A 4MJAA 2IFQA 5D8IA 2H71A 3CMIA 2RLIA 3L9SA 3HJPA 5G5EA 1MD4A 2KOKA 3VURA 4RQRA 2GSRA 4OWYA 3C8EA 2LJAA 3ZVJD 4FIWA 22GSA 5B7CA 3ZVJA 2LQOA 3V1WA 4K7NA 4GSSA 3ERGA 1WOUA 1EOHA 4TW5A 4K2DA 3CSHA 3GHAA 2DMMA 4JBBA 1ERTA 4ZL7A 2AUVA 5ECIB 2V1MA 12GSA 4L8EA 3US3A 3MDKA 4MJBA 3FZ4A 4RI7A 3O76A 2H6ZA 3PGTA 3KD0A 1GNEA 3TRQA 4ZXGA 6GSVA 5LCZA 1XPVA 1PSQA 1VRSD 1GSDA 3W8JA 2CVKA 4KUNA 2YWMA 2IIYA 3IAM2 5DDLA 1C72A 4NV2A 4PNFA 4NV5A 3GMFA 3AY8A 3TRXA 1W89A 3K8NA 2RM6A 3DRNA 2M80A 5C00A 3RPNA 3DGQA 1WE0A 4QQ7A 1GP1A 2LNSA 1SKSB 4GRFA 3UBKA 2DJ3A 3C7MA 1EZKA 3UMAA 5B8AA 3M8NA 1SYRA 2Z9SA 4ZBAA 3VI7A 1PX7A 3WGEA 2GQMA 4RI6A 2X8GA 2F51A 5GSTA 1MEKA 3D4TA 3HA9A 4MZWA 4ZILA 5KN1A 1X5DA 4OFMA 2R37A 1G7OA 6GSUA 4EUYA 3FYGA 4MPFA 2L57A 3PH9A 4O32A 2RIIA 4KE3A 1SL0B 1WJKA 1Z3EA 2AJQB 2JSYA 4ULXA 4YAPA 1K0MA 5A5KA 5J41A 1DSBA 3IC4A 2WZ9A 4POBA 4MF7A 1F3AA 3LFLA 1YEPA 4I5QA 3LXTA 1K0OA 1XWAA 3DMLA 1H4OA 5DVBA 1UC7A 5ECPB 3L0HA 5HQPA 9GSSA 2YZHA 4MF6A 4GSTA 3Q74A 2FWFA 3W8SA 2HXKA 2AAWA 2C4JA 2TIRA 4KAEA 4D73B 1SKWB 4PURA 3A2WA 1UN2A 5H5SA 4IW9A 3D6IA 2HYXA 5J5NA 1GSUA 1G6WA 4HEA2 4ECIA 1GSFA 2V6KA 2FWGA 1HNCA 2DJ0A 2CZ3A 1HNAA 1EP8A 1RK4A 3GSTA 4WBJA 5FT3A 1UVZA 2N5AA 3QCPA 3I6AA 3KMNA 4H86A 4EL1A 1EOGA 2EIQA 3TKQA 3TB2A 4IBPA 1KEBA 2YNXA 2K8SA 4Q5FA 4P3YB 3QDNA 2VCWA 4KX4A 4I8BA 5F05A 1N2AA 2L5LA 3TRPA 4AGSA 3DVWA 2PERA 2C3TA 3ZL5A 5ENUA 3NZNA 3QR6A 4KDYA 2KUCA 1AQVA 3ME8A 2I3YA 3EC3A 2X8CA 4I2TA 3ZMKA 4POKA 3KP8A 1A8LA 1M2AA 4DSSA 2YCDA 3F3RA 4KH7A 4IP1A 5D9XA 1V98A 4OO4A 1GUMA 3D5JA 1EGRA 20GSA 1ON4A 1SK0A 4MPGA 3C1RA 3VPQA 1F2EA 1B9YC 4TN8A 1T8EB 3O3TA 3D4MA 2X99A 5G1LA 17GSA 1ERVA 1K3OA 3APQA 3FR6A 1PMTA 3IDVA 2DJJA 1QXHA 2P5QA 4E8EA 5DCGA 2FA4A 1B4QA 3L9UA 1BEDA 1O8XA 3GYKA 4MMMA 3A2VA 1O7UA 2I4AA 1H75A 3IR4A 3EMPA 1XWGA 7GSSA 1U88A 1GSEA 3LG6A 4BWQA 2FHEA 3FKFA 1BX9A 5J3RA 5AIXA 4OCEA 5DQSA 1TOFA 2LRCA 3IOSA 1EEJA 5A4UA 2G2QA 1R26A 2JL4A 3Q18A 1R5AA 2KP1A 1PD21 2WCIA 2JZTA 4K7IA 2C0EA 2P0GA 4I97A 2FUG2 1XCCA 3IXRA 2CV4A 1O85A 2IL3A 3P7XA 1WMJA 3U6VA 1HYUA 3ME7A 2IMEA 3KTLA 5DCHA 4EDZA 3M1GA 3LYKA 3UVHA 2MBTA 2WS2A 5L71A 3G9BA 3EU4A 18GSA 4ZB8A 5ECHB 3GFKA 4OFTA 1SD8A 5GZZB 5D9VA 1XIYA 2VM2A 3VLNA 2B1KA 2WRTA 1QUWA 1ZYEA 2VD1A 2B5EA 1G6YA 5IPGA 3GUSA 4FYBA 2E2MA 3HZ4A 2OJLA 5EPFA 3LQ7A 4ZIJA 2H75A 1FG4A 3KEBA 2V2GA 2GSQA 2NDOA 4TRXA 4LL1B 2E0QA 1M99A 3DIEA 2VIMA 2E2GA 2L6CA 1LU4A 2MYGA 4BWSA 4JZQA 4WR4A 1X9SB 2B7KA 4DSRA 2H1AA 3KZQA 4F03A 2KHPA 2VCXA 5IM9A 1ZOFA 2M46A 4JE1A 2DC5A 5D73A 2JSZA 2CQ9A 3ZITA 2YWOA 5J4UA 3UL3A 1YQ1A 3KIJA 1DE2A 4MJCA 2B6MA 4HQZA 3EMXA 1PKWA 4I6XA 3DD3A 1ZGNA 1CQGA 10GSA 1TRWA 5IMFA 1YF1A 2OBKA 1J08A 2LV3A 1TP9A 3UJ1A 1J9BA 3DEXA 3HD5A 3APOA 1SK2A 2IWTA 5JWQB 2NTOA 4WR5A 1GWCA 4HJMA 3LWAA 5INYA 1SJZA 4HUAA 5ECRB 4EC0A 1A0RP 3F6DA 1DE1A 2I81A 4YQMA 4K0NA 1XXUA 3DVXA 3ED3A 5IOXA 4IS0A 1EV9A 3GRXA 1A0FA 4XRDA 4MK3A 3IHQA 5KN0A 1E6BA 2GLRA 4IELA 1QMVA 2VUPA 5H5QA 2GZYA 4MH2A 3IE3A 5F0GA 1Z7RA 2ES7A 2R4VA 1WPIA 1Z6MA 2JZSA 2AV4A 1FHEA 5CRHA 3TJGA 1MDKA 4JU5A 3C73A 4XS4B 4N30A 2OA7A 4XHMA 3CXGA 5D96A 3QMXA 1IYIA 4EDYA 16GSA 2BTOT 5ELAA 3I69A 4NWYA 2PVQA 4TXVA 4Q5QA 5JCGA 3U5RE 2C1YA 4NPBA 4TR1B 3P90A 4TXOA 2XPDA 3TCOA 1GUKA 2QGVA 4TXOB 2IFQB 5KN2A 2OADA 3VWXA 5LD0A 2AYTA 4MF5A 4RUVA 2F3MA 3H1NA 1LJRA 2O8VB 2A4VA 1MDJA 2I1UA 1KTEA 3GNJA 1TW9A 5FWGA 4X0XA 1ILOA 2YJHA 4ZBBA 1TRSA 3KMOA 3M9JA 1X5CA 1M2DA 5HR3A 3VWUA 1O6JA 2X8HA 1HD2A 5IMVA 1ZL9A 5J9BA 14GSA 1OC8A 5DJMA 4OFNA 2YZUA 4TR3A 3GKNA 1GL8A 3F4RA 2MMNA 2VCQA 2HSYA 2WFCA 1K0NA 3WGDA 5GAPD 2XPEA 1BAYA 1TK8B 3CRTA 3HVXA 3ZFBA 2D2ZA 2YWIA 3QAGA 3HZ8A 4MCUA 1SENA 3RAZA 2OBIA 4IP6A 1SJIA 3KP9A 4HOJA 3FZ5A 2VM1A 1FB6A 4PX1A 1TKDB 5A4WA 2YWNA 3MSZA 3E0UA 4K1FA 3MNGA 2V32A 4J56E 2R3XA 3GL5A 3GKXA 1GNWA 3GKMA 3KJYA 1TU8A 4K6XA 2C3QA 3C71A 3CSJA 4ECBA 1V58A 1JZWA 5IIZA 1ML6A 4FYCA 3TKSC 4GSNA 4KDUA 5CRWA 4TR4A 1AAZA 4NMUA 4G9HA 2YV9A 5LNKe 4K0GA 2HRNA 1T4YA 1TU7A 4ZBDA 4V2NA 1X9MB 2B1LA 1GLPA 3M3MA 3UOMA 1ZCPA 1T3BA 2VL9A 1S3DA 2B5YA 3ZTLA 3BD2A 2KP2A 4N0VA 3M9KA 3BCIA 3CYNA 4IN0A 3GN3A 1FVJA 3BBYA 2IMIA 4NXIA 2V41A 1OC9A 1A23A 3GH9A 1THXA 5ECSA 2GT5A 1XWCA 5CP1A 3E9JB 4KSOA 2F9SA 2REMA 2L4CA 3TJFA 4J2FA 1OAZA 4GLTA 5D93A 2VLVA 1V40A 2CAIA 2FLSA 4J57E 1GUHA 3QD9A 1O73A 3WGXA 3UBLA 2J23A 2WB9A 2GGTA 3LEFA 1OE8A 3F9UA 1FVKA 2HRFA 4V1Ag 1AW9A 1YY7A 2LUSA 2H19A 4EE0A 2P5RA 3L9VA 4K8MA 3ZREA 3DKSA 1TK0B 2E7PA 3TGZA 1A8YA 1YJ6A 1GTIA 1K0BA 1WRYA 1GRXA 4I2UA 2ZNMA 1GH2A 2K6VA 4Z7XA 1FW1A 2FY6A 2BMXA 2OE3A 5AISA 1R4WA 5CNWA 1YEXA 6GSWA 1O8WA 3F3QA 1FAAA 1F37A 3F4TA 4HZ4A 2CX4A 2MMAA 4NAXA 1ZMAA 4DSSB 1TI1A 2VL3A 4LMVA 1BYEA 1ERWA 4IQ1A 4MLYA 4PQ1A 2PVOC 1XWKA 4AJ6A 1JZRA 3BOAA 3BJ5A 3QAVA 1EP7A 1U6TA 3DXBA 2B7JA 4ML1A 1X0RA 1S3AA 4QL7A 2H0HA 2C80A 2L4QA 1VF1A 1JHBA 4N11A 5AIVA 5GAND 3N5OA 4OCFA 1AQWA 2G0FA 4KB3A 4O5RA 3HJOA 5HR1A 1ZYQB 1X5EA 1T00A 3M0FA 1T7PB 4GWRA 2VLTA 1SJ6A 3DYRA 1DBYA 1XW5A 2FD3A 1B4PA 5G2ZA 4EO3A 1ERUA 5COHA 2RUFA 3D21A 4MZBA 2R2JA 2VO4A 3UVTA 2HFDA 1GTUA 4F9ZA 1G7EA 3F4SA 1Z5YE 4L5LA 3I43A 4HZ2A 4WXTA 1FOVA 2M72A 2IMDA 2PU9C 2JACA 3HXSA 3RPPA 2H6YA 1GSYA 8GSSA 1ST9A 2H8LA 4V2LA 1B8XA 1Z7PA 4MH3A 1VF4A 4YQVA 3ZIVA 4IHUA 1RW1A 1VGLA 4DSQA 4L0UA 3UAPA 2MMZA 1G0TA 2NVLA 5AN1A 3GTUA 2EIRA 2GT6A 2DLXA 3GSSA 1XW6A 3SBCA 3IK9A 2OKAA 2DBCA 3H93A 4ECJA 5CYYA 3LJRA 1AIUA 4KGIA 1F3BA 3HHVA 5DALA 1PL2A 4ISDA 3VK9A 1SU9A 1GTBA 2IN3A 3J7Yb 4XS6A 1YF0A 5IO2A 1GULA 1S3CA 1T4ZA 1NW2A 3CBUA 5HFKA 1PA3A 1YKAA 2H30A 3P8WA 4AF2A 2MMOA 5KEJA 1XOAA 1TXXA 3LORA 4ID0A 3EYTA 5HFIA 2H1DA 4X43A 3WYWA 3BCKA 4YQUA 1EWXA 2C0GA 4JR6A 4PGTA 5KN3A 2VD0A 5JWRB 4CDOA 5IO0A 3CTGA 1TI3A 3W6GA 2BJXA 4BVYA 2TRCP 2HLSA 2B3SA 2VL2C 3RDWA 1XVWA 1PQNA 4KDXA 5G5FA 1KNGA 4TOPA 2JADA 1BJXA 3A3TA 1EV4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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